Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1024_g232650.1 (Contig4464.g33544)
0.01 0.1 0.05 0.02 0.04 0.11 0.31 0.36 0.18 0.4 0.25 0.54 0.66 0.44 0.33 0.35 0.17 0.29 0.37 1.0 0.53 0.28 0.15 0.27 0.44 0.27 0.29
Sro1049_g235430.1 (Contig3572.g27598)
0.01 0.26 0.22 0.07 0.08 0.36 0.58 0.44 0.18 0.68 0.65 0.84 0.62 0.59 0.85 1.0 0.51 0.62 0.66 0.74 0.89 0.61 0.23 0.66 0.52 0.5 0.75
Sro1054_g236000.1 (Contig2250.g18657)
0.04 0.15 0.19 0.07 0.11 0.1 0.44 0.31 0.25 0.42 0.4 0.52 0.93 0.29 0.46 0.56 0.32 0.53 0.66 1.0 0.65 0.28 0.17 0.58 0.53 0.51 0.33
Sro1068_g237510.1 (Contig852.g9370)
0.03 0.15 0.09 0.08 0.05 0.28 0.64 0.44 0.26 0.7 0.65 0.9 0.78 0.55 0.69 0.79 0.42 0.48 0.49 1.0 0.99 0.69 0.25 0.57 0.59 0.45 0.5
Sro1098_g241030.1 (Contig3483.g27024)
0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.12 0.34 0.3 0.32 0.55 0.72 0.74 0.57 0.5 0.58 1.0 0.49 0.49 0.46 0.63 0.73 0.29 0.16 0.48 0.34 0.39 0.51
Sro1139_g245400.1 (Contig125.g1416)
0.03 0.07 0.07 0.03 0.04 0.15 0.35 0.29 0.25 0.54 0.61 0.65 0.65 0.44 0.54 0.6 0.54 0.69 0.86 1.0 0.7 0.42 0.21 0.39 0.32 0.32 0.5
Sro1141_g245640.1 (Contig1502.g13741)
0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.2 0.49 0.48 0.18 0.57 0.49 0.59 1.0 0.41 0.57 0.71 0.4 0.72 0.71 0.97 0.89 0.53 0.2 0.53 0.47 0.44 0.43
Sro1165_g248140.1 (Contig3103.g24685)
0.0 0.05 0.25 0.04 0.07 0.14 0.44 0.13 0.17 0.59 0.54 0.54 0.39 0.23 0.74 0.59 0.45 0.56 0.59 1.0 0.72 0.3 0.12 0.29 0.79 0.66 0.4
Sro1185_g250210.1 (Contig4663.g34704)
0.03 0.05 0.02 0.02 0.02 0.08 0.4 0.2 0.16 0.56 0.61 0.83 0.94 0.4 0.66 0.63 0.38 0.53 1.0 0.82 0.8 0.33 0.12 0.61 0.35 0.34 0.48
Sro1223_g253860.1 (Contig4600.g34348)
0.01 0.02 0.04 0.03 0.04 0.11 0.38 0.12 0.17 0.53 0.53 0.52 0.72 0.48 0.48 0.82 0.37 0.78 0.75 1.0 0.65 0.69 0.22 0.28 0.56 0.49 0.36
Sro122_g059270.1 (Contig71.g746)
0.06 0.53 0.56 0.46 0.36 0.13 0.4 0.85 0.19 0.56 1.0 0.46 0.71 0.17 0.74 0.59 0.63 0.75 0.72 0.71 0.91 0.14 0.15 0.81 0.76 0.6 0.72
Sro1235_g254990.1 (Contig1411.g12957)
0.04 0.31 0.29 0.24 0.24 0.35 0.46 0.47 0.48 0.62 0.78 0.73 0.73 0.59 0.7 0.86 0.59 0.7 0.87 1.0 0.75 0.54 0.39 0.5 0.4 0.5 0.66
Sro1269_g257850.1 (Contig3033.g24206)
0.01 0.25 0.19 0.13 0.1 0.31 0.55 0.58 0.35 0.63 0.91 0.76 0.77 0.47 0.82 1.0 0.73 0.78 0.79 0.93 0.94 0.65 0.31 0.7 0.7 0.49 0.82
Sro133_g063160.1 (Contig2274.g18875)
0.01 0.05 0.03 0.03 0.02 0.17 0.31 0.28 0.31 0.4 0.32 0.36 0.95 0.34 0.32 0.43 0.3 0.47 0.74 1.0 0.58 0.41 0.11 0.28 0.3 0.32 0.26
Sro143_g066540.1 (Contig3754.g28760)
0.0 0.0 0.06 0.07 0.07 0.1 0.28 0.46 0.34 0.63 0.69 0.8 0.14 0.35 0.53 0.66 0.08 0.37 0.49 0.44 1.0 0.12 0.05 0.56 0.23 0.26 0.66
Sro146_g067520.1 (Contig2363.g19442)
0.03 0.14 0.11 0.08 0.04 0.25 0.58 0.41 0.29 0.61 0.83 0.69 0.41 0.46 0.54 0.61 0.38 0.56 0.5 0.55 1.0 0.31 0.18 0.73 0.48 0.44 0.8
Sro153_g069710.1 (Contig466.g6251)
0.01 0.14 0.13 0.13 0.11 0.11 0.45 0.46 0.1 0.5 0.49 0.56 0.46 0.19 0.43 0.38 0.24 0.41 0.55 0.65 0.99 0.36 0.12 0.66 1.0 0.83 0.46
Sro1615_g286150.1 (Contig3649.g28188)
0.11 0.4 0.42 0.21 0.29 0.17 0.43 0.74 0.29 0.66 0.98 0.75 0.57 0.56 0.65 0.47 0.51 0.58 0.61 1.0 0.88 0.55 0.31 0.79 0.84 0.7 0.61
Sro1638_g287750.1 (Contig4204.g31975)
0.03 0.17 0.14 0.13 0.1 0.35 0.57 0.54 0.26 0.68 0.69 0.86 0.68 0.34 0.58 0.7 0.51 0.74 0.77 0.99 1.0 0.55 0.21 0.69 0.91 0.51 0.5
0.02 0.07 0.04 0.03 0.05 0.09 0.5 0.35 0.32 0.48 0.42 0.59 0.82 0.39 0.48 0.58 0.3 0.5 0.61 0.95 0.82 0.38 0.17 0.67 1.0 0.56 0.29
0.02 0.07 0.04 0.03 0.05 0.09 0.5 0.35 0.32 0.48 0.42 0.59 0.82 0.39 0.48 0.58 0.3 0.5 0.61 0.95 0.82 0.38 0.17 0.67 1.0 0.56 0.29
Sro175_g077030.1 (Contig1856.g16219)
0.8 0.05 0.05 0.02 0.02 0.17 0.56 0.36 0.14 0.69 0.71 0.63 0.53 0.35 0.63 0.81 0.18 0.44 1.0 0.78 0.85 0.34 0.13 0.81 0.81 0.61 0.64
Sro184_g079870.1 (Contig2216.g18390)
0.01 0.07 0.02 0.03 0.02 0.13 0.37 0.26 0.12 0.41 0.18 0.54 0.56 0.12 0.21 0.17 0.19 0.33 0.52 1.0 0.58 0.26 0.13 0.3 0.25 0.22 0.19
Sro1872_g302790.1 (Contig3496.g27132)
0.03 0.04 0.05 0.01 0.01 0.23 0.36 0.27 0.18 0.54 0.24 0.64 0.85 0.51 0.38 0.45 0.46 0.19 0.39 1.0 0.85 0.49 0.15 0.31 0.44 0.32 0.25
Sro188_g081130.1 (Contig1383.g12714)
0.03 0.19 0.2 0.21 0.17 0.43 0.46 0.43 0.39 0.56 0.78 0.75 0.69 0.47 0.58 0.48 0.48 0.4 0.73 0.96 1.0 0.46 0.26 0.65 0.71 0.56 0.62
Sro18_g012690.1 (Contig1351.g12429)
0.0 0.05 0.03 0.02 0.02 0.17 0.42 0.18 0.13 0.49 0.38 0.6 0.45 0.55 0.37 0.38 0.22 0.59 0.61 1.0 0.56 0.55 0.15 0.34 0.27 0.35 0.32
Sro1927_g305950.1 (Contig136.g1514)
0.01 0.08 0.08 0.06 0.04 0.09 0.31 0.22 0.23 0.42 0.41 0.45 0.88 0.24 0.49 0.68 0.28 0.66 0.54 1.0 0.59 0.54 0.19 0.3 0.67 0.34 0.35
Sro199_g084380.1 (Contig257.g3176)
0.12 0.31 0.38 0.2 0.2 0.22 0.64 0.45 0.43 0.59 0.61 0.85 1.0 0.45 0.59 0.86 0.55 0.7 0.79 0.96 0.86 0.4 0.38 0.52 0.49 0.47 0.47
Sro215_g089130.1 (Contig4439.g33337)
0.03 0.24 0.23 0.17 0.14 0.32 0.57 0.39 0.23 0.62 0.72 0.7 0.76 0.39 0.5 0.66 0.56 0.44 0.5 1.0 1.0 0.39 0.17 0.89 0.98 0.64 0.44
0.01 0.06 0.01 0.01 0.01 0.06 0.15 0.21 0.23 0.32 0.21 0.32 1.0 0.28 0.28 0.28 0.19 0.38 0.53 0.99 0.41 0.23 0.08 0.15 0.09 0.18 0.18
Sro247_g098160.1 (Contig3058.g24349)
0.0 0.22 0.19 0.13 0.06 0.3 0.63 0.4 0.31 0.65 0.8 0.7 0.8 0.52 0.64 0.48 0.38 0.67 0.51 0.84 1.0 0.04 0.25 0.58 0.71 0.56 0.67
Sro248_g098320.1 (Contig288.g3766)
0.0 0.08 0.11 0.15 0.06 0.38 0.4 0.43 0.22 0.56 0.51 0.56 0.94 0.38 0.74 0.77 0.41 0.82 0.87 1.0 0.85 0.38 0.17 0.3 0.3 0.45 0.61
Sro249_g098760.1 (Contig4691.g34880)
0.02 0.14 0.1 0.13 0.06 0.34 0.52 0.37 0.22 0.65 0.69 0.73 0.86 0.43 0.73 1.0 0.53 0.65 0.83 0.88 0.81 0.41 0.22 0.56 0.79 0.66 0.61
Sro257_g100860.1 (Contig2018.g17265)
0.02 0.09 0.04 0.05 0.06 0.17 0.74 0.53 0.32 0.68 0.95 0.6 0.57 0.47 0.67 0.9 0.53 0.82 0.65 0.81 1.0 0.42 0.26 0.7 0.59 0.51 0.72
Sro257_g100880.1 (Contig2018.g17267)
0.0 0.01 0.05 0.03 0.02 0.24 0.41 0.34 0.36 0.6 0.48 0.73 0.39 0.42 0.55 0.54 0.34 0.3 0.42 0.71 1.0 0.35 0.13 0.54 0.96 0.63 0.43
Sro26_g017410.1 (Contig2432.g19912)
0.01 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 0.19 0.15 0.11 0.28 0.13 0.2 0.84 0.19 0.19 0.47 0.07 0.55 0.7 1.0 0.58 0.27 0.1 0.14 0.25 0.18 0.11
Sro28_g018660.1 (Contig404.g5475)
0.01 0.12 0.12 0.06 0.06 0.16 0.59 0.41 0.2 0.57 0.65 0.67 0.52 0.44 0.58 0.69 0.43 0.57 0.57 0.84 1.0 0.34 0.17 0.65 0.6 0.6 0.51
Sro303_g112430.1 (Contig4655.g34653)
0.02 0.18 0.22 0.11 0.09 0.13 0.59 0.49 0.43 0.58 0.66 0.73 0.63 0.57 0.57 0.71 0.36 0.62 0.6 0.86 1.0 0.41 0.36 0.57 0.59 0.47 0.53
Sro311_g114290.1 (Contig909.g9544)
0.0 0.08 0.07 0.06 0.04 0.24 0.25 0.39 0.19 0.44 0.27 0.5 0.86 0.3 0.38 0.52 0.34 0.3 0.46 1.0 0.69 0.4 0.11 0.2 0.31 0.28 0.25
Sro313_g114820.1 (Contig1770.g15657)
0.02 0.1 0.03 0.03 0.02 0.11 0.27 0.27 0.11 0.61 0.52 0.75 0.41 0.13 0.59 0.92 0.48 0.8 1.0 1.0 0.78 0.51 0.17 0.49 0.91 0.7 0.51
Sro319_g116310.1 (Contig204.g2471)
0.06 0.22 0.17 0.14 0.09 0.16 0.37 0.2 0.28 0.45 0.42 0.58 0.79 0.42 0.45 0.55 0.51 0.43 0.6 1.0 0.62 0.63 0.21 0.34 0.29 0.37 0.29
Sro331_g119140.1 (Contig3186.g25151)
0.04 0.11 0.08 0.04 0.08 0.13 0.44 0.41 0.11 0.66 0.67 0.74 0.65 0.32 0.82 1.0 0.73 0.26 0.3 0.66 0.93 0.43 0.06 0.53 0.93 0.69 0.47
Sro37_g023080.1 (Contig1425.g13124)
0.02 0.08 0.05 0.04 0.04 0.43 0.68 0.51 0.32 0.73 0.88 0.87 0.42 0.52 0.81 0.69 0.46 0.82 0.84 0.76 1.0 0.59 0.24 0.58 0.68 0.71 0.73
Sro3_g002880.1 (Contig3832.g29473)
0.0 0.02 0.13 0.09 0.04 0.17 0.62 0.7 0.22 0.66 0.76 0.78 0.63 0.83 0.75 0.73 0.44 0.48 1.0 0.7 0.96 0.27 0.25 0.78 0.48 0.86 0.53
Sro42_g025570.1 (Contig312.g4134)
0.0 0.03 0.02 0.01 0.01 0.06 0.28 0.17 0.17 0.37 0.36 0.45 0.7 0.4 0.34 0.3 0.28 0.48 0.38 1.0 0.44 0.36 0.12 0.22 0.24 0.2 0.19
Sro454_g146340.1 (Contig682.g7960)
0.0 0.06 0.07 0.06 0.08 0.23 0.33 0.26 0.3 0.55 0.36 0.59 0.74 0.4 0.57 0.63 0.45 0.69 0.89 0.9 1.0 0.56 0.23 0.28 0.5 0.47 0.37
Sro508_g156620.1 (Contig2824.g22617)
0.02 0.34 0.34 0.29 0.24 0.29 0.54 0.47 0.34 0.63 0.74 0.79 1.0 0.5 0.62 0.8 0.52 0.76 0.79 1.0 0.99 0.53 0.28 0.52 0.53 0.45 0.43
Sro541_g163170.1 (Contig3996.g30682)
0.03 0.06 0.06 0.06 0.06 0.29 0.43 0.25 0.3 0.48 0.56 0.73 0.61 0.62 0.47 0.42 0.16 0.48 0.76 0.66 1.0 0.07 0.2 0.34 0.16 0.24 0.54
Sro541_g163180.1 (Contig3996.g30683)
0.05 0.18 0.29 0.16 0.18 0.2 0.6 0.56 0.39 0.61 0.41 0.78 0.67 0.61 0.55 0.56 0.3 0.51 0.91 0.84 1.0 0.25 0.27 0.38 0.25 0.3 0.58
Sro567_g168050.1 (Contig3851.g29661)
0.05 0.22 0.22 0.23 0.17 0.23 0.43 0.28 0.36 0.42 0.36 0.52 0.95 0.5 0.35 0.35 0.23 0.46 0.59 1.0 0.47 0.44 0.26 0.29 0.22 0.21 0.33
Sro596_g172870.1 (Contig2605.g21091)
0.01 0.2 0.19 0.06 0.05 0.22 0.3 0.22 0.25 0.42 0.45 0.48 0.8 0.58 0.39 0.52 0.33 0.54 0.75 1.0 0.56 0.6 0.2 0.34 0.4 0.38 0.28
Sro620_g176580.1 (Contig2122.g17925)
0.03 0.25 0.29 0.2 0.2 0.34 0.59 0.57 0.39 0.62 0.83 0.6 0.85 0.54 0.68 0.8 0.53 0.9 0.68 1.0 0.73 0.54 0.37 0.53 0.48 0.35 0.7
Sro645_g180590.1 (Contig2972.g23603)
0.01 0.03 0.04 0.02 0.02 0.3 0.63 0.57 0.28 0.67 0.55 0.68 0.42 0.4 0.82 0.67 0.33 0.63 1.0 1.0 0.85 0.32 0.11 0.54 0.19 0.47 0.64
Sro667_g184210.1 (Contig793.g8882)
0.0 0.04 0.04 0.14 0.07 0.08 0.21 0.08 0.06 0.42 0.33 0.53 0.76 0.58 0.32 0.49 0.2 0.58 0.58 1.0 0.53 0.42 0.1 0.32 0.56 0.3 0.18
Sro738_g195280.1 (Contig2916.g23207)
0.0 0.06 0.09 0.03 0.04 0.04 0.23 0.1 0.12 0.26 0.26 0.27 0.71 0.24 0.2 0.25 0.19 0.21 0.46 1.0 0.3 0.24 0.09 0.12 0.13 0.21 0.22
Sro73_g040540.1 (Contig3929.g30155)
0.01 0.05 0.08 0.1 0.05 0.18 0.2 0.2 0.23 0.38 0.25 0.58 0.66 0.4 0.32 0.51 0.39 0.69 0.81 1.0 0.42 0.3 0.11 0.22 0.13 0.24 0.2
Sro76_g041680.1 (Contig184.g2146)
0.01 0.26 0.21 0.16 0.16 0.17 0.5 0.37 0.36 0.53 0.67 0.59 0.5 0.48 0.57 0.8 0.43 0.7 0.67 1.0 0.53 0.39 0.28 0.48 0.34 0.42 0.55
Sro773_g200530.1 (Contig1379.g12696)
0.01 0.07 0.07 0.05 0.05 0.13 0.31 0.2 0.21 0.47 0.32 0.49 0.79 0.39 0.42 0.48 0.26 0.43 0.49 1.0 0.78 0.45 0.16 0.38 0.46 0.31 0.26
Sro77_g042130.1 (Contig338.g4608)
0.02 0.05 0.03 0.01 0.01 0.16 0.38 0.15 0.08 0.54 0.62 0.56 0.44 0.13 0.7 1.0 0.53 0.59 0.39 0.75 0.82 0.18 0.13 0.34 0.88 0.47 0.47
Sro85_g045160.1 (Contig4580.g34193)
0.06 0.22 0.31 0.22 0.15 0.25 0.51 0.25 0.31 0.63 0.67 0.81 0.74 0.45 0.66 0.9 0.58 0.69 0.95 0.87 1.0 0.37 0.21 0.62 0.62 0.46 0.62
Sro865_g212730.1 (Contig3005.g23896)
0.0 0.03 0.01 0.03 0.01 0.06 0.16 0.08 0.15 0.42 0.25 0.61 0.7 0.66 0.23 0.37 0.18 0.29 0.53 1.0 0.6 0.46 0.12 0.13 0.22 0.18 0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)