Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
0.34 0.04 -0.03 0.26 0.1 -0.75 0.49 -1.32 0.18 -0.27 0.52 -1.41 0.37
-0.06 0.03 0.31 -0.14 0.03 -0.36 0.23 -0.68 0.51 -0.45 0.45 -1.1 0.35
-1.75 1.47 1.52 -2.32 -0.75 -2.56 0.59 -3.02 0.83 -3.88 0.46 -4.62 0.27
-0.22 0.45 0.48 0.22 -0.35 -0.08 -0.79 -0.16 -0.39 0.21 -0.06 -0.23 0.35
-0.7 1.18 1.01 -0.62 0.55 -0.11 -0.89 -0.62 -0.11 -1.2 -0.34 -1.43 0.43
-0.33 0.6 0.98 -1.1 1.05 -1.52 0.56 -3.58 0.3 -3.27 0.5 -4.17 0.54
-0.16 0.19 0.52 -0.85 0.21 -0.84 0.64 -1.28 0.65 -0.96 0.27 -1.32 0.67
-0.14 0.33 0.41 0.09 0.17 -0.31 0.17 -0.57 0.32 -0.32 0.05 -0.86 0.11
-0.21 0.5 0.42 -0.45 0.28 -0.63 0.39 -0.51 0.24 -0.12 -0.62 0.42 -0.52
0.17 0.11 -0.3 0.01 0.44 -0.72 0.23 -0.96 0.39 -0.74 0.61 -1.27 0.56
-0.23 0.52 -0.03 -0.92 1.06 -1.51 0.99 -1.5 0.31 -0.64 -0.18 -0.18 -0.34
-0.12 0.2 0.16 0.08 0.13 -0.3 0.29 -0.66 0.21 -0.93 0.4 -1.36 0.67
0.09 0.39 0.56 0.15 0.18 -0.13 -0.33 -0.38 -0.15 -0.36 -0.06 -0.55 0.15
-0.59 0.28 0.45 -0.27 0.08 0.09 0.25 0.08 0.05 -0.14 -0.28 -0.27 -0.05
-0.07 0.09 0.32 -0.55 0.32 -1.49 0.28 -2.23 1.21 -2.23 0.86 -3.59 0.68
-0.68 1.02 1.07 -0.55 -0.03 -0.43 -0.19 -0.64 -0.16 -0.74 0.03 -1.0 0.39
-0.32 -0.02 0.71 -0.54 0.68 -1.56 0.59 -2.07 0.62 -2.62 0.73 -3.73 0.83
-0.25 0.58 0.43 -0.29 0.3 -0.73 0.19 -0.82 0.45 -0.69 0.35 -1.33 0.38
-0.41 0.29 0.29 -0.38 0.36 -0.39 0.2 -0.72 0.56 -1.21 0.46 -1.45 0.66
-0.43 -0.78 -0.87 -0.45 1.06 -1.15 0.95 -1.33 0.79 -1.27 0.73 -1.71 0.52
-0.16 -0.11 -0.19 -0.82 -0.24 -1.24 1.0 -1.76 1.29 -2.26 0.98 -3.37 0.53
0.3 -0.04 -0.03 0.26 -0.14 0.06 -0.32 -0.19 0.02 0.03 -0.05 -0.25 0.2
0.13 -0.27 -0.03 -0.3 0.12 -0.77 0.81 -1.12 0.84 -1.27 0.67 -1.66 0.36
-0.39 0.14 0.43 -0.23 -0.02 -0.57 0.05 -0.81 0.61 -0.67 0.75 -1.16 0.48
0.66 -0.5 -0.03 0.63 -0.25 -1.13 0.65 -1.91 0.16 -0.39 0.75 -1.82 0.26
-0.3 0.65 0.6 -0.21 0.07 0.14 -0.39 0.14 -0.13 -0.38 -0.4 -0.2 -0.15
-0.04 0.09 0.07 -0.72 -0.05 -1.75 0.91 -2.5 1.2 -2.91 1.0 -3.86 0.57
-0.39 -0.08 0.23 -0.84 0.16 -1.41 0.72 -1.94 0.75 -0.69 0.84 -0.66 0.52
-0.42 0.38 0.75 -0.5 0.44 -0.82 0.12 -1.03 0.27 -0.96 0.42 -1.7 0.76
-1.13 1.0 0.99 -1.35 0.94 -1.17 0.3 -1.18 0.34 -1.61 0.07 -1.97 0.29
-1.16 0.65 0.74 -0.18 -0.64 -0.03 -0.99 -0.0 -0.73 -0.03 0.39 -0.12 0.58
0.19 -0.34 -0.44 -0.07 0.01 -0.13 0.3 -0.35 0.66 -0.65 0.51 -0.58 0.19
-0.52 0.73 0.74 -0.4 -0.47 -0.6 0.18 -0.69 0.48 -0.39 0.43 -0.94 0.08
-1.58 0.65 0.56 -1.06 -0.27 -1.14 0.4 -1.07 0.27 0.03 0.13 0.81 -0.02
-0.1 -0.27 -0.13 -0.49 0.49 -0.68 0.54 -1.02 0.65 -1.13 0.75 -2.07 0.76
-0.7 1.07 1.06 -0.26 -0.52 -0.38 -0.08 -0.52 -0.41 0.05 -0.34 -0.31 -0.19
0.07 -0.23 -0.32 0.29 -0.45 -0.34 0.56 -0.71 0.58 -0.44 0.57 -1.07 0.35
0.1 -0.47 -0.66 0.34 0.09 -0.11 -0.17 -0.27 -0.07 -0.24 0.67 -0.85 0.73
0.91 0.12 0.42 0.22 0.33 -0.44 -0.5 -1.24 -0.23 -0.56 0.34 -1.62 0.36
0.48 0.07 0.3 0.13 0.46 -1.25 -0.31 -1.92 0.25 -0.65 0.68 -1.96 0.76
1.6 -0.57 -0.48 -0.11 -0.38 -1.4 0.04 -1.92 0.5 -0.87 0.6 -2.82 0.68
-0.77 0.6 0.65 -0.37 -0.45 0.02 -0.26 -0.02 -0.15 -0.11 -0.1 0.4 -0.13
-0.21 0.32 0.7 -0.68 0.34 -1.19 0.28 -1.62 0.4 -1.85 0.86 -2.97 0.89
0.58 -0.14 0.33 0.28 -0.18 -0.87 0.34 -1.52 0.17 -0.05 0.59 -1.16 0.05
-0.74 1.04 1.23 -1.78 0.56 -2.16 0.37 -2.96 0.55 -3.19 0.42 -4.85 0.72
-0.04 0.31 0.51 -0.09 0.34 -0.78 0.15 -0.89 0.11 -0.69 0.37 -1.14 0.57
-0.22 0.49 0.5 -0.3 0.16 -0.18 -0.14 -0.89 0.4 -1.0 0.5 -1.47 0.55
-0.28 0.29 0.71 -0.24 -0.09 -0.64 -0.16 -1.78 0.44 -1.22 0.9 -2.49 0.9
-1.3 1.4 1.37 -0.93 -0.41 -1.29 0.17 -1.56 0.15 -1.36 0.42 -2.39 0.23
-3.66 0.87 1.08 -1.84 0.18 -1.43 0.83 -1.7 0.47 -0.88 0.81 -2.42 0.31
-3.73 1.35 1.73 -2.2 0.31 -1.45 -0.66 -0.99 0.07 -1.27 0.24 -1.59 0.17
-1.21 1.5 1.2 -1.13 -0.65 -0.48 -0.06 -0.12 -0.45 -0.34 -0.76 0.1 -0.82
-3.07 1.82 1.67 -0.94 -0.54 -1.65 -0.06 -1.52 -0.49 -0.37 -0.52 -1.24 -0.49
-0.33 0.68 1.03 -0.14 0.29 -0.6 -0.14 -1.24 0.31 -0.8 0.28 -1.89 0.2
-0.6 -0.06 0.49 -0.93 0.75 -1.05 0.12 -1.4 0.57 -1.4 0.75 -1.57 0.96
-0.48 0.47 0.55 -0.35 0.02 -0.68 0.13 -0.84 0.45 -0.87 0.5 -1.1 0.65
-0.25 0.51 0.73 0.08 -0.02 -0.28 -0.14 -0.55 -0.24 0.03 -0.03 -0.68 0.2
1.16 0.54 0.76 -0.26 -0.56 -1.43 0.28 -2.31 0.37 -2.6 0.58 -3.05 0.31
-0.03 0.19 0.55 -0.05 -0.2 -0.06 -0.06 -0.31 0.32 -0.66 0.19 -0.87 0.36
0.92 -0.77 -0.47 0.79 -0.81 -0.86 0.37 -1.36 0.2 0.04 0.57 -1.2 0.23
- - 2.89 - - - 2.32 -21.76 - - - -0.7 -
- - 2.18 - - - 3.08 - - - - - -
-25.07 - -23.62 -13.54 - -4.26 3.54 -5.03 -26.41 -4.01 - 0.28 -27.88
-0.13 0.2 -0.37 0.08 0.42 0.29 0.13 -0.27 0.1 -0.55 0.05 -0.88 0.36
-0.42 0.13 0.67 -0.06 0.18 -0.74 0.28 -1.2 0.5 -0.15 0.56 -1.76 0.2
-0.91 0.87 0.95 -0.05 -0.26 -0.19 -0.34 -0.25 -0.39 0.19 -0.3 -0.51 -0.03
0.86 -1.56 -1.31 0.24 -0.03 -0.63 0.46 -1.19 0.96 -1.01 0.84 -1.67 0.35
-0.04 0.52 0.19 0.18 -0.03 -0.12 -0.32 -0.27 0.11 -0.32 0.1 -0.33 0.05
-0.79 0.55 0.83 -0.39 0.04 -0.37 -0.49 -0.4 -0.59 -0.54 0.59 -0.8 0.78
-0.03 0.15 0.03 -0.03 -0.03 0.06 -0.14 -0.18 0.32 -0.34 0.09 -0.54 0.38
-0.64 0.78 0.68 -0.27 -0.16 -0.15 0.06 -0.51 0.32 -0.49 0.08 -0.61 -0.0
-0.65 0.63 0.49 -0.42 0.45 -0.62 0.35 -0.33 0.17 -0.14 -0.05 -0.56 -0.13
-0.4 0.3 0.24 -0.82 0.84 -0.42 -0.45 -0.69 0.81 -1.19 0.57 -1.87 0.51
-0.36 0.34 0.21 0.09 -0.03 0.14 -0.14 -0.09 -0.17 -0.03 -0.13 -0.02 0.05
-0.4 -0.18 0.61 0.23 -0.06 -0.18 0.28 -0.73 0.08 -0.06 0.23 -0.83 0.34
0.49 -0.78 -0.56 0.12 -0.68 -0.54 0.42 -1.34 0.87 -0.55 0.81 -1.01 0.54
-0.17 0.44 0.03 -0.29 -0.2 -0.72 0.61 -0.97 0.52 0.13 0.17 -0.81 0.23
0.08 0.08 0.49 -0.94 0.97 -2.02 0.58 -2.89 0.75 -3.1 0.82 -4.43 0.6
-0.19 0.43 0.51 -0.12 0.08 -0.38 0.33 -0.86 0.34 -0.74 0.4 -1.49 0.33
0.27 -0.26 -0.07 0.24 -0.51 -0.81 0.7 -1.2 0.57 -0.27 0.81 -1.38 0.05
-0.5 0.4 1.01 -0.71 -0.48 -0.2 -0.03 -0.15 -0.16 -0.15 -0.11 0.12 0.09
-0.46 -0.1 1.44 -1.07 -0.21 -2.21 0.73 -2.88 0.2 -0.02 0.47 -0.89 0.27
-0.55 0.35 0.51 -0.76 0.31 -1.16 0.69 -1.53 0.6 -1.86 0.64 -2.12 0.85
-0.64 0.54 0.69 -1.05 0.45 -1.13 0.52 -1.44 0.62 -1.77 0.56 -2.02 0.7
0.16 0.05 0.18 0.53 0.1 -0.18 -0.29 -0.78 0.23 -0.25 0.3 -0.82 0.14
0.83 -0.97 -1.19 0.24 -0.12 -0.29 0.32 -0.73 0.81 -0.62 0.51 -0.51 -0.03
0.31 -0.07 0.23 0.29 0.27 -0.74 0.3 -1.03 0.28 -0.15 0.37 -0.94 -0.04
-1.38 0.45 0.6 -0.94 -0.11 -1.43 0.94 -2.35 1.08 -2.54 0.96 -3.94 0.58
0.37 0.13 0.17 0.12 -0.17 0.06 -0.17 -0.39 -0.2 0.04 0.07 -0.58 0.26
0.02 -0.47 -0.26 -0.47 0.21 -1.28 0.86 -2.24 1.21 -2.35 0.95 -3.74 0.68
-0.09 0.01 -0.02 0.16 -0.25 -1.37 0.67 -2.02 0.69 0.02 0.72 -1.5 0.32
-0.89 0.41 0.6 -0.61 -0.19 -0.99 0.24 -1.02 0.43 -0.54 0.88 -1.56 0.75
0.32 0.06 0.39 0.14 -0.09 -0.26 0.06 -0.49 0.07 -0.27 0.13 -0.66 0.21
-0.47 0.45 0.54 -0.71 -0.2 -0.91 0.51 -1.37 0.62 -0.97 0.69 -1.96 0.79
0.38 -0.08 0.9 0.19 -0.18 -0.7 0.02 -1.05 0.22 0.02 0.19 -1.47 0.09
0.19 -0.1 0.44 0.13 0.36 -0.63 0.19 -1.08 0.2 -0.3 0.47 -1.5 0.3
-0.61 0.75 1.19 -0.68 0.4 -1.51 0.87 -2.06 0.37 -1.57 0.31 -2.16 -0.12
0.41 -0.52 0.02 0.48 -0.16 -0.6 -0.01 -1.26 0.31 -0.21 0.75 -1.35 0.51
-0.65 0.42 0.71 -0.64 -0.13 -1.57 0.75 -2.03 0.61 -0.75 0.83 -1.73 0.44
0.08 0.02 -0.17 0.15 0.09 -0.08 0.02 -0.3 0.21 -0.15 0.28 -0.55 0.2
0.05 -0.07 -0.19 0.63 0.06 -0.15 -0.18 -0.7 0.12 -0.24 0.5 -1.01 0.37
-0.36 0.16 -0.13 -0.2 0.08 0.03 0.78 -0.37 0.41 -0.66 0.05 -0.8 0.25
1.23 -1.36 -1.12 0.19 -0.29 -0.93 0.57 -1.64 0.98 -1.38 0.91 -2.0 0.04
0.7 -0.27 0.02 0.45 -0.27 -0.73 0.22 -1.15 0.24 -0.34 0.61 -1.5 0.34
0.05 -0.11 0.64 0.03 0.19 -1.25 0.83 -1.76 0.57 -1.22 0.49 -1.96 0.31
0.39 0.0 0.52 -0.44 -0.04 -0.95 1.0 -2.1 0.66 -2.55 0.76 -3.32 0.3
-0.57 0.19 0.45 -1.13 1.03 -1.51 0.65 -1.94 0.66 -2.01 0.56 -2.39 0.73
0.42 0.19 0.34 -0.17 -0.21 -0.63 0.06 -1.17 0.33 -1.32 0.71 -2.14 0.88
0.65 -0.79 -0.09 0.7 -0.42 -0.61 0.13 -1.01 0.09 0.04 0.61 -1.07 0.25
-0.92 0.64 0.44 -0.32 -0.54 -0.86 0.57 -0.83 0.65 -0.34 0.41 -0.98 0.35
-1.29 1.03 1.31 -1.46 -0.8 -2.82 0.9 -3.24 0.8 -2.8 0.88 -4.07 0.3
-0.41 0.0 0.41 0.12 0.29 -0.93 0.38 -1.28 0.28 -0.12 0.78 -1.22 0.12
0.1 0.04 0.37 0.21 -0.34 -0.19 0.44 -0.99 0.25 -0.27 0.48 -1.22 0.12
-0.25 0.29 -0.42 0.08 0.11 -0.18 -0.14 -0.37 0.11 -0.47 0.76 -0.14 0.12
-0.57 0.41 0.56 -0.29 -0.8 -0.15 -0.11 -0.2 0.22 -0.16 0.21 -0.11 0.36
0.93 -0.08 -0.13 -0.02 -0.4 -0.99 0.53 -1.03 0.38 -0.47 0.21 -0.66 0.32
-0.42 -0.07 -0.1 0.21 -0.22 -0.47 0.45 -0.64 0.23 0.11 0.45 -0.58 0.41
0.47 -2.76 -3.38 -0.73 0.03 -1.98 0.45 -2.61 1.49 -1.88 1.51 -2.42 0.89
-0.02 -0.03 -0.02 0.2 -0.04 -0.06 -0.07 -0.32 -0.07 0.38 0.0 -0.0 -0.05
-0.01 0.29 0.22 -0.51 0.16 -1.56 0.62 -1.93 0.84 -1.26 0.99 -2.06 0.29
-0.15 -0.56 -0.01 0.39 -0.61 -1.4 0.56 -1.9 0.57 -0.03 1.25 -1.88 0.28
0.12 0.06 0.32 0.04 0.12 -0.32 -0.15 -0.7 0.17 -0.33 0.43 -1.19 0.56
-0.95 0.58 0.38 -0.98 0.3 -0.9 0.75 -1.62 0.73 -1.54 0.69 -2.03 0.63
0.31 -0.22 0.15 0.02 0.23 -0.44 0.4 -0.87 0.5 -0.81 0.32 -1.23 0.42
-1.14 0.83 0.92 -0.16 -0.39 -0.07 -0.54 -0.11 -0.41 0.18 -0.24 -0.05 -0.1
-0.21 0.58 0.74 -0.14 -0.2 -0.77 0.15 -0.84 0.03 0.06 0.25 -0.91 0.2
-0.46 0.47 0.33 -0.19 0.2 -0.05 0.04 -0.13 0.03 -0.21 -0.18 -0.59 0.35
0.27 0.36 0.41 0.34 -0.22 0.01 -0.29 -0.61 0.04 -0.31 -0.01 -0.78 0.21
-0.77 0.85 0.3 -0.31 -0.2 -0.26 0.54 -0.49 0.32 -0.72 0.07 -1.13 0.43
0.15 0.44 -0.28 0.17 -0.38 -0.74 -0.13 -0.12 0.38 -0.02 0.07 -0.67 0.49
-0.19 -0.58 -0.51 0.07 0.31 -0.63 -0.34 -0.71 0.25 -0.69 1.24 -1.79 0.96
-0.5 -0.01 0.73 0.38 -0.09 -2.01 0.91 -2.24 0.2 0.23 0.8 -2.24 -0.37
0.07 0.18 0.32 0.02 -0.1 -0.2 -0.09 -0.39 0.08 -0.11 0.27 -0.7 0.33
0.71 -0.25 -0.03 0.29 -0.14 -0.58 0.05 -0.81 0.01 0.38 0.1 -0.5 0.08
0.07 0.18 0.32 0.02 -0.1 -0.2 -0.09 -0.39 0.08 -0.11 0.27 -0.7 0.33
0.4 -0.16 -0.49 0.3 -0.3 -0.42 -0.85 -0.59 0.33 0.08 0.73 -1.27 0.76
-3.21 1.55 1.35 -2.87 -0.82 -1.99 -1.1 -4.15 0.56 -2.51 1.08 -5.55 1.1
-0.62 -1.4 -1.38 -2.43 -0.5 -2.41 1.5 -3.49 1.82 -4.42 1.32 -5.37 0.59
0.55 -0.34 -0.01 0.19 -0.13 -0.09 0.13 -0.31 0.19 -0.19 0.09 -0.5 0.07

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.