Heatmap: Cluster_318 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1004_g230140.1 (Contig213.g2530)	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.0	0.1	1.0	0.59	0.01	0.0	0.0	0.08	0.0	0.01	0.0	0.0	0.06	0.02	0.12	0.0	0.19	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1125_g243930.1 (Contig4623.g34499)	0.01	0.12	0.12	0.08	0.11	0.07	0.2	1.0	0.53	0.17	0.2	0.24	0.49	0.21	0.22	0.22	0.19	0.19	0.21	0.48	0.18	0.41	0.06	0.18	0.2	0.12	0.11
Sro1162_g247910.1 (Contig2070.g17726)	0.0	0.21	0.3	0.06	0.02	0.0	0.14	1.0	0.56	0.1	0.05	0.07	0.5	0.04	0.1	0.06	0.02	0.36	0.23	0.55	0.1	0.26	0.08	0.14	0.32	0.3	0.06
Sro121_g059030.1 (Contig1619.g14657)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.18	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.05	0.0	0.01	0.01	0.06
Sro1255_g256470.2	0.12	0.36	0.37	0.53	0.32	0.12	0.06	1.0	0.56	0.16	0.24	0.1	0.22	0.04	0.14	0.22	0.26	0.81	0.59	0.17	0.17	0.28	0.27	0.17	0.14	0.27	0.12
Sro1427_g271810.1 (Contig1281.g11983)	0.0	0.03	0.11	0.0	0.02	0.0	0.01	1.0	0.42	0.03	0.0	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01	0.19	0.23	0.01	0.01	0.06	0.67	0.02	0.0	0.0	0.0	0.12
Sro1456_g274220.1 (Contig1061.g10398)	0.24	0.19	0.3	0.29	0.29	0.01	0.07	1.0	0.77	0.1	0.07	0.08	0.22	0.04	0.04	0.05	0.03	0.5	0.32	0.2	0.08	0.37	0.12	0.06	0.05	0.04	0.03
Sro14_g010680.1 (Contig1128.g10817)	0.0	0.05	0.01	0.03	0.02	0.0	0.05	1.0	0.49	0.02	0.03	0.02	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.1	0.01	0.01	0.04	0.23	0.14	0.04	0.27	0.17	0.01
Sro1536_g280590.1 (Contig2003.g17142)	0.0	0.05	0.03	0.03	0.05	0.0	0.15	1.0	0.58	0.02	0.01	0.04	0.01	0.0	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.48	0.2	0.01	0.0	0.01	0.01
Sro1614_g286100.1 (Contig3441.g26767)	0.0	0.0	0.03	0.05	0.0	0.0	0.3	1.0	0.63	0.05	0.0	0.05	0.03	0.03	0.01	0.0	0.01	0.13	0.08	0.06	0.2	0.07	0.11	0.0	0.0	0.03	0.01
Sro1632_g287280.1 (Contig3523.g27243)	0.0	0.0	0.02	0.02	0.02	0.0	0.02	1.0	0.28	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.04	0.01	0.01	0.0	0.26	0.04	0.0	0.01	0.01	0.0
Sro1651_g288750.1 (Contig2974.g23647)	0.08	0.23	0.36	0.39	0.46	0.04	0.14	1.0	0.74	0.14	0.14	0.04	0.46	0.09	0.13	0.07	0.18	0.52	0.21	0.29	0.12	0.35	0.24	0.09	0.06	0.05	0.21
Sro16_g011610.1 (Contig916.g9598)	0.04	0.08	0.03	0.23	0.12	0.0	0.02	0.91	1.0	0.07	0.0	0.01	0.27	0.0	0.06	0.0	0.01	0.04	0.01	0.24	0.09	0.7	0.17	0.01	0.0	0.01	0.0
Sro180_g078640.1 (Contig350.g4743)	0.0	0.21	0.12	0.13	0.09	0.01	0.09	0.97	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.01	0.77	0.1	0.0	0.01	0.05	0.01
Sro1894_g303920.1 (Contig4005.g30803)	0.07	0.19	0.21	0.13	0.19	0.02	0.1	1.0	0.76	0.08	0.05	0.17	0.05	0.01	0.04	0.09	0.03	0.18	0.11	0.07	0.07	0.61	0.28	0.06	0.09	0.06	0.04
Sro1896_g304020.1 (Contig1676.g15064)	0.0	0.1	0.06	0.11	0.12	0.0	0.23	1.0	0.85	0.02	0.01	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.03	0.27	0.01	0.38	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1991_g309780.1 (Contig4515.g33855)	0.01	0.1	0.04	0.1	0.06	0.33	0.15	0.84	1.0	0.11	0.07	0.12	0.56	0.0	0.03	0.0	0.09	0.3	0.1	0.75	0.09	0.68	0.46	0.08	0.03	0.04	0.03
Sro19_g013600.1 (Contig446.g6024)	0.03	0.16	0.16	0.36	0.16	0.0	0.04	1.0	0.75	0.04	0.0	0.02	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.4	0.15	0.0	0.01	0.0	0.0
Sro2059_g312880.1 (Contig3244.g25637)	0.0	0.28	0.23	0.15	0.23	0.02	0.09	1.0	0.5	0.1	0.09	0.05	0.45	0.07	0.08	0.08	0.04	0.73	0.39	0.39	0.09	0.21	0.12	0.01	0.01	0.03	0.07
Sro209_g087270.1 (Contig4070.g31198)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.19	0.0	0.06	0.0	0.06	0.0	0.03	0.04	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.13	0.02	0.0	0.01	0.0	0.03
Sro2120_g315410.1 (Contig3476.g26955)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0	0.32	0.04	0.05	0.0	0.08	0.04	0.06	0.05	0.05	0.47	0.38	0.13	0.04	0.22	0.12	0.01	0.01	0.01	0.03
Sro2133_g315911.1	0.0	0.35	1.0	0.49	0.42	0.0	0.01	0.47	0.72	0.1	0.0	0.13	0.0	0.01	0.01	0.0	0.02	0.01	0.07	0.03	0.02	0.71	0.06	0.03	0.28	0.09	0.01
Sro214_g088870.1 (Contig282.g3672)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.71	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.02	0.03	0.0	0.52	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro2405_g326510.1 (Contig3497.g27142)	0.07	0.21	0.19	0.23	0.21	0.13	0.06	1.0	0.62	0.09	0.11	0.11	0.19	0.03	0.1	0.08	0.12	0.35	0.14	0.14	0.14	0.13	0.3	0.06	0.15	0.06	0.07
Sro257_g100810.1 (Contig2018.g17260)	0.0	0.14	0.06	0.06	0.09	0.08	0.14	1.0	0.9	0.17	0.13	0.19	0.02	0.15	0.2	0.3	0.14	0.23	0.09	0.06	0.09	0.8	0.19	0.03	0.01	0.03	0.23
Sro28_g018850.1 (Contig404.g5494)	0.01	0.07	0.24	0.17	0.2	0.01	0.02	1.0	0.89	0.06	0.06	0.03	0.45	0.17	0.11	0.11	0.11	0.3	0.22	0.43	0.01	0.51	0.19	0.04	0.08	0.08	0.04
Sro379_g130440.1 (Contig3398.g26561)	0.16	0.29	0.32	0.19	0.18	0.09	0.33	0.96	1.0	0.19	0.51	0.22	0.31	0.2	0.33	0.26	0.6	0.28	0.27	0.23	0.11	0.79	0.59	0.06	0.03	0.18	0.27
Sro386_g131940.1 (Contig4061.g31135)	0.65	0.0	0.0	0.46	0.45	0.0	0.0	0.98	0.91	0.19	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0	0.0	0.14	0.48	1.0	0.49	0.36	0.0	0.0	0.0	0.1
Sro38_g023860.1 (Contig1551.g14121)	0.08	0.31	0.47	0.25	0.28	0.17	0.44	0.94	1.0	0.26	0.3	0.31	0.38	0.15	0.29	0.21	0.36	0.48	0.24	0.32	0.26	0.82	0.62	0.11	0.19	0.22	0.24
Sro4219_g353410.1 (Contig4.g67)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.62	0.01	0.13	0.08	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.78	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro430_g141330.1 (Contig4379.g32927)	0.0	0.1	0.08	0.13	0.08	0.0	0.01	1.0	0.17	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.01	0.02	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro432_g141730.1 (Contig1545.g14028)	0.0	0.24	0.16	0.07	0.06	0.0	0.02	0.48	0.58	0.07	0.04	0.04	0.01	0.0	0.02	0.14	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	1.0	0.14	0.0	0.0	0.04	0.04
Sro451_g145760.1 (Contig1599.g14520)	0.01	0.37	0.49	0.38	0.35	0.05	0.22	1.0	0.47	0.08	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.02	0.34	0.09	0.05	0.03	0.4	0.32	0.2	0.31	0.2	0.08
Sro486_g152720.1 (Contig3152.g25011)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.88	1.0	0.15	0.11	0.04	0.17	0.02	0.05	0.05	0.0	0.02	0.0	0.16	0.11	0.58	0.38	0.0	0.0	0.09	0.01
Sro49_g028621.1	0.32	0.09	0.05	0.06	0.05	0.03	0.03	1.0	0.39	0.07	0.05	0.17	0.15	0.05	0.08	0.09	0.04	0.05	0.11	0.12	0.11	0.11	0.09	0.08	0.25	0.15	0.04
Sro500_g155180.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	1.0	0.0	0.04	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro524_g159870.1 (Contig202.g2384)	0.12	0.25	0.22	0.31	0.3	0.01	0.12	1.0	0.73	0.08	0.08	0.06	0.17	0.02	0.08	0.05	0.07	0.2	0.18	0.11	0.14	0.38	0.34	0.1	0.08	0.06	0.06
Sro526_g160270.1 (Contig842.g9272)	0.03	0.13	0.3	0.26	0.2	0.02	0.19	0.91	1.0	0.08	0.06	0.05	0.18	0.02	0.09	0.03	0.02	0.02	0.01	0.09	0.31	0.99	0.58	0.01	0.0	0.03	0.03
Sro570_g168520.1 (Contig131.g1475)	0.01	0.23	0.25	0.44	0.64	0.03	0.09	0.98	1.0	0.05	0.09	0.0	0.08	0.02	0.07	0.09	0.03	0.47	0.18	0.05	0.0	0.37	0.4	0.11	0.23	0.11	0.07
Sro574_g169170.1 (Contig281.g3636)	0.07	0.16	0.22	0.3	0.25	0.02	0.14	0.67	1.0	0.06	0.09	0.0	0.13	0.0	0.07	0.0	0.03	0.12	0.0	0.15	0.02	0.73	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01
Sro602_g173740.1 (Contig490.g6600)	0.0	0.21	0.43	0.2	0.15	0.12	0.22	1.0	0.38	0.11	0.16	0.13	0.34	0.06	0.19	0.11	0.15	0.15	0.09	0.23	0.11	0.16	0.15	0.32	0.3	0.13	0.09
Sro640_g179930.1 (Contig454.g6127)	0.0	0.05	0.03	0.16	0.15	0.0	0.0	1.0	0.05	0.01	0.03	0.04	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01
Sro658_g182801.1	0.01	0.13	0.15	0.18	0.18	0.0	0.39	0.76	0.6	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	1.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro71_g039500.1 (Contig2582.g20973)	0.12	0.23	0.32	0.18	0.17	0.02	0.24	1.0	0.86	0.11	0.08	0.12	0.49	0.07	0.14	0.15	0.09	0.1	0.13	0.3	0.16	0.74	0.2	0.08	0.19	0.11	0.08
Sro75_g041021.1	0.0	0.13	0.19	0.07	0.06	0.0	0.03	1.0	0.28	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.1	0.07	0.01	0.01	0.02	0.2	0.07	0.0	0.0	0.0	0.1
Sro76_g041470.1 (Contig184.g2125)	0.0	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	1.0	0.32	0.05	0.01	0.02	0.28	0.01	0.02	0.09	0.04	0.54	0.23	0.22	0.05	0.23	0.13	0.0	0.02	0.04	0.03
Sro782_g201830.1 (Contig2391.g19607)	0.0	0.04	0.22	0.06	0.0	0.0	0.0	0.64	0.85	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.26	0.09	0.03	0.01	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08
Sro896_g217390.1 (Contig3311.g25950)	0.0	0.18	0.11	0.07	0.06	0.0	0.09	1.0	0.7	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.45	0.38	0.0	0.01	0.0	0.0
Sro918_g220031.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.29	1.0	0.32	0.05	0.03	0.08	0.04	0.01	0.05	0.12	0.03	0.19	0.07	0.04	0.01	0.26	0.27	0.0	0.01	0.03	0.05
Sro931_g221441.1	0.0	0.21	0.18	0.26	0.23	0.06	0.19	1.0	0.68	0.08	0.28	0.04	0.23	0.13	0.37	0.04	0.4	0.52	0.04	0.1	0.07	0.85	0.18	0.0	0.0	0.1	0.03
Sro934_g221850.1 (Contig2403.g19672)	0.0	0.18	0.24	0.19	0.2	0.02	0.17	1.0	0.82	0.08	0.08	0.01	0.17	0.05	0.06	0.01	0.01	0.49	0.21	0.08	0.13	0.81	0.59	0.03	0.01	0.03	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)