Heatmap: Cluster_150 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051500.1 (Contig348.g4703)
0.01 0.59 0.92 0.42 1.0 0.17 0.33 0.71 0.46 0.33 0.02 0.38 0.22 0.44 0.17 0.05 0.03 0.37 0.11 0.03 0.25 0.31 0.56 0.55 0.49 0.08 0.06
Sro1025_g232730.1 (Contig568.g7224)
0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.05 0.14 0.15 0.16 0.18 0.0 0.1 0.61 0.0 0.08 0.14 0.12 0.45 0.23 1.0 0.38 0.49 0.07 0.3 0.19 0.03 0.1
Sro1210_g252740.1 (Contig2015.g17240)
0.04 0.17 0.42 0.28 0.29 0.24 0.06 1.0 0.4 0.19 0.49 0.14 0.4 0.09 0.35 0.17 0.29 0.27 0.32 0.38 0.08 0.3 0.28 0.19 0.33 0.22 0.28
Sro1264_g257390.1 (Contig827.g9174)
0.0 0.69 0.7 0.52 0.56 0.39 0.26 1.0 0.31 0.25 0.54 0.25 0.36 0.17 0.38 0.36 0.25 0.14 0.26 0.2 0.18 0.07 0.09 0.66 0.4 0.26 0.25
Sro1371_g267060.1 (Contig1338.g12336)
0.0 0.3 0.35 0.19 0.43 0.09 0.06 1.0 0.47 0.13 0.03 0.21 0.35 0.47 0.08 0.15 0.01 0.08 0.33 0.02 0.07 0.38 0.21 0.89 0.6 0.05 0.06
Sro138_g064590.1 (Contig2021.g17281)
1.0 0.37 0.57 0.23 0.31 0.13 0.23 0.63 0.75 0.3 0.23 0.32 0.46 0.2 0.27 0.18 0.15 0.12 0.2 0.36 0.31 0.26 0.3 0.2 0.1 0.06 0.17
Sro1401_g269490.1 (Contig1376.g12633)
0.01 0.84 0.74 0.25 0.39 0.24 0.29 1.0 0.52 0.2 0.23 0.15 0.32 0.12 0.2 0.19 0.27 0.07 0.11 0.22 0.06 0.08 0.26 0.79 0.34 0.1 0.25
Sro1465_g274970.1 (Contig1516.g13830)
0.0 0.24 0.35 0.25 0.47 0.17 0.32 1.0 0.7 0.24 0.03 0.37 0.09 0.45 0.14 0.06 0.06 0.85 0.14 0.01 0.23 0.38 0.59 0.42 0.37 0.2 0.09
0.0 0.3 0.67 0.31 0.63 0.16 0.29 1.0 0.62 0.16 0.04 0.12 0.09 0.06 0.09 0.02 0.09 0.5 0.15 0.05 0.09 0.54 0.7 0.96 0.64 0.33 0.04
0.01 0.6 0.59 0.15 0.13 0.2 0.2 0.35 0.4 0.35 0.15 0.19 0.34 0.48 0.31 0.13 0.55 0.16 0.68 0.19 0.21 1.0 0.49 0.53 0.14 0.13 0.19
Sro1560_g282540.1 (Contig3879.g29829)
0.01 0.06 0.05 0.01 0.04 0.01 0.19 1.0 0.27 0.03 0.01 0.01 0.26 0.01 0.08 0.04 0.0 0.04 0.01 0.12 0.02 0.26 0.09 0.2 0.03 0.01 0.03
Sro1712_g292900.1 (Contig3889.g29865)
0.0 0.37 1.0 0.26 0.13 0.02 0.06 0.12 0.21 0.04 0.01 0.01 0.11 0.18 0.02 0.07 0.02 0.01 0.09 0.0 0.0 0.19 0.33 0.18 0.03 0.01 0.01
Sro1724_g293730.1 (Contig1866.g16322)
0.08 0.43 0.33 0.27 0.27 0.34 0.43 0.35 0.54 0.52 0.48 0.55 0.85 0.37 0.53 0.84 0.46 0.25 0.42 0.93 0.42 1.0 0.53 0.32 0.29 0.18 0.47
Sro1900_g304250.1 (Contig3998.g30694)
0.0 0.31 0.43 0.29 0.35 0.05 0.14 0.14 0.17 0.11 0.07 0.08 0.32 0.26 0.11 0.18 0.15 0.07 0.59 0.03 0.03 0.42 0.3 1.0 0.54 0.14 0.05
Sro1900_g304260.1 (Contig3998.g30695)
0.34 0.46 1.0 0.52 0.57 0.02 0.12 0.2 0.21 0.13 0.02 0.02 0.12 0.03 0.05 0.12 0.02 0.05 0.2 0.02 0.02 0.53 0.33 0.39 0.15 0.04 0.02
Sro1918_g305380.1 (Contig9.g107)
0.37 0.13 0.34 0.19 0.21 0.33 0.52 1.0 0.8 0.29 0.39 0.32 1.0 0.17 0.41 0.52 0.4 0.18 0.14 0.47 0.42 0.32 0.38 0.53 0.19 0.13 0.29
Sro1927_g305960.1 (Contig136.g1515)
0.0 0.39 0.49 0.35 0.47 0.03 0.17 1.0 0.49 0.18 0.08 0.15 0.21 0.11 0.11 0.12 0.13 0.12 0.25 0.2 0.16 0.55 0.4 0.27 0.11 0.07 0.09
Sro1938_g306530.1 (Contig3016.g24076)
0.05 0.11 0.15 0.2 0.33 0.31 0.71 1.0 0.69 0.35 0.38 0.45 0.35 0.66 0.42 0.55 0.38 0.36 0.25 0.29 0.43 0.4 0.39 0.35 0.11 0.12 0.53
Sro2034_g312020.1 (Contig3527.g27262)
0.01 0.18 0.23 0.27 0.28 0.06 0.19 1.0 0.28 0.21 0.3 0.21 0.2 0.23 0.35 0.29 0.44 0.16 0.25 0.17 0.25 0.28 0.36 0.24 0.07 0.14 0.29
Sro2055_g312790.1 (Contig940.g9752)
0.0 0.48 0.31 0.19 0.36 0.03 0.18 0.21 0.47 0.14 0.02 0.11 0.44 0.22 0.05 0.01 0.01 0.18 0.63 0.21 0.06 1.0 0.65 0.42 0.22 0.02 0.01
Sro2055_g312800.1 (Contig940.g9753)
0.0 0.76 0.44 0.43 1.0 0.1 0.14 0.56 0.42 0.25 0.28 0.14 0.21 0.25 0.13 0.16 0.02 0.08 0.23 0.04 0.08 0.24 0.51 0.71 0.35 0.12 0.07
Sro20_g014430.1 (Contig2954.g23473)
0.0 0.73 0.91 0.47 0.58 0.21 0.26 0.36 0.31 0.25 0.05 0.31 0.14 1.0 0.15 0.02 0.01 0.02 0.11 0.02 0.19 0.41 0.39 0.46 0.18 0.05 0.06
Sro216_g089460.1 (Contig227.g2723)
0.46 0.32 0.6 0.34 0.36 0.46 0.82 1.0 0.79 0.37 0.4 0.46 0.45 0.16 0.29 0.24 0.3 0.64 0.59 0.28 0.64 0.34 0.42 0.72 0.44 0.28 0.34
Sro2193_g318490.1 (Contig1101.g10670)
0.0 0.46 0.22 0.32 0.43 0.22 0.03 1.0 0.19 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0 0.06 0.01 0.0 0.01 0.0 0.18 0.1 0.01 0.01 0.0 0.04
Sro24_g016400.1 (Contig40.g250)
0.0 0.22 0.36 0.19 0.43 0.1 0.14 1.0 0.25 0.13 0.04 0.12 0.07 0.16 0.08 0.07 0.03 0.26 0.09 0.01 0.1 0.31 0.27 0.43 0.58 0.14 0.09
Sro2662_g334000.1 (Contig651.g7773)
0.1 0.74 0.94 0.58 0.63 0.36 0.12 0.33 0.31 0.21 0.12 0.29 0.19 0.34 0.22 0.14 0.3 0.01 0.13 0.02 0.06 0.39 0.51 1.0 0.12 0.11 0.13
Sro2739_g336010.1 (Contig2076.g17744)
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.33 0.04 1.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro276_g105990.1 (Contig2556.g20779)
0.05 0.65 1.0 0.35 0.6 0.3 0.48 0.79 0.43 0.4 0.3 0.31 0.57 0.23 0.42 0.17 0.35 0.34 0.28 0.3 0.29 0.55 0.45 0.62 0.67 0.28 0.2
Sro278_g106650.1 (Contig1952.g16780)
0.13 0.18 0.72 0.37 0.28 0.19 0.51 1.0 0.82 0.16 0.15 0.38 0.19 0.04 0.18 0.2 0.16 0.13 0.11 0.06 0.12 0.11 0.27 0.99 0.35 0.15 0.14
Sro2949_g340870.1 (Contig4300.g32472)
0.02 0.65 0.7 0.4 0.33 0.06 0.45 0.68 0.39 0.33 0.29 0.39 0.62 0.25 0.32 0.37 0.28 0.32 0.39 0.53 0.38 0.87 0.45 0.39 1.0 0.5 0.27
Sro310_g113930.1 (Contig2751.g22153)
0.16 0.95 0.84 0.35 0.59 0.28 0.54 0.55 0.65 0.7 0.45 0.79 0.69 0.71 0.52 0.78 0.39 0.51 0.79 0.7 0.62 1.0 0.71 0.36 0.18 0.16 0.53
Sro311_g114170.1 (Contig909.g9532)
0.09 1.0 0.94 0.42 0.5 0.15 0.35 0.86 0.38 0.58 0.84 0.75 0.77 0.16 0.62 0.58 0.47 0.52 0.5 0.91 0.77 0.83 0.35 0.47 0.5 0.52 0.49
Sro408_g136870.1 (Contig3193.g25222)
0.0 0.54 0.75 0.31 0.37 0.2 0.32 0.25 0.27 0.17 0.12 0.14 0.31 0.25 0.28 0.12 0.24 0.26 0.29 0.1 0.07 0.45 0.34 1.0 0.4 0.12 0.08
Sro421_g139490.1 (Contig1157.g11062)
0.6 0.7 0.79 0.35 0.29 0.09 0.18 0.09 0.42 0.39 0.2 0.43 0.34 0.43 0.16 0.05 0.31 0.13 0.46 0.66 0.53 1.0 0.42 0.2 0.28 0.16 0.13
Sro454_g146360.1 (Contig682.g7962)
0.25 0.94 0.65 0.53 0.99 0.43 0.33 0.44 0.29 0.35 0.21 0.2 1.0 0.16 0.23 0.17 0.38 0.3 0.51 0.42 0.18 0.62 0.34 0.4 0.19 0.11 0.21
0.0 0.49 0.73 0.43 0.47 0.04 0.05 0.21 0.45 0.08 0.02 0.1 0.03 0.05 0.07 0.07 0.02 0.12 0.15 0.0 0.0 0.37 0.54 1.0 0.87 0.24 0.03
Sro529_g161020.1 (Contig4737.g35124)
0.0 0.66 0.65 0.39 0.43 0.21 0.26 1.0 0.57 0.25 0.15 0.27 0.23 0.22 0.25 0.14 0.22 0.09 0.26 0.22 0.23 0.38 0.27 0.7 0.38 0.2 0.15
Sro52_g031150.1 (Contig3190.g25198)
0.0 0.57 0.04 0.19 0.29 0.0 0.05 0.0 0.03 0.14 0.03 0.06 0.1 0.02 0.05 0.0 0.09 0.0 0.03 0.04 0.05 1.0 0.26 0.26 0.37 0.0 0.01
Sro53_g031420.1 (Contig1592.g14482)
0.0 0.38 0.61 0.24 0.46 0.28 0.31 0.14 0.59 0.11 0.04 0.07 0.32 0.44 0.2 0.19 0.03 0.11 0.14 0.0 0.1 1.0 0.72 0.42 0.06 0.01 0.08
Sro54_g031970.1 (Contig2430.g19885)
0.01 0.5 0.49 0.17 0.37 0.16 0.28 0.23 0.43 0.15 0.01 0.16 0.5 0.59 0.1 0.07 0.04 0.08 0.31 0.04 0.06 0.47 1.0 0.58 0.03 0.04 0.08
0.0 0.49 0.77 0.34 0.68 0.16 0.26 0.21 0.5 0.21 0.08 0.36 0.85 0.74 0.11 0.17 0.06 0.17 0.38 0.04 0.04 0.4 1.0 0.59 0.11 0.03 0.08
0.0 0.54 1.0 0.37 0.26 0.0 0.34 0.47 0.24 0.21 0.31 0.09 0.2 0.16 0.24 0.34 0.12 0.1 0.19 0.12 0.31 0.81 0.31 0.53 0.26 0.09 0.19
Sro582_g170530.1 (Contig2996.g23809)
0.0 0.13 0.19 0.27 0.42 0.14 0.36 1.0 0.62 0.2 0.26 0.26 0.72 0.38 0.3 0.31 0.25 0.49 0.23 0.21 0.18 0.38 0.42 0.5 0.46 0.12 0.2
Sro624_g177400.1 (Contig2249.g18645)
0.0 0.25 0.39 0.15 0.45 0.24 0.43 1.0 0.97 0.21 0.03 0.32 0.33 0.48 0.23 0.12 0.04 0.22 0.23 0.02 0.22 0.76 0.86 0.53 0.25 0.01 0.1
Sro629_g178230.1 (Contig2563.g20832)
0.0 0.14 0.25 0.17 0.28 0.08 0.29 1.0 0.64 0.1 0.07 0.15 0.03 0.18 0.1 0.08 0.02 0.14 0.02 0.0 0.09 0.32 0.37 0.34 0.3 0.13 0.16
Sro646_g180810.1 (Contig2967.g23579)
0.02 0.66 0.6 0.48 0.46 0.16 0.33 0.25 0.43 0.4 0.28 0.4 0.7 0.55 0.32 0.33 0.17 0.22 0.31 0.47 0.52 1.0 0.31 0.44 0.56 0.29 0.24
Sro646_g180820.1 (Contig2967.g23580)
0.34 0.6 1.0 0.37 0.4 0.02 0.17 0.14 0.71 0.14 0.03 0.13 0.51 0.61 0.09 0.07 0.03 0.08 0.08 0.12 0.12 0.99 0.55 0.16 0.22 0.01 0.02
Sro65_g036660.1 (Contig155.g1736)
0.02 0.39 0.38 0.76 0.59 0.17 0.4 0.68 0.52 0.42 0.67 0.36 0.33 0.17 0.62 1.0 0.63 0.35 0.47 0.44 0.58 0.71 0.44 0.09 0.14 0.5 0.75
Sro65_g036670.1 (Contig155.g1737)
0.09 0.72 0.23 0.53 0.5 0.14 0.42 1.0 0.44 0.42 0.56 0.44 0.44 0.28 0.76 0.84 0.3 0.41 0.54 0.56 0.64 0.86 0.69 0.03 0.19 0.27 0.59
Sro663_g183530.1 (Contig119.g1351)
0.0 0.31 0.57 0.42 0.26 0.43 0.76 1.0 0.89 0.21 0.37 0.14 0.75 0.14 0.49 0.42 0.45 0.55 0.24 0.42 0.15 0.36 0.41 0.18 0.2 0.37 0.26
Sro685_g186950.1 (Contig1991.g17050)
0.0 0.63 0.58 0.22 0.51 0.29 0.35 0.54 0.48 0.31 0.09 0.77 0.34 0.42 0.31 0.2 0.16 0.43 0.61 0.24 0.23 0.3 0.3 1.0 0.52 0.22 0.21
Sro710_g191100.1 (Contig1639.g14782)
0.06 0.26 0.42 0.27 0.22 0.07 0.12 0.13 0.17 0.22 0.19 0.2 0.31 0.2 0.18 0.23 0.26 0.24 0.36 0.25 0.25 1.0 0.26 0.6 0.39 0.32 0.21
Sro72_g039930.1 (Contig1459.g13392)
0.03 0.19 0.52 0.61 0.49 0.44 0.58 1.0 0.7 0.13 0.27 0.07 0.17 0.03 0.26 0.17 0.19 0.15 0.03 0.03 0.12 0.17 0.26 0.51 0.6 0.28 0.15
Sro769_g199880.1 (Contig2367.g19490)
0.05 0.38 0.49 0.25 0.25 0.11 0.54 0.54 0.6 0.4 0.46 0.33 1.0 0.43 0.38 0.6 0.28 0.45 0.91 0.92 0.26 0.89 0.51 0.56 0.42 0.2 0.61
Sro80_g043020.1 (Contig92.g1046)
0.01 0.64 1.0 0.7 0.92 0.07 0.24 0.28 0.4 0.29 0.19 0.38 0.89 0.76 0.21 0.09 0.18 0.51 0.22 0.2 0.23 0.35 0.56 0.4 0.16 0.03 0.11
Sro82_g043910.1 (Contig4032.g30982)
0.01 0.58 0.65 0.46 0.58 0.59 0.31 1.0 0.44 0.3 0.37 0.24 0.71 0.7 0.55 0.34 0.28 0.29 0.45 0.32 0.22 0.45 0.22 0.69 0.61 0.37 0.27
Sro840_g209420.1 (Contig1129.g10840)
0.02 0.45 0.54 0.17 0.14 0.31 0.49 0.79 0.71 0.46 0.16 0.51 0.06 0.37 0.33 0.14 0.17 0.1 0.03 0.06 0.64 1.0 0.94 0.23 0.09 0.01 0.34
Sro870_g213680.1 (Contig1807.g15938)
0.09 0.34 0.38 0.29 0.43 0.11 0.31 1.0 0.48 0.28 0.17 0.43 0.33 0.3 0.21 0.2 0.1 0.09 0.25 0.15 0.26 0.23 0.27 0.29 0.23 0.09 0.17
Sro882_g215310.1 (Contig1771.g15674)
0.01 0.22 0.35 0.13 0.23 0.13 0.45 1.0 0.84 0.11 0.09 0.12 0.16 0.12 0.18 0.28 0.09 0.11 0.04 0.02 0.07 0.42 0.43 0.47 0.16 0.03 0.1
Sro8_g006900.1 (Contig89.g1003)
0.0 0.34 1.0 0.4 0.18 0.14 0.18 0.06 0.21 0.14 0.1 0.08 0.32 0.52 0.1 0.05 0.19 0.09 0.5 0.13 0.01 0.37 0.44 0.52 0.15 0.19 0.08
Sro912_g219370.1 (Contig4041.g31035)
0.01 0.4 0.72 0.19 0.48 0.09 0.54 0.59 0.53 0.37 0.13 1.0 0.43 0.84 0.13 0.19 0.1 0.21 0.47 0.11 0.24 0.31 0.53 0.4 0.13 0.06 0.1
Sro945_g223180.1 (Contig53.g399)
0.58 0.55 0.23 0.26 0.28 0.08 0.25 0.24 0.29 0.29 0.08 0.21 0.54 0.09 0.26 0.14 0.13 0.12 0.4 0.56 0.22 0.77 0.31 1.0 0.56 0.19 0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)