1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_224 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro111_g055250.1 (Contig567.g7202)
 0.12 0.03 0.06 0.05 0.03 0.14 0.25 0.26 0.17 0.38 0.42 0.36 0.27 0.08 0.56 0.65 0.77 1.0 0.46 0.3 0.48 0.01 0.04 0.19 0.37 0.22 0.53
Sro113_g056060.1 (Contig4126.g31571)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.14 0.1 0.3 0.04 1.0 0.04 0.53 0.74 0.32 0.79 0.28 0.71 0.17 0.0 0.06 0.05 0.13 0.05 0.12
Sro1203_g252040.1 (Contig3938.g30198)
 0.02 0.01 0.03 0.01 0.0 0.01 0.31 0.3 0.32 0.27 0.25 0.41 0.99 0.06 0.53 0.85 0.6 0.69 0.46 1.0 0.34 0.05 0.39 0.07 0.05 0.01 0.12
Sro1306_g261230.1 (Contig1290.g12018)
 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.26 0.1 0.21 0.3 0.59 0.39 1.0 0.24 0.58 0.56 0.82 0.74 0.46 0.78 0.36 0.06 0.28 0.21 0.06 0.04 0.23
Sro1334_g263790.1 (Contig785.g8783)
 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.0 0.04 0.1 0.07 0.21 0.41 0.17 0.63 0.03 0.48 0.84 0.3 1.0 0.52 0.49 0.2 0.02 0.04 0.11 0.17 0.08 0.32
Sro134_g063580.1 (Contig145.g1620)
 0.02 0.09 0.04 0.03 0.04 0.14 0.06 0.07 0.02 0.23 0.43 0.22 0.66 0.12 0.53 0.23 1.0 0.18 0.13 0.62 0.16 0.02 0.01 0.0 0.15 0.01 0.16
Sro1366_g266700.1 (Contig4192.g31932)
 0.1 0.07 0.09 0.08 0.06 0.13 0.21 0.1 0.19 0.32 0.79 0.26 0.77 0.27 0.78 0.95 1.0 0.67 0.47 0.72 0.52 0.07 0.18 0.19 0.09 0.08 0.44
Sro136_g064090.1 (Contig2000.g17120)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.01 0.11 0.13 0.15 0.45 0.24 0.26 0.18 0.22 1.0 0.48 0.39 0.06 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.07
Sro1444_g273290.1 (Contig2917.g23221)
 0.01 0.18 0.4 0.47 0.53 0.01 0.35 0.26 0.31 0.27 0.1 0.46 0.86 0.18 0.24 0.38 0.28 1.0 0.6 0.41 0.61 0.08 0.29 0.12 0.12 0.06 0.02
Sro145_g067340.1 (Contig3646.g28180)
 0.2 0.04 0.05 0.05 0.05 0.3 0.17 0.18 0.26 0.28 0.42 0.37 0.3 0.49 0.44 0.26 0.65 1.0 0.56 0.41 0.52 0.19 0.09 0.16 0.21 0.19 0.2
Sro1488_g276870.1 (Contig1217.g11421)
 0.06 0.59 0.61 0.69 0.69 0.28 0.27 0.56 0.54 0.51 0.6 0.55 0.99 0.33 0.5 0.79 0.55 0.38 0.56 1.0 0.45 0.27 0.47 0.3 0.21 0.31 0.35
Sro1537_g280660.1 (Contig3053.g24290)
 0.01 0.09 0.1 0.07 0.08 0.15 0.31 0.1 0.21 0.47 0.73 0.46 0.63 0.37 0.68 1.0 0.44 0.49 0.5 0.93 0.53 0.29 0.12 0.23 0.41 0.34 0.53
Sro1565_g282810.1 (Contig2951.g23395)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 0.08 0.07 0.17 0.3 0.27 0.27 0.08 0.53 0.99 0.6 1.0 0.43 0.31 0.29 0.0 0.03 0.09 0.05 0.03 0.1
Sro1610_g285830.1 (Contig4416.g33188)
 0.15 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.14 0.09 0.05 0.31 0.14 0.37 0.49 0.1 0.38 0.53 0.22 1.0 0.85 0.65 0.6 0.08 0.04 0.2 0.29 0.15 0.02
Sro166_g074140.1 (Contig1709.g15293)
 0.05 0.98 0.43 0.51 0.45 0.24 0.53 0.27 0.21 0.57 0.87 0.66 1.0 0.85 0.74 0.69 0.66 0.81 0.71 0.94 0.55 0.14 0.21 0.44 0.21 0.15 0.52
Sro177_g077700.1 (Contig795.g8896)
 0.11 0.04 0.06 0.06 0.11 0.06 0.15 0.02 0.01 0.35 0.27 0.56 0.73 0.32 0.34 0.25 0.13 1.0 0.5 0.97 0.28 0.04 0.02 0.37 0.26 0.35 0.16
Sro1822_g299810.1 (Contig1026.g10233)
 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.2 0.14 0.1 0.31 0.35 0.62 0.43 0.17 0.35 0.13 0.55 1.0 0.6 0.52 0.58 0.01 0.09 0.18 0.26 0.11 0.12
0.04 0.07 0.05 0.04 0.05 0.04 0.4 0.2 0.05 0.35 0.11 0.38 0.43 0.06 0.3 0.2 0.28 1.0 0.33 0.58 0.71 0.09 0.15 0.26 0.63 0.3 0.11
Sro182_g079500.1 (Contig1301.g12086)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.04 0.05 0.18 0.14 0.24 0.69 0.05 0.56 0.69 0.57 1.0 0.67 0.63 0.33 0.0 0.07 0.08 0.04 0.04 0.07
Sro1860_g302140.1 (Contig183.g2122)
 0.03 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01 0.05 0.02 0.01 0.36 0.22 0.98 0.75 0.1 0.33 0.89 0.19 1.0 0.5 0.42 0.6 0.0 0.01 0.23 0.34 0.13 0.24
Sro2017_g311180.1 (Contig4220.g32059)
 0.11 0.15 0.49 0.36 0.32 0.0 0.0 0.15 0.07 0.11 0.1 0.14 1.0 0.04 0.13 0.61 0.05 0.24 0.2 0.32 0.07 0.01 0.06 0.0 0.01 0.0 0.1
Sro217_g089740.1 (Contig1718.g15348)
 0.03 0.16 0.17 0.15 0.1 0.18 0.22 0.03 0.11 0.36 0.56 0.51 0.78 0.15 0.67 1.0 0.16 0.41 0.51 0.67 0.38 0.03 0.05 0.46 0.25 0.23 0.55
Sro2215_g319400.1 (Contig374.g5057)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.64 0.98 0.07 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 1.0 0.91 0.03 0.16 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro2367_g325100.1 (Contig2056.g17649)
 0.03 0.24 0.14 0.11 0.11 0.32 0.3 0.38 0.26 0.34 0.68 0.32 0.56 0.17 0.73 1.0 0.74 0.72 0.26 0.45 0.57 0.04 0.15 0.33 0.44 0.28 0.37
Sro243_g096790.1 (Contig3073.g24503)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.06 0.07 0.07 0.13 0.1 0.35 0.03 0.18 0.24 0.23 1.0 0.39 0.32 0.12 0.01 0.04 0.05 0.04 0.02 0.04
Sro2549_g330900.1 (Contig1816.g15999)
 0.02 0.08 0.09 0.04 0.04 0.14 0.29 0.23 0.32 0.34 0.37 0.41 1.0 0.37 0.48 0.34 0.63 0.56 0.45 0.85 0.47 0.24 0.28 0.24 0.23 0.2 0.18
Sro259_g101210.1 (Contig240.g2911)
 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.09 0.06 0.32 0.54 0.27 0.43 0.05 0.6 0.87 0.8 1.0 0.48 0.48 0.34 0.0 0.07 0.23 0.08 0.05 0.39
Sro270_g104230.1 (Contig1617.g14607)
 0.0 0.01 0.01 0.05 0.02 0.09 0.14 0.1 0.07 0.26 0.45 0.25 0.39 0.13 0.66 0.66 0.55 1.0 0.53 0.35 0.4 0.02 0.04 0.17 0.24 0.15 0.3
Sro2878_g339190.1 (Contig4091.g31274)
 0.1 0.24 0.27 0.05 0.07 0.07 0.32 0.12 0.1 0.41 0.2 0.41 0.61 0.2 0.31 0.93 0.38 0.78 0.82 1.0 0.59 0.07 0.08 0.28 0.4 0.19 0.2
Sro301_g111980.1 (Contig455.g6146)
 0.02 0.04 0.02 0.03 0.02 0.06 0.39 0.2 0.12 0.37 0.39 0.38 0.48 0.28 0.49 0.8 0.38 1.0 0.43 0.64 0.62 0.2 0.13 0.37 0.55 0.23 0.12
0.01 0.03 0.07 0.03 0.02 0.32 0.43 0.17 0.11 0.51 0.83 0.49 0.35 0.07 0.8 0.9 1.0 0.58 0.48 0.87 0.52 0.06 0.04 0.34 0.74 0.38 0.62
Sro308_g113520.1 (Contig2352.g19322)
 0.22 0.48 0.37 0.35 0.31 0.2 0.57 0.65 0.45 0.54 0.81 0.77 0.49 0.46 0.8 1.0 0.66 0.34 0.28 0.54 0.64 0.2 0.18 0.95 0.48 0.28 0.62
Sro33_g021200.1 (Contig2613.g21141)
 0.01 0.03 0.04 0.08 0.04 0.0 0.05 0.16 0.04 0.08 0.02 0.12 0.69 0.0 0.03 0.11 0.02 0.36 0.88 1.0 0.11 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro343_g122100.1 (Contig2616.g21261)
 0.0 0.0 0.18 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.33 0.52 0.1 1.0 0.0 0.64 0.0 0.87 0.36 0.05 0.85 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro344_g122300.1 (Contig3448.g26818)
 0.54 0.12 0.14 0.12 0.1 0.16 0.38 0.22 0.26 0.41 0.55 0.48 0.91 0.49 0.51 0.65 0.71 1.0 0.58 0.95 0.47 0.13 0.31 0.35 0.12 0.14 0.32
Sro3592_g349430.1 (Contig859.g9395)
 0.6 0.3 0.44 0.4 0.35 0.22 0.29 0.67 0.74 0.35 0.26 0.34 0.59 0.09 0.49 0.22 0.4 0.5 1.0 0.92 0.64 0.24 0.35 0.17 0.36 0.23 0.26
Sro383_g131220.1 (Contig132.g1487)
 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.21 0.18 0.19 0.15 0.18 0.34 0.13 1.0 0.2 0.42 0.54 0.34 0.58 0.53 0.76 0.12 0.13 0.06 0.09 0.06 0.06 0.16
Sro3_g002430.1 (Contig3832.g29428)
 0.04 0.27 0.41 0.45 0.42 0.26 0.17 0.18 0.33 0.29 0.3 0.27 1.0 0.46 0.39 0.29 0.38 0.43 0.57 0.9 0.15 0.12 0.25 0.25 0.11 0.14 0.3
Sro401_g135350.1 (Contig2817.g22593)
 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.08 0.06 0.3 0.61 0.32 0.54 0.08 0.66 0.86 0.75 1.0 0.58 0.45 0.4 0.0 0.06 0.19 0.04 0.03 0.41
Sro401_g135360.1 (Contig2817.g22594)
 0.03 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.46 0.2 0.11 0.38 0.71 0.27 0.29 0.1 0.82 1.0 0.96 0.67 0.34 0.45 0.46 0.01 0.16 0.33 0.16 0.12 0.51
Sro427_g140630.1 (Contig2653.g21434)
 0.01 0.19 0.25 0.39 0.21 0.22 0.45 0.3 0.28 0.59 0.81 0.73 0.73 0.61 0.84 1.0 0.53 0.72 0.7 0.59 0.91 0.35 0.31 0.55 0.55 0.39 0.67
Sro433_g141820.1 (Contig4540.g33944)
 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.22 0.3 0.33 0.08 0.53 1.0 0.53 0.33 0.27 0.98 0.85 0.3 0.51 0.48 0.44 0.33 0.06 0.02 0.64 0.13 0.17 0.57
Sro437_g142760.1 (Contig994.g10042)
 0.33 0.11 0.09 0.08 0.08 0.01 0.12 0.04 0.08 0.3 0.14 0.58 0.91 0.04 0.38 0.11 0.53 1.0 0.68 0.93 0.35 0.04 0.11 0.14 0.14 0.07 0.03
Sro43_g025950.1 (Contig2453.g20061)
 0.16 0.02 0.03 0.02 0.01 0.01 0.06 0.04 0.06 0.21 0.05 0.34 0.34 0.02 0.13 0.18 0.16 1.0 0.46 0.43 0.38 0.01 0.08 0.07 0.19 0.04 0.03
Sro494_g154340.1 (Contig3119.g24799)
 0.01 0.03 0.14 0.02 0.02 0.0 0.04 0.06 0.07 0.21 0.3 0.17 1.0 0.21 0.58 0.5 0.75 0.79 0.33 0.59 0.15 0.02 0.16 0.04 0.04 0.01 0.11
Sro526_g160370.1 (Contig842.g9282)
 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.12 0.05 0.02 0.02 0.08 0.19 0.03 0.46 0.01 0.24 0.37 0.37 1.0 0.59 0.43 0.03 0.04 0.04 0.07 0.08 0.07 0.12
Sro52_g031110.1 (Contig3190.g25194)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.06 0.18 0.13 0.25 0.6 0.14 0.33 0.48 0.3 1.0 0.53 0.51 0.32 0.0 0.06 0.12 0.08 0.05 0.07
Sro538_g162580.1 (Contig95.g1099)
 0.01 0.34 0.45 0.42 0.35 0.31 0.4 0.58 0.47 0.53 0.43 0.57 0.99 0.6 0.35 0.34 0.27 0.28 0.55 0.95 1.0 0.5 0.35 0.41 0.75 0.48 0.42
Sro567_g167890.1 (Contig3851.g29645)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.23 0.01 0.4 1.0 0.17 0.08 0.12 0.01 0.77 0.31 0.78 0.73 0.0 0.04 0.12 0.09 0.02 0.0
Sro56_g032710.1 (Contig3029.g24147)
 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.07 0.05 0.05 0.03 0.15 0.07 0.19 1.0 0.14 0.21 0.03 0.19 0.61 0.35 0.91 0.25 0.03 0.04 0.1 0.14 0.07 0.01
Sro581_g170210.1 (Contig2661.g21526)
 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.05 0.04 0.17 0.33 0.16 0.41 0.01 0.61 1.0 0.36 0.56 0.29 0.36 0.18 0.0 0.04 0.08 0.13 0.09 0.27
Sro622_g176950.1 (Contig2850.g22856)
 0.42 0.07 0.15 0.08 0.02 0.32 0.25 0.27 0.08 0.47 0.47 0.66 1.0 0.38 0.61 0.97 0.47 0.5 0.55 0.9 0.61 0.12 0.08 0.78 0.41 0.21 0.51
Sro647_g180870.1 (Contig3562.g27503)
 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.04 0.04 0.05 0.24 0.02 0.48 1.0 0.28 0.25 0.17 0.26 0.07 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0
Sro668_g184320.1 (Contig3161.g25037)
 0.02 1.0 0.6 0.8 0.62 0.11 0.63 0.43 0.49 0.52 0.98 0.75 0.65 0.21 0.59 0.43 0.62 0.65 0.27 0.46 0.55 0.09 0.22 0.36 0.27 0.14 0.29
Sro677_g185800.1 (Contig3197.g25276)
 0.01 0.09 0.14 0.11 0.12 0.2 0.4 0.31 0.32 0.37 0.36 0.4 1.0 0.42 0.41 0.43 0.52 0.55 0.61 0.85 0.54 0.29 0.34 0.43 0.5 0.51 0.3
Sro701_g189840.1 (Contig2013.g17195)
 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.03 0.01 0.07 0.05 0.08 0.32 0.07 0.28 1.0 0.04 0.06 0.03 0.08 0.19 0.01 0.02 0.09 0.09 0.03 0.05
Sro744_g196140.1 (Contig393.g5313)
 0.02 0.13 0.18 0.1 0.18 0.04 0.18 0.13 0.11 0.22 0.13 0.51 0.66 0.05 0.19 0.53 0.12 1.0 0.46 0.4 0.34 0.02 0.13 0.19 0.28 0.11 0.11
Sro747_g196550.1 (Contig4185.g31903)
 0.01 0.04 0.1 0.16 0.15 0.01 0.04 0.03 0.02 0.1 0.11 0.17 0.61 0.06 0.44 1.0 0.18 0.96 0.54 0.36 0.14 0.0 0.04 0.09 0.07 0.02 0.03
Sro764_g199050.1 (Contig1534.g13934)
 0.02 0.03 0.06 0.01 0.02 0.0 0.03 0.04 0.01 0.34 0.28 0.53 0.69 0.08 0.19 0.37 0.09 1.0 0.56 0.55 0.59 0.02 0.04 0.09 0.13 0.03 0.21
Sro93_g048680.1 (Contig3841.g29556)
 0.0 0.02 0.04 0.03 0.03 0.06 0.11 0.05 0.03 0.1 0.34 0.02 0.12 0.01 0.42 1.0 0.58 0.68 0.43 0.17 0.09 0.11 0.01 0.08 0.11 0.09 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)