Heatmap: Cluster_95 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1033_g233710.1 (Contig1396.g12845)
0.03 0.14 0.17 0.13 0.33 0.09 0.35 0.22 0.29 0.55 0.28 0.67 0.21 1.0 0.36 0.58 0.5 0.26 0.46 0.47 0.56 0.51 0.48 0.14 0.16 0.65 0.48
Sro1048_g235290.1 (Contig3784.g29053)
0.02 0.09 0.11 0.08 0.22 0.13 0.26 0.17 0.18 0.45 0.28 0.55 0.13 1.0 0.37 0.64 0.55 0.18 0.36 0.34 0.46 0.5 0.36 0.09 0.08 0.61 0.41
Sro1093_g240360.1 (Contig384.g5162)
0.28 0.09 0.18 0.14 0.24 0.14 0.55 0.3 0.49 0.71 0.39 0.94 0.26 1.0 0.49 0.72 0.66 0.32 0.57 0.53 0.76 0.71 0.64 0.22 0.26 0.77 0.58
Sro1192_g251020.1 (Contig331.g4398)
0.02 0.21 0.33 0.14 0.37 0.12 0.38 0.23 0.35 0.52 0.31 0.54 0.18 1.0 0.41 0.64 0.53 0.22 0.44 0.43 0.55 0.77 0.55 0.18 0.16 0.63 0.47
Sro120_g058380.1 (Contig2411.g19716)
0.01 0.05 0.08 0.04 0.16 0.08 0.13 0.1 0.14 0.42 0.23 0.54 0.07 1.0 0.3 0.49 0.4 0.12 0.25 0.26 0.41 0.4 0.2 0.07 0.05 0.52 0.35
Sro1286_g259390.1 (Contig2537.g20698)
0.02 0.07 0.13 0.07 0.18 0.1 0.24 0.17 0.2 0.52 0.28 0.64 0.12 1.0 0.35 0.58 0.49 0.19 0.4 0.35 0.64 0.57 0.34 0.1 0.1 0.65 0.46
Sro1315_g262090.1 (Contig2837.g22773)
0.02 0.14 0.23 0.12 0.28 0.09 0.22 0.14 0.19 0.45 0.27 0.52 0.13 1.0 0.33 0.57 0.51 0.18 0.38 0.36 0.43 0.58 0.35 0.09 0.06 0.59 0.4
Sro1334_g263860.1 (Contig785.g8790)
0.01 0.1 0.12 0.08 0.22 0.1 0.26 0.17 0.16 0.45 0.25 0.58 0.1 1.0 0.34 0.6 0.44 0.16 0.35 0.3 0.52 0.48 0.35 0.1 0.09 0.54 0.37
Sro1384_g268110.1 (Contig2234.g18573)
0.02 0.11 0.16 0.09 0.22 0.1 0.29 0.16 0.22 0.44 0.25 0.47 0.11 1.0 0.35 0.55 0.48 0.17 0.35 0.29 0.47 0.66 0.41 0.1 0.07 0.58 0.4
Sro1394_g268940.1 (Contig598.g7460)
0.03 0.11 0.2 0.1 0.29 0.1 0.22 0.14 0.2 0.52 0.24 0.67 0.12 1.0 0.35 0.56 0.46 0.2 0.45 0.36 0.57 0.47 0.28 0.09 0.11 0.65 0.41
Sro13_g009690.1 (Contig337.g4510)
0.04 0.19 0.23 0.14 0.39 0.12 0.51 0.25 0.35 0.61 0.29 0.76 0.14 1.0 0.42 0.64 0.53 0.24 0.51 0.4 0.59 0.75 0.61 0.16 0.14 0.69 0.49
Sro1425_g271560.1 (Contig1471.g13484)
0.02 0.21 0.32 0.11 0.29 0.1 0.4 0.21 0.3 0.51 0.36 0.52 0.16 1.0 0.48 0.81 0.63 0.22 0.49 0.43 0.48 0.96 0.56 0.19 0.15 0.6 0.49
Sro1425_g271600.1 (Contig1471.g13488)
0.03 0.07 0.13 0.09 0.2 0.11 0.3 0.2 0.21 0.53 0.29 0.69 0.15 1.0 0.35 0.52 0.49 0.22 0.44 0.37 0.61 0.52 0.4 0.11 0.11 0.65 0.45
Sro143_g066550.1 (Contig3754.g28761)
0.02 0.19 0.32 0.13 0.46 0.09 0.46 0.23 0.31 0.54 0.29 0.68 0.11 1.0 0.4 0.6 0.48 0.17 0.37 0.33 0.56 0.96 0.51 0.17 0.11 0.71 0.44
Sro1505_g278180.1 (Contig474.g6440)
0.01 0.09 0.15 0.09 0.25 0.14 0.34 0.24 0.25 0.57 0.29 0.72 0.13 1.0 0.37 0.65 0.55 0.26 0.5 0.39 0.63 0.55 0.43 0.12 0.1 0.7 0.49
Sro154_g070110.1 (Contig2716.g21889)
0.02 0.09 0.15 0.1 0.24 0.14 0.35 0.21 0.25 0.51 0.29 0.61 0.16 1.0 0.36 0.58 0.51 0.21 0.45 0.39 0.55 0.62 0.48 0.15 0.16 0.63 0.47
Sro1684_g291000.1 (Contig2811.g22545)
0.02 0.18 0.18 0.15 0.47 0.16 0.74 0.39 0.4 0.58 0.31 0.8 0.16 1.0 0.47 0.68 0.56 0.26 0.49 0.43 0.54 0.77 0.72 0.18 0.21 0.71 0.54
Sro169_g075080.1 (Contig4412.g33128)
0.02 0.04 0.09 0.06 0.13 0.09 0.22 0.16 0.16 0.45 0.26 0.53 0.13 1.0 0.32 0.51 0.41 0.19 0.37 0.35 0.55 0.34 0.34 0.09 0.09 0.64 0.41
Sro174_g076500.1 (Contig4298.g32434)
0.01 0.13 0.15 0.08 0.22 0.13 0.32 0.2 0.22 0.51 0.28 0.62 0.19 1.0 0.4 0.6 0.52 0.23 0.46 0.43 0.49 0.71 0.38 0.16 0.11 0.64 0.46
Sro178_g078160.1 (Contig275.g3541)
0.04 0.19 0.16 0.16 0.38 0.17 0.55 0.27 0.33 0.54 0.29 0.66 0.21 1.0 0.41 0.57 0.47 0.25 0.44 0.39 0.55 0.57 0.57 0.19 0.16 0.64 0.44
Sro182_g079470.1 (Contig1301.g12083)
0.01 0.08 0.11 0.1 0.2 0.09 0.27 0.19 0.23 0.44 0.25 0.54 0.14 1.0 0.3 0.62 0.48 0.17 0.32 0.33 0.49 0.43 0.41 0.1 0.1 0.61 0.4
Sro185_g080500.1 (Contig1228.g11525)
0.02 0.18 0.25 0.12 0.39 0.09 0.41 0.23 0.29 0.56 0.25 0.74 0.13 1.0 0.37 0.64 0.49 0.2 0.46 0.36 0.59 0.85 0.56 0.13 0.12 0.71 0.44
Sro189_g081570.1 (Contig744.g8521)
0.03 0.1 0.21 0.1 0.25 0.1 0.32 0.2 0.26 0.53 0.3 0.68 0.16 1.0 0.36 0.57 0.5 0.23 0.45 0.42 0.55 0.5 0.44 0.11 0.09 0.63 0.44
Sro2117_g315240.1 (Contig3258.g25694)
0.03 0.22 0.28 0.17 0.41 0.11 0.51 0.26 0.39 0.58 0.33 0.67 0.15 1.0 0.42 0.63 0.56 0.22 0.47 0.38 0.64 0.83 0.65 0.19 0.21 0.7 0.51
Sro227_g092220.1 (Contig327.g4334)
0.02 0.15 0.24 0.11 0.28 0.11 0.33 0.19 0.25 0.49 0.32 0.54 0.13 1.0 0.43 0.63 0.53 0.2 0.39 0.35 0.56 0.82 0.48 0.13 0.1 0.66 0.44
Sro232_g093840.1 (Contig4063.g31149)
0.05 0.21 0.31 0.16 0.4 0.17 0.61 0.29 0.34 0.64 0.32 0.78 0.15 1.0 0.44 0.73 0.6 0.25 0.54 0.43 0.69 0.56 0.65 0.16 0.18 0.67 0.52
Sro2397_g326060.1 (Contig2368.g19493)
0.04 0.12 0.18 0.1 0.24 0.1 0.4 0.23 0.27 0.52 0.3 0.66 0.15 1.0 0.4 0.66 0.58 0.21 0.39 0.35 0.56 0.61 0.47 0.16 0.13 0.61 0.48
Sro245_g097440.1 (Contig3087.g24615)
0.02 0.11 0.22 0.08 0.24 0.08 0.36 0.23 0.29 0.5 0.25 0.6 0.14 1.0 0.36 0.54 0.46 0.21 0.42 0.39 0.57 0.64 0.5 0.14 0.16 0.63 0.43
Sro245_g097460.1 (Contig3087.g24617)
0.02 0.15 0.26 0.11 0.29 0.13 0.41 0.19 0.29 0.57 0.29 0.7 0.15 1.0 0.4 0.61 0.57 0.22 0.49 0.42 0.59 0.65 0.49 0.12 0.1 0.72 0.47
Sro245_g097470.1 (Contig3087.g24618)
0.03 0.17 0.23 0.11 0.3 0.16 0.57 0.29 0.38 0.61 0.35 0.72 0.14 1.0 0.5 0.82 0.7 0.24 0.46 0.39 0.69 0.81 0.65 0.21 0.17 0.73 0.55
Sro253_g099930.1 (Contig3900.g29911)
0.03 0.09 0.19 0.1 0.24 0.11 0.31 0.18 0.24 0.49 0.31 0.6 0.12 1.0 0.38 0.6 0.49 0.16 0.34 0.32 0.54 0.51 0.39 0.14 0.13 0.58 0.43
Sro264_g102550.1 (Contig921.g9681)
0.01 0.07 0.09 0.07 0.18 0.09 0.22 0.15 0.19 0.48 0.28 0.61 0.13 1.0 0.34 0.54 0.48 0.18 0.37 0.34 0.46 0.53 0.3 0.11 0.08 0.6 0.38
Sro27_g018140.1 (Contig3926.g30075)
0.03 0.31 0.45 0.18 0.48 0.13 0.52 0.27 0.42 0.59 0.32 0.66 0.16 0.94 0.51 0.73 0.63 0.25 0.54 0.43 0.59 1.0 0.7 0.18 0.17 0.7 0.52
Sro305_g112730.1 (Contig560.g7114)
0.03 0.06 0.07 0.06 0.16 0.1 0.5 0.25 0.25 0.58 0.3 0.74 0.05 1.0 0.4 0.6 0.48 0.09 0.1 0.16 0.75 0.32 0.49 0.18 0.17 0.66 0.46
Sro307_g113390.1 (Contig2839.g22809)
0.03 0.12 0.17 0.09 0.24 0.12 0.36 0.21 0.26 0.49 0.29 0.55 0.16 1.0 0.39 0.61 0.51 0.21 0.44 0.4 0.57 0.71 0.49 0.13 0.11 0.69 0.45
Sro327_g118460.1 (Contig839.g9254)
0.02 0.12 0.22 0.12 0.3 0.1 0.35 0.19 0.22 0.54 0.27 0.64 0.18 1.0 0.36 0.5 0.46 0.22 0.44 0.42 0.56 0.48 0.43 0.1 0.09 0.65 0.44
Sro327_g118470.1 (Contig839.g9255)
0.03 0.16 0.26 0.16 0.37 0.12 0.48 0.26 0.41 0.6 0.33 0.73 0.23 1.0 0.43 0.62 0.49 0.3 0.57 0.51 0.7 0.94 0.62 0.19 0.21 0.67 0.46
Sro345_g122470.1 (Contig2266.g18806)
0.01 0.27 0.48 0.2 0.42 0.14 0.36 0.22 0.37 0.62 0.29 0.77 0.11 1.0 0.44 0.72 0.76 0.24 0.53 0.42 0.58 0.95 0.57 0.15 0.14 0.82 0.65
Sro37_g023400.1 (Contig1425.g13156)
0.04 0.17 0.24 0.11 0.31 0.14 0.51 0.28 0.46 0.6 0.32 0.73 0.19 1.0 0.44 0.65 0.5 0.25 0.55 0.47 0.66 0.93 0.71 0.17 0.15 0.77 0.54
Sro490_g153470.1 (Contig328.g4367)
0.03 0.13 0.13 0.17 0.34 0.19 0.45 0.25 0.29 0.55 0.31 0.68 0.17 1.0 0.39 0.61 0.51 0.23 0.44 0.37 0.62 0.56 0.48 0.18 0.17 0.59 0.42
Sro490_g153560.1 (Contig328.g4376)
0.02 0.12 0.2 0.1 0.23 0.1 0.33 0.21 0.25 0.49 0.25 0.6 0.12 1.0 0.33 0.5 0.45 0.18 0.38 0.33 0.54 0.59 0.42 0.11 0.1 0.62 0.41
Sro49_g028920.1 (Contig2054.g17642)
0.01 0.03 0.04 0.03 0.09 0.11 0.22 0.13 0.11 0.39 0.27 0.45 0.07 1.0 0.34 0.52 0.45 0.09 0.2 0.19 0.45 0.14 0.23 0.11 0.11 0.6 0.37
Sro521_g159410.1 (Contig1979.g16931)
0.01 0.1 0.16 0.1 0.33 0.1 0.37 0.28 0.22 0.49 0.24 0.56 0.12 1.0 0.37 0.61 0.52 0.18 0.37 0.37 0.51 0.49 0.47 0.1 0.09 0.67 0.49
Sro569_g168300.1 (Contig1581.g14356)
0.02 0.09 0.09 0.09 0.25 0.12 0.23 0.14 0.17 0.49 0.24 0.65 0.13 1.0 0.33 0.56 0.46 0.21 0.44 0.37 0.53 0.51 0.29 0.09 0.06 0.64 0.43
Sro5_g004490.1 (Contig4001.g30764)
0.03 0.17 0.14 0.1 0.3 0.12 0.44 0.26 0.3 0.51 0.3 0.57 0.17 1.0 0.43 0.58 0.52 0.24 0.49 0.4 0.47 0.83 0.49 0.15 0.09 0.57 0.35
Sro60_g034780.1 (Contig797.g8955)
0.02 0.06 0.19 0.08 0.19 0.08 0.24 0.19 0.24 0.47 0.29 0.58 0.12 1.0 0.34 0.6 0.5 0.19 0.41 0.37 0.51 0.51 0.38 0.11 0.11 0.57 0.43
Sro60_g034790.1 (Contig797.g8956)
0.02 0.16 0.22 0.15 0.38 0.12 0.35 0.21 0.33 0.62 0.34 0.79 0.19 1.0 0.47 0.71 0.58 0.31 0.61 0.46 0.67 0.89 0.5 0.16 0.14 0.73 0.51
Sro611_g175300.1 (Contig1882.g16411)
0.01 0.08 0.22 0.09 0.2 0.12 0.29 0.18 0.28 0.5 0.31 0.62 0.16 1.0 0.36 0.55 0.47 0.22 0.42 0.45 0.51 0.59 0.4 0.12 0.12 0.59 0.42
Sro611_g175310.1 (Contig1882.g16412)
0.02 0.11 0.18 0.1 0.22 0.13 0.33 0.23 0.34 0.49 0.35 0.6 0.18 1.0 0.4 0.58 0.53 0.22 0.4 0.43 0.43 0.77 0.48 0.16 0.13 0.63 0.43
Sro621_g176640.1 (Contig1511.g13781)
0.02 0.1 0.14 0.08 0.19 0.1 0.16 0.12 0.15 0.4 0.24 0.49 0.09 1.0 0.31 0.47 0.4 0.13 0.28 0.31 0.4 0.51 0.24 0.08 0.04 0.57 0.33
Sro673_g185180.1 (Contig1386.g12783)
0.02 0.12 0.15 0.09 0.28 0.14 0.29 0.17 0.18 0.5 0.29 0.64 0.12 1.0 0.38 0.58 0.5 0.22 0.46 0.35 0.54 0.44 0.34 0.12 0.12 0.73 0.49
Sro678_g186000.1 (Contig2726.g21985)
0.05 0.11 0.15 0.08 0.25 0.15 0.38 0.22 0.25 0.58 0.3 0.71 0.13 1.0 0.4 0.63 0.52 0.22 0.5 0.38 0.68 0.66 0.44 0.14 0.11 0.76 0.48
Sro691_g187740.1 (Contig1133.g10869)
0.01 0.07 0.14 0.08 0.18 0.11 0.25 0.17 0.23 0.42 0.28 0.46 0.14 1.0 0.36 0.53 0.49 0.22 0.4 0.44 0.45 0.52 0.37 0.12 0.1 0.61 0.38
Sro693_g188270.1 (Contig3212.g25392)
0.07 0.11 0.14 0.08 0.3 0.09 0.29 0.17 0.21 0.5 0.28 0.61 0.1 1.0 0.38 0.59 0.49 0.18 0.37 0.32 0.5 0.68 0.35 0.1 0.08 0.62 0.4
Sro694_g188520.1 (Contig4437.g33305)
0.03 0.1 0.17 0.1 0.26 0.09 0.4 0.22 0.26 0.51 0.28 0.65 0.13 1.0 0.34 0.56 0.48 0.17 0.35 0.33 0.54 0.47 0.48 0.13 0.12 0.62 0.46
Sro694_g188530.1 (Contig4437.g33306)
0.03 0.07 0.11 0.06 0.21 0.11 0.25 0.18 0.2 0.5 0.21 0.64 0.08 1.0 0.33 0.54 0.45 0.15 0.33 0.27 0.51 0.52 0.34 0.09 0.09 0.63 0.43
Sro6_g004850.1 (Contig175.g1990)
0.02 0.12 0.15 0.15 0.34 0.12 0.3 0.2 0.22 0.52 0.29 0.7 0.19 1.0 0.35 0.59 0.53 0.23 0.48 0.4 0.47 0.46 0.41 0.1 0.08 0.59 0.44
Sro730_g194010.1 (Contig80.g833)
0.01 0.11 0.2 0.09 0.2 0.12 0.29 0.18 0.19 0.56 0.32 0.67 0.17 1.0 0.42 0.7 0.61 0.23 0.49 0.46 0.63 0.46 0.35 0.14 0.1 0.72 0.53
Sro734_g194640.1 (Contig3769.g28942)
0.04 0.13 0.18 0.14 0.26 0.2 0.5 0.3 0.41 0.58 0.38 0.73 0.22 1.0 0.45 0.55 0.5 0.31 0.53 0.42 0.63 0.68 0.55 0.17 0.16 0.61 0.44
Sro789_g202650.1 (Contig1895.g16481)
0.03 0.15 0.25 0.19 0.33 0.19 0.44 0.28 0.32 0.58 0.36 0.73 0.22 1.0 0.47 0.7 0.6 0.29 0.51 0.43 0.62 0.43 0.51 0.14 0.13 0.62 0.48
Sro827_g207890.1 (Contig2896.g23094)
0.02 0.14 0.15 0.13 0.32 0.15 0.45 0.22 0.27 0.52 0.3 0.6 0.18 1.0 0.39 0.63 0.5 0.25 0.49 0.42 0.58 0.54 0.47 0.13 0.14 0.67 0.5
Sro827_g207900.1 (Contig2896.g23095)
0.02 0.11 0.15 0.1 0.26 0.11 0.34 0.19 0.22 0.49 0.32 0.6 0.16 1.0 0.39 0.62 0.55 0.23 0.43 0.39 0.47 0.55 0.38 0.15 0.13 0.64 0.46
Sro84_g044900.1 (Contig220.g2623)
0.01 0.05 0.09 0.06 0.16 0.11 0.32 0.18 0.2 0.46 0.3 0.57 0.14 1.0 0.37 0.56 0.47 0.21 0.42 0.35 0.43 0.41 0.4 0.1 0.1 0.64 0.42
Sro872_g213940.1 (Contig2262.g18776)
0.01 0.1 0.16 0.07 0.19 0.1 0.25 0.14 0.17 0.45 0.24 0.49 0.11 1.0 0.36 0.53 0.43 0.17 0.37 0.34 0.51 0.61 0.31 0.1 0.09 0.66 0.4
Sro922_g220630.1 (Contig2958.g23506)
0.03 0.1 0.19 0.09 0.27 0.13 0.38 0.23 0.29 0.55 0.33 0.66 0.16 1.0 0.41 0.72 0.62 0.22 0.46 0.41 0.61 0.6 0.5 0.18 0.22 0.66 0.53
Sro925_g220910.1 (Contig3078.g24550)
0.0 0.04 0.07 0.04 0.13 0.08 0.22 0.17 0.16 0.46 0.27 0.58 0.08 1.0 0.35 0.54 0.49 0.18 0.4 0.29 0.44 0.42 0.26 0.1 0.1 0.78 0.4

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)