Heatmap: Cluster_143 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1020_g232080.1 (Contig2444.g20008)
0.42 0.9 1.35 1.93 2.32 0.88 3.06 1.06 1.36 7.4 3.25 9.36 4.5 11.69 5.05 5.6 3.1 1.28 1.64 6.89 12.25 3.34 2.17 2.73 7.13 5.31 4.13
Sro1022_g232380.1 (Contig2862.g22952)
2.87 12.51 9.62 9.21 11.04 13.82 22.74 20.73 23.98 32.27 32.33 39.57 31.41 41.09 29.3 37.23 27.85 27.69 27.96 39.22 37.31 29.53 16.91 22.86 34.82 28.82 27.99
0.41 2.28 1.98 0.93 1.51 9.87 11.51 8.5 6.05 11.67 9.31 19.27 8.59 14.1 10.96 11.14 7.17 11.2 3.62 13.62 16.96 20.18 5.49 7.93 18.6 12.55 6.33
Sro1124_g243770.1 (Contig4358.g32835)
0.82 0.88 0.36 0.79 1.92 6.43 12.02 6.63 4.33 22.29 17.36 28.25 10.43 26.96 17.17 24.21 14.36 14.09 12.15 21.02 33.83 13.57 4.1 10.63 13.9 17.22 14.82
Sro113_g055980.1 (Contig4126.g31563)
1.27 4.92 4.6 4.95 4.67 5.47 11.27 6.54 6.11 18.2 14.4 23.25 20.45 19.27 15.1 16.93 13.11 11.49 11.04 28.18 23.77 12.8 7.3 9.76 15.46 12.77 11.98
Sro1159_g247610.1 (Contig4112.g31379)
0.3 8.88 18.95 15.4 12.51 9.28 9.64 6.44 5.11 26.24 12.91 27.09 19.05 33.78 17.09 25.94 13.34 13.44 20.73 27.67 41.89 7.35 5.39 10.86 20.58 23.5 16.03
Sro1170_g248760.1 (Contig3531.g27305)
2.77 12.67 7.86 7.26 9.52 8.84 19.98 15.08 13.59 38.26 23.88 53.96 23.71 57.36 28.15 36.09 28.76 20.65 26.99 39.28 52.68 27.04 16.94 25.1 49.77 41.04 24.13
Sro1177_g249450.1 (Contig1274.g11886)
0.47 3.64 2.92 5.98 6.8 4.64 20.76 11.62 6.88 33.0 18.64 48.29 29.85 40.3 19.92 29.4 12.81 15.94 20.46 38.44 48.63 15.83 9.74 13.43 34.61 29.81 20.71
Sro1179_g249620.1 (Contig1870.g16347)
0.51 0.22 0.47 0.15 0.2 1.44 5.52 2.74 2.09 11.16 8.09 17.36 3.84 7.28 6.56 8.91 5.85 6.5 5.15 10.23 16.81 8.96 1.58 3.03 7.74 3.95 5.43
Sro1223_g253880.1 (Contig4600.g34350)
0.97 7.78 7.38 5.58 7.71 28.91 23.51 13.95 11.33 30.23 21.62 47.71 32.23 29.76 23.82 19.64 21.96 21.51 17.59 28.94 29.54 32.99 11.75 32.37 45.48 32.46 17.35
Sro1281_g258920.1 (Contig268.g3377)
0.04 0.77 0.7 0.37 0.71 2.06 2.42 1.57 1.12 6.15 3.33 7.98 5.75 8.14 4.15 3.41 4.36 2.28 2.84 5.64 12.64 2.68 1.21 2.08 4.68 2.19 3.65
Sro1303_g260960.1 (Contig1728.g15426)
0.33 0.81 1.83 0.5 0.63 2.44 4.7 3.24 2.44 12.86 7.0 16.62 10.85 22.8 8.29 11.29 6.54 3.69 7.03 16.87 18.8 11.26 3.33 8.6 13.25 11.16 9.59
Sro133_g062880.1 (Contig2274.g18847)
0.8 5.66 8.06 10.14 6.39 6.97 15.4 9.17 8.34 25.51 15.49 34.3 16.06 28.45 17.77 26.87 15.4 8.92 8.22 20.63 42.86 15.24 10.07 18.25 28.71 23.07 14.44
Sro133_g063150.1 (Contig2274.g18874)
0.42 6.68 8.16 7.19 4.97 21.41 21.18 11.97 6.72 35.96 22.29 43.35 26.49 42.38 27.23 28.5 17.97 27.64 31.42 40.45 56.52 20.97 6.41 31.57 52.35 32.98 21.09
Sro1389_g268530.1 (Contig3774.g28973)
0.25 2.3 1.68 3.59 2.61 6.69 16.25 8.59 7.0 26.75 23.8 32.68 28.0 32.78 20.75 22.6 21.99 15.06 20.39 32.26 41.64 17.05 6.11 20.68 44.96 27.02 20.7
Sro1401_g269390.1 (Contig1376.g12623)
3.29 2.45 4.21 3.97 2.53 5.47 3.59 2.66 3.93 9.76 8.95 13.72 15.14 13.59 6.35 9.5 5.97 4.86 6.61 11.45 12.03 8.2 3.11 3.91 6.95 4.36 4.62
Sro1436_g272430.1 (Contig4282.g32357)
0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.95 0.23 0.37 0.91 0.29 1.26 0.33 0.33 1.01 0.81 0.39 0.07 0.12 0.2 1.09 1.24 0.14 0.26 0.75 0.38 0.33
Sro1550_g281710.1 (Contig2005.g17166)
4.81 35.16 30.57 33.91 36.77 23.62 28.99 29.88 22.59 61.89 45.25 81.95 59.09 62.27 47.52 62.95 36.46 44.0 42.35 64.17 71.86 49.93 19.19 36.56 55.24 43.36 33.85
Sro169_g075070.1 (Contig4412.g33127)
5.97 20.93 23.53 18.4 17.51 21.66 67.47 41.58 37.64 84.13 57.86 109.49 42.89 89.09 57.22 64.85 42.77 48.51 66.33 65.8 108.46 76.88 37.34 54.5 100.67 81.58 46.4
Sro1721_g293520.1 (Contig2994.g23792)
0.06 3.51 1.47 1.44 3.66 2.59 7.84 3.53 6.92 12.91 9.84 16.87 20.75 14.66 8.53 12.29 8.37 9.37 15.78 18.43 23.2 10.91 7.06 7.85 11.32 11.61 8.49
Sro1741_g294670.1 (Contig4311.g32513)
8.61 29.52 16.72 15.83 20.1 25.15 30.11 12.92 11.33 52.62 25.49 84.56 16.44 51.34 32.03 32.35 26.63 14.16 40.48 31.92 59.06 52.89 18.5 53.18 70.17 46.13 23.14
Sro175_g076960.1 (Contig1856.g16212)
0.06 2.74 2.97 2.3 2.32 1.37 1.15 0.73 0.86 5.02 1.47 6.86 11.0 3.68 1.13 1.22 1.51 2.13 3.57 9.78 4.81 4.97 1.16 2.48 3.03 4.12 3.2
Sro181_g079030.1 (Contig4257.g32230)
0.15 0.88 1.24 0.92 1.55 2.22 4.71 1.85 3.14 9.48 5.73 16.56 13.1 4.82 6.28 8.35 4.34 3.84 5.66 13.36 11.83 10.66 2.68 4.07 9.15 5.46 5.52
Sro1863_g302320.1 (Contig1972.g16862)
0.34 6.79 7.24 10.58 9.08 24.65 27.96 18.94 18.57 57.75 36.2 74.77 54.48 82.24 43.92 53.53 42.21 34.24 31.44 70.87 82.74 20.37 16.95 23.27 39.12 38.61 44.21
Sro197_g083750.1 (Contig3509.g27180)
0.07 0.15 1.32 0.26 0.54 0.79 3.74 1.24 3.87 7.65 3.53 11.52 7.87 11.16 3.83 4.11 2.31 1.85 4.53 10.1 13.68 5.16 1.24 3.57 9.76 7.35 5.65
Sro199_g084330.1 (Contig257.g3171)
0.11 0.35 0.27 0.06 0.1 0.35 0.9 0.63 0.25 4.24 0.79 6.09 0.41 3.15 0.64 0.79 1.67 0.11 3.44 2.41 7.32 2.48 0.51 1.18 4.0 2.29 1.27
Sro2010_g310800.1 (Contig3241.g25608)
0.0 1.78 1.13 0.47 0.89 13.25 7.69 4.2 1.9 19.52 4.52 35.09 8.68 19.52 7.33 2.37 5.83 18.97 12.26 26.17 19.4 28.37 2.41 14.71 19.63 18.28 6.55
Sro218_g090080.1 (Contig1136.g10909)
3.1 2.89 4.25 2.7 3.35 10.82 19.78 17.46 11.3 39.56 25.49 55.13 27.65 46.04 26.8 39.44 25.95 24.5 26.23 41.04 60.18 19.27 9.56 20.64 35.56 37.23 27.44
Sro2249_g320750.1 (Contig1963.g16820)
2.79 11.3 4.59 3.6 7.08 21.37 25.36 15.04 11.07 53.15 44.65 81.18 46.46 61.13 44.37 70.7 39.57 33.89 37.71 61.55 74.87 29.97 14.82 34.41 53.02 32.95 35.14
Sro226_g092030.1 (Contig565.g7175)
0.67 9.19 11.43 9.18 8.62 10.06 21.85 17.47 12.9 33.13 24.57 44.86 20.2 32.64 25.96 34.08 24.2 16.57 23.74 29.68 50.09 25.13 13.34 20.97 41.21 22.95 21.27
Sro229_g093040.1 (Contig429.g5808)
86.89 25.95 18.87 22.36 25.81 14.23 68.11 38.31 40.75 88.15 38.06 115.56 32.16 42.1 43.64 59.83 22.46 40.35 55.37 43.21 101.75 55.72 29.67 46.62 107.79 45.14 47.66
Sro2563_g331380.1 (Contig869.g9421)
0.27 14.89 7.9 7.95 7.24 17.2 48.91 27.56 20.32 57.98 47.91 59.75 58.97 69.18 50.62 61.79 33.96 31.88 30.91 66.86 89.5 45.95 23.32 48.23 112.2 67.27 37.84
Sro25_g017190.1 (Contig1417.g13058)
0.06 6.75 4.19 8.33 8.04 3.04 13.18 3.75 8.6 21.55 11.55 23.89 19.53 31.05 14.44 19.67 17.18 9.3 14.15 23.03 34.58 15.9 8.64 9.66 16.15 11.18 16.18
Sro25_g017220.1 (Contig1417.g13061)
0.7 6.91 6.96 9.7 8.94 2.74 16.58 11.69 9.6 32.3 20.03 39.13 23.91 54.84 23.98 35.34 27.67 12.85 19.32 41.39 41.72 14.8 7.58 17.94 34.91 29.64 25.34
Sro268_g103680.1 (Contig1776.g15717)
0.32 8.07 4.89 4.12 3.91 9.32 27.34 11.81 7.83 29.9 25.18 37.07 31.74 36.56 28.82 29.1 14.17 15.36 18.19 35.73 55.52 16.36 10.28 34.01 67.97 40.92 21.02
Sro279_g106690.1 (Contig3140.g24908)
0.46 2.22 1.25 2.41 3.29 5.5 16.52 10.52 7.37 21.47 15.29 32.53 15.09 31.74 17.29 24.02 14.65 9.59 7.36 19.83 31.58 14.33 8.67 18.06 26.94 23.07 14.29
Sro281_g107310.1 (Contig3786.g29070)
0.05 1.03 0.3 1.02 0.85 0.62 1.95 0.6 0.22 2.79 1.42 3.69 2.55 1.48 0.99 0.2 1.06 1.59 2.42 3.95 4.27 3.71 1.28 2.54 3.03 2.65 0.86
Sro2862_g338840.1 (Contig2547.g20737)
1.52 6.75 3.7 6.38 4.38 11.09 12.79 8.33 7.56 24.75 19.76 30.25 20.83 36.48 20.49 27.05 23.19 11.77 20.27 31.14 28.1 22.48 10.72 14.06 19.41 19.74 18.47
Sro30_g019900.1 (Contig3962.g30390)
0.35 0.24 0.12 0.12 0.07 2.63 5.43 3.77 2.54 7.45 4.56 6.63 12.34 9.05 7.05 10.12 3.44 4.26 4.25 13.95 12.39 5.18 1.89 5.06 14.63 7.22 3.89
Sro3351_g347090.1 (Contig3507.g27172)
0.15 0.67 0.29 0.44 0.82 1.61 4.61 3.04 1.98 8.01 5.94 11.04 6.6 10.5 6.11 7.49 5.26 5.14 5.01 9.73 13.01 5.4 2.59 5.24 7.88 7.59 5.78
Sro353_g124480.1 (Contig1923.g16582)
0.68 4.41 3.17 1.93 4.38 8.53 11.02 6.39 7.59 20.62 17.1 28.2 18.15 29.79 17.12 24.62 12.86 9.37 13.18 19.96 25.94 13.78 6.77 12.61 15.87 16.76 15.57
Sro371_g128510.1 (Contig736.g8429)
0.37 2.18 1.95 1.71 2.26 6.85 13.73 7.26 6.59 16.67 10.54 25.42 18.01 21.97 12.35 19.95 10.26 9.35 11.18 25.37 24.0 10.57 6.88 11.86 16.12 9.63 9.9
Sro404_g135980.1 (Contig4176.g31858)
0.0 1.66 0.75 1.37 1.71 0.93 3.13 0.45 1.76 6.16 2.93 7.98 4.12 10.14 2.4 4.03 3.83 1.75 4.7 6.86 11.01 4.2 1.48 2.77 3.19 6.56 5.43
Sro408_g136880.1 (Contig3193.g25223)
0.03 0.6 0.34 0.29 0.18 1.2 2.47 1.04 1.1 4.55 2.1 4.82 6.16 9.45 2.85 4.38 1.87 1.84 2.29 7.42 7.81 2.74 0.75 2.44 6.4 2.9 2.21
Sro434_g142100.1 (Contig783.g8767)
4.62 5.77 4.84 5.96 5.54 5.71 7.62 5.54 7.05 13.52 10.64 16.17 14.18 12.38 10.7 12.04 11.58 12.11 17.6 18.65 18.59 11.99 7.48 11.55 12.17 9.96 7.45
Sro448_g145230.1 (Contig3664.g28298)
6.54 2.61 1.15 2.68 2.07 2.15 8.23 4.92 2.34 14.87 6.63 18.58 13.92 14.36 8.29 13.32 6.93 6.54 8.17 13.57 32.29 10.74 3.94 6.68 11.14 7.44 5.45
Sro44_g026490.1 (Contig358.g4818)
1.32 10.64 9.14 9.83 11.11 7.0 22.17 12.0 8.38 41.23 23.69 55.34 37.07 52.84 31.53 42.29 30.53 17.43 22.16 33.36 68.57 27.5 11.23 21.79 49.82 27.98 20.48
Sro461_g147670.1 (Contig3552.g27421)
0.26 1.25 0.14 1.13 1.39 3.08 16.13 6.35 5.61 27.1 13.03 36.08 18.58 39.7 20.54 30.69 15.68 18.65 17.06 40.0 39.9 10.16 3.57 22.4 54.16 31.36 17.35
Sro461_g147880.1 (Contig3552.g27442)
6.04 4.84 3.32 3.49 4.18 21.02 50.03 31.75 26.73 74.42 46.21 90.85 48.23 62.79 51.75 54.02 33.48 45.42 55.39 83.34 99.76 65.57 38.21 36.9 68.27 53.46 40.49
Sro47_g027780.1 (Contig1172.g11171)
0.12 0.41 0.32 0.12 0.18 0.4 0.7 0.53 0.87 4.41 0.99 6.19 6.69 6.46 0.86 0.77 1.76 0.96 1.85 14.39 8.96 4.52 1.31 0.9 1.56 3.09 1.9
Sro529_g161030.1 (Contig4737.g35125)
0.23 1.69 0.98 0.98 1.13 2.71 5.37 2.73 4.31 8.42 9.59 12.78 8.42 12.87 7.53 10.39 8.86 5.53 6.1 8.89 11.95 6.44 3.56 5.24 4.02 5.81 5.11
Sro543_g163490.1 (Contig1245.g11635)
1.31 1.1 1.03 1.66 2.07 1.8 10.27 3.43 3.99 18.09 11.92 26.16 7.27 22.86 10.95 16.54 11.1 7.51 11.93 16.74 21.65 12.22 3.24 10.42 15.59 13.21 10.27
Sro549_g164570.1 (Contig1749.g15562)
0.62 3.88 5.17 5.59 4.54 2.12 7.79 4.88 5.4 16.77 9.99 20.77 19.37 22.11 9.24 12.83 10.15 6.0 12.41 21.15 24.35 11.74 5.17 8.78 20.35 12.22 9.66
Sro585_g171030.1 (Contig3766.g28927)
1.63 16.74 17.68 8.8 10.03 9.42 29.2 22.29 22.09 44.99 25.99 50.63 42.06 58.24 30.58 42.84 23.4 30.12 42.6 55.56 69.23 38.82 23.93 32.59 43.21 31.82 27.95
Sro604_g174160.1 (Contig2463.g20170)
0.12 1.37 1.92 1.54 1.74 3.19 7.36 4.94 5.2 15.55 11.44 18.78 20.13 28.38 12.85 20.26 14.76 8.8 11.74 18.5 23.21 13.22 5.92 8.21 12.06 16.87 12.18
Sro668_g184390.1 (Contig3161.g25044)
0.61 1.42 0.86 1.24 0.86 6.43 7.72 4.02 3.31 14.0 8.49 17.66 12.92 13.35 8.4 11.85 7.36 4.26 7.01 13.82 15.41 12.01 3.62 6.17 9.14 7.87 6.56
Sro66_g037210.1 (Contig399.g5391)
0.0 0.83 0.83 0.0 0.39 0.77 3.8 1.17 1.11 5.86 1.24 7.86 4.88 4.44 2.03 5.75 4.42 2.31 6.58 9.32 7.64 7.31 0.72 3.28 6.2 3.9 3.9
Sro720_g192600.1 (Contig2421.g19821)
0.2 2.16 1.04 1.22 0.75 6.09 9.19 6.92 3.03 22.02 10.51 48.78 10.77 36.58 17.51 12.42 10.31 16.07 8.36 17.93 25.94 19.11 6.76 18.74 23.94 22.22 6.9
Sro734_g194700.1 (Contig3769.g28948)
0.81 13.09 10.59 11.02 11.7 9.51 15.88 9.96 11.92 24.37 16.05 32.8 23.66 29.72 17.4 24.37 18.99 13.77 18.91 29.24 28.13 22.75 12.28 15.67 23.86 22.39 16.46
Sro803_g204780.1 (Contig386.g5192)
0.2 1.15 0.86 1.13 1.21 2.02 2.73 2.06 0.99 8.06 4.11 11.73 5.21 11.94 3.78 3.85 4.09 4.46 5.15 7.4 10.31 6.77 1.76 3.43 7.21 6.49 3.94
Sro80_g043130.1 (Contig92.g1057)
3.43 7.07 3.0 7.06 5.01 20.08 35.08 23.73 23.44 53.94 25.2 67.71 52.9 46.43 35.9 33.52 20.93 32.25 20.99 49.09 53.82 41.97 18.44 21.09 27.03 17.22 20.07
Sro839_g209300.1 (Contig1990.g17037)
0.52 1.23 0.99 0.69 1.0 2.29 5.47 3.07 1.35 11.07 8.39 14.63 12.63 19.22 8.95 12.73 11.07 5.39 5.59 15.64 13.95 8.83 2.8 4.85 7.53 7.45 7.85
Sro83_g044200.1 (Contig4450.g33394)
1.3 7.12 6.4 6.83 7.37 13.47 19.94 13.57 11.21 31.2 26.12 41.28 38.49 42.77 23.42 29.03 25.11 19.42 27.06 42.83 40.33 31.42 15.66 22.78 28.24 26.65 22.42
Sro84_g045000.1 (Contig220.g2633)
0.15 1.01 0.3 0.83 0.81 1.5 6.87 5.34 4.25 9.34 6.71 11.41 6.18 9.32 7.84 6.46 4.47 12.67 11.53 14.69 11.02 14.74 4.31 5.59 12.47 7.76 5.22
Sro889_g216640.1 (Contig1913.g16529)
1.23 1.49 1.14 0.98 1.2 2.71 7.02 5.3 4.62 10.96 10.53 14.64 14.19 5.19 8.42 9.54 4.89 8.22 10.45 11.81 13.94 12.44 5.19 7.75 15.73 11.08 7.54
Sro91_g047660.1 (Contig190.g2217)
4.13 9.53 8.42 8.93 9.96 15.27 21.73 13.24 12.9 36.66 21.34 49.08 32.21 50.47 27.09 37.44 24.1 14.47 22.0 33.77 48.14 26.89 16.18 22.9 37.3 31.8 23.61

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)