Heatmap: Cluster_197 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	112-1,-N,48h	112-1,-N,72h	112-1,-P,48h	112-1,-P,72h	112-1,Control,48h	112-1,Control,72h	84A,MT-,F/2,18C	84A,MT-,Maribacter sp.,F/2,18C	84A,MT-,Roseovarius sp.,F/2,18C	85A,MT+	85A,MT+,-Si,24h	85A,MT+,100nM diproline	85A,MT+,1mM H2O2	85A,MT+,50uM decadienal,0.26% MeOH	85A,MT+,ASW,F/2,72h	85A,MT+,Cold,4C	85A,MT+,Heat,30C	85A,MT+,High light,30m	85A,MT+,High light,6h	85A,MT+,High salt	85A,MT+,Low salt	85B,MT-	85B,MT-,+SIP	PONTON36/34,Crossed strains,11h	PONTON36/34,Crossed strains,14h	PONTON36/34,Crossed strains,21h	PONTON36/34,Separate strains
Sro1002_g229840.1 (Contig2058.g17653)	0.02	0.57	0.37	0.33	0.36	0.02	0.12	1.0	0.98	0.08	0.05	0.02	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.07	0.05	0.03	0.02	0.24	0.28	0.07	0.07	0.06	0.04
Sro1066_g237340.1 (Contig1437.g13210)	0.24	0.23	0.57	0.68	1.0	0.0	0.04	0.85	0.93	0.11	0.0	0.17	0.09	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.09	0.02	0.05	0.0	0.06	0.02
Sro1167_g248410.1 (Contig525.g6881)	0.23	0.12	0.32	0.56	0.23	0.0	0.01	1.0	0.92	0.02	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01
Sro1174_g249030.1 (Contig3404.g26592)	0.71	0.64	1.0	0.73	0.82	0.09	0.18	0.73	0.74	0.28	0.3	0.33	0.22	0.15	0.12	0.1	0.18	0.29	0.4	0.33	0.25	0.07	0.18	0.24	0.4	0.21	0.16
Sro1194_g251340.1 (Contig2725.g21973)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	1.0	0.01	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.38	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1209_g252650.1 (Contig2883.g23017)	0.04	0.5	0.64	0.29	0.27	0.06	0.25	0.93	1.0	0.29	0.21	0.28	0.38	0.25	0.19	0.2	0.11	0.22	0.33	0.49	0.43	0.53	0.48	0.17	0.16	0.39	0.17
Sro124_g059900.1 (Contig2339.g19241)	0.01	0.44	0.33	0.74	1.0	0.11	0.23	0.92	0.73	0.14	0.17	0.1	0.12	0.11	0.12	0.09	0.35	0.54	0.13	0.11	0.1	0.34	0.22	0.04	0.03	0.07	0.15
Sro1311_g261720.1 (Contig1682.g15099)	0.0	0.73	0.71	0.47	0.58	0.01	0.18	0.98	1.0	0.06	0.0	0.01	0.04	0.0	0.02	0.01	0.0	0.04	0.06	0.04	0.0	0.27	0.43	0.02	0.01	0.02	0.02
Sro1424_g271480.1 (Contig1069.g10422)	0.0	0.13	0.15	0.18	0.21	0.0	0.0	1.0	0.63	0.01	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.42	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1427_g271800.1 (Contig1281.g11982)	0.0	0.38	0.13	0.1	0.2	0.07	0.26	1.0	0.84	0.13	0.1	0.17	0.03	0.04	0.11	0.13	0.03	0.33	0.1	0.09	0.15	0.54	0.3	0.1	0.21	0.19	0.14
Sro1554_g282060.1 (Contig1398.g12863)	0.01	0.63	0.43	0.47	0.49	0.01	0.1	0.74	1.0	0.06	0.01	0.04	0.11	0.02	0.02	0.01	0.0	0.04	0.03	0.06	0.05	0.24	0.45	0.04	0.05	0.01	0.01
Sro1586_g284190.1 (Contig1772.g15687)	0.0	0.8	0.9	0.81	0.97	0.01	0.04	0.84	1.0	0.08	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.02	0.16	0.11	0.03	0.0	0.32	0.19	0.02	0.03	0.06	0.02
Sro1628_g287010.1 (Contig1353.g12486)	0.01	0.19	0.34	0.56	0.45	0.01	0.0	1.0	0.87	0.04	0.01	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.08	0.09	0.04	0.0	0.0	0.03
Sro1667_g289770.1 (Contig4103.g31331)	0.01	0.46	0.77	1.0	0.67	0.0	0.02	0.65	0.55	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.17	0.1	0.0	0.01	0.01	0.01
Sro1684_g291030.1 (Contig2811.g22548)	0.03	0.75	0.66	0.25	0.43	0.0	0.01	1.0	0.91	0.11	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.08	0.38	0.29	0.19	0.1	0.02	0.0
Sro1814_g299330.1 (Contig665.g7848)	0.0	0.52	1.0	0.47	0.44	0.0	0.02	0.84	0.96	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.09	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro1880_g303230.1 (Contig160.g1804)	0.01	0.09	0.29	0.18	0.1	0.0	0.18	1.0	0.88	0.03	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.03	0.05	0.0	0.22	0.32	0.0	0.01	0.0	0.0
Sro1902_g304490.1 (Contig632.g7675)	0.04	0.52	1.0	0.55	0.34	0.01	0.09	0.81	0.56	0.09	0.06	0.08	0.18	0.02	0.06	0.04	0.02	0.21	0.19	0.2	0.09	0.65	0.21	0.04	0.05	0.04	0.04
Sro1914_g305060.1 (Contig4462.g33535)	0.0	0.08	0.11	0.05	0.15	0.01	0.05	1.0	0.51	0.05	0.0	0.01	0.08	0.06	0.01	0.01	0.0	0.02	0.03	0.0	0.02	0.11	0.25	0.56	0.12	0.0	0.0
Sro2044_g312380.1 (Contig1368.g12583)	0.0	0.53	0.51	0.18	0.19	0.0	0.01	1.0	0.81	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro2173_g317600.1 (Contig2757.g22199)	0.02	0.34	1.0	0.93	0.91	0.01	0.1	0.54	0.78	0.02	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.02	0.0	0.0	0.0	0.19	0.09	0.01	0.01	0.0	0.01
Sro2353_g324470.1 (Contig3833.g29480)	0.0	0.37	0.46	0.17	0.23	0.0	0.08	0.79	1.0	0.03	0.02	0.03	0.02	0.0	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.39	0.23	0.01	0.0	0.0	0.01
Sro2422_g327180.1 (Contig2242.g18610)	0.03	0.48	0.92	1.0	0.76	0.12	0.21	0.61	0.8	0.16	0.23	0.19	0.37	0.12	0.19	0.16	0.32	0.18	0.17	0.29	0.11	0.31	0.34	0.22	0.22	0.12	0.14
Sro2476_g328760.1 (Contig1473.g13493)	0.07	0.68	1.0	0.65	0.65	0.1	0.21	0.94	0.95	0.26	0.26	0.32	0.42	0.14	0.22	0.28	0.21	0.11	0.12	0.52	0.21	0.71	0.41	0.16	0.17	0.16	0.16
Sro257_g100910.1 (Contig2018.g17270)	0.0	0.48	0.3	0.47	0.62	0.02	0.06	0.94	1.0	0.07	0.01	0.02	0.01	0.0	0.03	0.08	0.02	0.03	0.02	0.01	0.14	0.31	0.22	0.02	0.08	0.06	0.03
Sro259_g101490.1 (Contig240.g2939)	0.01	0.1	0.1	0.06	0.07	0.01	0.32	1.0	0.74	0.02	0.03	0.01	0.11	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.26	0.43	0.05	0.04	0.02	0.05
Sro25_g017260.1 (Contig1417.g13065)	0.02	0.77	0.87	0.8	0.49	0.15	0.19	0.82	1.0	0.27	0.32	0.29	0.07	0.12	0.3	0.38	0.31	0.15	0.18	0.16	0.16	0.45	0.16	0.13	0.18	0.12	0.28
Sro266_g103270.1 (Contig1823.g16058)	0.03	0.49	1.0	0.21	0.19	0.02	0.04	0.45	0.37	0.04	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.03	0.25	0.16	0.03	0.08	0.03	0.0
Sro269_g104020.1 (Contig1337.g12323)	0.11	0.31	1.0	0.36	0.18	0.15	0.01	0.76	0.68	0.1	0.04	0.04	0.51	0.03	0.07	0.06	0.16	0.11	0.39	0.12	0.03	0.08	0.05	0.98	0.74	0.39	0.05
Sro2810_g337600.1 (Contig697.g8121)	0.02	0.11	0.22	0.45	0.62	0.0	0.08	0.94	1.0	0.32	0.18	0.52	0.08	0.2	0.24	0.08	0.14	0.02	0.06	0.09	0.72	0.47	0.05	0.13	0.15	0.22	0.17
Sro290_g109380.1 (Contig380.g5109)	0.01	0.51	0.77	1.0	0.43	0.0	0.05	0.74	0.62	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.09	0.04	0.0	0.0	0.01	0.01
Sro303_g112340.1 (Contig4655.g34644)	0.13	0.09	0.28	0.29	0.26	0.08	0.27	0.71	1.0	0.21	0.25	0.26	0.25	0.11	0.19	0.29	0.19	0.11	0.11	0.29	0.28	0.24	0.18	0.23	0.47	0.23	0.19
Sro319_g116130.1 (Contig204.g2453)	0.44	0.23	0.63	0.44	0.59	0.05	0.36	0.96	1.0	0.17	0.41	0.14	0.08	0.01	0.22	0.19	0.11	0.16	0.3	0.13	0.32	0.12	0.17	0.57	0.89	0.46	0.22
Sro32_g020640.1 (Contig3715.g28537)	0.55	0.21	0.16	0.65	0.58	0.0	0.0	1.0	0.81	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.24	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro342_g121830.1 (Contig3070.g24483)	0.0	0.0	0.05	0.0	0.05	0.0	0.01	1.0	0.99	0.06	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro3831_g351310.1 (Contig3748.g28718)	0.0	0.21	0.48	0.17	0.19	0.0	0.0	0.81	1.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.02	0.03	0.0	0.21	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0
Sro3882_g351660.1 (Contig2885.g23032)	0.0	0.49	0.59	0.67	0.85	0.04	0.08	1.0	0.64	0.1	0.1	0.06	0.05	0.02	0.07	0.05	0.03	0.09	0.08	0.04	0.02	0.13	0.12	0.12	0.05	0.07	0.1
Sro394_g133890.1 (Contig4153.g31719)	0.22	0.66	1.0	0.78	0.64	0.03	0.06	0.69	0.86	0.07	0.03	0.04	0.1	0.05	0.03	0.02	0.07	0.07	0.07	0.16	0.05	0.38	0.18	0.04	0.18	0.12	0.02
Sro419_g139010.1 (Contig4415.g33162)	0.08	0.42	0.48	0.84	0.9	0.03	0.17	0.96	1.0	0.08	0.15	0.07	0.07	0.02	0.13	0.09	0.09	0.08	0.04	0.08	0.03	0.36	0.21	0.03	0.04	0.08	0.15
Sro41_g025280.1 (Contig169.g1934)	0.0	0.31	0.11	0.3	0.91	0.01	0.04	0.79	1.0	0.1	0.0	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.0	0.02	0.05	0.01	0.02	0.39	0.15	0.0	0.0	0.01	0.0
Sro659_g182860.1 (Contig2136.g17994)	0.21	0.25	0.29	1.0	0.47	0.16	0.2	0.82	0.66	0.17	0.11	0.19	0.17	0.16	0.18	0.32	0.18	0.1	0.09	0.17	0.17	0.26	0.18	0.1	0.13	0.07	0.08
Sro720_g192500.1 (Contig2421.g19811)	0.0	0.43	1.0	0.7	0.77	0.01	0.07	0.45	0.63	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.1	0.0	0.0	0.01	0.01
Sro725_g193310.1 (Contig3530.g27283)	0.0	0.14	0.18	0.15	0.22	0.02	0.08	1.0	0.5	0.03	0.24	0.01	0.03	0.01	0.03	0.1	0.0	0.01	0.03	0.0	0.0	0.12	0.2	0.09	0.01	0.01	0.03
Sro836_g209030.1 (Contig1441.g13252)	0.0	0.05	0.08	0.05	0.05	0.0	0.31	1.0	0.64	0.04	0.0	0.0	0.31	0.0	0.01	0.02	0.01	0.39	0.13	0.24	0.01	0.24	0.4	0.04	0.08	0.07	0.02
Sro914_g219530.1 (Contig629.g7632)	0.0	0.62	0.62	0.26	0.19	0.0	0.09	1.0	0.46	0.16	0.0	0.08	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.27	0.4	0.2	0.0	0.08	0.0	0.02
Sro938_g222340.1 (Contig3860.g29715)	0.0	0.2	1.0	0.5	0.91	0.0	0.01	0.7	0.58	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01
Sro97_g050090.1 (Contig689.g8063)	0.03	0.89	0.45	0.51	0.61	0.0	0.04	0.85	1.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.0	0.01	0.33	0.12	0.0	0.05	0.01	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)