Heatmap: Cluster_286 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1014_g231410.1 (Contig3403.g26584)
0.35 1.0 0.55 0.35 0.51 0.13 0.2 0.47 0.62 0.23 0.25 0.2 0.15 0.22 0.17 0.17 0.26 0.41 0.22 0.27 0.21 0.4 0.65 0.16 0.19 0.14 0.13
Sro1014_g231420.1 (Contig3403.g26585)
0.55 1.0 0.45 0.44 0.6 0.24 0.29 0.63 0.63 0.35 0.33 0.29 0.31 0.37 0.27 0.21 0.3 0.67 0.54 0.54 0.36 0.54 0.56 0.24 0.37 0.45 0.25
Sro103_g052360.1 (Contig308.g4033)
0.04 1.0 0.68 0.39 0.43 0.33 0.55 0.12 0.21 0.6 0.41 0.34 0.73 0.41 0.5 0.52 0.21 0.36 0.4 0.87 0.51 0.58 0.25 0.28 0.46 0.41 0.28
Sro1121_g243440.1 (Contig138.g1537)
0.07 0.92 0.51 1.0 0.99 0.1 0.32 0.12 0.2 0.12 0.05 0.06 0.05 0.0 0.11 0.0 0.08 0.1 0.03 0.0 0.01 0.28 0.17 0.56 0.23 0.14 0.02
Sro113_g056150.1 (Contig4126.g31580)
0.39 0.75 1.0 0.5 0.69 0.04 0.09 0.14 0.12 0.13 0.1 0.09 0.66 0.01 0.11 0.1 0.06 0.38 0.28 0.47 0.02 0.05 0.35 0.01 0.03 0.02 0.1
Sro1174_g249050.1 (Contig3404.g26594)
0.28 0.71 0.92 1.0 0.56 0.04 0.43 0.29 0.27 0.12 0.2 0.07 0.03 0.01 0.14 0.16 0.27 0.14 0.08 0.1 0.04 0.35 0.24 0.69 0.3 0.1 0.04
0.1 1.0 0.45 0.5 0.29 0.11 0.23 0.09 0.12 0.27 0.29 0.24 0.37 0.26 0.28 0.14 0.25 0.22 0.28 0.45 0.26 0.29 0.12 0.13 0.09 0.1 0.16
0.04 0.18 0.22 0.07 0.19 0.03 0.33 0.77 0.62 0.34 0.03 0.49 1.0 0.16 0.04 0.05 0.04 0.25 0.15 0.84 0.44 0.52 0.34 0.05 0.28 0.13 0.02
Sro1307_g261310.1 (Contig4504.g33770)
0.02 0.1 0.26 0.21 0.19 0.09 0.35 0.37 0.64 0.19 0.38 0.18 0.17 0.08 0.24 0.53 0.28 0.32 0.15 0.26 0.21 0.14 0.42 0.41 1.0 0.47 0.22
Sro130_g062120.1 (Contig2611.g21135)
0.21 0.84 1.0 0.75 0.9 0.11 0.45 0.68 0.72 0.26 0.28 0.24 0.33 0.25 0.37 0.47 0.27 0.38 0.38 0.33 0.19 0.42 0.71 0.13 0.14 0.17 0.25
Sro1316_g262130.1 (Contig3701.g28501)
0.05 0.85 1.0 0.48 0.66 0.04 0.19 0.35 0.21 0.11 0.09 0.26 0.28 0.02 0.09 0.19 0.04 0.07 0.02 0.33 0.04 0.06 0.3 0.05 0.08 0.07 0.08
Sro1325_g262910.1 (Contig1058.g10382)
0.0 0.88 1.0 0.87 0.83 0.15 0.33 0.44 0.75 0.14 0.31 0.07 0.09 0.07 0.21 0.33 0.27 0.08 0.07 0.09 0.04 0.28 0.48 0.18 0.25 0.38 0.23
Sro1326_g263030.1 (Contig231.g2778)
0.01 0.94 0.93 1.0 0.95 0.01 0.58 0.47 0.61 0.15 0.13 0.1 0.33 0.03 0.09 0.15 0.09 0.5 0.29 0.48 0.09 0.37 0.74 0.05 0.02 0.02 0.09
Sro13_g010210.1 (Contig337.g4562)
0.59 0.63 0.61 0.42 0.42 0.4 0.37 0.42 0.66 0.49 0.41 0.48 1.0 0.3 0.34 0.27 0.56 0.39 0.63 0.81 0.47 0.71 0.61 0.27 0.25 0.32 0.29
Sro1428_g271870.1 (Contig3166.g25068)
0.0 0.73 1.0 0.91 0.82 0.14 0.25 0.47 0.44 0.2 0.1 0.28 0.24 0.09 0.12 0.07 0.15 0.26 0.42 0.2 0.1 0.12 0.54 0.09 0.05 0.13 0.1
0.0 1.0 0.94 0.6 0.75 0.12 0.41 0.42 0.2 0.17 0.15 0.09 0.12 0.1 0.3 0.34 0.07 0.24 0.07 0.11 0.12 0.21 0.19 0.35 0.27 0.17 0.18
Sro1521_g279500.1 (Contig1605.g14554)
0.12 0.44 0.71 0.31 0.54 0.14 0.52 0.91 1.0 0.33 0.9 0.43 0.49 0.1 0.55 0.93 0.69 0.32 0.28 0.45 0.25 0.19 0.63 0.13 0.29 0.2 0.39
Sro156_g070750.1 (Contig473.g6413)
0.02 1.0 0.77 0.42 0.47 0.01 0.05 0.27 0.33 0.06 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.03 0.01 0.01 0.04 0.08 0.44 0.02 0.02 0.09 0.02
Sro1704_g292390.1 (Contig765.g8680)
0.04 0.92 0.49 0.64 0.51 0.33 0.49 0.88 0.38 0.34 0.71 0.31 0.13 0.31 0.78 0.85 0.32 0.06 0.05 0.16 0.33 0.26 0.3 1.0 0.47 0.3 0.44
Sro172_g076040.1 (Contig1453.g13313)
0.34 1.0 0.69 0.55 0.73 0.05 0.19 0.44 0.48 0.11 0.07 0.15 0.08 0.05 0.06 0.04 0.02 0.26 0.04 0.1 0.09 0.09 0.49 0.13 0.22 0.18 0.05
Sro181_g078980.1 (Contig4257.g32225)
1.0 0.69 0.74 0.52 0.42 0.28 0.6 0.38 0.43 0.53 0.33 0.68 0.69 0.45 0.44 0.39 0.4 0.33 0.35 0.67 0.62 0.24 0.37 0.62 0.79 0.56 0.27
Sro1837_g300720.1 (Contig1447.g13263)
0.0 1.0 0.62 0.31 0.33 0.01 0.23 0.52 0.37 0.17 0.15 0.07 0.23 0.03 0.13 0.26 0.03 0.4 0.51 0.38 0.11 0.08 0.2 0.17 0.08 0.09 0.17
0.21 0.78 0.43 0.18 0.34 0.04 1.0 0.31 0.38 0.27 0.16 0.11 0.1 0.08 0.24 0.26 0.13 0.26 0.13 0.16 0.2 0.08 0.42 0.46 0.25 0.19 0.12
Sro190_g081870.1 (Contig3488.g27062)
0.13 1.0 0.64 0.76 0.74 0.03 0.17 0.26 0.37 0.13 0.1 0.08 0.13 0.07 0.11 0.12 0.08 0.32 0.13 0.12 0.03 0.22 0.34 0.06 0.09 0.06 0.07
0.01 1.0 0.86 0.53 0.51 0.0 0.42 0.26 0.28 0.13 0.06 0.01 0.0 0.01 0.2 0.12 0.02 0.03 0.05 0.0 0.11 0.23 0.23 0.15 0.18 0.15 0.1
0.05 1.0 0.27 0.24 0.31 0.01 0.22 0.33 0.46 0.15 0.1 0.09 0.07 0.01 0.19 0.12 0.01 0.11 0.07 0.13 0.24 0.26 0.42 0.16 0.09 0.1 0.11
Sro2191_g318330.1 (Contig3818.g29316)
0.0 0.46 0.8 1.0 0.79 0.01 0.12 0.13 0.14 0.04 0.01 0.02 0.02 0.0 0.02 0.0 0.01 0.06 0.03 0.02 0.0 0.06 0.64 0.0 0.01 0.01 0.0
Sro2218_g319570.1 (Contig3225.g25513)
0.0 0.99 0.61 0.29 0.3 0.03 0.29 1.0 0.38 0.22 0.09 0.28 0.61 0.14 0.2 0.27 0.05 0.1 0.11 0.38 0.38 0.01 0.09 0.2 0.24 0.04 0.07
Sro22_g015290.1 (Contig426.g5753)
0.03 1.0 0.74 0.44 0.56 0.08 0.3 0.34 0.18 0.18 0.09 0.15 0.13 0.08 0.17 0.15 0.11 0.21 0.19 0.17 0.22 0.25 0.31 0.13 0.16 0.13 0.11
Sro246_g097700.1 (Contig171.g1954)
0.03 1.0 0.7 0.46 0.71 0.17 0.35 0.3 0.52 0.33 0.29 0.31 0.45 0.31 0.31 0.26 0.27 0.34 0.37 0.54 0.37 0.28 0.54 0.22 0.22 0.21 0.21
Sro2476_g328780.1 (Contig1473.g13495)
0.15 0.88 0.86 0.77 0.84 0.3 0.74 1.0 0.96 0.6 0.32 0.71 0.92 0.37 0.47 0.69 0.31 0.4 0.41 0.63 0.56 0.83 0.65 0.48 0.63 0.35 0.37
Sro273_g105090.1 (Contig4205.g31990)
0.03 1.0 0.52 0.65 0.43 0.07 0.74 0.53 0.17 0.58 0.0 0.4 0.19 0.69 0.61 0.67 0.91 0.54 0.36 0.64 0.62 0.89 0.32 0.28 0.19 0.46 0.43
Sro302_g112160.1 (Contig378.g5074)
0.1 0.37 1.0 0.52 0.37 0.03 0.66 0.27 0.64 0.4 0.18 0.44 0.51 0.19 0.17 0.12 0.08 0.07 0.19 0.64 0.57 0.1 0.46 0.51 0.64 0.35 0.12
Sro309_g113800.1 (Contig3477.g26970)
0.0 0.79 1.0 0.37 0.37 0.38 0.27 0.19 0.66 0.28 0.16 0.28 0.86 0.27 0.24 0.22 0.12 0.46 0.46 0.73 0.25 0.9 0.37 0.26 0.19 0.2 0.08
Sro313_g114910.1 (Contig1770.g15666)
0.03 1.0 0.35 0.31 0.44 0.14 0.5 0.65 0.38 0.34 0.31 0.36 0.36 0.25 0.41 0.29 0.19 0.33 0.25 0.47 0.4 0.38 0.39 0.36 0.42 0.27 0.24
Sro315_g115250.1 (Contig447.g6048)
0.24 0.98 0.94 0.67 0.76 0.04 0.72 0.36 0.36 0.42 0.12 0.34 0.5 0.36 0.19 0.19 0.13 0.32 0.38 1.0 0.49 0.25 0.34 0.32 0.77 0.31 0.09
0.09 0.3 0.31 0.42 0.42 0.22 0.25 0.59 0.48 0.25 1.0 0.24 0.24 0.37 0.4 0.36 0.59 0.4 0.32 0.23 0.15 0.27 0.42 0.31 0.44 0.43 0.39
Sro321_g116680.1 (Contig56.g424)
0.01 1.0 0.99 0.74 0.9 0.08 0.4 0.42 0.67 0.22 0.29 0.19 0.24 0.23 0.25 0.16 0.23 0.38 0.27 0.2 0.17 0.2 0.6 0.51 0.67 0.52 0.18
Sro328_g118600.1 (Contig3574.g27615)
0.0 1.0 0.46 0.47 0.53 0.02 0.09 0.12 0.26 0.08 0.05 0.02 0.08 0.05 0.03 0.02 0.04 0.08 0.07 0.07 0.03 0.11 0.19 0.34 0.53 0.19 0.03
Sro3323_g346790.1 (Contig1216.g11417)
0.3 0.59 0.82 1.0 0.65 0.12 0.34 0.21 0.29 0.31 0.18 0.3 0.33 0.14 0.27 0.48 0.26 0.42 0.22 0.37 0.25 0.57 0.36 0.24 0.03 0.13 0.24
Sro347_g122910.1 (Contig477.g6459)
0.03 1.0 0.55 0.59 0.61 0.04 0.33 0.56 0.49 0.24 0.14 0.26 0.22 0.32 0.16 0.14 0.14 0.13 0.09 0.26 0.27 0.37 0.49 0.25 0.36 0.13 0.1
Sro418_g138920.1 (Contig289.g3797)
0.15 0.81 1.0 0.24 0.62 0.01 0.12 0.41 0.81 0.15 0.02 0.27 0.04 0.0 0.06 0.0 0.04 0.0 0.0 0.08 0.02 0.57 0.81 0.01 0.06 0.21 0.02
Sro428_g140930.1 (Contig2589.g21021)
0.01 0.97 1.0 0.87 0.94 0.03 0.59 0.57 0.57 0.07 0.03 0.02 0.09 0.01 0.04 0.07 0.01 0.05 0.06 0.06 0.01 0.14 0.65 0.01 0.03 0.01 0.03
Sro440_g143380.1 (Contig2528.g20650)
0.04 0.84 0.93 1.0 0.72 0.05 0.79 0.66 0.51 0.21 0.21 0.11 0.08 0.07 0.26 0.41 0.21 0.04 0.02 0.1 0.24 0.64 0.33 0.31 0.24 0.14 0.25
Sro458_g146980.1 (Contig3230.g25530)
0.0 1.0 0.7 0.66 0.73 0.0 0.35 0.09 0.12 0.19 0.0 0.02 0.0 0.0 0.17 0.07 0.0 0.0 0.03 0.31 0.02 0.16 0.16 0.46 0.47 0.1 0.04
Sro46_g027550.1 (Contig1636.g14745)
0.05 0.64 1.0 0.23 0.39 0.21 0.22 0.24 0.12 0.1 0.01 0.09 0.01 0.02 0.06 0.04 0.03 0.04 0.01 0.0 0.1 0.01 0.55 0.08 0.07 0.08 0.07
Sro474_g150280.1 (Contig2775.g22324)
0.03 1.0 0.54 0.59 0.68 0.05 0.16 0.35 0.28 0.15 0.3 0.12 0.08 0.02 0.21 0.34 0.27 0.44 0.2 0.11 0.06 0.07 0.22 0.14 0.11 0.09 0.21
Sro474_g150290.1 (Contig2775.g22325)
0.01 1.0 0.55 0.69 0.6 0.05 0.13 0.29 0.17 0.24 0.15 0.31 0.32 0.12 0.18 0.34 0.13 0.26 0.42 0.33 0.2 0.11 0.28 0.19 0.24 0.2 0.2
Sro483_g152080.1 (Contig4159.g31760)
0.16 1.0 0.43 0.27 0.37 0.08 0.29 0.24 0.18 0.38 0.26 0.39 0.4 0.23 0.2 0.56 0.19 0.45 0.45 0.58 0.62 0.32 0.22 0.32 0.73 0.38 0.16
Sro559_g166560.1 (Contig536.g6972)
0.01 0.47 0.48 0.42 0.43 0.1 0.48 0.2 0.59 0.44 0.29 0.39 1.0 0.39 0.4 0.56 0.25 0.49 0.56 0.76 0.42 0.7 0.64 0.32 0.34 0.3 0.31
Sro567_g167940.1 (Contig3851.g29650)
0.0 0.77 0.69 0.88 0.77 0.09 0.38 0.43 0.61 0.23 0.22 0.23 0.39 0.3 0.26 0.21 0.16 0.24 0.23 0.32 0.3 0.21 0.63 0.46 1.0 0.59 0.13
Sro591_g172000.1 (Contig3321.g26071)
0.01 1.0 0.36 0.31 0.45 0.03 0.18 0.29 0.24 0.14 0.06 0.11 0.18 0.06 0.09 0.08 0.03 0.36 0.22 0.16 0.18 0.05 0.16 0.08 0.21 0.09 0.08
0.0 1.0 0.77 0.53 0.39 0.12 0.29 0.14 0.25 0.2 0.26 0.19 0.42 0.28 0.21 0.17 0.35 0.19 0.16 0.34 0.2 0.6 0.29 0.08 0.11 0.07 0.13
Sro628_g178140.1 (Contig4318.g32587)
0.0 1.0 0.7 0.38 0.4 0.02 0.3 0.39 0.4 0.21 0.18 0.12 0.22 0.15 0.17 0.23 0.07 0.56 0.26 0.21 0.44 0.3 0.14 0.29 0.52 0.39 0.12
Sro631_g178400.1 (Contig3194.g25245)
0.03 0.61 0.68 1.0 0.58 0.02 0.17 0.32 0.38 0.06 0.09 0.02 0.12 0.01 0.06 0.02 0.26 0.12 0.04 0.07 0.0 0.17 0.52 0.01 0.01 0.03 0.02
0.05 0.67 0.83 0.67 0.69 0.21 0.4 0.98 0.64 0.38 0.82 0.27 0.08 0.28 0.68 0.69 1.0 0.07 0.04 0.08 0.39 0.22 0.53 0.41 0.44 0.22 0.38
Sro671_g184850.1 (Contig562.g7142)
0.02 1.0 0.62 0.26 0.45 0.41 0.16 0.05 0.15 0.27 0.18 0.28 1.0 0.34 0.29 0.27 0.07 0.42 0.49 0.92 0.39 0.37 0.23 0.05 0.02 0.09 0.16
Sro705_g190350.1 (Contig346.g4669)
0.29 0.0 0.0 0.0 0.01 0.08 0.15 0.35 0.48 0.22 0.22 0.3 0.02 0.04 0.13 0.36 0.28 0.34 0.03 0.04 0.23 0.04 0.27 0.28 1.0 0.39 0.21
Sro752_g197250.1 (Contig1730.g15449)
0.0 0.7 1.0 0.56 0.6 0.09 0.45 0.49 0.91 0.39 0.16 0.23 0.69 0.55 0.21 0.34 0.14 0.23 0.39 0.79 0.48 0.78 0.59 0.23 0.4 0.26 0.18
Sro762_g198650.1 (Contig3620.g28006)
0.01 1.0 0.76 0.51 0.45 0.15 0.24 0.7 0.32 0.26 0.23 0.25 0.1 0.1 0.25 0.2 0.16 0.42 0.09 0.11 0.25 0.06 0.18 0.2 0.27 0.16 0.2
0.0 0.94 1.0 0.02 0.43 0.0 0.06 0.54 0.43 0.09 0.03 0.06 0.42 0.01 0.01 0.01 0.03 0.1 0.45 0.18 0.01 0.19 0.2 0.0 0.0 0.01 0.03
Sro880_g215150.1 (Contig3977.g30553)
0.04 1.0 0.75 0.24 0.52 0.0 0.02 0.32 0.11 0.08 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.06 0.08 0.22 0.0 0.08 0.05 0.04 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro882_g215370.1 (Contig1771.g15680)
0.1 0.18 0.33 0.23 0.23 0.31 0.69 0.48 0.85 0.29 0.61 0.52 0.68 0.52 0.42 0.32 0.55 0.51 0.7 0.58 0.19 0.07 0.61 1.0 0.51 0.63 0.28
Sro882_g215380.1 (Contig1771.g15681)
0.05 0.42 0.47 0.47 0.53 0.11 0.38 0.28 0.4 0.15 0.26 0.19 0.34 0.21 0.2 0.14 0.27 0.29 0.42 0.38 0.1 0.05 0.37 0.54 1.0 0.78 0.12
Sro943_g222770.1 (Contig253.g3117)
0.0 0.21 0.44 0.21 0.2 0.0 0.14 0.05 0.31 0.08 0.11 0.08 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.1 0.02 0.01 0.18 0.0 0.33 0.19 1.0 0.39 0.03
0.0 1.0 0.73 0.34 0.44 0.02 0.39 0.27 0.19 0.18 0.11 0.11 0.14 0.11 0.16 0.15 0.18 0.15 0.09 0.13 0.14 0.33 0.21 0.27 0.38 0.16 0.09
Sro999_g229600.1 (Contig4042.g31037)
0.0 1.0 0.45 0.19 0.43 0.11 0.23 0.28 0.11 0.07 0.03 0.03 0.02 0.0 0.07 0.06 0.04 0.12 0.03 0.01 0.06 0.07 0.26 0.08 0.12 0.06 0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)