Heatmap: Cluster_226 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1070_g237720.1 (Contig4107.g31345)
0.04 0.67 1.0 0.28 0.3 0.06 0.16 0.12 0.24 0.19 0.28 0.18 0.27 0.11 0.3 0.2 0.12 0.2 0.45 0.19 0.16 0.2 0.25 0.22 0.13 0.08 0.18
Sro1070_g237730.1 (Contig4107.g31346)
0.01 0.56 0.83 0.31 0.35 0.05 0.23 0.34 0.32 0.24 0.38 0.2 0.39 0.13 0.34 0.25 0.16 0.3 1.0 0.23 0.18 0.25 0.38 0.28 0.17 0.12 0.28
Sro108_g054210.1 (Contig2294.g19001)
0.0 0.14 0.16 0.19 0.18 0.12 0.25 0.24 0.23 0.36 1.0 0.35 0.64 0.24 0.38 0.37 0.54 0.27 0.33 0.67 0.55 0.33 0.18 0.32 0.13 0.11 0.45
Sro112_g055550.1 (Contig1575.g14280)
0.01 0.65 0.5 0.65 0.67 0.13 0.14 0.51 0.13 0.25 0.46 0.2 0.53 0.16 0.42 0.49 0.27 1.0 0.42 0.26 0.28 0.28 0.11 0.41 0.37 0.26 0.4
Sro1152_g246910.1 (Contig333.g4431)
0.01 0.45 0.77 0.95 1.0 0.21 0.52 0.68 0.43 0.23 0.4 0.14 0.21 0.11 0.45 0.39 0.28 0.84 0.85 0.22 0.2 0.29 0.26 0.71 0.77 0.61 0.33
Sro1168_g248450.1 (Contig1520.g13867)
0.06 0.52 0.86 0.57 0.58 0.21 0.42 0.59 0.45 0.26 0.44 0.19 0.18 0.12 0.34 0.36 0.39 0.49 0.4 0.19 0.33 0.28 0.41 0.52 1.0 0.52 0.32
Sro1200_g251940.1 (Contig430.g5838)
0.01 0.29 0.35 0.38 0.6 0.1 0.37 0.52 0.26 0.27 0.13 0.26 1.0 0.22 0.43 0.43 0.3 0.92 0.62 0.55 0.48 0.34 0.4 0.68 0.57 0.21 0.36
Sro1200_g251950.1 (Contig430.g5839)
0.0 0.54 0.78 0.63 0.68 0.12 0.35 0.46 0.33 0.33 0.35 0.3 1.0 0.25 0.43 0.44 0.26 0.96 0.68 0.61 0.5 0.34 0.5 0.73 0.5 0.33 0.36
Sro1275_g258510.1 (Contig2428.g19850)
0.06 0.19 0.5 0.62 0.88 0.07 0.1 0.53 0.56 0.27 0.13 0.11 0.32 0.05 0.16 0.35 0.04 1.0 0.2 0.36 0.21 0.29 0.23 0.31 0.54 0.23 0.1
Sro131_g062180.1 (Contig67.g670)
0.0 0.01 0.04 0.01 0.01 0.0 0.04 0.1 0.12 0.07 0.01 0.04 1.0 0.01 0.03 0.03 0.01 0.63 0.59 0.29 0.09 0.06 0.17 0.4 0.37 0.31 0.02
Sro1328_g263250.1 (Contig1099.g10665)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.07 0.05 0.1 0.09 0.05 0.01 0.75 0.0 0.12 0.0 0.14 0.5 1.0 0.44 0.03 0.08 0.14 0.06 0.06 0.03 0.05
Sro1332_g263600.1 (Contig296.g3880)
0.41 0.15 0.1 0.08 0.06 0.03 0.2 0.51 0.44 0.22 0.19 0.16 1.0 0.16 0.24 0.34 0.19 0.81 0.95 0.86 0.19 0.16 0.08 0.23 0.06 0.04 0.22
Sro1349_g265130.1 (Contig4305.g32490)
0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.03 0.06 0.17 0.08 0.13 0.1 0.18 1.0 0.09 0.14 0.24 0.12 0.68 0.47 0.27 0.32 0.06 0.02 0.25 0.2 0.05 0.17
Sro134_g063310.1 (Contig145.g1593)
0.23 1.0 0.78 0.7 0.79 0.01 0.25 0.28 0.26 0.23 0.07 0.12 0.31 0.05 0.15 0.16 0.08 0.83 0.9 0.45 0.29 0.09 0.18 0.4 0.58 0.3 0.1
Sro1409_g270210.1 (Contig1095.g10602)
0.0 0.16 0.54 0.41 0.27 0.12 0.2 0.62 0.4 0.23 0.29 0.18 0.44 0.05 0.28 0.34 0.26 0.47 1.0 0.24 0.24 0.35 0.31 0.28 0.26 0.35 0.24
Sro1461_g274790.1 (Contig2979.g23686)
0.01 0.28 0.61 0.48 0.38 0.13 0.29 0.58 0.4 0.38 0.67 0.36 1.0 0.49 0.45 0.44 0.17 0.66 0.56 0.79 0.33 0.22 0.32 0.58 0.61 0.23 0.48
Sro1535_g280530.1 (Contig3021.g24090)
0.0 0.09 0.43 0.21 0.26 0.0 0.15 0.6 0.28 0.09 0.52 0.0 0.28 0.0 0.18 0.2 0.03 0.86 1.0 0.12 0.01 0.05 0.09 0.78 0.51 0.36 0.43
Sro163_g073120.1 (Contig1793.g15845)
0.02 0.14 0.18 0.22 0.26 0.24 0.16 0.5 0.41 0.17 0.31 0.1 0.38 0.09 0.21 0.16 0.22 0.35 1.0 0.48 0.19 0.38 0.39 0.18 0.32 0.37 0.27
Sro1658_g289110.1 (Contig4672.g34729)
0.0 0.24 0.33 0.65 0.4 0.15 0.0 0.16 0.03 0.07 0.22 0.01 0.26 0.03 0.18 0.26 0.2 1.0 0.2 0.08 0.0 0.07 0.03 0.31 0.08 0.04 0.21
Sro1712_g292930.1 (Contig3889.g29868)
0.02 0.04 0.38 0.32 0.21 0.01 0.03 0.08 0.11 0.16 0.17 0.08 0.34 0.06 0.14 0.1 0.11 0.45 1.0 0.38 0.34 0.09 0.12 0.16 0.18 0.19 0.14
Sro177_g077690.1 (Contig795.g8895)
1.0 0.53 0.43 0.69 0.69 0.06 0.09 0.16 0.11 0.25 0.33 0.07 0.58 0.06 0.26 0.39 0.21 1.0 0.19 0.58 0.09 0.04 0.16 0.31 0.59 0.33 0.19
Sro17_g012310.1 (Contig269.g3410)
0.1 0.66 0.57 1.0 0.55 0.02 0.01 0.2 0.29 0.17 0.0 0.08 0.3 0.01 0.04 0.18 0.0 0.05 0.02 0.13 0.09 0.23 0.07 0.04 0.21 0.0 0.05
Sro1803_g298640.1 (Contig1067.g10413)
0.01 0.61 1.0 0.65 0.67 0.24 0.55 0.5 0.59 0.34 0.43 0.4 0.43 0.27 0.4 0.43 0.42 0.52 0.79 0.26 0.33 0.35 0.74 0.59 0.3 0.24 0.36
Sro181_g079010.1 (Contig4257.g32228)
0.01 0.37 0.8 0.55 0.42 0.05 0.0 0.0 0.01 0.09 0.17 0.03 0.37 0.02 0.15 0.24 0.19 0.21 1.0 0.11 0.0 0.06 0.01 0.12 0.1 0.04 0.19
Sro1912_g304980.1 (Contig2968.g23583)
0.01 0.11 0.14 0.09 0.1 0.01 0.19 0.29 0.4 0.1 0.3 0.06 0.17 0.17 0.1 0.08 0.06 0.53 1.0 0.21 0.07 0.04 0.15 0.22 0.22 0.13 0.12
0.03 0.39 0.84 0.55 0.71 0.01 0.13 0.3 0.19 0.13 0.08 0.04 0.29 0.0 0.07 0.06 0.05 0.94 1.0 0.35 0.2 0.17 0.05 0.16 0.32 0.19 0.09
Sro212_g088140.1 (Contig3756.g28797)
0.1 0.97 0.96 0.65 0.68 0.48 0.42 0.78 0.6 0.62 0.88 0.55 0.75 0.44 0.75 0.69 1.0 0.89 0.99 0.97 0.55 0.79 0.45 0.74 0.43 0.44 0.69
Sro251_g099380.1 (Contig687.g8018)
0.04 0.43 0.37 0.71 0.58 0.2 0.42 1.0 0.42 0.53 0.63 0.49 0.57 0.43 0.52 0.61 0.46 0.75 0.57 0.56 0.54 0.03 0.18 0.4 0.43 0.45 0.43
Sro2520_g330150.1 (Contig2879.g23001)
0.01 1.0 0.84 0.64 0.58 0.24 0.43 0.69 0.36 0.48 0.74 0.55 0.48 0.2 0.55 0.59 0.55 0.58 0.38 0.56 0.62 0.34 0.31 0.34 0.35 0.23 0.62
Sro252_g099490.1 (Contig311.g4091)
0.01 0.34 1.0 0.73 0.54 0.01 0.11 0.11 0.06 0.26 0.18 0.09 0.58 0.06 0.14 0.46 0.18 0.59 0.48 0.72 0.67 0.09 0.09 0.06 0.2 0.16 0.26
Sro255_g100350.1 (Contig2336.g19212)
0.0 0.58 0.57 0.47 0.42 0.21 0.13 0.85 0.56 0.4 0.57 0.45 0.88 0.26 0.43 0.33 0.25 0.93 1.0 0.65 0.35 0.05 0.13 0.27 0.23 0.26 0.54
Sro265_g102830.1 (Contig1806.g15913)
0.05 0.2 0.15 0.23 0.1 0.01 0.03 0.12 0.1 0.09 0.03 0.05 0.85 0.03 0.05 0.03 0.02 0.46 1.0 0.38 0.03 0.22 0.08 0.05 0.08 0.03 0.04
Sro2669_g334240.1 (Contig3859.g29702)
0.0 0.05 0.15 0.22 0.16 0.0 0.32 0.45 0.21 0.07 0.0 0.01 0.41 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.52 0.62 0.0 0.07 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro269_g104120.1 (Contig1337.g12333)
0.0 0.37 0.89 0.54 0.43 0.16 0.18 0.25 0.38 0.19 0.24 0.15 0.58 0.19 0.2 0.23 0.16 0.69 1.0 0.2 0.13 0.29 0.31 0.72 0.55 0.34 0.15
Sro2794_g337270.1 (Contig3742.g28684)
0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.14 0.08 0.2 0.0 0.03 0.86 0.0 0.01 0.0 0.0 0.86 1.0 0.94 0.49 0.06 0.39 0.22 0.76 0.83 0.0
Sro2851_g338570.1 (Contig1949.g16753)
0.01 0.14 0.21 0.23 0.28 0.03 0.15 0.27 0.11 0.14 0.15 0.1 0.15 0.05 0.16 0.36 0.15 1.0 0.46 0.24 0.18 0.13 0.13 0.08 0.08 0.1 0.28
Sro28_g018690.1 (Contig404.g5478)
0.02 0.69 0.72 0.37 0.39 0.12 0.62 0.53 0.34 0.4 0.38 0.24 0.45 0.1 0.21 0.31 0.25 0.78 1.0 0.65 0.91 0.23 0.37 0.48 0.63 0.39 0.32
Sro2924_g340350.1 (Contig2720.g21944)
0.08 0.26 0.4 0.28 0.31 0.02 0.15 0.24 0.26 0.17 0.19 0.16 1.0 0.12 0.17 0.54 0.15 0.89 0.96 0.31 0.29 0.31 0.23 0.49 0.62 0.38 0.11
Sro299_g111240.1 (Contig1218.g11426)
0.0 0.01 0.38 0.05 0.03 0.11 0.05 0.01 0.13 0.12 0.07 0.01 0.65 0.01 0.15 0.01 0.17 0.34 1.0 0.47 0.06 0.19 0.14 0.04 0.05 0.11 0.05
Sro300_g111600.1 (Contig270.g3448)
0.02 0.33 0.31 0.71 0.65 0.08 0.19 0.4 0.45 0.25 0.42 0.08 0.2 0.01 0.22 0.3 0.29 1.0 0.31 0.23 0.14 0.2 0.15 0.38 0.63 0.5 0.37
Sro304_g112610.1 (Contig465.g6235)
0.01 0.33 0.35 0.23 0.15 0.05 0.08 0.26 0.21 0.09 0.36 0.01 0.34 0.04 0.16 0.22 0.16 0.37 1.0 0.17 0.01 0.16 0.19 0.33 0.2 0.12 0.23
Sro33_g021620.1 (Contig2613.g21183)
0.0 0.97 1.0 0.87 0.73 0.14 0.16 0.25 0.36 0.22 0.23 0.11 0.12 0.01 0.22 0.4 0.15 0.4 0.52 0.26 0.15 0.11 0.21 0.26 0.27 0.15 0.14
Sro344_g122230.1 (Contig3448.g26811)
0.46 0.53 0.81 0.96 1.0 0.04 0.06 0.31 0.14 0.23 0.29 0.22 0.69 0.09 0.23 0.24 0.27 0.23 0.09 0.27 0.18 0.23 0.1 0.27 0.48 0.09 0.06
Sro37_g023160.1 (Contig1425.g13132)
0.0 0.19 0.33 0.32 0.22 0.16 0.11 0.42 0.2 0.19 0.22 0.12 0.56 0.2 0.18 0.15 0.2 0.73 1.0 0.27 0.28 0.3 0.15 0.18 0.44 0.28 0.17
Sro3877_g351630.1 (Contig3000.g23868)
0.04 0.16 0.34 0.27 0.27 0.01 0.07 0.21 0.17 0.11 0.07 0.07 0.19 0.01 0.05 0.15 0.05 1.0 0.62 0.29 0.13 0.06 0.09 0.07 0.11 0.07 0.12
Sro3994_g352390.1 (Contig4079.g31251)
0.0 0.06 0.3 0.23 0.17 0.0 0.02 0.08 0.1 0.1 0.07 0.04 0.23 0.02 0.06 0.04 0.04 0.34 1.0 0.29 0.15 0.29 0.25 0.09 0.12 0.13 0.06
Sro40_g024570.1 (Contig335.g4464)
0.32 0.38 0.46 0.59 0.58 0.15 0.73 0.62 0.62 0.38 0.57 0.35 0.5 0.36 0.44 0.43 0.28 1.0 0.57 0.49 0.43 0.22 0.42 0.42 0.54 0.39 0.37
Sro415_g138550.1 (Contig3170.g25090)
0.07 0.25 0.61 0.46 0.5 0.08 0.1 0.33 0.21 0.2 0.17 0.19 0.22 0.04 0.13 0.41 0.18 1.0 0.76 0.3 0.32 0.11 0.1 0.18 0.37 0.27 0.29
Sro517_g158730.1 (Contig741.g8494)
0.0 0.0 0.07 0.12 0.13 0.01 0.02 0.16 0.05 0.05 0.0 0.02 0.99 0.15 0.03 0.02 0.0 0.34 1.0 0.31 0.04 0.2 0.05 0.0 0.0 0.01 0.02
Sro538_g162470.1 (Contig95.g1088)
0.0 0.46 0.61 0.75 0.4 0.0 0.11 0.51 0.22 0.11 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.63 0.51 0.0 0.08 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro551_g164940.1 (Contig4706.g35015)
0.01 0.41 0.66 0.71 0.69 0.03 0.06 0.08 0.04 0.12 0.09 0.02 0.62 0.01 0.06 0.09 0.07 1.0 0.52 0.61 0.03 0.02 0.01 0.15 0.33 0.12 0.07
Sro553_g165300.1 (Contig1023.g10206)
0.01 0.41 0.67 0.52 0.55 0.29 0.16 0.36 0.37 0.26 0.55 0.09 0.31 0.03 0.35 0.45 0.42 0.85 1.0 0.4 0.16 0.45 0.31 0.33 0.58 0.42 0.35
Sro553_g165410.1 (Contig1023.g10217)
0.37 0.18 0.65 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.07 0.13 0.0 0.03 0.38 0.0 0.02 0.0 0.0 0.37 1.0 0.5 0.05 0.14 0.16 0.01 0.05 0.06 0.01
Sro69_g038440.1 (Contig4677.g34753)
0.0 0.72 0.65 0.57 0.55 0.11 0.4 0.39 0.45 0.2 0.29 0.1 0.17 0.18 0.36 0.34 0.24 0.72 0.49 0.2 0.19 0.35 0.39 0.47 1.0 0.67 0.22
Sro73_g040440.1 (Contig3929.g30145)
0.01 0.67 0.73 0.6 0.39 0.26 0.43 0.47 0.52 0.4 0.45 0.33 0.19 0.15 0.47 0.59 0.39 1.0 0.69 0.25 0.37 0.1 0.33 0.9 0.4 0.44 0.49
Sro749_g196840.1 (Contig2460.g20141)
0.01 0.27 0.77 0.52 0.44 0.03 0.22 0.29 0.14 0.27 0.36 0.2 0.41 0.07 0.25 0.43 0.17 1.0 0.9 0.48 0.35 0.23 0.15 0.26 0.3 0.26 0.42
Sro74_g040890.1 (Contig4700.g34951)
0.01 0.14 0.39 0.29 0.23 0.19 0.26 0.5 0.26 0.21 0.26 0.25 0.39 0.26 0.24 0.18 0.28 0.75 1.0 0.2 0.33 0.17 0.26 0.13 0.2 0.15 0.15
Sro760_g198320.1 (Contig3371.g26393)
0.0 0.42 0.37 0.54 0.75 0.14 0.29 0.34 0.49 0.29 0.24 0.31 0.57 0.16 0.34 0.35 0.18 1.0 0.36 0.44 0.4 0.12 0.21 0.39 0.3 0.07 0.29
Sro779_g201330.1 (Contig4354.g32823)
0.01 0.4 0.69 0.5 0.44 0.23 0.38 0.8 0.33 0.22 0.27 0.14 0.1 0.08 0.26 0.39 0.22 0.33 0.28 0.14 0.3 0.11 0.11 0.44 1.0 0.4 0.3
Sro842_g209660.1 (Contig6.g74)
0.0 0.49 0.39 1.0 0.63 0.06 0.16 0.12 0.15 0.23 0.32 0.19 0.28 0.13 0.16 0.07 0.28 0.95 0.65 0.39 0.25 0.03 0.12 0.15 0.2 0.14 0.26
Sro842_g209670.1 (Contig6.g75)
0.0 0.34 0.42 0.77 0.46 0.06 0.37 0.25 0.36 0.14 0.21 0.07 0.28 0.02 0.22 0.15 0.16 1.0 0.57 0.28 0.25 0.04 0.13 0.61 0.52 0.24 0.18
Sro888_g216450.1 (Contig4324.g32627)
0.0 0.87 0.43 0.58 0.69 0.11 0.37 0.6 0.65 0.16 0.27 0.04 0.1 0.01 0.19 0.32 0.17 0.38 0.36 0.16 0.1 0.41 0.44 0.48 1.0 0.6 0.31
Sro888_g216470.1 (Contig4324.g32629)
0.0 0.41 0.88 1.0 0.84 0.13 0.06 0.39 0.15 0.1 0.35 0.07 0.08 0.08 0.21 0.11 0.21 0.46 0.29 0.03 0.08 0.12 0.2 0.24 0.29 0.24 0.12
Sro905_g218590.1 (Contig2792.g22471)
0.0 0.81 0.82 0.87 0.96 0.34 0.36 0.72 0.7 0.27 0.65 0.16 0.27 0.1 0.39 0.53 0.32 0.49 0.63 0.18 0.19 0.51 0.53 1.0 0.87 0.72 0.48
Sro921_g220350.1 (Contig435.g5867)
0.02 0.88 1.0 0.39 0.32 0.15 0.52 0.53 0.29 0.56 0.95 0.46 0.91 0.25 0.6 0.52 0.49 0.46 0.45 0.94 0.78 0.43 0.3 0.3 0.48 0.29 0.79
Sro9_g007290.1 (Contig4120.g31497)
0.01 0.03 0.49 0.16 0.13 0.0 0.03 0.04 0.05 0.14 0.21 0.01 0.74 0.01 0.07 0.04 0.01 0.56 1.0 0.74 0.39 0.23 0.04 0.03 0.13 0.14 0.17
Sro9_g007300.1 (Contig4120.g31498)
0.0 0.13 0.45 0.15 0.15 0.01 0.05 0.16 0.2 0.12 0.2 0.06 0.45 0.06 0.12 0.12 0.05 0.21 1.0 0.3 0.17 0.22 0.21 0.08 0.13 0.13 0.17

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)