Heatmap: Cluster_267 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
0.0 0.15 0.07 0.15 0.17 0.02 0.15 1.0 0.36 0.18 0.48 0.06 0.03 0.07 0.31 0.48 0.52 0.51 0.58 0.3 0.08 0.03 0.04 0.25 0.18 0.27 0.33
0.0 0.05 0.08 0.03 0.0 0.0 0.02 1.0 0.24 0.1 0.08 0.03 0.06 0.0 0.13 0.14 0.0 0.11 0.19 0.01 0.03 0.18 0.0 0.03 0.0 0.03 0.03
Sro10_g007970.1 (Contig1.g21)
0.0 0.12 0.18 0.23 0.14 0.05 0.07 0.84 0.21 0.17 0.7 0.03 0.08 0.01 0.38 1.0 0.35 0.46 0.04 0.05 0.16 0.08 0.06 0.12 0.15 0.2 0.96
Sro10_g008150.1 (Contig1.g39)
0.0 0.29 0.53 0.65 0.4 0.17 0.15 1.0 0.59 0.19 0.4 0.07 0.11 0.03 0.26 0.78 0.46 0.59 0.14 0.06 0.18 0.48 0.29 0.17 0.28 0.41 0.64
Sro1187_g250520.1 (Contig433.g5850)
0.0 0.35 0.13 0.16 0.23 0.0 0.17 1.0 0.33 0.04 0.06 0.0 0.05 0.01 0.07 0.04 0.06 0.7 0.24 0.08 0.01 0.07 0.11 0.03 0.04 0.08 0.11
Sro118_g057610.1 (Contig2714.g21831)
0.23 0.65 1.0 0.58 0.47 0.23 0.2 0.72 0.36 0.29 0.56 0.26 0.17 0.16 0.32 0.28 0.39 0.25 0.3 0.27 0.31 0.58 0.38 0.36 0.33 0.37 0.36
Sro1236_g255080.1 (Contig1374.g12611)
0.37 0.31 0.57 0.49 0.44 0.03 0.16 1.0 0.82 0.15 0.15 0.13 0.09 0.12 0.15 0.35 0.14 0.13 0.09 0.27 0.1 0.32 0.3 0.12 0.09 0.1 0.21
Sro1291_g259920.1 (Contig4270.g32312)
0.0 0.03 0.13 0.06 0.06 0.0 0.06 1.0 0.47 0.2 0.61 0.19 0.13 0.06 0.29 0.77 0.46 0.68 0.25 0.17 0.18 0.15 0.12 0.07 0.15 0.13 0.41
Sro1291_g259930.1 (Contig4270.g32313)
0.02 0.34 0.7 0.41 0.45 0.06 0.17 1.0 0.59 0.11 0.25 0.07 0.03 0.04 0.11 0.11 0.22 0.27 0.13 0.04 0.12 0.42 0.32 0.07 0.12 0.18 0.22
Sro1355_g265590.1 (Contig1703.g15256)
0.0 0.33 0.71 0.7 0.5 0.23 0.16 1.0 0.61 0.24 0.56 0.17 0.32 0.23 0.35 0.51 0.92 0.59 0.44 0.26 0.25 0.57 0.5 0.14 0.18 0.59 0.51
Sro136_g063960.1 (Contig2000.g17107)
0.0 0.09 1.0 0.46 0.46 0.06 0.45 0.93 0.75 0.18 0.27 0.17 0.48 0.24 0.2 0.18 0.56 0.22 0.35 0.35 0.28 0.59 0.39 0.16 0.23 0.13 0.13
Sro1411_g270390.1 (Contig2736.g22021)
0.01 0.68 1.0 0.63 0.49 0.05 0.2 0.64 0.45 0.2 0.15 0.2 0.26 0.03 0.17 0.25 0.16 0.23 0.42 0.32 0.17 0.34 0.33 0.25 0.32 0.25 0.13
Sro1445_g273410.1 (Contig760.g8632)
0.0 0.05 0.23 0.15 0.08 0.04 0.07 1.0 0.25 0.06 0.24 0.06 0.08 0.04 0.16 0.15 0.14 0.17 0.13 0.05 0.05 0.43 0.19 0.16 0.19 0.22 0.11
Sro1456_g274210.1 (Contig1061.g10397)
0.0 0.29 0.65 0.49 0.49 0.05 0.24 1.0 0.59 0.15 0.35 0.07 0.23 0.04 0.24 0.64 0.27 0.73 0.4 0.11 0.09 0.28 0.32 0.09 0.18 0.12 0.43
Sro1511_g278700.1 (Contig2369.g19497)
0.0 0.1 0.37 0.37 0.3 0.21 0.21 1.0 0.43 0.17 0.44 0.1 0.37 0.11 0.35 0.34 0.42 0.6 0.37 0.22 0.16 0.14 0.42 0.3 0.69 0.46 0.41
Sro1553_g281920.1 (Contig1252.g11687)
0.04 0.39 0.53 0.47 0.49 0.1 0.23 1.0 0.95 0.09 0.27 0.02 0.25 0.03 0.18 0.27 0.21 0.99 0.36 0.15 0.03 0.33 0.75 0.2 0.23 0.3 0.24
Sro1649_g288560.1 (Contig3529.g27266)
0.08 0.43 1.0 0.56 0.42 0.16 0.37 0.87 0.5 0.32 0.43 0.34 0.42 0.34 0.35 0.42 0.6 0.6 0.43 0.43 0.35 0.61 0.46 0.21 0.13 0.2 0.4
Sro164_g073460.1 (Contig4339.g32720)
0.0 0.26 0.55 0.29 0.34 0.01 0.06 1.0 0.61 0.07 0.31 0.01 0.05 0.0 0.21 0.28 0.03 0.59 0.27 0.03 0.02 0.3 0.34 0.14 0.14 0.11 0.33
Sro1778_g296960.1 (Contig1025.g10225)
0.0 0.32 0.5 0.72 0.43 0.3 0.16 1.0 0.73 0.21 0.44 0.04 0.18 0.01 0.24 0.87 0.93 0.56 0.23 0.09 0.2 0.48 0.37 0.08 0.13 0.45 0.63
Sro1784_g297340.1 (Contig4744.g35155)
0.0 0.02 0.03 0.01 0.03 0.01 0.07 1.0 0.32 0.02 0.05 0.02 0.15 0.0 0.04 0.05 0.03 0.08 0.07 0.02 0.02 0.55 0.07 0.03 0.06 0.02 0.03
0.0 0.11 0.27 0.27 0.13 0.33 0.31 1.0 0.62 0.14 0.44 0.03 0.15 0.08 0.37 0.68 0.61 0.28 0.19 0.13 0.03 0.18 0.5 0.17 0.42 0.58 0.7
Sro2217_g319480.1 (Contig953.g9843)
0.29 0.57 0.81 0.77 0.73 0.17 0.21 1.0 0.6 0.27 0.5 0.2 0.57 0.17 0.44 0.54 0.45 0.45 0.36 0.33 0.21 0.57 0.46 0.31 0.18 0.18 0.4
Sro2220_g319610.1 (Contig1022.g10192)
0.01 0.62 0.98 1.0 0.77 0.26 0.19 0.95 0.73 0.32 0.46 0.34 0.19 0.39 0.37 0.33 0.46 0.29 0.37 0.27 0.29 0.61 0.5 0.19 0.16 0.36 0.4
Sro2403_g326410.1 (Contig1134.g10895)
0.0 0.06 0.25 0.19 0.17 0.02 0.08 1.0 0.32 0.15 0.35 0.01 0.0 0.01 0.19 0.49 0.37 0.02 0.0 0.01 0.02 0.08 0.1 0.01 0.02 0.01 0.65
Sro258_g101170.1 (Contig315.g4203)
0.0 0.15 0.75 0.53 0.33 0.23 0.2 1.0 0.43 0.14 0.69 0.09 0.07 0.04 0.35 0.57 0.42 0.27 0.11 0.02 0.08 0.05 0.21 0.17 0.31 0.36 0.64
Sro2705_g335180.1 (Contig2398.g19645)
0.0 0.27 0.46 0.4 0.42 0.28 0.49 1.0 0.59 0.28 0.52 0.16 0.29 0.21 0.52 0.69 0.57 0.71 0.48 0.2 0.19 0.24 0.47 0.51 0.54 0.46 0.59
Sro2769_g336720.1 (Contig1968.g16839)
0.0 0.23 0.11 0.18 0.18 0.01 0.2 1.0 0.48 0.09 0.26 0.0 0.06 0.02 0.21 0.17 0.26 0.74 0.32 0.08 0.02 0.1 0.07 0.17 0.18 0.25 0.32
Sro296_g110610.1 (Contig440.g5900)
0.02 0.32 0.3 0.35 0.29 0.29 0.2 1.0 0.46 0.21 0.43 0.16 0.24 0.13 0.41 0.54 0.34 0.31 0.25 0.17 0.26 0.2 0.16 0.32 0.42 0.27 0.4
Sro302_g112200.1 (Contig378.g5078)
0.0 0.07 0.13 0.06 0.05 0.14 0.06 1.0 0.34 0.06 0.07 0.05 0.35 0.24 0.1 0.09 0.22 0.07 0.1 0.13 0.05 0.39 0.22 0.15 0.03 0.04 0.08
Sro321_g116870.1 (Contig56.g443)
0.0 0.57 1.0 0.43 0.4 0.17 0.16 0.54 0.47 0.19 0.2 0.25 0.15 0.11 0.17 0.16 0.25 0.35 0.31 0.14 0.3 0.46 0.45 0.23 0.4 0.35 0.22
Sro324_g117600.1 (Contig590.g7398)
0.0 0.18 0.4 0.28 0.19 0.18 0.15 1.0 0.61 0.16 0.27 0.13 0.21 0.19 0.2 0.15 0.44 0.14 0.16 0.14 0.15 0.58 0.32 0.14 0.06 0.14 0.2
Sro336_g120300.1 (Contig4022.g30919)
0.0 0.06 0.23 0.2 0.14 0.16 0.1 0.89 0.24 0.26 0.98 0.18 0.53 0.1 0.53 0.98 0.37 0.54 0.36 0.15 0.23 0.1 0.13 0.17 0.27 0.23 1.0
Sro357_g125580.1 (Contig708.g8186)
0.04 0.45 0.59 0.65 0.55 0.07 0.22 1.0 0.59 0.24 0.23 0.2 0.37 0.15 0.24 0.28 0.19 0.25 0.25 0.47 0.2 0.4 0.31 0.15 0.09 0.12 0.21
Sro3587_g349390.1 (Contig1909.g16503)
0.0 0.14 0.02 0.03 0.08 0.0 0.01 1.0 0.15 0.02 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.41 0.27 0.11 0.0 0.4 0.26 0.0 0.02 0.0 0.0
Sro365_g127290.1 (Contig3612.g27903)
0.0 0.47 1.0 0.68 0.52 0.1 0.17 0.84 0.47 0.12 0.31 0.08 0.16 0.03 0.19 0.29 0.25 0.1 0.12 0.14 0.13 0.3 0.38 0.13 0.21 0.27 0.28
Sro391_g133080.1 (Contig2759.g22209)
0.01 0.53 0.91 0.78 0.76 0.32 0.31 1.0 0.7 0.33 0.56 0.31 0.38 0.21 0.49 0.58 0.66 0.62 0.39 0.45 0.24 0.57 0.49 0.22 0.15 0.29 0.44
Sro434_g142030.1 (Contig783.g8760)
0.01 0.45 0.25 0.14 0.18 0.03 0.05 1.0 0.61 0.07 0.04 0.1 0.06 0.03 0.03 0.1 0.04 0.05 0.02 0.1 0.07 0.27 0.26 0.01 0.04 0.03 0.03
Sro43_g026230.1 (Contig2453.g20089)
0.19 0.65 0.65 0.54 0.58 0.12 0.3 1.0 0.61 0.19 0.36 0.12 0.26 0.17 0.38 0.43 0.32 0.28 0.1 0.21 0.19 0.64 0.39 0.27 0.22 0.13 0.33
Sro445_g144500.1 (Contig1488.g13605)
0.0 0.36 0.66 0.68 0.54 0.3 0.21 1.0 0.45 0.23 0.49 0.19 0.31 0.17 0.4 0.6 0.56 0.35 0.18 0.13 0.2 0.31 0.3 0.22 0.28 0.39 0.47
Sro469_g149290.1 (Contig2361.g19379)
0.02 0.76 0.43 0.26 0.43 0.03 0.21 1.0 0.55 0.16 0.08 0.08 0.4 0.26 0.21 0.12 0.1 0.76 0.45 0.22 0.25 0.67 0.42 0.27 0.24 0.08 0.08
Sro533_g161640.1 (Contig3819.g29332)
0.0 0.1 0.2 0.11 0.09 0.11 0.23 0.92 0.41 0.14 0.28 0.04 0.17 0.04 0.27 0.58 0.26 1.0 0.44 0.14 0.08 0.11 0.14 0.2 0.38 0.37 0.41
Sro56_g032780.1 (Contig3029.g24154)
0.01 0.34 0.5 0.52 0.68 0.41 0.62 1.0 0.6 0.35 0.68 0.21 0.41 0.15 0.55 0.77 0.66 0.58 0.32 0.27 0.27 0.29 0.44 0.55 0.34 0.27 0.72
Sro606_g174530.1 (Contig3560.g27490)
0.0 0.07 0.73 0.46 0.28 0.13 0.03 1.0 0.33 0.04 0.11 0.01 0.05 0.01 0.07 0.02 0.13 0.01 0.0 0.04 0.0 0.56 0.09 0.01 0.0 0.1 0.05
Sro683_g186640.1 (Contig860.g9402)
0.0 0.03 0.22 0.2 0.14 0.23 0.15 1.0 0.25 0.09 0.61 0.03 0.02 0.03 0.48 0.63 0.23 0.07 0.02 0.0 0.01 0.05 0.18 0.13 0.15 0.1 0.63
Sro683_g186650.1 (Contig860.g9403)
0.0 0.27 0.58 0.62 0.45 0.19 0.16 1.0 0.37 0.13 0.49 0.02 0.05 0.03 0.34 0.61 0.37 0.25 0.12 0.01 0.01 0.22 0.25 0.19 0.18 0.22 0.58
Sro694_g188490.1 (Contig4437.g33302)
0.06 0.1 0.3 0.11 0.12 0.06 0.22 1.0 0.38 0.22 0.64 0.15 0.2 0.05 0.33 0.5 0.7 0.65 0.2 0.14 0.33 0.12 0.16 0.15 0.22 0.17 0.84
Sro708_g190700.1 (Contig4523.g33874)
0.0 0.46 0.55 0.25 0.28 0.08 0.24 0.88 0.58 0.18 0.18 0.03 0.28 0.01 0.16 0.26 0.28 1.0 0.6 0.4 0.1 0.34 0.34 0.05 0.11 0.15 0.31
Sro710_g190980.1 (Contig1639.g14770)
0.0 0.26 0.43 0.4 0.41 0.2 0.22 1.0 0.43 0.1 0.19 0.08 0.23 0.17 0.28 0.34 0.17 0.1 0.04 0.03 0.1 0.14 0.26 0.25 0.13 0.05 0.31
Sro7_g006400.1 (Contig389.g5293)
0.0 0.25 0.34 0.48 0.26 0.19 0.21 1.0 0.41 0.09 0.29 0.05 0.04 0.05 0.29 0.05 0.12 0.28 0.04 0.02 0.08 0.51 0.34 0.06 0.03 0.05 0.1
Sro85_g045530.1 (Contig4580.g34230)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 1.0 0.18 0.03 0.0 0.0 0.19 0.02 0.01 0.01 0.0 0.2 0.02 0.02 0.0 0.29 0.02 0.43 0.12 0.01 0.0
Sro883_g215420.1 (Contig421.g5652)
0.01 0.16 0.15 0.18 0.11 0.01 0.0 1.0 0.35 0.02 0.0 0.0 0.1 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.36 0.02 0.01 0.12 0.19 0.0
Sro883_g215540.1 (Contig421.g5664)
0.06 0.37 0.47 0.42 0.5 0.12 0.26 1.0 0.56 0.21 0.27 0.26 0.15 0.1 0.19 0.22 0.32 0.6 0.27 0.12 0.3 0.37 0.35 0.14 0.16 0.2 0.21
Sro920_g220220.1 (Contig2508.g20522)
0.01 0.19 0.54 0.77 0.68 0.21 0.29 1.0 0.73 0.09 0.23 0.03 0.37 0.01 0.1 0.1 0.32 0.93 0.23 0.12 0.1 0.46 0.56 0.17 0.32 0.43 0.08
Sro950_g223790.1 (Contig3704.g28513)
0.01 0.21 0.47 0.45 0.42 0.02 0.16 1.0 0.44 0.13 0.17 0.13 0.38 0.03 0.16 0.15 0.1 0.45 0.48 0.35 0.07 0.14 0.26 0.08 0.05 0.05 0.13
Sro980_g227450.1 (Contig982.g9982)
0.01 0.4 0.56 0.59 0.65 0.11 0.39 1.0 0.73 0.32 0.35 0.4 0.45 0.23 0.34 0.31 0.24 0.51 0.54 0.4 0.32 0.28 0.54 0.13 0.13 0.18 0.35
Sro984_g227940.1 (Contig3577.g27654)
0.0 0.26 0.45 0.54 0.35 0.17 0.17 1.0 0.72 0.1 0.23 0.01 0.05 0.01 0.13 0.47 0.45 0.26 0.09 0.03 0.09 0.49 0.38 0.04 0.07 0.25 0.33
Sro989_g228470.1 (Contig1449.g13276)
0.01 0.56 0.71 0.53 0.46 0.18 0.24 1.0 0.48 0.26 0.34 0.24 0.19 0.19 0.3 0.46 0.58 0.64 0.3 0.2 0.19 0.44 0.33 0.12 0.12 0.22 0.37
Sro997_g229450.1 (Contig4588.g34267)
0.01 0.27 0.38 0.19 0.21 0.07 0.09 1.0 0.44 0.07 0.22 0.05 0.11 0.01 0.1 0.12 0.21 0.13 0.2 0.02 0.02 0.28 0.17 0.02 0.04 0.03 0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)