Heatmap: Cluster_186 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1012_g231230.1 (Contig304.g3993)	1.0	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.12	0.06	0.1	0.07	0.05	0.04	0.02	0.03	0.01	0.05	0.07	0.08	0.04	0.03	0.07	0.03	0.02	0.04
Sro1198_g251640.1 (Contig1060.g10394)	1.0	0.0	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.13	0.11	0.44	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.38	0.52	0.14	0.01
Sro124_g060020.1 (Contig2339.g19253)	1.0	0.07	0.11	0.12	0.09	0.05	0.05	0.12	0.11	0.43	0.16	0.15	0.27	0.14	0.11	0.11	0.17	0.12	0.13	0.24	0.15	0.06	0.1	0.05	0.04	0.06	0.08
Sro1392_g268880.1 (Contig2185.g18223)	1.0	0.03	0.04	0.05	0.05	0.01	0.03	0.06	0.05	0.12	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.09	0.03	0.11	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.02
Sro13_g009670.1 (Contig337.g4508)	1.0	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.08	0.18	0.04	0.1	0.07	0.06	0.04	0.03	0.03	0.03	0.11	0.18	0.08	0.07	0.06	0.02	0.02	0.04	0.04
Sro1460_g274590.1 (Contig332.g4411)	1.0	0.02	0.06	0.09	0.05	0.01	0.03	0.03	0.06	0.16	0.04	0.03	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.05	0.05	0.06	0.02	0.03	0.08	0.08	0.06	0.02
Sro1568_g283070.2	1.0	0.04	0.07	0.02	0.02	0.0	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.09	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.07	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02
Sro1577_g283580.1 (Contig4524.g33888)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.14	0.01	0.02	0.04	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro166_g074020.1 (Contig1709.g15281)	1.0	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.09	0.25	0.27	0.86	0.16	0.24	0.51	0.13	0.11	0.14	0.14	0.09	0.2	0.61	0.12	0.16	0.13	0.04	0.01	0.03	0.08
Sro1798_g298260.1 (Contig1745.g15540)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0
Sro17_g012450.1 (Contig269.g3424)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.09	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.0	0.01	0.01	0.01
Sro1898_g304160.1 (Contig1148.g10965)	1.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.09	0.16	0.07	0.1	0.1	0.21	0.06	0.02	0.13	0.05	0.04	0.09	0.16	0.04	0.07	0.03	0.06	0.03	0.02
Sro189_g081630.1 (Contig744.g8527)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro198_g084130.1 (Contig2317.g19133)	1.0	0.08	0.15	0.16	0.12	0.06	0.1	0.15	0.15	0.63	0.16	0.27	0.26	0.19	0.15	0.12	0.22	0.12	0.18	0.31	0.23	0.09	0.12	0.09	0.07	0.1	0.14
Sro19_g013400.1 (Contig446.g6004)	1.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.06	0.3	0.06	0.18	0.62	0.09	0.04	0.05	0.03	0.04	0.07	0.22	0.21	0.05	0.04	0.03	0.08	0.03	0.05
Sro200_g084750.1 (Contig201.g2366)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.1	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro200_g084850.1 (Contig201.g2376)	1.0	0.12	0.16	0.14	0.16	0.04	0.1	0.14	0.18	0.18	0.09	0.06	0.09	0.03	0.06	0.06	0.08	0.12	0.16	0.13	0.08	0.17	0.12	0.05	0.06	0.06	0.05
Sro204_g086000.1 (Contig1096.g10630)	1.0	0.0	0.0	0.06	0.08	0.0	0.02	0.17	0.02	0.3	0.15	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.11	0.1	0.1	0.31	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.06	0.02
Sro205_g086240.1 (Contig2217.g18437)	1.0	0.13	0.17	0.12	0.12	0.01	0.01	0.19	0.11	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02
Sro214_g088720.1 (Contig282.g3657)	0.8	0.07	0.06	0.03	0.05	0.01	0.05	0.05	0.07	0.28	0.05	0.2	1.0	0.04	0.05	0.05	0.03	0.07	0.06	0.43	0.14	0.05	0.03	0.05	0.12	0.05	0.04
Sro2326_g323410.1 (Contig1600.g14525)	1.0	0.04	0.09	0.1	0.08	0.04	0.03	0.06	0.08	0.17	0.07	0.08	0.07	0.03	0.04	0.01	0.09	0.07	0.1	0.21	0.1	0.07	0.09	0.05	0.04	0.08	0.04
Sro2326_g323420.1 (Contig1600.g14526)	1.0	0.02	0.08	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.06	0.17	0.02	0.05	0.13	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.1	0.27	0.05	0.05	0.06	0.03	0.02	0.02	0.02
Sro238_g095530.1 (Contig99.g1199)	1.0	0.06	0.1	0.07	0.07	0.02	0.06	0.16	0.15	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.05	0.06	0.04	0.13	0.05	0.02	0.02	0.06	0.07	0.05	0.13	0.09	0.04
Sro2609_g332500.1 (Contig2575.g20917)	1.0	0.03	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.1	0.08	0.0	0.02	0.03	0.09	0.2	0.02	0.09	0.04	0.09	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.12
Sro261_g101860.1 (Contig3068.g24458)	1.0	0.02	0.07	0.01	0.0	0.1	0.04	0.08	0.07	0.64	0.27	0.05	0.14	0.17	0.26	0.16	0.16	0.04	0.06	0.16	0.08	0.0	0.02	0.86	0.46	0.17	0.23
Sro287_g108640.1 (Contig252.g3105)	1.0	0.14	0.19	0.16	0.18	0.03	0.07	0.18	0.16	0.16	0.05	0.07	0.08	0.05	0.04	0.03	0.04	0.09	0.1	0.05	0.08	0.16	0.1	0.04	0.03	0.02	0.03
Sro296_g110680.1 (Contig440.g5907)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.11	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro369_g128270.1 (Contig1690.g15150)	1.0	0.05	0.05	0.08	0.08	0.04	0.05	0.15	0.14	0.16	0.06	0.1	0.11	0.07	0.06	0.05	0.06	0.07	0.16	0.13	0.1	0.04	0.04	0.08	0.07	0.05	0.05
Sro385_g131680.1 (Contig3292.g25850)	1.0	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.03	0.05	0.08	0.02	0.02	0.1	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01
Sro388_g132280.1 (Contig4393.g33002)	1.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.21	0.03	0.07	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.11	0.04	0.07	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02
Sro393_g133510.1 (Contig2258.g18682)	1.0	0.09	0.07	0.07	0.1	0.05	0.11	0.09	0.08	0.29	0.11	0.24	0.27	0.11	0.1	0.1	0.09	0.24	0.33	0.34	0.22	0.08	0.05	0.1	0.11	0.06	0.05
Sro433_g141890.1 (Contig4540.g33951)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro455_g146570.1 (Contig189.g2200)	1.0	0.16	0.11	0.05	0.05	0.08	0.02	0.02	0.0	0.15	0.05	0.1	0.02	0.08	0.06	0.06	0.04	0.05	0.07	0.03	0.05	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.1
Sro469_g149340.1 (Contig2361.g19384)	1.0	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.06	0.09	0.4	0.05	0.09	0.19	0.01	0.04	0.07	0.09	0.23	0.21	0.31	0.23	0.08	0.06	0.02	0.0	0.02	0.03
Sro507_g156550.1 (Contig4452.g33457)	1.0	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.19	0.11	0.03	0.08	0.09	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.06	0.03	0.07	0.03	0.02
Sro50_g028930.1 (Contig297.g3881)	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.04	0.2	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.0	0.0	0.01
Sro512_g157560.1 (Contig4754.g35256)	1.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.1	0.05	0.08	0.18	0.07	0.11	0.16	0.18	0.08	0.08	0.06	0.07	0.07	0.18	0.17	0.05	0.07	0.04	0.05	0.03	0.02
Sro523_g159760.1 (Contig779.g8731)	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.12	0.0	0.15	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0
Sro552_g165150.1 (Contig2064.g17695)	1.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.03	0.02	0.02	0.05	0.13	0.04	0.08	0.06	0.03	0.03	0.01	0.03	0.09	0.13	0.14	0.08	0.05	0.08	0.03	0.09	0.12	0.05
Sro601_g173470.1 (Contig3429.g26705)	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.18	0.15	0.13	0.02	0.07	0.05	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.11	0.11	0.09	0.06	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02
Sro651_g181510.1 (Contig2568.g20855)	1.0	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.08	0.31	0.33	0.35	0.05	0.22	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.03	0.05	0.08	0.19	0.09	0.15	0.03	0.04	0.03	0.04
Sro652_g181760.1 (Contig2024.g17329)	1.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.18	0.16	0.47	0.09	0.35	1.0	0.08	0.07	0.09	0.05	0.05	0.13	0.48	0.34	0.14	0.09	0.04	0.05	0.05	0.08
Sro65_g036980.1 (Contig155.g1768)	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.08	0.02	0.07	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro670_g184640.1 (Contig318.g4216)	1.0	0.04	0.09	0.1	0.12	0.03	0.07	0.14	0.08	0.21	0.03	0.07	0.06	0.01	0.05	0.06	0.0	0.01	0.0	0.25	0.04	0.03	0.03	0.13	0.07	0.08	0.02
Sro67_g037790.1 (Contig495.g6695)	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.19	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro685_g186930.1 (Contig1991.g17048)	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.03	0.03	0.08	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.02	0.03	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01
Sro708_g190690.1 (Contig4523.g33873)	1.0	0.03	0.07	0.05	0.04	0.02	0.02	0.09	0.09	0.17	0.04	0.12	0.07	0.04	0.04	0.03	0.04	0.05	0.14	0.19	0.11	0.06	0.07	0.02	0.03	0.04	0.04
Sro710_g191130.1 (Contig1639.g14785)	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.11	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02
Sro758_g198120.1 (Contig434.g5864)	1.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.04	0.05	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01
Sro788_g202520.1 (Contig3902.g29933)	1.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.05	0.06	0.2	0.11	0.22	0.22	0.18	0.09	0.06	0.12	0.05	0.07	0.22	0.12	0.08	0.07	0.05	0.03	0.03	0.04
Sro79_g042600.1 (Contig1826.g16067)	1.0	0.01	0.01	0.02	0.03	0.08	0.08	0.04	0.06	0.24	0.09	0.22	0.17	0.11	0.07	0.04	0.06	0.13	0.17	0.2	0.16	0.11	0.08	0.1	0.1	0.07	0.05
Sro817_g206750.1 (Contig4010.g30839)	1.0	0.05	0.1	0.06	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.11	0.04	0.08	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.08	0.05	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03
Sro820_g207190.1 (Contig34.g201)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.2	0.13	0.07	0.01	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0
Sro896_g217310.1 (Contig3311.g25942)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.11	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.04	0.06	0.03	0.01
Sro936_g222120.1 (Contig2485.g20359)	1.0	0.08	0.07	0.05	0.04	0.02	0.06	0.14	0.15	0.37	0.03	0.08	0.07	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.12	0.16	0.08	0.1	0.07	0.08	0.03	0.03	0.03
Sro93_g048530.1 (Contig3841.g29541)	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)