Heatmap: Cluster_227 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1029_g233270.1 (Contig460.g6200)
2264.88 32.34 22.91 27.97 23.41 41.69 54.91 58.41 37.48 147.84 87.03 143.79 66.51 109.32 67.59 61.95 54.35 61.13 86.5 111.11 104.1 38.53 79.91 132.9 98.07 51.36 57.11
Sro1037_g234120.1 (Contig2347.g19301)
265.57 4.09 5.16 3.86 3.65 8.08 14.54 15.48 8.64 19.57 16.83 19.27 19.18 14.45 16.61 9.35 9.93 14.47 10.1 13.83 28.15 11.62 15.78 35.0 31.96 17.41 9.86
Sro107_g053850.1 (Contig1548.g14060)
394.02 4.05 26.79 13.93 7.43 2.87 3.35 3.95 5.45 19.84 5.78 15.9 4.7 3.33 4.6 1.56 4.72 8.74 12.27 13.95 21.36 6.3 4.68 12.14 16.14 10.64 3.7
Sro112_g055770.1 (Contig1575.g14302)
126.84 0.0 0.39 0.0 0.0 0.59 3.59 4.66 0.6 7.72 3.68 5.69 4.16 3.52 5.83 5.49 2.23 0.45 0.89 6.03 11.82 3.74 1.78 7.64 5.65 0.99 2.95
Sro1169_g248600.1 (Contig2988.g23732)
4486.89 84.44 53.97 105.12 118.67 96.38 155.91 183.7 78.84 395.06 122.73 339.21 94.21 270.76 135.69 168.91 123.82 75.33 106.92 124.74 417.71 91.02 128.11 558.78 535.49 152.94 120.32
Sro118_g057600.1 (Contig2714.g21830)
27.51 0.58 0.5 0.71 0.45 0.24 1.08 2.1 0.72 2.99 1.98 3.01 3.3 2.3 1.5 1.05 1.3 1.16 1.73 4.06 2.39 0.46 0.49 0.94 1.63 0.81 1.25
Sro1218_g253320.1 (Contig436.g5880)
126.16 8.65 14.0 8.7 6.34 6.95 11.51 11.02 10.18 18.8 21.99 19.55 40.39 13.87 15.32 13.74 11.94 9.53 15.55 33.93 17.96 9.79 8.14 16.83 13.18 9.01 14.31
Sro1220_g253590.1 (Contig4141.g31646)
1135.8 44.05 87.36 127.75 90.02 113.66 154.7 105.2 143.78 141.81 203.17 152.66 201.52 88.77 138.32 117.9 158.18 74.29 77.69 197.34 144.18 48.08 105.98 150.86 197.91 103.11 86.43
Sro1311_g261790.1 (Contig1682.g15106)
28.16 0.35 0.56 0.4 0.18 0.09 1.18 1.17 0.17 1.4 0.32 0.66 6.42 0.33 0.87 0.29 0.47 1.24 0.94 5.03 1.34 0.23 0.49 1.55 3.04 1.3 0.18
123.85 0.18 0.43 0.19 0.25 0.78 4.59 3.15 1.07 8.29 4.74 3.83 5.1 6.13 8.05 4.86 6.43 4.48 2.58 4.32 9.73 2.67 1.97 11.85 14.7 4.63 3.38
Sro13_g010360.1 (Contig337.g4577)
811.77 2.08 3.63 3.73 2.15 1.21 7.99 11.02 3.13 50.26 6.8 39.16 17.84 18.52 8.66 7.97 5.9 9.0 29.16 27.02 50.08 8.06 12.59 32.22 65.63 16.5 6.27
Sro1401_g269400.1 (Contig1376.g12624)
52.67 0.84 1.11 1.59 1.04 3.97 2.66 0.86 0.77 6.3 3.2 7.63 6.68 10.76 4.64 4.21 1.66 4.15 4.19 7.05 6.59 3.86 1.06 4.29 6.32 3.18 3.22
Sro1435_g272340.1 (Contig4058.g31110)
146.86 2.16 2.4 2.16 2.15 0.63 2.26 1.88 3.42 7.16 1.76 4.1 21.22 1.0 1.72 0.81 1.3 2.65 3.25 28.65 5.28 1.81 2.36 1.22 3.03 1.69 1.26
Sro1455_g274120.1 (Contig3944.g30236)
738.18 5.68 5.0 8.07 5.82 15.32 39.83 41.2 23.25 65.14 40.24 46.65 31.68 41.48 72.7 43.07 29.56 35.29 73.34 37.94 54.64 32.18 26.56 97.04 134.14 40.62 22.93
Sro1476_g275920.1 (Contig1982.g16967)
260.51 20.5 26.04 28.81 20.6 19.75 36.94 28.72 42.43 50.02 55.52 58.19 63.05 32.06 40.49 42.51 40.55 30.08 37.85 75.14 55.99 18.87 26.02 46.59 33.89 24.86 32.86
Sro1504_g278140.1 (Contig3213.g25415)
144.39 12.2 13.09 10.1 12.79 3.13 6.57 5.46 7.41 16.23 9.06 15.4 22.16 10.05 8.58 8.68 8.34 8.17 13.82 23.88 18.48 6.44 5.69 9.2 9.67 5.43 6.61
Sro1528_g279930.1 (Contig526.g6883)
65.59 0.91 1.53 1.15 0.94 1.81 2.41 2.72 1.6 8.4 4.31 9.17 13.53 1.74 4.3 4.29 2.34 9.8 10.67 17.3 9.75 1.1 0.78 7.26 8.15 3.57 2.87
Sro1541_g280920.1 (Contig4013.g30880)
368.04 6.15 5.29 5.73 4.4 9.45 28.27 20.33 19.84 44.52 24.12 40.91 47.6 39.02 23.88 28.48 18.44 21.85 26.41 56.49 59.56 13.53 18.41 37.71 48.03 23.98 14.73
Sro1579_g283730.1 (Contig3855.g29674)
219.78 12.8 16.46 17.19 14.1 8.7 15.5 10.44 16.14 28.57 20.85 31.91 49.23 24.02 18.18 17.76 16.74 14.98 20.1 36.36 29.54 13.43 14.08 13.97 13.12 11.41 13.16
Sro1631_g287230.1 (Contig2461.g20146)
1261.55 10.67 19.06 6.3 6.27 17.7 16.61 19.32 21.27 67.73 52.21 51.96 48.34 55.31 43.55 37.02 32.41 24.99 45.09 35.07 84.15 29.73 34.51 74.12 42.5 24.33 42.75
Sro1653_g288850.1 (Contig3957.g30321)
322.01 3.41 4.43 4.19 3.27 5.04 12.66 8.89 7.3 24.48 14.19 19.57 31.54 17.32 13.53 11.14 8.92 10.34 15.34 45.79 23.25 6.05 7.98 24.96 28.68 8.8 7.57
Sro175_g076950.1 (Contig1856.g16211)
157.13 5.65 8.69 4.38 3.46 5.32 10.99 6.84 11.33 16.28 14.98 14.28 26.54 6.51 10.75 11.43 10.17 8.36 14.46 40.83 19.79 11.88 6.72 17.7 23.35 8.72 7.9
Sro183_g079670.1 (Contig3056.g24312)
224.63 8.71 17.86 17.21 14.98 9.29 8.19 7.59 8.77 20.52 21.43 13.47 34.62 16.72 18.9 22.58 14.72 23.7 23.08 28.44 10.31 5.8 9.3 11.77 7.29 5.62 12.04
Sro190_g081830.1 (Contig3488.g27058)
113.95 12.26 8.23 12.46 7.48 2.73 5.01 3.72 2.55 9.67 9.15 7.46 23.08 7.05 7.35 7.06 6.52 6.15 6.23 15.42 9.58 5.07 2.22 13.14 6.98 3.29 4.91
Sro1940_g306630.1 (Contig1706.g15275)
130.69 0.32 0.25 0.47 0.32 3.88 10.72 5.7 5.14 14.09 10.63 14.66 20.97 15.07 14.74 16.05 11.79 16.89 13.33 30.27 16.6 9.71 3.81 10.41 21.06 11.36 8.85
Sro200_g084620.1 (Contig201.g2353)
291.76 4.51 4.94 2.68 1.75 2.77 3.59 6.4 3.4 17.6 10.13 15.36 6.3 10.03 9.5 5.96 6.88 10.91 12.71 8.63 12.7 9.11 4.81 17.46 8.74 5.24 6.6
Sro21_g014760.1 (Contig813.g9066)
40.46 0.38 0.18 0.0 0.0 0.14 0.8 1.7 1.1 2.09 0.76 1.11 3.7 1.04 0.26 0.48 0.33 0.2 0.84 4.99 1.74 1.27 2.39 0.56 0.98 0.9 0.32
Sro229_g093110.1 (Contig429.g5815)
99.53 5.83 6.37 7.34 5.8 5.34 12.0 10.46 10.01 15.41 16.62 15.01 19.14 12.49 12.89 14.67 11.16 10.73 15.41 21.19 15.7 14.04 9.99 16.9 12.07 7.16 10.09
Sro229_g093180.1 (Contig429.g5822)
345.53 11.15 15.17 18.06 15.16 16.84 25.27 23.62 13.06 48.12 35.77 39.89 43.27 31.61 37.63 54.1 23.86 33.05 32.36 59.61 44.41 17.97 11.94 35.87 46.45 16.82 25.2
Sro232_g093910.1 (Contig4063.g31156)
168.7 2.41 1.65 1.97 1.49 1.35 5.04 4.85 1.94 13.03 4.78 11.13 18.01 8.99 5.98 6.83 4.73 7.34 9.05 27.26 11.52 5.81 4.01 7.06 12.4 9.51 5.31
Sro232_g094020.1 (Contig4063.g31167)
520.75 3.51 2.09 3.57 3.47 7.47 10.27 13.86 9.94 40.08 14.41 38.16 17.12 26.12 16.84 11.8 15.99 13.13 26.62 24.32 36.33 17.9 7.04 16.45 17.72 10.56 10.16
42.54 0.56 0.48 1.21 0.49 0.22 1.0 1.07 1.08 2.53 2.01 1.71 4.35 3.07 2.27 3.1 0.69 1.26 0.86 5.75 2.18 3.19 1.41 2.77 1.85 0.66 0.72
Sro255_g100300.1 (Contig2336.g19207)
565.45 22.83 36.83 38.74 34.83 8.92 17.35 27.71 23.9 40.68 22.73 32.26 25.11 10.15 21.67 18.23 12.79 12.33 13.31 33.83 49.0 15.8 8.11 27.34 45.17 18.17 15.6
222.75 5.37 6.06 7.59 5.26 1.97 2.08 2.17 2.41 12.54 6.94 8.3 32.62 3.65 5.52 7.99 4.43 10.77 9.72 35.43 7.73 1.8 2.89 3.29 3.18 5.17 4.54
Sro273_g104990.1 (Contig4205.g31980)
749.67 3.54 9.11 7.59 4.82 10.12 11.31 6.07 0.14 37.07 20.54 20.91 23.45 11.69 23.33 19.26 15.46 27.78 17.24 27.26 38.63 0.0 0.0 38.59 72.41 33.85 14.31
Sro277_g106350.1 (Contig444.g5973)
1707.92 5.26 4.17 26.83 6.2 5.93 31.92 48.43 21.22 100.19 25.37 72.66 28.75 53.81 45.37 20.66 17.32 20.59 90.48 48.74 59.34 15.45 25.78 57.89 65.41 17.38 15.85
Sro287_g108570.1 (Contig252.g3098)
2111.19 7.31 10.67 24.97 7.41 16.52 45.7 64.63 27.73 147.09 67.14 176.6 46.59 92.57 82.65 26.2 46.86 26.48 72.91 72.51 143.68 37.51 63.99 225.39 280.01 50.45 27.83
Sro288_g108830.1 (Contig62.g503)
281.51 8.52 12.25 16.14 11.23 5.16 24.96 17.95 18.53 35.86 15.55 30.3 56.19 28.93 20.42 36.53 14.65 13.8 13.27 35.66 33.76 20.27 19.65 11.99 13.89 11.02 10.68
Sro30_g019460.1 (Contig3962.g30346)
128.12 1.73 2.06 1.95 1.62 1.37 4.54 2.82 3.44 9.21 3.4 6.28 10.71 6.16 3.07 4.01 3.48 5.07 8.71 12.72 7.08 5.4 3.68 2.21 1.19 1.56 2.37
Sro316_g115480.1 (Contig2414.g19754)
422.18 10.78 17.13 25.58 21.34 22.66 29.99 22.13 25.79 49.36 40.48 57.03 72.72 57.21 35.61 40.7 38.45 37.45 42.75 63.22 45.84 21.79 27.89 27.23 19.93 21.18 25.36
Sro324_g117480.1 (Contig590.g7386)
64.71 5.85 3.25 4.32 3.13 1.38 3.05 1.46 1.09 6.98 8.98 6.91 8.54 3.16 4.39 3.03 4.04 4.92 7.87 15.41 7.03 2.57 1.34 3.88 3.17 3.18 4.66
Sro353_g124400.1 (Contig1923.g16574)
31.23 0.67 0.39 0.54 0.75 0.3 0.94 0.55 0.55 2.34 1.63 1.58 6.11 2.71 1.41 1.07 1.16 0.81 0.7 6.09 3.68 1.37 0.5 1.21 1.88 0.87 0.54
Sro355_g124940.1 (Contig2977.g23652)
451.67 19.53 25.05 29.99 28.16 22.4 49.25 28.02 41.31 67.14 42.44 66.27 65.2 48.74 42.7 45.03 41.63 56.11 68.13 78.51 70.86 37.93 41.9 39.55 43.44 35.26 25.21
Sro370_g128310.1 (Contig2388.g19570)
210.54 8.17 8.27 9.62 9.05 1.06 6.93 5.57 4.79 10.57 4.74 5.92 30.6 3.7 5.53 10.91 8.31 17.6 10.57 17.69 8.76 1.51 3.95 4.8 9.83 4.99 4.36
Sro373_g129130.1 (Contig1347.g12398)
93.3 0.93 1.26 1.09 0.75 1.83 3.17 3.35 1.58 6.71 4.72 7.45 8.59 3.52 3.94 3.45 3.35 3.89 5.11 13.1 6.81 1.33 1.46 4.83 2.98 2.89 2.51
Sro399_g134790.1 (Contig279.g3606)
105.98 8.02 8.82 7.1 4.62 2.85 6.88 3.35 5.67 9.62 7.83 8.7 28.7 7.47 6.69 8.77 6.93 6.79 10.72 24.42 9.09 7.67 5.66 6.31 6.26 3.79 4.21
Sro399_g134860.1 (Contig279.g3613)
511.25 9.15 8.82 18.43 16.47 19.39 48.66 38.68 35.73 64.95 37.44 70.92 76.12 63.01 39.37 48.37 38.33 34.99 39.19 68.6 72.06 29.23 36.54 22.56 28.65 25.3 25.77
Sro426_g140270.1 (Contig1720.g15372)
4807.4 12.54 12.12 24.59 8.67 15.26 67.08 146.8 65.04 217.83 57.85 159.63 42.79 89.34 108.96 55.61 44.48 94.74 51.12 56.41 201.69 11.58 195.07 289.32 384.47 74.08 49.14
Sro436_g142510.1 (Contig228.g2739)
1034.71 1.76 2.39 1.95 1.27 6.5 16.95 21.02 9.19 58.14 26.72 52.24 23.44 29.89 28.57 23.26 8.94 18.02 23.73 37.77 42.11 6.3 18.37 73.85 100.79 16.98 15.83
Sro481_g151700.1 (Contig3107.g24728)
51.97 0.22 0.23 0.51 0.39 0.94 3.62 5.66 3.94 5.84 5.84 5.28 4.22 1.43 3.66 3.29 1.6 3.08 5.08 6.69 6.43 2.33 1.37 4.59 2.24 2.66 4.93
Sro4_g003250.1 (Contig3815.g29243)
323.2 28.56 35.94 22.58 28.21 13.0 19.67 9.03 15.75 40.79 20.31 39.5 61.51 32.78 21.88 21.82 24.75 16.22 28.42 50.46 39.33 22.07 17.85 23.66 26.07 28.04 21.4
2.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 0.03 0.2 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro596_g172800.1 (Contig2605.g21084)
103.48 3.87 3.25 4.05 6.6 1.22 3.46 1.74 4.26 10.04 5.81 8.09 5.9 5.69 4.8 3.68 4.18 7.53 15.8 12.19 10.19 3.44 2.89 6.15 3.96 2.93 4.7
Sro61_g035030.1 (Contig3112.g24756)
446.38 6.79 3.79 2.78 3.11 10.29 11.15 9.92 4.33 28.99 22.59 32.53 8.33 17.88 15.05 12.16 12.19 9.57 17.13 14.37 19.36 11.33 5.66 21.29 8.29 7.12 13.72
Sro638_g179560.1 (Contig628.g7619)
211.47 2.44 3.87 3.61 2.27 5.67 6.98 13.96 3.78 19.0 11.71 16.55 9.56 10.08 10.13 10.78 5.93 3.47 3.23 13.49 22.32 3.83 9.69 41.0 32.69 9.58 7.5
Sro658_g182790.1 (Contig1438.g13229)
29.73 1.04 1.29 0.79 0.9 0.03 0.92 0.32 0.78 1.53 0.94 1.36 1.56 0.36 0.51 0.81 0.52 0.68 0.5 2.81 1.13 0.88 1.24 0.44 0.46 0.7 0.47
Sro680_g186210.1 (Contig3657.g28235)
405.08 24.9 31.56 26.54 26.47 12.77 20.71 23.19 28.67 41.68 48.56 40.83 57.04 34.74 41.8 47.24 39.61 21.6 24.11 42.05 32.02 7.91 18.63 39.27 29.31 20.2 30.8
Sro68_g038150.1 (Contig2027.g17396)
176.22 7.23 8.39 6.46 7.47 6.9 4.83 4.91 1.52 12.76 6.58 12.31 8.03 1.08 6.17 2.76 5.97 17.31 22.48 11.87 18.87 8.33 3.19 10.25 6.13 3.84 3.91
52.17 0.61 0.17 0.09 0.17 0.53 0.83 0.11 0.0 4.22 2.06 4.39 4.67 3.5 1.2 1.1 1.41 0.26 1.18 4.93 4.11 0.0 0.0 1.14 1.56 0.87 0.93
Sro710_g191150.1 (Contig1639.g14787)
62.56 0.0 0.33 0.59 0.21 0.31 1.22 0.9 1.21 4.91 2.39 5.15 5.91 3.82 2.05 1.66 1.32 1.41 3.09 10.11 4.41 0.17 0.15 1.86 4.34 1.33 2.0
Sro732_g194420.1 (Contig2721.g21951)
196.12 9.41 5.18 7.81 7.71 3.3 10.28 7.4 5.73 18.88 7.2 18.14 13.71 14.52 8.71 10.88 7.5 11.13 11.26 14.04 23.41 4.87 4.9 12.24 15.12 8.09 6.72
Sro734_g194770.1 (Contig3769.g28955)
150.7 2.84 5.88 4.32 3.73 0.62 5.78 7.71 9.58 9.51 2.81 8.28 12.38 3.67 1.91 2.37 1.06 3.34 3.64 16.48 9.12 1.6 4.64 12.83 28.73 8.72 1.44
Sro763_g198860.1 (Contig4662.g34690)
312.93 24.44 29.59 21.94 15.67 6.42 16.0 12.58 22.47 25.54 14.3 18.43 39.07 15.83 11.74 9.47 13.38 13.62 19.29 31.46 20.79 23.03 21.58 9.09 6.31 6.54 9.46
Sro763_g198870.1 (Contig4662.g34691)
202.04 4.05 2.82 2.43 3.33 2.74 4.14 2.93 6.68 15.35 9.68 12.35 27.24 11.64 6.66 4.93 3.1 9.5 13.31 18.62 13.16 2.22 7.4 3.63 1.99 2.03 5.86
Sro763_g198890.1 (Contig4662.g34693)
931.33 5.72 5.98 4.87 5.16 9.24 19.01 11.97 19.75 60.83 11.06 54.77 70.72 24.92 13.36 16.19 10.42 21.65 40.3 89.43 86.6 18.8 19.58 14.0 20.48 13.6 7.99
Sro806_g205120.1 (Contig1260.g11798)
237.75 4.54 12.18 11.31 6.07 6.85 8.86 7.54 5.46 18.99 25.02 12.94 23.28 9.47 21.8 20.86 11.38 15.38 16.34 35.45 18.45 2.98 3.94 27.55 51.12 18.34 16.14
Sro809_g205610.1 (Contig3027.g24124)
1824.55 9.91 7.86 11.65 6.77 41.11 31.86 52.84 33.85 133.7 85.47 138.18 41.64 77.25 82.17 24.18 45.89 19.83 21.48 76.28 94.23 31.72 31.89 73.27 90.89 37.94 22.46
Sro811_g205970.1 (Contig4366.g32894)
171.25 5.96 12.4 10.62 11.6 6.11 14.68 14.48 13.65 20.44 20.58 19.46 47.78 14.91 16.21 19.57 9.45 16.34 18.49 51.23 16.96 3.98 7.53 30.79 29.26 13.66 12.85
Sro820_g207200.1 (Contig34.g202)
159.04 10.54 13.73 12.99 9.12 4.41 7.37 4.99 10.03 14.34 4.33 7.85 29.43 3.28 3.12 3.22 4.3 3.5 5.32 17.84 7.28 9.46 8.36 4.17 3.35 1.62 2.29
164.18 3.2 3.4 4.86 4.62 2.9 6.54 9.45 9.76 15.25 4.85 10.37 29.93 3.8 4.53 0.84 2.84 5.32 7.07 17.28 7.2 7.13 8.11 3.36 1.98 1.52 2.51
Sro828_g208010.1 (Contig4589.g34277)
2364.06 29.38 25.61 34.98 26.74 99.53 244.7 192.59 215.87 305.69 123.49 312.09 406.86 324.92 130.69 118.48 130.17 172.81 155.32 232.87 338.88 165.26 242.62 70.68 116.37 93.92 70.97
Sro835_g208900.1 (Contig3133.g24872)
78.64 0.3 0.87 0.56 0.14 0.64 1.79 0.81 0.91 5.76 2.59 4.38 3.14 2.66 2.83 4.1 3.51 1.19 2.14 5.27 5.84 0.85 0.76 2.16 2.97 4.33 2.38
Sro846_g210210.1 (Contig3685.g28437)
226.72 0.08 0.23 0.25 0.3 0.29 1.79 0.94 0.13 8.5 0.48 1.98 58.35 0.79 1.34 0.39 0.63 3.2 1.83 68.31 2.4 0.45 0.28 4.51 7.18 2.27 0.26
55.25 0.44 0.35 0.69 0.42 1.68 1.83 1.09 1.81 5.67 2.19 6.87 6.6 4.65 2.84 2.97 3.24 3.43 4.86 6.8 4.86 1.32 0.99 1.94 1.95 2.13 1.54

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)