Heatmap: Cluster_155 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1023_g232580.1 (Contig1305.g12114)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.16 0.04 0.03 0.42 0.12 0.04 0.11 0.19 0.03 0.24 0.09 5.48 5.59 0.1 0.31 0.07 0.04 0.08 0.0 0.1 0.17
0.1 0.47 0.28 0.1 0.18 0.19 1.2 4.03 1.68 0.93 0.53 0.57 5.92 0.2 0.64 1.07 0.16 3.98 4.42 5.53 0.17 2.0 1.06 0.42 0.87 0.31 0.67
Sro10_g007860.1 (Contig1.g10)
0.87 0.34 1.0 1.49 1.09 1.87 1.11 1.02 0.99 6.39 2.86 8.9 7.25 3.94 2.85 2.22 4.11 40.69 21.12 11.42 11.02 0.5 3.73 2.0 6.56 4.99 1.74
Sro10_g007870.1 (Contig1.g11)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.97 0.08 0.0 0.53 0.0 1.66 0.74 0.27 17.32 6.66 0.77 0.24 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.17
Sro1158_g247500.1 (Contig718.g8291)
3.72 18.73 16.71 21.43 22.85 28.54 56.27 87.95 42.83 29.43 40.43 25.79 59.73 14.85 32.75 22.04 30.81 88.4 39.11 36.88 43.15 27.46 34.84 44.5 15.26 12.34 26.46
Sro1187_g250500.1 (Contig433.g5848)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.74 5.48 0.65 0.64 0.47 0.18 4.11 0.09 0.76 0.0 0.0 4.0 2.05 5.98 0.93 0.82 0.04 1.92 1.5 1.03 0.44
Sro1187_g250530.1 (Contig433.g5851)
0.17 3.2 0.97 3.4 4.15 0.35 7.28 7.77 7.26 6.15 0.52 1.08 29.32 1.03 2.11 1.63 1.39 81.84 16.02 22.94 0.86 0.77 5.94 0.87 1.19 0.67 0.43
Sro1201_g251970.1 (Contig377.g5064)
0.08 4.67 4.92 2.21 2.49 0.38 2.34 5.37 4.99 1.91 1.63 0.67 3.27 0.22 1.86 1.65 2.54 15.06 6.51 3.61 1.66 1.32 4.5 1.52 1.58 0.79 1.73
Sro1316_g262180.1 (Contig3701.g28506)
0.0 1.36 0.45 0.4 0.16 0.0 0.0 0.58 0.01 1.63 0.15 0.0 3.55 0.0 0.11 0.81 0.0 38.36 50.74 6.72 0.04 0.15 0.36 0.03 0.0 0.0 0.25
0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.03 0.03 0.07 0.05 0.05 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.01 0.0 0.61 0.31 0.55 0.01 0.04 0.04 0.0 0.05 0.04 0.01
Sro1335_g263920.1 (Contig341.g4640)
0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.03 0.03 0.07 0.05 0.05 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.01 0.0 0.61 0.31 0.55 0.01 0.04 0.04 0.0 0.05 0.04 0.01
Sro1427_g271770.1 (Contig1281.g11979)
783.91 762.3 1228.58 362.65 369.16 571.62 843.86 1839.47 1408.15 850.41 1195.29 857.01 1765.71 598.67 962.68 1069.72 1599.9 3982.17 3195.91 2248.44 436.58 759.23 729.45 328.58 208.93 314.48 1117.97
Sro1510_g278570.1 (Contig668.g7852)
0.15 0.98 0.97 0.89 1.95 0.47 6.43 8.35 4.16 3.39 1.76 3.18 7.42 3.56 3.7 5.58 1.4 9.58 7.09 9.79 4.21 2.52 2.99 3.31 2.52 2.56 2.19
Sro1527_g279890.1 (Contig3630.g28059)
0.86 10.5 10.4 18.6 11.53 0.11 0.42 21.46 6.25 8.1 0.49 0.45 49.5 0.35 0.37 0.93 0.04 103.86 45.11 50.85 0.5 13.02 1.48 0.28 2.05 0.4 0.32
Sro1530_g280040.1 (Contig886.g9453)
0.88 17.11 13.06 21.04 20.08 6.65 43.28 71.68 29.39 16.04 16.44 8.57 32.64 5.95 13.22 7.08 11.33 57.48 25.96 22.56 15.78 24.13 27.49 28.02 9.24 7.87 11.17
Sro1545_g281290.1 (Contig3310.g25931)
0.35 0.13 0.24 0.18 0.16 0.36 7.39 23.72 11.23 5.17 1.36 7.15 1.89 0.31 4.66 4.4 1.31 22.12 11.81 3.56 8.31 1.65 2.25 0.71 2.08 3.36 3.6
Sro1545_g281350.1 (Contig3310.g25937)
0.0 1.27 1.73 1.26 1.13 0.46 1.63 7.77 2.78 1.55 2.02 1.04 6.37 1.51 2.14 2.87 2.06 17.86 14.13 3.17 1.24 2.47 1.71 1.39 1.84 1.33 2.56
Sro159_g071910.1 (Contig500.g6731)
0.0 0.67 0.95 1.52 1.42 0.07 0.58 2.73 1.33 0.42 0.32 0.19 3.02 0.18 0.13 0.23 0.12 1.01 1.44 4.29 0.41 1.72 0.57 0.28 0.48 0.19 0.23
Sro1601_g285110.1 (Contig4269.g32295)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.32 0.07 0.04 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 5.28 2.12 0.82 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05
Sro1632_g287270.1 (Contig3523.g27242)
0.02 0.08 0.03 0.06 0.04 0.12 0.06 0.37 0.23 0.33 0.41 0.32 0.46 0.09 0.37 0.2 0.44 1.04 0.81 0.76 0.5 0.05 0.15 0.08 0.07 0.05 0.29
Sro1752_g295370.1 (Contig2498.g20494)
0.0 0.19 0.72 0.13 0.14 0.03 0.63 3.95 2.3 0.37 0.25 0.26 2.09 0.0 0.28 0.26 0.0 2.84 1.32 1.03 0.55 0.01 0.23 0.34 0.47 0.47 0.11
Sro1843_g301200.1 (Contig4701.g34968)
39.17 34.19 31.72 31.21 33.17 31.55 54.76 50.23 54.31 54.74 55.73 65.61 101.28 43.35 53.99 54.17 43.42 112.58 126.3 96.44 45.93 46.4 45.18 33.1 25.98 25.22 37.55
Sro1898_g304110.1 (Contig1148.g10960)
0.0 9.53 20.43 16.63 11.62 2.58 13.13 19.17 14.39 4.21 3.99 4.01 11.49 3.47 6.17 5.92 5.36 33.12 13.15 9.85 2.63 9.3 9.76 6.49 4.44 3.75 5.32
Sro2029_g311780.1 (Contig1505.g13756)
0.0 0.34 0.12 0.16 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.58 1.29 1.1 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro206_g086560.1 (Contig4750.g35193)
0.94 23.77 13.77 16.06 15.84 7.55 22.53 50.07 35.03 15.78 8.66 14.39 27.49 9.15 20.43 18.1 13.79 70.74 47.43 25.51 13.86 27.45 17.19 8.7 10.03 7.62 17.07
Sro2094_g314120.1 (Contig1203.g11326)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.3 0.08 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro20_g014250.1 (Contig2954.g23455)
0.29 0.05 0.17 0.24 0.05 1.02 4.41 9.97 4.52 4.31 3.08 5.19 3.01 1.61 6.1 8.82 3.06 10.09 4.44 3.15 9.0 2.56 3.73 3.86 7.44 5.88 3.57
Sro212_g088240.1 (Contig3756.g28807)
0.0 0.13 0.05 0.05 0.09 0.0 0.04 0.58 0.21 0.15 0.13 0.02 0.46 0.0 0.18 0.1 0.14 1.82 1.46 0.63 0.1 0.18 0.2 0.02 0.04 0.11 0.14
Sro212_g088250.1 (Contig3756.g28808)
0.0 0.18 0.19 0.03 0.1 0.01 0.05 0.17 0.15 0.12 0.14 0.02 0.27 0.03 0.17 0.11 0.19 1.0 1.15 0.39 0.05 0.06 0.09 0.06 0.06 0.01 0.13
Sro221_g090860.1 (Contig91.g1009)
0.02 10.51 18.18 8.48 18.05 0.0 0.0 4.5 3.12 5.06 0.0 0.0 39.54 0.0 0.0 0.0 0.0 90.48 46.72 35.28 0.06 7.06 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0
Sro2241_g320390.1 (Contig1724.g15422)
0.12 0.67 0.92 1.13 0.44 0.92 2.95 5.82 2.21 2.09 2.32 2.64 5.05 0.68 1.94 1.16 2.94 8.18 5.28 6.4 1.98 0.36 1.35 0.96 1.81 2.11 1.34
Sro242_g096520.1 (Contig554.g7070)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.21 4.11 0.0 0.0 0.0 0.0 4.98 3.75 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2442_g327790.1 (Contig1758.g15601)
1.62 2.35 0.54 2.28 2.22 0.12 0.12 6.44 0.9 1.23 1.7 1.26 2.09 0.15 0.71 1.27 0.97 2.81 5.19 2.68 2.67 2.09 1.85 0.05 0.48 0.0 0.52
1.54 3.44 1.84 14.37 10.19 108.44 12.95 128.16 36.24 38.97 74.24 13.04 249.29 3.84 86.56 88.29 61.93 406.84 203.99 183.78 4.28 44.53 14.6 0.78 0.78 40.67 43.94
Sro255_g100460.1 (Contig2336.g19223)
1.91 11.94 7.0 3.91 9.25 5.83 24.21 53.72 21.6 12.74 17.7 14.05 7.39 4.89 16.79 20.74 13.21 22.71 15.95 8.32 14.36 9.41 21.45 12.03 9.05 8.63 14.32
Sro258_g101190.1 (Contig315.g4205)
0.0 9.76 19.61 6.92 10.01 0.99 9.03 16.23 16.43 3.71 2.83 3.37 8.44 5.65 3.75 3.61 0.27 15.1 14.85 6.78 1.3 8.36 7.14 3.93 3.76 4.21 2.47
Sro260_g101500.1 (Contig1663.g15002)
0.0 0.08 0.07 0.04 0.03 0.02 0.17 1.6 0.49 0.34 0.3 0.3 0.81 0.07 0.41 0.25 0.42 2.46 1.35 0.77 0.31 0.16 0.37 0.11 0.11 0.07 0.41
Sro2823_g337980.1 (Contig4484.g33691)
0.0 0.6 0.23 0.16 0.07 0.05 0.0 0.19 0.75 0.16 0.05 0.03 0.95 0.07 0.02 0.04 0.03 0.65 0.85 1.23 0.09 0.41 0.03 0.03 0.0 0.0 0.02
Sro282_g107450.1 (Contig1420.g13088)
0.12 0.59 0.95 0.73 0.6 1.12 7.53 5.74 10.25 7.77 7.08 9.64 18.18 5.46 8.58 9.27 4.26 13.22 18.47 19.68 9.32 6.37 5.99 5.28 8.82 7.02 5.08
0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.02 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.12 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro3007_g342010.1 (Contig2640.g21379)
0.02 0.0 0.0 0.06 0.05 0.81 0.21 2.21 0.83 0.52 0.08 0.11 2.7 0.45 0.56 0.9 0.24 1.24 1.74 2.11 0.63 0.73 0.16 0.97 0.73 0.23 0.23
Sro308_g113600.1 (Contig2352.g19330)
1.66 11.1 10.51 8.26 12.25 8.0 18.04 14.07 17.23 20.87 15.85 23.72 39.81 23.98 20.32 34.34 9.43 30.87 42.98 30.22 14.23 13.85 11.33 9.26 4.59 5.06 16.72
Sro315_g115230.1 (Contig447.g6046)
1.15 3.15 3.34 2.61 2.47 1.57 9.87 5.54 8.93 6.84 5.37 8.17 15.03 4.65 5.5 9.35 4.44 17.18 17.91 21.44 7.72 7.03 6.91 4.37 3.28 3.51 4.12
Sro320_g116400.1 (Contig3665.g28301)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.29 0.0 0.03 1.61 0.03 0.07 0.0 0.0 4.74 2.55 0.97 0.07 0.0 0.0 0.25 0.58 0.0 0.01
Sro3308_g346510.1 (Contig4509.g33819)
0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.93 6.64 2.98 0.44 1.49 0.4 3.21 0.36 1.65 0.16 0.0 5.71 5.81 4.6 1.6 1.57 0.94 1.93 0.31 0.33 0.88
Sro3475_g348440.1 (Contig1307.g12116)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.06 0.52 0.25 2.62 0.46 0.0 1.12 0.0 0.22 0.38 0.12 31.65 33.25 2.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38
Sro36_g022990.1 (Contig97.g1154)
0.0 6.9 10.06 4.37 6.75 0.0 0.0 5.44 1.95 3.97 0.0 0.05 5.63 0.13 0.02 0.0 0.0 50.09 18.04 15.29 0.09 7.12 0.46 0.07 0.0 0.28 0.11
Sro375_g129560.1 (Contig4478.g33657)
0.0 6.73 5.19 4.11 2.35 0.57 2.09 12.8 5.84 1.74 1.23 0.11 3.6 1.02 1.85 2.01 1.21 19.06 18.15 2.73 0.83 2.91 4.36 0.0 0.38 0.68 2.2
Sro3800_g351160.1 (Contig3395.g26548)
0.03 0.04 0.0 0.09 0.0 0.01 0.14 2.16 0.66 0.33 0.43 0.48 0.53 0.04 0.49 0.32 0.16 1.64 0.97 0.62 0.37 0.14 0.2 0.15 0.08 0.01 0.35
Sro389_g132570.1 (Contig669.g7874)
0.13 2.29 1.57 1.42 1.54 0.39 3.72 11.79 5.25 6.96 2.54 7.53 5.99 0.21 3.01 5.51 0.66 68.71 41.74 7.21 5.36 5.93 1.7 7.98 23.22 9.93 2.49
Sro407_g136500.1 (Contig2478.g20241)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro4337_g353760.1 (Contig2819.g22597)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.02 0.0 0.24 0.0 0.0 1.23 0.0 0.04 0.08 0.04 3.61 1.45 0.82 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.05
Sro449_g145270.1 (Contig3482.g26997)
0.0 1.0 0.48 1.33 0.25 0.0 0.0 0.67 1.63 0.22 0.0 0.0 2.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 1.69 2.93 0.0 0.54 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro470_g149560.1 (Contig850.g9350)
2.11 20.85 17.15 27.78 21.98 8.05 36.05 73.32 29.6 24.03 18.5 21.52 48.79 10.79 33.39 73.01 10.18 66.07 27.77 76.59 24.8 17.56 20.37 30.02 38.93 30.51 16.99
Sro478_g151070.1 (Contig272.g3505)
0.01 1.59 0.31 0.3 0.64 0.37 5.33 12.73 3.94 1.7 1.23 1.69 1.47 0.37 1.78 2.43 0.94 10.47 3.36 3.08 3.38 1.99 2.44 2.73 4.01 2.26 1.63
Sro487_g152890.1 (Contig367.g4965)
0.52 0.89 0.58 0.26 0.63 0.19 1.0 4.99 3.7 1.92 0.56 1.39 3.06 0.54 1.34 2.39 1.61 7.69 6.04 4.55 3.22 1.61 0.51 0.7 1.42 0.28 0.7
0.0 0.21 0.12 0.08 0.71 0.0 0.3 0.32 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 0.0 8.06 2.74 0.0 0.0 0.11 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro52_g030920.1 (Contig3190.g25175)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.42 0.19 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro533_g161650.1 (Contig3819.g29333)
1.38 54.95 49.96 55.12 38.74 16.79 52.86 63.11 49.58 19.73 18.21 10.05 40.27 3.85 18.2 24.25 13.93 85.04 73.48 23.04 12.85 38.61 34.31 35.14 30.23 27.63 17.72
Sro5_g003910.1 (Contig4001.g30706)
0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.15 0.06 0.48 0.63 0.06 1.57 0.0 0.89 0.8 0.91 4.13 1.79 1.69 0.32 0.01 0.25 0.21 1.32 1.23 0.82
Sro600_g173410.1 (Contig1881.g16400)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.56 0.0 0.0 3.45 0.0 0.0 0.0 0.0 10.78 7.79 4.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro670_g184760.1 (Contig318.g4228)
40.89 8.22 12.64 14.63 15.14 7.08 26.08 24.09 28.32 20.53 14.07 18.07 62.66 17.32 16.07 19.54 19.46 48.55 41.77 67.94 20.29 16.45 25.94 7.81 13.25 9.77 10.54
Sro70_g038820.1 (Contig3352.g26229)
0.04 0.38 0.1 0.34 0.12 0.0 1.19 1.21 1.16 0.31 0.0 0.05 2.99 0.02 0.11 0.09 0.03 1.76 1.41 2.91 0.16 0.41 0.48 0.17 0.0 0.06 0.11
Sro728_g193700.1 (Contig1495.g13654)
0.46 0.7 0.51 0.52 0.97 0.03 68.42 205.44 152.0 2.49 0.44 1.96 1.17 0.14 0.35 0.28 0.69 20.44 8.9 1.97 1.52 50.04 65.95 1.05 1.47 0.55 0.38
Sro7_g006370.1 (Contig389.g5290)
0.03 0.38 1.02 0.39 0.11 0.05 0.23 2.72 0.53 0.31 0.03 0.12 0.84 0.03 0.13 0.06 0.0 2.21 2.54 1.21 0.79 0.79 0.33 0.01 0.07 0.04 0.04
Sro819_g207170.1 (Contig8.g103)
0.04 0.31 0.19 0.11 0.05 0.02 8.25 25.81 13.43 0.89 0.03 0.06 4.9 0.02 0.02 0.0 0.07 10.47 3.02 4.27 0.04 0.73 1.17 0.0 0.0 0.07 0.11
Sro820_g207260.1 (Contig34.g208)
0.67 1.27 0.91 1.93 3.92 51.53 10.86 4.39 1.21 18.48 14.46 1.43 38.67 0.47 16.43 1.28 19.81 87.6 88.77 37.08 11.24 3.22 0.46 27.97 79.35 39.36 31.96
Sro87_g045960.1 (Contig2014.g17204)
0.0 0.0 0.11 0.03 0.11 0.07 0.16 0.01 0.03 0.23 0.02 0.03 0.75 0.15 0.07 0.02 0.24 2.55 0.31 0.83 0.29 0.0 0.07 0.07 0.06 0.14 0.04
Sro892_g216990.1 (Contig1567.g14233)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.19 0.05 0.35 0.43 0.43 0.92 0.13 0.2 0.28 0.11 1.64 0.76 0.81 0.33 0.03 0.03 0.26 0.44 0.67 0.26
Sro916_g219790.1 (Contig1577.g14326)
0.08 0.33 0.27 0.17 0.18 0.21 0.27 0.57 0.54 0.41 0.53 0.25 0.42 0.08 0.46 0.41 0.6 1.77 0.89 0.44 0.47 0.04 0.44 0.39 0.49 0.2 0.48
Sro983_g227850.1 (Contig79.g824)
16.1 2.53 0.89 1.49 1.28 2.25 2.08 23.33 7.87 6.69 5.7 4.48 7.73 1.03 4.47 4.66 2.04 78.83 29.96 14.17 14.69 10.63 2.99 3.77 6.55 3.43 5.86

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)