1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_339 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
0.04 0.15 0.09 0.0 0.21 0.06 0.01 0.18 0.03 0.07 0.11 0.0 0.38 0.07 0.05 0.0 0.08 0.08 0.08 0.49 0.15 1.0 0.23 0.0 0.02 0.0 0.08
Sro117_g057330.1 (Contig3937.g30177)
 0.0 0.38 0.78 0.32 0.36 0.08 0.14 0.31 0.46 0.07 0.08 0.07 0.39 0.06 0.07 0.02 0.12 0.09 0.01 0.23 0.02 1.0 0.27 0.02 0.0 0.04 0.06
Sro1233_g254840.1 (Contig3336.g26182)
 0.0 0.4 0.79 0.32 0.33 0.11 0.0 0.56 1.0 0.07 0.11 0.06 0.59 0.02 0.08 0.08 0.49 0.09 0.0 0.52 0.12 0.91 0.14 0.0 0.0 0.04 0.08
Sro1284_g259190.1 (Contig3866.g29728)
 0.04 0.57 1.0 0.57 0.55 0.01 0.29 0.45 0.51 0.11 0.04 0.11 0.08 0.08 0.09 0.12 0.02 0.04 0.02 0.06 0.16 0.79 0.53 0.12 0.16 0.1 0.05
0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.15 0.0 0.23 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.09 0.16 1.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro148_g068240.1 (Contig3597.g27816)
 0.0 0.05 0.07 0.11 0.1 0.0 0.02 0.02 0.08 0.1 0.0 0.18 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.28 0.02 0.0 0.05 1.0 0.26 0.0 0.0 0.09 0.03
Sro1517_g279170.1 (Contig3255.g25683)
 0.0 0.69 0.67 0.43 0.43 0.48 0.03 0.12 0.32 0.14 0.3 0.06 0.04 0.09 0.24 0.08 0.75 0.0 0.0 0.05 0.03 1.0 0.74 0.0 0.0 0.26 0.24
Sro1517_g279180.1 (Contig3255.g25684)
 0.0 0.28 0.26 0.17 0.2 0.07 0.01 0.25 0.17 0.07 0.15 0.02 0.77 0.0 0.09 0.03 0.45 0.24 0.3 0.63 0.04 1.0 0.41 0.0 0.0 0.05 0.08
Sro1644_g288140.1 (Contig3810.g29183)
 0.0 0.46 0.75 0.19 0.04 0.0 0.2 0.48 0.24 0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.09 0.04 0.05 1.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1654_g288880.1 (Contig4624.g34508)
 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.04 0.1 0.11 0.01 0.13 0.05 0.16 0.11 0.0 0.0 0.01 0.03 0.06 0.05 1.0 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0
Sro1775_g296890.1 (Contig695.g8119)
 0.1 0.6 0.58 0.73 0.45 0.14 0.21 0.37 1.0 0.38 0.24 0.39 0.52 0.33 0.35 0.24 0.14 0.28 0.41 0.62 0.47 0.46 0.44 0.4 0.16 0.15 0.19
Sro1814_g299340.1 (Contig665.g7849)
 0.07 0.41 0.72 0.28 0.28 0.07 0.27 0.32 0.59 0.11 0.1 0.1 0.1 0.09 0.15 0.13 0.13 0.24 0.12 0.09 0.1 1.0 0.43 0.08 0.03 0.06 0.09
Sro1952_g307510.1 (Contig4337.g32715)
 0.0 0.41 0.0 0.01 0.19 0.0 0.0 0.5 0.08 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 1.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
Sro196_g083610.1 (Contig3206.g25357)
 0.03 0.26 0.39 0.2 0.16 0.07 0.07 0.45 0.39 0.27 0.08 0.3 0.02 0.59 0.11 0.14 0.28 0.13 0.28 0.18 0.35 1.0 0.28 0.08 0.13 0.59 0.25
Sro1_g000050.1 (Contig3007.g23920)
 0.0 0.43 1.0 0.25 0.24 0.03 0.16 0.1 0.26 0.08 0.05 0.02 0.04 0.04 0.13 0.01 0.07 0.14 0.07 0.04 0.04 0.79 0.29 0.12 0.08 0.08 0.03
Sro207_g086840.1 (Contig755.g8587)
 0.02 0.03 0.25 0.05 0.01 0.01 0.2 0.28 0.31 0.09 0.05 0.14 0.03 0.03 0.12 0.04 0.05 0.02 0.01 0.05 0.19 1.0 0.45 0.09 0.04 0.06 0.03
Sro212_g088190.1 (Contig3756.g28802)
 0.16 0.13 0.06 0.11 0.11 0.03 0.06 0.18 0.63 0.34 0.22 0.35 0.55 0.1 0.13 0.08 0.11 0.16 0.49 0.68 0.37 1.0 0.28 0.21 0.4 0.23 0.16
Sro2252_g320880.1 (Contig572.g7295)
 0.0 0.4 0.0 0.18 0.53 0.0 0.03 0.0 0.0 0.1 0.0 0.08 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.46 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.26 0.17 0.0 0.04 0.1 0.05 0.05 0.2 0.0 0.2 0.0 0.13 0.1 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.28 1.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2429_g327430.1 (Contig1246.g11653)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.23 0.03 0.01 0.04 0.25 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.32 0.0 1.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro2463_g328400.1 (Contig2143.g18010)
 0.01 0.06 0.02 0.04 0.1 0.03 0.09 0.08 0.11 0.24 0.07 0.31 0.01 0.26 0.06 0.1 0.23 0.01 0.16 0.07 0.35 1.0 0.2 0.06 0.06 0.21 0.12
Sro2555_g331110.1 (Contig261.g3241)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro278_g106620.1 (Contig1952.g16777)
 0.01 0.52 0.84 0.14 0.07 0.03 0.07 0.34 0.89 0.26 0.05 0.21 0.62 0.33 0.14 0.15 0.14 0.46 0.48 1.0 0.18 0.98 0.29 0.05 0.09 0.15 0.18
Sro297_g110870.1 (Contig251.g3076)
 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.12 0.41 0.01 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.27 0.0 1.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro2_g001850.1 (Contig467.g6343)
 0.01 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.04 0.05 0.09 0.34 0.21 0.32 0.03 0.43 0.21 0.52 0.24 0.13 0.31 0.35 0.81 1.0 0.21 0.06 0.03 0.67 0.36
0.0 0.31 0.15 0.1 0.14 0.0 0.03 0.31 0.22 0.09 0.0 0.02 0.2 0.01 0.04 0.08 0.01 0.83 0.54 0.31 0.01 1.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.02
Sro303_g112360.1 (Contig4655.g34646)
 0.0 0.84 0.81 0.25 0.39 0.01 0.02 0.8 1.0 0.12 0.06 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.12 0.04 0.03 0.02 0.0 0.34 0.21 0.0 0.0 0.06 0.04
Sro362_g126780.1 (Contig50.g360)
 0.05 0.85 0.75 1.0 0.95 0.28 0.21 0.47 0.63 0.4 0.42 0.37 0.75 0.37 0.42 0.28 0.46 0.82 0.74 0.73 0.31 0.88 0.37 0.29 0.27 0.34 0.35
Sro374_g129170.1 (Contig347.g4678)
 0.0 0.28 0.28 0.13 0.07 0.05 0.21 0.19 0.34 0.12 0.07 0.05 0.13 0.07 0.22 0.18 0.11 0.07 0.12 0.06 0.05 1.0 0.35 0.16 0.05 0.03 0.07
Sro377_g129960.1 (Contig75.g799)
 0.0 0.99 0.67 0.52 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro377_g130000.1 (Contig75.g803)
 0.0 1.0 0.42 0.46 0.45 0.0 0.0 0.31 0.59 0.07 0.0 0.0 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.23 0.21 0.23 0.0 0.81 0.15 0.0 0.0 0.0 0.01
0.77 0.27 0.01 0.04 0.22 0.08 0.15 0.07 0.29 0.33 0.23 0.32 0.19 0.36 0.28 0.17 0.13 0.06 0.42 0.27 0.49 1.0 0.28 0.13 0.32 0.77 0.32
Sro382_g131100.1 (Contig4152.g31694)
 0.0 1.0 0.86 0.24 0.28 0.01 0.15 0.28 0.92 0.15 0.0 0.12 0.25 0.05 0.08 0.05 0.02 0.13 0.12 0.31 0.15 0.86 0.27 0.06 0.06 0.03 0.04
Sro382_g131110.1 (Contig4152.g31695)
 0.0 0.74 0.74 0.29 0.3 0.01 0.05 0.15 0.17 0.09 0.03 0.1 0.41 0.13 0.09 0.07 0.04 0.12 0.16 0.35 0.09 1.0 0.1 0.05 0.12 0.06 0.04
Sro396_g134370.1 (Contig2592.g21048)
 0.0 1.0 0.99 0.42 0.34 0.01 0.02 0.55 0.54 0.07 0.05 0.01 0.07 0.0 0.07 0.05 0.02 0.06 0.05 0.08 0.02 0.32 0.17 0.01 0.02 0.04 0.05
Sro403_g135570.1 (Contig3393.g26511)
 0.01 0.11 0.03 0.03 0.05 0.0 0.16 0.59 0.84 0.28 0.02 0.11 0.0 0.58 0.27 0.4 0.01 0.0 0.01 0.0 0.33 1.0 0.45 0.27 0.46 0.15 0.02
Sro40_g024890.1 (Contig335.g4496)
 0.01 0.59 0.99 0.31 0.31 0.15 0.13 0.35 0.34 0.14 0.07 0.1 0.2 0.03 0.09 0.04 0.04 0.36 0.29 0.18 0.1 1.0 0.33 0.13 0.13 0.08 0.08
Sro417_g138680.1 (Contig2416.g19776)
 0.0 0.63 0.79 0.23 0.13 0.0 0.37 0.42 0.56 0.1 0.03 0.02 0.03 0.04 0.09 0.02 0.0 0.14 0.1 0.05 0.05 1.0 0.51 0.07 0.07 0.02 0.03
0.0 1.0 0.41 0.18 0.17 0.0 0.03 0.29 0.52 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.07 0.02 0.02 0.31 0.2 0.01 0.0 0.01 0.0
Sro514_g158190.1 (Contig3991.g30660)
 0.0 0.49 1.0 0.57 0.62 0.0 0.12 0.59 0.54 0.04 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.14 0.01 0.67 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro545_g163860.1 (Contig1180.g11229)
 0.09 0.6 1.0 0.51 0.4 0.11 0.31 0.39 0.43 0.19 0.19 0.1 0.24 0.16 0.24 0.26 0.19 0.27 0.2 0.16 0.17 0.68 0.35 0.3 0.19 0.08 0.21
Sro550_g164680.1 (Contig731.g8398)
 0.03 0.69 0.78 0.5 0.66 0.16 0.31 0.64 1.0 0.17 0.2 0.17 0.21 0.11 0.19 0.24 0.21 0.29 0.14 0.22 0.17 0.9 0.54 0.13 0.21 0.19 0.13
Sro55_g032520.1 (Contig4458.g33526)
 0.01 0.71 0.5 0.48 0.38 0.04 0.05 0.12 0.6 0.21 0.28 0.18 0.25 0.08 0.13 0.1 0.1 0.14 0.35 0.53 0.17 1.0 0.29 0.07 0.08 0.13 0.21
Sro55_g032530.1 (Contig4458.g33527)
 0.01 0.51 0.44 0.52 0.46 0.12 0.09 0.17 0.4 0.32 0.6 0.31 0.12 0.12 0.19 0.13 0.23 0.29 0.67 0.46 0.32 1.0 0.34 0.08 0.13 0.22 0.38
Sro585_g171100.1 (Contig3766.g28934)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.14 0.22 0.07 0.0 0.1 0.22 0.05 0.04 0.01 0.0 0.02 0.01 0.33 0.13 1.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro641_g180060.1 (Contig1098.g10650)
 0.02 0.06 0.02 0.02 0.03 0.11 0.16 0.14 0.24 0.32 0.27 0.37 0.2 0.35 0.23 0.21 0.16 0.13 0.23 0.43 0.42 1.0 0.23 0.17 0.09 0.19 0.28
Sro848_g210460.1 (Contig2791.g22454)
 0.02 0.41 0.48 0.17 0.29 0.16 0.18 0.33 0.49 0.17 0.11 0.17 0.2 0.23 0.4 0.09 0.16 0.18 0.26 0.17 0.15 1.0 0.49 0.06 0.02 0.06 0.16
0.01 0.89 0.64 1.0 0.83 0.38 0.18 0.43 0.58 0.24 0.27 0.06 0.69 0.14 0.16 0.09 0.6 0.12 0.12 0.55 0.22 0.87 0.3 0.05 0.16 0.05 0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)