1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_113 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1159_g247570.1 (Contig4112.g31375)
 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.04 0.04 0.05 0.25 0.08 0.25 0.2 0.29 0.25 1.0 0.1 0.26 0.35 0.18 0.22 0.08 0.01 0.0 0.0 0.01 0.14
Sro1182_g249990.1 (Contig4113.g31396)
 0.32 1.0 0.49 0.26 0.37 0.36 0.23 0.18 0.11 0.99 0.22 0.83 0.12 0.51 0.5 0.65 0.15 0.33 0.35 0.11 0.89 0.05 0.08 0.06 0.05 0.06 0.53
Sro1199_g251760.1 (Contig642.g7728)
 0.06 0.2 0.18 0.15 0.07 0.49 0.3 0.38 0.13 1.0 0.28 0.65 0.29 0.42 0.53 0.85 0.24 0.3 0.29 0.32 0.56 0.03 0.11 0.06 0.0 0.01 0.78
Sro1253_g256330.1 (Contig4693.g34900)
 0.0 0.06 0.15 0.02 0.0 0.65 0.09 0.17 0.06 1.0 0.35 0.74 0.16 0.65 0.41 0.26 0.18 0.44 0.99 0.88 0.44 0.0 0.07 0.04 0.0 0.02 0.8
Sro1253_g256340.1 (Contig4693.g34901)
 0.02 0.12 0.04 0.04 0.03 0.73 0.15 0.19 0.12 1.0 0.46 0.61 0.12 0.59 0.38 0.33 0.14 0.49 0.78 0.76 0.23 0.0 0.08 0.03 0.01 0.03 0.93
Sro1253_g256350.1 (Contig4693.g34902)
 0.01 0.74 0.32 0.21 0.19 0.79 0.38 0.31 0.2 1.0 0.44 0.56 0.1 0.58 0.68 0.32 0.21 0.56 0.86 0.92 0.26 0.03 0.16 0.08 0.01 0.05 0.99
Sro12_g009620.1 (Contig2293.g18982)
 0.05 1.0 0.2 0.31 0.42 0.32 0.18 0.33 0.16 0.42 0.19 0.3 0.22 0.22 0.3 0.47 0.2 0.2 0.27 0.37 0.05 0.06 0.11 0.03 0.01 0.07 0.55
Sro132_g062800.1 (Contig2745.g22123)
 0.01 0.22 0.23 0.09 0.21 0.28 0.19 0.22 0.2 0.53 0.2 0.62 0.31 0.41 0.36 0.58 0.05 0.63 1.0 0.5 0.48 0.24 0.09 0.1 0.03 0.11 0.43
Sro14_g010560.1 (Contig1128.g10805)
 0.02 0.03 0.05 0.04 0.05 0.2 0.45 0.25 0.27 0.68 0.97 0.53 0.54 0.43 0.62 0.67 0.58 0.34 0.74 1.0 0.68 0.09 0.14 0.36 0.83 0.46 0.68
Sro1550_g281690.1 (Contig2005.g17164)
 0.08 0.17 0.02 0.11 0.07 0.39 0.09 0.27 0.05 1.0 0.3 0.58 0.47 0.36 0.34 0.23 0.35 0.86 0.75 0.69 0.46 0.13 0.12 0.11 0.0 0.05 0.66
Sro1552_g281850.1 (Contig3671.g28368)
 0.0 1.0 0.46 0.74 0.71 0.34 0.43 0.33 0.14 0.66 0.08 0.44 0.44 0.22 0.58 0.65 0.11 0.56 0.48 0.36 0.27 0.0 0.14 0.16 0.15 0.21 0.61
Sro156_g070700.1 (Contig473.g6408)
 0.01 0.22 0.17 0.13 0.07 0.73 0.42 0.33 0.24 0.83 0.47 1.0 0.44 0.66 0.52 0.4 0.24 0.54 0.7 0.68 0.43 0.24 0.16 0.33 0.47 0.34 0.81
Sro1658_g289170.1 (Contig4672.g34735)
 0.0 0.18 0.29 0.11 0.07 0.27 0.08 0.05 0.0 0.49 0.16 0.31 0.06 0.19 0.22 0.34 0.22 0.51 1.0 0.28 0.21 0.0 0.02 0.04 0.01 0.0 0.43
Sro1660_g289320.1 (Contig4018.g30906)
 0.02 0.24 0.2 0.15 0.12 0.61 0.29 0.25 0.1 1.0 0.43 0.79 0.57 0.53 0.41 0.74 0.13 0.48 0.64 0.52 0.6 0.02 0.05 0.11 0.08 0.09 0.87
Sro177_g077680.1 (Contig795.g8894)
 0.03 0.73 0.34 0.3 0.51 0.53 0.76 0.53 0.32 0.67 0.36 0.58 0.08 0.39 0.67 1.0 0.4 0.59 0.48 0.18 0.29 0.03 0.21 0.2 0.15 0.17 0.86
Sro1947_g307170.1 (Contig4111.g31368)
 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.04 0.13 0.05 0.01 0.43 0.15 0.43 0.52 0.32 0.31 1.0 0.02 0.21 0.31 0.34 0.56 0.03 0.01 0.09 0.26 0.08 0.15
Sro19_g013480.1 (Contig446.g6012)
 0.07 0.03 0.02 0.03 0.04 0.03 0.06 0.02 0.01 0.33 0.07 0.27 0.78 0.17 0.37 1.0 0.02 0.44 0.52 0.44 0.32 0.04 0.02 0.02 0.0 0.03 0.17
Sro200_g084820.1 (Contig201.g2373)
 0.01 0.18 0.16 0.14 0.06 0.75 0.4 0.15 0.06 1.0 0.49 0.85 0.31 0.59 0.43 0.4 0.29 0.22 0.4 0.31 0.63 0.03 0.05 0.28 0.17 0.17 0.82
0.01 0.38 0.13 0.27 0.13 0.99 0.49 0.48 0.43 0.95 0.64 0.39 0.28 0.69 0.93 0.6 0.19 0.25 0.52 0.59 0.31 0.1 0.19 0.23 0.0 0.37 1.0
Sro203_g085720.1 (Contig1270.g11866)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.07 0.24 0.09 0.29 0.47 0.29 0.27 1.0 0.01 0.24 0.31 0.39 0.33 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.06
Sro2049_g312540.1 (Contig754.g8570)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.0 0.17 0.02 0.14 0.04 0.14 0.16 1.0 0.04 0.22 0.23 0.05 0.08 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.06
0.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.02 0.02 0.41 0.06 0.23 0.23 0.32 0.21 1.0 0.07 0.15 0.25 0.22 0.44 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.07
Sro245_g097410.1 (Contig3087.g24612)
 0.03 0.1 0.02 0.06 0.03 0.39 0.15 0.14 0.11 0.96 0.49 0.54 1.0 0.69 0.4 0.86 0.44 0.41 0.56 0.71 0.59 0.2 0.07 0.07 0.07 0.24 0.76
Sro25_g016690.1 (Contig1417.g13008)
 0.03 0.39 0.41 0.33 0.32 0.25 0.2 0.18 0.19 0.72 1.0 0.95 0.5 0.43 0.52 0.44 0.31 0.25 0.43 0.49 0.71 0.11 0.14 0.25 0.08 0.27 0.75
Sro263_g102390.1 (Contig612.g7561)
 0.02 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.07 0.08 0.03 0.61 0.27 0.43 0.48 0.72 0.2 0.6 0.45 0.56 0.44 1.0 0.41 0.18 0.01 0.06 0.12 0.17 0.42
Sro269_g103970.1 (Contig1337.g12318)
 0.01 0.03 0.0 0.02 0.01 0.17 0.32 0.15 0.2 0.9 0.35 0.39 0.42 0.15 0.24 0.52 0.33 0.83 0.5 0.66 0.41 0.2 0.11 0.31 0.86 0.38 1.0
Sro280_g107070.1 (Contig1076.g10467)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.11 0.0 0.06 0.78 0.34 0.83 0.0 0.15 0.32 0.6 0.23 0.77 1.0 0.4 0.23 0.11 0.02 0.04 0.0 0.06 0.44
Sro280_g107080.1 (Contig1076.g10468)
 0.04 0.09 0.05 0.03 0.15 0.34 0.13 0.08 0.04 0.75 0.18 0.89 0.26 0.27 0.41 0.69 0.4 0.71 1.0 0.81 0.39 0.01 0.03 0.05 0.04 0.0 0.53
Sro309_g113860.1 (Contig3477.g26976)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0 0.25 0.04 0.1 0.21 0.11 0.19 1.0 0.01 0.16 0.16 0.2 0.22 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.05
Sro341_g121580.1 (Contig3952.g30290)
 0.14 0.01 0.01 0.01 0.0 0.08 0.16 0.1 0.06 0.44 0.15 0.46 1.0 0.3 0.36 0.86 0.11 0.4 0.41 0.34 0.36 0.02 0.04 0.05 0.04 0.04 0.29
Sro366_g127560.1 (Contig1993.g17065)
 0.04 0.06 0.02 0.03 0.02 0.2 0.15 0.14 0.11 0.27 0.17 0.3 1.0 0.13 0.19 0.26 0.06 0.2 0.23 0.46 0.17 0.04 0.11 0.06 0.03 0.07 0.33
Sro381_g130800.1 (Contig161.g1813)
 0.1 0.3 0.17 0.1 0.28 0.13 0.11 0.1 0.07 0.36 0.09 0.31 1.0 0.36 0.25 0.47 0.07 0.22 0.21 0.32 0.45 0.04 0.08 0.05 0.03 0.02 0.22
Sro407_g136730.1 (Contig2478.g20264)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.04 0.02 0.0 0.36 0.07 0.28 0.82 0.4 0.35 1.0 0.07 0.18 0.23 0.27 0.66 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.18
Sro428_g140890.1 (Contig2589.g21017)
 0.03 0.67 0.55 0.21 0.16 0.84 0.39 0.51 0.18 1.0 0.24 0.99 0.04 0.5 0.69 0.82 0.16 0.71 0.51 0.12 0.67 0.05 0.21 0.15 0.13 0.11 0.83
Sro466_g148810.1 (Contig1164.g11100)
 0.01 0.07 0.06 0.07 0.07 0.14 0.04 0.03 0.01 0.31 0.19 0.21 0.5 0.22 0.33 1.0 0.16 0.3 0.41 0.35 0.39 0.02 0.01 0.0 0.01 0.12 0.27
Sro471_g149800.1 (Contig458.g6193)
 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.05 0.02 0.0 1.0 0.41 0.44 0.34 0.31 0.26 0.0 0.0 0.27 0.32 0.21 0.19 0.0 0.02 0.15 0.0 0.2 0.93
Sro47_g027970.1 (Contig1172.g11190)
 0.0 0.13 0.15 0.21 0.19 0.05 0.06 0.04 0.02 0.3 0.08 0.22 0.59 0.18 0.27 1.0 0.07 0.3 0.28 0.2 0.18 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02 0.18
0.0 0.08 0.02 0.02 0.05 0.16 0.11 0.17 0.07 0.33 0.03 0.25 0.07 0.27 0.27 1.0 0.04 0.23 0.2 0.08 0.41 0.12 0.11 0.02 0.02 0.11 0.17
Sro49_g028510.1 (Contig2054.g17601)
 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.03 0.01 0.33 0.02 0.13 0.87 0.24 0.2 1.0 0.07 0.32 0.32 0.73 0.32 0.02 0.01 0.03 0.08 0.05 0.09
Sro4_g003370.1 (Contig3815.g29255)
 0.01 0.17 0.25 0.34 0.26 0.39 0.27 0.26 0.17 0.67 0.76 0.64 0.42 1.0 0.6 0.67 0.38 0.3 0.43 0.35 0.59 0.12 0.15 0.34 0.3 0.27 0.73
Sro507_g156540.1 (Contig4452.g33456)
 0.05 0.81 0.34 0.51 0.49 0.17 0.2 0.33 0.03 1.0 0.44 0.21 0.0 0.17 0.28 0.51 0.03 0.25 0.48 0.03 0.69 0.07 0.08 0.43 0.08 0.0 0.6
Sro50_g029110.1 (Contig297.g3899)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.16 0.08 0.24 0.02 0.38 0.5 0.29 0.23 1.0 0.09 0.23 0.23 0.26 0.35 0.03 0.02 0.08 0.02 0.02 0.1
Sro545_g163810.1 (Contig1180.g11224)
 0.04 0.28 0.04 0.17 0.11 0.05 0.17 0.18 0.08 0.6 0.58 0.57 1.0 0.85 0.34 0.42 0.48 0.4 0.33 0.49 0.52 0.03 0.06 0.19 0.07 0.19 0.47
Sro555_g165790.1 (Contig677.g7927)
 0.0 0.14 0.0 0.17 0.0 0.6 0.17 0.45 0.03 0.85 0.36 0.84 0.07 0.45 0.51 0.84 0.06 0.23 1.0 0.32 0.55 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.75
Sro605_g174320.1 (Contig514.g6798)
 0.01 0.14 0.12 0.1 0.09 0.69 0.47 0.53 0.13 0.84 0.74 1.0 0.62 0.78 0.7 0.99 0.93 0.46 0.46 0.89 0.49 0.14 0.13 0.39 0.29 0.4 0.74
Sro605_g174330.1 (Contig514.g6799)
 0.0 0.3 0.25 0.16 0.07 0.1 0.5 0.16 0.31 0.67 0.62 0.7 0.77 0.47 0.49 0.55 0.66 0.66 0.53 1.0 0.66 0.15 0.15 0.38 0.58 0.48 0.54
Sro652_g181700.1 (Contig2024.g17323)
 0.12 0.5 0.43 0.46 0.34 0.13 0.26 0.14 0.34 1.0 0.93 0.81 0.83 1.0 0.54 0.77 0.63 0.45 0.51 0.92 0.61 0.4 0.18 0.48 0.49 0.48 0.61
Sro652_g181770.1 (Contig2024.g17330)
 0.06 1.0 0.46 0.44 0.41 0.71 0.6 0.61 0.25 0.85 0.24 0.64 0.06 0.66 0.55 0.59 0.2 0.66 0.53 0.05 0.45 0.02 0.23 0.08 0.0 0.03 0.88
Sro809_g205640.1 (Contig3027.g24127)
 0.06 0.73 0.34 0.3 0.28 0.76 0.42 0.39 0.18 1.0 0.31 0.66 0.19 0.58 0.69 0.6 0.22 0.8 0.58 0.2 0.42 0.01 0.17 0.08 0.02 0.03 0.95
Sro896_g217350.1 (Contig3311.g25946)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.04 0.02 0.04 0.11 0.29 1.0 0.07 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01 0.04 0.01 0.09
Sro896_g217370.1 (Contig3311.g25948)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.0 0.0 0.21 0.17 0.06 0.0 0.43 0.33 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14
Sro923_g220720.1 (Contig4194.g31940)
 0.0 1.0 0.35 0.46 0.4 0.28 0.11 0.12 0.05 0.26 0.1 0.12 0.01 0.16 0.16 0.15 0.06 0.15 0.09 0.01 0.07 0.0 0.05 0.06 0.02 0.02 0.34
Sro97_g050110.1 (Contig689.g8065)
 0.12 0.54 0.47 0.2 0.24 0.13 0.25 0.15 0.16 0.5 0.43 0.43 0.47 0.21 0.58 1.0 0.38 0.42 0.36 0.25 0.42 0.15 0.21 0.27 0.38 0.1 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)