Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
0.13 0.01 0.03 0.15 0.06 0.17 0.09 0.15 0.04 0.37 0.13 0.43 0.1 0.21 0.17 0.08 0.07 0.35 0.1 0.2 0.18 0.01 0.13 0.28 0.58 1.0 0.15
Sro1062_g236970.1 (Contig721.g8303)
0.14 0.44 0.71 0.62 0.58 0.48 0.41 0.57 0.61 0.72 0.96 1.0 0.57 0.71 0.64 0.65 0.8 0.09 0.16 0.65 0.72 0.29 0.51 0.36 0.37 0.59 0.81
Sro1096_g240780.1 (Contig2666.g21566)
0.46 0.07 0.04 0.02 0.06 0.05 0.11 0.4 0.22 0.62 0.15 0.7 0.96 0.27 0.11 0.03 0.22 0.32 0.34 1.0 0.42 0.34 0.21 0.01 0.0 0.03 0.12
Sro10_g007840.1 (Contig1.g8)
1.0 0.11 0.17 0.3 0.19 0.26 0.3 0.36 0.21 0.56 0.32 0.61 0.5 0.59 0.35 0.25 0.32 0.27 0.31 0.58 0.52 0.2 0.26 0.2 0.22 0.27 0.18
Sro10_g008180.1 (Contig1.g42)
0.0 0.21 0.26 0.24 0.26 0.45 0.13 0.37 0.58 0.3 0.52 0.48 0.78 0.3 0.28 0.2 1.0 0.35 0.81 0.73 0.17 0.17 0.34 0.06 0.02 0.26 0.29
Sro1142_g245760.1 (Contig2104.g17865)
0.04 0.04 0.13 0.13 0.19 0.13 0.09 0.11 0.3 0.28 0.04 1.0 0.15 0.06 0.11 0.04 0.07 0.05 0.35 0.72 0.5 0.18 0.17 0.01 0.0 0.14 0.11
Sro1288_g259590.1 (Contig1971.g16853)
0.13 0.47 0.65 0.35 0.18 0.39 0.25 0.51 0.15 0.51 0.36 0.58 0.95 0.32 0.34 0.33 0.28 0.48 0.76 1.0 0.51 0.46 0.21 0.23 0.14 0.23 0.27
Sro1288_g259600.1 (Contig1971.g16854)
0.19 0.01 0.07 0.13 0.07 0.03 0.15 1.0 0.32 0.42 0.09 0.85 0.19 0.08 0.15 0.08 0.09 0.15 0.14 0.3 0.38 0.44 0.2 0.21 0.2 0.16 0.17
Sro1305_g261200.1 (Contig1643.g14834)
0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.0 0.08 0.12 0.08 0.09 0.41 0.02 0.05 0.01 0.04 0.03 0.12 1.0 0.14 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro1333_g263630.1 (Contig3364.g26362)
0.53 0.16 0.2 0.23 0.14 0.16 0.24 0.3 0.34 0.63 0.44 1.0 0.64 0.56 0.45 0.47 0.32 0.43 0.46 0.52 0.83 0.12 0.36 0.33 0.31 0.46 0.43
Sro1333_g263640.1 (Contig3364.g26363)
0.27 0.43 0.71 0.71 0.44 0.15 0.28 0.13 0.38 0.77 0.29 0.82 0.74 0.56 0.52 0.33 0.25 0.36 0.62 1.0 0.97 0.2 0.35 0.35 0.14 0.34 0.42
Sro1333_g263650.1 (Contig3364.g26364)
0.24 0.45 0.51 0.42 0.28 0.12 0.19 0.18 0.24 0.45 0.37 0.56 1.0 0.35 0.33 0.39 0.39 0.39 0.38 0.65 0.63 0.2 0.27 0.27 0.23 0.32 0.29
Sro133_g063040.1 (Contig2274.g18863)
0.04 0.51 0.69 0.32 0.28 0.0 0.37 0.11 0.85 0.64 0.2 1.0 0.43 0.21 0.39 0.37 0.33 0.37 0.27 0.67 0.54 0.22 0.45 0.06 0.28 0.21 0.18
Sro1375_g267380.1 (Contig4583.g34248)
1.0 0.04 0.14 0.04 0.04 0.25 0.45 0.52 0.4 0.4 0.41 0.43 0.27 0.17 0.5 0.45 0.55 0.07 0.35 0.73 0.34 0.62 0.41 0.17 0.37 0.2 0.2
Sro1485_g276510.1 (Contig4245.g32132)
0.81 0.27 0.67 0.57 0.5 0.07 0.23 0.18 0.14 0.66 0.64 1.0 0.49 0.29 0.45 0.57 0.44 0.45 0.63 0.88 0.6 0.14 0.23 0.35 0.37 0.35 0.39
Sro1506_g278300.1 (Contig3888.g29861)
0.11 0.32 0.43 0.15 0.14 0.18 0.23 0.18 0.43 0.47 0.36 1.0 0.35 0.34 0.25 0.29 0.36 0.15 0.29 0.62 0.53 0.08 0.25 0.22 0.37 0.28 0.3
Sro1519_g279300.1 (Contig4680.g34808)
0.19 0.01 0.05 0.05 0.01 0.15 0.16 0.35 0.31 0.67 0.17 1.0 0.26 0.21 0.2 0.29 0.19 0.05 0.25 0.51 0.48 0.19 0.13 0.07 0.12 0.06 0.21
Sro1584_g284020.1 (Contig1414.g12982)
0.0 0.04 0.19 0.12 0.14 0.01 0.01 0.08 1.0 0.14 0.02 0.23 0.05 0.04 0.02 0.01 0.19 0.12 0.43 0.1 0.05 0.4 0.06 0.01 0.01 0.57 0.34
Sro162_g073000.1 (Contig2670.g21636)
0.91 0.03 0.03 0.0 0.04 0.03 0.07 0.42 0.35 0.56 0.07 1.0 0.31 0.33 0.12 0.02 0.0 0.09 0.29 0.56 0.53 0.75 0.23 0.24 0.05 0.0 0.06
1.0 0.04 0.01 0.01 0.02 0.03 0.2 0.28 0.43 0.27 0.12 0.25 0.15 0.14 0.12 0.05 0.09 0.05 0.29 0.2 0.13 0.32 0.16 0.09 0.02 0.03 0.1
Sro1700_g292140.1 (Contig4692.g34897)
0.15 0.14 0.2 0.1 0.12 0.09 0.22 0.75 0.35 0.74 0.2 1.0 0.58 0.41 0.28 0.22 0.06 0.53 0.79 0.98 0.76 0.58 0.32 0.19 0.17 0.17 0.18
Sro1755_g295560.1 (Contig3455.g26837)
0.01 0.31 0.32 0.5 0.48 0.06 0.23 0.16 0.08 0.56 0.52 0.64 0.19 0.17 0.3 0.49 0.18 0.29 0.42 0.47 1.0 0.14 0.15 0.42 0.59 0.52 0.42
Sro176_g077410.1 (Contig203.g2428)
1.0 0.23 0.32 0.49 0.44 0.18 0.23 0.24 0.31 0.45 0.41 0.48 0.91 0.36 0.29 0.21 0.46 0.27 0.33 0.66 0.44 0.14 0.34 0.13 0.15 0.16 0.22
Sro1775_g296830.1 (Contig695.g8113)
0.31 0.12 0.13 0.17 0.14 0.06 0.15 0.34 0.62 0.57 0.43 1.0 0.35 0.29 0.2 0.17 0.22 0.1 0.26 0.49 0.5 0.19 0.06 0.11 0.13 0.14 0.31
Sro177_g077790.1 (Contig795.g8905)
0.43 1.0 0.88 0.52 0.64 0.15 0.19 0.22 0.15 0.59 0.61 0.71 0.47 0.25 0.57 0.87 0.46 0.56 0.67 0.73 0.83 0.2 0.14 0.77 0.73 0.46 0.5
Sro181_g078920.1 (Contig4257.g32219)
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.28 0.18 0.11 0.07 0.24 0.14 0.21 0.17 0.03 0.06 0.02 0.0 0.26 0.17 1.0 0.54 0.1 0.0 0.0 0.07
Sro1896_g304030.1 (Contig1676.g15065)
0.55 0.19 0.14 0.13 0.1 0.15 0.45 0.74 0.68 0.71 0.24 1.0 0.38 0.48 0.4 0.19 0.16 0.09 0.13 0.55 0.63 0.54 0.54 0.18 0.16 0.11 0.22
Sro195_g083170.1 (Contig4576.g34154)
0.0 0.09 0.76 0.61 0.39 1.0 0.07 0.05 0.25 0.22 0.28 0.25 0.08 0.2 0.26 0.25 0.47 0.17 0.47 0.11 0.17 0.02 0.1 0.09 0.08 0.46 0.26
Sro220_g090730.1 (Contig3599.g27835)
0.4 0.42 0.46 0.36 0.31 0.21 0.35 0.45 0.34 0.76 0.48 0.91 0.53 0.73 0.45 0.29 0.3 0.33 0.88 1.0 0.86 0.62 0.28 0.39 0.32 0.36 0.41
Sro224_g091620.1 (Contig758.g8616)
0.03 0.27 0.25 0.21 0.21 0.29 0.17 0.26 0.4 0.29 0.58 0.42 0.71 0.29 0.31 0.3 1.0 0.39 0.55 0.47 0.26 0.18 0.21 0.14 0.04 0.2 0.36
Sro247_g098170.1 (Contig3058.g24350)
0.01 0.35 0.37 0.4 0.28 0.16 0.23 0.47 0.41 0.64 0.95 1.0 0.66 0.48 0.59 0.29 0.95 0.37 0.95 0.79 0.74 0.26 0.28 0.18 0.07 0.13 0.7
Sro247_g098180.1 (Contig3058.g24351)
0.02 0.29 0.28 0.29 0.23 0.18 0.31 0.25 0.46 0.66 0.8 0.95 0.69 0.48 0.55 0.44 0.67 0.55 1.0 0.93 0.66 0.16 0.35 0.2 0.03 0.13 0.65
Sro298_g111010.1 (Contig4399.g33032)
0.02 0.05 0.03 0.04 0.08 0.02 0.21 0.36 0.34 0.42 0.08 0.61 0.74 0.2 0.12 0.12 0.03 0.43 0.11 1.0 0.34 0.62 0.24 0.02 0.01 0.06 0.08
Sro375_g129360.1 (Contig4478.g33637)
0.22 0.38 0.31 0.26 0.16 0.05 0.26 0.97 0.54 0.62 0.22 0.46 0.98 0.28 0.32 0.59 0.11 0.5 0.32 1.0 0.7 0.57 0.13 0.26 0.22 0.14 0.25
Sro398_g134590.1 (Contig371.g5020)
0.1 0.45 0.44 0.31 0.51 0.05 0.13 0.08 0.05 0.62 0.66 1.0 0.36 0.19 0.46 0.35 0.52 0.37 0.38 0.37 0.75 0.03 0.1 0.07 0.01 0.13 0.37
Sro398_g134600.1 (Contig371.g5021)
0.09 0.12 0.12 0.04 0.07 0.08 0.07 0.03 0.06 0.35 0.49 0.73 0.07 0.03 0.37 0.37 1.0 0.16 0.12 0.17 0.37 0.0 0.03 0.04 0.05 0.1 0.24
Sro398_g134610.1 (Contig371.g5022)
0.08 0.05 0.06 0.08 0.02 0.07 0.06 0.05 0.06 0.39 0.47 1.0 0.48 0.07 0.34 0.24 0.67 0.45 0.34 0.37 0.3 0.02 0.07 0.02 0.0 0.14 0.31
0.11 0.47 0.25 0.06 0.18 0.08 0.43 0.24 0.18 0.74 0.19 1.0 0.19 0.43 0.11 0.06 0.05 0.16 0.65 0.19 0.91 0.11 0.22 0.14 0.13 0.06 0.11
Sro420_g139330.1 (Contig1861.g16276)
0.01 0.03 0.06 0.03 0.03 0.19 0.53 0.43 0.53 0.65 0.64 1.0 0.29 0.37 0.45 0.64 0.83 0.4 0.53 0.44 0.64 0.13 0.73 0.31 0.3 0.53 0.38
Sro425_g140160.1 (Contig3537.g27361)
1.0 0.06 0.04 0.02 0.0 0.13 0.28 0.47 0.38 0.45 0.39 0.5 0.16 0.3 0.22 0.25 0.17 0.05 0.21 0.34 0.59 0.49 0.22 0.57 0.4 0.21 0.29
Sro437_g142870.1 (Contig994.g10053)
0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.33 0.38 0.68 0.38 0.69 1.0 0.96 0.46 0.55 0.81 0.72 0.84 0.15 0.23 0.45 0.91 0.86 0.22 0.57 0.5 0.71 0.86
Sro463_g148280.1 (Contig3968.g30437)
0.38 0.36 0.36 0.29 0.38 0.13 0.14 0.3 0.31 0.69 0.53 0.8 0.92 0.49 0.57 0.78 0.42 0.42 1.0 0.91 0.56 0.32 0.22 0.31 0.09 0.3 0.43
1.0 0.4 0.4 0.21 0.21 0.05 0.15 0.15 0.12 0.66 0.28 0.92 0.37 0.39 0.31 0.26 0.28 0.26 0.18 0.33 0.47 0.37 0.13 0.29 0.22 0.21 0.21
Sro46_g027540.1 (Contig1636.g14744)
0.0 0.27 0.19 0.1 0.12 0.28 0.01 0.12 0.87 0.18 0.11 0.25 0.24 0.11 0.11 0.08 0.48 0.1 0.28 0.33 0.04 0.38 0.07 0.01 0.0 1.0 0.39
Sro507_g156460.1 (Contig4452.g33448)
0.41 0.24 0.2 0.2 0.18 0.39 0.22 0.2 0.22 0.62 0.68 0.9 0.75 0.27 0.37 0.35 0.78 0.2 0.31 1.0 0.55 0.23 0.22 0.13 0.19 0.23 0.4
Sro545_g163930.1 (Contig1180.g11236)
0.15 0.01 0.02 0.01 0.02 0.0 0.1 0.18 0.39 0.32 0.03 0.37 0.61 0.14 0.08 0.1 0.08 0.06 0.08 1.0 0.22 0.29 0.17 0.04 0.01 0.02 0.03
Sro557_g166080.1 (Contig1427.g13178)
0.44 0.03 0.04 0.02 0.02 0.09 0.21 0.38 0.35 0.33 0.12 0.35 0.8 0.16 0.12 0.09 0.15 0.07 0.04 1.0 0.24 0.29 0.2 0.17 0.12 0.08 0.11
Sro579_g169970.1 (Contig368.g4981)
0.02 0.2 0.24 0.18 0.16 0.21 0.17 0.38 0.42 0.52 0.56 0.8 1.0 0.51 0.39 0.35 0.54 0.44 0.88 0.9 0.59 0.27 0.35 0.12 0.02 0.28 0.46
0.04 0.33 0.39 0.35 0.26 0.31 0.33 0.13 0.56 0.57 0.51 0.6 0.61 0.75 0.33 0.47 1.0 0.43 0.84 0.8 0.57 0.18 0.49 0.23 0.04 0.34 0.46
Sro671_g184960.1 (Contig562.g7153)
0.35 0.09 0.06 0.06 0.03 0.15 0.41 0.45 0.43 0.57 0.5 0.69 0.44 0.3 0.3 0.53 0.21 0.16 0.28 1.0 0.41 0.3 0.23 0.41 0.17 0.16 0.57
0.54 0.04 0.02 0.03 0.0 0.2 0.62 0.55 0.63 0.59 0.17 0.58 0.14 0.23 0.26 0.04 0.05 0.01 0.04 1.0 0.61 0.39 0.21 0.18 0.02 0.09 0.23
Sro744_g196280.1 (Contig393.g5327)
0.03 0.41 1.0 0.67 0.48 0.08 0.3 0.19 0.38 0.65 0.62 0.91 0.49 0.55 0.42 0.44 0.6 0.28 0.4 0.84 0.93 0.42 0.21 0.44 0.95 0.48 0.42
Sro746_g196360.1 (Contig3041.g24227)
0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.3 0.49 0.43 0.67 0.57 0.79 0.46 1.0 0.47 0.25 0.69 0.04 0.04 0.38 0.83 0.81 0.48 0.27 0.18 0.61 0.62
Sro746_g196370.1 (Contig3041.g24228)
0.11 0.04 0.0 0.0 0.0 0.32 0.27 0.34 0.62 0.8 1.0 1.0 0.51 0.61 0.67 0.53 0.66 0.1 0.25 0.76 0.7 0.8 0.81 0.39 0.64 0.94 1.0
Sro850_g210670.1 (Contig2035.g17489)
0.17 0.11 0.1 0.06 0.1 0.04 0.49 0.57 0.68 0.75 0.14 0.73 1.0 0.14 0.2 0.12 0.08 0.11 0.11 0.91 0.58 0.41 0.24 0.09 0.04 0.08 0.23
Sro854_g211210.1 (Contig1879.g16383)
0.01 0.47 0.53 0.34 0.31 0.48 0.27 0.27 0.46 0.45 0.81 0.64 0.79 0.35 0.49 0.42 1.0 0.55 0.68 0.81 0.45 0.2 0.33 0.23 0.04 0.18 0.49
Sro876_g214470.1 (Contig165.g1862)
0.78 0.16 0.17 0.11 0.17 0.17 0.01 0.03 0.0 0.95 0.22 1.0 0.03 0.52 0.32 0.53 0.44 0.03 0.45 0.28 0.98 0.07 0.0 0.09 0.0 0.64 0.36
Sro910_g219080.1 (Contig1356.g12500)
0.31 0.63 0.68 0.3 0.4 0.15 0.29 0.17 0.21 0.71 0.76 1.0 0.15 0.37 0.42 0.54 0.76 0.16 0.23 0.32 0.88 0.07 0.2 0.24 0.3 0.33 0.69
Sro940_g222570.1 (Contig4646.g34615)
1.0 0.36 0.34 0.39 0.39 0.22 0.25 0.2 0.26 0.53 0.42 0.6 0.77 0.46 0.4 0.51 0.62 0.55 0.63 0.63 0.55 0.24 0.3 0.24 0.26 0.3 0.34
Sro981_g227550.1 (Contig2364.g19468)
0.37 0.52 0.55 0.63 0.58 0.24 0.37 0.32 0.4 0.73 0.7 0.91 0.65 0.45 0.52 0.6 0.58 0.42 0.69 1.0 0.89 0.28 0.48 0.41 0.63 0.48 0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)