1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_57 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1028_g233170.1 (Contig2198.g18310)
 0.28 5.98 6.28 5.19 3.18 4.2 12.18 9.65 4.57 11.6 14.58 10.12 10.43 4.36 10.89 13.84 11.68 42.46 22.67 31.69 8.71 5.12 3.46 10.43 8.23 8.12 12.8
Sro1068_g237540.1 (Contig852.g9373)
 0.0 0.89 1.49 0.72 0.31 4.97 5.23 2.1 0.41 4.95 1.69 6.41 7.26 2.76 3.07 2.24 2.39 4.22 5.32 9.34 10.48 0.82 0.58 4.64 12.87 6.19 3.44
Sro1106_g242040.1 (Contig673.g7899)
 0.09 1.75 1.29 0.52 0.38 1.09 1.56 0.78 0.43 3.57 2.94 2.93 10.9 1.58 4.86 3.39 1.2 10.95 8.67 21.23 4.75 4.23 1.13 3.74 5.95 4.94 4.58
Sro1127_g244150.1 (Contig3424.g26682)
 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.02 0.01 0.17 0.0 0.07 0.03 0.0 0.07 0.0 0.05 0.0 0.14 0.14 0.33 0.49 0.12 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01
Sro1136_g245220.1 (Contig1812.g15974)
 0.16 4.88 3.53 3.19 2.67 10.41 10.73 5.6 2.05 9.92 8.58 8.38 3.45 4.07 7.14 1.45 8.76 8.28 14.03 10.76 12.28 2.16 1.04 20.14 36.52 28.21 9.63
Sro119_g058240.1 (Contig2194.g18297)
 0.06 0.32 0.73 2.12 0.58 0.44 3.55 0.65 0.34 2.05 2.15 1.27 0.69 0.13 2.48 0.87 0.99 2.17 1.17 2.72 3.77 0.08 0.17 2.64 5.78 5.24 2.56
Sro128_g061020.1 (Contig1654.g14878)
 0.04 2.86 0.82 1.54 1.31 2.88 2.41 0.5 0.54 5.07 3.58 6.21 8.6 6.17 5.42 3.22 3.83 3.22 3.26 6.23 7.28 0.83 0.58 2.64 3.34 0.95 2.59
Sro138_g064870.1 (Contig2021.g17309)
 26.81 5.98 8.04 6.19 4.34 0.84 4.14 1.98 2.4 5.54 3.24 3.67 13.33 1.67 3.22 3.08 2.86 7.74 14.44 14.76 7.6 1.3 1.61 14.55 19.95 7.02 2.14
Sro138_g064880.1 (Contig2021.g17310)
 199.22 15.89 20.15 24.76 14.71 22.41 32.47 23.89 15.46 58.28 70.58 35.76 149.65 38.44 92.83 88.71 41.55 106.82 153.32 152.79 50.11 10.64 10.18 90.48 61.5 35.21 58.79
Sro1456_g274250.1 (Contig1061.g10401)
 0.09 3.85 2.87 3.78 1.91 0.44 3.12 3.82 0.81 2.89 1.79 2.89 3.12 0.3 1.47 2.7 3.45 7.71 8.79 9.49 3.45 0.19 0.57 1.89 2.79 1.89 2.37
Sro1473_g275580.1 (Contig4548.g33989)
 0.0 0.51 0.12 0.08 0.0 0.12 0.89 1.19 0.0 0.84 0.11 0.76 1.96 0.06 0.49 0.07 0.04 1.13 1.93 4.36 1.96 0.11 0.0 0.85 2.58 1.21 0.69
Sro1478_g276040.1 (Contig2375.g19518)
 0.08 0.08 0.12 0.06 0.11 2.26 2.78 1.07 0.0 2.51 1.19 1.96 0.25 0.85 2.01 0.86 0.68 3.68 2.3 2.66 2.78 0.12 0.01 4.13 5.08 6.48 2.22
Sro147_g067970.1 (Contig246.g3020)
 9.66 1.48 1.33 2.69 0.92 4.8 3.92 5.28 2.14 4.92 4.54 5.02 9.11 4.42 5.16 6.13 4.23 4.67 9.15 9.34 6.71 1.78 0.87 5.32 7.49 3.52 4.95
Sro154_g070180.1 (Contig2716.g21896)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.53 0.59 0.39 0.55 0.3 0.31 0.54 0.0 0.83 0.65 0.32 1.2 0.91 0.38 0.81 0.06 0.0 0.87 2.16 2.22 0.55
0.0 0.26 0.07 0.2 0.0 0.09 0.62 0.24 0.23 1.06 0.67 0.85 0.66 0.16 1.03 0.55 0.87 0.94 0.52 2.54 1.77 0.17 0.04 0.75 1.54 0.03 0.75
Sro1583_g283960.1 (Contig2117.g17915)
 0.89 15.52 7.81 14.92 11.82 5.04 9.51 13.25 16.87 11.49 13.85 7.76 6.3 2.64 12.16 20.26 6.74 28.03 33.32 8.4 6.79 11.38 9.39 39.08 66.89 60.71 17.73
Sro1633_g287420.1 (Contig361.g4868)
 0.0 0.17 0.15 0.07 0.06 0.05 0.67 0.44 0.03 0.69 0.38 0.32 1.47 0.04 0.49 0.49 0.24 1.57 0.82 4.12 1.1 0.0 0.01 2.21 2.73 1.4 0.67
Sro1653_g288840.1 (Contig3957.g30320)
 5.51 0.61 0.78 0.35 0.37 0.43 3.79 2.46 0.83 3.73 2.25 2.93 14.82 1.38 2.57 2.2 1.2 9.37 9.02 20.4 3.8 0.42 0.88 8.27 8.71 3.5 1.44
Sro1737_g294420.1 (Contig996.g10061)
 0.03 0.0 0.0 0.12 0.09 0.33 1.39 0.54 0.41 1.2 0.57 0.61 1.06 0.08 0.9 1.23 0.23 2.18 1.31 1.92 1.84 1.03 0.21 1.27 3.09 1.86 0.8
Sro184_g079970.1 (Contig2216.g18400)
 0.13 4.02 2.57 1.21 0.33 6.07 7.58 4.09 1.42 5.47 3.85 7.05 6.19 5.38 4.6 1.29 1.13 1.89 5.43 11.48 6.77 0.86 0.96 6.52 17.13 4.73 1.44
Sro19_g013710.1 (Contig446.g6035)
 10.16 0.82 1.43 0.78 0.52 0.38 0.94 0.68 0.16 3.15 2.13 2.49 13.36 2.61 2.01 1.56 1.88 9.68 7.86 12.84 3.98 0.14 0.27 7.73 7.02 3.24 1.38
Sro2041_g312220.1 (Contig4209.g32024)
 0.15 0.63 0.59 0.96 0.78 1.72 3.21 1.66 3.38 5.98 3.76 6.12 5.98 6.67 5.99 5.41 4.2 8.13 7.62 6.75 8.27 1.9 1.39 3.57 5.69 3.75 4.24
19.36 7.23 4.78 6.42 5.49 5.32 9.49 8.1 7.38 14.94 14.03 15.02 31.64 11.23 13.72 18.22 10.84 17.51 18.97 38.35 14.9 15.0 6.51 7.31 13.34 8.07 11.27
2.67 2.23 3.04 0.5 1.04 2.33 18.66 17.86 10.04 17.88 16.68 21.59 23.52 8.14 15.2 20.54 5.57 57.81 58.51 48.28 35.8 6.44 4.17 41.58 105.81 49.38 14.66
Sro2541_g330670.1 (Contig3297.g25883)
 0.0 0.55 0.25 0.36 0.24 0.71 1.5 1.68 1.35 1.24 2.49 1.26 3.7 1.73 1.7 1.85 0.73 0.86 1.78 2.28 1.45 0.39 0.4 1.09 1.9 0.94 1.43
Sro2628_g333000.1 (Contig928.g9707)
 0.59 0.83 0.87 1.11 0.32 0.08 2.17 7.93 2.18 4.41 4.1 2.71 6.32 1.26 5.39 7.39 2.69 10.79 9.97 12.09 6.65 1.31 1.63 4.48 5.07 3.44 3.38
Sro269_g104140.1 (Contig1337.g12335)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.2 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.22 0.0
Sro279_g106900.1 (Contig3140.g24929)
 0.07 0.13 0.2 0.0 0.0 0.08 0.86 0.71 0.04 0.91 0.72 0.38 1.41 0.03 0.55 0.17 0.53 1.81 1.26 2.53 1.38 0.14 0.02 0.61 1.65 0.96 0.74
Sro282_g107540.1 (Contig1420.g13097)
 0.48 4.15 2.62 1.38 1.34 11.49 12.97 7.48 1.7 13.07 15.68 11.72 3.79 7.08 13.55 9.99 13.04 11.05 14.06 10.47 23.97 11.1 2.9 24.58 27.53 21.24 13.47
Sro29_g019130.1 (Contig1384.g12756)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.3 0.45 0.04 0.66 0.12 0.14 2.1 0.0 0.41 0.87 0.08 1.77 0.78 3.34 0.91 0.0 0.08 0.39 1.93 1.34 0.19
Sro33_g021240.1 (Contig2613.g21145)
 0.0 0.0 0.1 0.1 0.07 0.02 1.25 0.51 0.48 0.7 0.4 0.14 1.68 0.0 0.65 0.84 0.02 1.55 1.41 2.13 1.41 0.05 0.13 1.64 2.06 2.28 0.29
Sro33_g021500.1 (Contig2613.g21171)
 0.02 0.43 0.48 0.19 0.22 0.13 1.52 0.48 0.23 2.08 2.38 0.78 3.03 0.03 1.36 1.34 0.45 8.78 10.33 9.84 2.98 0.01 0.06 4.13 7.01 4.1 2.57
Sro34_g021810.1 (Contig4590.g34284)
 0.06 0.93 0.79 0.93 0.61 0.26 1.9 2.27 1.45 2.98 3.35 2.14 3.49 1.97 3.72 4.21 2.24 5.27 4.44 5.92 4.09 1.39 0.47 1.74 3.34 2.27 2.7
Sro3673_g350160.1 (Contig3183.g25139)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.21 0.01 0.84 0.31 0.48 1.0 0.07 0.41 0.16 0.08 1.39 0.53 0.82 1.09 0.0 0.02 0.82 1.19 0.92 0.14
0.0 0.23 0.49 0.26 0.13 0.0 0.02 0.43 0.11 0.17 0.0 0.12 0.19 0.0 0.08 0.0 0.22 0.36 0.95 1.35 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.1
Sro375_g129530.1 (Contig4478.g33654)
 1.23 9.48 6.08 15.95 6.91 26.51 43.47 22.43 17.73 25.63 40.72 16.52 5.28 3.99 41.93 51.99 30.14 27.47 81.44 48.44 22.86 18.14 34.14 92.75 88.2 73.89 52.03
Sro3989_g352350.1 (Contig2642.g21382)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.07 0.04 0.15 0.09 0.02 0.98 0.0 0.24 0.22 0.23 0.49 0.74 1.89 0.1 0.0 0.07 0.45 0.24 0.32 0.23
Sro4117_g352980.1 (Contig1432.g13204)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 2.1 0.28 0.02 1.47 0.53 1.0 1.39 0.31 1.39 1.5 0.51 2.23 1.0 2.05 2.72 0.12 0.05 1.41 2.28 2.11 1.21
Sro425_g140120.1 (Contig3537.g27357)
 0.04 1.42 0.47 0.41 0.12 0.27 1.61 0.29 0.15 2.35 1.01 1.85 0.67 0.1 2.72 1.32 1.21 3.17 5.18 5.24 4.23 0.16 0.2 0.53 1.56 1.02 2.41
Sro430_g141270.1 (Contig4379.g32921)
 1.18 0.93 0.57 0.56 1.79 0.0 2.75 2.89 3.87 1.71 3.92 1.54 3.98 0.14 1.78 2.13 0.48 2.69 3.55 11.78 1.39 0.78 2.15 3.32 2.83 0.89 1.2
Sro430_g141280.1 (Contig4379.g32922)
 1.01 0.29 0.25 0.23 0.13 0.09 1.88 1.61 1.34 1.28 2.28 0.98 3.54 0.22 1.19 1.46 0.91 1.81 1.83 7.22 1.12 0.48 0.76 2.06 1.67 0.82 0.9
Sro453_g146250.1 (Contig1693.g15182)
 0.17 1.16 2.53 0.61 0.99 16.51 15.34 7.59 3.87 9.87 17.59 6.75 1.03 2.81 11.67 7.76 13.52 11.14 8.75 8.26 17.09 12.17 3.33 23.24 42.78 23.31 15.54
Sro526_g160430.1 (Contig842.g9288)
 0.0 0.13 0.12 0.0 0.0 0.5 2.15 6.53 3.53 1.98 4.64 0.73 8.35 0.56 5.63 7.62 4.01 4.37 1.98 10.83 3.25 0.69 0.53 1.13 6.12 4.15 5.04
Sro54_g031720.1 (Contig2430.g19860)
 0.43 1.8 2.2 3.76 0.55 22.78 21.1 13.77 2.4 23.42 32.48 7.5 3.36 1.26 29.28 28.66 24.67 24.26 26.98 39.36 20.89 11.09 7.37 54.3 88.93 62.42 48.99
Sro54_g031730.1 (Contig2430.g19861)
 0.33 1.48 1.72 1.39 0.7 9.88 8.27 3.5 4.32 11.27 12.96 6.2 8.73 1.87 12.63 11.82 9.72 6.44 20.57 31.6 12.83 8.54 5.39 16.29 22.64 17.9 17.96
Sro607_g174600.1 (Contig3533.g27318)
 0.04 0.25 0.25 0.22 0.05 0.07 0.88 1.77 1.14 0.73 1.51 0.28 3.9 0.01 1.31 1.27 0.42 2.1 2.55 7.99 0.62 0.19 0.59 1.94 1.98 1.24 1.1
Sro633_g178800.1 (Contig1591.g14452)
 44.91 9.58 9.93 8.7 7.99 11.72 11.73 11.34 8.38 18.68 19.79 26.74 53.61 11.14 18.29 17.58 7.56 25.06 31.63 61.34 13.67 7.94 6.05 13.9 8.01 4.55 17.22
Sro660_g182990.1 (Contig1196.g11304)
 0.04 0.56 0.42 0.44 0.4 2.76 2.16 1.42 1.18 2.62 3.36 2.35 2.59 3.06 2.38 1.99 0.96 3.26 6.25 5.92 2.8 1.51 1.01 4.55 3.5 3.25 3.02
Sro742_g195870.1 (Contig1214.g11403)
 0.0 0.32 0.24 0.04 0.04 0.36 0.99 0.79 1.04 0.85 1.0 0.62 1.13 0.21 1.92 2.57 0.33 1.45 0.68 1.73 0.77 0.16 0.08 1.22 1.57 0.91 1.25
Sro747_g196530.1 (Contig4185.g31901)
 0.03 0.05 0.0 0.05 0.14 0.11 0.48 0.06 0.07 0.37 0.5 0.35 1.31 0.22 0.43 0.55 0.25 0.79 0.8 1.74 0.47 0.12 0.06 0.53 0.41 0.53 0.36
Sro779_g201290.1 (Contig4354.g32819)
 0.81 6.15 3.16 2.74 5.44 3.59 19.08 25.25 6.15 15.96 34.74 15.46 20.69 2.86 14.58 6.39 17.69 35.36 41.52 29.4 21.12 6.94 5.32 27.89 60.88 27.26 14.12
Sro857_g211680.1 (Contig1150.g11006)
 10.35 0.57 0.93 1.15 0.85 2.81 1.6 1.73 1.55 4.08 5.74 2.41 12.4 2.87 4.27 2.86 3.71 6.7 11.45 16.18 6.03 2.06 1.5 4.18 3.33 2.71 2.78
Sro915_g219660.1 (Contig3226.g25516)
 7.82 1.04 0.54 0.74 0.8 0.31 0.81 0.99 1.31 2.12 0.69 1.65 8.79 0.86 1.27 0.87 0.55 3.02 5.16 9.18 2.57 0.63 0.38 2.24 4.34 1.83 0.87
Sro96_g049490.1 (Contig3763.g28875)
 0.17 0.07 0.1 0.0 0.1 0.46 0.49 0.62 0.39 0.73 0.72 0.55 1.38 0.34 0.6 0.82 1.24 0.47 0.68 2.87 1.15 0.35 0.1 0.78 2.74 0.8 0.62
0.03 0.05 0.29 0.11 0.12 0.1 0.3 0.3 0.32 0.5 0.77 0.38 2.01 0.14 0.79 0.72 0.62 1.21 1.28 3.65 0.45 0.39 0.2 0.38 0.39 0.42 0.63
Sro9_g007620.1 (Contig4120.g31530)
 0.0 1.1 1.28 0.3 0.54 0.0 1.25 0.48 0.09 1.61 1.71 0.56 5.87 0.6 1.93 1.33 0.31 3.31 4.48 4.17 3.08 0.67 0.08 2.16 4.92 4.26 1.05

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)