1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_117 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1002_g229930.1 (Contig2058.g17662)
 0.0 0.1 0.0 0.07 0.0 0.17 0.0 0.43 0.0 0.04 0.54 0.0 0.07 1.0 0.48 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.05
Sro1052_g235780.1 (Contig1507.g13764)
 0.0 0.16 0.1 0.11 0.07 0.11 0.15 0.15 0.05 0.34 0.47 0.27 0.74 0.74 0.46 0.3 0.63 0.32 0.27 1.0 0.32 0.03 0.05 0.19 0.2 0.2 0.25
Sro10_g008060.1 (Contig1.g30)
 0.0 0.13 0.1 0.1 0.14 0.06 0.08 0.05 0.14 0.12 0.12 0.08 0.92 0.48 0.13 0.12 0.46 0.21 0.14 1.0 0.04 0.04 0.15 0.01 0.0 0.15 0.12
Sro1123_g243610.1 (Contig3394.g26535)
 0.01 0.0 0.05 0.01 0.05 0.01 0.02 0.03 0.01 0.24 0.04 0.15 0.8 0.31 0.13 0.02 1.0 0.01 0.0 0.92 0.16 0.1 0.0 0.01 0.07 0.27 0.27
Sro1244_g255580.1 (Contig394.g5329)
 0.2 0.24 0.37 0.51 0.14 0.1 0.19 0.29 0.16 0.44 0.61 0.33 1.0 0.45 0.5 0.59 0.86 0.02 0.25 0.96 0.43 0.19 0.13 0.32 0.03 0.33 0.39
Sro1251_g256170.1 (Contig2232.g18542)
 0.01 0.07 0.14 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.09 0.07 0.01 0.72 1.0 0.1 0.01 0.13 0.07 0.13 0.77 0.05 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.03 0.05 0.04 0.01 0.05 0.02 0.01 0.0 0.12 0.03 0.03 0.59 1.0 0.09 0.01 0.08 0.2 0.05 0.67 0.02 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro1301_g260800.1 (Contig4448.g33381)
 0.01 0.38 0.1 0.13 0.11 0.09 0.07 0.16 0.1 0.28 0.2 0.25 0.83 0.91 0.15 0.15 0.91 0.12 0.09 1.0 0.16 0.05 0.1 0.01 0.0 0.27 0.16
Sro1567_g283000.1 (Contig3738.g28666)
 0.0 0.04 0.17 0.48 0.25 0.33 0.08 0.06 0.19 0.39 0.36 0.34 0.99 1.0 0.4 0.25 0.59 0.2 0.14 1.0 0.24 0.05 0.06 0.03 0.0 0.35 0.24
Sro1572_g283390.1 (Contig2634.g21351)
 0.0 0.17 0.17 0.02 0.04 0.04 0.01 0.01 0.01 0.12 0.11 0.02 0.81 1.0 0.31 0.03 0.23 0.07 0.05 0.84 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro1596_g284750.1 (Contig2886.g23035)
 0.01 0.04 0.04 0.01 0.01 0.41 0.0 0.0 0.0 0.12 0.66 0.02 0.31 0.65 0.75 0.19 1.0 0.35 0.08 0.37 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08
Sro1596_g284760.1 (Contig2886.g23036)
 0.0 0.11 0.03 0.01 0.01 0.3 0.0 0.0 0.0 0.14 0.49 0.02 0.86 0.59 0.67 0.13 0.57 0.22 0.07 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro1611_g285880.1 (Contig2477.g20235)
 0.12 0.03 0.03 0.03 0.02 0.16 0.13 0.07 0.07 0.36 0.46 0.62 0.67 1.0 0.59 0.37 0.97 0.16 0.28 0.69 0.44 0.03 0.1 0.15 0.11 0.11 0.21
0.07 0.38 0.37 0.22 0.17 0.46 0.12 0.12 0.13 0.31 0.58 0.41 0.44 0.32 0.72 0.1 1.0 0.26 0.17 0.44 0.38 0.02 0.14 0.12 0.09 0.12 0.2
Sro1719_g293450.1 (Contig4364.g32877)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.0 0.01 0.0 0.08 0.09 0.03 0.97 0.39 0.16 0.02 0.18 0.09 0.03 1.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
Sro178_g078120.1 (Contig275.g3537)
 0.0 0.18 0.05 0.0 0.01 0.38 0.0 0.0 0.0 0.11 0.25 0.0 0.53 1.0 0.54 0.02 0.64 0.04 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.09
Sro1878_g303130.1 (Contig3110.g24734)
 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.04 0.06 0.09 0.08 0.06 0.03 1.0 0.39 0.14 0.09 0.02 0.27 0.09 0.9 0.07 0.19 0.05 0.02 0.0 0.01 0.01
Sro1_g000260.1 (Contig3007.g23941)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.93 0.98 0.21 0.01 0.18 0.3 0.14 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2004_g310420.1 (Contig2826.g22658)
 0.0 0.06 0.02 0.01 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.01 0.91 0.3 0.19 0.02 0.19 0.1 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2091_g314000.1 (Contig29.g195)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.01 0.12 0.09 0.12 0.01 1.0 0.8 0.29 0.03 0.32 0.02 0.01 0.93 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06
Sro2129_g315770.1 (Contig3432.g26732)
 0.0 0.05 0.03 0.01 0.02 0.89 0.11 0.09 0.09 0.23 0.45 0.08 0.99 0.94 0.78 0.05 1.0 0.41 0.29 0.68 0.2 0.3 0.07 0.1 0.1 0.13 0.1
Sro2159_g316990.1 (Contig1250.g11678)
 0.0 0.07 0.03 0.02 0.02 0.38 0.0 0.0 0.0 0.16 0.49 0.06 0.48 1.0 0.7 0.14 0.7 0.14 0.07 0.53 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09
Sro2180_g317960.1 (Contig3551.g27415)
 0.0 0.4 0.36 0.12 0.1 0.22 0.0 0.01 0.01 0.13 0.32 0.01 0.78 0.5 0.47 0.1 0.59 0.12 0.07 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06
Sro218_g090200.1 (Contig1136.g10921)
 0.0 0.07 0.19 0.17 0.1 0.01 0.02 0.0 0.05 0.14 0.17 0.15 0.29 0.73 1.0 0.03 0.33 0.01 0.02 0.26 0.08 0.03 0.07 0.06 0.0 0.0 0.01
Sro227_g092280.1 (Contig327.g4340)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 0.0 0.04 1.0 0.34 0.02 0.29 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2296_g322360.1 (Contig1462.g13427)
 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.07 0.02 0.07 0.09 0.05 0.04 1.0 0.49 0.21 0.08 0.07 0.01 0.01 0.92 0.06 0.14 0.07 0.03 0.0 0.01 0.01
Sro2346_g324220.1 (Contig4425.g33219)
 0.0 0.03 0.12 0.0 0.0 0.24 0.01 0.0 0.08 0.16 0.15 0.04 0.54 0.48 0.18 0.01 0.17 0.39 0.52 1.0 0.05 0.09 0.04 0.0 0.0 0.04 0.02
Sro2463_g328430.1 (Contig2143.g18013)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.07 0.08 0.02 0.0 0.89 0.9 0.12 0.01 0.03 0.02 0.01 1.0 0.0 0.15 0.13 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro251_g099420.1 (Contig687.g8022)
 0.0 0.14 0.09 0.03 0.03 0.5 0.0 0.0 0.0 0.21 0.61 0.06 0.98 0.82 0.77 0.33 0.97 0.3 0.13 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.14
Sro251_g099430.1 (Contig687.g8023)
 0.0 0.04 0.03 0.02 0.02 0.36 0.0 0.0 0.0 0.14 0.51 0.02 1.0 0.94 0.8 0.13 0.86 0.13 0.03 0.98 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06
Sro2882_g339270.1 (Contig3220.g25449)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09 0.22 0.0 0.94 1.0 0.29 0.03 0.4 0.05 0.01 0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.08 0.12 0.0 1.0 0.66 0.24 0.02 0.28 0.06 0.01 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2882_g339290.1 (Contig3220.g25451)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.06 0.25 0.01 0.09 1.0 0.33 0.04 0.5 0.01 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro309_g113670.1 (Contig3477.g26957)
 0.0 0.03 0.03 0.02 0.03 0.02 0.06 0.07 0.06 0.07 0.1 0.0 0.8 1.0 0.28 0.01 0.21 0.15 0.05 0.82 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro320_g116570.1 (Contig3665.g28318)
 0.01 0.03 0.02 0.02 0.01 0.19 0.06 0.03 0.01 0.19 0.25 0.17 0.63 0.58 0.33 0.07 0.51 0.16 0.19 1.0 0.16 0.02 0.02 0.06 0.06 0.07 0.09
Sro408_g136910.1 (Contig3193.g25226)
 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 0.01 0.03 0.12 0.16 0.09 0.95 0.51 0.34 0.09 0.15 0.01 0.03 1.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.17 0.09 0.05
Sro429_g141050.1 (Contig2742.g22037)
 0.01 0.1 0.13 0.17 0.15 0.14 0.12 0.21 0.09 0.28 0.45 0.31 0.75 1.0 0.33 0.18 0.83 0.22 0.21 0.77 0.23 0.1 0.07 0.12 0.09 0.21 0.14
Sro481_g151660.1 (Contig3107.g24724)
 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.22 0.02 0.02 0.02 0.19 0.26 0.13 0.82 1.0 0.4 0.11 0.85 0.2 0.18 0.81 0.15 0.06 0.02 0.01 0.01 0.04 0.08
Sro489_g153380.1 (Contig402.g5447)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 0.2 0.0 1.0 0.66 0.39 0.04 0.44 0.08 0.01 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro702_g189950.1 (Contig1416.g12998)
 0.0 0.13 0.06 0.03 0.03 0.38 0.0 0.0 0.0 0.14 0.51 0.02 0.67 0.63 0.73 0.2 1.0 0.13 0.05 0.75 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.11
Sro764_g199120.1 (Contig1534.g13941)
 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.08 0.24 0.0 0.42 1.0 0.36 0.04 0.48 0.03 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro819_g207160.1 (Contig8.g102)
 0.08 0.16 0.19 0.17 0.13 0.22 0.15 0.1 0.14 0.29 0.33 0.37 0.78 0.68 0.4 0.25 0.59 0.24 0.4 1.0 0.3 0.18 0.15 0.14 0.11 0.1 0.15
Sro855_g211470.1 (Contig1132.g10861)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.07 0.06 0.0 0.95 0.46 0.19 0.02 0.02 0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.25
Sro931_g221440.1 (Contig2300.g19027)
 0.0 0.1 0.05 0.1 0.1 0.29 0.07 0.02 0.09 0.2 0.29 0.1 0.87 1.0 0.33 0.04 0.54 0.05 0.02 0.79 0.16 0.06 0.1 0.0 0.01 0.2 0.1
Sro94_g048900.1 (Contig150.g1680)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.0 1.0 0.6 0.2 0.02 0.17 0.03 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro95_g049260.1 (Contig45.g311)
 0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.11 0.43 0.01 0.83 1.0 0.59 0.09 0.91 0.1 0.03 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro976_g226960.1 (Contig4239.g32119)
 0.0 0.16 0.05 0.03 0.04 0.61 0.0 0.0 0.0 0.21 0.68 0.04 0.83 1.0 0.98 0.22 0.9 0.32 0.11 0.93 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)