Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
0.04 0.19 0.21 0.24 0.3 0.18 0.4 0.23 0.37 0.37 0.64 0.42 0.61 0.32 0.48 0.67 0.57 0.8 1.0 0.59 0.34 0.05 0.26 0.51 0.47 0.44 0.79
Sro1126_g244130.1 (Contig1609.g14574)
0.0 0.65 0.33 0.24 0.33 0.15 0.64 0.09 0.3 0.39 0.5 0.27 0.68 0.24 0.75 1.0 0.22 0.44 0.43 0.8 0.36 0.43 0.16 0.82 0.97 0.88 0.44
Sro1193_g251130.1 (Contig4499.g33736)
0.03 0.07 0.1 0.09 0.08 0.23 0.15 0.15 0.11 0.2 0.49 0.14 0.28 0.12 0.72 0.37 0.33 1.0 0.68 0.27 0.2 0.07 0.11 0.6 0.44 0.22 0.3
Sro1258_g256850.1 (Contig3284.g25822)
0.07 0.3 0.29 0.29 0.25 0.06 0.56 0.66 0.44 0.26 0.42 0.19 0.29 0.02 0.42 1.0 0.22 0.61 0.41 0.37 0.47 0.05 0.57 0.46 0.8 0.23 0.59
Sro1380_g267790.1 (Contig4344.g32788)
0.02 0.68 0.54 0.29 0.28 0.18 0.5 0.51 0.44 0.6 0.74 0.6 1.0 0.53 0.56 0.78 0.57 0.68 0.7 0.82 0.86 0.36 0.37 0.78 0.64 0.45 0.85
Sro1515_g279020.1 (Contig1412.g12974)
0.0 0.1 0.14 0.19 0.09 0.06 0.18 0.11 0.05 0.15 0.26 0.11 0.14 0.04 0.37 0.2 0.11 0.39 0.3 0.19 0.17 0.0 0.06 0.4 1.0 0.67 0.13
Sro1519_g279260.1 (Contig4680.g34804)
0.0 0.58 0.41 0.47 0.36 0.15 0.52 0.46 0.32 0.44 0.78 0.47 1.0 0.29 0.69 0.8 0.61 0.53 0.55 0.63 0.58 0.38 0.25 0.5 0.66 0.51 0.48
Sro1599_g285000.1 (Contig4096.g31290)
0.09 0.16 0.13 0.06 0.08 0.08 0.62 0.55 0.41 0.23 0.59 0.18 0.34 0.07 0.43 0.55 0.29 0.38 0.26 0.37 0.28 0.2 0.67 0.46 1.0 0.29 0.49
Sro1662_g289400.1 (Contig4121.g31546)
0.01 0.21 0.16 0.09 0.11 0.15 0.44 0.71 0.39 0.3 0.93 0.11 0.15 0.07 0.68 0.61 0.52 0.56 0.59 0.17 0.23 0.11 0.42 0.6 0.44 0.24 1.0
Sro1662_g289410.1 (Contig4121.g31547)
0.0 0.07 0.05 0.06 0.04 0.07 0.19 0.42 0.24 0.22 0.74 0.11 0.17 0.07 0.51 0.33 0.46 0.48 0.44 0.15 0.19 0.1 0.18 0.3 0.17 0.04 1.0
Sro1685_g291090.1 (Contig3608.g27876)
0.0 0.09 0.08 0.07 0.1 1.0 0.2 0.17 0.13 0.3 0.49 0.06 0.43 0.07 0.43 0.41 0.19 0.41 0.86 0.65 0.26 0.05 0.31 0.66 0.58 0.49 0.36
Sro1770_g296560.1 (Contig2654.g21451)
0.0 0.42 0.37 0.27 0.25 0.03 0.39 0.56 0.32 0.34 0.8 0.03 0.27 0.13 0.64 0.4 0.35 0.84 0.78 0.53 0.23 0.02 0.16 0.29 0.48 0.19 1.0
Sro186_g080630.1 (Contig266.g3344)
0.01 0.04 0.05 0.02 0.02 0.13 0.09 0.06 0.08 0.19 1.0 0.06 0.13 0.02 0.9 0.62 0.56 0.5 0.26 0.15 0.11 0.0 0.08 0.1 0.25 0.15 0.68
Sro1882_g303400.1 (Contig570.g7241)
0.64 0.26 0.24 0.24 0.25 0.33 0.58 0.59 0.47 0.44 0.89 0.36 0.45 0.4 0.85 0.66 0.73 0.97 0.81 0.55 0.56 0.34 0.41 0.75 1.0 0.71 0.61
Sro18_g013010.1 (Contig1351.g12461)
0.01 0.12 0.07 0.03 0.02 0.19 0.32 0.31 0.08 0.32 0.87 0.2 0.15 0.06 0.71 1.0 0.39 0.52 0.61 0.29 0.46 0.03 0.12 0.55 0.64 0.42 0.82
Sro18_g013050.1 (Contig1351.g12465)
0.01 0.05 0.05 0.02 0.01 0.18 0.26 0.26 0.11 0.22 0.51 0.16 0.11 0.01 0.44 0.41 0.28 0.56 0.53 0.17 0.41 0.02 0.12 0.46 1.0 0.52 0.45
Sro2009_g310740.1 (Contig340.g4634)
0.0 0.09 0.08 0.09 0.08 0.12 0.23 0.18 0.19 0.25 0.52 0.12 0.24 0.08 0.59 0.49 0.3 1.0 0.82 0.41 0.33 0.03 0.15 0.37 0.73 0.56 0.45
Sro222_g091180.1 (Contig3134.g24881)
0.01 0.12 0.1 0.11 0.1 0.2 0.5 0.99 0.7 0.27 0.89 0.11 0.14 0.03 0.84 0.69 0.72 0.82 0.6 0.15 0.21 0.03 1.0 0.7 0.47 0.28 0.97
Sro2269_g321370.1 (Contig2676.g21659)
0.32 0.33 0.25 0.25 0.31 0.18 0.41 0.44 0.38 0.42 0.49 0.3 0.72 0.34 0.48 0.57 0.36 1.0 0.9 0.64 0.5 0.36 0.62 0.36 0.7 0.45 0.51
Sro2304_g322580.1 (Contig3171.g25092)
0.03 0.07 0.06 0.04 0.05 0.16 0.49 0.48 0.26 0.33 1.0 0.29 0.12 0.03 0.86 0.7 0.58 0.86 0.56 0.25 0.37 0.01 0.31 0.67 0.68 0.36 0.97
Sro231_g093620.1 (Contig3051.g24275)
0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.16 0.23 0.41 0.21 0.26 0.9 0.06 0.15 0.07 0.79 0.58 0.43 1.0 0.59 0.12 0.08 0.03 0.31 0.8 0.6 0.44 0.66
Sro269_g104070.1 (Contig1337.g12328)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.18 0.11 0.02 0.22 0.48 0.03 0.38 0.01 0.55 0.4 0.12 1.0 0.82 0.59 0.3 0.0 0.06 0.4 0.9 0.61 0.39
Sro276_g106130.1 (Contig2556.g20793)
0.02 0.42 0.37 0.39 0.41 0.44 0.53 0.52 0.37 0.48 0.94 0.45 0.38 0.25 0.88 0.78 0.7 1.0 0.85 0.52 0.6 0.11 0.39 0.57 0.52 0.56 0.62
Sro291_g109460.1 (Contig4055.g31092)
0.01 0.74 0.49 0.42 0.42 0.16 0.53 0.67 0.44 0.32 0.92 0.07 0.61 0.1 0.73 0.95 0.85 0.95 0.72 1.0 0.23 0.29 0.43 0.55 0.33 0.16 0.68
Sro3032_g342510.1 (Contig3309.g25928)
0.01 0.03 0.09 0.03 0.03 0.11 0.18 0.09 0.19 0.22 0.65 0.13 0.51 0.19 0.49 0.29 0.41 0.38 1.0 0.58 0.15 0.03 0.21 0.39 0.22 0.25 0.34
Sro304_g112540.1 (Contig465.g6228)
0.01 0.07 0.06 0.06 0.08 0.36 0.29 0.21 0.13 0.45 0.75 0.43 0.41 0.21 0.74 0.54 0.71 0.96 0.92 0.48 0.69 0.03 0.11 0.37 1.0 0.71 0.36
Sro3086_g343430.1 (Contig1039.g10280)
0.01 0.44 0.26 0.23 0.23 0.21 0.5 0.31 0.37 0.46 0.78 0.49 0.63 0.39 0.69 0.83 0.38 0.71 0.88 0.59 0.51 0.23 0.38 0.79 0.52 0.45 1.0
Sro34_g021960.1 (Contig4590.g34299)
0.0 0.12 0.15 0.07 0.09 0.18 0.18 0.24 0.13 0.26 0.75 0.14 0.11 0.02 0.63 0.57 0.55 0.81 1.0 0.17 0.23 0.0 0.22 0.63 0.51 0.32 0.43
Sro34_g021970.1 (Contig4590.g34300)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.01 0.11 0.05 0.11 0.05 0.19 1.0 0.26 0.03 0.04 0.84 0.9 0.38 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.12 0.67 0.04 0.07 0.55
Sro34_g021980.1 (Contig4590.g34301)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.09 0.07 0.13 0.06 0.23 0.52 0.17 0.13 0.02 0.52 0.44 0.44 0.86 1.0 0.17 0.21 0.0 0.11 0.28 0.11 0.03 0.38
0.01 0.05 0.01 0.03 0.01 0.22 0.07 0.29 0.09 0.39 1.0 0.07 0.17 0.14 0.73 0.42 0.1 0.71 0.26 0.18 0.17 0.0 0.11 0.1 0.09 0.05 0.71
Sro34_g021990.1 (Contig4590.g34302)
0.0 0.14 0.18 0.15 0.2 0.34 0.19 0.27 0.22 0.28 0.62 0.27 0.18 0.07 0.57 0.5 0.63 0.82 0.62 0.22 0.39 0.1 0.23 0.4 1.0 0.67 0.29
Sro384_g131520.1 (Contig425.g5725)
0.0 0.03 0.06 0.02 0.02 0.17 0.66 0.85 0.51 0.24 0.62 0.24 0.1 0.04 0.49 0.47 0.48 0.94 0.55 0.12 0.28 0.01 0.49 0.93 1.0 0.72 0.55
Sro38_g023610.1 (Contig1551.g14096)
0.6 0.24 0.21 0.17 0.21 0.25 0.37 0.73 0.43 0.29 0.96 0.08 0.16 0.05 0.8 0.82 0.68 0.71 0.52 0.17 0.17 0.08 0.58 0.52 0.4 0.32 1.0
Sro395_g134070.1 (Contig4272.g32326)
0.01 0.08 0.09 0.02 0.05 0.23 0.4 0.61 0.31 0.33 0.57 0.29 0.48 0.18 0.48 0.35 0.4 0.66 0.49 1.0 0.32 0.1 0.61 0.29 0.18 0.12 0.58
Sro403_g135650.1 (Contig3393.g26519)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.57 0.19 0.26 0.21 0.24 0.16 0.57 0.16 0.4 0.63 0.12 1.0 0.73 0.69 0.32 0.01 0.18 0.33 0.43 0.32 0.24
Sro415_g138470.1 (Contig3170.g25082)
0.01 0.17 0.13 0.16 0.12 0.08 0.4 0.53 0.29 0.27 0.56 0.23 0.09 0.02 0.39 0.49 0.54 0.59 0.48 0.17 0.51 0.03 0.3 0.54 1.0 0.33 0.42
Sro41_g025330.1 (Contig169.g1939)
0.0 0.06 0.04 0.04 0.07 0.2 0.49 0.65 0.35 0.34 0.9 0.16 0.16 0.03 0.78 0.75 0.48 0.94 0.79 0.25 0.43 0.03 0.59 0.62 0.54 0.38 1.0
Sro41_g025340.1 (Contig169.g1940)
0.0 0.01 0.02 0.12 0.03 0.41 0.33 0.62 0.18 0.32 0.8 0.24 0.32 0.28 1.0 0.92 0.43 0.61 0.25 0.37 0.26 0.01 0.05 0.71 0.53 0.54 0.59
Sro480_g151310.1 (Contig2927.g23332)
0.0 0.23 0.18 0.18 0.23 0.14 0.31 0.31 0.2 0.19 0.53 0.04 0.1 0.08 0.62 0.47 0.29 0.68 0.5 0.13 0.13 0.01 0.37 0.79 1.0 0.81 0.33
Sro481_g151530.1 (Contig3107.g24711)
0.0 0.17 0.08 0.04 0.06 0.07 0.31 0.82 0.46 0.17 0.42 0.04 0.06 0.0 0.35 0.22 0.12 0.5 0.23 0.08 0.08 0.01 0.45 0.35 0.47 0.24 1.0
Sro486_g152670.1 (Contig3152.g25006)
0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.07 0.37 0.36 0.21 0.3 0.49 0.17 0.11 0.05 0.57 0.73 0.26 0.65 0.47 0.19 0.68 0.02 0.26 0.47 1.0 0.62 0.49
Sro530_g161230.1 (Contig4609.g34408)
0.0 0.05 0.08 0.06 0.08 0.07 0.25 0.35 0.23 0.13 0.46 0.01 0.05 0.05 0.39 0.34 0.33 0.51 0.25 0.07 0.13 0.01 0.4 0.51 1.0 0.42 0.46
Sro530_g161240.1 (Contig4609.g34409)
0.0 0.05 0.11 0.07 0.13 0.13 0.34 0.61 0.41 0.2 0.69 0.01 0.04 0.01 0.59 0.5 0.41 0.71 0.36 0.06 0.09 0.01 0.72 0.93 1.0 0.62 0.9
Sro553_g165220.1 (Contig1023.g10198)
0.01 0.05 0.03 0.02 0.04 0.18 0.42 0.39 0.12 0.33 0.69 0.15 0.14 0.04 0.78 0.77 0.46 0.76 0.6 0.2 0.4 0.01 0.2 1.0 0.99 0.62 0.7
Sro584_g170740.1 (Contig2089.g17799)
0.02 0.68 0.64 0.38 0.35 0.12 0.43 0.5 0.31 0.42 0.66 0.38 0.6 0.24 0.51 0.63 0.28 0.69 0.57 0.61 0.36 0.26 0.2 1.0 0.34 0.19 0.79
Sro606_g174550.1 (Contig3560.g27492)
0.02 0.43 0.54 0.25 0.24 0.33 0.62 0.57 0.36 0.47 0.84 0.43 0.49 0.25 0.8 0.76 0.47 0.69 0.55 0.61 0.49 0.13 0.33 0.69 1.0 0.73 0.57
Sro658_g182660.1 (Contig1438.g13216)
0.01 0.11 0.1 0.12 0.14 0.2 0.38 0.36 0.24 0.26 0.47 0.18 0.49 0.17 0.56 0.37 0.33 0.88 1.0 0.66 0.25 0.03 0.23 0.6 0.74 0.67 0.24
Sro722_g192830.1 (Contig2490.g20403)
0.08 0.46 0.33 0.17 0.13 0.13 0.5 0.41 0.18 0.34 0.64 0.19 0.27 0.07 0.54 0.79 0.26 0.68 0.85 0.41 0.33 0.02 0.11 0.81 0.85 0.43 1.0
Sro783_g201950.1 (Contig1778.g15746)
0.01 0.65 0.53 0.5 0.28 0.29 0.7 0.57 0.49 0.56 0.75 0.57 0.89 0.29 0.82 0.87 0.55 0.75 0.94 1.0 0.64 0.6 0.43 0.65 0.68 0.43 0.7
Sro96_g049720.1 (Contig3763.g28898)
0.0 0.18 0.09 0.07 0.03 0.04 0.19 0.14 0.03 0.2 0.2 0.11 0.4 0.03 0.43 0.4 0.16 1.0 0.55 0.63 0.2 0.01 0.03 0.5 0.66 0.56 0.16
Sro990_g228570.1 (Contig427.g5781)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.09 0.15 0.18 0.12 0.5 0.0 0.17 0.0 0.38 0.19 0.13 0.52 1.0 0.13 0.13 0.04 0.27 0.31 0.09 0.03 0.41
Sro995_g229150.1 (Contig1284.g11992)
0.02 0.23 0.33 0.35 0.35 0.32 0.38 1.0 0.46 0.26 0.34 0.28 0.23 0.02 0.61 0.74 0.28 0.47 0.12 0.26 0.39 0.01 0.46 0.7 0.58 0.39 0.44
Sro9_g007350.1 (Contig4120.g31503)
0.05 0.45 0.26 0.12 0.09 0.29 0.5 0.49 0.2 0.48 0.99 0.42 0.29 0.11 1.0 0.89 0.55 0.84 0.59 0.29 0.8 0.07 0.29 0.7 0.91 0.63 0.78

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)