Heatmap: Cluster_340 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1009_g230710.1 (Contig1546.g14036)
0.0 0.28 0.18 0.19 0.12 0.76 0.63 0.44 0.52 0.33 0.43 0.36 0.58 0.18 0.53 1.0 0.24 0.38 0.28 0.57 0.33 0.23 0.3 0.45 0.75 0.46 0.41
Sro1012_g231260.1 (Contig304.g3996)
0.05 0.6 0.56 0.51 0.65 0.22 0.52 0.28 0.63 0.42 0.27 0.49 0.93 0.29 0.27 0.29 0.23 0.53 0.57 1.0 0.4 0.26 0.77 0.17 0.32 0.2 0.29
Sro1042_g234670.1 (Contig734.g8415)
0.01 0.67 0.43 0.49 0.51 0.43 0.55 0.34 0.67 0.53 0.48 0.54 1.0 0.62 0.48 0.48 0.59 0.56 0.68 0.93 0.7 0.35 0.48 0.42 0.6 0.45 0.42
Sro114_g056200.1 (Contig1482.g13520)
0.34 0.22 0.46 0.91 0.55 0.04 0.58 0.95 1.0 0.22 0.08 0.28 0.36 0.08 0.07 0.09 0.08 0.68 0.36 0.25 0.43 0.37 0.78 0.31 0.35 0.19 0.07
Sro1199_g251790.1 (Contig642.g7731)
0.15 0.54 0.33 0.66 0.61 0.17 0.51 0.44 0.86 0.68 0.49 1.0 0.85 0.52 0.45 0.33 0.38 0.25 0.51 0.75 0.74 0.14 0.78 0.92 0.59 0.38 0.29
Sro11_g008470.1 (Contig724.g8321)
0.01 1.0 0.85 0.95 0.52 0.06 0.13 0.24 0.4 0.23 0.35 0.34 0.23 0.26 0.24 0.13 0.25 0.52 0.47 0.36 0.04 0.09 0.36 0.54 0.28 0.19 0.21
Sro1252_g256270.1 (Contig3295.g25878)
0.96 0.45 0.34 0.2 0.32 0.06 0.27 0.67 0.65 0.34 0.5 0.22 0.76 0.32 0.39 0.79 0.2 0.15 0.2 0.47 1.0 0.26 0.16 0.35 0.56 0.21 0.39
Sro128_g061380.1 (Contig1654.g14914)
0.01 0.34 0.23 0.2 0.27 0.26 0.7 0.88 0.71 0.32 0.65 0.35 0.74 0.13 0.52 0.39 0.4 0.88 0.5 1.0 0.37 0.22 0.72 0.47 0.83 0.45 0.23
Sro1427_g271780.1 (Contig1281.g11980)
0.21 0.6 0.59 0.27 0.33 0.3 0.37 0.41 0.4 0.5 0.56 0.63 0.5 0.24 0.47 0.33 0.26 0.36 0.27 0.8 0.61 0.23 0.46 0.25 1.0 0.69 0.35
Sro1447_g273600.1 (Contig3101.g24675)
0.2 0.83 0.65 0.86 1.0 0.13 0.51 0.32 0.63 0.47 0.46 0.48 0.48 0.35 0.4 0.37 0.41 0.24 0.4 0.63 0.39 0.3 0.64 0.44 0.82 0.34 0.23
0.02 0.15 0.19 0.31 0.27 0.14 0.43 0.64 0.63 0.19 0.37 0.2 0.75 0.28 0.26 0.23 0.46 1.0 0.71 0.52 0.14 0.3 0.62 0.08 0.03 0.16 0.27
Sro1593_g284470.1 (Contig579.g7333)
0.0 0.23 0.31 0.23 0.24 0.13 0.47 0.6 0.43 0.2 0.22 0.26 0.34 0.12 0.17 0.35 0.2 0.05 0.14 0.2 0.19 0.15 0.31 1.0 0.89 0.27 0.21
Sro159_g071740.1 (Contig500.g6714)
0.02 0.44 0.88 0.69 0.7 0.17 0.51 0.42 0.58 0.38 0.45 0.43 1.0 0.35 0.51 0.47 0.51 0.59 0.61 0.82 0.46 0.22 0.34 0.48 0.89 0.41 0.3
Sro1644_g288210.1 (Contig3810.g29190)
0.0 0.36 0.41 0.53 0.43 0.06 0.27 0.78 0.58 0.05 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.35 0.38 0.0 0.22 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1665_g289600.1 (Contig3312.g25960)
0.29 0.44 0.6 0.62 0.51 0.31 0.55 0.56 0.83 0.44 0.52 0.54 1.0 0.34 0.38 0.29 0.38 0.41 0.5 0.8 0.38 0.39 0.69 0.46 0.55 0.28 0.34
Sro1683_g290900.1 (Contig4497.g33721)
0.02 0.31 0.76 0.35 0.3 0.39 0.81 0.68 0.84 0.48 0.57 0.56 1.0 0.4 0.52 0.45 0.46 0.66 0.96 0.68 0.63 0.29 0.89 0.5 0.38 0.33 0.49
Sro16_g011660.1 (Contig916.g9603)
0.01 0.47 0.46 0.6 0.52 0.35 0.45 0.48 0.56 0.49 0.67 0.53 1.0 0.55 0.48 0.35 0.72 0.52 0.45 0.79 0.47 0.26 0.52 0.3 0.52 0.34 0.56
Sro1737_g294460.1 (Contig996.g10065)
0.02 0.1 0.1 0.1 0.08 0.16 0.8 0.58 0.65 0.28 0.53 0.23 0.97 0.09 0.4 0.77 0.3 0.4 0.41 1.0 0.27 0.42 0.35 0.64 0.27 0.28 0.29
Sro1753_g295420.1 (Contig4414.g33155)
0.07 0.13 0.05 0.06 0.05 0.01 0.67 0.66 0.81 0.18 0.08 0.15 0.39 0.02 0.05 0.06 0.0 0.31 0.82 1.0 0.55 0.06 0.6 0.01 0.02 0.06 0.05
Sro1826_g300140.1 (Contig1209.g11358)
0.23 0.4 0.43 0.33 0.42 0.07 0.45 0.28 0.24 0.28 0.3 0.38 0.49 0.05 0.24 0.24 0.12 0.36 0.24 1.0 0.38 0.05 0.33 0.36 0.65 0.33 0.14
0.02 0.43 0.19 0.07 0.2 0.08 0.27 0.53 0.25 0.4 0.33 0.5 1.0 0.19 0.49 0.43 0.12 0.18 0.22 0.79 0.58 0.08 0.28 0.27 0.31 0.18 0.18
Sro1914_g305080.1 (Contig4462.g33537)
0.04 0.11 0.15 0.04 0.13 0.03 0.22 0.36 0.56 0.16 0.0 0.21 0.13 1.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.03 0.15 0.34 0.05 0.04 0.03 0.01
Sro195_g083130.1 (Contig4576.g34150)
0.17 0.49 0.49 0.52 0.64 0.24 0.39 0.58 0.56 0.44 0.81 0.37 0.98 0.4 0.51 0.55 0.59 1.0 0.51 0.8 0.39 0.27 0.47 0.48 0.39 0.25 0.42
Sro1977_g308970.1 (Contig2098.g17851)
0.0 0.24 0.41 0.49 0.32 0.0 0.56 1.0 0.82 0.03 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.27 0.24 0.0 0.37 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro202_g085270.1 (Contig1673.g15034)
0.0 0.25 0.12 0.0 0.05 0.08 0.22 0.35 0.73 0.15 0.31 0.07 1.0 0.05 0.24 0.25 0.18 0.55 0.46 0.76 0.04 0.08 0.19 0.0 0.0 0.02 0.25
Sro2104_g314720.1 (Contig873.g9427)
0.0 0.44 0.45 0.33 0.37 0.26 0.86 1.0 0.79 0.44 0.65 0.43 0.67 0.64 0.67 0.68 0.55 0.48 0.38 0.52 0.45 0.4 0.78 0.55 0.38 0.37 0.63
Sro2146_g316400.1 (Contig984.g9988)
0.0 0.09 0.07 0.22 0.18 0.04 0.16 0.16 0.36 0.06 0.11 0.02 1.0 0.05 0.06 0.05 0.09 0.35 0.12 0.64 0.01 0.17 0.28 0.01 0.02 0.09 0.05
Sro214_g088680.1 (Contig282.g3653)
0.5 0.79 1.0 0.88 0.79 0.16 0.29 0.45 0.69 0.36 0.45 0.32 0.58 0.28 0.35 0.46 0.51 0.25 0.25 0.56 0.23 0.21 0.36 0.2 0.27 0.28 0.27
Sro2269_g321360.1 (Contig2676.g21658)
0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.08 0.92 0.74 0.91 0.34 0.39 0.44 0.85 0.26 0.32 0.24 0.27 0.26 0.49 1.0 0.34 0.45 0.36 0.4 0.54 0.19 0.2
Sro2335_g323800.1 (Contig3717.g28590)
0.03 0.02 0.07 0.04 0.08 0.0 0.88 0.79 1.0 0.1 0.06 0.15 0.68 0.01 0.04 0.02 0.05 0.45 0.17 0.8 0.18 0.23 0.65 0.05 0.32 0.13 0.03
Sro236_g094950.1 (Contig1410.g12933)
0.01 0.53 0.51 0.85 0.71 0.53 0.76 0.44 0.97 0.66 1.0 0.82 0.79 0.57 0.6 0.55 0.9 0.41 0.49 0.64 0.58 0.27 0.77 0.55 0.59 0.37 0.55
Sro2410_g326660.1 (Contig2265.g18790)
0.02 0.77 0.68 0.74 0.77 0.31 0.63 0.77 0.78 0.38 0.62 0.43 0.75 0.28 0.48 0.39 0.5 1.0 0.99 0.7 0.38 0.44 0.71 0.3 0.21 0.34 0.37
Sro251_g099450.1 (Contig687.g8025)
0.0 0.17 0.1 0.11 0.1 0.0 0.32 0.27 0.36 0.06 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.01 0.0 0.21 0.64 1.0 0.0 0.12 0.28 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro2558_g331190.1 (Contig4411.g33110)
0.16 0.61 0.71 0.55 0.53 0.08 0.22 0.3 0.4 0.34 0.13 0.39 1.0 0.25 0.22 0.22 0.22 0.26 0.25 0.92 0.29 0.09 0.4 0.13 0.23 0.2 0.16
Sro2658_g333880.1 (Contig1257.g11767)
0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.41 0.48 0.55 0.42 0.26 0.29 0.26 1.0 0.22 0.42 0.4 0.11 0.47 0.65 0.98 0.45 0.25 0.49 0.26 0.32 0.21 0.28
Sro2699_g335000.1 (Contig2762.g22248)
0.0 0.51 0.58 0.33 0.33 0.02 0.61 0.93 1.0 0.11 0.12 0.02 0.42 0.14 0.14 0.05 0.41 0.76 0.5 0.35 0.05 1.0 0.88 0.02 0.01 0.07 0.14
Sro279_g106820.1 (Contig3140.g24921)
0.1 0.12 0.2 0.12 0.12 0.28 0.23 0.51 0.49 0.26 0.11 0.28 0.3 1.0 0.15 0.12 0.26 0.14 0.33 0.21 0.12 0.34 0.34 0.25 0.09 0.19 0.11
Sro27_g018360.1 (Contig3926.g30097)
0.23 0.39 0.51 0.5 0.52 0.29 0.49 0.34 0.54 0.54 0.52 0.65 1.0 0.48 0.49 0.49 0.4 0.73 0.53 0.89 0.58 0.2 0.44 0.38 0.56 0.33 0.46
Sro309_g113720.1 (Contig3477.g26962)
0.05 0.09 0.29 0.06 0.12 0.0 0.09 0.06 0.47 0.09 0.13 0.05 0.46 0.12 0.11 0.07 0.02 0.0 0.0 0.74 0.07 0.07 1.0 0.19 0.36 0.18 0.02
Sro309_g113780.1 (Contig3477.g26968)
0.17 0.31 0.52 0.47 0.39 0.22 0.45 0.55 1.0 0.35 0.37 0.31 0.77 0.38 0.34 0.26 0.41 0.56 0.56 0.56 0.37 0.32 0.62 0.27 0.26 0.23 0.24
Sro319_g116200.1 (Contig204.g2460)
0.1 1.0 0.58 0.59 0.67 0.43 0.68 0.63 0.67 0.6 0.61 0.81 0.79 0.3 0.58 0.62 0.75 0.54 0.44 0.79 0.62 0.39 0.58 0.55 0.68 0.42 0.44
Sro3338_g346930.1 (Contig3594.g27788)
0.03 0.56 0.58 0.35 0.47 0.09 0.82 0.47 0.61 0.33 0.31 0.29 0.35 0.16 0.32 0.43 0.2 1.0 0.6 0.53 0.37 0.08 0.47 0.27 0.46 0.29 0.29
Sro357_g125550.1 (Contig708.g8183)
0.03 0.32 0.45 0.48 0.45 0.3 0.45 0.32 0.42 0.53 0.41 0.67 1.0 0.44 0.41 0.43 0.37 0.39 0.45 0.73 0.61 0.31 0.44 0.42 0.67 0.45 0.35
Sro374_g129150.1 (Contig347.g4676)
0.0 0.74 0.79 0.71 0.29 0.04 0.37 0.55 1.0 0.34 0.2 0.41 0.52 0.14 0.23 0.37 0.02 0.2 0.47 0.88 0.58 0.2 0.82 0.12 0.15 0.04 0.09
Sro452_g145860.1 (Contig1249.g11665)
0.01 0.61 0.54 0.46 0.59 0.4 0.8 0.7 0.81 0.51 0.87 0.56 0.67 0.34 0.72 0.65 0.76 1.0 0.61 0.66 0.56 0.52 0.71 0.47 0.5 0.38 0.6
Sro490_g153590.1 (Contig328.g4379)
0.01 0.47 0.76 0.76 0.72 0.42 0.6 0.88 0.65 0.46 0.66 0.47 0.4 0.26 0.58 0.6 0.66 1.0 0.93 0.37 0.52 0.34 0.49 0.41 0.46 0.41 0.5
Sro495_g154480.1 (Contig3243.g25628)
0.02 0.3 0.41 0.29 0.27 0.24 0.39 0.38 0.56 0.39 0.93 0.66 0.62 0.26 0.72 0.94 1.0 0.65 0.92 0.42 0.5 0.16 0.35 0.2 0.36 0.17 0.38
Sro499_g155150.1 (Contig989.g10017)
0.77 0.33 0.37 0.4 0.32 0.28 0.52 0.56 0.68 0.45 0.65 0.41 0.75 0.28 0.6 0.81 0.49 0.49 0.35 0.86 0.6 0.43 0.44 0.51 1.0 0.43 0.4
1.0 0.19 0.73 0.29 0.27 0.03 0.32 0.26 0.4 0.3 0.5 0.32 0.97 0.11 0.21 0.32 0.31 0.35 0.28 0.76 0.35 0.11 0.2 0.5 0.78 0.25 0.18
Sro567_g167970.1 (Contig3851.g29653)
0.05 0.32 0.72 0.5 0.28 0.09 0.34 0.38 0.71 0.1 0.08 0.05 0.82 0.01 0.05 0.05 0.12 0.4 0.27 1.0 0.06 0.12 0.38 0.13 0.21 0.11 0.06
Sro598_g173110.1 (Contig1655.g14937)
0.0 0.11 0.22 0.2 0.13 0.01 0.5 1.0 0.68 0.05 0.04 0.01 0.47 0.06 0.05 0.02 0.12 0.91 0.56 0.31 0.01 0.38 0.57 0.01 0.0 0.02 0.08
Sro603_g173980.1 (Contig4246.g32157)
0.55 0.52 0.82 1.0 0.85 0.16 0.3 0.35 0.66 0.32 0.27 0.42 0.63 0.13 0.17 0.14 0.19 0.31 0.49 0.91 0.18 0.48 0.66 0.24 0.39 0.29 0.17
Sro620_g176590.1 (Contig2122.g17926)
0.01 0.1 0.16 0.15 0.18 0.15 0.54 0.63 0.55 0.27 0.35 0.29 0.79 0.14 0.51 1.0 0.37 0.73 0.42 0.51 0.43 0.26 0.33 0.36 0.62 0.26 0.32
Sro690_g187650.1 (Contig137.g1526)
0.07 0.93 0.67 0.51 0.61 0.51 0.69 0.42 0.79 0.74 0.74 0.93 1.0 0.92 0.62 0.65 0.91 0.4 0.78 0.94 0.77 0.54 0.71 0.76 0.35 0.37 0.49
Sro70_g039100.1 (Contig3352.g26257)
0.17 0.44 0.73 0.56 0.56 0.28 0.57 0.59 0.92 0.53 0.5 0.6 1.0 0.54 0.47 0.75 0.45 0.6 0.59 0.99 0.54 0.58 0.73 0.37 0.54 0.34 0.37
Sro72_g039760.1 (Contig1459.g13375)
0.01 0.58 0.44 0.92 0.72 0.85 0.87 0.85 1.0 0.53 0.82 0.49 0.56 0.31 0.78 0.79 0.75 0.91 0.79 0.48 0.45 0.36 0.91 0.38 0.46 0.58 0.8
Sro795_g203550.1 (Contig372.g5048)
0.01 0.53 0.48 0.32 0.43 0.13 0.6 0.43 0.58 0.41 0.25 0.46 1.0 0.42 0.28 0.29 0.31 0.28 0.46 0.83 0.47 0.23 0.55 0.3 0.45 0.23 0.25
Sro79_g042730.1 (Contig1826.g16080)
0.02 0.45 0.52 0.33 0.29 0.22 0.47 0.31 0.63 0.44 0.32 0.54 1.0 0.66 0.35 0.49 0.33 0.24 0.64 0.58 0.6 0.2 0.52 0.51 0.46 0.28 0.26
Sro830_g208260.1 (Contig4325.g32641)
0.91 0.19 0.19 0.08 0.17 0.06 0.37 0.43 0.3 0.35 0.46 0.52 0.27 0.12 0.35 0.49 0.44 0.05 0.21 0.47 0.34 0.28 0.17 0.97 1.0 0.46 0.29
Sro869_g213450.1 (Contig2492.g20421)
0.01 0.62 0.3 0.2 0.16 0.08 0.67 0.68 0.92 0.38 0.49 0.51 0.8 0.44 0.55 0.58 0.32 0.36 0.37 1.0 0.45 0.56 0.64 0.56 0.83 0.4 0.28
Sro885_g216050.1 (Contig1350.g12414)
0.0 0.46 0.45 0.31 0.18 0.31 0.55 0.99 0.81 0.22 0.79 0.11 0.45 0.02 0.72 0.44 1.0 0.61 0.41 0.43 0.13 0.15 0.65 0.16 0.14 0.17 0.49
Sro88_g046610.1 (Contig265.g3319)
0.01 0.46 0.76 0.91 0.81 0.29 0.62 0.72 0.88 0.45 0.62 0.4 1.0 0.45 0.62 0.75 0.57 0.83 0.6 0.88 0.46 0.42 0.68 0.38 0.71 0.45 0.45
Sro905_g218560.1 (Contig2792.g22468)
0.17 0.08 0.07 0.07 0.08 0.02 0.67 0.83 1.0 0.21 0.19 0.21 0.32 0.13 0.13 0.19 0.08 0.07 0.07 0.73 0.55 0.52 0.59 0.3 0.82 0.16 0.12
Sro928_g221240.1 (Contig3234.g25580)
0.07 0.48 0.58 0.4 0.23 0.42 0.43 0.74 0.77 0.33 0.64 0.51 0.43 0.31 0.54 0.41 0.73 0.54 1.0 0.29 0.27 0.39 0.48 0.74 0.42 0.41 0.45
Sro932_g221720.1 (Contig2857.g22915)
0.0 0.24 0.28 0.33 0.27 0.0 0.3 0.46 0.35 0.04 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.21 0.0 0.19 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro946_g223290.1 (Contig2147.g18089)
0.01 0.33 0.44 0.4 0.31 0.42 0.41 0.34 0.75 0.55 0.66 0.66 1.0 0.72 0.54 0.34 0.74 0.61 0.8 0.81 0.62 0.36 0.65 0.31 0.07 0.3 0.5
Sro965_g225530.1 (Contig945.g9782)
0.04 0.44 0.53 0.7 0.69 0.3 0.62 0.66 0.78 0.55 1.0 0.63 0.95 0.46 0.73 0.81 0.81 0.9 0.9 0.82 0.55 0.5 0.72 0.69 0.65 0.59 0.74

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)