1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_312 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1071_g237970.1 (Contig1299.g12055)
 0.01 0.02 0.61 0.09 0.07 0.0 0.03 0.81 0.7 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.44 0.21 1.0 0.46 0.01
Sro107_g053910.1 (Contig1548.g14066)
 0.0 0.32 0.58 0.51 0.47 0.0 0.01 0.9 1.0 0.04 0.07 0.0 0.01 0.0 0.03 0.17 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.25 0.33 0.08 0.05 0.02 0.02
Sro10_g007950.1 (Contig1.g19)
 0.02 0.03 0.0 0.04 0.04 0.1 0.24 0.55 0.1 0.45 0.2 0.29 0.26 0.29 0.12 0.01 0.07 0.48 0.49 0.62 1.0 0.61 0.32 0.2 0.53 0.76 0.25
0.03 0.09 0.12 0.18 0.23 0.04 0.04 1.0 0.94 0.09 0.08 0.18 0.24 0.01 0.03 0.05 0.02 0.28 0.16 0.29 0.11 0.32 0.46 0.01 0.0 0.06 0.07
Sro128_g061230.1 (Contig1654.g14899)
 0.0 0.35 0.43 0.21 0.18 0.11 0.53 0.75 0.73 0.47 0.32 0.68 0.48 0.4 0.38 0.25 0.21 0.23 0.49 0.51 1.0 0.41 0.6 0.77 0.57 0.29 0.31
Sro1371_g267120.1 (Contig1338.g12342)
 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.14 1.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.45 0.17 0.03 0.01 0.0
Sro13_g009880.1 (Contig337.g4529)
 0.02 1.0 0.98 0.68 0.65 0.1 0.2 0.15 0.24 0.25 0.26 0.23 0.19 0.15 0.2 0.31 0.16 0.17 0.22 0.3 0.26 0.14 0.28 0.34 0.2 0.19 0.21
Sro1415_g270770.1 (Contig16.g138)
 0.24 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 1.0 0.85 0.06 0.0 0.12 0.0 0.01 0.03 0.04 0.01 0.29 0.06 0.03 0.13 0.53 0.26 0.08 0.36 0.33 0.04
Sro1472_g275510.1 (Contig2029.g17423)
 0.0 0.37 0.41 0.22 0.31 0.09 0.11 0.4 0.67 0.15 0.13 0.02 0.45 0.01 0.11 0.14 0.04 0.07 1.0 0.17 0.02 0.42 0.65 0.16 0.18 0.1 0.08
Sro149_g068400.1 (Contig259.g3208)
 0.0 0.58 1.0 0.76 0.64 0.16 0.37 0.31 0.43 0.24 0.32 0.29 0.1 0.13 0.31 0.59 0.4 0.23 0.21 0.18 0.18 0.32 0.46 0.33 0.17 0.22 0.26
Sro1514_g278930.1 (Contig2561.g20813)
 0.0 0.19 0.22 0.27 0.27 0.06 0.38 1.0 0.89 0.16 0.36 0.07 0.24 0.21 0.22 0.47 0.43 0.4 0.35 0.17 0.05 0.57 0.77 0.11 0.12 0.29 0.5
Sro1581_g283800.1 (Contig585.g7355)
 0.01 0.12 0.16 0.17 0.15 0.01 0.2 0.09 0.17 0.14 0.04 0.1 0.39 0.02 0.07 0.05 0.06 0.17 0.17 0.43 0.13 0.33 0.18 1.0 0.25 0.18 0.03
Sro1766_g296240.1 (Contig1953.g16784)
 0.0 0.64 0.76 0.52 0.65 0.0 0.02 0.93 1.0 0.07 0.29 0.01 0.01 0.0 0.06 0.08 0.01 0.4 0.13 0.01 0.0 0.22 0.74 0.11 0.27 0.34 0.04
Sro1795_g298000.1 (Contig2340.g19255)
 0.0 0.42 1.0 0.08 0.06 0.0 0.07 0.04 0.41 0.05 0.0 0.0 0.11 0.05 0.01 0.0 0.0 0.05 0.0 0.43 0.0 0.27 0.48 0.0 0.0 0.0 0.03
Sro1818_g299610.1 (Contig4294.g32426)
 0.0 0.13 0.19 0.08 0.1 0.15 0.23 0.45 0.39 0.09 0.2 0.05 0.12 0.03 0.09 0.11 0.07 0.25 0.13 0.07 0.13 0.17 0.36 1.0 0.52 0.23 0.14
Sro18_g013160.1 (Contig1351.g12476)
 0.0 0.09 0.29 0.2 0.12 0.07 0.02 1.0 0.86 0.02 0.09 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.14 0.01 0.03 0.0 0.0 0.18 0.52 0.04 0.04 0.1 0.03
Sro219_g090570.1 (Contig3313.g25997)
 0.0 0.15 0.29 0.13 0.12 0.13 0.46 0.63 0.6 0.08 0.11 0.06 0.05 0.06 0.08 0.06 0.16 0.05 0.06 0.06 0.15 0.32 0.54 1.0 0.66 0.53 0.07
Sro2290_g322160.1 (Contig3468.g26910)
 0.0 0.29 0.46 0.25 0.22 0.26 0.25 0.8 0.49 0.14 0.34 0.08 0.34 0.07 0.13 0.16 0.18 0.63 0.37 0.19 0.06 0.17 0.33 1.0 0.7 0.31 0.22
Sro2344_g324160.1 (Contig1082.g10518)
 0.01 1.0 0.59 0.43 0.55 0.15 0.33 0.27 0.64 0.47 0.43 0.56 0.36 0.35 0.37 0.41 0.28 0.19 0.34 0.43 0.57 0.65 0.49 0.41 0.49 0.2 0.28
0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.87 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.55 0.01 0.07 0.09 0.0
0.1 0.51 0.89 0.56 0.55 0.03 0.38 0.75 0.52 0.19 0.86 0.15 0.03 0.01 0.36 0.19 0.4 0.12 0.12 0.08 0.4 0.26 0.55 0.6 1.0 0.84 0.52
Sro310_g114060.1 (Contig2751.g22166)
 0.0 0.07 0.2 0.15 0.14 0.0 0.16 0.55 0.48 0.02 0.05 0.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.18 0.51 1.0 0.76 0.46 0.05
Sro3143_g344390.1 (Contig748.g8544)
 0.0 0.12 0.14 0.05 0.04 0.01 0.14 1.0 0.99 0.03 0.04 0.05 0.0 0.0 0.06 0.03 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.44 0.66 0.01 0.11 0.06 0.04
Sro321_g116730.1 (Contig56.g429)
 0.0 0.52 0.56 0.55 0.53 0.0 0.05 0.81 0.99 0.06 0.28 0.01 0.03 0.0 0.08 0.2 0.02 0.17 0.15 0.04 0.0 0.12 1.0 0.27 0.51 0.42 0.09
Sro3261_g345950.1 (Contig657.g7782)
 0.0 0.06 0.14 0.03 0.09 0.02 0.46 0.69 1.0 0.13 0.1 0.12 0.1 0.07 0.03 0.02 0.18 0.04 0.06 0.0 0.52 0.23 0.36 0.77 0.64 0.73 0.04
Sro326_g118110.1 (Contig1080.g10499)
 0.09 0.41 1.0 0.55 0.43 0.1 0.14 0.22 0.23 0.1 0.15 0.12 0.04 0.05 0.09 0.11 0.14 0.13 0.1 0.05 0.06 0.2 0.3 0.23 0.12 0.12 0.12
Sro360_g126200.1 (Contig4561.g34064)
 0.03 0.46 1.0 0.68 0.64 0.04 0.27 0.19 0.27 0.11 0.14 0.17 0.06 0.02 0.12 0.27 0.13 0.05 0.04 0.05 0.09 0.13 0.3 0.17 0.13 0.12 0.09
Sro3644_g349930.1 (Contig2696.g21745)
 0.0 1.0 0.97 0.39 0.73 0.0 0.11 0.46 0.82 0.09 0.04 0.0 0.18 0.0 0.02 0.02 0.14 0.25 0.1 0.44 0.02 0.37 0.77 0.0 0.01 0.02 0.05
Sro389_g132620.1 (Contig669.g7879)
 0.01 0.18 0.39 0.3 0.19 0.17 0.71 0.53 0.51 0.24 0.12 0.23 0.23 0.26 0.17 0.13 0.06 0.22 0.34 0.24 0.46 0.18 0.47 0.98 0.7 1.0 0.17
Sro47_g027890.1 (Contig1172.g11182)
 0.05 0.03 0.01 0.01 0.01 0.0 0.14 0.16 0.19 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.37 0.33 1.0 0.51 0.34 0.01
Sro48_g028250.1 (Contig1255.g11720)
 0.0 0.5 0.76 0.73 0.96 0.0 0.01 0.8 1.0 0.05 0.12 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.09 0.02 0.01 0.0 0.0 0.15 0.22 0.03 0.13 0.27 0.03
0.0 1.0 0.63 0.7 0.27 0.48 0.17 0.52 0.38 0.27 0.97 0.19 0.18 0.15 0.31 0.33 0.16 0.22 0.05 0.12 0.32 0.27 0.53 0.58 0.18 0.31 0.44
Sro520_g159120.1 (Contig2679.g21668)
 0.02 0.7 1.0 0.83 0.84 0.12 0.33 0.37 0.4 0.16 0.23 0.16 0.06 0.05 0.16 0.23 0.23 0.11 0.1 0.08 0.1 0.24 0.51 0.69 0.35 0.37 0.16
Sro525_g160210.1 (Contig3147.g24969)
 0.0 0.45 0.6 0.49 0.73 0.0 0.05 0.81 1.0 0.04 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.27 0.22 0.07 0.0 0.34 0.73 0.65 0.83 0.42 0.0
Sro534_g161780.1 (Contig3269.g25743)
 0.0 0.36 0.33 0.29 0.34 0.04 0.12 0.97 1.0 0.09 0.57 0.0 0.21 0.01 0.17 0.42 0.1 0.18 0.44 0.09 0.0 0.45 0.68 0.06 0.05 0.07 0.37
Sro537_g162370.1 (Contig1194.g11289)
 0.03 0.08 0.12 0.08 0.06 0.05 0.49 0.61 0.43 0.32 0.38 0.3 0.22 0.22 0.34 0.46 0.34 0.32 0.25 0.29 0.73 0.43 0.5 1.0 0.86 0.51 0.27
Sro554_g165580.1 (Contig3803.g29157)
 0.03 0.06 0.08 0.07 0.07 0.07 0.21 0.81 0.49 0.05 0.18 0.03 0.01 0.02 0.1 0.1 0.09 0.02 0.04 0.01 0.02 0.21 0.51 1.0 0.54 0.55 0.18
Sro572_g168720.1 (Contig1817.g16001)
 0.11 0.8 1.0 0.72 0.59 0.2 0.33 0.4 0.64 0.28 0.36 0.29 0.34 0.22 0.36 0.57 0.41 0.22 0.26 0.28 0.17 0.61 0.72 0.41 0.17 0.25 0.3
Sro5_g003940.1 (Contig4001.g30709)
 0.0 0.37 0.41 0.38 0.49 0.24 0.06 0.24 0.58 0.09 0.21 0.08 0.14 0.11 0.1 0.22 0.13 0.23 0.36 0.03 0.01 0.46 0.36 1.0 0.72 0.26 0.15
Sro614_g175700.1 (Contig1589.g14424)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.12 0.37 0.0 0.01 0.01 0.0
Sro709_g190910.1 (Contig1341.g12357)
 0.0 1.0 0.94 0.59 0.49 0.1 0.13 0.26 0.49 0.14 0.16 0.06 0.08 0.08 0.11 0.14 0.07 0.06 0.06 0.05 0.04 0.22 0.42 0.33 0.2 0.16 0.14
Sro709_g190920.1 (Contig1341.g12358)
 0.0 0.92 1.0 0.7 0.56 0.08 0.18 0.31 0.52 0.16 0.19 0.12 0.16 0.13 0.13 0.2 0.08 0.1 0.12 0.11 0.06 0.2 0.46 0.45 0.27 0.28 0.18
Sro730_g194090.1 (Contig80.g841)
 0.0 0.57 0.48 0.29 0.37 0.01 0.01 0.32 0.91 0.06 0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.06 0.0 0.05 0.09 0.1 0.0 0.15 1.0 0.25 0.42 0.41 0.03
Sro768_g199690.1 (Contig2130.g17974)
 0.03 0.82 1.0 0.86 0.66 0.14 0.3 0.27 0.41 0.39 0.36 0.42 0.21 0.22 0.36 0.38 0.29 0.16 0.36 0.52 0.42 0.35 0.32 0.49 0.48 0.37 0.3
Sro7_g006360.1 (Contig389.g5289)
 0.0 0.19 0.52 0.55 0.72 0.0 0.04 0.41 0.41 0.06 0.12 0.0 0.02 0.0 0.05 0.1 0.0 0.57 0.51 0.02 0.0 0.11 0.55 0.54 1.0 0.83 0.03
Sro879_g214910.1 (Contig3022.g24102)
 0.15 0.11 0.07 0.05 0.08 0.03 0.12 0.05 0.06 0.19 0.11 0.17 0.31 0.14 0.18 0.48 0.13 0.11 0.28 0.49 0.2 0.36 0.14 0.55 1.0 0.36 0.08
Sro8_g006850.1 (Contig89.g998)
 0.0 0.32 0.94 0.39 0.27 0.31 0.7 0.77 0.85 0.45 0.37 0.29 0.3 0.68 0.53 0.28 0.52 0.86 1.0 0.44 0.63 0.78 0.87 0.77 0.74 0.77 0.31
Sro91_g047600.1 (Contig190.g2211)
 0.02 0.14 0.12 0.05 0.09 0.04 0.15 0.17 0.19 0.1 0.09 0.06 0.03 0.03 0.09 0.07 0.08 0.01 0.03 0.04 0.13 0.5 0.16 1.0 0.28 0.26 0.1
Sro938_g222300.1 (Contig3860.g29711)
 0.0 0.46 0.5 0.27 0.39 0.04 0.39 0.56 0.97 0.08 0.1 0.05 0.16 0.0 0.06 0.05 0.1 0.58 0.19 0.11 0.11 0.33 1.0 0.12 0.17 0.12 0.06
Sro954_g224280.1 (Contig1658.g14940)
 0.01 1.0 0.86 0.49 0.63 0.05 0.07 0.14 0.32 0.17 0.12 0.18 0.06 0.08 0.13 0.15 0.13 0.08 0.08 0.08 0.11 0.14 0.3 0.12 0.04 0.06 0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)