Heatmap: Cluster_181 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1002_g229910.1 (Contig2058.g17660)
0.01 0.59 0.43 0.63 0.28 0.25 0.3 0.16 0.09 0.69 0.97 0.61 0.53 1.0 0.62 0.51 0.53 0.54 0.74 0.77 0.57 0.01 0.05 0.46 0.23 0.34 0.76
Sro104_g052780.1 (Contig1278.g11921)
0.01 1.0 0.53 0.54 0.32 0.57 0.37 0.31 0.13 0.74 0.88 0.67 0.28 0.98 0.57 0.35 0.78 0.48 0.7 0.72 0.42 0.03 0.11 0.4 0.09 0.24 0.77
Sro105_g053160.1 (Contig544.g7005)
0.01 0.09 0.01 0.11 0.05 0.13 0.16 0.09 0.03 0.38 1.0 0.44 0.07 0.69 0.41 0.5 0.51 0.29 0.33 0.12 0.17 0.02 0.02 0.19 0.14 0.33 0.41
Sro1061_g236850.1 (Contig3773.g28968)
0.01 0.07 0.05 0.07 0.13 0.2 0.18 0.17 0.12 0.33 0.49 0.34 0.09 0.41 0.45 1.0 0.4 0.38 0.33 0.17 0.22 0.08 0.15 0.18 0.3 0.15 0.4
Sro1088_g239970.1 (Contig3790.g29092)
0.01 0.12 0.05 0.1 0.06 0.08 0.19 0.16 0.06 0.49 0.9 0.5 0.2 0.6 0.52 1.0 0.56 0.49 0.57 0.27 0.49 0.04 0.04 0.33 0.39 0.38 0.49
Sro1116_g242860.1 (Contig365.g4926)
0.01 0.11 0.03 0.09 0.08 0.09 0.17 0.12 0.06 0.44 0.7 0.33 0.19 0.75 0.49 1.0 0.44 0.36 0.2 0.14 0.28 0.04 0.04 0.19 0.15 0.19 0.6
Sro1124_g243850.1 (Contig4358.g32843)
0.03 0.96 0.34 0.48 0.3 0.52 0.34 0.27 0.11 0.68 0.85 0.66 0.05 1.0 0.53 0.6 0.39 0.27 0.34 0.1 0.42 0.01 0.09 0.22 0.04 0.21 0.86
Sro129_g061700.1 (Contig1945.g16744)
0.05 0.27 0.13 0.38 0.22 0.28 0.25 0.25 0.19 0.56 1.0 0.61 0.54 0.68 0.61 0.88 0.72 0.28 0.33 0.58 0.38 0.2 0.16 0.59 0.69 0.47 0.56
Sro1319_g262240.1 (Contig3198.g25285)
0.0 0.2 0.05 0.12 0.05 0.24 0.28 0.09 0.05 0.58 1.0 0.55 0.52 0.82 0.56 0.89 0.41 0.6 0.75 0.57 0.46 0.02 0.03 0.31 0.3 0.41 0.42
0.02 0.84 0.72 0.7 0.51 0.29 0.22 0.15 0.07 0.53 0.62 0.52 0.8 0.46 0.45 0.34 0.36 0.4 0.48 1.0 0.38 0.02 0.05 0.46 0.31 0.25 0.54
Sro1362_g266260.1 (Contig3580.g27673)
0.01 0.15 0.05 0.14 0.09 0.17 0.22 0.14 0.08 0.47 0.86 0.48 0.37 0.64 0.54 1.0 0.65 0.32 0.47 0.32 0.41 0.09 0.07 0.26 0.18 0.3 0.54
Sro1368_g266780.1 (Contig1805.g15891)
0.04 0.04 0.01 0.14 0.09 0.08 0.26 0.15 0.05 0.55 0.85 0.57 0.52 0.94 0.56 1.0 0.59 0.43 0.38 0.22 0.41 0.02 0.03 0.23 0.3 0.43 0.51
Sro1419_g271100.1 (Contig2543.g20730)
0.01 0.14 0.07 0.12 0.09 0.09 0.23 0.17 0.08 0.52 1.0 0.56 0.32 0.64 0.53 0.76 0.57 0.41 0.52 0.54 0.36 0.05 0.04 0.36 0.13 0.28 0.62
Sro142_g066320.1 (Contig226.g2681)
0.07 0.81 0.84 1.0 0.65 0.14 0.32 0.2 0.1 0.65 0.71 0.75 0.93 0.64 0.54 0.74 0.47 0.3 0.53 0.97 0.74 0.05 0.09 0.57 0.2 0.25 0.46
Sro1440_g272890.1 (Contig840.g9267)
0.0 0.15 0.03 0.13 0.05 0.11 0.21 0.12 0.05 0.55 1.0 0.62 0.1 0.95 0.57 0.94 0.59 0.33 0.44 0.2 0.38 0.03 0.03 0.35 0.16 0.3 0.67
Sro14_g010460.1 (Contig1128.g10795)
0.04 1.0 0.75 0.65 0.54 0.65 0.58 0.42 0.23 0.84 0.73 0.89 0.26 0.94 0.58 0.5 0.37 0.56 0.77 0.36 0.64 0.05 0.21 0.24 0.07 0.17 0.91
Sro1509_g278500.1 (Contig198.g2305)
0.03 1.0 0.25 0.38 0.46 0.35 0.4 0.36 0.14 0.56 0.59 0.52 0.05 0.49 0.43 0.56 0.4 0.43 0.42 0.1 0.29 0.01 0.12 0.22 0.19 0.22 0.51
Sro154_g070020.1 (Contig2716.g21880)
0.1 0.34 0.13 0.28 0.26 0.55 0.28 0.26 0.18 0.73 0.99 0.73 0.16 1.0 0.63 0.8 0.77 0.46 0.52 0.42 0.44 0.17 0.12 0.22 0.16 0.36 0.79
Sro156_g070650.1 (Contig473.g6403)
0.0 1.0 0.56 0.61 0.44 0.31 0.25 0.23 0.12 0.54 0.56 0.55 0.21 0.49 0.36 0.17 0.28 0.23 0.35 0.24 0.28 0.05 0.08 0.41 0.16 0.13 0.49
Sro1596_g284830.1 (Contig2886.g23043)
0.02 0.11 0.02 0.06 0.08 0.15 0.13 0.17 0.09 0.55 0.78 0.52 0.2 0.83 0.5 1.0 0.66 0.16 0.06 0.24 0.16 0.08 0.06 0.19 0.12 0.28 0.73
Sro1666_g289650.1 (Contig3636.g28066)
0.01 0.08 0.02 0.1 0.07 0.07 0.14 0.11 0.06 0.56 0.79 0.5 0.22 0.91 0.55 1.0 0.55 0.37 0.36 0.14 0.22 0.03 0.04 0.19 0.09 0.19 0.82
Sro178_g078260.1 (Contig275.g3551)
0.02 0.2 0.08 0.13 0.14 0.21 0.23 0.17 0.07 0.49 0.91 0.4 0.04 1.0 0.5 0.71 0.55 0.16 0.2 0.08 0.43 0.02 0.06 0.2 0.14 0.23 0.57
Sro1800_g298440.1 (Contig4279.g32347)
0.01 0.8 0.41 0.26 0.34 0.35 0.19 0.13 0.07 0.45 0.27 0.32 1.0 0.8 0.34 0.35 0.13 0.41 0.59 0.84 0.3 0.21 0.06 0.05 0.04 0.03 0.47
Sro1824_g300020.1 (Contig618.g7588)
0.08 0.08 0.05 0.07 0.05 0.15 0.25 0.25 0.31 0.68 0.62 0.92 0.69 0.69 0.62 1.0 0.59 0.66 0.82 0.54 0.63 0.18 0.18 0.18 0.04 0.17 0.63
Sro184_g080010.1 (Contig2216.g18404)
0.0 0.04 0.04 0.05 0.03 0.12 0.12 0.08 0.07 0.27 0.18 0.24 0.15 0.29 0.28 1.0 0.13 0.36 0.3 0.16 0.27 0.03 0.05 0.11 0.15 0.14 0.25
Sro184_g080020.1 (Contig2216.g18405)
0.0 0.04 0.03 0.03 0.03 0.17 0.11 0.07 0.05 0.29 0.21 0.25 0.22 0.45 0.32 1.0 0.17 0.35 0.31 0.22 0.23 0.06 0.04 0.08 0.08 0.1 0.3
Sro1857_g302060.1 (Contig4756.g384)
0.05 0.2 0.06 0.16 0.1 0.11 0.26 0.14 0.09 0.58 0.97 0.57 0.57 1.0 0.51 0.87 0.5 0.44 0.66 0.81 0.65 0.06 0.05 0.36 0.19 0.34 0.47
Sro187_g080910.1 (Contig2990.g23764)
0.0 0.25 0.14 0.3 0.26 0.19 0.21 0.26 0.12 0.6 1.0 0.48 0.47 0.73 0.75 0.98 0.37 0.13 0.59 0.48 0.59 0.18 0.06 0.37 0.25 0.19 0.92
Sro18_g012770.1 (Contig1351.g12437)
0.02 0.16 0.05 0.16 0.09 0.22 0.25 0.19 0.08 0.62 0.61 0.59 0.4 0.93 0.64 1.0 0.41 0.65 0.64 0.41 0.64 0.11 0.07 0.29 0.22 0.27 0.69
Sro1918_g305410.1 (Contig9.g110)
0.18 0.15 0.13 0.08 0.09 0.44 0.27 0.26 0.16 0.73 0.89 0.67 0.87 0.88 0.68 1.0 0.54 0.58 0.5 0.35 0.39 0.02 0.08 0.14 0.1 0.21 0.96
Sro200_g084570.1 (Contig201.g2348)
0.04 0.24 0.07 0.17 0.09 0.17 0.25 0.15 0.08 0.57 1.0 0.62 0.32 0.73 0.55 0.89 0.63 0.43 0.55 0.49 0.49 0.06 0.07 0.32 0.22 0.37 0.46
Sro2149_g316610.1 (Contig2542.g20718)
0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.11 0.1 0.05 0.05 0.37 0.33 0.33 0.34 0.58 0.37 1.0 0.27 0.38 0.37 0.41 0.34 0.11 0.04 0.1 0.11 0.21 0.34
Sro216_g089240.1 (Contig227.g2701)
0.04 0.24 0.07 0.14 0.13 0.04 0.2 0.13 0.15 0.57 1.0 0.55 0.51 0.95 0.46 0.56 0.64 0.47 0.78 0.63 0.4 0.09 0.09 0.26 0.23 0.45 0.72
Sro21_g015010.1 (Contig813.g9091)
0.02 0.16 0.04 0.15 0.34 0.08 0.13 0.1 0.07 0.32 0.42 0.27 0.07 0.4 0.37 1.0 0.34 0.23 0.15 0.15 0.13 0.04 0.04 0.13 0.13 0.12 0.34
Sro2256_g321060.1 (Contig1739.g15497)
0.02 1.0 0.72 0.91 0.63 0.28 0.28 0.15 0.12 0.53 0.38 0.51 0.41 0.33 0.4 0.42 0.48 0.27 0.59 0.8 0.4 0.1 0.15 0.25 0.17 0.2 0.54
Sro2285_g321920.1 (Contig4566.g34113)
0.0 0.04 0.01 0.09 0.05 0.07 0.11 0.06 0.06 0.44 0.96 0.47 0.17 0.9 0.57 1.0 0.48 0.36 0.49 0.18 0.34 0.03 0.01 0.1 0.04 0.26 0.48
Sro2380_g325440.1 (Contig3899.g29887)
0.04 0.1 0.03 0.15 0.12 0.17 0.22 0.17 0.05 0.7 1.0 0.8 0.93 0.92 0.63 0.96 0.53 0.4 0.46 0.59 0.75 0.03 0.05 0.15 0.13 0.3 0.6
Sro250_g099070.1 (Contig1989.g17023)
0.07 0.53 0.5 0.38 0.34 0.12 0.31 0.17 0.21 0.66 0.7 1.0 0.71 0.64 0.4 0.69 0.52 0.3 0.41 0.49 0.46 0.11 0.18 0.24 0.14 0.2 0.54
Sro25_g017100.1 (Contig1417.g13049)
0.03 0.8 0.28 0.34 0.3 0.32 0.27 0.24 0.16 0.77 0.7 0.65 0.23 0.84 0.61 0.67 0.44 0.54 0.67 0.38 0.57 0.08 0.09 0.21 0.09 0.22 1.0
Sro26_g017970.1 (Contig2432.g19968)
0.01 1.0 0.78 0.74 0.75 0.52 0.31 0.25 0.12 0.64 0.85 0.66 0.48 0.95 0.59 0.6 0.54 0.38 0.6 0.59 0.43 0.07 0.11 0.28 0.19 0.27 0.73
Sro274_g105560.1 (Contig1557.g14180)
0.02 1.0 0.56 0.35 0.37 0.27 0.18 0.18 0.1 0.45 0.29 0.48 0.84 0.36 0.33 0.45 0.11 0.36 0.51 0.84 0.35 0.09 0.07 0.17 0.2 0.14 0.38
Sro287_g108610.1 (Contig252.g3102)
0.16 0.25 0.1 0.17 0.11 0.07 0.24 0.19 0.15 0.42 1.0 0.41 0.19 0.58 0.47 0.53 0.47 0.29 0.35 0.28 0.38 0.08 0.1 0.37 0.12 0.23 0.54
Sro29_g019090.1 (Contig1384.g12752)
0.01 0.1 0.03 0.06 0.04 0.04 0.11 0.07 0.02 0.27 0.53 0.25 0.22 0.46 0.37 1.0 0.31 0.15 0.23 0.28 0.36 0.02 0.01 0.16 0.07 0.18 0.24
Sro352_g124080.1 (Contig2645.g21384)
0.02 1.0 0.59 0.6 0.56 0.47 0.26 0.25 0.17 0.55 0.71 0.67 0.49 0.53 0.46 0.25 0.35 0.35 0.58 0.63 0.29 0.11 0.15 0.18 0.04 0.17 0.56
Sro356_g125190.1 (Contig3618.g27955)
0.0 0.02 0.01 0.03 0.02 0.08 0.06 0.07 0.06 0.26 0.28 0.24 0.07 0.3 0.28 1.0 0.31 0.28 0.34 0.12 0.17 0.08 0.09 0.06 0.08 0.15 0.32
Sro42_g025830.1 (Contig312.g4160)
0.01 0.53 0.29 0.35 0.32 0.63 0.33 0.34 0.18 0.68 0.57 0.57 0.29 1.0 0.51 0.38 0.32 0.33 0.41 0.31 0.34 0.07 0.17 0.32 0.14 0.2 0.91
0.06 0.09 0.09 0.15 0.09 0.09 0.24 0.2 0.1 0.47 0.77 0.59 0.19 1.0 0.44 0.71 0.68 0.24 0.43 0.22 0.5 0.07 0.06 0.21 0.28 0.27 0.42
Sro444_g144240.1 (Contig1407.g12897)
0.03 0.41 0.18 0.29 0.32 0.38 0.35 0.21 0.11 0.67 0.68 0.51 0.18 0.79 0.54 0.59 0.39 0.64 0.65 0.22 0.38 0.02 0.1 0.32 0.21 0.14 1.0
Sro488_g153170.1 (Contig4435.g33284)
0.03 0.5 0.16 0.21 0.17 0.39 0.35 0.22 0.15 0.69 0.7 0.77 0.1 1.0 0.53 0.69 0.63 0.39 0.58 0.16 0.43 0.03 0.09 0.35 0.15 0.26 0.91
Sro543_g163590.1 (Contig1245.g11645)
0.01 0.39 0.04 0.15 0.1 0.14 0.25 0.13 0.06 0.6 0.99 0.63 0.53 1.0 0.58 0.9 0.4 0.37 0.52 0.36 0.49 0.05 0.05 0.25 0.08 0.22 0.6
Sro54_g032060.1 (Contig2430.g19894)
0.01 0.19 0.1 0.18 0.12 0.2 0.2 0.15 0.1 0.48 0.4 0.51 0.44 0.59 0.47 1.0 0.29 0.35 0.44 0.32 0.46 0.05 0.09 0.17 0.11 0.19 0.48
Sro5_g004650.1 (Contig4001.g30780)
0.02 0.05 0.03 0.03 0.06 0.09 0.09 0.07 0.09 0.25 0.13 0.24 0.09 0.29 0.37 1.0 0.19 0.29 0.25 0.09 0.28 0.18 0.11 0.08 0.12 0.11 0.24
Sro67_g037570.1 (Contig495.g6673)
0.03 0.97 0.5 0.68 0.64 0.73 0.41 0.44 0.17 0.71 1.0 0.65 0.19 0.94 0.58 0.38 0.67 0.49 0.39 0.33 0.14 0.02 0.15 0.34 0.16 0.34 0.87
Sro67_g037670.1 (Contig495.g6683)
0.0 0.07 0.01 0.05 0.04 0.5 0.18 0.14 0.06 0.65 0.71 0.53 0.11 0.91 0.51 0.65 0.46 0.31 0.25 0.15 0.78 0.02 0.05 0.08 0.07 0.13 1.0
Sro71_g039570.1 (Contig2582.g20980)
0.02 1.0 0.46 0.26 0.33 0.09 0.16 0.11 0.07 0.28 0.23 0.33 0.48 0.2 0.23 0.23 0.16 0.17 0.16 0.55 0.17 0.1 0.07 0.18 0.09 0.06 0.18
Sro726_g193470.1 (Contig3737.g28651)
0.02 1.0 0.62 0.69 0.52 0.6 0.48 0.26 0.12 0.65 0.93 0.74 0.36 0.77 0.49 0.32 0.62 0.37 0.56 0.28 0.39 0.03 0.08 0.7 0.24 0.35 0.83
Sro734_g194720.1 (Contig3769.g28950)
0.06 0.29 0.08 0.26 0.22 0.07 0.22 0.2 0.08 0.53 0.91 0.59 0.07 1.0 0.38 0.4 0.72 0.35 0.41 0.18 0.43 0.06 0.07 0.22 0.12 0.38 0.45
Sro818_g206990.1 (Contig3760.g28845)
0.0 0.08 0.01 0.03 0.04 0.06 0.07 0.09 0.04 0.47 1.0 0.36 0.43 0.8 0.52 0.63 0.74 0.29 0.41 0.22 0.3 0.02 0.02 0.16 0.07 0.19 0.76
Sro828_g207970.1 (Contig4589.g34273)
0.0 0.16 0.09 0.16 0.09 0.25 0.18 0.15 0.05 0.58 1.0 0.59 0.4 0.95 0.6 0.6 0.56 0.55 0.6 0.34 0.41 0.01 0.03 0.24 0.1 0.22 0.74
Sro831_g208330.1 (Contig2214.g18375)
0.0 0.34 0.13 0.19 0.1 0.36 0.33 0.21 0.08 0.56 1.0 0.66 0.29 0.66 0.47 0.24 0.8 0.11 0.31 0.39 0.4 0.06 0.05 0.34 0.16 0.36 0.73
Sro836_g209040.1 (Contig1441.g13253)
0.01 0.17 0.05 0.12 0.05 0.03 0.15 0.06 0.03 0.44 1.0 0.33 0.07 0.79 0.59 0.77 0.41 0.27 0.41 0.14 0.39 0.01 0.05 0.28 0.14 0.16 0.64
Sro907_g218740.1 (Contig3495.g27121)
0.02 0.14 0.07 0.13 0.03 0.13 0.18 0.09 0.12 0.62 0.6 0.66 0.27 0.74 0.56 0.66 0.17 0.63 1.0 0.25 0.3 0.0 0.04 0.21 0.22 0.12 0.64
Sro961_g224960.1 (Contig1333.g12282)
0.0 0.2 0.02 0.18 0.09 0.15 0.2 0.16 0.08 0.41 1.0 0.38 0.23 0.82 0.61 0.85 0.72 0.23 0.36 0.37 0.19 0.08 0.06 0.31 0.48 0.71 0.5
Sro987_g228230.1 (Contig1137.g10930)
0.02 1.0 0.59 0.54 0.51 0.4 0.35 0.28 0.13 0.59 0.97 0.59 0.07 0.65 0.52 0.42 0.44 0.42 0.47 0.12 0.31 0.02 0.1 0.27 0.09 0.21 0.73
Sro987_g228290.1 (Contig1137.g10936)
0.04 0.73 0.31 0.36 0.34 0.44 0.37 0.32 0.17 0.69 1.0 0.71 0.24 0.88 0.64 0.53 0.38 0.53 0.68 0.23 0.38 0.02 0.13 0.24 0.02 0.13 0.86

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)