Heatmap: Cluster_313 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
112-1,-N,48h
112-1,-N,72h
112-1,-P,48h
112-1,-P,72h
112-1,Control,48h
112-1,Control,72h
84A,MT-,F/2,18C
84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C
84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C
85A,MT+
85A,MT+,-Si,24h
85A,MT+,100nM diproline
85A,MT+,1mM H2O2
85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH
85A,MT+,ASW,F/2,72h
85A,MT+,Cold,4C
85A,MT+,Heat,30C
85A,MT+,High light,30m
85A,MT+,High light,6h
85A,MT+,High salt
85A,MT+,Low salt
85B,MT-
85B,MT-,+SIP
PONTON36/34,Crossed strains,11h
PONTON36/34,Crossed strains,14h
PONTON36/34,Crossed strains,21h
PONTON36/34,Separate strains
Sro1037_g234160.1 (Contig2347.g19305)
0.02 0.2 0.21 0.1 0.14 0.07 0.49 0.26 0.43 0.6 0.32 0.65 0.77 0.57 0.41 0.56 0.23 0.32 0.7 1.0 0.93 0.8 0.42 0.27 0.45 0.39 0.35
Sro1144_g246050.1 (Contig3141.g24934)
0.02 0.07 0.05 0.03 0.03 0.09 0.3 0.21 0.25 0.58 0.33 0.69 0.41 0.6 0.4 0.38 0.4 0.23 0.26 0.45 1.0 0.36 0.26 0.15 0.21 0.14 0.36
Sro118_g057780.1 (Contig2714.g21848)
0.03 0.08 0.06 0.06 0.04 0.27 0.62 0.59 0.4 0.62 0.84 0.61 0.84 0.71 0.74 0.86 0.43 0.77 0.8 1.0 0.84 0.61 0.32 0.51 0.39 0.35 0.63
Sro1204_g252170.1 (Contig1757.g15592)
0.01 0.13 0.06 0.09 0.11 0.23 0.57 0.33 0.33 0.66 0.7 0.82 0.68 0.67 0.61 0.81 0.51 0.23 0.4 0.75 1.0 0.59 0.24 0.51 0.72 0.59 0.58
Sro134_g063440.1 (Contig145.g1606)
0.01 0.18 0.22 0.19 0.18 0.19 0.37 0.26 0.32 0.53 0.33 0.66 0.66 0.49 0.36 0.47 0.35 0.29 0.34 0.77 1.0 0.28 0.26 0.18 0.35 0.27 0.24
Sro1355_g265490.1 (Contig1703.g15246)
0.05 0.14 0.11 0.08 0.17 0.09 0.29 0.11 0.2 0.5 0.38 0.55 0.93 0.66 0.35 0.38 0.29 0.44 0.31 1.0 0.63 0.32 0.17 0.25 0.39 0.29 0.21
0.01 0.05 0.11 0.17 0.13 0.22 0.39 0.19 0.38 0.63 0.53 0.73 1.0 0.81 0.52 0.57 0.5 0.4 0.48 1.0 0.88 0.32 0.31 0.29 0.45 0.42 0.34
Sro1473_g275620.1 (Contig4548.g33993)
0.06 0.05 0.14 0.08 0.07 0.11 0.3 0.21 0.19 0.58 0.42 0.72 0.88 0.75 0.45 0.58 0.48 0.5 0.43 1.0 0.74 0.61 0.22 0.3 0.67 0.5 0.38
Sro157_g071290.1 (Contig2362.g19419)
0.01 0.21 0.13 0.11 0.15 0.55 0.42 0.25 0.1 0.63 0.68 0.64 0.92 0.52 0.62 0.76 0.58 0.47 0.67 0.95 0.86 0.63 0.19 0.51 1.0 0.58 0.48
Sro1706_g292540.1 (Contig3328.g26160)
0.01 0.14 0.08 0.04 0.05 0.03 0.12 0.09 0.07 0.43 0.1 0.58 0.91 0.61 0.3 0.63 0.26 0.19 0.48 1.0 0.61 0.28 0.16 0.1 0.16 0.12 0.17
Sro1732_g294150.1 (Contig1542.g13999)
0.01 0.27 0.29 0.2 0.14 0.2 0.25 0.18 0.12 0.54 0.43 0.67 0.64 0.61 0.33 0.47 0.36 0.4 0.63 1.0 0.67 0.55 0.21 0.16 0.17 0.24 0.34
Sro173_g076140.1 (Contig2926.g23295)
0.18 0.21 0.24 0.22 0.12 0.31 0.49 0.46 0.45 0.65 0.65 0.69 0.78 0.69 0.57 0.77 0.63 0.53 0.7 1.0 0.79 0.58 0.47 0.49 0.57 0.5 0.46
Sro174_g076510.1 (Contig4298.g32435)
0.0 0.04 0.04 0.05 0.04 0.19 0.39 0.15 0.25 0.7 0.57 0.96 1.0 0.83 0.58 0.84 0.55 0.37 0.52 1.0 0.99 0.46 0.22 0.39 0.63 0.63 0.47
Sro180_g078850.1 (Contig350.g4764)
0.03 0.31 0.31 0.13 0.14 0.24 0.59 0.38 0.41 0.62 0.58 0.84 1.0 0.67 0.56 0.71 0.49 0.54 0.69 0.99 0.88 0.76 0.41 0.51 0.31 0.35 0.49
Sro1850_g301570.1 (Contig4526.g33898)
0.01 0.05 0.09 0.07 0.09 0.24 0.49 0.3 0.19 0.79 0.44 0.83 0.98 1.0 0.67 0.62 0.32 0.56 0.51 1.0 0.97 0.48 0.21 0.4 0.57 0.48 0.43
Sro1891_g303780.1 (Contig3442.g26775)
0.09 0.1 0.08 0.07 0.09 0.21 0.31 0.19 0.22 0.61 0.37 0.93 0.8 0.59 0.41 0.61 0.18 0.34 0.4 0.73 1.0 0.63 0.17 0.26 0.32 0.27 0.29
Sro1948_g307220.1 (Contig1161.g11081)
0.0 0.23 0.21 0.14 0.14 0.11 0.3 0.16 0.15 0.49 0.27 0.65 1.0 0.46 0.37 0.27 0.29 0.35 0.52 0.97 0.7 0.47 0.22 0.32 0.4 0.34 0.3
Sro2117_g315250.1 (Contig3258.g25695)
0.01 0.12 0.09 0.07 0.06 0.15 0.22 0.13 0.17 0.54 0.31 0.66 0.56 0.82 0.37 0.62 0.46 0.29 0.58 1.0 0.79 0.4 0.15 0.11 0.2 0.29 0.29
Sro2130_g315830.1 (Contig1536.g13943)
0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.25 0.42 0.19 0.2 0.54 0.44 0.74 0.83 0.57 0.41 0.33 0.72 0.34 0.35 0.82 1.0 0.29 0.32 0.24 0.43 0.3 0.29
Sro216_g089300.1 (Contig227.g2707)
0.2 0.12 0.24 0.11 0.1 0.14 0.34 0.28 0.35 0.56 0.38 0.76 0.7 0.69 0.38 0.38 0.3 0.33 0.43 1.0 0.84 0.61 0.38 0.31 0.33 0.28 0.29
Sro220_g090680.1 (Contig3599.g27830)
0.02 0.2 0.13 0.19 0.18 0.14 0.39 0.18 0.45 0.48 0.28 0.66 0.85 0.64 0.42 0.67 0.31 0.4 0.56 1.0 0.74 0.63 0.34 0.27 0.6 0.47 0.31
Sro225_g091760.1 (Contig1661.g14974)
0.0 0.09 0.11 0.09 0.13 0.44 0.47 0.21 0.18 0.68 0.51 0.84 0.81 0.65 0.6 1.0 0.68 0.39 0.6 0.99 0.9 0.9 0.25 0.37 0.66 0.43 0.44
Sro2276_g321660.1 (Contig3282.g25810)
0.01 0.03 0.14 0.09 0.07 0.08 0.25 0.1 0.15 0.56 0.35 0.66 0.76 0.83 0.5 0.74 0.42 0.46 0.5 1.0 0.77 0.46 0.11 0.25 0.49 0.42 0.4
Sro236_g094940.1 (Contig1410.g12932)
0.07 0.09 0.11 0.15 0.12 0.11 0.32 0.13 0.17 0.48 0.41 0.63 0.7 0.36 0.33 0.25 0.45 0.3 0.47 1.0 0.67 0.25 0.24 0.4 0.42 0.26 0.26
Sro23_g015810.1 (Contig2259.g18731)
0.02 0.1 0.14 0.15 0.05 0.34 0.33 0.27 0.17 0.65 0.57 0.7 0.98 0.75 0.55 1.0 0.66 0.4 0.73 0.97 0.83 0.45 0.22 0.28 0.26 0.5 0.49
Sro244_g097180.1 (Contig2788.g22434)
0.02 0.12 0.14 0.06 0.06 0.17 0.22 0.08 0.19 0.53 0.38 0.74 0.73 0.43 0.36 0.34 0.23 0.29 0.48 1.0 0.73 0.32 0.13 0.17 0.37 0.21 0.26
Sro253_g099970.1 (Contig3900.g29915)
0.02 0.02 0.01 0.02 0.0 0.09 0.22 0.12 0.08 0.59 0.3 0.79 0.82 1.0 0.41 0.53 0.43 0.53 0.4 0.96 0.85 0.3 0.13 0.34 0.51 0.31 0.18
Sro278_g106600.1 (Contig1952.g16775)
0.23 0.05 0.08 0.05 0.05 0.14 0.28 0.2 0.33 0.6 0.38 1.0 0.44 0.61 0.43 0.42 0.44 0.12 0.3 0.41 0.86 0.7 0.18 0.29 0.27 0.36 0.29
Sro288_g108880.1 (Contig62.g508)
0.01 0.21 0.17 0.2 0.18 0.09 0.28 0.18 0.22 0.51 0.35 0.6 1.0 0.59 0.33 0.4 0.35 0.4 0.46 0.99 0.59 0.34 0.2 0.27 0.51 0.4 0.32
Sro325_g117900.1 (Contig3568.g27579)
0.04 0.14 0.23 0.16 0.16 0.11 0.44 0.24 0.41 0.68 0.43 0.84 0.86 0.68 0.47 0.56 0.4 0.63 0.66 1.0 0.95 0.57 0.37 0.36 0.65 0.58 0.37
Sro338_g120910.1 (Contig15.g128)
0.04 0.11 0.07 0.04 0.04 0.34 0.65 0.44 0.37 0.63 0.55 0.65 0.6 0.71 0.76 0.72 0.34 0.8 0.43 1.0 0.96 0.36 0.35 0.39 0.25 0.21 0.53
Sro381_g130850.1 (Contig161.g1818)
0.02 0.24 0.27 0.16 0.16 0.19 0.43 0.33 0.39 0.49 0.5 0.57 0.95 0.41 0.39 0.44 0.41 0.57 0.55 1.0 0.62 0.51 0.35 0.31 0.25 0.21 0.41
Sro381_g130910.1 (Contig161.g1824)
0.02 0.09 0.09 0.13 0.13 0.19 0.34 0.21 0.24 0.62 0.38 0.81 0.91 0.82 0.53 0.59 0.5 0.39 0.47 1.0 0.89 0.53 0.28 0.38 0.72 0.43 0.43
Sro436_g142650.1 (Contig228.g2753)
0.01 0.23 0.28 0.26 0.23 0.21 0.47 0.35 0.4 0.65 0.57 0.74 0.69 0.71 0.56 0.83 0.67 0.47 0.61 0.92 1.0 0.72 0.32 0.41 0.93 0.59 0.56
Sro43_g026400.1 (Contig2453.g20106)
0.01 0.15 0.1 0.11 0.14 0.09 0.39 0.17 0.2 0.65 0.27 0.82 0.81 0.83 0.37 0.39 0.52 0.19 0.37 1.0 0.99 0.75 0.19 0.35 0.59 0.46 0.21
Sro443_g144060.1 (Contig715.g8252)
0.02 0.05 0.09 0.03 0.08 0.03 0.08 0.1 0.23 0.41 0.11 0.4 0.96 0.54 0.2 0.28 0.17 0.2 0.49 1.0 0.67 0.18 0.14 0.07 0.23 0.19 0.11
Sro445_g144600.1 (Contig1488.g13615)
0.03 0.07 0.11 0.12 0.07 0.16 0.33 0.2 0.28 0.45 0.4 0.49 1.0 0.4 0.37 0.42 0.36 0.26 0.41 0.85 0.56 0.26 0.23 0.2 0.46 0.48 0.38
Sro461_g147690.1 (Contig3552.g27423)
0.05 0.11 0.08 0.07 0.08 0.09 0.33 0.24 0.31 0.6 0.4 0.67 0.91 0.71 0.39 0.41 0.35 0.29 0.44 1.0 0.82 0.83 0.29 0.28 0.67 0.41 0.31
Sro464_g148490.1 (Contig363.g4897)
0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.35 0.27 0.07 0.05 0.58 0.38 0.55 0.25 0.43 0.54 0.47 0.14 0.28 0.35 0.75 1.0 0.38 0.08 0.11 0.08 0.23 0.26
Sro488_g153070.1 (Contig4435.g33274)
0.01 0.02 0.03 0.06 0.05 0.24 0.34 0.14 0.17 0.64 0.33 0.72 0.94 0.89 0.46 0.55 0.17 0.46 0.42 0.99 1.0 0.46 0.18 0.26 0.62 0.37 0.27
Sro4_g003010.1 (Contig3815.g29219)
0.0 0.04 0.02 0.03 0.03 0.14 0.22 0.14 0.08 0.42 0.21 0.45 0.69 0.57 0.27 0.34 0.21 0.23 0.33 1.0 0.66 0.57 0.13 0.33 0.59 0.32 0.23
Sro508_g156910.1 (Contig2824.g22646)
0.13 0.02 0.01 0.01 0.01 0.16 0.31 0.28 0.25 0.62 0.4 1.0 0.76 0.53 0.37 0.3 0.35 0.18 0.29 0.82 0.89 0.7 0.24 0.25 0.25 0.22 0.22
Sro560_g166720.1 (Contig2779.g22387)
0.02 0.13 0.13 0.18 0.16 0.23 0.37 0.22 0.28 0.59 0.4 0.72 0.8 0.95 0.45 0.64 0.36 0.26 0.34 0.85 1.0 0.84 0.35 0.34 0.63 0.49 0.33
Sro562_g167050.1 (Contig149.g1657)
0.04 0.17 0.27 0.23 0.21 0.14 0.45 0.31 0.33 0.65 0.43 1.0 0.72 0.73 0.46 0.55 0.35 0.36 0.38 0.91 0.63 0.58 0.31 0.37 0.71 0.48 0.39
Sro583_g170710.1 (Contig323.g4302)
0.02 0.19 0.17 0.14 0.16 0.22 0.33 0.23 0.24 0.57 0.3 0.65 0.85 0.56 0.4 0.52 0.39 0.3 0.4 1.0 0.71 0.38 0.29 0.14 0.21 0.16 0.27
Sro59_g034400.1 (Contig571.g7286)
0.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.02 0.2 0.04 0.04 0.34 0.09 0.37 0.48 0.7 0.16 0.11 0.21 0.11 0.27 1.0 0.67 0.25 0.08 0.14 0.31 0.28 0.16
Sro616_g175890.1 (Contig2621.g21281)
0.0 0.01 0.03 0.04 0.04 0.22 0.21 0.17 0.08 0.56 0.46 0.68 0.65 0.97 0.49 1.0 0.37 0.43 0.46 0.94 0.85 0.53 0.17 0.19 0.21 0.2 0.31
Sro65_g036750.1 (Contig155.g1745)
0.01 0.09 0.35 0.05 0.05 0.06 0.16 0.08 0.15 0.42 0.38 0.47 1.0 0.29 0.27 0.34 0.35 0.18 0.38 0.96 0.49 0.25 0.21 0.21 0.22 0.24 0.28
Sro691_g187750.1 (Contig1133.g10870)
0.04 0.06 0.05 0.02 0.06 0.16 0.4 0.19 0.25 0.66 0.34 0.81 0.69 1.0 0.41 0.38 0.33 0.35 0.48 0.97 0.99 0.56 0.28 0.33 0.78 0.45 0.33
Sro730_g193970.1 (Contig80.g829)
0.02 0.19 0.12 0.13 0.16 0.17 0.41 0.43 0.25 0.61 0.53 0.69 0.64 0.76 0.55 0.85 0.42 0.21 0.46 0.78 1.0 0.58 0.23 0.31 0.62 0.35 0.42
Sro813_g206150.1 (Contig4011.g30861)
0.05 0.11 0.08 0.09 0.14 0.17 0.37 0.23 0.31 0.5 0.31 0.64 1.0 0.41 0.33 0.52 0.25 0.27 0.27 0.91 0.47 0.37 0.32 0.12 0.22 0.09 0.21
Sro829_g208140.1 (Contig1016.g10173)
0.04 0.2 0.23 0.28 0.28 0.32 0.44 0.29 0.34 0.69 0.47 0.74 0.92 0.7 0.5 0.6 0.46 0.54 0.59 0.94 1.0 0.37 0.35 0.41 0.67 0.44 0.39
Sro83_g044580.1 (Contig4450.g33432)
0.03 0.18 0.09 0.09 0.1 0.26 0.38 0.25 0.21 0.63 0.53 0.67 0.79 0.82 0.57 0.64 0.44 0.74 0.7 1.0 0.91 0.59 0.24 0.32 0.29 0.33 0.46
Sro84_g045090.1 (Contig220.g2642)
0.03 0.13 0.09 0.09 0.05 0.16 0.25 0.16 0.17 0.44 0.36 0.51 1.0 0.42 0.3 0.25 0.27 0.45 0.66 0.9 0.74 0.37 0.14 0.27 0.29 0.31 0.35
Sro90_g047200.1 (Contig124.g1382)
0.06 0.11 0.11 0.15 0.08 0.07 0.19 0.13 0.22 0.42 0.29 0.48 0.87 0.45 0.22 0.3 0.27 0.32 0.44 1.0 0.61 0.47 0.22 0.17 0.34 0.28 0.23
Sro922_g220480.1 (Contig2958.g23491)
0.0 0.12 0.06 0.02 0.09 0.08 0.27 0.08 0.08 0.47 0.24 0.58 0.68 0.56 0.29 0.43 0.22 0.18 0.44 1.0 0.66 0.23 0.07 0.2 0.53 0.44 0.36
Sro946_g223310.1 (Contig2147.g18091)
0.02 0.11 0.09 0.1 0.09 0.27 0.52 0.19 0.29 0.67 0.46 1.0 0.84 0.76 0.6 0.66 0.53 0.31 0.38 0.99 0.82 0.75 0.25 0.4 0.45 0.27 0.35
Sro972_g226540.1 (Contig330.g4383)
0.02 0.21 0.3 0.3 0.14 0.2 0.35 0.16 0.25 0.58 0.59 0.79 0.82 0.76 0.51 0.52 0.62 0.34 0.64 1.0 0.83 0.46 0.17 0.42 0.27 0.45 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)