1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_325 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1014_g231460.1 (Contig3403.g26589)
 0.01 0.27 1.0 0.55 0.34 0.05 0.14 0.27 0.24 0.11 0.28 0.06 0.09 0.13 0.21 0.14 0.32 0.05 0.06 0.09 0.04 0.18 0.17 0.07 0.08 0.09 0.23
Sro1184_g250120.1 (Contig2400.g19657)
 0.01 0.7 0.77 0.64 0.71 0.51 0.48 0.54 0.59 0.42 1.0 0.59 0.52 0.59 0.68 0.5 0.99 0.21 0.3 0.34 0.36 0.31 0.56 0.56 0.29 0.25 0.55
Sro118_g057720.1 (Contig2714.g21842)
 0.01 0.02 0.03 0.01 0.02 0.25 0.13 0.02 1.0 0.25 0.11 0.26 0.41 0.14 0.12 0.01 0.31 0.03 0.05 0.68 0.21 0.94 0.25 0.04 0.04 0.45 0.22
Sro1242_g255480.1 (Contig1008.g10128)
 0.01 0.18 0.44 0.68 0.78 0.5 0.06 1.0 0.89 0.35 0.47 0.46 0.12 0.09 0.34 0.4 0.52 0.11 0.27 0.07 0.21 0.54 0.35 0.19 0.35 0.7 0.47
Sro1242_g255490.1 (Contig1008.g10129)
 0.0 0.21 0.37 0.48 0.47 0.22 0.05 0.89 1.0 0.21 0.3 0.3 0.05 0.05 0.22 0.17 0.19 0.05 0.11 0.02 0.12 0.59 0.41 0.16 0.25 0.48 0.31
Sro1242_g255510.1 (Contig1008.g10131)
 0.01 0.4 0.46 0.27 0.27 0.17 0.53 0.5 1.0 0.13 0.09 0.06 0.08 0.04 0.17 0.01 0.19 0.06 0.09 0.04 0.03 0.45 0.76 0.25 0.16 0.17 0.09
Sro1497_g277590.1 (Contig4331.g32653)
 0.0 0.3 0.73 1.0 0.65 0.04 0.13 0.21 0.29 0.08 0.13 0.04 0.06 0.13 0.09 0.1 0.33 0.21 0.16 0.03 0.01 0.42 0.19 0.01 0.02 0.08 0.13
Sro1501_g277920.1 (Contig2462.g20155)
 0.03 1.0 0.87 0.72 0.38 0.32 0.4 0.23 0.66 0.6 0.55 0.82 0.43 0.37 0.41 0.4 0.57 0.36 0.51 0.59 0.69 0.51 0.43 0.31 0.56 0.52 0.61
Sro1615_g286180.1 (Contig3649.g28191)
 0.0 0.22 0.21 0.19 0.26 0.09 0.36 1.0 0.92 0.11 0.16 0.13 0.28 0.14 0.16 0.05 0.33 0.41 0.22 0.1 0.1 0.29 0.55 0.28 0.15 0.11 0.05
Sro1625_g286730.1 (Contig1487.g13588)
 0.0 0.54 0.79 0.64 0.55 0.39 0.39 0.66 0.69 0.59 0.77 0.52 0.78 0.78 0.69 0.65 1.0 0.77 0.81 0.98 0.54 0.76 0.59 0.37 0.23 0.56 0.63
Sro189_g081590.1 (Contig744.g8523)
 0.02 1.0 0.91 0.66 0.75 0.29 0.64 0.84 0.64 0.57 0.74 0.65 0.61 0.57 0.7 0.69 0.97 0.64 0.57 0.42 0.53 0.58 0.6 0.49 0.29 0.3 0.59
Sro189_g081600.1 (Contig744.g8524)
 0.01 0.83 0.71 0.71 0.78 0.29 0.51 0.82 0.68 0.45 0.82 0.49 1.0 0.71 0.64 0.52 0.98 0.62 0.43 0.63 0.45 0.73 0.62 0.26 0.13 0.22 0.5
Sro1910_g304880.1 (Contig1302.g12092)
 0.02 0.51 0.62 0.72 0.76 0.38 0.56 0.86 0.9 0.42 0.61 0.5 0.51 0.48 0.55 0.49 0.75 1.0 0.76 0.37 0.45 0.46 0.87 0.27 0.17 0.38 0.51
Sro199_g084500.1 (Contig257.g3188)
 0.19 0.26 0.45 0.6 0.51 0.25 0.56 0.55 0.58 0.32 0.43 0.29 0.54 0.31 0.35 0.32 0.48 1.0 0.5 0.46 0.4 0.28 0.61 0.27 0.33 0.38 0.31
Sro2107_g314830.1 (Contig4155.g31727)
 0.01 0.42 0.73 0.67 0.68 0.48 0.4 0.94 0.87 0.27 0.56 0.22 0.78 0.3 0.46 0.29 1.0 0.76 0.58 0.5 0.11 0.52 0.67 0.34 0.24 0.59 0.46
Sro224_g091520.1 (Contig758.g8606)
 0.02 0.79 0.95 0.74 0.74 0.52 0.62 1.0 0.97 0.44 0.64 0.47 0.69 0.51 0.6 0.41 0.79 0.81 0.89 0.37 0.43 0.52 0.82 0.56 0.2 0.27 0.5
Sro2309_g322790.1 (Contig1964.g16824)
 0.02 0.47 0.69 0.49 0.32 0.48 0.31 0.6 0.84 0.26 0.92 0.25 0.8 0.1 0.39 0.32 1.0 0.2 0.29 0.35 0.12 0.3 0.53 0.33 0.06 0.3 0.4
Sro232_g094010.1 (Contig4063.g31166)
 0.0 0.71 0.73 0.75 0.78 0.41 0.46 0.7 0.82 0.46 1.0 0.49 0.51 0.48 0.56 0.33 0.84 0.39 0.46 0.45 0.33 0.49 0.61 0.46 0.28 0.49 0.61
Sro2396_g326010.1 (Contig3316.g26026)
 0.34 0.65 0.59 0.96 0.85 0.14 0.22 0.37 0.48 0.17 0.28 0.08 0.26 0.06 0.16 0.12 0.63 1.0 0.53 0.26 0.05 0.13 0.57 0.07 0.08 0.18 0.22
Sro2472_g328670.1 (Contig2276.g18888)
 0.16 0.29 0.34 0.18 0.15 0.26 0.13 0.32 0.71 0.37 0.39 0.39 0.56 0.77 0.39 0.27 1.0 0.09 0.24 0.79 0.3 0.22 0.26 0.16 0.14 0.33 0.26
Sro2522_g330210.1 (Contig3995.g30669)
 0.0 0.16 0.22 0.11 0.24 0.0 0.04 1.0 0.51 0.03 0.28 0.0 0.05 0.02 0.09 0.04 0.05 0.36 0.15 0.03 0.0 0.45 0.47 0.13 0.05 0.02 0.05
Sro2607_g332450.1 (Contig1442.g13260)
 0.03 0.69 0.75 0.42 0.36 0.2 0.22 0.6 0.5 0.28 0.65 0.15 0.36 0.14 0.29 0.09 0.6 0.72 1.0 0.83 0.13 0.87 0.44 0.13 0.13 0.36 0.54
Sro2711_g335270.1 (Contig2102.g17857)
 0.07 0.29 0.37 0.26 0.27 0.47 0.45 0.94 0.78 0.29 0.62 0.29 0.23 0.23 0.38 0.5 1.0 0.26 0.17 0.2 0.41 0.58 0.76 0.23 0.22 0.33 0.45
0.02 0.52 0.43 0.44 0.59 0.02 0.5 0.79 1.0 0.18 0.23 0.14 0.44 0.19 0.25 0.23 0.62 0.45 0.36 0.3 0.08 0.53 0.9 0.18 0.41 0.43 0.26
Sro288_g108910.1 (Contig62.g511)
 0.04 0.05 0.02 0.02 0.04 0.44 0.55 0.13 0.69 0.36 0.42 0.49 0.23 0.23 0.29 0.06 0.85 0.02 0.03 0.39 0.29 1.0 0.39 0.02 0.02 0.59 0.29
Sro2925_g340370.1 (Contig505.g6743)
 0.1 0.52 0.63 0.38 0.42 0.16 0.27 0.29 0.33 0.37 0.18 0.22 0.21 0.4 0.34 0.23 0.2 0.64 1.0 0.27 0.23 0.62 0.36 0.79 0.51 0.48 0.18
0.01 0.35 0.45 0.28 0.28 0.09 0.58 1.0 0.89 0.19 0.18 0.19 0.38 0.07 0.17 0.13 0.15 0.29 0.29 0.32 0.17 0.58 0.6 0.31 0.49 0.2 0.12
Sro3018_g342160.1 (Contig1743.g15533)
 0.0 0.58 0.87 0.84 0.83 0.26 0.4 0.54 0.58 0.34 0.41 0.31 0.52 0.34 0.44 0.55 0.47 1.0 0.87 0.33 0.38 0.38 0.65 0.34 0.23 0.3 0.38
Sro313_g114780.1 (Contig1770.g15653)
 0.0 0.1 0.11 0.1 0.11 0.21 0.25 0.46 0.64 0.14 1.0 0.08 0.3 0.09 0.33 0.26 0.66 0.24 0.22 0.25 0.04 0.31 0.46 0.06 0.08 0.29 0.44
Sro34_g022000.1 (Contig4590.g34303)
 0.05 0.75 0.82 0.96 1.0 0.28 0.28 0.66 0.7 0.25 0.51 0.19 0.34 0.25 0.38 0.25 0.82 0.8 0.61 0.22 0.13 0.65 0.58 0.29 0.25 0.48 0.34
Sro373_g128930.1 (Contig1347.g12378)
 0.02 0.63 1.0 0.83 0.48 0.71 0.4 0.42 0.9 0.37 0.32 0.4 0.23 0.42 0.22 0.08 0.87 0.24 0.26 0.29 0.49 0.96 0.99 0.15 0.18 0.61 0.31
Sro389_g132710.1 (Contig669.g7888)
 0.03 0.57 0.78 0.45 0.56 0.07 0.15 0.27 0.56 0.22 0.18 0.18 0.78 0.37 0.19 0.24 0.3 1.0 0.49 0.53 0.13 0.48 0.35 0.54 0.47 0.3 0.11
Sro420_g139240.1 (Contig1861.g16267)
 0.0 0.5 0.89 0.7 0.45 0.14 0.66 1.0 0.99 0.25 0.38 0.23 0.17 0.22 0.34 0.35 0.55 0.43 0.36 0.18 0.29 0.56 0.83 0.17 0.17 0.35 0.33
Sro452_g145840.1 (Contig1249.g11663)
 0.01 0.12 0.22 0.11 0.11 1.0 0.05 0.1 0.76 0.18 0.26 0.32 0.03 0.14 0.23 0.0 0.58 0.12 0.14 0.08 0.23 0.79 0.54 0.12 0.09 0.27 0.19
Sro468_g149250.1 (Contig3973.g30519)
 0.07 0.06 0.11 0.1 0.1 0.02 0.22 0.66 1.0 0.11 0.29 0.21 0.04 0.25 0.14 0.17 0.16 0.11 0.07 0.02 0.22 0.4 0.47 0.26 0.32 0.25 0.1
0.0 0.04 0.23 0.05 0.15 0.02 0.02 0.0 0.46 0.14 0.0 0.19 0.01 0.01 0.03 0.0 0.33 0.06 0.05 0.02 0.17 1.0 0.68 0.0 0.06 0.32 0.19
Sro504_g156060.1 (Contig4263.g32272)
 0.0 1.0 0.98 0.98 0.79 0.61 0.18 0.83 1.0 0.32 0.32 0.2 0.34 0.38 0.35 0.09 0.33 0.1 0.22 0.41 0.23 0.37 0.48 0.18 0.11 0.59 0.33
Sro50_g029140.1 (Contig297.g3902)
 0.03 0.44 0.42 0.39 0.33 0.18 0.25 0.72 0.97 0.25 0.23 0.29 0.47 0.26 0.25 0.14 0.22 0.33 0.41 0.37 0.32 0.21 1.0 0.28 0.09 0.11 0.14
Sro53_g031340.1 (Contig1592.g14474)
 0.0 0.13 0.09 0.08 0.06 0.33 0.16 0.16 0.63 0.17 0.29 0.08 0.13 0.14 0.29 0.05 0.36 0.2 0.22 0.17 0.15 1.0 0.71 0.22 0.09 0.23 0.27
Sro540_g162920.1 (Contig4704.g34981)
 0.0 0.34 1.0 0.66 0.48 0.08 0.11 0.48 0.51 0.09 0.38 0.07 0.18 0.05 0.15 0.11 0.45 0.16 0.13 0.12 0.02 0.42 0.22 0.02 0.02 0.09 0.16
Sro548_g164490.1 (Contig1714.g15329)
 0.0 0.42 1.0 0.83 0.65 0.11 0.14 0.3 0.24 0.09 0.19 0.07 0.08 0.04 0.13 0.05 0.42 0.09 0.08 0.07 0.04 0.28 0.22 0.06 0.03 0.07 0.13
0.1 0.75 1.0 0.81 0.83 0.09 0.46 0.81 0.81 0.28 0.33 0.18 0.43 0.21 0.33 0.32 0.25 0.43 0.43 0.28 0.2 0.63 0.92 0.23 0.14 0.13 0.24
Sro58_g033790.1 (Contig64.g573)
 0.0 0.26 0.34 0.16 0.26 0.52 0.06 0.6 0.81 0.18 0.34 0.22 0.07 0.03 0.25 0.08 1.0 0.06 0.31 0.08 0.17 0.91 0.58 0.23 0.08 0.46 0.27
Sro58_g033850.1 (Contig64.g579)
 0.02 0.43 0.52 0.48 0.44 0.13 0.38 0.57 0.6 0.2 0.46 0.15 0.42 0.21 0.29 0.3 0.34 1.0 0.76 0.32 0.09 0.23 0.54 0.35 0.18 0.34 0.27
Sro62_g035330.1 (Contig2718.g21914)
 0.0 0.7 0.66 0.57 0.58 0.37 0.26 0.83 0.7 0.35 1.0 0.28 0.69 0.41 0.52 0.3 0.9 0.49 0.6 0.49 0.3 0.86 0.52 0.23 0.12 0.32 0.73
Sro650_g181420.1 (Contig647.g7758)
 0.01 0.3 0.47 0.27 0.23 0.11 0.67 0.55 1.0 0.16 0.11 0.1 0.06 0.05 0.22 0.02 0.24 0.04 0.1 0.05 0.07 0.4 0.84 0.29 0.19 0.25 0.12
Sro666_g184020.1 (Contig1358.g12521)
 0.0 0.52 0.54 0.46 0.55 0.28 0.3 1.0 0.84 0.33 0.64 0.46 0.59 0.46 0.53 0.52 0.67 0.67 0.44 0.33 0.28 0.67 0.71 0.26 0.31 0.33 0.47
Sro875_g214420.1 (Contig1071.g10441)
 0.0 0.68 1.0 0.56 0.53 0.14 0.24 0.52 0.38 0.22 0.34 0.17 0.27 0.17 0.33 0.54 0.71 0.26 0.18 0.2 0.28 0.3 0.37 0.11 0.12 0.11 0.35
Sro9_g007020.1 (Contig4120.g31470)
 0.01 0.47 0.71 0.57 0.46 0.39 0.45 0.62 0.85 0.58 1.0 0.64 0.52 0.47 0.77 0.65 0.87 0.36 0.39 0.49 0.54 0.64 0.45 0.64 0.53 0.52 0.77

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)