1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_236 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1010_g230900.1 (Contig4560.g34055)
 0.04 0.27 0.39 0.24 0.11 0.27 0.42 0.39 0.28 0.77 0.46 0.94 0.75 0.79 0.53 0.56 0.43 0.51 0.78 0.68 1.0 0.39 0.17 0.51 0.63 0.44 0.63
Sro1094_g240510.1 (Contig659.g7790)
 0.01 0.57 0.44 0.42 0.29 0.07 0.24 0.21 0.11 0.4 0.38 0.47 0.4 0.38 0.35 0.49 0.32 0.51 0.36 1.0 0.52 0.02 0.07 0.17 0.18 0.22 0.33
Sro1129_g244360.1 (Contig2187.g18229)
 0.41 0.12 0.06 0.06 0.05 0.06 0.12 0.47 0.2 0.8 0.67 1.0 0.19 0.75 0.27 0.17 0.38 0.31 0.26 0.21 0.72 0.3 0.14 0.11 0.14 0.19 0.49
Sro113_g056000.1 (Contig4126.g31565)
 0.09 0.14 0.13 0.13 0.13 0.06 0.35 0.29 0.35 0.59 0.37 0.85 0.1 0.22 0.31 0.47 0.24 0.13 0.14 0.21 1.0 0.09 0.2 0.46 0.41 0.23 0.28
Sro1222_g253850.1 (Contig1750.g15577)
 0.0 0.05 0.06 0.03 0.02 0.13 0.38 0.07 0.0 0.5 0.41 1.0 0.0 0.17 0.48 0.52 0.34 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.62 0.7 0.41 0.35
Sro129_g061550.1 (Contig1945.g16729)
 0.01 0.17 0.4 0.32 0.22 0.1 0.31 0.3 0.1 0.53 0.68 0.72 0.43 0.77 0.65 1.0 0.36 0.5 0.58 0.76 0.79 0.15 0.1 0.55 0.37 0.41 0.5
Sro130_g061930.1 (Contig2611.g21116)
 0.03 0.48 0.61 0.32 0.21 0.26 0.45 0.26 0.13 0.67 0.71 0.75 0.64 0.58 0.65 0.66 0.74 0.69 0.63 0.86 1.0 0.07 0.15 0.49 0.62 0.64 0.58
Sro1313_g261960.1 (Contig4199.g31964)
 0.01 0.61 0.54 0.7 0.51 0.22 0.41 0.41 0.33 0.62 0.55 0.51 0.92 0.73 0.56 0.5 0.84 0.81 0.56 1.0 0.71 0.16 0.34 0.22 0.22 0.22 0.47
Sro1339_g264350.1 (Contig2212.g18360)
 0.01 0.16 0.23 0.18 0.19 0.13 0.35 0.41 0.33 0.74 1.0 0.82 0.58 0.43 0.64 0.66 0.54 0.3 0.25 0.65 0.84 0.33 0.24 0.59 0.38 0.34 0.59
Sro1343_g264620.1 (Contig3518.g27230)
 0.04 0.16 0.16 0.12 0.27 0.06 0.11 0.03 0.22 0.61 0.23 1.0 0.38 0.52 0.13 0.13 0.17 0.05 0.04 0.66 0.96 0.28 0.07 0.04 0.02 0.07 0.2
Sro1361_g266240.1 (Contig3089.g24639)
 0.01 0.47 0.56 0.41 0.27 0.1 0.28 0.16 0.23 0.5 0.46 0.56 0.44 1.0 0.54 0.55 0.53 0.29 0.3 0.92 0.63 0.17 0.17 0.27 0.18 0.31 0.4
Sro1416_g270840.1 (Contig660.g7806)
 0.05 0.08 0.1 0.03 0.06 0.09 0.49 0.4 0.31 0.61 0.41 0.76 0.21 0.21 0.46 0.47 0.35 0.48 0.29 0.33 1.0 0.12 0.11 0.56 0.43 0.36 0.35
Sro1443_g273170.1 (Contig745.g8538)
 0.06 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.15 0.15 0.77 0.1 1.0 0.13 0.23 0.2 0.09 0.02 0.21 0.5 0.43 0.77 0.08 0.03 0.04 0.08 0.12 0.36
Sro1542_g281080.1 (Contig3357.g26289)
 0.01 0.06 0.0 0.07 0.05 0.15 0.29 0.07 0.1 0.45 0.45 0.47 0.61 0.88 0.41 0.75 0.34 0.49 0.75 1.0 0.39 0.0 0.13 0.38 0.16 0.19 0.21
Sro160_g072240.1 (Contig2985.g23720)
 0.15 0.01 0.01 0.02 0.01 0.1 0.17 0.1 0.08 0.7 0.26 0.81 0.09 0.59 0.22 0.27 0.17 0.13 0.21 0.16 1.0 0.09 0.06 0.11 0.05 0.1 0.19
Sro1838_g300810.1 (Contig106.g1231)
 0.01 0.17 0.08 0.1 0.11 0.18 0.49 0.53 0.39 0.71 0.63 0.86 0.38 0.38 0.57 0.89 0.54 0.5 0.83 0.54 1.0 0.3 0.24 0.35 0.39 0.36 0.7
Sro1912_g304960.1 (Contig2968.g23581)
 0.0 0.06 0.22 0.02 0.02 0.08 0.58 0.59 0.12 0.56 0.4 0.85 0.33 0.36 0.77 1.0 0.78 0.4 0.45 0.37 0.86 0.09 0.17 0.65 0.58 0.81 0.5
Sro1977_g308910.1 (Contig2098.g17845)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.25 0.04 0.0 0.57 0.3 0.83 0.0 0.15 0.47 0.68 0.15 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.39 0.83 0.54 1.0
Sro199_g084360.1 (Contig257.g3174)
 0.01 0.21 0.2 0.07 0.04 0.04 0.27 0.1 0.16 0.44 0.24 1.0 0.01 0.03 0.25 0.24 0.18 0.0 0.01 0.02 0.87 0.0 0.06 0.15 0.23 0.28 0.19
Sro1_g000740.1 (Contig3007.g23989)
 1.0 0.05 0.03 0.07 0.06 0.16 0.11 0.14 0.07 0.67 0.27 1.0 0.15 0.47 0.29 0.43 0.29 0.22 0.39 0.27 0.87 0.14 0.13 0.23 0.32 0.14 0.26
Sro201_g085000.1 (Contig2914.g23169)
 0.17 0.35 0.26 0.15 0.12 0.18 0.33 0.23 0.21 0.72 0.63 0.81 0.29 0.46 0.53 0.52 0.45 0.4 0.46 0.45 1.0 0.15 0.1 0.34 0.28 0.36 0.51
Sro201_g085010.1 (Contig2914.g23170)
 0.01 0.09 0.12 0.08 0.04 0.2 0.27 0.27 0.13 0.66 0.66 0.82 0.17 0.43 0.46 0.55 0.41 0.29 0.39 0.31 1.0 0.09 0.08 0.33 0.3 0.32 0.5
Sro2306_g322740.1 (Contig2093.g17838)
 0.23 0.02 0.01 0.0 0.01 0.05 0.06 0.03 0.05 0.42 0.18 0.86 0.09 0.22 0.3 0.31 0.09 0.04 0.02 0.11 1.0 0.02 0.02 0.04 0.07 0.04 0.12
Sro275_g105790.1 (Contig3464.g26881)
 0.01 0.03 0.07 0.07 0.13 0.03 0.19 0.31 0.23 0.5 0.34 0.67 0.04 0.17 0.31 0.38 0.1 0.19 0.09 0.09 1.0 0.08 0.07 0.15 0.13 0.21 0.24
Sro2870_g339100.1 (Contig3015.g24070)
 0.0 0.13 0.23 0.24 0.16 0.41 0.15 0.07 0.01 0.67 0.89 0.71 0.69 0.33 0.52 0.71 0.75 0.44 0.41 0.96 1.0 0.0 0.01 0.42 0.29 0.35 0.52
Sro3082_g343370.1 (Contig1477.g13511)
 0.01 0.51 0.36 0.45 0.3 0.06 0.27 0.34 0.21 0.59 0.34 0.7 0.22 0.52 0.53 0.53 0.35 0.27 0.17 0.5 1.0 0.18 0.11 0.34 0.35 0.41 0.44
Sro3109_g343890.1 (Contig3616.g27946)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12 0.04 0.05 0.3 0.16 0.41 0.49 0.24 0.17 0.44 0.12 0.39 0.26 1.0 0.28 0.04 0.04 0.12 0.0 0.09 0.21
Sro313_g114830.1 (Contig1770.g15658)
 0.04 0.0 0.18 0.08 0.06 0.02 0.05 0.21 0.03 0.46 0.31 1.0 0.05 0.68 0.1 0.15 0.11 0.03 0.14 0.27 0.51 0.02 0.04 0.01 0.14 0.2 0.11
Sro313_g114840.1 (Contig1770.g15659)
 0.03 0.06 0.33 0.04 0.11 0.1 0.08 0.18 0.09 0.53 0.17 1.0 0.16 0.55 0.17 0.23 0.15 0.05 0.18 0.41 0.93 0.11 0.1 0.03 0.08 0.22 0.17
Sro327_g118390.1 (Contig839.g9247)
 0.08 0.37 0.57 0.28 0.32 0.07 0.39 0.36 0.24 0.74 0.7 0.86 0.49 0.7 0.74 1.0 0.7 0.49 0.34 0.65 0.89 0.09 0.14 0.46 0.51 0.43 0.47
Sro3287_g346230.1 (Contig3043.g24241)
 0.03 0.08 0.19 0.03 0.07 0.18 0.43 0.07 0.13 0.47 0.64 0.92 0.0 0.73 0.48 0.47 0.5 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.33 0.15 0.19 0.39
Sro338_g120830.1 (Contig15.g120)
 0.02 0.13 0.13 0.06 0.11 0.18 0.31 0.27 0.07 0.68 0.6 0.8 0.25 0.9 0.46 0.49 0.34 0.49 0.34 0.56 1.0 0.22 0.15 0.34 0.34 0.37 0.82
Sro33_g021590.1 (Contig2613.g21180)
 0.12 0.13 0.12 0.09 0.09 0.33 0.43 0.48 0.46 0.69 0.98 1.0 0.42 0.45 0.6 0.46 0.74 0.47 0.6 0.51 0.86 0.32 0.32 0.57 0.55 0.46 0.63
Sro3787_g351040.1 (Contig3052.g24289)
 0.04 0.22 0.22 0.19 0.14 0.32 0.44 0.34 0.36 0.56 0.72 0.75 0.47 0.7 0.69 0.66 0.59 0.25 0.35 0.58 1.0 0.16 0.21 0.36 0.3 0.39 0.69
Sro386_g131840.1 (Contig4061.g31125)
 0.02 0.08 0.06 0.07 0.08 0.17 0.45 0.28 0.25 0.75 0.66 1.0 0.13 0.91 0.67 0.63 0.53 0.51 0.23 0.57 0.91 0.12 0.26 0.39 0.41 0.57 0.63
Sro395_g134060.1 (Contig4272.g32325)
 0.38 0.06 0.06 0.04 0.05 0.29 0.27 0.22 0.34 0.66 0.25 0.83 0.56 0.53 0.26 0.18 0.24 0.18 0.16 0.79 1.0 0.23 0.21 0.38 0.34 0.6 0.31
Sro515_g158400.1 (Contig141.g1573)
 0.0 0.1 0.1 0.04 0.02 0.08 0.39 0.29 0.14 0.54 0.57 0.6 0.01 0.31 0.7 0.61 0.33 0.06 0.03 0.06 0.89 0.04 0.07 0.68 0.34 1.0 0.69
Sro535_g161910.1 (Contig1610.g14582)
 0.01 0.52 0.45 0.42 0.43 0.2 0.39 0.23 0.23 0.64 0.65 0.73 0.77 0.58 0.6 0.62 0.44 0.35 0.6 0.78 1.0 0.32 0.16 0.55 0.5 0.43 0.5
Sro555_g165760.1 (Contig677.g7924)
 0.17 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.08 0.2 0.14 0.28 0.02 1.0 0.02 0.13 0.02 0.04 0.04 0.01 0.02 0.02 0.42 0.03 0.05 0.04 0.01 0.01 0.02
Sro563_g167190.1 (Contig3666.g28328)
 0.02 0.06 0.02 0.03 0.04 0.03 0.12 0.05 0.04 0.49 0.65 1.0 0.01 0.08 0.23 0.18 0.1 0.03 0.07 0.06 0.78 0.03 0.03 0.25 0.17 0.17 0.43
Sro563_g167230.1 (Contig3666.g28332)
 0.03 0.19 0.12 0.15 0.11 0.01 0.12 0.08 0.18 0.6 0.69 1.0 0.0 0.08 0.26 0.23 0.28 0.0 0.0 0.0 0.93 0.08 0.12 0.33 0.33 0.36 0.49
Sro566_g167870.1 (Contig3739.g28682)
 0.02 0.04 0.03 0.05 0.14 0.14 0.02 0.02 0.01 0.48 0.16 1.0 0.04 0.3 0.23 0.2 0.07 0.01 0.0 0.09 0.91 0.0 0.02 0.02 0.06 0.06 0.2
Sro589_g171860.1 (Contig2898.g23123)
 0.03 0.19 0.17 0.12 0.12 0.16 0.19 0.02 0.0 0.49 0.32 0.55 0.59 0.78 0.42 0.81 0.24 0.58 0.77 1.0 0.71 0.0 0.0 0.17 0.17 0.17 0.4
Sro612_g175510.1 (Contig276.g3569)
 0.03 0.05 0.0 0.07 0.0 0.0 0.24 0.12 0.07 0.54 1.0 0.67 0.07 0.06 0.19 0.29 0.19 0.0 0.15 0.11 0.8 0.0 0.0 0.64 0.14 0.59 0.33
Sro665_g183890.1 (Contig1678.g15082)
 0.04 0.23 0.2 0.21 0.2 0.33 0.49 0.45 0.38 0.69 0.79 0.87 0.41 0.5 0.62 0.81 0.47 0.56 0.69 0.71 1.0 0.36 0.37 0.69 0.62 0.5 0.61
Sro669_g184480.1 (Contig2091.g17820)
 0.04 0.15 0.11 0.04 0.12 0.31 0.2 0.13 0.09 0.65 0.68 0.8 0.49 0.76 0.46 0.47 0.21 0.33 0.36 0.86 1.0 0.1 0.06 0.3 0.18 0.37 0.82
Sro672_g185090.1 (Contig919.g9657)
 0.01 0.31 0.35 0.16 0.12 0.24 0.36 0.2 0.28 0.68 0.36 0.74 0.59 1.0 0.35 0.18 0.29 0.31 0.46 0.99 0.84 0.46 0.21 0.41 0.47 0.41 0.46
Sro732_g194480.1 (Contig2721.g21957)
 0.05 0.25 0.24 0.27 0.16 0.24 0.28 0.4 0.4 0.56 0.48 0.51 0.35 0.39 0.45 0.45 0.36 0.41 0.72 0.72 1.0 0.29 0.31 0.4 0.38 0.35 0.41
Sro800_g204380.1 (Contig413.g5572)
 0.05 0.23 0.13 0.11 0.1 0.16 0.35 0.05 0.21 0.52 0.47 0.76 0.29 0.54 0.47 0.5 0.48 0.05 0.09 0.33 1.0 0.01 0.13 0.28 0.23 0.2 0.46
0.04 0.1 0.01 0.11 0.06 0.08 0.18 0.07 0.14 0.63 0.54 1.0 0.13 0.6 0.35 0.27 0.33 0.16 0.18 0.29 0.71 0.08 0.08 0.15 0.03 0.17 0.31
Sro80_g042980.1 (Contig92.g1042)
 0.02 0.12 0.23 0.11 0.08 0.03 0.1 0.27 0.09 0.49 0.82 0.59 0.22 0.17 0.29 0.42 0.32 0.17 0.22 0.28 1.0 0.23 0.11 0.13 0.46 0.3 0.44
Sro833_g208580.1 (Contig120.g1364)
 0.02 0.13 0.03 0.04 0.06 0.25 0.25 0.28 0.12 0.55 0.43 0.64 0.62 1.0 0.4 0.47 0.31 0.33 0.4 0.8 0.63 0.29 0.1 0.27 0.22 0.31 0.67
Sro85_g045230.1 (Contig4580.g34200)
 0.03 0.16 0.24 0.27 0.19 0.26 0.27 0.17 0.27 0.68 0.87 0.91 0.75 0.6 0.56 0.55 0.91 0.56 0.77 0.94 1.0 0.25 0.23 0.27 0.32 0.22 0.57
Sro86_g045860.1 (Contig2999.g23864)
 0.35 0.66 0.71 0.65 0.57 0.2 0.44 0.31 0.25 0.75 0.62 0.85 0.27 0.53 0.73 0.89 0.57 0.69 0.59 0.74 1.0 0.25 0.19 0.59 0.38 0.42 0.65
0.01 0.02 0.0 0.02 0.02 0.06 0.12 0.04 0.04 0.47 0.3 0.82 0.0 0.09 0.25 0.34 0.28 0.01 0.0 0.0 1.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.06 0.21
Sro941_g222650.1 (Contig3325.g26148)
 0.1 0.28 0.27 0.17 0.11 0.1 0.29 0.23 0.14 0.69 0.38 0.89 0.18 0.3 0.34 0.47 0.16 0.29 0.44 0.34 1.0 0.07 0.07 0.24 0.06 0.09 0.27
Sro952_g224030.1 (Contig1940.g16681)
 0.06 0.11 0.02 0.08 0.07 0.09 0.19 0.06 0.09 0.58 0.33 0.83 0.11 0.45 0.29 0.23 0.13 0.18 0.15 0.26 1.0 0.08 0.02 0.14 0.06 0.16 0.24
Sro95_g049320.1 (Contig45.g317)
 0.01 0.06 0.06 0.07 0.03 0.37 0.34 0.14 0.08 0.71 0.62 0.96 0.1 0.29 0.73 0.96 0.61 0.28 0.41 0.26 1.0 0.15 0.04 0.28 0.27 0.27 0.89
Sro965_g225510.1 (Contig945.g9780)
 0.01 0.4 0.16 0.22 0.26 0.28 0.36 0.25 0.28 0.59 0.45 0.67 0.51 1.0 0.43 0.52 0.52 0.26 0.51 0.65 0.75 0.49 0.21 0.34 0.36 0.31 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)