Heatmap: Cluster_337 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1022_g232350.1 (Contig2862.g22949)
0.04 0.08 0.02 0.0 0.03 0.07 0.54 0.27 0.18 0.57 0.41 0.7 0.5 0.68 0.6 0.94 0.32 0.57 0.45 1.0 0.75 0.06 0.13 0.3 0.21 0.26 0.3
Sro104_g052860.1 (Contig1278.g11929)
0.03 0.16 0.1 0.1 0.11 0.22 0.43 0.3 0.26 0.57 0.46 0.72 0.75 0.54 0.44 0.49 0.39 0.42 0.55 1.0 0.72 0.32 0.24 0.43 0.42 0.33 0.33
Sro1072_g238010.1 (Contig2124.g17931)
0.02 0.03 0.1 0.03 0.04 0.13 0.34 0.2 0.14 0.52 0.43 0.65 0.84 0.37 0.42 0.43 0.24 0.44 0.62 1.0 0.92 0.26 0.16 0.27 0.4 0.38 0.43
Sro1087_g239880.1 (Contig998.g10095)
0.03 0.05 0.07 0.04 0.05 0.12 0.35 0.28 0.16 0.48 0.41 0.61 0.71 0.42 0.39 0.65 0.25 0.55 0.65 1.0 0.54 0.42 0.15 0.42 0.4 0.31 0.37
Sro1112_g242570.1 (Contig2910.g23156)
0.03 0.13 0.12 0.13 0.15 0.34 0.58 0.42 0.2 0.69 0.72 0.88 0.53 0.92 0.7 0.6 0.44 0.57 0.53 0.67 1.0 0.18 0.16 0.61 0.38 0.41 0.57
Sro1122_g243520.1 (Contig3960.g30329)
0.01 0.07 0.12 0.08 0.05 0.05 0.22 0.12 0.09 0.34 0.21 0.33 0.59 0.41 0.34 0.66 0.18 0.24 0.28 1.0 0.51 0.19 0.06 0.18 0.27 0.21 0.19
Sro1177_g249350.1 (Contig1274.g11876)
0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.13 0.24 0.08 0.12 0.44 0.39 0.5 0.66 0.54 0.39 0.57 0.37 0.54 0.52 1.0 0.5 0.28 0.07 0.26 0.2 0.17 0.29
Sro1178_g249500.1 (Contig1120.g10721)
0.01 0.26 0.13 0.27 0.26 0.18 0.45 0.29 0.21 0.64 0.52 0.68 0.83 0.92 0.71 1.0 0.37 0.6 0.61 0.91 0.7 0.34 0.17 0.27 0.29 0.27 0.54
Sro1232_g254730.1 (Contig645.g7742)
0.01 0.03 0.01 0.01 0.02 0.16 0.4 0.22 0.11 0.53 0.37 0.67 0.36 0.39 0.57 1.0 0.22 0.53 0.5 0.73 0.74 0.18 0.08 0.39 0.32 0.29 0.43
Sro1271_g258140.1 (Contig3272.g25762)
0.02 0.09 0.06 0.08 0.05 0.15 0.31 0.14 0.13 0.69 0.44 0.96 0.9 0.49 0.4 0.41 0.4 0.33 0.54 0.98 1.0 0.31 0.12 0.44 0.73 0.4 0.36
Sro1288_g259560.1 (Contig1971.g16850)
0.01 0.04 0.04 0.04 0.04 0.2 0.44 0.4 0.17 0.65 0.68 0.95 0.42 0.64 0.6 0.87 0.51 0.34 0.44 0.57 1.0 0.6 0.18 0.35 0.5 0.47 0.47
Sro1386_g268270.1 (Contig1512.g13810)
0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.1 0.26 0.12 0.05 0.36 0.2 0.38 0.53 0.32 0.45 1.0 0.17 0.43 0.3 0.71 0.58 0.16 0.05 0.28 0.33 0.31 0.21
Sro1606_g285470.1 (Contig770.g8701)
0.01 0.05 0.21 0.04 0.03 0.19 0.41 0.23 0.21 0.48 0.4 0.41 0.83 0.6 0.51 0.73 0.41 0.79 0.68 1.0 0.81 0.28 0.22 0.37 0.59 0.38 0.32
Sro169_g075110.1 (Contig4412.g33131)
0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.27 0.45 0.21 0.11 0.66 0.72 0.75 0.24 0.54 0.64 0.91 0.4 0.69 0.63 0.55 1.0 0.27 0.13 0.48 0.24 0.38 0.6
Sro1764_g296040.1 (Contig4076.g31240)
0.01 0.39 0.26 0.21 0.14 0.42 0.31 0.2 0.19 0.5 0.77 0.54 1.0 0.43 0.51 0.57 0.52 0.41 0.53 0.84 0.74 0.2 0.13 0.42 0.25 0.25 0.65
Sro1764_g296050.1 (Contig4076.g31241)
0.01 0.46 0.39 0.24 0.17 0.21 0.24 0.11 0.11 0.28 0.4 0.22 1.0 0.18 0.3 0.31 0.27 0.3 0.3 0.71 0.4 0.24 0.11 0.2 0.14 0.16 0.33
Sro195_g083110.1 (Contig4576.g34148)
0.05 0.12 0.15 0.12 0.17 0.11 0.3 0.22 0.25 0.5 0.54 0.6 0.79 0.47 0.53 1.0 0.37 0.54 0.78 0.97 0.67 0.32 0.15 0.41 0.43 0.4 0.42
Sro196_g083450.1 (Contig3206.g25341)
0.0 0.11 0.06 0.08 0.07 0.13 0.32 0.15 0.12 0.51 0.38 0.68 0.61 0.33 0.44 0.56 0.28 0.51 0.89 1.0 0.88 0.42 0.12 0.38 0.33 0.28 0.42
Sro2106_g314800.1 (Contig3561.g27496)
0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.18 0.39 0.2 0.13 0.57 0.31 0.64 0.53 0.95 0.51 0.71 0.34 0.71 0.31 0.77 1.0 0.37 0.13 0.48 0.45 0.41 0.28
Sro213_g088460.1 (Contig1149.g10986)
0.01 0.01 0.01 0.04 0.04 0.13 0.23 0.15 0.12 0.46 0.53 0.63 0.5 0.26 0.54 1.0 0.38 0.38 0.38 0.54 0.67 0.11 0.06 0.22 0.26 0.2 0.37
Sro21_g014890.1 (Contig813.g9079)
0.01 0.06 0.1 0.09 0.08 0.09 0.2 0.07 0.05 0.44 0.32 0.51 0.66 0.56 0.39 0.72 0.31 0.41 0.43 1.0 0.86 0.35 0.14 0.19 0.46 0.4 0.33
Sro226_g092040.1 (Contig565.g7176)
0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 0.2 0.31 0.17 0.09 0.52 0.5 0.57 0.56 0.41 0.41 0.46 0.21 0.68 0.59 1.0 0.89 0.14 0.04 0.35 0.31 0.49 0.41
Sro23_g015820.1 (Contig2259.g18732)
0.01 0.05 0.04 0.04 0.02 0.04 0.33 0.16 0.08 0.51 0.34 0.59 0.2 0.42 0.39 0.7 0.28 0.37 0.34 0.54 1.0 0.18 0.07 0.34 0.57 0.35 0.32
Sro255_g100370.1 (Contig2336.g19214)
0.0 0.07 0.04 0.1 0.05 0.21 0.59 0.27 0.2 0.63 0.4 0.73 0.73 0.82 0.71 1.0 0.44 0.57 0.65 0.85 0.79 0.35 0.19 0.54 0.5 0.46 0.42
Sro271_g104460.1 (Contig2573.g20879)
0.07 0.12 0.1 0.05 0.05 0.32 0.61 0.46 0.31 0.79 0.88 0.98 0.59 0.88 0.91 0.89 0.65 0.76 0.56 0.73 1.0 0.3 0.36 0.48 0.54 0.54 0.6
Sro2_g001820.1 (Contig467.g6340)
0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.12 0.47 0.18 0.18 0.56 0.6 0.7 0.51 0.62 0.57 0.64 0.37 0.63 0.38 0.65 1.0 0.11 0.14 0.29 0.26 0.26 0.41
Sro311_g114200.1 (Contig909.g9535)
0.0 0.3 0.26 0.34 0.24 0.18 0.43 0.43 0.37 0.6 0.66 0.66 1.0 0.69 0.69 0.55 0.63 0.54 0.65 0.99 0.77 0.38 0.24 0.47 0.33 0.42 0.55
Sro3288_g346240.1 (Contig2970.g23593)
0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 0.47 0.39 0.31 0.09 0.64 0.77 0.73 0.61 0.78 0.8 1.0 0.89 0.41 0.39 0.77 0.92 0.35 0.11 0.46 0.38 0.36 0.68
Sro3501_g348670.1 (Contig2383.g19556)
0.06 0.37 0.2 0.11 0.13 0.16 0.38 0.12 0.16 0.67 0.44 0.8 0.81 0.59 0.5 0.58 0.4 0.3 0.51 0.96 1.0 0.38 0.19 0.37 0.46 0.34 0.37
Sro358_g125920.1 (Contig1210.g11379)
0.05 0.05 0.02 0.02 0.02 0.08 0.48 0.14 0.18 0.56 0.62 0.73 0.68 0.47 0.46 0.68 0.31 0.65 0.6 1.0 0.82 0.33 0.09 0.42 0.47 0.32 0.38
Sro35_g022480.1 (Contig3323.g26125)
0.05 0.02 0.0 0.01 0.0 0.07 0.38 0.18 0.07 0.48 0.44 0.49 0.65 0.37 0.62 1.0 0.32 0.59 0.63 1.0 0.56 0.28 0.1 0.48 0.83 0.21 0.29
Sro388_g132360.1 (Contig4393.g33010)
0.01 0.07 0.04 0.03 0.04 0.23 0.57 0.28 0.27 0.72 0.53 0.91 0.41 0.62 0.68 0.91 0.44 0.78 0.48 0.92 1.0 0.3 0.21 0.5 0.47 0.43 0.59
Sro39_g024020.1 (Contig234.g2822)
0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.15 0.3 0.24 0.16 0.63 0.65 0.81 0.23 0.47 0.6 1.0 0.55 0.52 0.49 0.82 0.93 0.42 0.08 0.44 0.3 0.35 0.65
Sro3_g002390.1 (Contig3832.g29424)
0.7 0.35 0.33 0.33 0.2 0.24 0.38 0.25 0.27 0.71 0.74 0.95 0.73 0.56 0.73 0.96 0.42 0.67 0.77 0.89 1.0 0.2 0.19 0.47 0.3 0.28 0.63
Sro403_g135680.1 (Contig3393.g26522)
0.0 0.14 0.03 0.08 0.17 0.12 0.53 0.07 0.3 0.61 0.56 0.69 0.6 0.53 0.75 0.94 0.53 0.67 0.41 1.0 0.82 0.18 0.05 0.6 0.63 0.73 0.41
Sro406_g136360.1 (Contig2793.g22477)
0.01 0.13 0.1 0.08 0.06 0.29 0.48 0.38 0.15 0.66 0.66 0.86 0.31 0.81 0.57 0.73 0.52 0.66 0.75 0.64 1.0 0.61 0.15 0.64 0.69 0.59 0.59
Sro407_g136670.1 (Contig2478.g20258)
0.01 0.09 0.18 0.09 0.06 0.14 0.36 0.2 0.17 0.55 0.46 0.66 0.72 0.71 0.57 1.0 0.34 0.37 0.47 0.89 0.83 0.36 0.1 0.4 0.47 0.42 0.38
Sro407_g136690.1 (Contig2478.g20260)
0.01 0.07 0.05 0.08 0.04 0.13 0.22 0.23 0.1 0.49 0.4 0.56 0.81 0.52 0.34 0.45 0.32 0.25 0.37 1.0 0.71 0.23 0.08 0.21 0.22 0.18 0.34
Sro411_g137590.1 (Contig243.g2965)
0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.1 0.28 0.16 0.11 0.43 0.39 0.64 1.0 0.54 0.4 0.45 0.21 0.4 0.48 0.83 0.53 0.23 0.06 0.29 0.21 0.31 0.33
Sro435_g142300.1 (Contig492.g6636)
0.0 0.08 0.0 0.03 0.05 0.11 0.38 0.09 0.12 0.68 0.58 0.74 0.54 0.82 0.63 0.62 0.56 0.43 0.48 0.83 1.0 0.4 0.07 0.32 0.34 0.4 0.37
Sro457_g146800.1 (Contig1832.g16109)
0.01 0.04 0.04 0.03 0.03 0.15 0.32 0.2 0.13 0.55 0.52 0.58 0.36 0.4 0.41 0.49 0.22 0.53 0.59 1.0 0.86 0.22 0.11 0.26 0.23 0.2 0.4
Sro464_g148400.1 (Contig363.g4888)
0.01 0.38 0.22 0.34 0.35 0.28 0.61 0.33 0.32 0.72 0.86 0.91 0.8 0.85 0.82 1.0 0.8 0.68 0.55 0.72 0.86 0.17 0.24 0.38 0.3 0.23 0.58
Sro47_g027800.1 (Contig1172.g11173)
0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.05 0.19 0.12 0.04 0.27 0.23 0.28 0.42 0.27 0.27 0.44 0.15 0.33 0.24 1.0 0.6 0.11 0.05 0.27 0.43 0.29 0.15
Sro48_g028420.1 (Contig1255.g11737)
0.01 0.03 0.01 0.01 0.04 0.15 0.28 0.16 0.1 0.41 0.41 0.47 0.44 0.48 0.51 1.0 0.37 0.74 0.32 0.66 0.72 0.15 0.09 0.26 0.4 0.43 0.3
Sro495_g154450.1 (Contig3243.g25625)
0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.07 0.24 0.08 0.22 0.39 0.26 0.47 0.63 0.65 0.34 0.46 0.23 0.58 0.73 1.0 0.73 0.29 0.18 0.15 0.2 0.17 0.1
Sro532_g161490.1 (Contig1529.g13900)
0.06 0.14 0.09 0.1 0.13 0.23 0.37 0.26 0.17 0.49 0.43 0.66 0.79 0.38 0.41 0.52 0.26 0.41 0.54 1.0 0.54 0.41 0.18 0.57 0.53 0.46 0.45
Sro575_g169350.1 (Contig1981.g16953)
0.01 0.03 0.03 0.02 0.03 0.15 0.31 0.15 0.17 0.51 0.38 0.58 0.36 0.52 0.52 1.0 0.31 0.72 0.83 0.55 0.62 0.31 0.15 0.21 0.19 0.27 0.46
Sro587_g171320.1 (Contig2233.g18555)
0.06 0.07 0.04 0.03 0.03 0.16 0.54 0.35 0.27 0.63 0.7 0.73 0.73 0.59 0.63 0.68 0.4 0.92 0.51 1.0 0.77 0.37 0.25 0.47 0.36 0.35 0.48
Sro58_g033580.1 (Contig64.g552)
0.01 0.03 0.03 0.02 0.02 0.11 0.3 0.15 0.1 0.41 0.27 0.46 0.6 0.4 0.37 0.85 0.37 0.47 0.57 1.0 0.65 0.37 0.14 0.27 0.42 0.34 0.21
Sro594_g172510.1 (Contig3536.g27345)
0.02 0.02 0.05 0.05 0.05 0.15 0.38 0.19 0.17 0.57 0.51 0.62 0.73 0.36 0.54 0.65 0.51 0.42 0.65 1.0 0.68 0.32 0.13 0.38 0.49 0.53 0.44
Sro607_g174580.1 (Contig3533.g27316)
0.0 0.04 0.04 0.04 0.03 0.21 0.37 0.15 0.11 0.63 0.53 0.84 0.93 0.58 0.48 0.78 0.48 0.33 0.47 0.94 1.0 0.39 0.12 0.31 0.32 0.3 0.38
Sro60_g034580.1 (Contig797.g8935)
0.01 0.09 0.08 0.05 0.02 0.22 0.34 0.16 0.18 0.46 0.49 0.51 0.76 0.44 0.42 0.52 0.42 0.79 0.74 1.0 0.78 0.28 0.2 0.28 0.27 0.44 0.35
Sro659_g182890.1 (Contig2136.g17997)
0.03 0.05 0.01 0.0 0.0 0.16 0.38 0.09 0.06 0.65 0.27 0.61 0.65 0.87 0.49 0.59 0.37 0.51 0.45 0.73 1.0 0.28 0.06 0.16 0.38 0.14 0.36
0.02 0.34 0.21 0.14 0.1 0.1 0.37 0.13 0.18 0.55 0.46 0.68 1.0 0.58 0.43 0.76 0.39 0.28 0.4 0.93 0.86 0.38 0.08 0.32 0.49 0.22 0.27
Sro67_g037730.1 (Contig495.g6689)
0.01 0.07 0.08 0.03 0.08 0.12 0.29 0.19 0.15 0.56 0.39 1.0 0.88 0.51 0.46 0.77 0.27 0.38 0.53 0.94 0.81 0.32 0.06 0.43 0.57 0.38 0.4
Sro68_g038130.1 (Contig2027.g17394)
0.02 0.11 0.06 0.07 0.09 0.22 0.28 0.32 0.16 0.61 0.79 0.73 0.87 0.53 0.67 0.91 0.47 0.72 0.85 0.9 1.0 0.3 0.1 0.31 0.17 0.3 0.6
Sro744_g196220.1 (Contig393.g5321)
0.02 0.09 0.06 0.04 0.02 0.27 0.45 0.28 0.13 0.51 0.64 0.39 0.75 0.44 0.61 0.73 0.59 0.87 0.55 1.0 0.73 0.34 0.18 0.54 0.65 0.29 0.37
Sro814_g206340.1 (Contig2480.g20291)
0.04 0.4 0.36 0.24 0.22 0.24 0.43 0.18 0.22 0.6 0.67 0.68 0.8 0.82 0.55 0.64 0.42 0.54 0.54 1.0 0.69 0.44 0.2 0.27 0.3 0.22 0.41
Sro84_g044680.1 (Contig220.g2601)
0.0 0.02 0.03 0.02 0.05 0.19 0.2 0.08 0.08 0.48 0.37 0.67 0.6 0.58 0.39 0.55 0.29 0.4 0.45 1.0 0.43 0.31 0.11 0.18 0.23 0.28 0.3
Sro858_g211880.1 (Contig4009.g30834)
0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.11 0.31 0.19 0.14 0.55 0.64 0.72 0.29 0.48 0.68 1.0 0.52 0.45 0.5 0.74 0.81 0.05 0.09 0.26 0.17 0.32 0.6
0.01 0.04 0.04 0.04 0.01 0.23 0.18 0.14 0.08 0.35 0.31 0.44 1.0 0.5 0.33 0.4 0.23 0.28 0.51 0.78 0.36 0.16 0.06 0.21 0.21 0.3 0.25
Sro88_g046310.1 (Contig265.g3289)
0.01 0.08 0.06 0.05 0.08 0.07 0.37 0.2 0.07 0.66 0.33 0.8 0.63 0.52 0.43 0.98 0.29 0.26 0.56 0.73 1.0 0.26 0.05 0.28 0.36 0.39 0.22
Sro951_g223880.1 (Contig3277.g25786)
0.0 0.23 0.2 0.2 0.25 0.21 0.4 0.31 0.17 0.54 0.48 0.64 0.77 0.38 0.48 0.7 0.29 0.6 0.73 1.0 0.74 0.33 0.13 0.46 0.5 0.49 0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)