Heatmap: Cluster_99 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1024_g232630.1 (Contig4464.g33542)	0.07	0.11	0.03	0.05	0.09	0.28	0.52	0.45	0.2	0.49	0.31	0.51	0.52	0.58	0.63	1.0	0.36	0.61	0.47	0.32	0.48	0.14	0.22	0.33	0.52	0.25	0.58
Sro114_g056310.1 (Contig1482.g13531)	0.02	0.76	0.32	0.28	0.44	0.65	0.6	0.57	0.24	0.72	0.41	0.78	0.26	0.69	0.79	1.0	0.31	0.75	0.55	0.32	0.66	0.22	0.26	0.24	0.31	0.22	0.94
Sro1157_g247360.1 (Contig443.g5946)	0.17	0.27	0.31	0.2	0.24	0.48	0.49	0.5	0.39	0.67	0.53	0.7	0.95	0.66	0.66	1.0	0.49	0.81	0.9	0.96	0.59	0.35	0.37	0.45	0.45	0.54	0.6
Sro120_g058300.1 (Contig2411.g19708)	0.05	0.08	0.06	0.09	0.12	0.19	0.41	0.31	0.28	0.5	0.34	0.58	0.38	0.42	0.5	1.0	0.3	0.5	0.47	0.5	0.42	0.28	0.26	0.13	0.21	0.16	0.35
Sro1221_g253700.1 (Contig1854.g16194)	0.03	0.25	0.16	0.18	0.24	0.43	0.43	0.33	0.25	0.56	0.45	0.58	0.85	0.54	0.6	1.0	0.42	0.57	0.53	0.59	0.51	0.27	0.26	0.31	0.48	0.29	0.54
Sro1247_g255920.1 (Contig2843.g22832)	0.03	0.17	0.07	0.1	0.14	0.23	0.37	0.21	0.24	0.57	0.35	0.55	1.0	0.4	0.53	0.82	0.26	0.62	0.48	0.9	0.5	0.12	0.14	0.24	0.31	0.28	0.46
Sro1282_g258990.1 (Contig1370.g12590)	0.03	0.44	0.06	0.08	0.33	0.45	0.52	0.38	0.16	0.69	0.43	0.59	0.67	0.6	0.62	1.0	0.12	0.48	0.42	0.77	0.92	0.06	0.1	0.41	0.62	0.41	0.67
Sro1337_g264140.1 (Contig951.g9836)	0.01	0.14	0.27	0.14	0.14	0.1	0.15	0.37	0.09	0.3	0.18	0.33	0.79	0.25	0.38	1.0	0.09	0.59	0.7	0.46	0.41	0.15	0.08	0.2	0.29	0.19	0.33
Sro1356_g265710.1 (Contig4429.g33240)	0.03	0.89	0.52	0.64	0.77	0.72	0.77	0.66	0.35	0.83	0.31	0.8	0.15	0.56	0.86	1.0	0.18	0.97	0.81	0.16	0.58	0.05	0.3	0.3	0.1	0.05	0.98
Sro1421_g271220.1 (Contig1450.g13289)	0.04	0.19	0.1	0.1	0.13	0.36	0.37	0.29	0.2	0.56	0.37	0.53	1.0	0.61	0.6	1.0	0.36	0.6	0.53	0.67	0.54	0.32	0.21	0.23	0.35	0.28	0.52
Sro1563_g282700.1 (Contig1017.g10180)	0.13	0.17	0.28	0.4	0.38	0.15	0.29	0.21	0.2	0.43	0.31	0.71	0.5	0.36	0.4	1.0	0.27	0.34	0.33	0.49	0.38	0.15	0.21	0.14	0.25	0.17	0.27
Sro1642_g288070.1 (Contig4503.g33765)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.21	0.13	0.34	0.05	0.09	0.21	1.0	0.11	0.06	0.02	0.08	0.15	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.14
Sro1727_g293900.1 (Contig2229.g18502)	0.01	0.08	0.08	0.03	0.02	0.97	0.55	0.42	0.23	0.81	0.74	1.0	0.43	0.76	0.78	0.76	0.36	0.36	0.32	0.37	0.92	0.32	0.18	0.58	0.9	0.58	0.91
Sro173_g076330.1 (Contig2926.g23314)	0.08	0.38	0.16	0.16	0.23	0.53	0.48	0.31	0.12	0.82	0.64	0.74	0.21	0.81	0.82	1.0	0.64	0.48	0.54	0.36	0.74	0.1	0.13	0.47	0.86	0.45	0.82
Sro175_g077020.1 (Contig1856.g16218)	0.17	0.2	0.1	0.11	0.18	0.5	0.37	0.26	0.26	0.57	0.39	0.57	0.54	0.55	0.65	1.0	0.34	0.67	0.63	0.82	0.62	0.25	0.24	0.3	0.36	0.27	0.61
Sro178_g078230.1 (Contig275.g3548)	0.02	0.07	0.08	0.1	0.13	0.23	0.4	0.39	0.28	0.45	0.38	0.52	1.0	0.29	0.51	0.69	0.24	0.39	0.31	0.67	0.47	0.19	0.19	0.25	0.34	0.17	0.45
Sro179_g078390.1 (Contig4117.g31431)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.18	0.08	0.06	0.39	0.14	0.4	1.0	0.36	0.4	0.63	0.16	0.35	0.29	0.59	0.5	0.08	0.09	0.14	0.25	0.15	0.26
Sro17_g012280.1 (Contig269.g3407)	0.04	0.4	0.11	0.1	0.24	0.19	0.29	0.28	0.2	0.45	0.26	0.36	0.32	0.44	0.53	1.0	0.32	0.7	0.59	0.38	0.5	0.35	0.2	0.06	0.04	0.1	0.47
Sro181_g078960.1 (Contig4257.g32223)	0.05	0.37	0.14	0.24	0.49	0.31	0.4	0.32	0.23	0.71	0.52	0.88	0.93	0.68	0.64	0.94	0.79	0.48	0.47	1.0	0.56	0.1	0.19	0.26	0.37	0.3	0.49
Sro18_g013140.1 (Contig1351.g12474)	0.07	0.23	0.18	0.18	0.25	0.34	0.54	0.41	0.32	0.66	0.48	0.84	0.56	0.67	0.73	1.0	0.4	0.62	0.47	0.65	0.6	0.16	0.23	0.33	0.58	0.37	0.52
Sro196_g083480.1 (Contig3206.g25344)	0.06	0.21	0.13	0.15	0.17	0.35	0.42	0.3	0.22	0.62	0.42	0.71	0.69	0.66	0.57	1.0	0.4	0.49	0.49	0.47	0.59	0.21	0.24	0.26	0.32	0.25	0.56
Sro200_g084650.1 (Contig201.g2356)	0.07	0.16	0.12	0.09	0.08	0.24	0.43	0.29	0.26	0.55	0.53	0.66	0.75	0.59	0.59	1.0	0.47	0.23	0.22	0.6	0.49	0.24	0.24	0.45	0.75	0.43	0.56
Sro209_g087380.1 (Contig4070.g31209)	0.04	0.29	0.21	0.22	0.25	0.45	0.59	0.41	0.3	0.61	0.5	0.56	0.86	0.66	0.65	1.0	0.51	0.92	0.74	0.61	0.71	0.3	0.34	0.43	0.67	0.41	0.57
Sro21_g014880.1 (Contig813.g9078)	0.15	0.57	0.22	0.28	0.41	0.58	0.32	0.45	0.17	0.75	0.3	0.72	0.64	0.69	0.63	1.0	0.27	0.57	0.48	0.64	0.84	0.34	0.18	0.13	0.37	0.12	0.71
Sro228_g092710.1 (Contig1235.g11585)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.03	0.01	0.22	0.1	0.39	0.05	0.11	0.25	1.0	0.09	0.06	0.05	0.06	0.17	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.17
Sro228_g092790.1 (Contig1235.g11593)	0.11	0.0	0.01	0.01	0.02	0.06	0.11	0.07	0.04	0.49	0.29	1.0	0.3	0.24	0.28	0.9	0.2	0.1	0.09	0.23	0.3	0.03	0.03	0.06	0.01	0.04	0.26
Sro2314_g322920.1 (Contig3467.g26906)	0.06	0.05	0.05	0.05	0.16	0.11	0.2	0.25	0.19	0.46	0.32	0.84	0.22	0.29	0.42	1.0	0.29	0.21	0.2	0.33	0.28	0.2	0.14	0.12	0.18	0.17	0.28
Sro2314_g322930.1 (Contig3467.g26907)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.07	0.04	0.09	0.05	0.28	0.17	0.5	0.38	0.13	0.26	1.0	0.2	0.07	0.09	0.2	0.15	0.03	0.04	0.01	0.01	0.04	0.26
Sro2318_g323060.1 (Contig1175.g11212)	0.1	0.33	0.17	0.2	0.34	0.48	0.73	0.6	0.46	0.71	0.53	0.68	0.81	0.82	0.79	1.0	0.42	0.79	0.62	0.55	0.68	0.24	0.44	0.23	0.12	0.14	0.78
Sro245_g097590.1 (Contig3087.g24630)	0.06	0.39	0.24	0.22	0.26	0.46	0.59	0.49	0.37	0.63	0.45	0.67	1.0	0.7	0.63	0.97	0.41	0.73	0.55	0.6	0.62	0.26	0.34	0.46	0.51	0.34	0.6
Sro256_g100660.1 (Contig3587.g27711)	0.12	0.2	0.13	0.14	0.18	0.48	0.46	0.38	0.32	0.66	0.46	0.69	0.59	0.84	0.64	1.0	0.43	0.72	0.6	0.54	0.58	0.23	0.31	0.34	0.33	0.26	0.65
Sro266_g103020.1 (Contig1823.g16033)	0.12	0.79	0.34	0.3	0.48	0.73	0.71	0.61	0.41	0.87	0.39	0.8	0.17	0.75	0.85	1.0	0.4	0.76	0.51	0.23	0.97	0.54	0.48	0.23	0.19	0.12	0.98
Sro277_g106140.1 (Contig444.g5952)	0.04	0.13	0.12	0.15	0.22	0.25	0.37	0.49	0.28	0.42	0.26	0.5	1.0	0.4	0.47	0.68	0.15	0.55	0.41	0.53	0.34	0.2	0.16	0.2	0.31	0.16	0.42
Sro2803_g337430.1 (Contig1927.g16624)	0.07	0.38	0.18	0.19	0.24	0.32	0.48	0.4	0.29	0.63	0.43	0.64	0.79	0.66	0.65	1.0	0.37	0.66	0.57	0.58	0.61	0.42	0.3	0.33	0.53	0.32	0.53
Sro305_g112800.1 (Contig560.g7121)	0.05	0.45	0.24	0.17	0.2	0.39	0.66	0.52	0.3	0.63	0.42	0.64	0.79	0.62	0.62	1.0	0.41	0.69	0.52	0.51	0.66	0.22	0.31	0.31	0.49	0.31	0.6
Sro30_g019420.1 (Contig3962.g30342)	0.05	0.35	0.21	0.19	0.25	0.51	0.75	0.46	0.44	0.78	0.38	0.99	0.93	0.8	0.69	1.0	0.43	0.79	0.66	0.71	0.83	0.32	0.41	0.48	0.76	0.44	0.61
Sro3112_g343960.1 (Contig1992.g17054)	0.0	0.11	0.1	0.09	0.1	0.3	0.42	0.46	0.08	0.59	0.36	0.55	0.34	0.4	0.6	1.0	0.4	0.38	0.41	0.55	0.6	0.29	0.08	0.24	0.63	0.31	0.65
Sro32_g020740.1 (Contig3715.g28547)	0.14	0.22	0.2	0.12	0.13	0.08	0.67	0.39	0.32	0.62	0.45	0.69	0.94	0.25	0.43	0.57	0.34	0.45	0.46	1.0	0.64	0.07	0.19	0.44	0.67	0.36	0.28
Sro336_g120420.1 (Contig4022.g30931)	0.04	0.45	0.21	0.25	0.32	0.38	0.34	0.31	0.18	0.56	0.32	0.6	0.34	0.61	0.63	1.0	0.28	0.28	0.27	0.21	0.44	0.38	0.21	0.16	0.18	0.18	0.53
Sro352_g124310.1 (Contig2645.g21407)	0.01	0.07	0.05	0.05	0.07	0.25	0.42	0.35	0.22	0.42	0.31	0.39	0.84	0.41	0.54	1.0	0.31	0.67	0.49	0.52	0.44	0.31	0.18	0.24	0.36	0.21	0.4
Sro358_g125760.1 (Contig1210.g11363)	0.23	0.26	0.24	0.25	0.28	0.41	0.56	0.55	0.3	0.68	0.6	0.82	0.89	0.46	0.77	1.0	0.57	0.78	0.58	0.7	0.84	0.08	0.25	0.39	0.45	0.28	0.59
Sro376_g129840.1 (Contig3640.g28134)	0.07	0.28	0.27	0.27	0.28	0.36	0.49	0.51	0.32	0.72	0.57	0.75	0.74	0.54	0.68	1.0	0.35	0.44	0.51	0.71	0.72	0.35	0.23	0.33	0.48	0.41	0.66
Sro383_g131240.1 (Contig132.g1489)	0.04	0.48	0.28	0.29	0.3	0.37	0.59	0.48	0.29	0.65	0.42	0.72	0.96	0.55	0.58	1.0	0.42	0.71	0.62	0.69	0.58	0.26	0.25	0.39	0.63	0.35	0.57
Sro470_g149440.1 (Contig850.g9338)	0.04	0.04	0.02	0.12	0.34	0.07	0.08	0.04	0.01	0.31	0.09	0.6	0.07	0.24	0.29	1.0	0.2	0.08	0.07	0.04	0.16	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.2
Sro496_g154630.1 (Contig3388.g26493)	0.06	0.24	0.09	0.15	0.17	0.65	0.69	0.53	0.41	0.78	0.61	0.74	0.69	1.0	0.77	0.93	0.53	0.92	0.66	0.91	0.87	0.44	0.44	0.45	0.35	0.25	0.81
Sro506_g156360.1 (Contig3494.g27113)	0.09	0.27	0.16	0.15	0.17	0.43	0.52	0.45	0.28	0.64	0.42	0.69	0.49	0.74	0.62	1.0	0.36	0.61	0.54	0.41	0.61	0.21	0.26	0.42	0.5	0.38	0.62
Sro518_g158760.1 (Contig3565.g27531)	0.05	0.24	0.14	0.16	0.18	0.44	0.48	0.36	0.29	0.61	0.44	0.63	0.92	0.61	0.63	1.0	0.42	0.6	0.59	0.72	0.54	0.34	0.34	0.28	0.39	0.29	0.54
Sro556_g166000.1 (Contig1584.g14391)	0.11	0.33	0.18	0.13	0.15	0.39	0.66	0.43	0.38	0.72	0.41	0.92	0.95	0.8	0.64	1.0	0.36	0.81	0.68	0.8	0.81	0.3	0.43	0.49	0.65	0.35	0.53
Sro56_g032910.1 (Contig3029.g24167)	0.05	0.19	0.14	0.19	0.24	0.37	0.25	0.2	0.13	0.48	0.31	0.47	0.83	0.55	0.47	1.0	0.28	0.45	0.48	0.52	0.34	0.16	0.13	0.15	0.12	0.15	0.44
Sro58_g033950.1 (Contig64.g589)	0.09	0.56	0.39	0.46	0.51	0.39	0.54	0.5	0.48	0.66	0.48	0.7	0.82	0.54	0.59	1.0	0.35	0.65	0.62	0.64	0.66	0.47	0.41	0.36	0.53	0.37	0.54
Sro684_g186750.1 (Contig2085.g17779)	0.06	0.06	0.05	0.03	0.07	0.25	0.5	0.63	0.35	0.52	0.57	0.48	1.0	0.32	0.64	0.99	0.35	0.67	0.61	0.57	0.65	0.37	0.21	0.48	0.74	0.46	0.6
Sro69_g038570.1 (Contig4677.g34766)	0.01	0.05	0.07	0.08	0.09	0.15	0.33	0.36	0.32	0.34	0.42	0.36	0.96	0.22	0.48	1.0	0.29	0.53	0.36	0.68	0.41	0.12	0.16	0.2	0.32	0.16	0.37
Sro730_g194100.1 (Contig80.g842)	0.05	0.34	0.17	0.24	0.34	0.3	0.46	0.28	0.22	0.64	0.29	0.69	1.0	0.33	0.47	0.6	0.32	0.34	0.34	0.92	0.63	0.16	0.18	0.19	0.26	0.23	0.4
Sro731_g194200.1 (Contig3971.g30480)	0.05	0.15	0.15	0.12	0.19	0.29	0.48	0.34	0.26	0.61	0.4	0.56	0.66	0.68	0.57	1.0	0.34	0.69	0.47	0.56	0.73	0.27	0.21	0.4	0.56	0.28	0.46
Sro764_g199090.1 (Contig1534.g13938)	0.02	0.7	0.37	0.33	0.44	0.6	0.46	0.33	0.2	0.7	0.35	0.55	0.43	0.55	0.74	1.0	0.19	0.92	0.76	0.55	0.54	0.19	0.18	0.17	0.2	0.07	0.88
Sro791_g203020.1 (Contig1638.g14768)	0.13	0.33	0.12	0.18	0.24	0.28	0.51	0.42	0.36	0.65	0.15	0.88	0.79	0.79	0.68	1.0	0.33	0.33	0.28	0.76	0.49	0.24	0.24	0.06	0.04	0.05	0.66
Sro932_g221580.1 (Contig2857.g22901)	0.06	0.22	0.3	0.36	0.36	0.34	0.41	0.5	0.43	0.75	0.6	1.0	0.47	0.45	0.63	0.99	0.54	0.58	0.57	0.72	0.8	0.25	0.39	0.25	0.31	0.3	0.61

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)