Heatmap: Cluster_235 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1082_g239190.1 (Contig1844.g16164)	0.0	0.11	0.07	0.07	0.1	0.08	0.2	0.16	0.02	0.41	0.51	0.49	0.04	0.09	0.54	1.0	0.64	0.4	0.17	0.14	0.48	0.0	0.02	0.25	0.21	0.12	0.54
Sro1101_g241370.1 (Contig3867.g29739)	0.05	0.15	0.1	0.02	0.04	0.05	0.19	0.1	0.06	0.37	0.68	0.43	0.56	0.45	0.65	1.0	0.8	0.32	0.31	0.68	0.34	0.16	0.02	0.58	0.61	0.13	0.71
Sro1116_g242870.1 (Contig365.g4927)	0.01	0.1	0.09	0.07	0.06	0.2	0.33	0.28	0.07	0.34	0.62	0.27	0.05	0.08	0.58	1.0	0.75	0.72	0.27	0.11	0.34	0.0	0.08	0.62	0.34	0.18	0.54
Sro1150_g246670.1 (Contig603.g7504)	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.17	0.25	0.08	0.36	0.48	0.39	0.54	0.07	0.43	1.0	0.25	0.59	0.36	0.6	0.61	0.0	0.03	0.18	0.18	0.13	0.59
Sro1226_g254180.1 (Contig1389.g12809)	0.11	0.38	0.27	0.34	0.33	0.36	0.77	0.57	0.48	0.74	0.8	0.79	0.86	0.53	0.76	1.0	0.65	0.74	0.85	0.84	0.76	0.42	0.45	0.89	0.69	0.36	0.88
Sro1357_g265790.1 (Contig2181.g18203)	0.02	0.15	0.14	0.11	0.1	0.09	0.57	0.31	0.11	0.42	0.75	0.34	0.45	0.28	0.49	0.73	0.46	0.46	0.58	0.49	0.4	0.43	0.12	1.0	0.87	0.5	0.88
Sro137_g064470.1 (Contig3969.g30462)	0.03	0.16	0.06	0.04	0.02	0.08	0.41	0.15	0.07	0.49	0.62	0.3	0.37	0.21	0.76	0.84	0.42	0.26	0.37	1.0	0.65	0.12	0.07	0.76	0.55	0.43	0.63
Sro13_g009930.1 (Contig337.g4534)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.23	0.14	0.12	0.02	0.0	0.34	1.0	0.09	0.49	0.29	0.2	0.21	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.52
Sro1425_g271630.1 (Contig1471.g13491)	0.01	0.12	0.06	0.07	0.06	0.13	0.22	0.21	0.04	0.39	0.55	0.27	0.21	0.43	0.65	1.0	0.52	0.75	0.65	0.4	0.34	0.14	0.06	0.38	0.31	0.23	0.54
Sro149_g068430.1 (Contig259.g3211)	0.0	0.13	0.1	0.07	0.05	0.04	0.54	0.42	0.07	0.46	0.54	0.38	0.16	0.15	0.57	1.0	0.5	0.5	0.38	0.44	0.7	0.01	0.11	0.69	0.95	0.59	0.69
Sro1535_g280550.1 (Contig3021.g24092)	0.01	0.75	0.47	0.62	0.44	0.59	0.71	0.71	0.24	0.83	0.85	0.79	0.78	0.4	0.74	0.99	0.6	1.0	0.76	0.74	0.56	0.11	0.2	0.72	0.95	0.59	1.0
Sro1537_g280710.1 (Contig3053.g24295)	0.0	0.07	0.1	0.06	0.06	0.23	0.16	0.12	0.02	0.42	0.56	0.4	0.05	0.17	0.5	1.0	0.83	0.57	0.42	0.15	0.34	0.02	0.02	0.24	0.19	0.11	0.63
Sro1604_g285340.1 (Contig23.g161)	0.0	0.11	0.1	0.02	0.05	0.03	0.39	0.15	0.09	0.3	0.47	0.18	0.21	0.11	0.43	0.5	0.35	0.15	0.4	0.44	0.46	0.13	0.11	0.5	1.0	0.41	0.49
Sro1673_g290200.1 (Contig3669.g28349)	0.02	0.22	0.16	0.13	0.1	0.38	0.61	0.45	0.18	0.78	0.73	0.88	0.42	0.74	0.7	0.89	0.59	0.59	0.56	0.68	1.0	0.29	0.23	0.92	0.78	0.47	0.93
Sro179_g078530.1 (Contig4117.g31445)	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.56	0.38	0.66	0.19	0.63	0.7	0.54	0.41	0.39	0.74	1.0	0.4	0.56	0.62	0.39	0.61	0.15	0.08	0.41	0.27	0.56	0.97
Sro198_g084140.1 (Contig2317.g19134)	0.0	0.21	0.17	0.15	0.07	0.13	0.6	0.25	0.13	0.46	0.59	0.45	0.55	0.37	0.53	0.74	0.46	0.4	0.75	0.67	0.52	0.29	0.12	1.0	0.65	0.37	0.82
Sro2071_g313410.1 (Contig4578.g34175)	0.0	0.09	0.03	0.15	0.04	0.29	0.33	0.35	0.16	0.58	0.67	0.59	0.72	0.28	0.5	0.44	0.18	0.54	0.58	1.0	0.73	0.13	0.12	0.31	0.57	0.34	0.47
Sro2147_g316490.1 (Contig4426.g33224)	0.12	0.03	0.03	0.03	0.05	0.24	0.41	0.33	0.03	0.55	0.89	0.44	0.12	0.38	0.86	0.93	0.28	0.38	0.43	0.27	0.28	0.07	0.02	0.49	0.41	0.27	1.0
Sro2169_g317370.1 (Contig3131.g24848)	0.01	0.23	0.16	0.29	0.15	0.38	0.26	0.44	0.13	0.47	0.69	0.55	0.86	0.2	0.69	0.76	0.5	1.0	0.56	0.62	0.4	0.03	0.03	0.41	0.58	0.46	0.54
Sro2396_g325990.1 (Contig3316.g26024)	0.01	0.37	0.17	0.15	0.12	0.14	0.39	0.18	0.07	0.31	0.32	0.27	0.35	0.3	0.28	0.67	0.18	0.44	0.34	0.33	0.3	0.07	0.08	0.57	1.0	0.38	0.43
Sro2447_g328020.1 (Contig3072.g24494)	0.01	0.07	0.04	0.07	0.09	0.29	0.3	0.35	0.09	0.52	0.51	0.62	0.09	0.33	0.66	1.0	0.52	0.81	0.41	0.45	0.64	0.02	0.07	0.48	0.49	0.34	0.55
Sro2507_g329710.1 (Contig3389.g26499)	0.02	0.05	0.05	0.01	0.04	0.13	0.37	0.1	0.03	0.42	0.7	0.45	0.01	0.21	0.54	0.73	0.38	0.1	0.25	0.06	0.63	0.01	0.04	0.67	1.0	0.46	0.66
Sro2520_g330140.1 (Contig2879.g23000)	0.0	0.04	0.03	0.06	0.09	0.16	0.21	0.37	0.1	0.33	0.38	0.14	0.04	0.11	0.48	1.0	0.34	0.35	0.11	0.04	0.25	0.0	0.03	0.08	0.14	0.07	0.62
Sro2540_g330640.1 (Contig4048.g31076)	0.0	0.07	0.14	0.19	0.08	0.3	0.47	0.3	0.18	0.79	0.72	0.99	0.65	0.52	0.72	0.7	0.42	0.54	0.55	0.91	0.9	0.19	0.07	0.77	1.0	0.83	0.73
Sro26_g017440.1 (Contig2432.g19915)	0.01	0.11	0.11	0.02	0.02	0.09	0.25	0.23	0.1	0.28	0.28	0.11	0.11	0.04	0.32	0.42	0.17	0.5	0.14	0.15	0.2	0.01	0.05	0.93	1.0	0.71	0.59
Sro284_g107980.1 (Contig177.g2085)	0.01	0.35	0.39	0.31	0.09	0.06	0.3	0.24	0.02	0.56	0.82	0.49	0.12	0.02	0.68	1.0	0.35	0.48	0.48	0.42	0.8	0.01	0.01	0.48	0.5	0.39	0.81
Sro2977_g341400.2	0.03	0.2	0.16	0.07	0.15	0.09	0.16	0.18	0.05	0.29	0.4	0.33	0.04	0.2	0.47	1.0	0.12	0.03	0.31	0.13	0.29	0.07	0.03	0.46	0.31	0.15	0.55
Sro3092_g343570.1 (Contig3157.g25019)	0.01	0.47	0.34	0.32	0.22	0.23	0.7	0.38	0.24	0.6	0.61	0.62	0.61	0.37	0.41	0.61	0.44	0.47	0.53	0.6	0.66	0.16	0.19	0.99	1.0	0.34	0.87
Sro311_g114400.1 (Contig909.g9555)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.18	0.15	0.06	0.25	0.31	0.21	0.1	0.02	0.42	1.0	0.27	0.34	0.08	0.09	0.28	0.03	0.04	0.13	0.13	0.07	0.36
Sro339_g120970.1 (Contig3791.g29103)	0.01	0.62	0.4	0.18	0.12	0.23	0.35	0.2	0.03	0.57	0.56	0.4	0.08	0.47	0.48	1.0	0.99	0.97	0.86	0.28	0.75	0.03	0.04	0.63	0.83	0.42	0.64
Sro3433_g347990.1 (Contig2998.g23833)	0.0	0.31	0.06	0.04	0.07	0.16	0.53	0.37	0.12	0.41	0.34	0.39	0.08	0.32	0.3	0.44	0.34	0.5	0.9	0.2	0.32	0.19	0.1	0.85	1.0	0.37	0.7
Sro438_g143030.1 (Contig4247.g32173)	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.03	0.01	0.26	0.25	0.16	0.12	0.01	0.54	1.0	0.18	0.55	0.23	0.25	0.33	0.0	0.01	0.19	0.26	0.11	0.6
Sro477_g150810.1 (Contig553.g7060)	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.49	0.22	0.02	0.59	0.55	0.52	0.16	0.46	0.8	0.9	0.47	1.0	0.45	0.4	0.64	0.06	0.04	0.7	0.72	0.34	0.72
Sro487_g152780.1 (Contig367.g4954)	0.01	0.14	0.06	0.05	0.03	0.7	0.45	0.34	0.04	0.58	0.49	0.58	0.07	0.62	0.76	0.85	0.66	0.54	0.51	0.27	0.65	0.17	0.07	1.0	0.87	0.73	0.82
Sro537_g162320.1 (Contig1194.g11284)	0.0	0.01	0.03	0.01	0.02	0.3	0.58	0.2	0.1	0.51	0.66	0.51	0.62	0.26	0.66	1.0	0.42	0.52	0.53	0.78	0.59	0.01	0.04	0.61	0.33	0.26	0.93
Sro53_g031590.1 (Contig1592.g14499)	0.02	0.35	0.26	0.25	0.28	0.23	0.35	0.46	0.12	0.61	0.5	0.61	0.15	0.37	0.65	0.53	0.41	0.53	0.4	0.47	1.0	0.02	0.13	0.57	0.79	0.46	0.89
Sro548_g164360.1 (Contig1714.g15316)	0.02	0.36	0.24	0.37	0.15	0.4	0.39	0.47	0.21	0.49	0.73	0.42	0.54	0.32	0.71	1.0	0.48	0.77	0.54	0.41	0.55	0.03	0.09	0.76	0.62	0.31	0.9
Sro56_g033030.1 (Contig3029.g24179)	0.06	0.3	0.31	0.19	0.16	0.4	0.64	0.35	0.23	0.64	0.91	0.66	0.93	0.28	0.64	0.86	0.47	0.42	0.59	0.91	0.65	0.32	0.22	0.95	0.92	0.4	1.0
Sro58_g033670.1 (Contig64.g561)	0.01	0.1	0.07	0.05	0.06	0.15	0.56	0.27	0.07	0.55	0.45	0.61	0.11	0.42	0.59	1.0	0.32	0.71	0.49	0.37	0.69	0.16	0.1	0.81	0.91	0.64	0.63
Sro61_g035100.1 (Contig3112.g24763)	0.02	0.06	0.04	0.04	0.03	0.27	0.37	0.35	0.09	0.4	0.44	0.31	0.2	0.32	0.53	0.5	0.41	1.0	0.59	0.35	0.46	0.01	0.1	0.67	0.57	0.36	0.52
Sro648_g181050.1 (Contig423.g5676)	0.01	0.17	0.13	0.15	0.18	0.16	0.32	0.29	0.08	0.5	0.58	0.6	0.06	0.31	0.51	1.0	0.74	0.46	0.49	0.27	0.44	0.04	0.08	0.49	0.45	0.26	0.59
Sro651_g181490.1 (Contig2568.g20853)	0.01	0.18	0.21	0.27	0.2	0.06	0.43	0.26	0.06	0.51	0.41	0.57	0.12	0.26	0.5	0.8	0.28	0.4	0.21	0.27	0.61	0.01	0.03	0.69	1.0	0.46	0.53
Sro674_g185420.1 (Contig3274.g25778)	0.0	0.07	0.07	0.09	0.05	0.26	0.59	0.28	0.14	0.56	0.58	0.55	0.42	0.59	0.59	1.0	0.4	0.69	0.56	0.58	0.79	0.05	0.14	0.76	0.86	0.54	0.89
Sro70_g038860.1 (Contig3352.g26233)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.49	0.13	0.06	0.31	0.22	0.22	0.95	0.23	0.26	0.38	0.03	0.59	0.58	1.0	0.31	0.03	0.03	0.78	0.91	0.4	0.56
Sro713_g191580.1 (Contig2997.g23825)	0.0	0.01	0.02	0.02	0.0	0.01	0.55	0.28	0.04	0.57	0.5	0.65	0.49	0.04	0.98	0.5	0.08	0.89	0.34	0.83	1.0	0.02	0.03	0.68	0.82	0.73	0.69
Sro722_g192880.1 (Contig2490.g20408)	0.02	0.06	0.04	0.03	0.03	0.0	0.45	0.45	0.05	0.41	0.55	0.34	0.06	0.17	0.87	0.77	0.22	0.39	0.07	0.15	1.0	0.0	0.04	0.51	0.99	0.68	0.63
Sro735_g194940.1 (Contig2764.g22266)	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.12	0.48	0.48	0.02	0.34	0.39	0.23	0.03	0.06	0.58	0.68	0.23	0.18	0.13	0.1	0.59	0.06	0.03	0.45	1.0	0.57	0.47
Sro74_g040970.1 (Contig4700.g34959)	0.03	0.04	0.04	0.02	0.04	0.08	0.43	0.32	0.14	0.48	0.79	0.26	0.45	0.19	0.94	0.91	0.69	0.41	0.16	0.34	0.65	0.32	0.08	0.42	0.77	0.52	1.0
Sro794_g203370.1 (Contig1634.g14706)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.22	0.47	0.35	0.16	0.34	0.78	0.25	0.01	0.07	0.68	0.72	0.49	0.15	0.17	0.02	0.38	0.0	0.24	0.62	1.0	0.43	0.97
Sro855_g211460.1 (Contig1132.g10860)	0.01	0.06	0.04	0.04	0.01	0.05	0.15	0.13	0.09	0.27	0.27	0.33	0.13	0.17	0.26	0.57	0.11	0.21	0.18	0.14	0.3	0.03	0.03	0.35	1.0	0.45	0.32
Sro869_g213460.1 (Contig2492.g20422)	0.0	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.65	0.41	0.08	0.51	0.7	0.21	0.66	0.02	0.68	0.77	0.31	0.72	0.5	0.99	0.52	0.0	0.05	1.0	0.79	0.47	1.0
Sro88_g046720.1 (Contig265.g3330)	0.0	0.18	0.05	0.12	0.13	0.23	0.43	0.39	0.1	0.5	0.81	0.46	0.16	0.19	0.65	1.0	0.68	0.73	0.69	0.4	0.51	0.12	0.2	0.88	0.48	0.32	0.77
Sro906_g218690.1 (Contig1704.g15268)	0.0	0.06	0.12	0.4	0.27	0.07	0.3	0.14	0.03	0.35	0.29	0.24	0.57	0.25	0.32	0.43	0.19	0.65	0.72	1.0	0.35	0.01	0.02	0.37	0.3	0.24	0.5
Sro93_g048750.1 (Contig3841.g29563)	0.01	0.22	0.12	0.16	0.2	0.28	0.5	0.5	0.17	0.59	0.77	0.54	0.18	0.36	0.69	0.99	0.66	0.6	0.59	0.51	0.7	0.04	0.14	0.76	1.0	0.6	0.63
Sro974_g226720.1 (Contig3714.g28528)	0.0	0.05	0.08	0.08	0.04	0.08	0.54	0.35	0.15	0.59	0.68	0.67	0.67	0.35	0.8	1.0	0.5	0.51	0.48	0.69	0.79	0.15	0.1	0.67	0.81	0.62	0.86
Sro980_g227350.1 (Contig982.g9972)	0.06	0.2	0.15	0.14	0.09	0.64	0.36	0.3	0.13	0.75	0.94	0.85	0.75	0.68	0.7	0.81	0.46	0.76	0.9	0.4	0.58	0.09	0.1	0.31	0.12	0.43	1.0
Sro987_g228190.1 (Contig1137.g10926)	0.0	0.54	0.38	0.4	0.29	0.11	0.7	0.38	0.18	0.41	0.55	0.39	0.32	0.33	0.35	0.47	0.43	0.29	0.35	0.41	0.44	0.09	0.18	0.81	1.0	0.23	0.78

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)