Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1020_g232100.1 (Contig2444.g20010)
59.45 2.41 4.51 5.82 6.39 3.56 2.61 2.75 2.24 6.76 5.31 4.61 2.69 5.3 5.14 4.12 2.91 1.48 2.2 2.38 5.97 2.62 1.79 5.9 4.05 3.05 3.49
Sro1023_g232460.1 (Contig1305.g12102)
128.4 29.91 23.25 17.48 21.76 2.41 4.89 7.7 6.5 10.57 2.34 9.02 1.19 5.81 3.19 2.7 2.61 5.33 2.19 3.55 12.73 2.05 2.86 19.78 35.71 18.18 2.91
Sro102_g051990.1 (Contig319.g4243)
227.0 16.65 38.96 34.87 20.96 0.34 2.63 31.33 14.84 6.73 1.26 2.05 3.09 0.92 2.43 2.13 0.7 1.11 3.25 2.89 1.29 10.17 6.04 2.37 3.11 0.49 2.43
Sro1100_g241270.1 (Contig937.g9739)
352.69 53.27 77.24 71.09 66.99 19.59 23.88 23.48 34.47 40.61 47.23 42.81 54.37 29.53 33.64 29.26 40.23 23.31 35.61 35.93 35.0 32.12 38.97 41.92 39.53 19.53 24.42
Sro116_g057210.1 (Contig2228.g18497)
414.8 129.81 94.19 80.18 82.46 5.57 14.47 110.36 123.59 24.3 10.28 10.75 10.41 7.35 11.84 11.17 11.4 8.85 11.91 14.31 10.71 82.92 27.39 15.52 29.07 8.2 8.57
Sro1175_g249200.1 (Contig1328.g12267)
121.59 24.52 30.9 17.42 15.49 5.61 9.44 13.31 10.04 8.11 7.4 6.15 13.99 4.38 9.32 7.51 6.3 7.18 3.84 7.59 5.33 6.76 4.95 8.95 4.7 2.81 4.93
Sro1188_g250550.1 (Contig3566.g27547)
18.27 2.73 5.03 4.83 2.53 0.53 1.2 0.93 1.53 3.01 1.99 5.12 1.11 0.22 0.81 0.75 2.44 0.38 2.2 1.47 2.36 1.52 2.79 3.13 1.93 1.62 1.59
Sro119_g058150.1 (Contig2194.g18288)
240.83 18.59 39.82 60.89 28.08 13.79 8.09 35.0 27.91 17.62 7.76 27.98 8.61 2.58 6.74 3.34 4.92 5.59 3.6 32.9 10.45 8.82 10.5 28.06 47.2 9.74 7.41
Sro1220_g253570.1 (Contig4141.g31644)
1695.45 179.45 186.69 271.28 223.33 90.77 74.27 65.25 74.71 102.96 218.89 81.92 64.46 30.13 105.1 97.85 173.06 29.1 23.05 57.53 40.23 13.36 84.28 159.87 58.34 59.41 66.77
Sro1220_g253580.1 (Contig4141.g31645)
29.51 18.86 10.31 12.35 8.43 2.59 3.48 3.37 2.1 6.23 6.34 5.19 7.16 3.59 5.52 4.67 9.17 3.81 2.47 7.22 5.31 0.65 2.45 6.12 5.8 1.47 2.91
Sro125_g060060.1 (Contig2833.g22717)
262.91 17.99 46.1 49.63 40.22 23.24 14.89 41.58 42.14 43.57 49.38 24.54 65.85 21.07 56.95 56.13 51.88 27.85 35.19 66.44 22.62 19.48 9.44 41.92 50.49 22.53 37.35
Sro129_g061520.1 (Contig1945.g16726)
353.29 64.04 44.06 104.01 122.72 2.33 13.52 40.06 57.14 15.14 4.87 1.14 9.6 2.2 4.86 5.3 2.89 27.39 3.21 5.0 1.34 10.87 26.69 17.96 22.65 5.11 3.16
Sro12_g009440.1 (Contig2293.g18964)
826.68 98.33 170.57 95.48 99.27 17.12 7.34 31.22 35.72 37.85 31.89 26.16 16.41 1.93 28.15 35.59 27.04 15.33 24.05 30.51 6.15 14.69 16.52 47.06 29.87 21.38 25.66
Sro132_g062420.1 (Contig2745.g22085)
336.46 12.53 34.51 23.99 29.35 8.15 19.22 81.39 89.43 19.28 16.48 11.95 18.28 5.3 16.79 15.08 12.7 52.44 13.29 19.47 19.13 54.3 18.34 18.78 23.59 7.37 12.87
Sro137_g064400.1 (Contig3969.g30455)
167.86 27.62 27.64 15.97 16.31 1.81 8.86 46.19 56.44 11.73 3.57 12.49 5.22 4.11 4.01 4.3 2.53 1.63 1.59 3.43 11.18 28.71 18.09 5.55 3.39 2.09 2.67
Sro1394_g268930.1 (Contig598.g7459)
21.03 2.74 5.35 4.47 3.8 0.93 2.21 2.9 2.17 5.36 4.02 8.84 2.57 4.84 3.59 5.18 4.49 1.5 3.76 6.14 5.5 4.23 2.0 9.58 10.81 5.56 3.45
Sro1406_g269950.1 (Contig4418.g33203)
10.17 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 4.47 4.14 0.41 0.17 0.66 0.43 0.0 0.05 0.27 0.77 0.61 0.06 0.83 0.38 1.67 0.36 0.6 1.98 0.7 0.07
Sro1412_g270510.1 (Contig422.g5671)
303.45 17.42 60.15 14.88 7.39 1.36 3.07 0.73 3.06 12.38 0.6 5.96 10.32 3.42 4.98 0.0 0.28 0.69 4.9 15.36 7.62 2.85 3.67 0.0 0.0 0.0 4.2
Sro1446_g273490.1 (Contig1815.g15994)
118.91 11.61 20.6 14.86 18.2 6.11 1.48 2.96 1.49 7.71 4.73 4.07 12.66 3.03 5.19 6.6 1.56 8.16 6.44 10.24 4.35 0.76 1.22 3.12 5.08 2.63 2.48
Sro1475_g275780.1 (Contig4476.g33626)
9.98 1.42 1.73 1.12 1.23 0.18 0.45 0.24 0.37 1.01 0.51 0.96 1.1 0.47 0.49 0.78 0.28 0.48 0.46 1.55 0.97 0.42 0.16 1.16 1.38 0.31 0.32
Sro1626_g286840.1 (Contig1454.g13325)
51.68 17.35 36.9 11.01 13.24 0.55 2.27 28.81 34.63 6.88 1.38 4.61 2.88 0.0 4.25 0.58 3.7 3.89 2.36 2.16 2.79 8.6 20.48 4.71 6.85 6.25 5.13
Sro1638_g287780.1 (Contig4204.g31978)
1230.78 280.66 539.5 584.42 623.02 61.69 89.41 146.16 167.95 113.93 124.57 59.3 79.85 25.96 88.44 172.79 63.67 114.58 67.86 106.38 58.8 41.78 99.59 131.23 359.46 103.05 82.03
Sro1653_g288870.1 (Contig3957.g30323)
215.63 39.5 46.77 77.7 94.53 7.16 48.97 97.0 71.54 28.96 14.45 20.4 29.39 21.96 19.09 19.37 13.03 13.36 23.17 19.81 18.27 19.82 36.3 45.64 40.95 22.48 12.0
Sro1711_g292850.1 (Contig3721.g28603)
46.29 12.2 17.84 31.35 24.42 0.84 2.21 15.94 17.71 4.26 3.71 3.58 1.22 3.91 2.7 2.57 0.98 0.36 0.13 1.17 4.56 3.51 6.79 5.34 10.39 5.84 4.03
Sro176_g077350.1 (Contig203.g2422)
42.2 10.51 18.7 13.54 14.04 5.36 5.8 4.8 6.25 15.55 14.79 24.85 9.55 12.2 7.96 5.69 17.31 9.62 9.17 10.25 16.01 8.22 6.78 8.84 5.76 6.56 8.15
Sro176_g077380.1 (Contig203.g2425)
69.58 18.89 27.52 24.69 24.01 5.49 8.07 5.28 6.63 20.39 14.56 26.79 8.24 14.72 9.4 5.85 12.24 9.23 8.8 10.58 17.25 5.39 7.06 11.23 8.53 7.15 8.17
Sro1900_g304270.1 (Contig3998.g30696)
12.11 1.36 3.89 0.74 0.38 0.0 0.19 0.15 1.17 0.91 0.37 0.33 0.55 0.21 0.17 0.23 0.13 0.09 0.15 0.98 0.41 0.7 1.12 1.76 1.34 0.16 0.14
Sro1901_g304320.1 (Contig2664.g21552)
160.9 39.2 51.62 53.88 50.66 12.61 9.81 12.01 11.46 23.1 33.24 15.82 37.41 22.84 22.32 20.13 18.95 11.52 17.2 25.15 17.01 10.72 11.33 63.36 47.41 22.72 17.9
Sro191_g082130.1 (Contig2614.g21206)
82.95 10.33 24.55 12.9 6.53 1.64 2.07 6.45 2.81 5.29 1.69 4.67 3.24 1.21 2.39 3.24 1.12 2.94 3.56 3.71 2.66 0.9 1.4 2.66 2.85 0.54 3.22
Sro2044_g312350.1 (Contig1368.g12580)
240.95 73.89 76.39 53.38 63.7 16.52 18.33 32.3 36.8 30.6 23.83 34.53 14.24 17.77 19.17 10.8 16.8 28.2 36.85 23.98 14.39 11.15 12.38 17.48 6.68 7.74 22.27
Sro2064_g313150.1 (Contig4231.g32085)
1720.84 57.29 243.54 218.15 168.66 31.87 115.29 252.31 211.05 63.52 66.27 53.18 30.11 45.97 46.74 50.15 25.61 39.57 7.16 10.83 55.26 116.21 112.45 183.35 162.09 36.18 50.27
Sro229_g093130.1 (Contig429.g5817)
540.28 50.44 66.02 65.97 58.76 40.51 57.98 79.96 84.28 71.35 100.93 61.13 85.35 50.12 75.2 75.43 66.47 92.56 77.54 78.45 68.98 56.69 72.48 76.05 54.89 47.63 58.5
Sro2302_g322510.1 (Contig3019.g24082)
304.21 86.01 110.31 61.9 58.9 16.6 24.84 23.2 27.84 29.0 8.89 13.07 14.91 25.26 19.38 6.18 6.11 19.99 12.15 12.52 12.88 14.44 23.62 29.59 22.85 8.33 7.52
Sro234_g094510.1 (Contig3223.g25498)
20.64 0.58 3.19 0.79 1.33 1.22 0.85 6.76 4.4 1.69 0.44 1.63 2.11 0.7 0.4 0.29 0.22 0.26 0.17 0.99 2.1 1.26 1.57 1.34 2.56 0.41 0.26
Sro237_g095210.1 (Contig1864.g16292)
548.02 15.47 46.13 24.64 38.4 0.66 5.49 106.04 105.46 12.2 2.08 0.97 0.94 0.19 2.21 2.01 2.27 1.61 0.52 0.74 0.2 12.04 12.76 4.31 8.95 0.91 1.74
Sro238_g095520.1 (Contig99.g1198)
109.42 4.46 6.59 8.64 5.37 5.61 6.81 24.28 22.97 12.37 9.28 8.5 18.03 6.89 10.88 7.75 5.68 8.23 7.95 17.75 16.47 5.94 3.68 16.49 27.34 11.24 6.44
Sro2418_g327000.1 (Contig3744.g28702)
5.54 1.13 1.16 0.49 0.28 0.0 0.04 0.48 0.7 0.34 0.06 0.24 0.25 0.04 0.06 0.07 0.06 0.6 0.31 0.46 0.17 0.03 0.09 0.09 0.29 0.05 0.08
86.63 5.74 6.15 5.43 3.99 0.0 1.62 1.49 7.16 3.71 1.56 2.04 1.13 1.07 1.23 0.49 0.24 2.55 2.0 1.06 1.5 3.47 5.17 16.08 13.32 2.34 0.28
Sro247_g098020.1 (Contig3058.g24335)
68.97 6.16 21.66 32.53 18.29 3.67 3.03 16.19 12.22 6.01 6.65 5.32 2.03 2.29 5.26 8.58 9.0 1.06 1.0 2.08 3.45 6.15 6.0 25.29 13.93 7.31 5.71
Sro2653_g333740.1 (Contig2619.g21266)
1246.83 167.99 304.55 221.29 177.71 128.06 178.49 220.73 239.77 210.36 210.2 188.15 291.08 104.57 176.67 224.7 195.37 227.48 192.13 309.26 194.92 158.26 141.6 194.93 262.1 146.59 157.92
Sro2889_g339520.1 (Contig4534.g33917)
420.47 40.0 69.56 66.42 55.63 15.28 9.55 19.76 11.61 29.81 34.23 7.3 21.32 8.39 29.64 39.31 25.34 44.38 20.87 31.32 13.1 12.69 11.57 35.3 28.62 20.41 28.18
Sro3088_g343450.1 (Contig3729.g28624)
159.73 17.74 46.13 15.66 24.23 0.93 3.55 79.13 62.66 7.03 4.24 3.64 12.71 1.15 3.33 3.19 3.86 1.69 1.38 8.94 3.7 14.35 10.82 4.74 17.17 2.51 3.34
Sro318_g115960.1 (Contig3475.g26940)
69.13 4.77 23.16 10.9 17.23 0.1 1.67 21.58 19.18 2.08 1.08 1.2 1.09 0.08 0.58 0.2 0.78 0.92 0.31 0.92 0.48 2.91 5.97 0.36 0.98 1.85 0.75
23.57 8.67 8.24 4.85 8.36 1.53 0.33 7.3 3.33 1.72 2.31 2.37 0.55 0.11 1.36 1.15 0.25 0.57 0.46 1.07 0.44 2.98 2.31 1.1 6.84 1.47 0.56
Sro32_g021000.1 (Contig3715.g28573)
2660.73 454.82 758.31 1015.78 867.43 93.43 297.1 332.02 512.28 170.19 219.49 47.2 122.73 51.07 245.15 228.13 116.26 208.9 97.24 68.01 85.41 326.32 338.88 276.11 362.8 216.61 116.25
Sro358_g125940.1 (Contig1210.g11381)
359.22 78.48 125.39 137.54 100.13 31.56 48.04 33.94 39.6 69.37 55.68 77.89 80.13 50.91 54.13 67.52 37.6 59.0 61.24 83.42 76.46 34.36 36.63 57.71 79.88 47.69 40.82
Sro35_g022280.1 (Contig3323.g26105)
75.81 20.79 32.3 18.56 14.83 3.39 5.04 2.83 8.07 10.4 9.46 9.62 8.03 6.88 8.48 6.87 3.99 9.33 10.23 6.58 9.27 6.48 9.84 9.91 14.19 5.09 5.62
Sro3_g002660.1 (Contig3832.g29451)
538.76 66.84 128.35 139.25 124.12 36.01 92.99 113.38 131.82 93.41 102.74 66.02 68.7 59.54 78.55 59.27 64.19 83.03 96.47 85.09 107.48 61.36 68.73 150.74 262.77 115.3 64.44
79.38 22.3 28.77 15.02 18.79 10.29 7.6 2.92 5.1 9.05 2.03 5.2 3.92 6.88 8.0 4.29 1.36 6.54 3.67 4.99 7.38 2.18 5.6 7.76 7.17 3.91 5.95
Sro405_g136150.1 (Contig597.g7440)
14.18 4.71 9.21 8.03 6.34 0.0 1.52 3.22 8.1 1.58 0.66 3.74 0.05 0.26 0.46 0.41 0.82 0.73 2.81 0.59 1.14 1.46 1.73 0.31 2.63 1.43 0.74
Sro433_g141810.1 (Contig4540.g33943)
26.03 5.13 9.13 9.02 8.81 0.0 4.59 11.85 4.15 3.48 1.43 1.57 0.98 1.19 0.77 0.05 0.73 4.44 0.82 2.42 0.96 1.91 1.67 0.65 0.15 0.31 0.76
Sro458_g147030.1 (Contig3230.g25535)
32.91 5.74 4.17 6.23 7.36 3.18 9.22 4.93 8.64 8.73 9.7 9.59 14.61 7.26 8.35 11.3 7.29 7.19 6.75 12.61 8.93 6.17 6.81 5.63 7.13 4.5 5.5
Sro45_g026870.1 (Contig2311.g19069)
96.38 8.8 16.36 17.85 14.53 4.5 5.66 10.47 7.57 9.9 9.93 4.2 17.62 4.53 10.44 7.84 5.39 14.26 16.22 13.79 9.29 9.21 12.42 25.08 9.11 6.02 6.36
Sro480_g151320.1 (Contig2927.g23333)
264.95 27.38 94.96 34.69 27.1 9.87 22.96 32.55 21.62 14.61 7.71 11.79 4.09 13.44 11.53 10.18 7.89 2.21 7.41 2.84 10.76 2.44 7.32 29.01 46.98 6.1 10.43
Sro483_g152140.1 (Contig4159.g31766)
71.03 12.76 13.87 8.33 9.8 2.18 8.92 11.19 16.84 7.03 8.2 10.95 2.61 3.63 5.9 7.49 5.34 2.84 2.72 3.55 5.6 8.82 10.33 5.84 2.67 4.02 5.08
Sro49_g028460.1 (Contig2054.g17596)
289.9 27.61 102.47 48.44 35.29 1.76 11.92 37.95 34.54 10.89 9.6 1.73 7.07 0.58 12.43 12.22 2.86 1.06 1.05 4.34 1.28 13.78 12.47 43.13 13.92 2.28 5.35
Sro508_g156760.1 (Contig2824.g22631)
167.2 11.47 13.7 9.14 15.16 11.09 11.93 10.25 19.65 26.55 16.57 39.39 17.97 19.64 16.17 15.52 14.38 16.52 32.58 27.03 30.0 16.49 28.47 24.33 14.52 11.57 13.44
Sro538_g162550.1 (Contig95.g1096)
15.89 3.35 2.39 4.05 5.36 0.13 2.15 13.15 16.53 1.0 1.39 0.22 0.23 0.25 0.73 0.35 0.55 0.65 0.16 0.09 0.27 3.82 1.63 4.55 13.07 1.51 0.38
Sro549_g164610.1 (Contig1749.g15566)
191.79 49.42 32.75 26.27 26.84 0.63 2.5 6.69 11.76 11.65 0.88 1.87 7.06 0.99 2.11 2.39 0.57 4.4 2.04 6.05 1.45 4.33 22.78 1.13 1.15 0.41 1.73
Sro550_g164700.1 (Contig731.g8400)
37.49 0.36 3.53 1.14 2.18 0.05 0.57 6.15 9.4 1.8 0.84 0.07 0.09 0.05 0.71 2.74 0.05 0.26 0.12 0.08 0.05 2.83 2.65 0.91 1.48 0.32 0.39
Sro568_g168120.1 (Contig267.g3363)
4.8 0.98 2.37 2.75 1.47 0.5 1.47 1.47 1.59 2.87 1.72 3.9 2.99 2.08 1.74 3.16 1.79 1.82 3.02 3.74 3.02 1.43 1.42 1.18 1.5 1.1 0.96
Sro56_g032920.1 (Contig3029.g24168)
89.83 10.9 26.77 14.98 8.28 0.07 1.45 5.89 4.82 4.39 0.74 0.29 6.75 1.2 1.6 0.46 1.59 7.1 4.71 3.92 0.4 1.77 4.8 4.65 3.35 2.55 0.75
Sro588_g171440.1 (Contig4679.g34786)
266.43 59.21 107.6 69.91 43.61 2.17 9.03 20.2 32.25 13.99 14.12 9.14 9.05 5.13 9.69 6.98 12.84 7.18 5.81 11.92 8.89 18.51 13.47 7.54 8.65 5.34 7.05
Sro647_g180850.1 (Contig3562.g27501)
68.84 23.68 23.39 13.33 12.9 1.64 2.48 2.99 6.63 6.99 3.31 2.35 5.09 1.61 2.77 1.45 2.99 6.73 7.37 6.04 5.7 6.49 6.54 9.09 5.06 4.25 1.78
Sro664_g183670.1 (Contig3359.g26303)
188.13 10.45 6.61 5.43 4.91 0.3 21.61 96.61 91.92 8.14 1.28 1.41 3.11 0.45 2.18 2.81 0.57 4.53 2.91 2.33 1.8 11.64 22.1 4.83 17.34 17.36 3.01
Sro66_g037250.1 (Contig399.g5395)
281.93 37.72 47.93 27.1 37.47 5.11 34.68 30.32 41.87 28.9 11.66 19.35 5.06 13.4 21.17 8.96 6.98 2.89 6.63 6.42 20.76 26.9 22.76 15.34 13.66 9.27 7.99
Sro692_g188030.1 (Contig950.g9811)
129.14 24.68 32.13 12.0 13.37 3.28 6.32 7.09 10.67 12.98 7.86 7.78 13.96 6.28 6.71 5.33 6.61 12.49 8.9 15.15 13.01 10.25 9.52 8.88 10.28 4.99 6.26
Sro697_g189120.1 (Contig3345.g26211)
57.21 13.25 12.67 11.87 12.48 2.38 4.63 6.26 4.39 7.97 3.23 6.67 4.32 10.37 6.1 2.67 4.28 4.59 4.96 4.85 4.51 4.11 5.15 31.02 15.94 6.26 2.98
Sro786_g202240.1 (Contig1324.g12237)
80.98 5.82 35.01 17.36 8.21 0.37 1.26 1.74 0.55 4.17 0.78 2.42 2.66 1.27 1.32 1.89 0.76 1.06 7.26 1.33 2.7 0.74 0.48 6.84 11.43 1.81 1.5
Sro834_g208720.1 (Contig2061.g17674)
105.76 7.52 39.4 10.14 6.08 1.35 1.42 2.21 3.81 7.67 3.82 6.19 2.5 5.23 3.62 3.81 3.86 1.5 3.58 6.69 5.65 4.26 3.75 5.1 6.12 2.72 3.6
Sro904_g218340.1 (Contig2814.g22571)
6.33 0.97 1.45 1.53 1.52 0.0 0.03 0.33 0.99 0.35 0.0 0.1 0.24 0.09 0.0 0.06 0.0 0.0 0.26 0.34 0.31 0.0 0.01 0.33 0.41 0.63 0.0
Sro904_g218380.1 (Contig2814.g22575)
138.9 25.77 35.94 28.19 23.06 2.71 8.27 70.5 51.05 13.26 9.02 7.89 5.86 3.99 8.75 15.16 6.3 12.84 5.95 9.85 8.88 12.77 18.34 23.59 31.42 15.76 7.86
Sro980_g227460.1 (Contig982.g9983)
608.22 78.28 64.2 60.91 55.43 5.88 38.64 40.38 74.06 26.08 16.29 17.25 10.32 4.8 7.38 4.74 6.55 5.79 5.29 8.03 11.58 38.07 47.94 6.05 5.36 8.67 9.42
Sro986_g228100.1 (Contig4404.g33095)
48.76 8.48 6.86 6.82 7.17 1.78 1.65 5.38 9.38 3.56 4.44 0.79 5.35 0.32 2.9 2.8 3.86 11.22 16.69 6.6 0.94 3.25 7.47 1.69 1.34 1.36 2.88

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)