1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1092_g240310.1 (Contig3426.g26692)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.24 0.0 0.23 0.24 0.0 0.12 0.0 0.0 0.14 0.0 1.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro1143_g246020.1 (Contig934.g9728)
 1.0 0.24 0.11 0.07 0.02 0.22 0.02 0.14 0.0 0.32 0.17 0.43 0.43 0.2 0.14 0.14 0.07 0.04 0.09 0.63 0.33 0.03 0.02 0.85 0.34 0.03 0.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.01 0.24 0.0 0.1 0.11 0.22 0.05 0.01 0.09 0.22 0.0 1.0 0.17 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23
Sro1187_g250450.1 (Contig433.g5843)
 0.04 0.02 0.03 0.03 0.04 0.01 0.11 0.4 0.35 0.37 0.02 0.55 0.49 0.04 0.06 0.07 0.06 0.84 0.15 1.0 0.39 0.22 0.21 0.02 0.02 0.04 0.06
Sro1256_g256650.1 (Contig2043.g17570)
 0.06 0.04 0.05 0.04 0.03 0.02 0.28 0.25 0.21 0.56 0.37 1.0 0.65 0.11 0.59 0.62 0.31 0.6 0.24 0.95 0.87 0.2 0.11 0.23 0.59 0.33 0.3
Sro1258_g256830.1 (Contig3284.g25820)
 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 0.05 0.14 0.2 0.08 0.17 0.24 0.06 0.11 0.44 0.23 1.0 0.83 0.68 0.33 0.12 0.16 0.02 0.06 0.04 0.09
Sro1311_g261760.1 (Contig1682.g15103)
 0.0 0.33 0.24 0.0 0.11 0.0 0.03 0.02 0.0 0.21 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.11 0.76 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1311_g261770.1 (Contig1682.g15104)
 0.0 0.23 0.24 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.11 0.0 0.02 0.18 0.0 0.01 0.03 0.01 1.0 0.32 0.44 0.02 0.05 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01
0.87 0.05 0.02 0.07 0.07 0.09 0.12 0.28 0.09 0.4 0.22 0.43 0.38 0.14 0.3 0.32 0.18 0.8 0.23 0.69 0.22 0.07 0.09 1.0 0.79 0.18 0.13
Sro1490_g277050.1 (Contig2636.g21357)
 0.08 0.08 0.13 0.14 0.13 0.02 0.02 0.21 0.22 0.22 0.03 0.26 0.11 0.05 0.06 0.06 0.05 0.12 0.06 1.0 0.29 0.24 0.04 0.01 0.01 0.02 0.1
Sro1561_g282610.1 (Contig3759.g28832)
 0.13 0.03 0.01 0.04 0.0 0.04 0.12 0.26 0.1 0.47 0.38 0.75 0.98 0.1 0.64 0.64 0.28 0.79 0.14 1.0 0.83 0.06 0.1 0.3 0.48 0.09 0.29
Sro1642_g288090.1 (Contig4503.g33767)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1682_g290880.1 (Contig3596.g27794)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1835_g300560.1 (Contig4635.g34562)
 0.04 0.0 0.06 0.0 0.01 0.12 0.22 0.19 0.21 0.57 0.21 1.0 0.67 0.21 0.29 0.47 0.32 0.39 0.28 0.94 0.61 0.09 0.13 0.14 0.32 0.09 0.18
Sro1851_g301680.1 (Contig3358.g26295)
 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.01 0.01 0.03 0.15 0.03 0.03 0.84 0.09 0.1 0.55 0.02 1.0 0.92 0.55 0.17 0.04 0.01 0.0 0.0 0.09 0.1
Sro1928_g306020.1 (Contig2945.g23384)
 0.0 0.09 0.05 0.02 0.18 0.02 0.13 0.08 0.04 0.3 0.02 0.3 0.55 0.14 0.14 0.33 0.04 0.63 1.0 0.74 0.48 0.09 0.08 0.0 0.0 0.27 0.1
Sro2083_g313780.1 (Contig2803.g22536)
 0.05 0.0 0.02 0.03 0.0 0.03 0.02 0.08 0.03 0.18 0.0 0.18 0.13 0.02 0.03 0.03 0.01 1.0 0.32 0.78 0.26 0.11 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro213_g088470.1 (Contig1149.g10987)
 0.12 0.07 0.07 0.05 0.04 0.13 0.09 0.19 0.11 0.35 0.13 0.48 0.59 0.04 0.24 0.2 0.16 1.0 0.27 0.81 0.42 0.03 0.07 0.18 0.38 0.15 0.12
Sro216_g089280.1 (Contig227.g2705)
 1.0 0.51 0.63 0.43 0.57 0.05 0.19 0.5 0.54 0.4 0.33 0.75 0.22 0.16 0.23 0.2 0.31 0.54 0.3 0.23 0.39 0.44 0.24 0.34 0.18 0.24 0.19
Sro216_g089520.1 (Contig227.g2729)
 0.06 0.06 0.02 0.05 0.07 0.11 0.44 0.37 0.2 0.66 0.41 1.0 0.46 0.12 0.63 0.44 0.41 0.7 0.22 0.71 0.91 0.14 0.1 0.45 0.97 0.42 0.27
Sro243_g096880.1 (Contig3073.g24512)
 0.07 0.05 0.04 0.05 0.12 0.1 0.06 0.32 0.39 0.39 0.09 0.66 0.59 0.05 0.06 0.04 0.06 0.84 0.17 1.0 0.22 0.12 0.13 0.0 0.02 0.05 0.06
Sro2452_g328140.1 (Contig3548.g27405)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.03 0.0 0.06 0.02 0.05 0.0 1.0 0.22 0.13 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04
Sro2452_g328150.1 (Contig3548.g27406)
 0.06 0.06 0.1 0.02 0.04 0.0 0.01 0.06 0.15 0.3 0.07 0.24 0.23 0.1 0.12 0.2 0.03 0.62 0.18 1.0 0.43 0.15 0.09 0.01 0.0 0.03 0.1
0.0 0.04 0.08 0.0 0.03 0.03 0.02 0.08 0.16 0.15 0.0 0.07 0.08 0.2 0.02 0.12 0.0 1.0 0.26 0.24 0.41 0.08 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro2502_g329540.1 (Contig3589.g27742)
 0.04 0.07 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.16 0.08 0.13 0.59 0.01 0.08 0.0 0.25 0.82 0.06 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03
Sro2677_g334420.1 (Contig4486.g33714)
 0.0 0.04 0.04 0.03 0.01 0.04 0.26 0.22 0.22 0.12 0.15 0.01 0.17 0.05 0.2 0.24 0.13 1.0 0.85 0.48 0.1 0.12 0.1 0.18 0.04 0.03 0.18
Sro2682_g334510.1 (Contig2860.g22934)
 0.24 0.06 0.06 0.08 0.09 0.12 0.1 0.21 0.19 0.44 0.19 0.79 0.48 0.12 0.13 0.15 0.19 0.66 0.23 1.0 0.28 0.14 0.14 0.04 0.02 0.05 0.13
Sro285_g108100.1 (Contig491.g6616)
 0.04 0.07 0.02 0.05 0.03 0.31 0.29 0.3 0.11 0.41 0.33 0.4 0.24 0.15 0.48 0.39 0.2 0.5 0.36 0.43 0.52 0.19 0.06 0.42 1.0 0.42 0.27
Sro302_g112190.1 (Contig378.g5077)
 0.18 0.0 0.04 0.04 0.04 0.11 0.1 0.1 0.04 0.73 0.05 1.0 0.31 0.31 0.17 0.0 0.16 0.07 0.11 0.93 0.48 0.04 0.06 0.05 0.14 0.26 0.14
Sro3368_g347290.1 (Contig3351.g26220)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 1.0 0.44 0.09 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3434_g348000.1 (Contig3411.g26618)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3719_g350620.1 (Contig1300.g12058)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.05 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro380_g130720.1 (Contig3948.g30264)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.0 0.05 0.0 0.09 0.06 0.0 0.0 0.0 0.02 1.0 0.23 0.41 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.08 0.11 0.09 0.13 0.14 0.15 0.06 0.44 0.26 0.35 0.11 0.38 0.25 0.1 0.05 0.13 0.12 0.73 0.28 1.0 0.41 0.32 0.12 0.02 0.0 0.07 0.06
0.14 0.07 0.12 0.21 0.2 0.08 0.31 0.22 0.36 0.59 0.38 0.92 0.93 0.26 0.33 0.58 0.25 0.41 0.36 1.0 0.48 0.11 0.32 0.12 0.2 0.32 0.27
Sro506_g156330.1 (Contig3494.g27110)
 1.0 0.43 0.4 0.12 0.12 0.03 0.01 0.24 0.45 0.35 0.04 0.53 0.55 0.03 0.07 0.0 0.03 0.36 0.32 0.75 0.19 0.2 0.19 0.05 0.0 0.03 0.07
Sro52_g030810.1 (Contig3190.g25164)
 0.04 0.07 0.1 0.05 0.04 0.06 0.02 0.16 0.13 0.25 0.07 0.42 0.14 0.19 0.14 0.28 0.06 1.0 0.18 0.84 0.53 0.06 0.08 0.02 0.0 0.01 0.16
0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.02 0.1 0.07 0.01 0.08 0.08 0.01 0.01 0.06 0.0 1.0 0.22 0.22 0.36 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.05
Sro555_g165720.1 (Contig677.g7920)
 0.19 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 0.11 0.17 0.45 0.09 1.0 0.45 0.04 0.07 0.06 0.07 0.37 0.11 0.78 0.25 0.21 0.09 0.04 0.01 0.03 0.05
Sro625_g177490.1 (Contig691.g8087)
 1.0 0.26 0.34 0.43 0.28 0.14 0.17 0.54 0.38 0.34 0.28 0.27 0.21 0.08 0.21 0.21 0.2 0.31 0.23 0.31 0.4 0.24 0.14 0.35 0.3 0.21 0.21
Sro641_g179980.1 (Contig1098.g10642)
 0.11 0.04 0.03 0.05 0.06 0.06 0.12 0.22 0.22 0.51 0.14 0.88 0.68 0.08 0.18 0.18 0.11 0.92 0.24 1.0 0.41 0.12 0.1 0.04 0.12 0.05 0.11
Sro660_g182950.1 (Contig1196.g11300)
 0.03 0.46 0.41 0.32 0.2 0.0 0.55 0.49 0.47 0.49 0.36 0.83 0.87 0.03 0.08 0.1 0.21 0.93 0.32 1.0 0.17 0.36 0.46 0.03 0.02 0.11 0.1
Sro738_g195210.1 (Contig2916.g23200)
 0.0 0.61 0.11 0.1 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.59 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro74_g040660.1 (Contig4700.g34928)
 0.71 0.06 0.04 0.04 0.04 0.14 0.12 0.31 0.25 0.55 0.26 1.0 0.23 0.16 0.18 0.21 0.3 0.28 0.19 0.52 0.61 0.15 0.12 0.06 0.09 0.08 0.12
Sro782_g201810.1 (Contig2391.g19605)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 1.0 0.55 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.09 0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.09 0.24 0.04 0.43 0.03 1.0 0.34 0.04 0.06 0.1 0.05 0.38 0.15 0.57 0.37 0.12 0.05 0.0 0.01 0.02 0.04
Sro825_g207680.1 (Contig229.g2766)
 0.2 0.03 0.04 0.04 0.04 0.06 0.1 0.38 0.28 0.55 0.18 0.82 0.66 0.1 0.16 0.14 0.17 0.95 0.19 0.99 0.67 0.17 0.17 0.34 1.0 0.08 0.12
Sro839_g209230.1 (Contig1990.g17030)
 0.02 0.07 0.05 0.04 0.03 0.22 0.2 0.33 0.17 0.45 0.29 0.75 0.53 0.17 0.5 0.4 0.37 1.0 0.27 0.62 0.87 0.21 0.1 0.29 0.88 0.27 0.18
Sro855_g211360.1 (Contig1132.g10850)
 0.12 0.05 0.03 0.03 0.03 0.08 0.12 0.5 0.48 0.6 0.17 0.93 0.57 0.07 0.16 0.2 0.19 1.0 0.2 0.91 0.6 0.25 0.17 0.06 0.28 0.05 0.15
Sro917_g219930.1 (Contig3222.g25471)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.6 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro932_g221680.1 (Contig2857.g22911)
 0.07 0.07 0.11 0.09 0.07 0.15 0.38 0.45 0.29 0.52 0.47 0.78 1.0 0.15 0.48 0.61 0.29 0.64 0.81 0.99 0.65 0.4 0.22 0.44 0.69 0.34 0.33
Sro935_g221990.1 (Contig1126.g10779)
 0.42 0.05 0.02 0.07 0.06 0.3 0.04 0.09 0.07 0.47 0.13 1.0 0.37 0.23 0.07 0.03 0.02 0.28 0.07 0.45 0.41 0.07 0.08 0.04 0.08 0.05 0.08
Sro937_g222150.1 (Contig2321.g19157)
 0.01 0.02 0.03 0.02 0.06 0.0 0.16 0.12 0.26 0.34 0.1 0.69 0.55 0.06 0.06 0.09 0.29 0.7 0.15 1.0 0.25 0.25 0.21 0.04 0.0 0.03 0.07
Sro962_g225080.1 (Contig891.g9476)
 1.0 0.0 0.01 0.05 0.03 0.01 0.05 0.12 0.03 0.28 0.0 0.43 0.21 0.04 0.03 0.03 0.02 0.16 0.02 0.39 0.2 0.07 0.05 0.04 0.0 0.01 0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)