Heatmap: Cluster_110 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1051_g235740.1 (Contig3964.g30411)
1.0 0.33 0.32 0.36 0.29 0.23 0.19 0.12 0.18 0.25 0.24 0.27 0.04 0.29 0.3 0.31 0.25 0.07 0.12 0.14 0.24 0.13 0.25 0.28 0.24 0.22 0.22
Sro1074_g238360.1 (Contig4290.g32420)
0.56 0.43 0.26 0.23 0.26 0.39 0.71 0.78 1.0 0.53 0.88 0.82 0.12 0.22 0.5 0.69 0.66 0.13 0.28 0.2 0.75 0.42 0.47 0.7 0.55 0.28 0.43
Sro1128_g244250.1 (Contig1354.g12490)
1.0 0.13 0.24 0.18 0.14 0.07 0.07 0.09 0.11 0.15 0.21 0.16 0.2 0.11 0.17 0.2 0.16 0.06 0.12 0.21 0.17 0.06 0.05 0.18 0.1 0.07 0.13
Sro117_g057280.1 (Contig3937.g30172)
1.0 0.23 0.28 0.39 0.36 0.14 0.14 0.12 0.2 0.27 0.27 0.34 0.27 0.26 0.21 0.19 0.32 0.12 0.15 0.23 0.22 0.1 0.18 0.11 0.09 0.13 0.21
0.04 0.19 0.33 0.06 0.09 0.04 0.33 0.25 0.27 0.43 0.14 0.71 0.84 0.55 0.14 0.13 0.06 0.08 0.07 1.0 0.7 0.11 0.19 0.18 0.2 0.18 0.11
Sro1251_g256200.1 (Contig2232.g18545)
0.03 0.13 0.16 0.03 0.12 0.02 0.33 0.14 0.19 0.44 0.25 0.47 0.84 0.56 0.16 0.16 0.28 0.12 0.19 1.0 0.73 0.07 0.17 0.17 0.26 0.33 0.19
Sro126_g060450.1 (Contig82.g862)
1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.48 0.33 0.39 0.31 0.42 0.29 0.15 0.08 0.36 0.5 0.43 0.14 0.09 0.15 0.39 0.16 0.29 0.3 0.38 0.23 0.35
Sro127_g060920.1 (Contig98.g1179)
1.0 0.3 0.18 0.3 0.32 0.04 0.06 0.08 0.07 0.13 0.22 0.14 0.15 0.11 0.13 0.12 0.34 0.07 0.07 0.1 0.09 0.06 0.08 0.03 0.03 0.03 0.08
Sro127_g061000.1 (Contig98.g1187)
1.0 0.16 0.11 0.13 0.09 0.11 0.07 0.08 0.05 0.11 0.32 0.11 0.04 0.05 0.15 0.12 0.28 0.05 0.04 0.04 0.07 0.02 0.07 0.21 0.07 0.04 0.14
Sro1290_g259860.1 (Contig199.g2325)
1.0 0.1 0.22 0.08 0.06 0.13 0.14 0.12 0.13 0.22 0.21 0.24 0.27 0.22 0.22 0.23 0.16 0.13 0.23 0.23 0.25 0.06 0.12 0.34 0.29 0.17 0.2
Sro1302_g260900.1 (Contig3975.g30527)
1.0 0.19 0.31 0.16 0.12 0.12 0.23 0.15 0.24 0.23 0.31 0.27 0.22 0.25 0.23 0.25 0.22 0.1 0.19 0.24 0.28 0.24 0.2 0.41 0.26 0.2 0.18
Sro1316_g262170.1 (Contig3701.g28505)
1.0 0.14 0.26 0.27 0.15 0.17 0.35 0.25 0.3 0.23 0.53 0.2 0.05 0.12 0.32 0.48 0.47 0.15 0.07 0.1 0.24 0.15 0.19 0.36 0.47 0.23 0.34
Sro1344_g264720.1 (Contig723.g8312)
1.0 0.3 0.23 0.19 0.14 0.06 0.14 0.14 0.26 0.15 0.11 0.13 0.1 0.1 0.09 0.03 0.09 0.19 0.11 0.11 0.2 0.19 0.2 0.05 0.11 0.09 0.07
Sro146_g067560.1 (Contig2363.g19446)
1.0 0.07 0.11 0.08 0.06 0.06 0.11 0.14 0.19 0.19 0.27 0.21 0.18 0.17 0.15 0.1 0.14 0.12 0.14 0.18 0.21 0.05 0.13 0.42 0.1 0.07 0.15
Sro146_g067570.1 (Contig2363.g19447)
1.0 0.15 0.19 0.15 0.12 0.1 0.16 0.12 0.19 0.21 0.28 0.21 0.23 0.18 0.18 0.13 0.12 0.19 0.2 0.24 0.2 0.06 0.16 0.52 0.18 0.07 0.17
Sro146_g067580.1 (Contig2363.g19448)
1.0 0.37 0.6 0.36 0.35 0.06 0.19 0.14 0.28 0.23 0.28 0.19 0.18 0.16 0.2 0.12 0.16 0.14 0.15 0.21 0.21 0.09 0.22 0.5 0.24 0.11 0.15
Sro1516_g279140.1 (Contig3898.g29884)
0.88 0.64 0.54 0.61 0.54 0.26 0.47 0.38 0.63 0.58 0.63 0.78 1.0 0.62 0.5 0.54 0.58 0.56 0.51 0.89 0.54 0.46 0.62 0.42 0.39 0.26 0.38
Sro167_g074380.1 (Contig2973.g23619)
1.0 0.23 0.32 0.24 0.26 0.09 0.15 0.14 0.14 0.21 0.23 0.22 0.19 0.15 0.17 0.2 0.22 0.07 0.13 0.19 0.21 0.08 0.16 0.16 0.12 0.1 0.13
Sro168_g074730.1 (Contig1642.g14804)
1.0 0.13 0.29 0.3 0.26 0.15 0.23 0.33 0.28 0.24 0.4 0.21 0.31 0.2 0.31 0.31 0.28 0.31 0.18 0.24 0.25 0.15 0.3 0.45 0.36 0.19 0.25
1.0 0.08 0.02 0.06 0.07 0.07 0.05 0.09 0.11 0.15 0.07 0.12 0.12 0.13 0.09 0.11 0.1 0.08 0.15 0.2 0.17 0.2 0.08 0.08 0.08 0.06 0.08
Sro16_g011640.1 (Contig916.g9601)
1.0 0.07 0.08 0.17 0.1 0.04 0.35 0.48 0.42 0.44 0.25 0.61 0.21 0.08 0.24 0.13 0.16 0.06 0.06 0.52 0.46 0.22 0.19 0.16 0.21 0.09 0.14
Sro175_g076930.1 (Contig1856.g16209)
1.0 0.38 0.48 0.41 0.38 0.06 0.17 0.2 0.29 0.23 0.18 0.25 0.2 0.17 0.17 0.22 0.2 0.16 0.13 0.23 0.21 0.23 0.29 0.09 0.11 0.13 0.13
Sro176_g077450.1 (Contig203.g2432)
1.0 0.6 0.75 0.58 0.49 0.13 0.26 0.28 0.37 0.55 0.56 0.56 0.29 0.27 0.45 0.58 0.36 0.21 0.3 0.33 0.44 0.16 0.23 0.25 0.13 0.21 0.46
1.0 0.68 0.45 0.47 0.56 0.27 0.2 0.36 0.43 0.35 0.49 0.47 0.43 0.23 0.25 0.13 0.75 0.44 0.27 0.34 0.34 0.12 0.22 0.23 0.16 0.15 0.21
Sro1968_g308400.1 (Contig2992.g23784)
1.0 0.11 0.14 0.16 0.17 0.05 0.09 0.09 0.13 0.11 0.06 0.1 0.14 0.09 0.07 0.05 0.09 0.04 0.07 0.12 0.09 0.09 0.13 0.03 0.05 0.02 0.04
Sro196_g083570.1 (Contig3206.g25353)
1.0 0.4 0.41 0.61 0.52 0.26 0.26 0.27 0.37 0.35 0.54 0.38 0.51 0.38 0.4 0.28 0.59 0.3 0.3 0.35 0.31 0.28 0.34 0.3 0.19 0.2 0.32
Sro1_g000460.1 (Contig3007.g23961)
1.0 0.12 0.23 0.11 0.12 0.04 0.06 0.09 0.06 0.12 0.07 0.16 0.13 0.08 0.07 0.08 0.11 0.06 0.18 0.16 0.14 0.03 0.05 0.13 0.08 0.07 0.06
0.96 0.07 0.01 0.03 0.07 0.11 0.23 0.24 0.29 0.5 0.29 0.49 0.46 0.25 0.31 0.15 0.31 0.22 0.32 1.0 0.43 0.32 0.09 0.14 0.18 0.22 0.26
Sro2223_g319690.1 (Contig2179.g18194)
1.0 0.25 0.24 0.27 0.23 0.15 0.2 0.21 0.22 0.25 0.43 0.26 0.28 0.22 0.29 0.23 0.37 0.18 0.2 0.23 0.27 0.1 0.22 0.3 0.29 0.2 0.24
Sro239_g095870.1 (Contig3063.g24383)
1.0 0.03 0.07 0.35 0.11 0.06 0.1 0.03 0.07 0.24 0.12 0.32 0.48 0.21 0.13 0.15 0.19 0.1 0.23 0.45 0.21 0.27 0.11 0.13 0.16 0.11 0.08
Sro23_g015640.1 (Contig2259.g18714)
1.0 0.3 0.26 0.28 0.28 0.21 0.22 0.26 0.19 0.35 0.33 0.35 0.33 0.18 0.27 0.33 0.37 0.23 0.38 0.35 0.26 0.17 0.2 0.12 0.08 0.16 0.27
Sro255_g100280.1 (Contig2336.g19205)
1.0 0.05 0.08 0.15 0.09 0.09 0.11 0.25 0.16 0.13 0.28 0.11 0.05 0.08 0.17 0.17 0.23 0.27 0.12 0.07 0.16 0.08 0.11 0.18 0.11 0.1 0.18
Sro267_g103320.1 (Contig4506.g33794)
1.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.07 0.08 0.1 0.27 0.06 0.33 0.16 0.12 0.06 0.04 0.03 0.02 0.01 0.41 0.31 0.08 0.04 0.06 0.07 0.04 0.05
Sro3141_g344370.1 (Contig3095.g24656)
1.0 0.1 0.11 0.09 0.1 0.08 0.14 0.15 0.26 0.29 0.24 0.32 0.59 0.2 0.22 0.17 0.31 0.23 0.48 0.68 0.28 0.38 0.26 0.18 0.24 0.21 0.18
Sro3324_g346820.1 (Contig807.g9011)
0.67 0.02 0.01 0.01 0.0 0.05 0.13 0.35 0.25 0.4 0.11 0.5 0.58 0.3 0.13 0.02 0.26 0.07 0.14 1.0 0.35 0.26 0.19 0.03 0.02 0.02 0.07
Sro3378_g347420.1 (Contig2115.g17906)
0.7 0.23 0.3 0.34 0.16 0.08 0.18 0.44 0.39 0.44 0.48 0.51 0.65 0.07 0.26 0.29 0.06 0.23 0.33 1.0 0.31 0.2 0.09 0.33 0.16 0.11 0.25
Sro368_g128040.1 (Contig2761.g22243)
1.0 0.27 0.26 0.24 0.25 0.12 0.17 0.19 0.21 0.27 0.27 0.3 0.33 0.24 0.24 0.24 0.27 0.16 0.21 0.41 0.28 0.23 0.19 0.22 0.11 0.11 0.19
Sro379_g130510.1 (Contig3398.g26568)
1.0 0.01 0.02 0.04 0.01 0.09 0.08 0.12 0.08 0.38 0.17 0.47 0.29 0.21 0.14 0.06 0.12 0.08 0.03 0.31 0.2 0.02 0.04 0.04 0.03 0.05 0.14
Sro409_g137200.1 (Contig1790.g15824)
0.61 0.44 1.0 0.64 0.48 0.21 0.18 0.3 0.5 0.74 0.73 1.0 0.42 0.5 0.49 0.52 0.56 0.19 0.51 0.57 0.89 0.22 0.58 0.28 0.49 0.38 0.59
Sro466_g148820.1 (Contig1164.g11101)
1.0 0.23 0.33 0.37 0.35 0.09 0.17 0.13 0.23 0.24 0.15 0.28 0.27 0.16 0.12 0.08 0.17 0.21 0.23 0.22 0.26 0.21 0.27 0.13 0.18 0.14 0.1
Sro4686_g354460.1 (Contig4449.g33388)
1.0 0.03 0.08 0.09 0.04 0.13 0.21 0.13 0.27 0.23 0.49 0.23 0.05 0.14 0.34 0.51 0.38 0.11 0.05 0.08 0.25 0.02 0.12 0.26 0.24 0.2 0.37
1.0 0.12 0.15 0.15 0.12 0.09 0.21 0.16 0.19 0.16 0.26 0.14 0.25 0.16 0.23 0.22 0.24 0.12 0.09 0.24 0.16 0.09 0.25 0.34 0.14 0.13 0.13
Sro564_g167270.1 (Contig73.g765)
1.0 0.2 0.37 0.26 0.22 0.17 0.11 0.14 0.14 0.17 0.32 0.14 0.21 0.1 0.21 0.19 0.21 0.09 0.15 0.16 0.21 0.16 0.09 0.44 0.24 0.13 0.2
Sro641_g180030.1 (Contig1098.g10647)
0.18 0.03 0.02 0.01 0.01 0.3 0.13 0.06 0.07 0.58 0.49 0.89 0.29 0.22 0.24 0.21 0.35 0.15 0.3 1.0 0.48 0.04 0.05 0.15 0.25 0.13 0.27
Sro67_g037680.1 (Contig495.g6684)
0.34 0.0 0.04 0.0 0.02 0.01 0.01 0.04 0.1 0.6 0.18 1.0 0.05 0.31 0.12 0.16 0.02 0.02 0.06 0.31 0.37 0.06 0.0 0.1 0.0 0.03 0.08
1.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.08 0.08 0.15 0.11 0.13 0.0 0.07 0.14 0.02 0.02 0.03 0.06 0.02 0.03 0.09 0.08 0.14 0.08 0.03 0.0 0.0 0.01
Sro72_g039780.1 (Contig1459.g13377)
0.58 0.03 0.02 0.05 0.04 0.07 0.13 0.08 0.43 0.5 0.48 0.93 1.0 0.13 0.29 0.14 0.29 0.0 0.0 0.64 0.25 0.16 0.22 0.06 0.04 0.13 0.39
1.0 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.02 0.11 0.11 0.07 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.06 0.06 0.02 0.12 0.08 0.02 0.01 0.01 0.01
Sro773_g200370.1 (Contig1379.g12680)
1.0 0.22 0.34 0.28 0.24 0.16 0.25 0.13 0.27 0.25 0.31 0.28 0.09 0.17 0.28 0.34 0.29 0.07 0.06 0.07 0.25 0.05 0.21 0.18 0.17 0.12 0.25
Sro816_g206690.1 (Contig51.g374)
1.0 0.4 0.27 0.22 0.28 0.03 0.17 0.21 0.28 0.21 0.05 0.15 0.22 0.06 0.1 0.05 0.03 0.17 0.26 0.26 0.22 0.18 0.17 0.12 0.2 0.09 0.06
Sro816_g206700.1 (Contig51.g375)
1.0 0.21 0.11 0.12 0.16 0.03 0.13 0.17 0.21 0.19 0.05 0.17 0.19 0.1 0.07 0.05 0.04 0.18 0.24 0.24 0.17 0.15 0.14 0.1 0.1 0.07 0.05
Sro822_g207490.1 (Contig2051.g17593)
1.0 0.23 0.26 0.22 0.23 0.14 0.22 0.24 0.22 0.41 0.3 0.41 0.5 0.34 0.28 0.21 0.29 0.35 0.48 0.65 0.5 0.24 0.23 0.17 0.13 0.19 0.23
Sro823_g207580.1 (Contig3379.g26445)
1.0 0.15 0.11 0.16 0.12 0.06 0.08 0.05 0.05 0.14 0.13 0.08 0.26 0.09 0.1 0.09 0.07 0.18 0.25 0.35 0.13 0.04 0.04 0.14 0.09 0.09 0.06
Sro856_g211570.1 (Contig4173.g31828)
1.0 0.63 0.25 0.16 0.1 0.01 0.04 0.03 0.1 0.12 0.07 0.08 0.04 0.08 0.03 0.02 0.11 0.03 0.05 0.06 0.17 0.07 0.07 0.08 0.09 0.04 0.02
Sro880_g215110.1 (Contig3977.g30549)
1.0 0.2 0.26 0.29 0.27 0.1 0.13 0.12 0.16 0.25 0.23 0.34 0.28 0.21 0.18 0.17 0.25 0.19 0.21 0.31 0.2 0.08 0.16 0.1 0.11 0.08 0.13
Sro898_g217670.1 (Contig2959.g23523)
1.0 0.16 0.22 0.37 0.1 0.21 0.81 0.58 0.81 0.74 0.91 0.99 0.54 0.18 0.41 0.55 0.59 0.28 0.27 0.99 0.61 0.18 0.52 0.63 0.29 0.26 0.48
Sro904_g218430.1 (Contig2814.g22580)
0.25 0.04 0.02 0.03 0.03 0.1 0.42 0.26 0.31 0.65 0.87 0.89 0.73 0.37 0.32 0.2 0.48 0.1 0.23 1.0 0.56 0.06 0.19 0.51 0.44 0.3 0.35
Sro91_g047570.1 (Contig190.g2208)
1.0 0.05 0.09 0.02 0.02 0.13 0.13 0.08 0.07 0.34 0.1 0.39 0.4 0.08 0.08 0.09 0.06 0.04 0.13 0.87 0.5 0.1 0.04 0.2 0.45 0.29 0.05
Sro926_g220970.1 (Contig4614.g34422)
1.0 0.16 0.26 0.2 0.16 0.07 0.15 0.17 0.19 0.23 0.33 0.26 0.39 0.27 0.21 0.18 0.22 0.11 0.19 0.28 0.18 0.09 0.11 0.24 0.18 0.19 0.2
Sro968_g225920.1 (Contig1973.g16867)
1.0 0.08 0.18 0.2 0.14 0.26 0.25 0.3 0.21 0.28 0.38 0.35 0.12 0.26 0.3 0.33 0.29 0.13 0.1 0.1 0.26 0.07 0.16 0.32 0.32 0.26 0.24
Sro970_g226310.1 (Contig1965.g16827)
0.08 0.21 0.32 0.3 0.26 0.08 0.45 0.43 0.58 0.39 0.22 0.47 0.86 0.26 0.24 0.18 0.22 0.16 0.22 1.0 0.28 0.3 0.45 0.12 0.11 0.1 0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)