Heatmap: Cluster_323 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1009_g230760.1 (Contig1546.g14041)
0.11 0.0 0.27 0.0 0.17 0.0 0.0 0.04 0.05 0.53 0.0 0.99 0.76 1.0 0.11 0.46 0.24 0.2 0.22 0.63 0.84 0.0 0.07 0.21 0.62 0.09 0.08
Sro1041_g234580.1 (Contig1456.g13343)
0.0 0.55 0.51 0.4 0.37 0.06 0.14 0.13 0.03 0.22 0.21 0.25 0.24 0.07 0.07 0.05 0.08 0.51 0.67 0.32 0.25 0.03 0.02 0.37 1.0 0.46 0.14
Sro1063_g237040.1 (Contig4044.g31055)
0.04 0.02 0.07 0.05 0.07 0.03 0.12 0.11 0.1 0.28 0.2 0.21 0.45 0.16 0.16 0.21 0.08 0.7 1.0 0.59 0.48 0.03 0.06 0.22 0.65 0.51 0.22
0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.19 0.05 0.0 0.0 0.22 0.0 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro114_g056210.1 (Contig1482.g13521)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.62 0.83 1.0 0.85 0.06 0.5 0.2 0.1 0.28 0.34 0.21 0.07 0.02 0.14 0.23 0.08 0.58 0.99 0.37 0.56 0.06 0.05 0.21 0.09 0.0 0.22
Sro1176_g249290.1 (Contig4140.g31633)
0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.17 0.03 0.02 0.13 0.12 0.07 0.5 0.06 0.19 0.17 0.01 0.13 0.08 0.49 0.13 0.0 0.01 0.38 1.0 0.5 0.11
Sro123_g059370.1 (Contig66.g626)
0.0 0.37 0.24 0.37 0.19 0.07 0.19 0.1 0.1 0.21 0.2 0.23 0.42 0.18 0.18 0.22 0.11 0.17 0.21 0.44 0.35 0.04 0.03 0.38 1.0 0.55 0.13
Sro1263_g257270.1 (Contig245.g2993)
0.01 0.33 0.34 0.17 0.22 0.22 0.47 0.3 0.16 0.37 0.25 0.37 0.06 0.19 0.36 0.46 0.3 0.39 0.45 0.15 0.4 0.06 0.19 0.4 1.0 0.76 0.46
Sro130_g061850.1 (Contig2611.g21108)
0.1 0.2 0.09 0.1 0.13 0.02 0.04 0.06 0.0 0.13 0.25 0.04 0.55 0.06 0.21 0.29 0.32 0.12 0.08 0.59 0.16 0.0 0.0 0.86 1.0 0.35 0.15
Sro134_g063620.1 (Contig145.g1624)
0.02 0.48 0.66 0.41 0.42 0.11 0.39 0.25 0.27 0.31 0.4 0.22 0.58 0.25 0.33 0.31 0.26 0.68 1.0 0.72 0.34 0.25 0.34 0.61 0.7 0.41 0.24
Sro1383_g267970.1 (Contig1647.g14856)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1449_g273640.1 (Contig2836.g22754)
0.23 0.1 0.12 0.11 0.1 0.09 0.1 0.07 0.04 0.22 0.15 0.22 0.38 0.04 0.19 0.35 0.12 1.0 0.59 0.48 0.38 0.01 0.02 0.28 0.8 0.37 0.1
Sro1494_g277370.1 (Contig4003.g30800)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1574_g283520.1 (Contig1885.g16433)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1641_g287970.1 (Contig17.g139)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1734_g294310.1 (Contig3416.g26634)
0.02 0.27 0.66 0.01 0.02 0.02 0.19 0.03 0.17 0.31 0.11 0.41 0.69 0.22 0.18 0.22 0.15 0.61 1.0 0.78 0.61 0.09 0.06 0.32 0.29 0.42 0.14
Sro1756_g295620.1 (Contig4362.g32865)
0.02 0.22 0.14 0.11 0.14 0.01 0.19 0.17 0.1 0.13 0.06 0.07 0.18 0.08 0.09 0.06 0.05 0.44 0.25 0.21 0.2 0.08 0.12 0.52 1.0 0.7 0.04
Sro1874_g302990.1 (Contig3840.g29508)
0.0 0.27 0.53 0.56 0.52 0.24 0.31 0.22 0.16 0.4 0.3 0.36 0.57 0.24 0.31 0.2 0.13 0.57 1.0 0.9 0.54 0.11 0.09 0.68 0.86 0.46 0.24
Sro189_g081620.1 (Contig744.g8526)
0.12 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.07 0.11 0.06 0.07 0.02 0.01 0.58 0.0 0.01 0.0 0.0 0.62 0.53 0.5 0.09 0.01 0.02 0.18 1.0 0.6 0.01
Sro1960_g308040.1 (Contig1426.g13171)
0.02 0.64 1.0 0.34 0.54 0.0 0.23 0.05 0.04 0.26 0.04 0.22 0.17 0.04 0.04 0.02 0.01 0.62 0.83 0.23 0.56 0.02 0.02 0.24 0.06 0.06 0.03
Sro196_g083530.1 (Contig3206.g25349)
0.0 0.27 0.31 0.19 0.21 0.03 0.14 0.06 0.07 0.18 0.43 0.07 0.42 0.08 0.29 0.4 0.19 0.24 0.25 0.37 0.22 0.09 0.06 0.35 1.0 0.62 0.25
Sro1984_g309390.1 (Contig3609.g27887)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.04 0.04 0.33 0.27 0.09 0.71 1.0 0.6 0.09 0.37 0.0 0.0 0.6 0.32 0.0 0.21 0.54 0.0 0.1 0.16
Sro198_g084120.1 (Contig2317.g19132)
0.08 0.11 0.12 0.18 0.18 0.11 0.21 0.32 0.09 0.24 0.45 0.2 0.35 0.13 0.25 0.15 0.17 0.26 0.31 0.46 0.21 0.12 0.05 0.65 1.0 0.36 0.16
Sro201_g084990.1 (Contig2914.g23168)
0.0 0.18 0.42 0.31 0.48 0.17 0.32 0.25 0.23 0.38 0.43 0.27 0.21 0.05 0.31 0.42 0.25 1.0 0.89 0.39 0.52 0.08 0.08 0.69 0.8 0.5 0.39
Sro207_g086760.1 (Contig755.g8579)
0.01 0.2 0.19 0.2 0.12 0.19 0.45 0.37 0.22 0.52 0.46 0.47 0.57 0.27 0.68 0.82 0.3 0.41 0.47 0.79 0.83 0.07 0.12 0.55 1.0 0.52 0.59
Sro2119_g315360.1 (Contig2006.g17173)
0.01 0.27 0.12 0.23 0.32 0.6 0.65 0.47 0.5 0.37 0.45 0.33 0.83 0.56 0.65 0.39 0.51 0.99 0.61 0.43 0.22 0.25 0.39 1.0 0.71 0.4 0.33
0.0 0.45 0.59 0.24 0.27 0.0 0.21 0.27 0.21 0.33 0.52 0.21 0.16 0.02 0.25 0.61 0.3 0.28 0.26 0.56 0.17 0.09 0.1 0.65 1.0 0.46 0.32
0.0 0.3 0.29 0.33 0.23 0.06 0.12 0.08 0.0 0.14 0.29 0.04 0.43 0.1 0.25 0.31 0.31 0.29 0.26 0.45 0.04 0.0 0.02 0.63 1.0 0.62 0.15
Sro2253_g320920.1 (Contig1189.g11263)
0.08 0.27 0.32 0.16 0.24 0.15 0.27 0.41 0.32 0.34 0.36 0.47 0.57 0.77 0.29 0.2 0.24 0.34 0.44 0.27 0.29 0.45 0.4 1.0 0.57 0.24 0.23
Sro231_g093610.1 (Contig3051.g24274)
0.16 0.28 0.25 0.48 0.25 0.12 0.29 0.17 0.2 0.35 0.37 0.35 0.79 0.28 0.45 0.44 0.35 0.55 0.31 0.9 0.46 0.1 0.17 0.5 1.0 0.54 0.17
Sro2402_g326330.1 (Contig2895.g23077)
0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.25 0.61 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2443_g327830.1 (Contig4167.g31800)
0.01 0.04 0.02 0.03 0.03 0.48 0.12 0.05 0.12 0.32 0.1 0.13 0.66 0.36 0.33 0.08 0.27 0.42 0.15 1.0 0.31 0.27 0.11 0.07 0.02 0.06 0.16
Sro2443_g327840.1 (Contig4167.g31801)
0.0 0.02 0.0 0.02 0.01 0.27 0.1 0.02 0.07 0.25 0.06 0.12 0.72 0.26 0.23 0.08 0.28 0.53 0.12 1.0 0.25 0.09 0.08 0.03 0.0 0.07 0.16
Sro251_g099130.1 (Contig687.g7993)
0.03 0.39 0.57 0.13 0.13 0.04 0.27 0.11 0.07 0.32 0.35 0.21 0.96 0.22 0.29 0.2 0.29 0.7 0.64 0.99 0.47 0.18 0.06 0.84 1.0 0.53 0.26
Sro2543_g330760.1 (Contig439.g5896)
0.0 0.88 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2545_g330800.1 (Contig2769.g22288)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.24 0.21 0.18 0.26 0.1 0.32 0.25 0.18 0.28 0.17 0.23 0.45 0.37 0.23 0.29 0.17 0.97 0.97 0.32 0.25 0.12 0.28 1.0 0.62 0.19 0.14
Sro2599_g332270.1 (Contig1329.g12274)
0.0 0.27 0.21 0.58 0.33 0.14 0.37 0.22 0.26 0.31 0.4 0.21 0.7 0.25 0.41 0.36 0.39 0.75 0.5 0.89 0.25 0.12 0.05 0.68 1.0 0.47 0.29
Sro2702_g335120.1 (Contig2308.g19049)
0.0 0.22 0.19 0.13 0.13 0.0 0.13 0.11 0.16 0.11 0.11 0.13 0.12 0.13 0.19 0.13 0.01 0.08 0.03 0.13 0.13 0.03 0.07 0.38 1.0 0.65 0.06
Sro3048_g342820.1 (Contig2470.g20205)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.07 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro312_g114650.1 (Contig2832.g22710)
0.03 0.46 0.71 0.03 0.08 0.04 0.04 0.04 0.01 0.41 0.04 0.75 0.6 0.0 0.1 0.12 0.0 0.43 1.0 0.84 0.77 0.05 0.06 0.2 0.8 0.54 0.08
Sro334_g119690.1 (Contig278.g3579)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro335_g120020.1 (Contig3868.g29759)
0.03 0.59 0.82 0.42 0.41 0.1 0.55 0.23 0.34 0.55 0.57 0.5 0.62 0.19 0.4 0.4 0.23 0.85 0.98 1.0 0.81 0.3 0.36 0.57 0.83 0.61 0.4
Sro337_g120490.1 (Contig2800.g22507)
0.0 0.12 0.12 0.12 0.08 0.01 0.18 0.08 0.05 0.07 0.1 0.05 0.15 0.02 0.05 0.04 0.02 0.29 0.24 0.22 0.08 0.06 0.02 0.38 1.0 0.53 0.03
Sro33_g021440.1 (Contig2613.g21165)
0.05 0.17 0.11 0.18 0.17 0.08 0.32 0.47 0.33 0.52 0.71 0.66 0.67 0.24 0.57 0.52 0.39 0.41 0.79 0.87 0.86 0.07 0.06 0.71 1.0 0.94 0.47
Sro347_g122900.1 (Contig477.g6458)
0.01 0.4 0.29 0.33 0.29 0.02 0.31 0.1 0.06 0.25 0.35 0.13 0.34 0.11 0.3 0.38 0.05 0.26 0.3 0.49 0.52 0.09 0.04 0.37 1.0 0.51 0.22
Sro371_g128650.1 (Contig736.g8443)
0.0 0.13 0.37 0.17 0.11 0.01 0.26 0.14 0.14 0.14 0.12 0.09 0.35 0.02 0.09 0.04 0.01 0.49 0.24 0.22 0.25 0.04 0.23 0.55 1.0 0.56 0.07
Sro378_g130200.1 (Contig2744.g22063)
0.02 0.5 0.54 0.3 0.26 0.07 0.35 0.13 0.06 0.4 0.47 0.44 0.32 0.17 0.39 0.49 0.19 0.44 0.54 0.71 0.91 0.11 0.07 0.47 1.0 0.45 0.4
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.53 0.0 0.63 0.23 0.0 0.18 0.73 0.23 0.21 0.48 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26
Sro42_g025860.1 (Contig312.g4163)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.38 0.0 1.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11
Sro445_g144470.1 (Contig1488.g13602)
0.02 0.0 0.04 0.03 0.03 0.0 0.08 0.08 0.08 0.18 0.21 0.12 0.45 0.01 0.13 0.22 0.08 0.53 1.0 0.66 0.29 0.01 0.0 0.08 0.89 0.39 0.14
Sro468_g149040.1 (Contig3973.g30498)
0.08 0.16 0.15 0.23 0.2 0.03 0.19 0.24 0.18 0.14 0.14 0.12 0.44 0.11 0.16 0.17 0.07 0.12 0.15 0.56 0.22 0.08 0.23 0.4 1.0 0.74 0.07
Sro478_g151010.1 (Contig272.g3499)
0.02 0.52 1.0 0.6 0.5 0.59 0.27 0.31 0.15 0.44 0.14 0.43 0.78 0.31 0.24 0.28 0.14 0.79 1.0 0.71 0.69 0.2 0.16 0.38 0.28 0.51 0.15
Sro481_g151560.1 (Contig3107.g24714)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.18 0.01 0.33 0.47 1.0 0.1 0.0 0.05 0.26 0.07 0.94 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro538_g162500.1 (Contig95.g1091)
0.01 0.22 0.26 0.18 0.08 0.22 0.15 0.09 0.02 0.16 0.13 0.08 0.31 0.07 0.15 0.11 0.07 0.3 0.42 0.42 0.21 0.05 0.02 0.47 1.0 0.6 0.12
Sro53_g031510.1 (Contig1592.g14491)
0.03 0.38 0.31 0.3 0.27 0.1 0.16 0.13 0.14 0.33 0.17 0.27 0.23 0.15 0.23 0.38 0.12 0.37 0.48 0.28 0.43 0.09 0.07 0.33 1.0 0.54 0.27
Sro540_g162990.1 (Contig4704.g34988)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro541_g163190.1 (Contig3996.g30684)
0.28 0.37 0.45 0.52 0.36 0.16 0.27 0.25 0.25 0.35 0.48 0.23 0.6 0.22 0.31 0.31 0.39 0.49 0.71 0.83 0.28 0.21 0.21 1.0 0.87 0.24 0.28
Sro548_g164320.1 (Contig1714.g15312)
0.0 0.69 0.72 0.49 0.33 0.27 0.34 0.22 0.11 0.39 0.36 0.47 0.81 0.36 0.33 0.29 0.31 0.36 0.59 0.8 0.56 0.33 0.18 0.72 1.0 0.69 0.3
Sro596_g172770.1 (Contig2605.g21081)
0.07 0.39 0.68 0.27 0.44 0.0 0.35 0.09 0.22 0.28 0.06 0.29 0.32 0.02 0.03 0.02 0.03 1.0 0.88 0.33 0.66 0.01 0.06 0.34 0.66 0.25 0.05
Sro59_g034370.1 (Contig571.g7283)
0.01 0.03 0.02 0.02 0.03 0.71 0.32 0.1 0.22 0.41 0.39 0.5 1.0 0.68 0.46 0.15 0.16 0.41 0.21 0.8 0.4 0.13 0.07 0.26 0.23 0.18 0.31
Sro65_g037000.1 (Contig155.g1770)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.06 0.0 0.22 0.0 0.01 0.02 0.02 0.19 0.07 0.25 0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.31 0.02
0.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.0 1.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86
Sro698_g189230.1 (Contig480.g6493)
0.14 0.39 0.25 0.19 0.19 0.13 0.15 0.25 0.25 0.26 0.44 0.21 0.43 0.14 0.35 0.3 0.42 0.42 0.32 0.43 0.25 0.17 0.07 0.68 1.0 0.54 0.34
Sro720_g192620.1 (Contig2421.g19823)
0.02 0.5 0.77 0.7 0.44 0.14 0.27 0.13 0.14 0.36 0.24 0.32 0.45 0.31 0.19 0.06 0.15 0.84 1.0 0.72 0.38 0.12 0.08 0.88 0.72 0.52 0.14
Sro832_g208470.1 (Contig3251.g25663)
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.43 0.26 0.5 0.51 1.0 0.89 0.55 0.04 0.4 0.13 0.6 0.32 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.3
Sro84_g044950.1 (Contig220.g2628)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro859_g212050.1 (Contig1286.g12012)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.42 0.0 0.32 0.19 0.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro890_g216710.1 (Contig4208.g32013)
0.05 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.19 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.59 0.22 0.04 0.0 0.0 0.1 0.69 0.79 0.0 0.0 0.01 0.57 1.0 0.94 0.05
Sro914_g219550.1 (Contig629.g7634)
0.01 0.24 0.41 0.22 0.2 0.04 0.19 0.17 0.14 0.31 0.36 0.25 0.32 0.05 0.31 0.47 0.2 0.57 0.56 0.5 0.5 0.07 0.06 0.63 1.0 0.61 0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)