Heatmap: Cluster_319 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1049_g235380.1 (Contig3572.g27593)	0.03	0.15	0.1	0.09	0.07	0.32	0.38	0.35	0.14	0.55	0.41	0.48	0.42	0.79	0.49	0.35	0.33	0.42	0.24	0.67	0.79	0.13	0.09	0.61	1.0	0.63	0.45
Sro1144_g246110.1 (Contig3141.g24940)	0.03	0.07	0.0	0.01	0.0	0.14	0.6	0.22	0.11	0.55	0.18	0.37	0.58	0.88	0.65	0.32	0.13	0.81	0.36	1.0	0.76	0.03	0.16	0.51	0.69	0.45	0.15
Sro120_g058430.1 (Contig2411.g19721)	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.5	0.41	0.35	0.07	0.38	0.3	0.32	0.1	0.06	0.43	0.72	0.4	0.3	0.11	0.22	0.41	0.02	0.03	0.82	1.0	0.42	0.27
Sro1221_g253650.1 (Contig1854.g16189)	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.24	0.41	0.46	0.19	0.56	0.48	0.55	0.21	0.29	0.69	0.95	0.55	0.93	0.29	0.26	0.97	0.03	0.09	0.79	1.0	0.34	0.39
Sro1267_g257730.1 (Contig3174.g25106)	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.6	0.47	0.32	0.41	0.51	0.39	0.54	0.1	0.8	0.93	0.4	0.83	0.3	0.62	0.87	0.05	0.25	0.82	1.0	0.51	0.47
Sro128_g061010.1 (Contig1654.g14877)	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.16	0.63	0.26	0.21	0.51	0.21	0.54	0.32	0.24	0.36	0.52	0.21	0.51	0.43	0.39	1.0	0.15	0.14	0.45	0.63	0.41	0.28
Sro1290_g259810.1 (Contig199.g2320)	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.1	0.65	0.09	0.12	0.53	0.64	0.6	0.57	0.7	0.56	0.56	0.23	0.5	0.36	1.0	0.96	0.12	0.05	0.44	0.44	0.39	0.27
Sro1359_g265970.1 (Contig4457.g33480)	0.01	0.05	0.04	0.04	0.03	0.42	0.4	0.33	0.16	0.5	0.4	0.43	0.3	0.45	0.6	0.44	0.44	1.0	0.55	0.58	0.73	0.05	0.11	0.53	0.9	0.43	0.27
Sro1431_g272030.1 (Contig2472.g20223)	0.0	0.05	0.05	0.0	0.02	0.01	0.42	0.11	0.04	0.39	0.16	0.23	0.53	0.86	0.46	0.45	0.37	0.33	0.14	0.74	0.82	0.01	0.03	0.53	1.0	0.4	0.18
Sro1451_g273870.1 (Contig4314.g32538)	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.18	0.59	0.46	0.32	0.46	0.64	0.54	0.6	0.45	0.77	0.85	0.43	0.98	0.36	0.49	0.71	0.09	0.28	0.86	1.0	0.53	0.37
Sro156_g070670.1 (Contig473.g6405)	0.01	0.17	0.13	0.18	0.13	0.17	0.5	0.44	0.31	0.4	0.42	0.38	0.74	0.27	0.65	1.0	0.27	0.78	0.24	0.48	0.51	0.11	0.19	0.5	0.49	0.31	0.35
Sro173_g076410.1 (Contig2926.g23322)	0.01	0.58	0.24	0.03	0.02	0.07	0.25	0.18	0.04	0.2	0.22	0.2	0.26	0.03	0.47	0.39	0.12	0.48	0.18	0.3	0.24	0.01	0.08	0.78	1.0	0.51	0.25
Sro186_g080580.1 (Contig266.g3339)	0.0	0.03	0.03	0.01	0.02	0.2	0.68	0.42	0.18	0.47	0.48	0.46	0.4	0.63	0.59	0.59	0.41	0.79	0.38	0.48	0.76	0.17	0.16	0.74	1.0	0.39	0.35
Sro197_g083740.1 (Contig3509.g27179)	0.0	0.07	0.01	0.0	0.0	0.07	0.44	0.07	0.03	0.5	0.22	0.67	0.5	0.44	0.52	0.26	0.23	0.16	0.19	0.73	0.9	0.06	0.02	0.42	1.0	0.39	0.28
Sro2054_g312750.1 (Contig1163.g11088)	0.02	0.09	0.05	0.05	0.02	0.48	0.64	0.48	0.13	0.42	0.31	0.42	0.11	0.38	0.58	0.59	0.2	0.27	0.04	0.08	0.63	0.03	0.17	1.0	0.89	0.6	0.46
Sro2134_g315950.1 (Contig2353.g19340)	0.02	0.02	0.03	0.01	0.0	0.09	0.64	0.17	0.1	0.61	0.23	0.6	0.8	1.0	0.56	0.4	0.2	0.46	0.25	0.71	0.87	0.04	0.08	0.54	0.75	0.39	0.21
Sro2161_g317120.1 (Contig4631.g34545)	0.03	0.1	0.06	0.08	0.08	0.39	0.58	0.34	0.31	0.54	0.56	0.7	0.46	0.46	0.67	0.89	0.44	0.76	0.36	0.51	0.83	0.09	0.27	0.64	1.0	0.47	0.41
Sro217_g089810.1 (Contig1718.g15355)	0.04	0.23	0.11	0.1	0.06	0.26	0.55	0.49	0.21	0.52	0.59	0.59	0.3	0.52	0.73	0.86	0.68	0.86	0.37	0.33	0.67	0.05	0.18	0.98	1.0	0.4	0.43
Sro2202_g318910.1 (Contig2558.g20800)	0.0	0.16	0.14	0.17	0.34	0.13	0.61	0.33	0.07	0.47	0.26	0.34	0.49	0.65	0.74	0.97	0.05	0.47	0.19	0.49	0.49	0.08	0.15	0.71	1.0	0.24	0.3
Sro2212_g319240.1 (Contig1531.g13919)	0.01	0.02	0.01	0.02	0.0	0.51	0.63	0.42	0.12	0.62	0.21	0.61	0.41	0.84	0.86	1.0	0.22	0.86	0.33	0.39	0.98	0.12	0.11	0.85	0.93	0.62	0.31
Sro2286_g321990.1 (Contig20.g151)	0.01	0.37	0.32	0.28	0.35	0.42	0.85	0.23	0.17	0.69	0.74	0.85	0.42	0.9	0.78	0.66	0.56	0.39	0.28	0.67	0.7	0.16	0.19	1.0	0.93	0.72	0.78
Sro2380_g325460.1 (Contig3899.g29889)	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.28	0.72	0.33	0.19	0.58	0.27	0.75	0.57	0.88	0.6	0.42	0.21	0.92	0.33	0.76	0.68	0.25	0.18	0.9	1.0	0.54	0.3
Sro2380_g325470.1 (Contig3899.g29890)	0.03	0.04	0.01	0.03	0.0	0.5	0.7	0.27	0.14	0.5	0.24	0.53	0.58	0.68	0.51	0.27	0.23	0.67	0.31	0.61	0.6	0.42	0.19	0.7	1.0	0.44	0.19
Sro25_g016990.1 (Contig1417.g13038)	0.04	0.07	0.08	0.07	0.12	0.37	0.71	0.37	0.19	0.63	0.26	0.69	0.38	0.77	0.58	0.56	0.32	0.42	0.17	0.49	0.87	0.14	0.13	0.69	1.0	0.47	0.41
Sro272_g104800.1 (Contig2144.g18021)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.37	0.58	0.27	0.16	0.34	0.41	0.18	0.23	0.2	0.58	0.44	0.28	0.62	0.24	0.2	0.56	0.18	0.08	0.5	1.0	0.44	0.4
Sro273_g105070.1 (Contig4205.g31988)	0.01	0.05	0.04	0.02	0.01	0.43	0.43	0.31	0.09	0.5	0.27	0.76	0.44	0.43	0.39	0.33	0.22	0.55	0.27	0.5	0.87	0.13	0.1	0.61	1.0	0.52	0.22
Sro285_g108080.1 (Contig491.g6614)	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.14	0.5	0.04	0.07	0.48	0.31	0.51	0.57	0.86	0.59	0.56	0.11	0.39	0.27	0.82	1.0	0.04	0.04	0.28	0.34	0.12	0.18
Sro2948_g340820.1 (Contig2871.g22977)	0.02	0.18	0.14	0.06	0.06	0.7	0.62	0.45	0.12	0.58	0.82	0.52	0.13	0.29	0.78	1.0	0.8	0.35	0.17	0.18	0.69	0.07	0.08	0.99	0.69	0.73	0.65
Sro2967_g341140.1 (Contig4428.g33229)	0.02	0.15	0.08	0.12	0.07	0.26	0.41	0.46	0.24	0.31	0.49	0.25	0.53	0.37	0.63	0.69	0.56	0.72	0.29	0.37	0.46	0.15	0.21	0.69	1.0	0.54	0.37
Sro2_g001390.1 (Contig467.g6297)	0.01	0.02	0.0	0.08	0.01	0.12	0.55	0.08	0.09	0.34	0.23	0.32	1.0	0.53	0.31	0.2	0.18	0.28	0.16	0.59	0.43	0.16	0.06	0.26	0.32	0.2	0.14
Sro30_g019610.1 (Contig3962.g30361)	0.01	0.56	0.6	0.25	0.32	0.3	0.46	0.18	0.08	0.64	0.7	0.77	0.3	0.91	0.77	0.7	0.49	0.36	0.31	0.39	1.0	0.03	0.06	0.65	0.94	0.43	0.55
Sro323_g117210.1 (Contig364.g4902)	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.04	0.49	0.15	0.08	0.47	0.28	0.54	0.54	0.95	0.54	0.7	0.12	0.41	0.22	0.61	1.0	0.24	0.08	0.34	0.63	0.16	0.17
Sro353_g124520.1 (Contig1923.g16586)	0.06	0.05	0.0	0.01	0.0	0.17	0.57	0.21	0.11	0.66	0.33	0.76	0.66	0.83	0.44	0.47	0.31	0.53	0.44	0.96	1.0	0.35	0.08	0.61	0.82	0.71	0.25
Sro355_g125150.1 (Contig2977.g23673)	0.01	0.12	0.06	0.19	0.26	0.41	0.76	0.43	0.2	0.54	0.84	0.58	0.67	0.5	0.72	0.61	0.62	0.44	0.27	0.5	0.55	0.11	0.18	1.0	0.5	0.28	0.69
Sro383_g131330.1 (Contig132.g1498)	0.01	0.12	0.08	0.08	0.06	0.19	0.73	0.44	0.23	0.48	0.39	0.49	0.52	0.48	0.41	0.51	0.32	0.52	0.37	0.49	0.6	0.11	0.28	1.0	0.85	0.57	0.51
Sro3870_g351610.1 (Contig1030.g10252)	0.0	0.01	0.02	0.01	0.0	0.12	0.25	0.14	0.07	0.08	0.32	0.03	0.07	0.0	0.61	0.31	0.3	0.29	0.04	0.05	0.09	0.0	0.03	0.7	1.0	0.64	0.2
Sro389_g132640.1 (Contig669.g7881)	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.08	0.47	0.43	0.09	0.6	0.34	1.0	0.57	0.73	0.67	0.54	0.2	0.49	0.36	0.64	1.0	0.13	0.03	0.37	0.85	0.29	0.22
Sro4012_g352510.1 (Contig1059.g10389)	0.0	0.17	0.05	0.21	0.0	0.02	0.66	0.25	0.09	0.59	0.09	0.61	0.73	0.79	0.67	0.71	0.18	0.67	0.39	0.84	1.0	0.1	0.02	0.51	0.7	0.38	0.21
Sro559_g166520.1 (Contig536.g6968)	0.04	0.12	0.12	0.13	0.06	0.4	0.57	0.38	0.22	0.46	0.64	0.52	0.66	0.41	0.73	0.85	0.5	0.67	0.27	0.44	0.6	0.17	0.25	0.86	1.0	0.58	0.43
Sro581_g170370.1 (Contig2661.g21542)	0.01	0.04	0.04	0.03	0.05	0.87	0.54	0.5	0.08	0.49	0.55	0.47	0.19	0.1	0.76	1.0	0.51	0.62	0.21	0.19	0.42	0.02	0.07	0.43	0.22	0.13	0.69
Sro618_g176160.1 (Contig3757.g28809)	0.01	0.04	0.03	0.05	0.04	0.27	0.66	0.28	0.19	0.57	0.28	0.77	0.38	0.45	0.37	0.55	0.23	0.52	0.27	0.5	1.0	0.16	0.13	0.75	0.87	0.49	0.24
Sro618_g176220.1 (Contig3757.g28815)	0.02	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.49	0.27	0.14	0.18	0.28	0.09	0.31	0.06	0.53	0.47	0.36	0.69	0.24	0.34	0.25	0.01	0.1	1.0	0.95	0.62	0.34
Sro65_g036690.1 (Contig155.g1739)	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.18	0.67	0.47	0.2	0.47	0.49	0.5	0.43	0.62	0.64	0.89	0.33	0.52	0.23	0.39	0.74	0.03	0.18	0.62	1.0	0.36	0.36
Sro65_g036800.1 (Contig155.g1750)	0.11	0.43	0.2	0.2	0.15	0.21	0.43	0.21	0.07	0.29	0.44	0.35	0.2	0.19	0.56	0.48	0.21	0.44	0.11	0.22	0.39	0.09	0.14	1.0	0.95	0.56	0.33
Sro68_g038100.1 (Contig2027.g17391)	0.03	0.58	0.38	0.36	0.34	0.15	0.36	0.25	0.12	0.52	0.5	0.52	0.26	0.53	0.59	1.0	0.27	0.39	0.45	0.48	0.7	0.28	0.11	0.41	0.52	0.5	0.43
Sro70_g039150.1 (Contig3352.g26262)	0.02	0.05	0.03	0.02	0.01	0.38	0.71	0.47	0.2	0.51	0.41	0.6	0.28	0.41	0.58	0.51	0.35	0.62	0.19	0.3	0.89	0.06	0.19	0.74	1.0	0.41	0.34
Sro744_g196170.1 (Contig393.g5316)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.78	0.24	0.4	0.61	0.12	0.76	0.57	0.43	0.5	0.2	0.05	0.42	0.34	0.89	1.0	0.34	0.16	0.37	0.48	0.52	0.21
Sro75_g041140.1 (Contig2656.g21486)	0.02	0.01	0.01	0.0	0.0	0.26	0.74	0.6	0.34	0.48	0.47	0.49	0.39	0.61	0.8	0.72	0.42	0.56	0.14	0.37	1.0	0.11	0.36	0.84	0.94	0.48	0.32
Sro81_g043360.1 (Contig1318.g12165)	0.0	0.06	0.05	0.05	0.02	0.32	0.5	0.38	0.18	0.37	0.26	0.45	0.39	0.27	0.39	0.26	0.19	0.66	0.28	0.4	0.75	0.15	0.16	0.57	1.0	0.48	0.32
Sro870_g213710.1 (Contig1807.g15941)	0.02	0.39	0.21	0.13	0.1	0.49	0.44	0.39	0.13	0.38	0.43	0.42	0.24	0.36	0.54	0.44	0.51	0.58	0.29	0.3	0.59	0.05	0.2	0.75	1.0	0.53	0.38
Sro880_g215060.1 (Contig3977.g30544)	0.01	0.02	0.02	0.0	0.02	0.24	0.39	0.41	0.06	0.37	0.3	0.32	0.36	0.8	0.38	0.17	0.31	0.46	0.25	0.57	0.5	0.14	0.05	0.48	1.0	0.67	0.15
Sro8_g006470.1 (Contig89.g960)	0.01	0.1	0.09	0.09	0.07	0.45	0.67	0.45	0.24	0.43	0.6	0.39	0.44	0.23	0.69	0.84	0.54	0.62	0.26	0.32	0.64	0.03	0.19	0.87	1.0	0.56	0.52
Sro913_g219450.1 (Contig577.g7326)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.26	0.58	0.25	0.25	0.35	0.59	0.23	0.63	0.29	0.98	1.0	0.4	0.34	0.19	0.45	0.65	0.06	0.15	0.61	0.95	0.61	0.56
Sro940_g222540.1 (Contig4646.g34612)	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.25	0.48	0.36	0.08	0.44	0.23	0.34	0.24	0.67	0.49	0.56	0.25	0.6	0.26	0.44	0.7	0.16	0.11	0.81	1.0	0.57	0.44
Sro98_g050270.1 (Contig3362.g26319)	0.01	0.04	0.02	0.01	0.0	0.78	0.73	0.48	0.12	0.4	0.53	0.2	0.26	0.05	0.67	0.85	0.38	0.5	0.13	0.25	0.57	0.05	0.06	0.91	1.0	0.54	0.54

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)