1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_20 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro10_g008240.1 (Contig1.g48)
 0.01 0.13 0.25 0.2 0.18 0.27 0.65 1.0 0.77 0.42 0.51 0.6 0.28 0.23 0.41 0.63 0.56 0.67 0.38 0.28 0.51 0.49 0.62 0.13 0.18 0.37 0.41
Sro10_g008250.1 (Contig1.g49)
 0.0 0.03 0.01 0.03 0.03 0.15 0.61 1.0 0.31 0.52 0.23 0.7 0.18 0.14 0.16 0.22 0.28 0.49 0.99 0.22 0.45 0.3 0.26 0.06 0.12 0.29 0.19
Sro1123_g243620.1 (Contig3394.g26536)
 0.1 0.34 0.64 0.52 0.63 0.02 0.62 0.58 0.82 0.37 0.1 0.58 0.05 0.23 0.08 0.07 0.01 0.1 0.24 0.13 0.65 0.24 0.63 0.41 1.0 0.24 0.05
Sro1123_g243660.1 (Contig3394.g26540)
 0.88 0.43 0.54 0.61 0.56 0.4 0.85 0.66 0.8 0.82 0.78 0.95 0.91 0.67 0.66 0.82 0.68 0.62 0.57 0.77 1.0 0.48 0.82 0.55 0.86 0.57 0.59
Sro1129_g244350.1 (Contig2187.g18228)
 0.03 0.03 0.08 0.06 0.03 0.07 0.97 1.0 0.62 0.64 0.25 0.95 0.42 0.68 0.17 0.31 0.07 0.39 0.41 0.54 0.93 0.43 0.42 0.0 0.0 0.06 0.3
Sro1146_g246280.1 (Contig2727.g21989)
 0.49 1.0 0.66 0.68 0.52 0.1 0.42 0.28 0.5 0.37 0.4 0.41 0.01 0.12 0.38 0.6 0.33 0.0 0.0 0.01 0.54 0.01 0.4 0.51 0.93 0.44 0.33
Sro1181_g249850.1 (Contig2161.g18136)
 0.06 0.41 0.59 1.0 0.96 0.45 0.72 0.54 0.76 0.56 0.7 0.64 0.53 0.57 0.52 0.53 0.58 0.49 0.51 0.65 0.59 0.45 0.79 0.58 0.99 0.71 0.49
Sro1224_g254000.1 (Contig293.g3824)
 0.07 0.33 0.28 0.21 0.36 0.28 0.59 0.16 0.64 0.63 0.54 1.0 0.47 0.53 0.45 0.54 0.46 0.35 0.5 0.58 0.66 0.21 0.81 0.31 0.25 0.35 0.38
0.04 0.25 0.48 0.36 0.31 0.16 0.57 1.0 0.67 0.25 0.31 0.31 0.17 0.21 0.28 0.34 0.46 0.7 0.3 0.21 0.38 0.24 0.52 0.12 0.17 0.14 0.31
Sro1302_g260910.1 (Contig3975.g30528)
 0.03 0.58 0.76 0.64 0.66 0.32 0.53 1.0 0.83 0.42 0.43 0.45 0.36 0.16 0.41 0.43 0.51 0.69 0.63 0.33 0.37 0.4 0.49 0.12 0.11 0.24 0.4
Sro1341_g264530.1 (Contig2923.g23284)
 0.1 0.24 0.11 0.18 0.34 0.29 0.28 0.86 0.72 0.48 0.14 0.77 0.37 0.61 0.21 0.29 0.35 1.0 0.38 0.29 0.64 0.46 0.32 0.37 0.11 0.14 0.22
Sro143_g066710.1 (Contig3754.g28777)
 0.06 0.31 0.26 0.51 0.44 0.29 0.79 0.94 0.72 0.52 0.85 0.75 0.48 0.29 0.64 0.64 1.0 0.9 0.29 0.36 0.6 0.19 0.7 0.55 0.38 0.24 0.55
Sro1499_g277750.1 (Contig1461.g13421)
 0.02 0.14 0.1 0.1 0.06 0.21 0.36 0.33 0.24 0.66 0.44 0.85 0.58 0.72 0.36 0.28 0.27 0.4 0.39 1.0 0.8 0.1 0.39 0.37 0.33 0.29 0.44
Sro1499_g277760.1 (Contig1461.g13422)
 0.01 0.35 0.2 0.19 0.06 0.21 0.39 0.42 0.17 0.65 0.59 0.82 0.39 0.59 0.46 0.19 0.46 0.53 0.49 0.96 1.0 0.15 0.36 0.52 0.71 0.3 0.42
Sro1554_g282050.1 (Contig1398.g12862)
 0.08 0.23 0.12 0.23 0.31 0.18 0.21 0.52 0.33 0.5 0.17 0.8 0.45 0.56 0.27 0.32 0.33 1.0 0.41 0.32 0.69 0.25 0.15 0.46 0.1 0.17 0.2
Sro1565_g282870.1 (Contig2951.g23401)
 0.55 0.46 0.49 0.33 0.36 0.14 0.8 0.51 0.41 0.68 0.29 1.0 0.6 0.33 0.39 0.37 0.18 0.37 0.68 0.8 0.76 0.0 0.68 0.31 0.5 0.29 0.29
Sro160_g072050.1 (Contig2985.g23701)
 0.17 0.06 0.12 0.05 0.09 0.06 0.55 0.18 0.23 0.49 0.32 0.84 0.2 0.18 0.25 0.19 0.09 0.07 0.21 0.35 0.51 0.11 0.35 0.59 1.0 0.46 0.14
Sro1679_g290650.1 (Contig1151.g11014)
 0.17 1.0 0.78 0.52 0.68 0.16 0.43 0.45 0.57 0.54 0.19 0.52 0.41 0.39 0.35 0.24 0.22 0.27 0.53 0.78 0.53 0.74 0.45 0.16 0.22 0.15 0.16
Sro172_g075880.1 (Contig1453.g13297)
 0.03 0.79 0.54 0.74 0.63 0.19 0.9 0.68 0.84 0.67 0.5 0.81 0.18 0.51 0.66 0.94 0.5 0.35 0.26 0.25 1.0 0.31 0.82 0.69 0.98 0.54 0.53
Sro175_g077170.1 (Contig1856.g16233)
 0.0 0.14 0.28 0.31 0.21 0.26 0.73 1.0 0.68 0.37 0.23 0.57 0.67 0.46 0.32 0.28 0.33 0.34 0.26 0.44 0.37 0.29 0.43 0.11 0.13 0.24 0.33
Sro1839_g300930.1 (Contig1409.g12923)
 0.17 0.12 0.12 0.08 0.13 0.07 0.39 0.6 0.57 0.46 0.21 1.0 0.35 0.31 0.13 0.07 0.12 0.56 0.29 0.24 0.51 0.08 0.54 0.3 0.25 0.17 0.09
Sro195_g083210.1 (Contig4576.g34158)
 0.02 0.19 0.14 0.24 0.24 0.23 0.66 0.48 0.62 0.5 0.6 0.58 0.97 0.45 0.71 0.59 0.49 0.42 0.34 1.0 0.5 0.37 0.46 0.3 0.35 0.21 0.56
Sro2071_g313380.1 (Contig4578.g34172)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.41 0.47 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro208_g087010.1 (Contig351.g4772)
 0.06 0.32 0.38 0.41 0.37 0.22 0.45 0.28 0.44 0.66 0.85 1.0 0.32 0.63 0.55 0.55 0.5 0.32 0.5 0.57 0.67 0.32 0.5 0.37 0.13 0.31 0.57
Sro2148_g316580.1 (Contig3130.g24844)
 1.0 0.14 0.19 0.37 0.39 0.14 0.32 0.23 0.28 0.33 0.3 0.36 0.49 0.48 0.43 0.82 0.44 0.56 0.38 0.39 0.3 0.11 0.36 0.21 0.25 0.2 0.18
Sro2226_g319810.1 (Contig2376.g19524)
 0.19 0.25 0.29 0.42 0.38 0.32 0.57 0.6 0.76 0.65 0.63 0.77 1.0 0.47 0.64 0.77 0.49 0.44 0.43 0.76 0.66 0.42 0.46 0.46 0.57 0.33 0.46
Sro236_g095000.1 (Contig1410.g12938)
 0.87 0.39 0.48 0.52 0.56 0.38 0.74 0.59 0.58 0.79 0.79 1.0 0.53 0.83 0.68 0.67 0.86 0.63 0.55 0.66 0.99 0.42 0.68 0.6 0.83 0.65 0.52
Sro2378_g325410.1 (Contig376.g5062)
 1.0 0.39 0.39 0.6 0.54 0.18 0.56 0.4 0.47 0.55 0.56 0.64 0.48 0.68 0.47 0.45 0.73 0.81 0.63 0.53 0.49 0.35 0.6 0.54 0.72 0.49 0.33
Sro248_g098280.1 (Contig288.g3762)
 0.0 0.51 0.12 0.1 0.15 0.07 0.63 0.22 0.79 0.41 0.31 0.77 0.71 0.16 0.25 0.48 0.1 0.17 0.3 0.35 0.73 0.38 0.7 0.31 1.0 0.25 0.2
Sro2542_g330720.1 (Contig739.g8472)
 0.03 0.36 0.49 0.62 0.47 0.26 0.64 0.54 0.71 0.62 0.75 1.0 0.48 0.78 0.51 0.6 0.73 0.4 0.4 0.49 0.86 0.35 0.84 0.28 0.13 0.28 0.46
Sro2585_g331890.1 (Contig1533.g13924)
 0.15 0.45 0.38 0.43 0.53 0.05 0.49 0.87 0.78 0.56 0.33 1.0 0.56 0.24 0.21 0.09 0.21 0.85 0.46 0.49 0.5 0.12 0.74 0.39 0.3 0.21 0.13
Sro264_g102450.1 (Contig921.g9671)
 0.32 0.4 0.5 0.52 0.54 0.22 0.62 0.59 0.81 0.67 0.4 1.0 0.55 0.59 0.51 0.87 0.54 0.59 0.56 0.6 0.89 0.38 0.93 0.35 0.64 0.4 0.29
Sro2795_g337320.1 (Contig2797.g22502)
 0.31 0.67 0.43 0.63 0.68 0.19 0.42 0.26 0.21 0.44 0.61 0.8 0.04 0.26 0.35 0.54 0.37 0.02 0.0 0.08 0.43 0.0 0.15 0.54 1.0 0.55 0.4
Sro287_g108600.1 (Contig252.g3101)
 0.2 0.14 0.37 0.3 0.25 0.26 1.0 0.98 0.89 0.47 0.67 0.48 0.23 0.18 0.49 0.84 0.7 0.53 0.31 0.3 0.53 0.28 0.77 0.2 0.29 0.3 0.54
Sro292_g109640.1 (Contig484.g6534)
 0.21 0.42 0.41 0.44 0.43 0.34 0.62 0.4 0.74 0.76 0.69 0.95 0.63 1.0 0.62 0.48 0.63 0.46 0.72 0.76 0.71 0.48 0.58 0.36 0.15 0.35 0.39
Sro294_g110250.1 (Contig215.g2573)
 0.28 0.56 0.7 0.95 0.87 0.44 0.75 0.52 0.8 0.77 0.7 0.99 1.0 0.46 0.67 0.68 0.63 0.74 0.76 0.94 0.83 0.42 0.78 0.62 0.96 0.6 0.56
Sro299_g111350.1 (Contig1218.g11437)
 0.09 0.95 0.46 0.22 0.27 0.24 0.83 0.6 0.47 0.72 0.49 0.71 0.49 0.39 0.57 0.86 0.52 0.67 0.35 0.55 0.99 0.21 0.55 0.69 1.0 0.52 0.53
Sro299_g111520.1 (Contig1218.g11454)
 0.01 0.7 0.46 0.8 0.64 0.08 0.91 0.62 0.45 0.63 0.44 1.0 0.19 0.34 0.25 0.35 0.29 0.41 0.29 0.45 0.73 0.17 0.83 0.68 0.93 0.55 0.35
Sro300_g111780.1 (Contig270.g3466)
 0.03 0.73 0.31 0.45 0.57 0.58 0.49 0.33 0.39 0.64 0.9 0.76 0.4 0.58 0.64 0.46 1.0 0.21 0.3 0.42 0.58 0.18 0.46 0.48 0.4 0.47 0.61
Sro3072_g343220.1 (Contig2349.g19315)
 0.0 1.0 0.39 0.22 0.19 0.18 0.7 0.61 0.21 0.41 0.51 0.34 0.08 0.67 0.66 0.77 0.53 0.07 0.09 0.17 0.64 0.0 0.56 0.14 0.47 0.47 0.64
Sro32_g020810.1 (Contig3715.g28554)
 0.03 1.0 0.55 0.41 0.59 0.04 0.67 0.39 0.48 0.52 0.18 0.69 0.25 0.18 0.28 0.57 0.45 0.32 0.38 0.34 0.91 0.13 0.96 0.3 0.31 0.27 0.3
Sro3387_g347490.1 (Contig4134.g31600)
 0.49 0.74 1.0 0.79 0.82 0.15 0.54 0.64 0.89 0.4 0.41 0.54 0.2 0.32 0.39 0.53 0.31 0.49 0.74 0.4 0.34 0.6 0.65 0.25 0.11 0.19 0.34
Sro366_g127510.1 (Contig1993.g17060)
 0.39 0.29 0.48 0.55 0.35 0.21 0.79 0.77 0.77 0.74 0.87 0.97 1.0 0.4 0.61 0.58 0.51 0.92 0.68 1.0 0.82 0.34 0.52 0.46 0.55 0.28 0.52
0.37 0.23 1.0 0.09 0.24 0.01 0.32 0.03 0.56 0.41 0.41 0.64 0.11 0.01 0.27 0.08 0.26 0.0 0.25 0.51 0.65 0.01 0.76 0.01 0.5 0.22 0.15
Sro3_g002410.1 (Contig3832.g29426)
 0.06 0.57 0.62 0.83 0.56 0.22 0.5 0.3 0.62 0.66 0.61 0.65 0.52 0.7 0.58 0.63 0.41 0.95 0.49 0.61 1.0 0.47 0.49 0.23 0.54 0.47 0.37
Sro4196_g353350.1 (Contig4202.g31969)
 0.49 0.16 0.36 0.12 0.15 0.0 0.81 0.19 0.54 0.42 0.15 0.59 0.0 0.26 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.26 0.51 0.0 0.06 0.05
Sro45_g027120.1 (Contig2311.g19094)
 0.05 0.97 0.94 0.65 0.62 0.38 0.65 0.62 0.39 0.64 0.34 0.94 0.27 0.37 0.38 0.23 0.23 0.42 0.48 0.53 0.6 0.22 0.41 0.58 1.0 0.6 0.42
Sro484_g152300.1 (Contig2684.g21701)
 0.08 0.17 0.31 0.25 0.25 0.32 0.89 1.0 0.68 0.39 0.36 0.56 0.35 0.19 0.36 0.45 0.44 0.67 0.31 0.28 0.31 0.17 0.59 0.12 0.24 0.47 0.3
Sro488_g153190.1 (Contig4435.g33286)
 0.81 0.36 0.2 0.29 0.28 0.71 0.34 0.18 0.46 0.61 1.0 0.8 0.03 0.68 0.71 0.31 0.84 0.03 0.0 0.03 0.5 0.24 0.25 0.33 0.37 0.23 0.46
Sro59_g034040.1 (Contig571.g7250)
 0.14 0.07 0.05 0.08 0.11 0.17 0.86 0.69 0.66 0.57 0.46 0.73 0.35 0.41 0.47 1.0 0.32 0.53 0.4 0.52 0.71 0.35 0.95 0.26 0.29 0.23 0.36
Sro636_g179330.1 (Contig84.g910)
 0.08 0.92 0.8 0.74 0.83 0.19 0.35 0.58 0.8 0.39 0.58 0.39 0.43 0.29 0.36 0.5 0.4 0.6 1.0 0.51 0.24 0.33 0.57 0.27 0.13 0.31 0.37
Sro647_g180840.1 (Contig3562.g27500)
 0.25 0.66 0.75 0.73 0.63 0.2 0.53 0.48 0.62 0.69 0.51 0.77 0.66 0.52 0.55 0.69 0.53 0.49 0.6 1.0 0.84 0.31 0.56 0.4 0.61 0.3 0.46
Sro65_g036600.1 (Contig155.g1730)
 0.0 0.89 0.44 0.78 0.94 0.62 0.42 0.33 0.4 0.59 1.0 0.64 0.8 0.49 0.71 0.72 0.83 0.55 0.66 0.63 0.69 0.38 0.37 0.29 0.33 0.4 0.61
Sro699_g189430.1 (Contig3762.g28856)
 0.03 0.16 0.1 0.09 0.07 0.17 0.67 0.44 0.64 0.35 0.22 0.4 0.15 0.3 0.24 0.31 0.3 0.21 0.18 0.15 0.42 0.16 0.51 0.52 1.0 0.31 0.26
Sro709_g190930.1 (Contig1341.g12359)
 0.01 0.55 0.66 0.78 0.57 0.32 0.57 0.23 0.51 0.6 0.52 0.74 1.0 0.49 0.52 0.57 0.64 0.48 0.61 0.74 0.88 0.22 0.39 0.74 0.81 0.78 0.38
Sro725_g193410.1 (Contig3530.g27293)
 0.0 0.61 0.53 1.0 0.55 0.22 0.22 0.07 0.12 0.24 0.31 0.34 0.16 0.28 0.14 0.14 0.11 0.06 0.1 0.21 0.24 0.0 0.12 0.25 0.38 0.31 0.17
Sro768_g199710.1 (Contig2130.g17976)
 0.71 0.41 0.26 0.25 0.43 0.36 0.5 0.19 0.49 0.68 0.4 1.0 0.25 0.99 0.72 0.35 0.97 0.15 0.15 0.15 0.46 0.0 0.55 0.39 0.09 0.27 0.63
Sro768_g199720.1 (Contig2130.g17977)
 0.62 0.54 0.38 0.31 0.73 0.23 0.45 0.15 0.44 0.58 0.38 0.64 1.0 0.87 0.62 0.37 0.91 0.37 0.73 0.78 0.46 0.0 0.54 0.38 0.13 0.37 0.6
Sro915_g219760.1 (Contig3226.g25526)
 0.03 0.09 0.2 0.19 0.21 0.21 0.48 0.31 0.5 0.47 0.82 0.57 0.9 0.26 0.49 0.49 0.51 0.9 0.48 1.0 0.78 0.17 0.18 0.3 0.5 0.34 0.63
Sro919_g220090.1 (Contig2964.g23546)
 1.0 0.47 0.34 0.25 0.2 0.7 0.42 0.29 0.6 0.58 0.39 0.93 0.39 0.6 0.29 0.22 0.75 0.52 0.88 0.54 0.49 0.21 0.84 0.18 0.11 0.54 0.28
Sro922_g220450.1 (Contig2958.g23488)
 0.34 1.0 0.66 0.57 0.8 0.13 0.43 0.55 0.6 0.61 0.25 0.84 0.21 0.47 0.35 0.46 0.34 0.6 0.51 0.33 0.74 0.65 0.56 0.25 0.37 0.34 0.18
Sro926_g220940.1 (Contig4614.g34419)
 0.16 0.21 0.1 0.13 0.27 0.09 1.0 0.49 0.76 0.75 0.06 0.87 0.0 0.68 0.27 0.41 0.18 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.67 0.7 0.32 0.24 0.25
Sro926_g220950.1 (Contig4614.g34420)
 0.38 0.42 0.23 0.0 0.23 0.3 1.0 0.27 0.83 0.79 0.66 0.88 0.0 0.68 0.5 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.49 0.51 0.33 0.1 0.27
Sro962_g225060.1 (Contig891.g9474)
 0.03 0.32 0.35 0.26 0.25 0.08 0.4 0.65 0.74 0.46 0.19 1.0 0.3 0.32 0.17 0.32 0.39 0.66 0.49 0.59 0.59 0.16 0.51 0.08 0.08 0.1 0.16
Sro992_g228880.1 (Contig4505.g33791)
 0.01 0.46 0.45 0.36 0.31 0.4 0.78 1.0 0.96 0.59 0.77 0.61 0.5 0.37 0.59 0.69 0.55 0.45 0.59 0.61 0.73 0.66 0.73 0.42 0.74 0.49 0.5
Sro99_g051030.1 (Contig1378.g12674)
 0.0 0.06 0.02 0.09 0.16 0.03 0.11 0.13 0.16 0.11 0.03 0.1 0.24 1.0 0.05 0.03 0.05 0.41 0.04 0.1 0.02 0.29 0.23 0.04 0.03 0.09 0.02

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)