Heatmap: Cluster_143 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1020_g232080.1 (Contig2444.g20008)
0.03 0.07 0.11 0.16 0.19 0.07 0.25 0.09 0.11 0.6 0.27 0.76 0.37 0.95 0.41 0.46 0.25 0.1 0.13 0.56 1.0 0.27 0.18 0.22 0.58 0.43 0.34
Sro1022_g232380.1 (Contig2862.g22952)
0.07 0.3 0.23 0.22 0.27 0.34 0.55 0.5 0.58 0.79 0.79 0.96 0.76 1.0 0.71 0.91 0.68 0.67 0.68 0.95 0.91 0.72 0.41 0.56 0.85 0.7 0.68
0.02 0.11 0.1 0.05 0.07 0.49 0.57 0.42 0.3 0.58 0.46 0.95 0.43 0.7 0.54 0.55 0.36 0.56 0.18 0.67 0.84 1.0 0.27 0.39 0.92 0.62 0.31
Sro1124_g243770.1 (Contig4358.g32835)
0.02 0.03 0.01 0.02 0.06 0.19 0.36 0.2 0.13 0.66 0.51 0.84 0.31 0.8 0.51 0.72 0.42 0.42 0.36 0.62 1.0 0.4 0.12 0.31 0.41 0.51 0.44
Sro113_g055980.1 (Contig4126.g31563)
0.05 0.17 0.16 0.18 0.17 0.19 0.4 0.23 0.22 0.65 0.51 0.83 0.73 0.68 0.54 0.6 0.47 0.41 0.39 1.0 0.84 0.45 0.26 0.35 0.55 0.45 0.43
Sro1159_g247610.1 (Contig4112.g31379)
0.01 0.21 0.45 0.37 0.3 0.22 0.23 0.15 0.12 0.63 0.31 0.65 0.45 0.81 0.41 0.62 0.32 0.32 0.49 0.66 1.0 0.18 0.13 0.26 0.49 0.56 0.38
Sro1170_g248760.1 (Contig3531.g27305)
0.05 0.22 0.14 0.13 0.17 0.15 0.35 0.26 0.24 0.67 0.42 0.94 0.41 1.0 0.49 0.63 0.5 0.36 0.47 0.68 0.92 0.47 0.3 0.44 0.87 0.72 0.42
Sro1177_g249450.1 (Contig1274.g11886)
0.01 0.07 0.06 0.12 0.14 0.1 0.43 0.24 0.14 0.68 0.38 0.99 0.61 0.83 0.41 0.6 0.26 0.33 0.42 0.79 1.0 0.33 0.2 0.28 0.71 0.61 0.43
Sro1179_g249620.1 (Contig1870.g16347)
0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.08 0.32 0.16 0.12 0.64 0.47 1.0 0.22 0.42 0.38 0.51 0.34 0.37 0.3 0.59 0.97 0.52 0.09 0.17 0.45 0.23 0.31
Sro1223_g253880.1 (Contig4600.g34350)
0.02 0.16 0.15 0.12 0.16 0.61 0.49 0.29 0.24 0.63 0.45 1.0 0.68 0.62 0.5 0.41 0.46 0.45 0.37 0.61 0.62 0.69 0.25 0.68 0.95 0.68 0.36
Sro1281_g258920.1 (Contig268.g3377)
0.0 0.06 0.06 0.03 0.06 0.16 0.19 0.12 0.09 0.49 0.26 0.63 0.46 0.64 0.33 0.27 0.35 0.18 0.23 0.45 1.0 0.21 0.1 0.16 0.37 0.17 0.29
Sro1303_g260960.1 (Contig1728.g15426)
0.01 0.04 0.08 0.02 0.03 0.11 0.21 0.14 0.11 0.56 0.31 0.73 0.48 1.0 0.36 0.5 0.29 0.16 0.31 0.74 0.82 0.49 0.15 0.38 0.58 0.49 0.42
Sro133_g062880.1 (Contig2274.g18847)
0.02 0.13 0.19 0.24 0.15 0.16 0.36 0.21 0.19 0.6 0.36 0.8 0.37 0.66 0.41 0.63 0.36 0.21 0.19 0.48 1.0 0.36 0.23 0.43 0.67 0.54 0.34
Sro133_g063150.1 (Contig2274.g18874)
0.01 0.12 0.14 0.13 0.09 0.38 0.37 0.21 0.12 0.64 0.39 0.77 0.47 0.75 0.48 0.5 0.32 0.49 0.56 0.72 1.0 0.37 0.11 0.56 0.93 0.58 0.37
Sro1389_g268530.1 (Contig3774.g28973)
0.01 0.05 0.04 0.08 0.06 0.15 0.36 0.19 0.16 0.59 0.53 0.73 0.62 0.73 0.46 0.5 0.49 0.33 0.45 0.72 0.93 0.38 0.14 0.46 1.0 0.6 0.46
Sro1401_g269390.1 (Contig1376.g12623)
0.22 0.16 0.28 0.26 0.17 0.36 0.24 0.18 0.26 0.64 0.59 0.91 1.0 0.9 0.42 0.63 0.39 0.32 0.44 0.76 0.79 0.54 0.21 0.26 0.46 0.29 0.31
Sro1436_g272430.1 (Contig4282.g32357)
0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.76 0.18 0.29 0.72 0.23 1.0 0.26 0.26 0.8 0.64 0.31 0.05 0.09 0.16 0.87 0.99 0.11 0.21 0.59 0.31 0.26
Sro1550_g281710.1 (Contig2005.g17166)
0.06 0.43 0.37 0.41 0.45 0.29 0.35 0.36 0.28 0.76 0.55 1.0 0.72 0.76 0.58 0.77 0.44 0.54 0.52 0.78 0.88 0.61 0.23 0.45 0.67 0.53 0.41
Sro169_g075070.1 (Contig4412.g33127)
0.05 0.19 0.21 0.17 0.16 0.2 0.62 0.38 0.34 0.77 0.53 1.0 0.39 0.81 0.52 0.59 0.39 0.44 0.61 0.6 0.99 0.7 0.34 0.5 0.92 0.75 0.42
Sro1721_g293520.1 (Contig2994.g23792)
0.0 0.15 0.06 0.06 0.16 0.11 0.34 0.15 0.3 0.56 0.42 0.73 0.89 0.63 0.37 0.53 0.36 0.4 0.68 0.79 1.0 0.47 0.3 0.34 0.49 0.5 0.37
Sro1741_g294670.1 (Contig4311.g32513)
0.1 0.35 0.2 0.19 0.24 0.3 0.36 0.15 0.13 0.62 0.3 1.0 0.19 0.61 0.38 0.38 0.31 0.17 0.48 0.38 0.7 0.63 0.22 0.63 0.83 0.55 0.27
Sro175_g076960.1 (Contig1856.g16212)
0.01 0.25 0.27 0.21 0.21 0.12 0.1 0.07 0.08 0.46 0.13 0.62 1.0 0.33 0.1 0.11 0.14 0.19 0.32 0.89 0.44 0.45 0.11 0.23 0.28 0.37 0.29
Sro181_g079030.1 (Contig4257.g32230)
0.01 0.05 0.07 0.06 0.09 0.13 0.28 0.11 0.19 0.57 0.35 1.0 0.79 0.29 0.38 0.5 0.26 0.23 0.34 0.81 0.71 0.64 0.16 0.25 0.55 0.33 0.33
Sro1863_g302320.1 (Contig1972.g16862)
0.0 0.08 0.09 0.13 0.11 0.3 0.34 0.23 0.22 0.7 0.44 0.9 0.66 0.99 0.53 0.65 0.51 0.41 0.38 0.86 1.0 0.25 0.2 0.28 0.47 0.47 0.53
Sro197_g083750.1 (Contig3509.g27180)
0.01 0.01 0.1 0.02 0.04 0.06 0.27 0.09 0.28 0.56 0.26 0.84 0.58 0.82 0.28 0.3 0.17 0.14 0.33 0.74 1.0 0.38 0.09 0.26 0.71 0.54 0.41
Sro199_g084330.1 (Contig257.g3171)
0.02 0.05 0.04 0.01 0.01 0.05 0.12 0.09 0.03 0.58 0.11 0.83 0.06 0.43 0.09 0.11 0.23 0.02 0.47 0.33 1.0 0.34 0.07 0.16 0.55 0.31 0.17
Sro2010_g310800.1 (Contig3241.g25608)
0.0 0.05 0.03 0.01 0.03 0.38 0.22 0.12 0.05 0.56 0.13 1.0 0.25 0.56 0.21 0.07 0.17 0.54 0.35 0.75 0.55 0.81 0.07 0.42 0.56 0.52 0.19
Sro218_g090080.1 (Contig1136.g10909)
0.05 0.05 0.07 0.04 0.06 0.18 0.33 0.29 0.19 0.66 0.42 0.92 0.46 0.77 0.45 0.66 0.43 0.41 0.44 0.68 1.0 0.32 0.16 0.34 0.59 0.62 0.46
Sro2249_g320750.1 (Contig1963.g16820)
0.03 0.14 0.06 0.04 0.09 0.26 0.31 0.19 0.14 0.65 0.55 1.0 0.57 0.75 0.55 0.87 0.49 0.42 0.46 0.76 0.92 0.37 0.18 0.42 0.65 0.41 0.43
Sro226_g092030.1 (Contig565.g7175)
0.01 0.18 0.23 0.18 0.17 0.2 0.44 0.35 0.26 0.66 0.49 0.9 0.4 0.65 0.52 0.68 0.48 0.33 0.47 0.59 1.0 0.5 0.27 0.42 0.82 0.46 0.42
Sro229_g093040.1 (Contig429.g5808)
0.75 0.22 0.16 0.19 0.22 0.12 0.59 0.33 0.35 0.76 0.33 1.0 0.28 0.36 0.38 0.52 0.19 0.35 0.48 0.37 0.88 0.48 0.26 0.4 0.93 0.39 0.41
Sro2563_g331380.1 (Contig869.g9421)
0.0 0.13 0.07 0.07 0.06 0.15 0.44 0.25 0.18 0.52 0.43 0.53 0.53 0.62 0.45 0.55 0.3 0.28 0.28 0.6 0.8 0.41 0.21 0.43 1.0 0.6 0.34
Sro25_g017190.1 (Contig1417.g13058)
0.0 0.2 0.12 0.24 0.23 0.09 0.38 0.11 0.25 0.62 0.33 0.69 0.56 0.9 0.42 0.57 0.5 0.27 0.41 0.67 1.0 0.46 0.25 0.28 0.47 0.32 0.47
Sro25_g017220.1 (Contig1417.g13061)
0.01 0.13 0.13 0.18 0.16 0.05 0.3 0.21 0.17 0.59 0.37 0.71 0.44 1.0 0.44 0.64 0.5 0.23 0.35 0.75 0.76 0.27 0.14 0.33 0.64 0.54 0.46
Sro268_g103680.1 (Contig1776.g15717)
0.0 0.12 0.07 0.06 0.06 0.14 0.4 0.17 0.12 0.44 0.37 0.55 0.47 0.54 0.42 0.43 0.21 0.23 0.27 0.53 0.82 0.24 0.15 0.5 1.0 0.6 0.31
Sro279_g106690.1 (Contig3140.g24908)
0.01 0.07 0.04 0.07 0.1 0.17 0.51 0.32 0.23 0.66 0.47 1.0 0.46 0.98 0.53 0.74 0.45 0.29 0.23 0.61 0.97 0.44 0.27 0.56 0.83 0.71 0.44
Sro281_g107310.1 (Contig3786.g29070)
0.01 0.24 0.07 0.24 0.2 0.15 0.46 0.14 0.05 0.65 0.33 0.86 0.6 0.35 0.23 0.05 0.25 0.37 0.57 0.92 1.0 0.87 0.3 0.59 0.71 0.62 0.2
Sro2862_g338840.1 (Contig2547.g20737)
0.04 0.18 0.1 0.17 0.12 0.3 0.35 0.23 0.21 0.68 0.54 0.83 0.57 1.0 0.56 0.74 0.64 0.32 0.56 0.85 0.77 0.62 0.29 0.39 0.53 0.54 0.51
Sro30_g019900.1 (Contig3962.g30390)
0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.18 0.37 0.26 0.17 0.51 0.31 0.45 0.84 0.62 0.48 0.69 0.24 0.29 0.29 0.95 0.85 0.35 0.13 0.35 1.0 0.49 0.27
Sro3351_g347090.1 (Contig3507.g27172)
0.01 0.05 0.02 0.03 0.06 0.12 0.35 0.23 0.15 0.62 0.46 0.85 0.51 0.81 0.47 0.58 0.4 0.4 0.38 0.75 1.0 0.41 0.2 0.4 0.61 0.58 0.44
Sro353_g124480.1 (Contig1923.g16582)
0.02 0.15 0.11 0.06 0.15 0.29 0.37 0.21 0.25 0.69 0.57 0.95 0.61 1.0 0.57 0.83 0.43 0.31 0.44 0.67 0.87 0.46 0.23 0.42 0.53 0.56 0.52
Sro371_g128510.1 (Contig736.g8429)
0.01 0.09 0.08 0.07 0.09 0.27 0.54 0.29 0.26 0.66 0.41 1.0 0.71 0.86 0.49 0.78 0.4 0.37 0.44 1.0 0.94 0.42 0.27 0.47 0.63 0.38 0.39
Sro404_g135980.1 (Contig4176.g31858)
0.0 0.15 0.07 0.12 0.16 0.08 0.28 0.04 0.16 0.56 0.27 0.72 0.37 0.92 0.22 0.37 0.35 0.16 0.43 0.62 1.0 0.38 0.13 0.25 0.29 0.6 0.49
Sro408_g136880.1 (Contig3193.g25223)
0.0 0.06 0.04 0.03 0.02 0.13 0.26 0.11 0.12 0.48 0.22 0.51 0.65 1.0 0.3 0.46 0.2 0.19 0.24 0.79 0.83 0.29 0.08 0.26 0.68 0.31 0.23
Sro434_g142100.1 (Contig783.g8767)
0.25 0.31 0.26 0.32 0.3 0.31 0.41 0.3 0.38 0.73 0.57 0.87 0.76 0.66 0.57 0.65 0.62 0.65 0.94 1.0 1.0 0.64 0.4 0.62 0.65 0.53 0.4
Sro448_g145230.1 (Contig3664.g28298)
0.2 0.08 0.04 0.08 0.06 0.07 0.25 0.15 0.07 0.46 0.21 0.58 0.43 0.44 0.26 0.41 0.21 0.2 0.25 0.42 1.0 0.33 0.12 0.21 0.34 0.23 0.17
Sro44_g026490.1 (Contig358.g4818)
0.02 0.16 0.13 0.14 0.16 0.1 0.32 0.17 0.12 0.6 0.35 0.81 0.54 0.77 0.46 0.62 0.45 0.25 0.32 0.49 1.0 0.4 0.16 0.32 0.73 0.41 0.3
Sro461_g147670.1 (Contig3552.g27421)
0.0 0.02 0.0 0.02 0.03 0.06 0.3 0.12 0.1 0.5 0.24 0.67 0.34 0.73 0.38 0.57 0.29 0.34 0.31 0.74 0.74 0.19 0.07 0.41 1.0 0.58 0.32
Sro461_g147880.1 (Contig3552.g27442)
0.06 0.05 0.03 0.03 0.04 0.21 0.5 0.32 0.27 0.75 0.46 0.91 0.48 0.63 0.52 0.54 0.34 0.46 0.56 0.84 1.0 0.66 0.38 0.37 0.68 0.54 0.41
Sro47_g027780.1 (Contig1172.g11171)
0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.03 0.05 0.04 0.06 0.31 0.07 0.43 0.46 0.45 0.06 0.05 0.12 0.07 0.13 1.0 0.62 0.31 0.09 0.06 0.11 0.21 0.13
Sro529_g161030.1 (Contig4737.g35125)
0.02 0.13 0.08 0.08 0.09 0.21 0.42 0.21 0.34 0.65 0.74 0.99 0.65 1.0 0.58 0.81 0.69 0.43 0.47 0.69 0.93 0.5 0.28 0.41 0.31 0.45 0.4
Sro543_g163490.1 (Contig1245.g11635)
0.05 0.04 0.04 0.06 0.08 0.07 0.39 0.13 0.15 0.69 0.46 1.0 0.28 0.87 0.42 0.63 0.42 0.29 0.46 0.64 0.83 0.47 0.12 0.4 0.6 0.5 0.39
Sro549_g164570.1 (Contig1749.g15562)
0.03 0.16 0.21 0.23 0.19 0.09 0.32 0.2 0.22 0.69 0.41 0.85 0.8 0.91 0.38 0.53 0.42 0.25 0.51 0.87 1.0 0.48 0.21 0.36 0.84 0.5 0.4
Sro585_g171030.1 (Contig3766.g28927)
0.02 0.24 0.26 0.13 0.14 0.14 0.42 0.32 0.32 0.65 0.38 0.73 0.61 0.84 0.44 0.62 0.34 0.44 0.62 0.8 1.0 0.56 0.35 0.47 0.62 0.46 0.4
Sro604_g174160.1 (Contig2463.g20170)
0.0 0.05 0.07 0.05 0.06 0.11 0.26 0.17 0.18 0.55 0.4 0.66 0.71 1.0 0.45 0.71 0.52 0.31 0.41 0.65 0.82 0.47 0.21 0.29 0.42 0.59 0.43
Sro668_g184390.1 (Contig3161.g25044)
0.03 0.08 0.05 0.07 0.05 0.36 0.44 0.23 0.19 0.79 0.48 1.0 0.73 0.76 0.48 0.67 0.42 0.24 0.4 0.78 0.87 0.68 0.21 0.35 0.52 0.45 0.37
Sro66_g037210.1 (Contig399.g5391)
0.0 0.09 0.09 0.0 0.04 0.08 0.41 0.13 0.12 0.63 0.13 0.84 0.52 0.48 0.22 0.62 0.47 0.25 0.71 1.0 0.82 0.78 0.08 0.35 0.67 0.42 0.42
Sro720_g192600.1 (Contig2421.g19821)
0.0 0.04 0.02 0.03 0.02 0.12 0.19 0.14 0.06 0.45 0.22 1.0 0.22 0.75 0.36 0.25 0.21 0.33 0.17 0.37 0.53 0.39 0.14 0.38 0.49 0.46 0.14
Sro734_g194700.1 (Contig3769.g28948)
0.02 0.4 0.32 0.34 0.36 0.29 0.48 0.3 0.36 0.74 0.49 1.0 0.72 0.91 0.53 0.74 0.58 0.42 0.58 0.89 0.86 0.69 0.37 0.48 0.73 0.68 0.5
Sro803_g204780.1 (Contig386.g5192)
0.02 0.1 0.07 0.1 0.1 0.17 0.23 0.17 0.08 0.68 0.34 0.98 0.44 1.0 0.32 0.32 0.34 0.37 0.43 0.62 0.86 0.57 0.15 0.29 0.6 0.54 0.33
Sro80_g043130.1 (Contig92.g1057)
0.05 0.1 0.04 0.1 0.07 0.3 0.52 0.35 0.35 0.8 0.37 1.0 0.78 0.69 0.53 0.5 0.31 0.48 0.31 0.72 0.79 0.62 0.27 0.31 0.4 0.25 0.3
Sro839_g209300.1 (Contig1990.g17037)
0.03 0.06 0.05 0.04 0.05 0.12 0.28 0.16 0.07 0.58 0.44 0.76 0.66 1.0 0.47 0.66 0.58 0.28 0.29 0.81 0.73 0.46 0.15 0.25 0.39 0.39 0.41
Sro83_g044200.1 (Contig4450.g33394)
0.03 0.17 0.15 0.16 0.17 0.31 0.47 0.32 0.26 0.73 0.61 0.96 0.9 1.0 0.55 0.68 0.59 0.45 0.63 1.0 0.94 0.73 0.37 0.53 0.66 0.62 0.52
Sro84_g045000.1 (Contig220.g2633)
0.01 0.07 0.02 0.06 0.06 0.1 0.47 0.36 0.29 0.63 0.46 0.77 0.42 0.63 0.53 0.44 0.3 0.86 0.78 1.0 0.75 1.0 0.29 0.38 0.85 0.53 0.35
Sro889_g216640.1 (Contig1913.g16529)
0.08 0.09 0.07 0.06 0.08 0.17 0.45 0.34 0.29 0.7 0.67 0.93 0.9 0.33 0.53 0.61 0.31 0.52 0.66 0.75 0.89 0.79 0.33 0.49 1.0 0.7 0.48
Sro91_g047660.1 (Contig190.g2217)
0.08 0.19 0.17 0.18 0.2 0.3 0.43 0.26 0.26 0.73 0.42 0.97 0.64 1.0 0.54 0.74 0.48 0.29 0.44 0.67 0.95 0.53 0.32 0.45 0.74 0.63 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)