Heatmap: Cluster_161 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051830.1 (Contig348.g4736)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 0.51 0.04 0.0 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.3 0.5 0.0 1.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1038_g234260.1 (Contig4312.g32520)
0.02 0.01 0.06 0.01 0.05 0.24 0.48 0.81 0.42 0.47 0.64 0.67 0.44 0.27 0.44 0.33 0.32 0.23 0.52 0.68 0.66 1.0 0.3 0.72 0.96 0.7 0.5
Sro1087_g239900.1 (Contig998.g10097)
0.01 0.27 0.21 0.2 0.16 0.15 0.23 0.46 0.36 0.27 0.14 0.3 0.82 0.18 0.2 0.16 0.14 0.59 0.57 1.0 0.33 0.81 0.23 0.19 0.38 0.23 0.14
Sro1096_g240740.1 (Contig2666.g21562)
0.01 0.11 0.23 0.09 0.17 0.37 0.28 0.54 0.34 0.38 0.38 0.23 0.43 0.13 0.38 0.23 0.21 0.24 0.61 0.4 0.63 0.78 0.33 0.7 1.0 0.44 0.55
Sro10_g008310.1 (Contig1.g55)
0.0 0.08 0.16 0.1 0.06 0.43 0.15 1.0 0.39 0.23 0.36 0.27 0.23 0.31 0.47 0.39 0.26 0.18 0.41 0.16 0.29 0.63 0.1 0.33 0.27 0.21 0.34
Sro113_g055950.1 (Contig4126.g31560)
0.01 0.41 0.44 0.36 0.29 0.0 0.08 1.0 0.64 0.15 0.26 0.0 0.03 0.0 0.13 0.06 0.35 0.07 0.18 0.09 0.04 0.66 0.65 0.0 0.16 0.0 0.01
Sro1179_g249580.1 (Contig1870.g16343)
0.0 0.48 0.23 0.13 0.22 0.06 0.45 0.28 0.56 0.4 0.49 0.41 0.66 0.33 0.32 0.42 0.33 0.42 0.65 1.0 0.41 0.66 0.28 0.24 0.37 0.15 0.22
Sro123_g059470.1 (Contig66.g636)
0.01 0.14 0.04 0.07 0.0 0.02 0.28 0.14 0.03 0.28 0.17 0.28 0.06 0.02 0.17 0.12 0.19 0.05 0.06 0.16 0.77 0.35 0.07 0.49 1.0 0.38 0.16
Sro1258_g256880.1 (Contig3284.g25825)
0.03 0.74 0.7 0.33 0.66 0.07 0.37 0.84 1.0 0.27 0.35 0.08 0.97 0.11 0.12 0.18 0.07 0.8 0.41 0.87 0.41 0.51 0.88 0.16 0.19 0.13 0.24
Sro1306_g261280.1 (Contig1290.g12023)
0.03 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.05 1.0 0.52 0.11 0.74 0.0 0.51 0.03 0.41 0.32 0.2 0.07 0.11 0.41 0.0 0.43 0.14 0.29 0.62 0.39 0.29
0.05 0.01 0.08 0.0 0.0 0.04 0.61 0.27 0.14 0.44 0.58 0.5 0.52 0.15 0.43 0.4 0.46 0.64 0.34 0.65 0.61 0.33 0.21 0.41 1.0 0.98 0.3
Sro1404_g269740.1 (Contig2588.g21002)
0.0 0.25 0.5 0.23 0.23 0.5 0.14 0.66 0.48 0.24 0.36 0.23 0.81 0.11 0.16 0.01 0.26 0.16 0.31 0.57 0.24 1.0 0.47 0.07 0.0 0.25 0.31
Sro1422_g271360.1 (Contig4158.g31746)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.18 0.52 0.31 0.17 0.0 0.14 0.45 0.05 0.19 0.41 0.04 0.56 0.5 1.0 0.25 0.71 0.28 0.15 0.38 0.36 0.13
Sro1457_g274330.1 (Contig749.g8549)
0.03 0.28 0.27 0.14 0.12 0.11 0.72 0.54 0.81 0.68 0.59 0.85 0.83 0.92 0.86 0.74 0.47 0.66 0.48 0.85 0.97 1.0 0.63 0.52 0.25 0.47 0.64
Sro1472_g275550.1 (Contig2029.g17427)
0.03 0.44 0.3 0.41 0.39 0.51 0.36 1.0 0.37 0.47 0.52 0.46 0.83 0.38 0.56 0.58 0.36 0.46 0.5 0.84 0.5 1.0 0.39 0.68 0.43 0.62 0.48
Sro1578_g283660.1 (Contig1633.g14699)
1.0 0.06 0.09 0.16 0.15 0.28 0.33 0.6 0.71 0.4 0.8 0.44 0.06 0.17 0.59 0.37 0.26 0.55 0.4 0.18 0.58 0.65 0.45 0.17 0.51 0.44 0.49
Sro1583_g283910.1 (Contig2117.g17910)
0.03 0.26 0.35 0.15 0.27 0.04 0.24 0.11 0.16 0.43 0.27 0.44 0.17 0.21 0.37 0.51 0.31 0.17 0.08 0.25 0.78 0.33 0.05 0.41 1.0 0.62 0.26
0.0 0.2 0.14 0.09 0.06 0.16 0.61 0.41 0.17 0.54 0.82 0.6 0.74 0.82 0.8 0.83 0.39 0.84 1.0 0.76 0.83 0.97 0.58 0.88 0.68 0.76 0.49
Sro1619_g286480.1 (Contig4638.g34573)
0.01 0.1 0.07 0.02 0.04 0.06 0.11 0.32 0.58 0.2 0.14 0.21 0.52 0.16 0.24 0.16 0.19 0.49 0.45 1.0 0.26 0.46 0.1 0.16 0.12 0.24 0.19
Sro166_g074130.1 (Contig1709.g15292)
0.01 0.18 0.34 0.17 0.18 0.67 0.53 0.69 0.25 0.55 0.2 0.13 0.63 0.0 0.32 1.0 0.53 0.91 0.02 0.46 0.56 0.83 0.27 0.62 0.79 0.87 0.23
Sro175_g077000.1 (Contig1856.g16216)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.2 0.3 0.09 0.46 0.13 0.47 0.72 0.25 0.39 0.34 0.1 1.0 0.89 0.8 0.74 0.21 0.14 0.36 0.74 0.27 0.25
Sro1771_g296630.1 (Contig3831.g29377)
0.0 0.1 0.05 0.07 0.02 0.07 0.23 0.07 0.26 0.32 0.63 0.42 0.73 0.15 0.45 0.55 0.43 0.47 0.75 0.89 0.52 1.0 0.43 0.21 0.33 0.27 0.34
Sro1786_g297440.1 (Contig4705.g34998)
0.02 0.05 0.09 0.04 0.03 0.06 0.63 0.13 0.19 0.65 0.43 0.79 0.71 0.45 0.58 0.7 0.37 1.0 0.87 0.99 0.56 0.5 0.21 0.39 0.3 0.5 0.27
Sro1797_g298180.1 (Contig3752.g28735)
0.02 0.18 0.18 0.2 0.23 0.15 0.32 0.54 0.53 0.37 0.34 0.32 1.0 0.22 0.31 0.36 0.24 0.54 0.62 0.98 0.4 0.54 0.33 0.31 0.49 0.21 0.19
Sro1821_g299770.1 (Contig1361.g12539)
0.01 0.28 0.21 0.26 0.24 0.1 0.34 0.47 0.65 0.41 0.36 0.45 0.92 0.38 0.35 0.18 0.39 0.64 0.77 1.0 0.53 0.71 0.38 0.23 0.45 0.33 0.23
Sro1874_g302970.1 (Contig3840.g29506)
0.09 0.19 0.05 0.07 0.24 0.04 0.3 0.36 0.36 0.44 0.1 0.41 0.74 0.55 0.29 0.25 0.07 0.8 0.87 0.97 0.73 1.0 0.25 0.26 0.32 0.24 0.16
0.03 0.02 0.03 0.0 0.0 0.04 0.43 0.15 0.21 0.31 0.2 0.35 0.22 0.24 0.22 0.28 0.44 0.13 0.06 0.21 1.0 0.33 0.1 0.46 0.83 0.86 0.16
Sro203_g085620.1 (Contig1270.g11856)
0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.11 0.16 0.09 0.03 0.3 0.23 0.43 0.58 0.19 0.34 0.34 0.17 0.34 0.43 1.0 0.5 0.38 0.13 0.23 0.4 0.19 0.16
Sro2120_g315420.1 (Contig3476.g26956)
0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.26 0.1 0.21 0.02 0.19 0.0 0.05 0.16 0.04 0.36 0.54 0.17 0.11 0.76 0.58 0.18 0.13 0.02 0.09
Sro218_g090230.1 (Contig1136.g10924)
0.0 0.05 0.12 0.06 0.09 0.18 0.75 1.0 0.3 0.4 0.44 0.36 0.44 0.33 0.41 0.3 0.35 0.81 0.5 0.51 0.85 1.0 0.27 0.59 0.88 0.73 0.43
Sro2190_g318300.1 (Contig3010.g24033)
0.01 0.5 0.25 0.54 0.41 0.36 0.35 0.43 0.2 0.36 0.38 0.41 0.88 0.23 0.31 0.19 0.22 0.88 0.71 1.0 0.4 0.27 0.14 0.45 0.38 0.24 0.25
Sro2195_g318570.1 (Contig600.g7478)
1.0 0.23 0.18 0.14 0.18 0.2 0.37 0.53 0.48 0.47 0.34 0.52 0.68 0.24 0.45 0.41 0.25 0.4 0.39 0.76 0.52 0.51 0.22 0.34 0.57 0.32 0.28
Sro221_g091080.1 (Contig91.g1031)
0.0 0.58 0.35 0.72 0.53 0.28 0.38 0.52 0.25 0.29 0.43 0.33 0.73 0.21 0.45 0.22 0.21 1.0 0.59 0.73 0.26 0.06 0.17 0.36 0.17 0.17 0.29
Sro224_g091530.1 (Contig758.g8607)
0.62 0.28 0.28 0.15 0.21 0.3 0.3 0.71 0.57 0.44 0.3 0.51 1.0 0.37 0.31 0.37 0.3 0.43 0.58 0.95 0.63 0.65 0.29 0.51 0.9 0.48 0.2
Sro2268_g321310.1 (Contig1483.g13558)
0.01 0.38 0.19 0.3 0.26 0.03 0.2 0.5 0.37 0.32 0.16 0.25 0.48 0.14 0.17 0.26 0.12 0.58 0.72 0.82 0.54 1.0 0.13 0.19 0.39 0.22 0.16
Sro232_g093970.1 (Contig4063.g31162)
0.7 0.26 0.44 0.31 0.24 0.15 0.46 0.41 0.42 0.54 0.49 0.73 0.63 0.59 0.44 0.45 0.42 0.28 0.42 0.64 0.57 0.71 0.37 0.68 1.0 0.69 0.39
Sro2338_g323910.1 (Contig557.g7097)
0.02 0.07 0.03 0.06 0.04 0.03 0.27 0.44 0.43 0.28 0.24 0.15 0.67 0.02 0.2 0.21 0.17 0.27 0.37 1.0 0.42 0.42 0.17 0.17 0.32 0.5 0.25
Sro2463_g328440.1 (Contig2143.g18014)
0.01 0.07 0.08 0.01 0.02 0.04 0.07 0.44 0.2 0.13 0.51 0.01 0.58 0.07 0.42 0.39 0.11 0.27 0.1 0.41 0.01 0.31 0.1 0.41 1.0 0.85 0.39
0.0 0.15 0.41 0.31 0.0 0.13 0.18 0.33 0.0 0.4 0.18 0.32 0.0 0.2 0.2 0.56 0.48 0.46 0.12 0.25 1.0 0.95 0.04 0.15 0.49 0.37 0.63
Sro2730_g335730.1 (Contig943.g9770)
0.1 0.06 0.12 0.02 0.0 0.04 0.15 0.47 0.24 0.31 0.34 0.25 0.44 0.05 0.22 0.39 0.05 0.66 1.0 0.7 0.63 0.69 0.24 0.08 0.3 0.25 0.2
Sro306_g113060.1 (Contig3593.g27780)
0.0 1.0 0.32 0.33 0.62 0.03 0.03 0.62 0.01 0.23 0.0 0.1 0.64 0.01 0.03 0.02 0.0 0.81 0.37 0.92 0.1 0.94 0.24 0.04 0.0 0.02 0.04
Sro319_g116360.1 (Contig204.g2476)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.35 0.0 0.0 0.36 0.22 0.3 0.4 0.43 0.17 0.3 0.43 0.49 0.95 1.0 0.39 0.22 0.3 0.37 0.43 0.18 0.39
Sro3297_g346320.1 (Contig3020.g24084)
0.02 0.31 0.25 0.29 0.32 0.42 0.27 0.6 0.28 0.31 0.46 0.32 0.73 0.09 0.27 0.27 0.25 0.59 0.83 1.0 0.26 0.4 0.16 0.18 0.42 0.16 0.28
Sro385_g131670.1 (Contig3292.g25849)
1.0 0.15 0.19 0.24 0.2 0.11 0.36 0.49 0.49 0.37 0.47 0.31 0.37 0.29 0.34 0.44 0.23 0.27 0.42 0.53 0.51 0.21 0.15 0.29 0.35 0.16 0.26
Sro386_g131850.1 (Contig4061.g31126)
0.0 0.22 0.0 0.11 0.0 0.19 0.17 0.05 0.07 0.21 0.3 0.24 0.0 0.19 0.22 0.65 0.03 0.08 0.0 0.0 0.78 0.61 0.02 0.1 1.0 0.57 0.27
Sro3_g002470.1 (Contig3832.g29432)
0.14 0.05 0.04 0.03 0.04 0.02 0.3 0.4 0.4 0.32 0.12 0.34 0.46 0.07 0.08 0.08 0.08 0.19 0.19 1.0 0.49 0.72 0.23 0.28 0.41 0.27 0.07
Sro430_g141240.1 (Contig4379.g32918)
0.04 0.14 0.18 0.07 0.09 0.07 0.27 0.81 1.0 0.19 0.04 0.18 0.56 0.25 0.13 0.07 0.07 0.41 0.64 0.73 0.12 0.4 0.71 0.06 0.04 0.02 0.13
0.05 0.06 0.0 0.17 0.0 0.08 0.2 0.33 0.33 0.21 0.23 0.12 0.69 0.16 0.09 0.15 0.24 0.65 0.81 1.0 0.06 0.6 0.21 0.16 0.13 0.12 0.18
Sro496_g154660.1 (Contig3388.g26496)
0.0 0.06 0.0 0.16 0.23 0.01 0.29 0.45 0.24 0.29 0.35 0.41 1.0 0.22 0.32 0.33 0.16 0.47 0.4 0.9 0.52 0.45 0.18 0.13 0.4 0.25 0.17
Sro4_g003120.1 (Contig3815.g29230)
0.08 0.07 0.05 0.06 0.07 0.09 0.37 0.25 0.17 0.44 0.45 0.44 0.78 0.53 0.3 0.26 0.23 0.37 0.95 1.0 0.53 0.61 0.41 0.63 0.42 0.3 0.25
Sro509_g157110.1 (Contig4289.g32404)
0.01 0.52 0.82 0.45 0.58 0.06 0.36 0.77 0.49 0.31 0.3 0.33 0.66 0.72 0.37 0.39 0.1 0.27 0.26 0.41 0.4 1.0 0.46 0.09 0.37 0.25 0.18
Sro544_g163700.1 (Contig3214.g25424)
0.04 0.02 0.06 0.07 0.09 0.01 0.07 0.86 0.39 0.1 0.08 0.18 0.24 0.41 0.11 0.55 0.0 0.02 0.05 0.01 0.13 0.33 0.09 0.67 1.0 0.25 0.09
Sro589_g171780.1 (Contig2898.g23115)
0.23 0.03 0.03 0.02 0.01 0.08 0.68 0.27 0.12 0.38 0.42 0.28 0.26 0.25 0.49 0.64 0.28 0.25 0.19 0.38 0.45 0.27 0.14 0.64 1.0 0.3 0.19
Sro5_g004040.1 (Contig4001.g30719)
0.0 0.37 0.51 0.54 0.15 0.33 0.62 0.68 0.17 0.5 0.61 0.49 0.9 0.74 0.53 0.69 0.6 0.46 0.38 1.0 0.54 0.72 0.15 0.38 0.71 0.38 0.39
Sro632_g178660.1 (Contig512.g6774)
0.03 0.18 0.2 0.15 0.1 0.55 0.65 0.64 0.55 0.45 0.61 0.47 0.81 0.3 0.75 0.91 0.34 0.32 0.28 0.78 0.53 1.0 0.47 0.72 0.73 0.45 0.53
Sro648_g181060.1 (Contig423.g5677)
0.03 0.15 0.07 0.08 0.09 0.11 0.23 0.24 0.22 0.28 0.28 0.26 0.49 0.1 0.27 0.27 0.34 0.58 0.86 1.0 0.28 0.85 0.25 0.22 0.17 0.16 0.18
Sro724_g193180.1 (Contig824.g9148)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.73 0.0 0.02 0.0 0.0 0.08 0.15 1.0 0.0 0.45 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro796_g203710.1 (Contig2034.g17469)
0.01 0.05 0.02 0.06 0.0 0.02 0.38 0.19 0.24 0.51 0.58 0.66 0.76 0.51 0.42 0.51 0.03 0.75 0.69 1.0 0.7 0.48 0.41 0.35 0.24 0.39 0.26
0.0 0.07 0.05 0.04 0.01 0.1 0.61 0.46 0.19 0.37 0.38 0.34 0.28 0.09 0.54 0.68 0.52 0.63 0.39 0.39 0.98 0.3 0.09 0.55 1.0 0.35 0.31
Sro820_g207230.1 (Contig34.g205)
0.0 0.05 0.07 0.1 0.09 0.05 0.51 0.72 0.22 0.46 0.26 0.42 0.27 0.12 0.46 0.59 0.22 0.57 0.28 0.68 0.97 1.0 0.21 0.2 0.56 0.32 0.37
Sro821_g207430.1 (Contig535.g6950)
0.0 0.05 0.02 0.14 0.07 0.01 0.23 0.08 0.08 0.23 0.13 0.04 0.84 0.35 0.52 0.53 0.28 0.57 0.28 1.0 0.22 0.31 0.22 0.27 0.35 0.18 0.19
Sro845_g210020.1 (Contig2192.g18254)
0.02 0.06 0.05 0.0 0.0 0.08 0.48 0.32 0.25 0.61 0.27 0.67 0.56 0.3 0.28 0.21 0.24 0.46 0.77 1.0 0.76 0.78 0.25 0.26 0.37 0.21 0.24
Sro86_g045710.1 (Contig2999.g23849)
0.0 0.14 0.25 0.23 0.12 1.0 0.41 0.87 0.62 0.51 0.49 0.45 0.46 0.35 0.67 0.68 0.66 0.56 0.34 0.39 0.83 0.94 0.33 0.67 0.96 0.8 0.38
Sro905_g218500.1 (Contig2792.g22462)
0.63 0.0 0.0 0.01 0.0 0.13 0.26 0.37 0.39 0.34 0.17 0.45 0.61 0.22 0.19 0.24 0.27 0.53 0.71 1.0 0.41 0.77 0.4 0.22 0.33 0.29 0.17
Sro920_g220280.1 (Contig2508.g20528)
0.0 0.25 0.06 0.1 0.21 0.03 0.14 0.11 0.08 0.16 0.01 0.14 0.12 0.09 0.12 0.08 0.0 1.0 0.62 0.65 0.08 0.77 0.29 0.02 0.0 0.11 0.11
Sro94_g049050.1 (Contig150.g1695)
0.01 0.7 0.32 0.32 0.33 0.06 0.39 0.7 0.55 0.42 0.35 0.47 0.75 0.12 0.4 0.32 0.33 0.84 0.68 1.0 0.64 0.89 0.6 0.25 0.36 0.22 0.31
Sro964_g225430.1 (Contig2151.g18105)
0.0 0.44 0.42 0.44 0.36 0.06 0.25 0.42 0.14 0.43 0.28 0.49 0.97 0.42 0.44 0.53 0.3 0.56 0.68 1.0 0.68 0.41 0.14 0.56 0.6 0.38 0.24
Sro991_g228750.1 (Contig3422.g26681)
0.0 0.14 0.5 0.12 0.53 0.0 0.02 0.63 0.3 0.06 0.0 0.04 0.31 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.08 0.19 0.0 1.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)