Heatmap: Cluster_182 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1009_g230750.1 (Contig1546.g14040)
0.02 1.0 0.61 0.47 0.81 0.08 0.23 0.24 0.52 0.21 0.12 0.13 0.04 0.09 0.14 0.11 0.19 0.02 0.04 0.01 0.08 0.15 0.57 0.38 0.17 0.15 0.11
Sro1028_g233110.1 (Contig2198.g18304)
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1037_g234190.1 (Contig2347.g19308)
0.04 1.0 0.17 0.22 0.24 0.01 0.15 0.22 0.19 0.17 0.0 0.02 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.06 0.07 0.03 0.01 0.32 0.19 0.97 0.1 0.01 0.0
Sro1074_g238250.1 (Contig4290.g32409)
0.0 1.0 0.95 0.55 0.86 0.15 0.39 0.49 0.92 0.3 0.27 0.14 0.13 0.2 0.36 0.09 0.39 0.29 0.31 0.09 0.09 0.9 0.73 0.42 0.1 0.15 0.23
Sro119_g058160.1 (Contig2194.g18289)
0.03 1.0 0.98 0.62 0.88 0.03 0.18 0.05 0.47 0.33 0.05 0.01 0.02 0.06 0.14 0.02 0.12 0.05 0.04 0.02 0.0 0.93 0.6 0.02 0.0 0.02 0.02
Sro123_g059540.1 (Contig66.g643)
0.0 1.0 0.37 0.38 0.53 0.08 0.11 0.08 0.2 0.16 0.04 0.02 0.13 0.08 0.06 0.01 0.15 0.09 0.19 0.07 0.03 0.25 0.28 0.1 0.04 0.07 0.04
Sro1275_g258460.1 (Contig2428.g19845)
0.01 1.0 0.87 0.72 0.68 0.38 0.33 0.29 0.52 0.43 0.47 0.45 0.48 0.38 0.32 0.24 0.49 0.25 0.42 0.44 0.4 0.52 0.53 0.39 0.38 0.43 0.35
Sro136_g064160.1 (Contig2000.g17127)
0.84 0.83 0.24 0.31 0.41 0.0 0.02 0.3 0.25 0.19 0.03 0.01 0.02 0.0 0.04 0.05 0.05 0.01 0.14 0.02 0.03 0.12 0.01 0.73 1.0 0.1 0.02
Sro1669_g289910.1 (Contig3699.g28495)
0.0 0.74 1.0 0.74 0.77 0.05 0.16 0.14 0.25 0.18 0.15 0.04 0.69 0.1 0.29 0.19 0.26 0.34 0.09 0.4 0.04 0.33 0.31 0.08 0.02 0.0 0.14
Sro167_g074310.1 (Contig2973.g23612)
0.67 0.99 0.36 0.71 1.0 0.03 0.36 0.24 0.52 0.16 0.01 0.02 0.02 0.04 0.07 0.0 0.03 0.08 0.08 0.02 0.01 0.5 0.5 0.65 0.29 0.03 0.01
Sro1754_g295450.1 (Contig193.g2257)
0.35 1.0 0.29 0.11 0.18 0.06 0.0 0.01 0.02 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.09 0.03 0.04 0.01 0.0 0.0
Sro1795_g298020.1 (Contig2340.g19257)
0.44 1.0 0.46 0.32 0.15 0.0 0.17 0.07 0.04 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.53 0.4 0.03 0.0
Sro1848_g301470.1 (Contig4444.g33360)
0.0 0.36 0.33 0.5 1.0 0.01 0.25 0.07 0.22 0.09 0.01 0.0 0.01 0.11 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.16 0.37 0.52 0.03 0.01 0.01
Sro1855_g301920.1 (Contig61.g487)
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.14 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro185_g080170.1 (Contig1228.g11492)
0.26 0.45 1.0 0.4 0.41 0.03 0.05 0.22 0.13 0.1 0.03 0.07 0.18 0.15 0.07 0.03 0.03 0.07 0.08 0.08 0.06 0.24 0.08 0.36 0.58 0.15 0.03
Sro1932_g306190.1 (Contig3236.g25589)
0.09 0.43 0.46 0.78 1.0 0.09 0.37 0.35 0.38 0.25 0.12 0.24 0.05 0.16 0.16 0.15 0.1 0.21 0.16 0.07 0.23 0.32 0.23 0.68 0.38 0.15 0.09
Sro1979_g309100.1 (Contig3652.g28205)
0.02 1.0 0.85 0.92 0.62 0.0 0.45 0.43 0.42 0.28 0.07 0.13 0.15 0.15 0.16 0.62 0.03 0.17 0.19 0.09 0.2 0.49 0.58 0.0 0.01 0.04 0.05
Sro1979_g309110.1 (Contig3652.g28206)
0.0 1.0 0.91 0.55 0.56 0.01 0.43 0.27 0.4 0.23 0.08 0.13 0.1 0.13 0.13 0.55 0.12 0.18 0.19 0.08 0.25 0.44 0.32 0.02 0.02 0.05 0.07
Sro2148_g316560.1 (Contig3130.g24842)
0.01 0.98 1.0 0.8 0.68 0.15 0.14 0.12 0.42 0.27 0.13 0.21 0.34 0.29 0.16 0.06 0.13 0.07 0.12 0.27 0.19 0.6 0.35 0.09 0.12 0.14 0.13
Sro2202_g318900.1 (Contig2558.g20799)
0.0 0.8 0.76 0.97 1.0 0.31 0.36 0.47 0.51 0.32 0.29 0.2 0.51 0.46 0.34 0.14 0.4 0.3 0.36 0.31 0.14 0.64 0.59 0.37 0.17 0.17 0.26
Sro2218_g319500.1 (Contig3225.g25506)
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro226_g092130.1 (Contig565.g7185)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2367_g325060.1 (Contig2056.g17645)
0.01 1.0 0.55 0.52 0.58 0.34 0.48 0.22 0.52 0.28 0.24 0.17 0.4 0.03 0.14 0.07 0.43 0.25 0.38 0.24 0.22 0.56 0.61 0.13 0.12 0.25 0.14
Sro238_g095480.1 (Contig99.g1194)
0.0 0.26 1.0 0.53 0.43 0.0 0.25 0.61 0.7 0.16 0.0 0.02 0.23 0.12 0.03 0.0 0.02 0.07 0.15 0.16 0.01 0.74 0.74 0.03 0.02 0.03 0.0
0.0 0.85 0.97 0.8 1.0 0.02 0.06 0.18 0.35 0.25 0.01 0.01 0.02 0.09 0.06 0.02 0.04 0.04 0.25 0.02 0.11 0.92 0.38 0.15 0.24 0.07 0.04
Sro2608_g332470.1 (Contig3473.g26924)
0.01 0.58 0.4 0.65 1.0 0.1 0.16 0.19 0.27 0.38 0.09 0.15 0.21 0.07 0.09 0.05 0.25 0.04 0.11 0.05 0.2 0.53 0.39 0.24 0.37 0.14 0.07
Sro265_g102860.1 (Contig1806.g15916)
0.0 0.95 0.42 0.77 1.0 0.0 0.04 0.09 0.25 0.12 0.0 0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.06 0.01 0.0 0.41 0.18 0.18 0.13 0.01 0.0
Sro271_g104610.1 (Contig2573.g20894)
0.01 0.55 1.0 0.55 0.57 0.35 0.19 0.25 0.28 0.3 0.19 0.41 0.23 0.46 0.24 0.28 0.11 0.16 0.11 0.07 0.41 0.39 0.13 0.45 0.5 0.11 0.11
Sro2767_g336690.1 (Contig3707.g28516)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2846_g338400.1 (Contig1601.g14535)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2868_g339030.1 (Contig4519.g33862)
0.02 1.0 0.89 0.69 0.45 0.0 0.05 0.08 0.19 0.1 0.02 0.01 0.02 0.0 0.03 0.01 0.0 0.05 0.1 0.02 0.01 0.25 0.06 0.02 0.02 0.05 0.0
Sro288_g108730.1 (Contig62.g493)
0.12 1.0 0.43 0.58 0.38 0.11 0.13 0.12 0.31 0.51 0.3 0.66 0.36 0.05 0.41 0.52 0.39 0.09 0.12 0.41 0.32 0.34 0.32 0.11 0.1 0.13 0.2
Sro2898_g339700.1 (Contig2509.g20534)
0.26 0.45 1.0 0.4 0.41 0.03 0.05 0.22 0.13 0.1 0.03 0.07 0.18 0.15 0.07 0.03 0.03 0.07 0.08 0.08 0.06 0.24 0.08 0.36 0.58 0.15 0.03
Sro298_g111180.1 (Contig4399.g33049)
0.0 1.0 0.82 0.62 0.46 0.01 0.1 0.03 0.09 0.11 0.03 0.0 0.07 0.06 0.14 0.02 0.06 0.06 0.05 0.06 0.0 0.09 0.13 0.04 0.02 0.0 0.02
Sro3089_g343490.1 (Contig1950.g16758)
0.01 0.41 1.0 0.47 0.34 0.0 0.27 0.52 0.25 0.15 0.03 0.09 0.06 0.07 0.08 0.35 0.04 0.09 0.08 0.07 0.08 0.21 0.29 0.0 0.02 0.01 0.03
Sro319_g116340.1 (Contig204.g2474)
0.58 0.11 0.14 0.34 0.4 0.05 0.04 0.04 0.03 0.13 0.09 0.1 0.17 0.06 0.09 0.03 0.09 0.07 0.22 0.05 0.12 0.11 0.06 0.75 1.0 0.24 0.03
Sro3270_g346070.1 (Contig1524.g13885)
0.01 0.71 1.0 0.79 0.77 0.0 0.0 0.02 0.29 0.14 0.0 0.04 0.05 0.0 0.04 0.02 0.0 0.08 0.07 0.03 0.01 0.48 0.24 0.14 0.05 0.02 0.01
Sro3343_g347010.1 (Contig2504.g20502)
0.01 1.0 0.57 0.34 0.8 0.1 0.09 0.23 0.38 0.18 0.07 0.03 0.08 0.03 0.05 0.06 0.09 0.09 0.13 0.04 0.02 0.48 0.3 0.03 0.03 0.05 0.05
Sro363_g126870.1 (Contig698.g8126)
0.0 1.0 0.99 0.27 0.48 0.11 0.25 0.38 0.46 0.13 0.06 0.05 0.07 0.05 0.06 0.05 0.12 0.24 0.21 0.06 0.05 0.17 0.46 0.16 0.08 0.16 0.05
0.07 0.42 1.0 0.47 0.63 0.0 0.33 0.29 0.49 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.42 0.49 0.27 0.04 0.0
Sro439_g143260.1 (Contig249.g3055)
0.0 1.0 0.49 0.31 0.77 0.02 0.23 0.18 0.46 0.16 0.01 0.03 0.05 0.02 0.06 0.02 0.01 0.02 0.04 0.01 0.0 0.32 0.58 0.13 0.03 0.01 0.02
Sro478_g151050.1 (Contig272.g3503)
0.0 1.0 0.59 0.29 0.49 0.05 0.18 0.19 0.24 0.26 0.05 0.18 0.34 0.1 0.08 0.03 0.05 0.25 0.21 0.22 0.21 0.19 0.16 0.47 0.12 0.08 0.05
Sro52_g031230.1 (Contig3190.g25206)
0.01 1.0 0.95 0.74 0.77 0.31 0.22 0.22 0.6 0.31 0.43 0.16 0.59 0.44 0.35 0.21 0.74 0.16 0.42 0.26 0.12 0.7 0.59 0.23 0.09 0.09 0.23
Sro53_g031280.1 (Contig1592.g14468)
0.0 0.51 0.32 0.93 1.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.09 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.38 0.12 0.12 0.27 0.1 0.0
Sro548_g164420.1 (Contig1714.g15322)
0.01 1.0 0.68 0.44 0.52 0.22 0.51 0.34 0.41 0.49 0.38 0.48 0.45 0.44 0.31 0.37 0.48 0.28 0.43 0.54 0.48 0.29 0.44 0.51 0.3 0.39 0.25
Sro550_g164730.1 (Contig731.g8403)
0.03 1.0 0.13 0.67 0.74 0.0 0.18 0.06 0.19 0.1 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.08 0.01 0.0 0.23 0.21 0.15 0.11 0.01 0.01
Sro559_g166550.1 (Contig536.g6971)
0.0 0.94 0.68 0.64 1.0 0.02 0.23 0.35 0.66 0.25 0.1 0.06 0.29 0.08 0.1 0.04 0.16 0.05 0.13 0.09 0.02 0.69 0.97 0.17 0.07 0.1 0.09
Sro67_g037490.1 (Contig495.g6665)
0.03 0.72 1.0 0.29 0.42 0.04 0.06 0.17 0.36 0.16 0.01 0.02 0.09 0.09 0.04 0.01 0.08 0.02 0.15 0.02 0.01 0.39 0.33 0.06 0.0 0.06 0.02
Sro683_g186670.1 (Contig860.g9405)
0.01 0.72 0.99 0.48 0.72 0.02 0.45 0.18 0.54 0.28 0.02 0.0 0.04 0.0 0.14 0.01 0.04 0.16 0.09 0.0 0.01 0.76 1.0 0.22 0.03 0.01 0.01
0.0 1.0 0.82 0.4 0.49 0.0 0.29 0.39 0.66 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.0 0.58 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro73_g040570.1 (Contig3929.g30158)
0.0 1.0 0.98 0.28 0.73 0.01 0.03 0.01 0.01 0.13 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11 0.0 0.09 0.0 0.0
Sro780_g201450.1 (Contig2838.g22779)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro787_g202400.1 (Contig4626.g34525)
0.0 0.53 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.17 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.01 1.0 0.62 0.27 0.62 0.0 0.43 0.23 0.53 0.42 0.13 0.07 0.12 0.27 0.14 0.03 0.09 0.91 0.55 0.0 0.01 0.29 0.56 0.16 0.07 0.21 0.13
Sro855_g211350.1 (Contig1132.g10849)
0.35 0.86 0.64 0.77 1.0 0.06 0.46 0.26 0.86 0.21 0.03 0.04 0.18 0.02 0.08 0.02 0.04 0.07 0.15 0.07 0.02 0.51 0.69 0.2 0.11 0.03 0.02
Sro85_g045260.1 (Contig4580.g34203)
0.0 1.0 0.74 0.75 0.8 0.09 0.15 0.15 0.38 0.21 0.27 0.19 0.16 0.16 0.11 0.05 0.28 0.04 0.13 0.2 0.11 0.43 0.32 0.11 0.06 0.05 0.14
Sro903_g218300.1 (Contig3909.g29970)
0.01 1.0 0.82 0.79 0.98 0.02 0.29 0.32 0.65 0.21 0.06 0.05 0.34 0.2 0.1 0.03 0.06 0.3 0.19 0.2 0.04 0.15 0.59 0.26 0.26 0.14 0.04
Sro90_g047320.1 (Contig124.g1394)
0.0 1.0 0.31 0.26 0.33 0.0 0.0 0.01 0.06 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.25 0.19 0.67 0.06 0.0 0.0
Sro937_g222160.1 (Contig2321.g19158)
0.0 1.0 0.35 0.91 0.5 0.0 0.22 0.23 0.09 0.37 0.0 0.06 0.01 0.01 0.07 0.0 0.01 0.06 0.13 0.0 0.01 0.87 0.48 0.08 0.04 0.0 0.0
Sro95_g049330.1 (Contig45.g318)
0.01 1.0 0.32 0.32 0.43 0.41 0.04 0.05 0.21 0.48 0.12 0.83 0.17 0.08 0.27 0.04 0.57 0.15 0.49 0.26 0.13 0.14 0.21 0.18 0.09 0.31 0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)