Heatmap: Cluster_246 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1136_g245170.1 (Contig1812.g15969)	0.06	0.03	0.01	0.01	0.0	0.04	0.2	0.08	0.1	0.43	0.26	0.5	0.75	0.69	0.35	1.0	0.23	0.33	0.49	0.86	0.65	0.42	0.13	0.1	0.36	0.26	0.21
Sro1313_g261980.1 (Contig4199.g31966)	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.05	0.14	0.07	0.15	0.24	0.1	0.21	0.78	0.45	0.26	0.79	0.14	0.28	0.36	1.0	0.41	0.2	0.06	0.11	0.37	0.19	0.12
Sro1384_g268120.1 (Contig2234.g18574)	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.17	0.05	0.26	0.26	0.11	0.31	0.66	0.53	0.28	1.0	0.17	0.37	0.32	0.57	0.34	0.26	0.18	0.03	0.05	0.1	0.09
Sro141_g065730.1 (Contig65.g597)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.11	0.09	0.16	0.3	0.12	0.3	0.78	0.42	0.23	1.0	0.17	0.57	0.48	0.73	0.33	0.13	0.08	0.03	0.07	0.25	0.12
Sro142_g066280.1 (Contig226.g2677)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.25	0.12	0.24	0.35	0.14	0.42	0.75	0.65	0.29	1.0	0.14	0.47	0.33	0.87	0.58	0.39	0.14	0.08	0.18	0.16	0.1
Sro1531_g280190.1 (Contig2576.g20925)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.14	0.09	0.04	0.19	0.1	0.26	0.48	0.21	0.26	1.0	0.11	0.42	0.44	0.24	0.22	0.05	0.05	0.03	0.08	0.06	0.11
Sro1535_g280540.1 (Contig3021.g24091)	0.04	0.06	0.06	0.09	0.12	0.12	0.27	0.21	0.15	0.29	0.15	0.4	0.59	0.33	0.34	1.0	0.16	0.29	0.25	0.31	0.35	0.08	0.15	0.1	0.17	0.12	0.18
Sro1537_g280690.1 (Contig3053.g24293)	0.0	0.07	0.06	0.06	0.1	0.04	0.18	0.07	0.2	0.34	0.21	0.37	0.9	0.6	0.29	0.86	0.22	0.39	0.36	1.0	0.65	0.39	0.18	0.08	0.13	0.12	0.14
Sro15_g011040.1 (Contig791.g8830)	0.24	0.1	0.07	0.07	0.19	0.23	0.4	0.2	0.25	0.56	0.28	0.69	0.93	0.61	0.45	1.0	0.26	0.51	0.59	0.73	0.52	0.43	0.25	0.25	0.52	0.27	0.25
Sro1601_g285180.1 (Contig4269.g32302)	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.07	0.05	0.06	0.22	0.11	0.14	0.68	0.34	0.3	1.0	0.11	0.54	0.58	0.39	0.16	0.07	0.03	0.11	0.2	0.19	0.1
Sro1634_g287500.1 (Contig879.g9442)	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.22	0.17	0.19	0.24	0.09	0.29	0.14	0.23	0.26	1.0	0.07	0.25	0.24	0.14	0.23	0.04	0.07	0.07	0.08	0.05	0.14
Sro174_g076600.1 (Contig4298.g32444)	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.06	0.05	0.28	0.08	0.36	0.37	0.36	0.2	1.0	0.12	0.26	0.3	0.42	0.39	0.14	0.07	0.06	0.12	0.1	0.08
Sro177_g077640.1 (Contig795.g8890)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.07	0.05	0.01	0.21	0.02	0.18	0.03	0.16	0.18	1.0	0.03	0.18	0.11	0.07	0.36	0.05	0.02	0.0	0.0	0.02	0.06
Sro1819_g299690.1 (Contig1484.g13568)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.18	0.0	0.19	0.49	0.29	0.22	1.0	0.03	0.13	0.2	0.41	0.37	0.23	0.05	0.04	0.01	0.06	0.1
Sro1835_g300610.1 (Contig4635.g34567)	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.16	0.02	0.19	0.26	0.06	0.14	1.0	0.47	0.19	0.48	0.1	0.34	0.41	1.0	0.36	0.25	0.13	0.01	0.03	0.15	0.08
Sro1943_g306870.1 (Contig3086.g24599)	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01	0.17	0.01	0.18	0.17	0.14	0.16	1.0	0.06	0.29	0.29	0.16	0.23	0.02	0.02	0.03	0.15	0.06	0.04
Sro1993_g309900.1 (Contig1033.g10269)	0.01	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.07	0.05	0.07	0.24	0.06	0.25	0.49	0.48	0.21	1.0	0.09	0.33	0.42	0.53	0.35	0.37	0.06	0.03	0.09	0.14	0.08
Sro1_g000510.1 (Contig3007.g23966)	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.18	0.06	0.25	0.28	0.17	0.26	0.68	0.62	0.34	1.0	0.26	0.48	0.47	0.58	0.33	0.37	0.17	0.06	0.09	0.16	0.09
Sro2015_g311070.1 (Contig3461.g26852)	0.0	0.01	0.01	0.03	0.04	0.14	0.21	0.07	0.13	0.37	0.15	0.36	0.9	0.61	0.39	1.0	0.22	0.56	0.46	0.61	0.42	0.17	0.12	0.07	0.18	0.16	0.17
Sro2045_g312460.1 (Contig2859.g22931)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.0	0.14	0.03	0.16	0.13	0.15	0.14	1.0	0.02	0.1	0.1	0.08	0.26	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01	0.03
Sro23_g016110.1 (Contig2259.g18761)	0.02	0.0	0.0	0.0	0.04	0.05	0.1	0.06	0.03	0.21	0.04	0.22	0.08	0.27	0.37	1.0	0.05	0.42	0.32	0.08	0.16	0.01	0.03	0.02	0.0	0.01	0.12
Sro2507_g329720.1 (Contig3389.g26500)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.1	0.05	0.32	0.32	0.12	0.3	0.59	0.61	0.29	1.0	0.19	0.33	0.21	0.63	0.61	0.24	0.1	0.05	0.17	0.15	0.06
Sro2552_g330990.1 (Contig4642.g34599)	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.09	0.05	0.08	0.25	0.1	0.21	1.0	0.32	0.2	0.85	0.09	0.38	0.33	0.8	0.36	0.27	0.07	0.06	0.14	0.06	0.08
Sro257_g100970.1 (Contig2018.g17276)	0.05	0.18	0.1	0.18	0.15	0.11	0.53	0.37	0.71	0.55	0.38	0.67	0.92	0.5	0.55	1.0	0.34	0.44	0.51	0.99	0.48	0.18	0.26	0.28	0.6	0.36	0.25
Sro2629_g333070.1 (Contig3211.g25383)	0.02	0.01	0.0	0.0	0.01	0.03	0.19	0.05	0.21	0.23	0.12	0.23	0.61	0.55	0.28	1.0	0.14	0.3	0.27	0.64	0.32	0.24	0.22	0.03	0.04	0.07	0.08
Sro289_g108940.1 (Contig4471.g33578)	0.0	0.04	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.12	0.22	0.1	0.25	0.75	0.43	0.34	1.0	0.15	0.33	0.33	0.61	0.28	0.31	0.09	0.02	0.06	0.08	0.12
Sro292_g109630.1 (Contig484.g6533)	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.17	0.09	0.12	0.3	0.13	0.45	1.0	0.5	0.25	0.8	0.14	0.34	0.27	0.78	0.38	0.27	0.12	0.08	0.13	0.11	0.09
Sro3146_g344440.1 (Contig4187.g31911)	0.03	0.15	0.11	0.13	0.16	0.23	0.47	0.36	0.28	0.49	0.25	0.64	0.66	0.59	0.48	1.0	0.31	0.42	0.35	0.68	0.72	0.35	0.29	0.3	0.39	0.22	0.24
Sro354_g124760.1 (Contig4485.g33699)	0.01	0.06	0.02	0.0	0.01	0.06	0.61	1.0	0.56	0.47	0.33	0.55	0.65	0.61	0.43	0.64	0.38	0.25	0.39	0.77	0.74	0.49	0.46	0.25	0.66	0.26	0.25
Sro369_g128110.1 (Contig1690.g15134)	0.05	0.08	0.06	0.08	0.11	0.18	0.27	0.2	0.15	0.34	0.23	0.39	0.84	0.31	0.35	1.0	0.26	0.57	0.55	0.51	0.41	0.19	0.19	0.16	0.21	0.18	0.18
Sro37_g023040.1 (Contig1425.g13120)	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.05	0.11	0.06	0.04	0.27	0.1	0.28	0.59	0.38	0.29	1.0	0.13	0.4	0.39	0.44	0.39	0.08	0.03	0.05	0.08	0.16	0.16
Sro392_g133380.1 (Contig4514.g33844)	0.05	0.02	0.03	0.05	0.12	0.06	0.18	0.13	0.12	0.26	0.11	0.32	0.43	0.27	0.3	1.0	0.14	0.38	0.32	0.28	0.29	0.1	0.15	0.06	0.12	0.11	0.14
Sro39_g024010.1 (Contig234.g2821)	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.14	0.3	0.17	0.27	0.48	0.21	0.54	0.99	0.9	0.37	0.81	0.22	0.41	0.43	1.0	0.69	0.42	0.15	0.21	0.42	0.47	0.2
Sro45_g027130.1 (Contig2311.g19095)	0.04	0.02	0.0	0.01	0.01	0.04	0.12	0.09	0.32	0.33	0.21	0.3	0.65	0.82	0.36	1.0	0.17	0.19	0.22	0.71	0.58	0.33	0.1	0.04	0.12	0.16	0.13
Sro461_g147680.1 (Contig3552.g27422)	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.22	0.11	0.21	0.41	0.18	0.5	0.7	0.56	0.34	1.0	0.19	0.45	0.41	0.75	0.53	0.32	0.19	0.09	0.16	0.19	0.12
Sro503_g155770.1 (Contig635.g7689)	0.14	0.25	0.14	0.22	0.25	0.29	0.5	0.24	0.31	0.52	0.36	0.52	0.99	0.55	0.47	0.93	0.29	0.51	0.43	1.0	0.6	0.49	0.27	0.38	0.43	0.3	0.21
Sro534_g161720.1 (Contig3269.g25737)	0.01	0.45	0.25	0.4	0.23	0.07	0.71	0.38	0.5	0.54	0.19	0.56	0.77	0.7	0.56	0.66	0.19	0.44	0.43	1.0	0.75	0.45	0.41	0.24	0.53	0.19	0.28
Sro534_g161730.1 (Contig3269.g25738)	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01	0.02	0.11	0.04	0.25	0.36	0.15	0.34	0.98	0.7	0.33	0.96	0.24	0.42	0.52	1.0	0.4	0.44	0.17	0.02	0.03	0.28	0.11
Sro582_g170480.1 (Contig2996.g23804)	0.1	0.22	0.32	0.47	0.47	0.19	0.52	0.38	0.46	0.64	0.55	0.81	1.0	0.67	0.54	0.73	0.56	0.32	0.31	0.63	0.72	0.25	0.27	0.31	0.34	0.22	0.42
Sro582_g170550.1 (Contig2996.g23811)	0.08	0.09	0.11	0.17	0.14	0.25	0.59	0.44	0.53	0.69	0.58	0.98	0.84	0.79	0.62	1.0	0.55	0.5	0.31	0.59	0.84	0.46	0.42	0.35	0.54	0.38	0.43
Sro609_g174930.1 (Contig285.g3725)	0.01	0.15	0.09	0.12	0.07	0.03	0.11	0.06	0.17	0.27	0.11	0.2	0.78	0.59	0.24	0.39	0.13	0.16	0.25	1.0	0.38	0.3	0.09	0.02	0.06	0.13	0.07
Sro619_g176470.1 (Contig2168.g18158)	0.05	0.05	0.07	0.08	0.14	0.11	0.34	0.27	0.26	0.38	0.25	0.4	0.64	0.39	0.37	1.0	0.24	0.52	0.43	0.45	0.48	0.27	0.28	0.19	0.4	0.23	0.22
Sro657_g182610.1 (Contig301.g3981)	0.03	0.01	0.01	0.0	0.01	0.07	0.26	0.11	0.23	0.42	0.22	0.55	0.96	0.51	0.3	1.0	0.16	0.33	0.35	0.65	0.55	0.3	0.16	0.18	0.43	0.3	0.16
Sro686_g187040.1 (Contig3553.g27448)	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.17	0.11	0.26	0.33	0.15	0.31	1.0	0.6	0.28	0.8	0.09	0.4	0.41	0.72	0.54	0.37	0.18	0.05	0.32	0.2	0.13
Sro716_g191950.1 (Contig2471.g20219)	0.0	0.13	0.08	0.07	0.14	0.03	0.12	0.08	0.28	0.27	0.22	0.27	1.0	0.68	0.18	0.49	0.11	0.38	0.49	0.85	0.41	0.2	0.13	0.09	0.16	0.13	0.1
Sro717_g192100.1 (Contig1315.g12157)	0.01	0.06	0.12	0.06	0.03	0.1	0.52	0.2	0.3	0.61	0.46	0.71	0.96	0.81	0.67	0.83	0.22	0.7	0.88	0.98	1.0	0.57	0.19	0.4	0.46	0.37	0.22
Sro730_g194110.1 (Contig80.g843)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.07	0.21	0.1	0.23	0.35	0.19	0.34	1.0	0.59	0.29	0.75	0.24	0.38	0.37	0.96	0.52	0.26	0.16	0.14	0.31	0.24	0.12
Sro764_g199110.1 (Contig1534.g13940)	0.0	0.05	0.05	0.02	0.03	0.1	0.15	0.09	0.27	0.25	0.09	0.24	1.0	0.44	0.18	0.66	0.09	0.3	0.34	0.88	0.39	0.31	0.21	0.05	0.03	0.13	0.07
Sro793_g203250.1 (Contig534.g6933)	0.02	0.0	0.01	0.0	0.0	0.07	0.22	0.08	0.27	0.37	0.21	0.42	1.0	0.62	0.35	0.86	0.23	0.42	0.36	0.98	0.61	0.38	0.19	0.14	0.3	0.27	0.12
Sro817_g206760.1 (Contig4010.g30840)	0.02	0.01	0.0	0.01	0.03	0.1	0.22	0.15	0.12	0.39	0.2	0.45	0.7	0.5	0.4	1.0	0.16	0.64	0.54	0.49	0.37	0.2	0.13	0.11	0.16	0.16	0.22
Sro861_g212190.1 (Contig902.g9513)	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.09	0.26	0.11	0.23	0.37	0.28	0.42	0.81	0.51	0.4	1.0	0.46	0.46	0.51	0.95	0.41	0.4	0.27	0.03	0.05	0.17	0.11
Sro861_g212260.1 (Contig902.g9520)	0.0	0.13	0.24	0.07	0.09	0.01	0.13	0.06	0.07	0.22	0.02	0.2	0.76	0.29	0.17	1.0	0.07	0.91	0.8	0.55	0.24	0.09	0.06	0.03	0.02	0.04	0.07
Sro861_g212300.1 (Contig902.g9524)	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.16	0.06	0.07	0.36	0.04	0.47	0.87	0.37	0.24	0.98	0.09	0.75	1.0	0.5	0.42	0.16	0.06	0.03	0.01	0.09	0.07
Sro868_g213310.1 (Contig2961.g23533)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.04	0.22	0.05	0.18	0.33	0.05	0.41	1.0	0.45	0.26	0.59	0.09	0.4	0.43	0.93	0.58	0.37	0.14	0.08	0.15	0.15	0.07
Sro873_g214080.1 (Contig3883.g29846)	0.03	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.13	0.08	0.09	0.33	0.15	0.41	0.67	0.47	0.36	1.0	0.17	0.39	0.29	0.61	0.44	0.28	0.09	0.09	0.17	0.15	0.1
Sro913_g219470.1 (Contig577.g7328)	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.1	0.08	0.1	0.19	0.23	0.08	0.23	0.41	0.58	0.34	1.0	0.2	0.22	0.23	0.42	0.32	0.28	0.12	0.03	0.06	0.15	0.13
Sro927_g221190.1 (Contig182.g2116)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.05	0.12	0.06	0.07	1.0	0.13	0.15	0.78	0.04	0.33	0.44	0.4	0.12	0.32	0.05	0.01	0.0	0.01	0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)