Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro101_g051680.1 (Contig348.g4721)
0.14 0.0 0.0 0.01 0.0 0.05 0.04 0.07 0.13 0.21 0.08 1.0 0.04 0.03 0.05 0.05 0.06 0.02 0.03 0.04 0.12 0.07 0.1 0.01 0.0 0.02 0.05
Sro1072_g238130.1 (Contig2124.g17943)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.08 0.02 0.25 0.12 0.03 1.0 0.09 0.0 0.02 0.03 0.04 0.01 0.01 0.08 0.01 0.01 0.04 0.02 0.04 0.03 0.02
Sro1085_g239660.1 (Contig3663.g28278)
0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.07 0.22 0.17 0.2 0.44 0.34 1.0 0.3 0.18 0.23 0.41 0.09 0.12 0.06 0.09 0.55 0.21 0.09 0.04 0.29 0.16 0.17
Sro1098_g241000.1 (Contig3483.g27021)
0.08 0.04 0.09 0.06 0.03 0.03 0.27 0.16 0.31 0.36 0.32 1.0 0.09 0.1 0.15 0.43 0.13 0.04 0.09 0.15 0.44 0.15 0.45 0.12 0.22 0.16 0.17
Sro109_g054470.1 (Contig4753.g35229)
0.0 0.02 0.65 0.04 0.02 0.02 0.08 0.02 0.18 0.17 0.01 1.0 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.18 0.02 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02
Sro114_g056260.1 (Contig1482.g13526)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.07 0.2 0.03 1.0 0.31 0.02 0.02 0.03 0.0 0.01 0.02 0.16 0.69 0.01 0.02 0.02 0.11 0.07 0.02
Sro114_g056270.1 (Contig1482.g13527)
0.01 0.02 0.05 0.04 0.02 0.03 0.37 0.16 0.41 0.24 0.11 1.0 0.29 0.03 0.13 0.2 0.11 0.14 0.12 0.38 0.24 0.02 0.11 0.5 0.49 0.34 0.07
Sro1294_g260170.1 (Contig1650.g14868)
0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.14 0.05 0.15 0.12 0.03 1.0 0.05 0.0 0.03 0.06 0.02 0.01 0.01 0.03 0.04 0.02 0.08 0.09 0.11 0.09 0.04
Sro1309_g261520.1 (Contig3914.g29995)
0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 1.0 0.17 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.28 0.65 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Sro1309_g261560.1 (Contig3914.g29999)
0.04 0.05 0.0 0.05 0.0 0.03 0.25 0.33 0.04 0.58 0.22 0.85 0.12 0.1 0.11 0.08 0.13 0.04 0.14 0.08 0.97 0.25 0.01 1.0 0.07 0.24 0.15
Sro134_g063510.1 (Contig145.g1613)
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.08 0.03 0.1 0.16 0.03 1.0 0.03 0.01 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.04 0.06 0.03 0.05 0.04 0.03 0.04 0.05
Sro143_g066520.1 (Contig3754.g28758)
0.06 0.1 0.42 1.0 0.35 0.09 0.1 0.12 0.21 0.25 0.06 0.98 0.02 0.01 0.03 0.01 0.04 0.01 0.11 0.06 0.44 0.06 0.11 0.17 0.5 0.24 0.04
Sro1484_g276430.1 (Contig1775.g15699)
0.2 0.02 0.02 0.06 0.03 0.12 0.1 0.14 0.07 0.34 0.15 1.0 0.12 0.06 0.09 0.16 0.11 0.07 0.04 0.75 0.14 0.03 0.05 0.05 0.03 0.05 0.11
Sro1563_g282720.1 (Contig1017.g10182)
1.0 0.04 0.17 0.07 0.18 0.0 0.02 0.34 0.02 0.2 0.06 0.97 0.03 0.0 0.08 0.41 0.03 0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09
Sro158_g071590.1 (Contig163.g1844)
0.07 0.07 0.22 0.26 0.33 0.19 0.22 0.26 0.21 0.34 0.21 1.0 0.32 0.19 0.24 0.26 0.42 0.89 0.41 0.47 0.36 0.13 0.14 0.24 0.54 0.23 0.13
Sro1633_g287390.1 (Contig361.g4865)
0.01 0.18 0.05 0.12 0.1 0.04 0.13 0.1 0.04 0.32 0.52 1.0 0.05 0.54 0.19 0.13 0.4 0.15 0.19 0.15 0.09 0.01 0.03 0.18 0.12 0.2 0.26
Sro1649_g288600.1 (Contig3529.g27270)
0.01 0.11 0.4 0.08 0.1 0.17 0.27 0.27 0.26 0.23 0.2 1.0 0.22 0.13 0.21 0.27 0.35 0.02 0.03 0.12 0.19 0.06 0.25 0.54 0.26 0.16 0.18
Sro1805_g298810.1 (Contig1266.g11825)
0.18 0.16 0.35 0.29 0.26 0.06 0.21 0.21 0.44 0.35 0.13 1.0 0.14 0.34 0.1 0.2 0.11 0.09 0.23 0.2 0.44 0.16 0.22 0.22 0.45 0.1 0.13
Sro183_g079640.1 (Contig3056.g24309)
0.18 0.09 0.33 0.29 0.12 0.21 0.08 0.68 0.47 0.28 0.03 1.0 0.11 0.0 0.06 0.13 0.06 0.01 0.03 0.08 0.18 0.34 0.18 0.09 0.04 0.02 0.1
Sro183_g079650.1 (Contig3056.g24310)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.01 0.13 0.03 1.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.03
Sro1851_g301690.1 (Contig3358.g26296)
0.04 0.02 0.04 0.02 0.01 0.14 0.24 0.19 0.22 0.19 0.16 1.0 0.09 0.02 0.12 0.26 0.16 0.01 0.04 0.11 0.11 0.15 0.33 0.2 0.26 0.07 0.17
Sro190_g081730.1 (Contig3488.g27048)
0.0 0.02 0.1 0.02 0.02 0.03 0.19 0.07 0.07 0.18 0.02 1.0 0.06 0.0 0.09 0.12 0.03 0.07 0.04 0.09 0.07 0.02 0.06 0.36 0.39 0.38 0.07
Sro1925_g305830.1 (Contig1431.g13203)
0.0 0.05 0.07 0.1 0.02 0.03 0.27 0.04 0.05 0.45 0.22 1.0 0.43 0.18 0.32 0.26 0.16 0.35 0.24 0.69 0.98 0.01 0.01 0.37 0.22 0.25 0.19
Sro1948_g307210.1 (Contig1161.g11080)
0.01 0.02 0.07 0.58 0.55 0.13 0.02 0.08 0.03 0.23 0.06 1.0 0.12 0.22 0.07 0.11 0.06 0.25 0.15 0.18 0.37 0.1 0.05 0.05 0.37 0.16 0.09
Sro2146_g316420.1 (Contig984.g9990)
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.1 0.03 0.09 0.14 0.02 1.0 0.04 0.0 0.03 0.04 0.02 0.02 0.02 0.05 0.07 0.02 0.04 0.08 0.23 0.17 0.02
Sro22_g015370.1 (Contig426.g5761)
0.0 0.23 0.34 0.09 0.1 0.1 0.39 0.12 0.39 0.36 0.25 1.0 0.51 0.14 0.19 0.31 0.04 0.3 0.41 0.5 0.52 0.12 0.18 0.42 0.78 0.39 0.25
Sro235_g094690.1 (Contig114.g1304)
0.01 0.08 0.12 0.03 0.03 0.01 0.18 0.13 0.07 0.31 0.11 0.22 0.04 0.11 0.11 0.13 0.04 0.13 0.07 0.07 1.0 0.03 0.06 0.79 0.1 0.07 0.1
Sro24_g016580.1 (Contig40.g268)
0.0 0.11 0.21 0.07 0.11 0.08 0.21 0.04 0.08 0.35 0.23 1.0 0.55 0.28 0.19 0.15 0.26 0.21 0.41 0.72 0.5 0.06 0.05 0.17 0.28 0.27 0.15
Sro255_g100450.1 (Contig2336.g19222)
0.37 0.08 0.03 0.13 0.07 0.09 0.1 0.03 0.0 0.26 0.09 1.0 0.09 0.11 0.1 0.08 0.19 0.02 0.01 0.26 0.17 0.04 0.02 0.12 0.01 0.1 0.13
Sro303_g112480.1 (Contig4655.g34658)
0.08 0.47 0.09 0.15 0.12 0.04 0.09 0.18 0.12 0.32 0.02 0.89 0.07 0.02 0.03 0.02 0.05 0.01 0.04 0.17 1.0 0.08 0.04 0.13 0.37 0.14 0.07
Sro311_g114440.1 (Contig909.g9559)
0.03 0.08 0.1 0.04 0.08 0.1 0.18 0.1 0.06 0.48 0.16 0.76 0.14 0.48 0.19 0.22 0.19 0.04 0.08 0.24 1.0 0.05 0.06 0.2 0.45 0.47 0.29
Sro32_g021070.1 (Contig3715.g28580)
0.01 0.16 0.22 0.09 0.05 0.07 0.27 0.08 0.05 0.27 0.15 1.0 0.08 0.02 0.18 0.14 0.18 0.15 0.1 0.25 0.21 0.07 0.19 0.24 0.33 0.42 0.18
Sro3498_g348650.1 (Contig4541.g33955)
0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.06 0.06 0.02 0.08 0.15 0.04 1.0 0.05 0.01 0.03 0.05 0.05 0.01 0.01 0.06 0.05 0.02 0.04 0.02 0.03 0.03 0.05
Sro409_g137130.1 (Contig1790.g15817)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
Sro409_g137140.1 (Contig1790.g15818)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.01 0.01 0.01 0.13 0.02 1.0 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02
Sro409_g137150.1 (Contig1790.g15819)
0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.12 0.07 0.01 0.07 0.21 0.17 1.0 0.01 0.0 0.31 0.56 0.07 0.04 0.19 0.02 0.32 0.01 0.08 0.06 0.0 0.0 0.29
Sro436_g142550.1 (Contig228.g2743)
0.03 0.23 0.28 0.24 0.17 0.08 0.42 0.13 0.29 0.42 0.23 1.0 0.31 0.36 0.31 0.26 0.19 0.2 0.13 0.3 0.37 0.27 0.24 0.26 0.19 0.11 0.11
Sro436_g142560.1 (Contig228.g2744)
0.01 0.03 0.09 0.02 0.02 0.05 0.12 0.03 0.11 0.13 0.02 1.0 0.02 0.01 0.03 0.05 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.11 0.21 0.12 0.1 0.05
Sro455_g146500.1 (Contig189.g2193)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.04 0.08 0.09 0.08 0.16 0.0 1.0 0.05 0.0 0.03 0.17 0.02 0.0 0.03 0.04 0.11 0.07 0.05 0.07 0.0 0.01 0.02
Sro465_g148580.1 (Contig3955.g30303)
0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.02 0.02 0.1 0.07 0.33 0.12 1.0 0.08 0.14 0.05 0.07 0.11 0.0 0.0 0.05 0.43 0.53 0.05 0.01 0.01 0.31 0.21
Sro468_g149090.1 (Contig3973.g30503)
0.0 0.01 0.09 0.01 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.33 0.01 0.79 0.05 0.04 0.04 0.0 0.04 0.12 0.37 0.12 1.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.44 0.38
Sro46_g027420.1 (Contig1636.g14732)
0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.04 0.05 0.07 0.23 0.09 1.0 0.06 0.15 0.08 0.15 0.05 0.06 0.06 0.08 0.07 0.11 0.34 0.04 0.1 0.1 0.07
Sro478_g151090.1 (Contig272.g3507)
0.01 0.03 0.03 0.0 0.02 0.26 0.11 0.01 0.0 0.18 0.05 1.0 0.0 0.01 0.16 0.29 0.13 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.16 0.12 0.16 0.16
Sro485_g152450.1 (Contig1932.g16645)
0.19 0.19 0.27 0.05 0.16 0.14 0.12 0.12 0.24 0.33 0.27 1.0 0.04 0.08 0.08 0.08 0.18 0.03 0.31 0.09 0.14 0.12 0.29 0.14 0.09 0.21 0.18
Sro60_g034880.1 (Contig797.g8965)
0.0 0.01 0.04 0.01 0.0 0.03 0.19 0.02 0.26 0.14 0.02 1.0 0.04 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.01 0.05 0.07 0.0 0.04 0.03 0.04 0.07 0.02
Sro634_g179010.1 (Contig3030.g24192)
0.02 0.24 0.1 0.08 0.05 0.11 0.13 0.14 0.2 0.3 0.28 1.0 0.22 0.4 0.2 0.31 0.17 0.11 0.09 0.15 0.15 0.15 0.16 0.07 0.07 0.22 0.14
Sro690_g187660.1 (Contig137.g1527)
0.42 0.42 0.63 0.51 0.38 0.14 0.16 0.13 0.32 0.45 0.16 1.0 0.1 0.68 0.15 0.09 0.09 0.07 0.1 0.15 0.67 0.45 0.28 0.15 0.25 0.12 0.23
Sro758_g198030.1 (Contig434.g5855)
0.0 0.41 0.42 0.01 0.02 0.01 0.07 0.02 0.08 0.26 0.01 1.0 0.01 0.05 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.8 0.09 0.06 0.01 0.0 0.03 0.02
Sro770_g199940.1 (Contig300.g3959)
0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.11 0.06 0.28 0.14 0.02 1.0 0.07 0.0 0.02 0.02 0.03 0.01 0.01 0.05 0.03 0.02 0.04 0.02 0.07 0.06 0.02
Sro787_g202310.1 (Contig4626.g34516)
0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.09 0.1 0.08 0.13 0.34 0.24 1.0 0.17 0.32 0.23 0.37 0.3 0.29 0.36 0.41 0.2 0.14 0.16 0.15 0.11 0.3 0.23
Sro808_g205390.1 (Contig630.g7648)
0.04 0.13 0.05 0.05 0.01 0.02 0.35 0.23 0.13 0.44 0.02 1.0 0.02 0.15 0.07 0.01 0.0 0.05 0.19 0.02 0.9 0.01 0.12 0.04 0.0 0.01 0.03
Sro825_g207690.1 (Contig229.g2767)
0.0 0.05 0.49 0.06 0.05 0.02 0.1 0.02 0.16 0.19 0.01 1.0 0.12 0.06 0.01 0.03 0.02 0.01 0.02 0.17 0.3 0.02 0.03 0.07 0.23 0.17 0.02
Sro88_g046580.1 (Contig265.g3316)
0.01 0.12 0.16 0.11 0.09 0.17 0.17 0.09 0.11 0.23 0.13 1.0 0.17 0.12 0.13 0.17 0.1 0.04 0.11 0.19 0.13 0.06 0.09 0.14 0.11 0.17 0.14
Sro899_g217730.1 (Contig130.g1460)
0.01 0.12 0.05 0.75 0.11 0.02 0.11 0.07 0.02 0.24 0.14 1.0 0.1 0.04 0.19 0.32 0.31 0.21 0.1 0.08 0.16 0.03 0.03 0.31 0.2 0.14 0.15
Sro89_g046900.1 (Contig3846.g29611)
0.68 0.14 0.14 0.16 0.09 0.21 0.18 0.16 0.19 0.41 0.37 1.0 0.27 0.12 0.24 0.22 0.42 0.11 0.13 0.42 0.33 0.13 0.21 0.29 0.39 0.27 0.21
Sro916_g219810.1 (Contig1577.g14328)
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.13 0.0 1.0 0.09 0.02 0.01 0.01 0.05 0.05 0.01 0.15 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03
Sro96_g049590.1 (Contig3763.g28885)
0.42 0.09 0.04 0.01 0.04 0.01 0.14 0.14 0.3 0.31 0.06 0.96 0.45 0.03 0.05 0.04 0.04 0.11 0.05 1.0 0.16 0.13 0.16 0.02 0.04 0.02 0.03
Sro980_g227390.1 (Contig982.g9976)
1.0 0.13 0.13 0.09 0.05 0.09 0.1 0.1 0.13 0.28 0.22 0.75 0.19 0.08 0.2 0.29 0.16 0.22 0.2 0.24 0.29 0.16 0.29 0.19 0.13 0.2 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)