Heatmap: Cluster_316 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1052_g235790.1 (Contig1507.g13765)	0.02	0.39	0.54	0.57	0.51	0.33	0.45	0.78	0.61	0.27	0.89	0.11	0.2	0.27	0.59	1.0	0.93	0.39	0.12	0.28	0.29	0.35	0.42	0.25	0.3	0.39	0.83
Sro1052_g235790.2	0.02	0.29	0.35	0.39	0.31	0.3	0.23	0.94	0.44	0.3	0.97	0.22	0.54	0.29	0.57	0.9	1.0	0.84	0.37	0.47	0.31	0.24	0.25	0.18	0.19	0.37	0.85
Sro1056_g236190.1 (Contig4431.g33260)	0.0	0.11	0.21	0.22	0.18	0.31	0.2	0.39	0.33	0.21	0.48	0.15	0.55	0.29	0.37	0.5	0.72	1.0	0.57	0.43	0.19	0.26	0.28	0.11	0.14	0.31	0.38
Sro1068_g237480.1 (Contig852.g9367)	0.15	0.49	0.62	0.69	0.69	0.45	0.48	0.66	0.67	0.51	1.0	0.46	0.81	0.4	0.84	0.96	0.85	0.92	0.88	0.7	0.37	0.48	0.64	0.48	0.4	0.48	0.86
Sro1081_g239120.1 (Contig4556.g34030)	0.09	0.81	0.87	0.9	0.93	0.38	0.63	0.85	0.9	0.61	0.98	0.71	0.87	0.67	0.79	0.68	1.0	0.94	0.79	0.72	0.53	0.57	0.87	0.49	0.28	0.43	0.66
Sro1236_g255130.1 (Contig1374.g12616)	0.0	0.26	0.56	0.46	0.24	0.28	0.21	0.74	0.5	0.28	0.79	0.16	0.47	0.05	0.46	1.0	0.9	0.87	0.45	0.34	0.33	0.3	0.33	0.07	0.11	0.21	0.77
Sro125_g060250.1 (Contig2833.g22736)	0.0	0.32	0.26	0.36	0.34	0.49	0.4	0.72	0.4	0.38	0.88	0.24	0.26	0.24	0.62	0.96	1.0	0.92	0.62	0.23	0.51	0.36	0.4	0.22	0.22	0.38	0.81
Sro1279_g258830.1 (Contig4725.g35076)	0.0	0.13	0.28	0.23	0.19	0.67	0.13	0.48	0.15	0.29	0.83	0.38	0.18	0.13	0.42	0.47	1.0	0.52	0.49	0.05	0.36	0.13	0.13	0.07	0.08	0.39	0.54
Sro1357_g265760.1 (Contig2181.g18200)	0.07	0.22	0.43	0.36	0.33	0.36	0.5	0.89	0.62	0.38	1.0	0.36	0.42	0.38	0.65	0.95	0.96	0.5	0.38	0.28	0.37	0.27	0.67	0.24	0.13	0.33	0.96
Sro1385_g268200.1 (Contig774.g8718)	0.11	1.0	0.86	0.65	0.73	0.33	0.6	0.81	0.86	0.53	0.74	0.58	0.92	0.56	0.63	0.57	0.78	0.69	0.66	0.94	0.59	0.47	0.75	0.42	0.25	0.32	0.59
Sro153_g069810.1 (Contig466.g6261)	0.01	0.25	0.46	0.21	0.22	0.23	0.34	1.0	0.57	0.26	0.58	0.15	0.34	0.34	0.49	0.45	0.69	0.35	0.66	0.43	0.15	0.58	0.33	0.23	0.13	0.22	0.55
Sro158_g071690.1 (Contig163.g1854)	0.01	0.47	0.37	0.4	0.41	0.53	0.6	1.0	0.86	0.3	0.72	0.24	0.4	0.17	0.43	0.41	0.83	0.59	0.3	0.33	0.25	0.34	0.58	0.4	0.36	0.28	0.49
Sro165_g073770.1 (Contig381.g5118)	0.01	0.08	0.17	0.15	0.11	0.28	0.21	0.72	0.37	0.32	1.0	0.22	0.14	0.16	0.69	0.75	0.84	0.41	0.22	0.21	0.36	0.35	0.14	0.37	0.63	0.47	0.88
Sro168_g074740.1 (Contig1642.g14805)	0.06	0.41	0.53	0.59	0.61	0.38	0.57	0.8	0.85	0.35	0.74	0.34	0.69	0.38	0.57	0.6	0.84	1.0	0.48	0.46	0.29	0.45	0.72	0.28	0.27	0.37	0.58
Sro183_g079710.1 (Contig3056.g24316)	0.01	0.23	0.22	0.06	0.2	0.19	0.0	1.0	0.3	0.14	0.82	0.21	0.04	0.14	0.36	0.26	0.57	0.08	0.02	0.06	0.14	0.39	0.09	0.21	0.09	0.33	0.48
Sro191_g082160.1 (Contig2614.g21209)	0.0	0.15	0.39	0.49	0.25	0.35	0.35	0.9	0.35	0.28	0.42	0.11	0.54	0.3	0.52	0.5	0.7	1.0	0.53	0.63	0.23	0.23	0.28	0.05	0.03	0.16	0.39
Sro1939_g306560.1 (Contig1997.g17091)	0.01	0.53	0.66	0.63	0.6	0.4	0.5	0.8	0.65	0.39	0.63	0.36	0.82	0.53	0.53	0.58	0.76	1.0	0.54	0.74	0.36	0.42	0.64	0.21	0.3	0.36	0.49
Sro2212_g319250.1 (Contig1531.g13920)	0.02	0.15	0.01	0.05	0.02	0.06	0.2	0.9	0.27	0.27	0.66	0.26	0.31	0.05	0.63	0.74	0.59	1.0	0.28	0.46	0.12	0.01	0.31	0.31	0.42	0.17	0.69
Sro2280_g321800.1 (Contig3386.g26483)	0.01	0.52	0.46	0.31	0.33	0.41	0.3	0.65	0.72	0.3	0.67	0.28	0.2	0.24	0.48	0.44	1.0	0.41	0.37	0.2	0.16	0.43	0.52	0.25	0.13	0.32	0.61
Sro228_g092600.1 (Contig1235.g11574)	0.02	0.22	0.15	0.15	0.13	0.28	0.24	0.38	0.24	0.26	0.9	0.17	0.24	0.1	0.43	0.82	1.0	0.59	0.27	0.17	0.32	0.26	0.15	0.17	0.22	0.34	0.76
Sro240_g096190.1 (Contig3315.g26017)	0.01	0.14	0.24	0.29	0.28	0.47	0.42	0.49	0.27	0.38	0.78	0.39	0.98	0.33	0.77	0.77	0.67	1.0	0.83	0.64	0.32	0.1	0.24	0.42	0.33	0.42	0.68
Sro2451_g328100.1 (Contig2245.g18615)	0.0	0.12	0.18	0.36	0.34	0.18	0.1	0.36	0.11	0.19	0.43	0.08	0.27	0.1	0.43	1.0	0.47	0.74	0.25	0.18	0.08	0.06	0.14	0.07	0.09	0.14	0.63
Sro270_g104180.1 (Contig1617.g14602)	0.01	1.0	0.6	0.46	0.46	0.12	0.41	0.9	0.73	0.24	0.75	0.11	0.49	0.33	0.5	0.51	0.47	0.71	0.66	0.52	0.1	0.38	0.43	0.46	0.29	0.16	0.53
Sro327_g118410.1 (Contig839.g9249)	0.01	0.43	0.35	0.35	0.39	0.46	0.52	1.0	0.81	0.41	0.65	0.45	0.41	0.34	0.61	0.59	0.81	0.44	0.37	0.32	0.34	0.64	0.56	0.31	0.4	0.35	0.53
Sro387_g132050.1 (Contig424.g5690)	0.01	0.17	0.23	0.39	0.41	0.33	0.31	0.83	0.53	0.23	1.0	0.22	0.36	0.12	0.47	0.58	0.77	0.54	0.28	0.3	0.12	0.26	0.36	0.2	0.27	0.22	0.58
Sro393_g133730.1 (Contig2258.g18704)	0.02	0.35	0.47	0.39	0.43	0.48	0.66	0.86	0.6	0.44	0.83	0.4	0.81	0.42	0.65	0.53	1.0	0.97	0.69	0.73	0.36	0.4	0.41	0.44	0.51	0.51	0.61
Sro3_g002290.1 (Contig3832.g29414)	0.0	0.38	0.42	0.47	0.47	0.25	0.45	1.0	0.68	0.29	0.71	0.14	0.48	0.31	0.51	0.62	0.75	0.53	0.61	0.39	0.12	0.38	0.62	0.15	0.09	0.22	0.78
Sro410_g137390.1 (Contig1741.g15520)	0.01	0.89	0.83	0.74	0.79	0.26	0.4	0.98	0.75	0.39	0.83	0.41	0.59	0.35	0.44	0.39	1.0	0.56	0.59	0.4	0.29	0.46	0.53	0.31	0.14	0.3	0.48
Sro454_g146430.1 (Contig682.g7969)	0.07	0.69	0.84	0.72	0.7	0.33	0.44	0.88	0.86	0.5	0.92	0.61	0.79	0.58	0.64	0.48	1.0	0.55	0.59	0.62	0.38	0.59	0.65	0.35	0.23	0.33	0.58
Sro456_g146660.1 (Contig1868.g16330)	0.13	0.64	0.82	0.71	0.65	0.26	0.4	0.69	0.52	0.34	0.79	0.27	0.39	0.23	0.62	0.78	0.72	1.0	0.55	0.42	0.31	0.46	0.42	0.35	0.29	0.38	0.67
Sro456_g146680.1 (Contig1868.g16332)	0.04	0.3	0.73	0.43	0.31	0.4	0.41	0.77	0.44	0.32	0.69	0.25	0.22	0.48	0.66	0.99	1.0	0.85	0.57	0.23	0.33	0.49	0.27	0.36	0.19	0.19	0.62
Sro46_g027410.1 (Contig1636.g14731)	0.02	0.64	0.54	0.46	0.46	0.33	0.41	0.72	0.81	0.41	0.7	0.6	0.58	0.36	0.5	0.44	1.0	0.56	0.6	0.58	0.38	0.4	0.51	0.25	0.19	0.3	0.51
Sro492_g153770.1 (Contig2481.g20303)	0.39	0.44	0.76	1.0	0.69	0.55	0.42	0.78	0.53	0.42	0.67	0.27	0.81	0.26	0.54	0.86	0.64	0.88	0.61	0.52	0.41	0.43	0.36	0.33	0.53	0.52	0.65
Sro497_g154790.1 (Contig738.g8461)	0.0	0.15	0.55	0.26	0.17	0.39	0.36	1.0	0.55	0.26	0.45	0.13	0.8	0.31	0.56	0.78	0.61	0.98	0.5	0.62	0.26	0.39	0.37	0.08	0.05	0.11	0.67
Sro505_g156090.1 (Contig1779.g15749)	0.04	0.67	0.75	0.72	0.64	0.47	0.55	0.61	0.54	0.53	0.7	0.43	1.0	0.46	0.84	0.99	0.74	0.81	0.72	0.7	0.78	0.38	0.47	0.42	0.65	0.55	0.76
Sro533_g161550.1 (Contig3819.g29323)	0.01	0.3	0.35	0.39	0.33	0.17	0.52	0.29	0.49	0.26	0.48	0.2	0.53	0.22	0.36	0.41	0.63	1.0	0.63	0.47	0.23	0.04	0.46	0.14	0.11	0.24	0.42
Sro548_g164500.1 (Contig1714.g15330)	0.0	0.59	1.0	0.51	0.55	0.25	0.25	0.63	0.45	0.23	0.43	0.1	0.7	0.2	0.5	0.37	0.64	0.98	0.5	0.54	0.1	0.61	0.38	0.24	0.25	0.29	0.48
Sro552_g165170.1 (Contig2064.g17697)	0.02	0.41	0.68	0.45	0.28	0.61	0.56	0.61	0.68	0.41	0.64	0.36	0.76	0.31	0.57	0.67	0.97	1.0	0.86	0.61	0.56	0.41	0.59	0.19	0.39	0.54	0.59
Sro682_g186470.1 (Contig1406.g12882)	0.02	0.16	0.22	0.31	0.3	0.21	0.48	0.58	0.55	0.26	0.5	0.2	0.73	0.36	0.47	0.57	0.55	1.0	0.49	0.6	0.19	0.29	0.48	0.34	0.37	0.34	0.5
Sro684_g186690.1 (Contig2085.g17773)	0.01	0.16	0.43	0.43	0.26	0.48	0.38	0.54	0.41	0.29	0.84	0.22	0.51	0.26	0.59	0.7	0.95	1.0	0.51	0.37	0.26	0.2	0.4	0.21	0.25	0.46	0.75
Sro759_g198290.1 (Contig608.g7529)	0.11	0.43	0.68	0.79	0.79	0.41	0.64	0.88	0.93	0.44	0.68	0.43	1.0	0.42	0.58	0.61	0.72	0.95	0.58	0.78	0.41	0.45	0.73	0.32	0.34	0.43	0.56
Sro767_g199560.1 (Contig2377.g19544)	0.14	0.81	0.9	0.71	0.7	0.38	0.6	0.96	0.93	0.56	0.82	0.64	1.0	0.49	0.71	0.71	0.81	0.92	0.86	0.83	0.52	0.63	0.75	0.4	0.23	0.34	0.64
Sro769_g199830.1 (Contig2367.g19485)	0.0	0.36	0.54	0.52	0.44	0.33	0.44	0.64	0.53	0.36	0.7	0.28	0.82	0.41	0.58	0.64	0.71	1.0	0.63	0.61	0.36	0.28	0.51	0.28	0.22	0.31	0.69
Sro769_g199870.1 (Contig2367.g19489)	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.21	0.13	0.22	0.17	0.14	0.34	0.03	1.0	0.18	0.33	0.45	0.15	0.25	0.31	0.42	0.02	0.17	0.1	0.08	0.03	0.11	0.47
Sro787_g202420.1 (Contig4626.g34527)	0.01	0.56	0.76	0.54	0.62	0.21	0.85	1.0	0.97	0.31	0.76	0.2	0.49	0.24	0.55	0.52	0.82	0.77	0.53	0.48	0.2	0.59	0.85	0.29	0.3	0.37	0.71
Sro792_g203170.1 (Contig385.g5185)	0.01	0.18	0.22	0.19	0.2	0.45	0.36	0.52	0.43	0.37	0.84	0.33	0.82	0.29	0.58	0.87	0.73	1.0	0.64	0.76	0.45	0.5	0.35	0.2	0.22	0.25	0.72
Sro831_g208300.1 (Contig2214.g18372)	0.0	0.54	0.51	0.48	0.57	0.19	0.36	1.0	0.64	0.19	0.84	0.08	0.29	0.07	0.4	0.36	0.64	0.68	0.26	0.16	0.05	0.31	0.54	0.13	0.07	0.13	0.52
Sro866_g213030.1 (Contig709.g8213)	0.01	0.46	0.31	0.31	0.46	0.26	0.59	1.0	0.72	0.31	0.49	0.31	0.5	0.31	0.42	0.35	0.52	0.44	0.39	0.31	0.28	0.33	0.57	0.28	0.15	0.27	0.39
Sro866_g213040.1 (Contig709.g8214)	0.0	0.21	0.25	0.33	0.32	0.42	0.48	0.85	0.44	0.36	0.67	0.36	0.76	0.5	0.6	0.7	0.87	1.0	0.69	0.45	0.45	0.22	0.41	0.18	0.18	0.31	0.54
Sro87_g046100.2	0.0	0.68	0.65	0.5	0.53	0.3	0.25	0.58	0.81	0.28	0.71	0.36	0.62	0.5	0.44	0.22	1.0	0.31	0.55	0.37	0.15	0.48	0.61	0.23	0.07	0.24	0.4
Sro885_g216150.1 (Contig1350.g12424)	0.0	0.48	0.73	0.59	0.61	0.34	0.49	0.85	0.37	0.35	0.61	0.21	0.9	0.28	0.77	0.87	0.77	1.0	0.75	0.66	0.31	0.49	0.5	0.4	0.52	0.38	0.83
Sro896_g217290.1 (Contig3311.g25940)	0.06	0.87	0.8	0.93	0.7	0.39	0.27	0.7	0.66	0.4	0.83	0.28	0.15	0.19	0.59	1.0	0.9	0.34	0.31	0.1	0.35	0.59	0.46	0.25	0.24	0.41	0.87
Sro90_g047190.1 (Contig124.g1381)	0.01	0.07	0.23	0.2	0.11	0.29	0.38	1.0	0.56	0.41	0.78	0.33	0.63	0.19	0.46	0.79	0.71	0.73	0.48	0.41	0.75	0.31	0.34	0.13	0.08	0.36	0.79
Sro984_g227900.1 (Contig3577.g27650)	0.01	0.37	0.3	0.41	0.37	0.24	0.57	0.85	0.56	0.38	0.93	0.3	0.58	0.27	0.6	0.92	0.83	1.0	0.64	0.5	0.52	0.5	0.43	0.68	0.45	0.53	0.74
Sro984_g227910.1 (Contig3577.g27651)	0.01	0.38	0.25	0.34	0.47	0.13	0.54	1.0	0.59	0.27	0.59	0.19	0.5	0.17	0.5	0.51	0.4	0.81	0.34	0.44	0.32	0.57	0.49	0.42	0.31	0.28	0.43

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)