Heatmap: Cluster_302 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1004_g230110.1 (Contig213.g2527)	0.22	0.06	0.09	0.15	0.13	0.5	0.18	0.18	0.45	0.52	0.3	0.78	0.22	0.16	0.23	0.04	0.24	0.67	1.0	0.32	0.36	0.29	0.62	0.24	0.42	0.48	0.19
Sro1011_g231010.1 (Contig997.g10074)	0.91	0.09	0.18	0.21	0.27	0.15	0.36	0.21	0.08	0.65	0.36	0.68	0.24	0.71	0.41	0.64	0.31	0.03	0.08	0.19	1.0	0.3	0.28	0.19	0.37	0.19	0.43
Sro1056_g236210.1 (Contig4431.g33262)	0.02	0.48	0.58	0.63	0.39	0.14	0.19	0.15	0.24	0.61	0.29	0.48	0.77	0.96	0.46	0.62	0.6	0.29	0.26	0.63	0.81	0.71	0.27	0.52	0.96	1.0	0.74
Sro107_g053860.1 (Contig1548.g14061)	0.07	0.05	0.05	0.03	0.02	0.05	0.17	0.09	0.13	0.63	0.31	0.6	0.42	0.56	0.34	0.51	0.35	0.27	0.35	0.83	1.0	0.26	0.1	0.18	0.28	0.36	0.3
Sro110_g055000.1 (Contig1501.g13723)	0.52	0.04	0.05	0.06	0.07	0.13	0.4	0.54	0.68	0.74	0.44	1.0	0.04	0.14	0.26	0.26	0.33	0.1	0.09	0.11	0.8	0.18	0.41	0.13	0.53	0.32	0.33
Sro1124_g243810.1 (Contig4358.g32839)	1.0	0.14	0.11	0.19	0.13	0.24	0.07	0.07	0.1	0.47	0.19	0.59	0.19	0.22	0.18	0.06	0.12	0.08	0.15	0.51	0.42	0.16	0.14	0.2	0.22	0.3	0.13
Sro1153_g247010.1 (Contig4473.g33616)	0.0	0.1	0.05	0.0	0.02	0.06	0.03	0.01	0.01	0.53	0.24	0.7	0.02	0.65	0.08	0.13	0.53	0.03	0.43	0.28	1.0	0.83	0.06	0.04	0.04	0.31	0.34
Sro1221_g253740.1 (Contig1854.g16198)	0.92	0.03	0.03	0.04	0.03	0.11	0.14	0.06	0.06	0.47	0.21	1.0	0.08	0.45	0.15	0.13	0.1	0.1	0.12	0.11	0.46	0.04	0.11	0.22	0.17	0.22	0.18
Sro12_g009050.1 (Contig2293.g18925)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1370_g266970.1 (Contig2356.g19357)	0.04	0.1	0.17	0.09	0.12	0.04	0.29	0.1	0.22	0.56	0.25	0.62	0.19	0.33	0.34	0.71	0.21	0.21	1.0	1.0	0.88	0.07	0.26	0.29	0.63	0.46	0.23
Sro144_g066960.1 (Contig3873.g29795)	0.01	0.48	0.41	0.24	0.21	0.16	0.41	0.18	0.36	0.82	0.29	0.75	0.26	0.44	0.32	0.36	0.5	0.18	0.32	0.66	1.0	0.31	0.36	0.2	0.19	0.33	0.26
Sro1585_g284060.1 (Contig469.g6363)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.27	0.53	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6	1.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1593_g284490.1 (Contig579.g7335)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.07	0.12	0.0	0.01	0.51	0.03	0.48	0.24	0.2	0.15	0.48	0.15	0.19	0.38	0.58	1.0	0.08	0.04	0.13	0.3	0.38	0.24
Sro1595_g284710.1 (Contig4539.g33935)	1.0	0.41	0.48	0.53	0.51	0.18	0.21	0.17	0.12	0.54	0.19	0.92	0.73	0.44	0.17	0.13	0.15	0.66	0.55	0.58	0.5	0.3	0.18	0.4	0.39	0.26	0.18
Sro163_g073340.1 (Contig1793.g15867)	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.05	0.09	0.05	0.45	0.09	0.54	0.15	0.64	0.17	0.29	0.24	0.16	0.13	0.62	1.0	0.15	0.07	0.01	0.06	0.29	0.19
Sro16_g011570.1 (Contig916.g9594)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1703_g292300.1 (Contig3129.g24835)	0.19	0.0	0.06	0.0	0.0	0.04	0.04	0.02	0.02	1.0	0.0	0.77	0.83	0.05	0.02	0.02	0.06	0.0	0.11	0.53	0.79	0.41	0.42	0.05	0.47	0.2	0.05
Sro184_g080130.1 (Contig2216.g18416)	0.36	0.06	0.05	0.04	0.04	0.22	0.22	0.12	0.03	0.58	0.25	1.0	0.12	0.46	0.17	0.14	0.03	0.11	0.23	0.31	0.72	0.11	0.03	0.36	0.61	0.42	0.17
Sro1874_g303000.1 (Contig3840.g29509)	0.1	0.23	0.43	0.17	0.09	0.07	0.19	0.08	0.05	0.6	0.4	0.58	0.13	0.88	0.36	0.57	0.35	0.12	0.29	0.51	1.0	0.34	0.09	0.24	0.37	0.52	0.35
Sro1967_g308370.1 (Contig1335.g12304)	1.0	0.11	0.32	0.28	0.19	0.02	0.08	0.08	0.08	0.34	0.11	0.64	0.09	0.1	0.08	0.09	0.11	0.07	0.25	0.19	0.28	0.07	0.06	0.06	0.14	0.08	0.12
Sro216_g089480.1 (Contig227.g2725)	0.9	0.37	0.33	0.44	0.66	0.2	0.28	0.25	0.17	0.87	0.57	1.0	0.77	0.92	0.44	0.42	0.43	0.31	0.61	0.81	0.64	0.25	0.19	0.48	0.34	0.29	0.43
Sro2255_g320980.1 (Contig1871.g16356)	0.08	0.05	0.03	0.05	0.06	0.1	0.24	0.22	0.1	0.55	0.12	1.0	0.16	0.37	0.19	0.18	0.13	0.28	0.1	0.33	0.67	0.09	0.14	0.23	0.2	0.15	0.09
Sro233_g094280.1	0.21	0.12	0.08	0.07	0.07	0.24	0.34	0.26	0.2	0.61	0.47	1.0	0.45	0.53	0.35	0.19	0.4	0.47	0.47	0.54	0.67	0.07	0.21	0.42	0.3	0.22	0.24
Sro2394_g325920.1 (Contig3451.g26828)	0.42	0.15	0.14	0.09	0.1	0.01	0.16	0.14	0.08	0.73	0.04	1.0	0.03	0.13	0.01	0.07	0.05	0.0	0.01	0.04	0.75	0.03	0.14	0.02	0.06	0.07	0.02
Sro23_g016070.1 (Contig2259.g18757)	0.08	0.12	0.07	0.04	0.06	0.13	0.26	0.17	0.2	0.73	0.5	0.77	0.09	0.56	0.34	0.59	0.37	0.16	0.61	0.5	0.91	1.0	0.4	0.37	0.76	0.61	0.47
Sro311_g114320.1 (Contig909.g9547)	0.11	0.22	0.06	0.02	0.03	0.04	0.02	0.07	0.18	0.92	0.22	1.0	0.08	0.17	0.06	0.02	0.17	0.02	0.04	0.2	0.28	0.15	0.13	0.03	0.07	0.07	0.05
Sro336_g120340.1 (Contig4022.g30923)	0.9	0.1	0.1	0.07	0.03	0.39	0.2	0.19	0.12	0.83	0.36	1.0	0.3	0.41	0.21	0.16	0.16	0.28	0.39	0.47	0.6	0.07	0.1	0.12	0.09	0.06	0.5
Sro336_g120350.1 (Contig4022.g30924)	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.01	0.04	0.37	0.01	0.82	0.01	0.04	0.02	0.0	0.02	0.01	0.0	0.02	0.16	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01
Sro351_g123950.1 (Contig4381.g32949)	0.09	0.15	0.87	0.03	0.07	0.01	0.08	0.02	0.01	0.39	0.12	0.45	0.23	0.22	0.13	0.2	0.09	0.25	0.45	1.0	0.99	0.08	0.17	0.09	0.2	0.19	0.23
Sro378_g130300.1 (Contig2744.g22073)	0.06	0.19	0.1	0.11	0.2	0.05	0.36	0.3	0.27	0.74	0.13	0.72	0.51	0.46	0.17	0.3	0.15	0.23	0.45	0.93	1.0	0.42	0.3	0.12	0.29	0.27	0.18
Sro37_g023050.1 (Contig1425.g13121)	0.01	0.17	1.0	0.16	0.12	0.06	0.11	0.15	0.2	0.47	0.23	0.54	0.23	0.57	0.18	0.24	0.22	0.17	0.44	0.48	0.83	0.34	0.23	0.14	0.46	0.56	0.28
Sro390_g133000.1 (Contig4620.g34489)	0.12	0.35	0.24	0.11	0.17	0.02	0.28	0.19	0.25	0.49	0.27	0.46	0.2	0.49	0.54	0.53	0.41	0.15	0.67	0.38	0.91	1.0	0.4	0.55	0.95	0.75	0.4
Sro419_g139180.1 (Contig4415.g33179)	0.01	0.01	0.03	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.94	1.0	0.02	0.12	0.03	0.02	0.28	0.01	0.04	0.02	0.0	0.27	0.0	0.42	0.41	0.05	0.0	0.06	0.14
Sro440_g143420.1 (Contig2528.g20654)	0.33	0.13	0.19	0.12	0.09	0.04	0.19	0.15	0.09	0.68	0.22	0.73	0.68	0.74	0.21	0.28	0.26	0.16	0.25	0.92	1.0	0.25	0.14	0.17	0.42	0.27	0.2
Sro443_g143970.1 (Contig715.g8243)	0.27	0.27	0.64	0.17	0.11	0.18	0.14	0.12	0.1	0.81	0.14	1.0	0.38	0.53	0.11	0.08	0.11	0.06	0.13	0.75	0.79	0.17	0.11	0.15	0.15	0.09	0.13
Sro461_g147650.1 (Contig3552.g27419)	1.0	0.19	0.38	0.36	0.36	0.09	0.1	0.15	0.17	0.47	0.1	0.9	0.17	0.34	0.09	0.02	0.08	0.13	0.23	0.31	0.49	0.36	0.23	0.2	0.26	0.2	0.1
Sro485_g152400.1 (Contig1932.g16640)	0.18	0.21	0.24	0.23	0.19	0.12	0.48	0.45	0.47	0.85	0.44	0.99	0.85	0.51	0.31	0.39	0.21	0.37	0.6	1.0	0.99	0.72	0.44	0.41	0.59	0.27	0.25
Sro503_g155750.1 (Contig635.g7687)	0.92	0.11	0.09	0.12	0.11	0.19	0.2	0.24	0.12	0.66	0.16	1.0	0.1	0.27	0.13	0.26	0.24	0.08	0.18	0.3	0.79	0.26	0.2	0.62	0.49	0.36	0.17
Sro507_g156470.1 (Contig4452.g33449)	0.94	0.26	0.33	0.28	0.28	0.08	0.1	0.16	0.21	0.68	0.12	1.0	0.18	0.19	0.09	0.12	0.09	0.1	0.25	0.39	0.88	0.22	0.25	0.17	0.21	0.19	0.12
Sro545_g163950.1 (Contig1180.g11238)	0.24	0.06	0.52	0.03	0.01	0.02	0.16	0.09	0.18	0.42	0.28	0.28	0.33	0.17	0.23	0.52	0.24	0.28	0.34	1.0	0.98	0.34	0.29	0.18	0.15	0.34	0.31
Sro624_g177430.1 (Contig2249.g18648)	0.0	0.13	0.14	0.32	0.24	0.46	0.32	0.24	0.31	0.6	0.82	1.0	0.36	0.64	0.48	0.57	0.54	0.28	0.44	0.43	0.71	0.17	0.17	0.41	0.16	0.33	0.41
Sro64_g036420.1 (Contig2497.g20476)	0.44	0.04	0.05	0.0	0.0	0.02	0.07	0.1	0.02	0.65	0.05	1.0	0.08	0.24	0.11	0.05	0.1	0.02	0.06	0.17	0.27	0.18	0.05	0.13	0.18	0.07	0.05
Sro652_g181730.1 (Contig2024.g17326)	0.24	0.09	0.11	0.06	0.07	0.2	0.27	0.27	0.09	0.86	0.8	1.0	0.23	0.3	0.46	0.73	0.72	0.34	0.22	0.43	0.81	0.05	0.14	0.51	0.5	0.2	0.56
Sro701_g189710.1 (Contig2013.g17182)	0.04	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.03	0.02	0.02	0.39	0.07	0.3	0.37	0.4	0.13	0.09	0.06	0.12	0.27	0.44	1.0	0.2	0.06	0.11	0.01	0.17	0.06
Sro74_g040780.1 (Contig4700.g34940)	1.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.42	0.04	0.49	0.06	0.03	0.04	0.03	0.04	0.11	0.15	0.17	0.29	0.03	0.03	0.08	0.17	0.1	0.04
Sro791_g202970.1 (Contig1638.g14763)	0.19	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.09	0.19	0.19	0.63	0.05	1.0	0.15	0.06	0.06	0.19	0.0	0.06	0.22	0.18	0.68	0.06	0.09	0.03	0.12	0.11	0.04
Sro809_g205630.1 (Contig3027.g24126)	0.33	0.19	0.16	0.22	0.16	0.15	0.16	0.11	0.13	0.79	0.31	1.0	0.54	0.4	0.25	0.29	0.27	0.24	0.38	0.87	0.86	0.33	0.13	0.18	0.32	0.28	0.29
Sro80_g043190.1 (Contig92.g1063)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro829_g208060.1 (Contig1016.g10165)	0.61	0.02	0.03	0.02	0.02	0.17	0.15	0.08	0.11	0.59	0.21	0.6	0.61	0.26	0.25	0.28	0.18	0.25	0.28	1.0	0.62	0.22	0.09	0.13	0.14	0.16	0.21
Sro835_g208790.1 (Contig3133.g24861)	0.01	0.08	0.02	0.04	0.11	0.2	0.32	0.18	0.15	0.68	0.32	1.0	0.4	0.9	0.42	0.77	0.22	0.46	0.57	0.81	0.81	0.52	0.07	0.48	0.45	0.56	0.32
Sro890_g216750.1 (Contig4208.g32017)	1.0	0.04	0.05	0.03	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01	0.27	0.05	0.47	0.07	0.14	0.04	0.0	0.04	0.03	0.06	0.16	0.27	0.08	0.03	0.09	0.11	0.11	0.05
Sro896_g217340.1 (Contig3311.g25945)	0.01	0.21	0.34	0.09	0.05	0.05	0.06	0.09	0.14	0.54	0.14	1.0	0.43	0.13	0.11	0.08	0.18	0.09	0.31	0.71	0.3	0.38	0.42	0.18	0.15	0.18	0.17
Sro968_g226040.1 (Contig1973.g16879)	0.01	0.1	1.0	0.12	0.08	0.0	0.04	0.06	0.15	0.32	0.16	0.31	0.03	0.2	0.21	0.38	0.09	0.15	0.18	0.56	0.56	0.23	0.14	0.09	0.11	0.27	0.2
Sro968_g226110.1 (Contig1973.g16886)	0.36	0.11	0.07	0.17	0.16	0.17	0.16	0.09	0.08	0.69	0.45	0.79	0.68	0.79	0.47	0.64	0.36	0.13	0.27	0.63	1.0	0.06	0.09	0.31	0.3	0.33	0.4
Sro98_g050490.1 (Contig3362.g26341)	0.72	0.38	0.45	0.62	0.44	0.08	0.3	0.42	0.19	0.82	0.29	0.83	0.29	0.26	0.27	0.38	0.28	0.56	0.43	0.66	1.0	0.15	0.07	0.46	0.71	0.4	0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)