Heatmap: Cluster_329 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1001_g229750.1 (Contig472.g6392)
0.06 0.5 1.0 0.8 0.7 0.01 0.07 0.06 0.11 0.17 0.04 0.07 0.01 0.01 0.03 0.03 0.04 0.01 0.0 0.01 0.22 0.0 0.15 0.03 0.16 0.03 0.05
Sro1009_g230740.1 (Contig1546.g14039)
0.02 1.0 0.47 0.17 0.32 0.02 0.03 0.25 0.47 0.16 0.02 0.03 0.0 0.0 0.03 0.06 0.0 0.15 0.25 0.11 0.08 0.14 0.01 0.05 0.25 0.07 0.13
Sro1082_g239240.1 (Contig1844.g16169)
0.0 0.47 0.33 1.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1139_g245440.1 (Contig125.g1420)
0.0 1.0 0.77 0.83 0.83 0.14 0.14 0.2 0.21 0.37 0.33 0.34 0.65 0.29 0.27 0.18 0.28 0.35 0.57 0.53 0.32 0.25 0.17 0.17 0.22 0.25 0.25
Sro1184_g250140.1 (Contig2400.g19659)
0.0 0.0 1.0 0.65 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro11_g008800.1 (Contig724.g8354)
0.05 0.69 0.36 1.0 0.52 0.01 0.0 0.0 0.43 0.32 0.12 0.2 0.04 0.06 0.02 0.01 0.05 0.02 0.11 0.1 0.02 0.14 0.06 0.0 0.04 0.27 0.33
Sro1200_g251830.1 (Contig430.g5827)
0.36 0.68 0.99 1.0 0.86 0.06 0.16 0.32 0.21 0.26 0.12 0.11 0.2 0.08 0.14 0.26 0.08 0.23 0.23 0.24 0.23 0.02 0.07 0.11 0.08 0.09 0.15
Sro1206_g252330.1 (Contig178.g2089)
0.06 1.0 0.86 0.77 0.57 0.01 0.12 0.15 0.21 0.22 0.01 0.11 0.06 0.01 0.06 0.0 0.14 0.59 0.16 0.04 0.36 0.0 0.29 0.08 0.19 0.14 0.05
Sro1207_g252450.1 (Contig242.g2948)
0.0 0.16 1.0 0.88 0.57 0.0 0.01 0.0 0.0 0.16 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
Sro1229_g254460.1 (Contig3654.g28210)
0.02 1.0 0.61 0.86 0.79 0.32 0.27 0.52 0.5 0.52 0.9 0.66 0.73 0.52 0.56 0.36 0.89 0.41 0.43 0.95 0.47 0.3 0.22 0.33 0.44 0.38 0.42
0.0 0.3 0.41 1.0 0.97 0.0 0.06 0.0 0.06 0.22 0.0 0.11 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.77 0.17
Sro1256_g256600.1 (Contig2043.g17565)
0.0 0.12 1.0 0.46 0.28 0.08 0.18 0.53 0.37 0.17 0.53 0.18 0.13 0.13 0.49 0.41 0.34 0.39 0.33 0.13 0.18 0.07 0.46 0.59 0.67 0.78 0.27
Sro1331_g263490.1 (Contig1733.g15455)
0.27 1.0 0.98 0.61 0.57 0.08 0.32 0.48 0.44 0.16 0.26 0.15 0.06 0.07 0.23 0.22 0.17 0.08 0.05 0.03 0.05 0.13 0.52 0.45 0.19 0.1 0.14
Sro1363_g266370.1 (Contig2704.g21791)
0.08 0.69 1.0 0.71 0.7 0.07 0.07 0.03 0.13 0.22 0.01 0.16 0.06 0.24 0.03 0.01 0.01 0.01 0.3 0.07 0.13 0.11 0.2 0.05 0.04 0.14 0.03
Sro1499_g277740.1 (Contig1461.g13420)
0.02 1.0 0.87 0.8 0.72 0.09 0.11 0.04 0.06 0.44 0.28 0.4 0.43 0.18 0.2 0.25 0.24 0.4 0.75 0.63 0.31 0.11 0.12 0.12 0.03 0.19 0.26
Sro1501_g277910.1 (Contig2462.g20154)
0.0 0.86 1.0 0.45 0.39 0.1 0.19 0.12 0.28 0.31 0.36 0.34 0.26 0.12 0.18 0.14 0.3 0.23 0.29 0.48 0.43 0.19 0.17 0.21 0.29 0.31 0.29
Sro1504_g278070.1 (Contig3213.g25408)
0.01 0.71 1.0 0.38 0.43 0.13 0.3 0.39 0.39 0.19 0.24 0.21 0.2 0.15 0.23 0.27 0.28 0.17 0.1 0.09 0.17 0.21 0.27 0.24 0.25 0.15 0.2
Sro1657_g289080.1 (Contig167.g1882)
0.0 0.89 0.7 0.56 0.59 0.0 1.0 0.19 0.52 0.18 0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.43 0.15 0.02 0.0 0.0
Sro165_g073960.1 (Contig381.g5137)
0.04 1.0 0.52 0.34 0.47 0.0 0.1 0.6 0.07 0.35 0.0 0.26 0.0 0.03 0.07 0.07 0.16 0.0 0.16 0.11 0.25 0.19 0.14 0.05 0.0 0.06 0.0
Sro166_g074230.1 (Contig1709.g15302)
0.01 0.78 0.72 0.66 0.86 0.03 0.13 0.1 0.31 0.27 0.02 0.05 0.12 0.01 0.13 0.07 0.17 0.19 0.21 0.11 1.0 0.14 0.43 0.03 0.07 0.07 0.03
Sro1686_g291100.1 (Contig1239.g11602)
0.06 0.57 1.0 0.47 0.4 0.23 0.06 0.1 0.06 0.25 0.54 0.14 0.18 0.14 0.4 0.57 0.57 0.48 0.28 0.14 0.22 0.08 0.05 0.24 0.24 0.38 0.51
Sro1778_g296970.1 (Contig1025.g10226)
0.0 0.93 0.96 1.0 0.78 0.37 0.04 0.32 0.23 0.15 0.3 0.02 0.02 0.0 0.14 0.64 0.67 0.24 0.12 0.0 0.1 0.14 0.17 0.05 0.09 0.39 0.34
Sro184_g080040.1 (Contig2216.g18407)
0.02 0.45 0.56 0.7 1.0 0.07 0.11 0.66 0.19 0.37 0.37 0.34 0.21 0.37 0.43 0.82 0.49 0.99 0.3 0.28 0.48 0.05 0.21 0.29 0.7 0.47 0.63
Sro2034_g311960.1 (Contig3527.g27256)
0.06 0.92 1.0 0.73 0.79 0.18 0.27 0.49 0.37 0.43 0.54 0.5 0.58 0.4 0.52 0.63 0.5 0.58 0.5 0.6 0.42 0.43 0.32 0.29 0.24 0.32 0.41
Sro2101_g314580.1 (Contig3218.g25440)
0.11 1.0 0.46 0.21 0.37 0.01 0.09 0.08 0.18 0.13 0.04 0.05 0.0 0.02 0.06 0.01 0.05 0.01 0.02 0.01 0.32 0.22 0.15 0.08 0.09 0.1 0.05
Sro220_g090650.1 (Contig3599.g27827)
0.0 0.79 0.98 1.0 0.72 0.28 0.34 0.69 0.61 0.26 0.36 0.19 0.29 0.09 0.36 0.51 0.33 0.27 0.27 0.26 0.25 0.54 0.45 0.19 0.4 0.31 0.37
Sro220_g090790.1 (Contig3599.g27841)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2214_g319380.1 (Contig3124.g24819)
0.01 0.86 1.0 0.86 0.87 0.2 0.29 0.33 0.38 0.33 0.45 0.31 0.37 0.28 0.34 0.43 0.42 0.34 0.29 0.35 0.23 0.16 0.37 0.17 0.3 0.24 0.26
Sro241_g096290.1 (Contig4317.g32547)
0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.24 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2422_g327160.1 (Contig2242.g18608)
0.05 1.0 0.85 0.17 0.16 0.29 0.25 0.17 0.18 0.45 0.29 0.4 0.41 0.18 0.35 0.37 0.26 0.18 0.37 0.43 0.51 0.23 0.34 0.36 0.65 0.21 0.26
Sro258_g101030.1 (Contig315.g4189)
0.0 0.0 1.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.84 1.0 0.28 0.55 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2630_g333090.1 (Contig944.g9772)
0.04 0.5 1.0 0.2 0.14 0.02 0.02 0.01 0.01 0.15 0.0 0.31 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.12 0.12 0.34 0.08 0.02 0.04 0.19 0.01 0.19 0.01
Sro2746_g336100.1 (Contig1916.g16546)
0.01 0.44 0.47 0.45 0.45 0.08 0.16 0.28 0.24 0.23 0.26 0.21 1.0 0.22 0.22 0.2 0.19 0.42 0.52 0.86 0.16 0.32 0.13 0.21 0.14 0.15 0.18
Sro2749_g336210.1 (Contig3725.g28608)
1.0 0.55 0.33 0.38 0.55 0.14 0.05 0.1 0.14 0.23 0.25 0.18 0.26 0.18 0.18 0.06 0.17 0.24 0.49 0.15 0.06 0.09 0.14 0.46 0.26 0.16 0.14
Sro2_g001230.1 (Contig467.g6281)
0.0 0.66 1.0 0.42 0.47 0.14 0.37 0.44 0.31 0.19 0.36 0.12 0.16 0.13 0.26 0.25 0.24 0.32 0.33 0.27 0.18 0.17 0.33 0.17 0.26 0.21 0.32
Sro3064_g343050.1 (Contig3816.g29312)
0.0 1.0 0.93 0.12 0.71 0.0 0.0 0.07 0.05 0.09 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.05 0.0 0.0 0.01
Sro338_g120920.1 (Contig15.g129)
0.01 1.0 0.82 0.76 0.66 0.1 0.11 0.16 0.16 0.38 0.34 0.46 0.11 0.26 0.21 0.29 0.17 0.14 0.36 0.24 0.44 0.17 0.15 0.1 0.09 0.16 0.26
Sro33_g021480.1 (Contig2613.g21169)
0.01 0.46 0.44 0.52 0.69 0.15 0.22 0.89 0.59 0.35 1.0 0.48 0.18 0.24 0.52 0.61 0.31 0.35 0.26 0.14 0.32 0.25 0.47 0.33 0.25 0.21 0.53
Sro388_g132270.1 (Contig4393.g33001)
0.02 0.86 0.52 0.66 1.0 0.01 0.11 0.46 0.22 0.11 0.04 0.07 0.0 0.03 0.09 0.1 0.05 0.0 0.0 0.01 0.1 0.07 0.23 0.11 0.23 0.15 0.04
Sro398_g134730.1 (Contig371.g5034)
0.02 0.87 1.0 0.7 0.59 0.2 0.11 0.19 0.21 0.18 0.25 0.11 0.1 0.04 0.15 0.04 0.53 0.19 0.14 0.13 0.26 0.06 0.17 0.12 0.21 0.33 0.18
Sro3_g002450.1 (Contig3832.g29430)
0.0 0.47 0.87 1.0 0.73 0.91 0.27 0.5 0.26 0.37 0.9 0.2 0.49 0.19 0.59 0.63 0.83 0.45 0.45 0.3 0.22 0.3 0.26 0.36 0.42 0.83 0.93
Sro401_g135320.1 (Contig2817.g22590)
0.0 0.7 1.0 0.48 0.58 0.07 0.02 0.04 0.11 0.33 0.05 0.24 0.05 0.02 0.03 0.0 0.06 0.29 0.52 0.09 0.13 0.05 0.14 0.04 0.11 0.42 0.05
0.0 1.0 0.0 0.25 0.65 0.0 0.0 0.03 0.03 0.2 0.0 0.16 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.16 0.06 0.23 0.21 0.08 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0
Sro451_g145780.1 (Contig1599.g14522)
0.02 0.58 1.0 0.37 0.17 0.04 0.05 0.01 0.0 0.15 0.19 0.05 0.11 0.06 0.14 0.29 0.1 0.01 0.01 0.08 0.06 0.0 0.01 0.09 0.03 0.1 0.11
Sro451_g145790.1 (Contig1599.g14523)
0.0 0.56 1.0 0.22 0.25 0.01 0.03 0.07 0.02 0.16 0.07 0.11 0.05 0.05 0.08 0.1 0.1 0.04 0.0 0.06 0.11 0.01 0.02 0.03 0.09 0.17 0.09
Sro489_g153340.1 (Contig402.g5443)
0.0 0.61 1.0 0.62 0.49 0.16 0.28 0.5 0.33 0.22 0.26 0.19 0.31 0.14 0.24 0.39 0.15 0.56 0.42 0.26 0.23 0.39 0.36 0.23 0.3 0.22 0.32
Sro511_g157530.1 (Contig3003.g23894)
0.0 1.0 0.0 0.11 0.15 0.0 0.0 0.0 0.02 0.21 0.16 0.0 0.15 0.0 0.05 0.0 0.1 0.1 0.23 0.15 0.14 0.16 0.07 0.24 0.28 0.0 0.07
Sro546_g164090.1 (Contig4069.g31186)
0.2 0.82 0.71 1.0 0.84 0.01 0.04 0.08 0.15 0.15 0.09 0.06 0.14 0.04 0.15 0.1 0.19 0.07 0.08 0.13 0.2 0.02 0.02 0.1 0.08 0.01 0.13
Sro570_g168590.1 (Contig131.g1482)
0.01 0.61 1.0 0.2 0.25 0.14 0.08 0.2 0.25 0.32 0.19 0.32 0.18 0.26 0.24 0.09 0.28 0.31 0.12 0.15 0.59 0.43 0.38 0.22 0.24 0.14 0.11
Sro5_g004780.1 (Contig4001.g30793)
0.01 1.0 0.37 0.33 0.33 0.07 0.08 0.19 0.18 0.26 0.17 0.43 0.04 0.11 0.2 0.22 0.46 0.1 0.21 0.11 0.38 0.09 0.02 0.15 0.32 0.12 0.15
Sro61_g035190.1 (Contig3112.g24772)
0.16 0.96 1.0 0.89 0.52 0.14 0.32 0.61 0.45 0.55 0.92 0.63 0.78 0.28 0.54 0.85 0.63 0.61 0.44 0.54 0.98 0.57 0.46 0.32 0.43 0.31 0.54
Sro636_g179320.1 (Contig84.g909)
0.02 1.0 0.64 0.59 0.7 0.27 0.2 0.16 0.18 0.45 0.52 0.51 0.13 0.39 0.34 0.29 0.37 0.33 0.62 0.31 0.44 0.2 0.13 0.26 0.26 0.28 0.33
Sro674_g185390.1 (Contig3274.g25775)
0.03 0.79 0.75 0.77 0.66 0.54 0.58 0.56 0.56 0.62 0.98 0.92 0.91 0.88 0.87 0.84 1.0 0.33 0.47 0.73 0.75 0.43 0.39 0.44 0.48 0.41 0.59
Sro689_g187500.1 (Contig4685.g34835)
0.04 1.0 0.83 0.6 0.59 0.08 0.03 0.13 0.1 0.25 0.15 0.11 0.08 0.04 0.12 0.09 0.27 0.11 0.06 0.08 0.4 0.1 0.05 0.02 0.02 0.03 0.13
Sro77_g041880.1 (Contig338.g4583)
0.0 0.25 0.0 1.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.53 1.0 0.55 0.52 0.08 0.28 0.35 0.4 0.39 0.32 0.44 0.46 0.34 0.29 0.31 0.35 0.79 0.92 0.55 0.59 0.55 0.34 0.39 0.39 0.38 0.26
Sro7_g006390.1 (Contig389.g5292)
0.0 0.0 0.0 0.59 0.0 0.56 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13
Sro842_g209760.1 (Contig6.g84)
0.01 1.0 0.54 0.69 0.61 0.09 0.09 0.22 0.15 0.25 0.19 0.16 0.24 0.09 0.16 0.17 0.14 0.22 0.26 0.41 0.23 0.1 0.1 0.03 0.07 0.12 0.15
Sro889_g216510.1 (Contig1913.g16516)
0.0 0.89 1.0 0.37 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.05
Sro90_g047250.1 (Contig124.g1387)
0.0 0.65 1.0 0.5 0.7 0.1 0.14 0.05 0.31 0.26 0.11 0.21 0.09 0.5 0.17 0.44 0.19 0.08 0.35 0.05 0.06 0.15 0.19 0.02 0.1 0.16 0.25
Sro910_g219170.1 (Contig1356.g12509)
0.01 0.94 1.0 0.48 0.66 0.12 0.15 0.19 0.14 0.24 0.22 0.18 0.14 0.1 0.26 0.3 0.19 0.27 0.26 0.21 0.26 0.04 0.1 0.05 0.05 0.03 0.27
Sro989_g228460.1 (Contig1449.g13275)
0.01 0.87 1.0 0.55 0.51 0.22 0.31 0.44 0.51 0.25 0.4 0.27 0.23 0.17 0.29 0.22 0.57 0.28 0.34 0.21 0.19 0.23 0.45 0.19 0.09 0.25 0.28

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)