Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1000_g229720.1 (Contig128.g1449)
0.01 0.24 0.28 0.13 0.16 0.16 0.23 1.0 0.42 0.23 0.33 0.16 0.23 0.11 0.34 0.59 0.22 0.42 0.32 0.26 0.37 0.64 0.21 0.2 0.31 0.26 0.31
Sro1066_g237320.1 (Contig1437.g13208)
0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.18 1.0 0.37 0.07 0.13 0.13 0.01 0.04 0.12 0.22 0.17 0.24 0.07 0.15 0.13 0.12 0.29 0.05 0.03 0.01 0.13
Sro1072_g238120.1 (Contig2124.g17942)
0.0 0.25 0.24 0.18 0.25 0.02 0.66 1.0 0.69 0.08 0.37 0.05 0.27 0.02 0.12 0.15 0.39 0.07 0.12 0.12 0.02 0.19 0.38 0.09 0.0 0.02 0.31
Sro107_g053780.1 (Contig1548.g14053)
0.06 0.27 0.16 0.16 0.17 0.02 0.06 0.56 0.31 0.16 0.04 0.22 0.19 0.02 0.06 0.12 0.04 1.0 0.48 0.09 0.37 0.19 0.33 0.06 0.1 0.03 0.05
Sro1093_g240380.1 (Contig384.g5164)
0.0 0.0 0.21 0.08 0.14 0.0 0.0 0.27 0.14 0.02 0.0 0.0 0.13 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.28 0.08 0.0 0.09 0.02 0.12 0.3 0.2 0.0
Sro110_g054800.1 (Contig1501.g13703)
0.0 0.2 0.17 0.21 0.19 0.19 0.57 1.0 0.81 0.42 0.72 0.49 0.48 0.3 0.44 0.53 0.58 0.8 0.56 0.43 0.53 0.3 0.53 0.27 0.3 0.34 0.64
Sro1130_g244560.1 (Contig1486.g13586)
0.02 0.27 0.46 0.44 0.35 0.23 0.39 1.0 0.46 0.3 0.42 0.27 0.24 0.27 0.36 0.37 0.45 0.56 0.34 0.23 0.42 0.21 0.34 0.2 0.21 0.27 0.38
Sro1178_g249510.1 (Contig1120.g10722)
0.0 0.25 0.29 0.44 0.36 0.08 0.22 1.0 0.61 0.13 0.27 0.03 0.23 0.09 0.24 0.44 0.28 0.3 0.2 0.16 0.09 0.29 0.2 0.15 0.15 0.16 0.31
Sro1252_g256240.1 (Contig3295.g25875)
0.0 0.24 0.24 0.28 0.37 0.1 0.31 1.0 0.7 0.17 0.49 0.2 0.07 0.07 0.37 0.22 0.7 0.05 0.06 0.14 0.13 0.57 0.62 0.13 0.07 0.18 0.33
Sro12_g009310.1 (Contig2293.g18951)
0.0 0.48 0.58 0.39 0.43 0.33 0.74 1.0 0.7 0.23 0.38 0.22 0.43 0.25 0.32 0.23 0.38 0.48 0.26 0.2 0.08 0.41 0.65 0.43 0.15 0.1 0.32
Sro1305_g261140.1 (Contig1643.g14828)
0.3 0.29 0.48 0.43 0.26 0.52 0.28 0.99 0.55 0.32 1.0 0.22 0.22 0.07 0.47 0.44 0.77 0.71 0.46 0.26 0.44 0.62 0.38 0.2 0.23 0.48 0.65
Sro1363_g266400.1 (Contig2704.g21794)
0.32 0.42 0.29 0.34 0.39 0.18 0.39 0.51 0.84 0.22 0.5 0.12 0.31 0.05 0.25 0.32 0.71 1.0 0.44 0.33 0.28 0.7 0.69 0.04 0.08 0.19 0.28
Sro138_g064630.1 (Contig2021.g17285)
0.33 0.37 0.4 0.63 0.46 0.22 0.32 1.0 0.78 0.21 0.39 0.13 0.18 0.06 0.27 0.54 0.51 0.52 0.25 0.15 0.23 0.31 0.29 0.05 0.03 0.11 0.33
Sro1416_g270810.1 (Contig660.g7803)
0.02 0.43 0.17 0.14 0.17 0.01 0.14 1.0 0.59 0.16 0.27 0.1 0.18 0.02 0.13 0.13 0.04 0.51 0.32 0.23 0.21 0.28 0.23 0.18 0.39 0.2 0.13
Sro1497_g277630.1 (Contig4331.g32657)
0.0 0.09 0.19 0.16 0.11 0.26 0.25 1.0 0.45 0.09 0.27 0.05 0.09 0.11 0.23 0.32 0.39 0.27 0.2 0.09 0.02 0.19 0.27 0.08 0.05 0.14 0.3
Sro150_g069010.1 (Contig1519.g13864)
0.03 0.3 0.59 0.33 0.35 0.19 0.6 0.94 1.0 0.38 0.34 0.36 0.52 0.37 0.43 0.52 0.38 0.44 0.58 0.63 0.45 0.64 0.77 0.3 0.29 0.38 0.45
Sro15_g011360.1 (Contig791.g8862)
0.05 0.28 0.21 0.12 0.14 0.08 0.41 1.0 0.77 0.31 0.31 0.28 0.72 0.18 0.31 0.41 0.29 0.49 0.33 0.85 0.42 0.64 0.57 0.18 0.2 0.15 0.38
Sro1722_g293570.1 (Contig772.g8711)
0.01 0.08 0.08 0.04 0.05 0.22 0.27 1.0 0.37 0.27 0.19 0.21 0.24 0.04 0.25 0.34 0.31 0.46 0.37 0.28 0.23 0.7 0.34 0.16 0.29 0.27 0.24
Sro177_g077660.1 (Contig795.g8892)
0.28 0.27 0.25 0.28 0.41 0.0 0.12 1.0 0.53 0.36 0.02 0.54 0.34 0.02 0.05 0.02 0.03 0.41 0.79 0.42 0.38 0.35 0.43 0.06 0.2 0.08 0.03
Sro186_g080690.1 (Contig266.g3350)
0.0 0.03 0.06 0.06 0.06 0.11 0.24 1.0 0.5 0.06 0.15 0.04 0.01 0.05 0.06 0.06 0.22 0.19 0.13 0.03 0.11 0.33 0.18 0.04 0.11 0.17 0.1
Sro186_g080700.1 (Contig266.g3351)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.21 1.0 0.42 0.1 0.07 0.08 0.17 0.01 0.07 0.07 0.06 0.75 0.66 0.23 0.12 0.44 0.14 0.01 0.07 0.08 0.07
0.0 0.01 0.01 0.08 0.02 0.07 0.21 1.0 0.25 0.07 0.26 0.01 0.43 0.09 0.19 0.35 0.45 0.35 0.06 0.18 0.09 0.03 0.05 0.02 0.02 0.04 0.17
Sro199_g084390.1 (Contig257.g3177)
0.0 0.27 0.42 0.27 0.26 0.28 0.26 1.0 0.54 0.22 0.37 0.24 0.27 0.21 0.3 0.32 0.36 0.21 0.18 0.16 0.22 0.36 0.3 0.21 0.37 0.3 0.3
Sro1_g000280.1 (Contig3007.g23943)
0.0 0.06 0.0 0.12 0.18 0.07 0.02 1.0 0.52 0.05 0.16 0.06 0.03 0.02 0.07 0.16 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.06 0.05 0.06 0.01 0.05 0.2
0.0 0.09 0.05 0.01 0.05 0.04 0.08 1.0 0.44 0.03 0.01 0.08 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.03 0.0 0.01 0.01 0.3 0.12 0.01 0.03 0.0 0.02
Sro2077_g313570.1 (Contig1970.g16842)
0.0 0.38 0.61 0.45 0.35 0.07 0.18 1.0 0.62 0.05 0.09 0.02 0.08 0.03 0.11 0.1 0.13 0.17 0.11 0.02 0.03 0.38 0.38 0.08 0.06 0.11 0.09
Sro2106_g314820.1 (Contig3561.g27498)
1.0 0.11 0.06 0.02 0.02 0.02 0.21 0.87 0.34 0.11 0.04 0.03 0.57 0.02 0.03 0.02 0.03 0.1 0.02 0.99 0.12 0.07 0.26 0.13 0.26 0.06 0.02
Sro2124_g315620.1 (Contig3835.g29498)
0.01 0.04 0.11 0.06 0.06 0.0 0.0 0.34 0.22 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 1.0 0.17 0.04 0.01 0.18 0.08 0.01 0.07 0.1 0.01
Sro234_g094320.1 (Contig3223.g25479)
0.0 0.16 0.17 0.11 0.13 0.31 0.6 1.0 0.89 0.22 0.43 0.17 0.39 0.16 0.35 0.39 0.67 1.0 0.4 0.26 0.13 0.59 0.49 0.14 0.11 0.19 0.47
Sro23_g015960.1 (Contig2259.g18746)
0.0 0.08 0.05 0.02 0.03 0.03 0.43 1.0 0.63 0.14 0.18 0.07 0.12 0.04 0.14 0.32 0.31 0.18 0.05 0.13 0.38 0.81 0.26 0.0 0.01 0.03 0.2
Sro2404_g326450.1 (Contig3181.g25133)
0.24 0.08 0.25 0.15 0.15 0.02 0.31 0.85 0.79 0.13 0.09 0.08 1.0 0.01 0.04 0.04 0.09 0.8 0.4 0.56 0.41 0.64 0.45 0.03 0.07 0.06 0.04
Sro2435_g327580.1 (Contig3908.g29957)
0.02 0.09 0.08 0.09 0.08 0.0 0.42 1.0 0.52 0.18 0.07 0.19 0.35 0.06 0.08 0.06 0.06 0.22 0.24 0.41 0.23 0.55 0.37 0.07 0.08 0.06 0.07
Sro2441_g327740.1 (Contig4619.g34459)
0.02 0.48 0.58 0.35 0.3 0.29 0.25 1.0 0.64 0.38 0.5 0.29 0.56 0.2 0.38 0.44 0.36 0.94 0.39 0.59 0.54 0.57 0.35 0.29 0.37 0.32 0.39
Sro2563_g331390.1 (Contig869.g9422)
0.01 0.07 0.12 0.09 0.09 0.19 0.45 1.0 0.45 0.34 0.45 0.41 0.2 0.16 0.36 0.42 0.54 0.7 0.38 0.23 0.45 0.33 0.36 0.15 0.11 0.29 0.37
Sro25_g017130.1 (Contig1417.g13052)
1.0 0.17 0.34 0.24 0.2 0.08 0.31 0.4 0.45 0.21 0.25 0.14 0.69 0.11 0.2 0.35 0.25 0.43 0.23 0.8 0.27 0.44 0.28 0.16 0.2 0.12 0.16
Sro2616_g332740.1 (Contig3376.g26421)
0.08 0.07 0.33 0.4 0.27 0.13 0.22 1.0 0.35 0.22 0.3 0.2 0.56 0.22 0.35 0.46 0.3 0.51 0.2 0.44 0.24 0.3 0.15 0.19 0.19 0.14 0.32
Sro270_g104220.1 (Contig1617.g14606)
0.0 0.08 0.04 0.06 0.09 0.05 0.01 0.6 0.2 0.07 0.07 0.02 0.12 0.05 0.13 0.03 0.05 1.0 0.32 0.19 0.01 0.21 0.18 0.03 0.05 0.09 0.05
Sro2934_g340500.1 (Contig247.g3026)
0.0 0.42 0.57 0.6 0.45 0.16 0.35 1.0 0.71 0.21 0.31 0.29 0.06 0.17 0.23 0.31 0.29 0.26 0.11 0.04 0.24 0.26 0.4 0.32 0.5 0.54 0.26
Sro3020_g342200.1 (Contig656.g7780)
0.14 0.27 0.42 0.46 0.4 0.21 0.26 1.0 0.83 0.14 0.22 0.12 0.0 0.1 0.24 0.5 0.3 0.0 0.0 0.0 0.22 0.53 0.45 0.14 0.15 0.26 0.33
Sro310_g113960.1 (Contig2751.g22156)
0.08 0.5 0.48 0.87 0.64 0.22 0.28 0.93 0.65 0.25 0.62 0.09 0.09 0.04 0.32 0.37 1.0 0.86 0.49 0.08 0.27 0.76 0.61 0.21 0.39 0.58 0.32
Sro3311_g346600.1 (Contig2722.g21962)
0.0 0.04 0.15 0.23 0.11 0.09 0.1 1.0 0.63 0.07 0.08 0.06 0.08 0.02 0.06 0.16 0.25 0.19 0.07 0.04 0.13 0.41 0.25 0.07 0.11 0.28 0.11
Sro356_g125410.1 (Contig3618.g27977)
0.27 0.17 0.22 0.24 0.23 0.18 0.4 1.0 0.79 0.22 0.31 0.21 0.16 0.06 0.21 0.4 0.37 0.27 0.1 0.11 0.25 0.44 0.4 0.07 0.07 0.14 0.28
0.03 0.18 0.22 0.2 0.18 0.09 0.34 1.0 0.96 0.34 0.26 0.41 0.45 0.07 0.25 0.16 0.39 0.48 0.77 0.32 0.37 0.58 0.75 0.0 0.02 0.16 0.25
Sro373_g129020.1 (Contig1347.g12387)
0.0 0.55 1.0 0.51 0.37 0.24 0.19 0.27 0.48 0.16 0.19 0.14 0.09 0.09 0.2 0.16 0.26 0.2 0.2 0.09 0.15 0.43 0.29 0.13 0.19 0.3 0.2
Sro393_g133650.1 (Contig2258.g18696)
0.07 0.46 0.32 0.23 0.25 0.03 0.25 1.0 0.56 0.18 0.23 0.08 0.55 0.17 0.19 0.26 0.16 0.35 0.28 0.65 0.17 0.42 0.17 0.14 0.12 0.17 0.15
Sro4132_g353090.1 (Contig2520.g20576)
0.0 0.2 0.14 0.23 0.22 0.09 0.13 1.0 0.68 0.06 0.15 0.02 0.06 0.01 0.09 0.13 0.23 0.29 0.14 0.04 0.02 0.47 0.35 0.09 0.09 0.16 0.11
Sro4460_g354040.1 (Contig3522.g27241)
0.0 0.01 0.02 0.03 0.04 0.03 0.12 1.0 0.34 0.04 0.08 0.01 0.04 0.02 0.08 0.17 0.19 0.03 0.01 0.05 0.02 0.09 0.12 0.05 0.1 0.17 0.12
Sro458_g147090.1 (Contig3230.g25541)
0.0 0.26 0.27 0.28 0.27 0.16 0.18 1.0 0.61 0.15 0.3 0.06 0.14 0.01 0.14 0.53 0.46 0.37 0.2 0.04 0.15 0.34 0.27 0.2 0.26 0.36 0.34
Sro461_g147850.1 (Contig3552.g27439)
0.01 0.63 0.43 0.31 0.52 0.25 0.28 0.86 1.0 0.18 0.45 0.13 0.26 0.16 0.31 0.09 0.55 0.26 0.37 0.08 0.12 0.28 0.56 0.18 0.06 0.06 0.28
Sro473_g150090.1 (Contig2918.g23229)
0.0 0.06 0.1 0.38 0.39 0.16 0.18 1.0 0.82 0.1 0.3 0.07 0.07 0.02 0.2 0.29 0.29 0.17 0.09 0.06 0.03 0.19 0.32 0.02 0.05 0.15 0.27
Sro48_g028100.1 (Contig1255.g11705)
0.01 0.22 0.24 0.2 0.28 0.27 0.39 1.0 0.51 0.1 0.38 0.05 0.03 0.13 0.24 0.07 0.27 0.22 0.09 0.01 0.01 0.26 0.44 0.13 0.05 0.07 0.21
Sro514_g158070.1 (Contig3991.g30648)
0.03 0.15 0.24 0.32 0.26 0.15 0.15 1.0 0.47 0.12 0.34 0.04 0.21 0.1 0.24 0.33 0.31 0.24 0.13 0.14 0.12 0.24 0.27 0.08 0.15 0.19 0.3
Sro533_g161620.1 (Contig3819.g29330)
0.0 0.15 0.12 0.11 0.13 0.09 0.36 1.0 0.75 0.1 0.19 0.03 0.04 0.03 0.16 0.28 0.27 0.39 0.15 0.04 0.11 0.58 0.24 0.03 0.03 0.08 0.17
Sro556_g165940.1 (Contig1584.g14385)
0.05 0.18 0.39 0.46 0.4 0.13 0.18 1.0 0.63 0.17 0.21 0.14 0.09 0.02 0.1 0.36 0.28 0.45 0.26 0.1 0.33 0.22 0.23 0.19 0.33 0.17 0.31
Sro589_g171730.1 (Contig2898.g23110)
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 1.0 0.24 0.12 0.12 0.11 0.04 0.03 0.25 0.37 0.11 0.14 0.07 0.06 0.12 0.14 0.05 0.09 0.13 0.06 0.23
Sro589_g171740.1 (Contig2898.g23111)
0.16 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.11 1.0 0.24 0.12 0.22 0.1 0.05 0.03 0.24 0.28 0.14 0.13 0.08 0.07 0.11 0.15 0.07 0.11 0.16 0.1 0.22
Sro64_g036190.1 (Contig2497.g20453)
0.0 0.04 0.1 0.08 0.08 0.17 0.33 1.0 0.63 0.15 0.05 0.13 0.12 0.04 0.09 0.07 0.02 0.77 0.49 0.26 0.31 0.42 0.14 0.05 0.11 0.11 0.05
Sro697_g189030.1 (Contig3345.g26202)
0.54 0.07 0.26 0.18 0.13 0.04 0.06 1.0 0.55 0.08 0.06 0.03 0.05 0.02 0.08 0.06 0.06 0.86 0.06 0.02 0.16 0.29 0.26 0.23 0.32 0.26 0.05
Sro76_g041580.1 (Contig184.g2136)
0.0 0.04 0.02 0.02 0.04 0.0 0.23 1.0 0.28 0.06 0.02 0.02 0.01 0.0 0.05 0.03 0.03 0.03 0.01 0.03 0.26 0.61 0.07 0.01 0.0 0.0 0.07
Sro794_g203450.1 (Contig1634.g14714)
0.0 0.11 0.08 0.04 0.04 0.2 0.21 1.0 0.32 0.19 0.17 0.16 0.17 0.14 0.19 0.17 0.41 0.18 0.19 0.29 0.24 0.52 0.19 0.01 0.01 0.15 0.2
Sro7_g006340.1 (Contig389.g5287)
0.04 0.45 1.0 0.79 0.66 0.3 0.43 0.59 0.61 0.34 0.67 0.34 0.15 0.16 0.37 0.45 0.66 0.81 0.41 0.23 0.43 0.5 0.41 0.34 0.36 0.57 0.49
Sro858_g211800.1 (Contig4009.g30826)
0.0 0.09 0.04 0.07 0.08 0.08 0.46 1.0 0.67 0.16 0.39 0.17 0.31 0.01 0.22 0.32 0.32 0.39 0.37 0.24 0.1 0.55 0.46 0.07 0.04 0.26 0.28
Sro903_g218320.1 (Contig3909.g29972)
0.0 0.49 0.49 0.21 0.33 0.03 0.33 1.0 0.45 0.29 0.42 0.18 0.31 0.12 0.29 0.32 0.44 0.62 0.3 0.28 0.28 0.39 0.3 0.05 0.15 0.28 0.5
Sro98_g050530.1 (Contig3362.g26345)
0.0 0.23 0.34 0.41 0.44 0.16 0.39 1.0 0.6 0.16 0.16 0.07 0.07 0.03 0.25 0.38 0.03 0.45 0.43 0.11 0.15 0.9 0.31 0.1 0.02 0.25 0.31
Sro996_g229320.1 (Contig2630.g21346)
0.0 0.37 0.4 0.39 0.38 0.19 0.46 1.0 0.35 0.15 0.27 0.09 0.13 0.09 0.21 0.18 0.45 0.22 0.21 0.07 0.08 0.22 0.55 0.11 0.05 0.15 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)