Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
0.29 -0.35 -0.51 0.52 -0.2 -0.22 0.46 -0.86 0.24 0.1 0.24 -0.57 0.12
0.17 -0.72 -1.03 0.51 -0.3 0.05 0.19 -0.02 0.01 0.35 0.04 0.1 0.0
0.22 -0.17 0.1 0.28 0.06 -0.29 0.16 -0.46 0.14 -0.23 0.32 -0.61 0.15
0.1 0.14 0.34 0.22 -0.12 -0.18 -0.34 -0.52 0.05 -0.03 0.23 -0.84 0.45
0.33 -0.16 -0.03 0.23 0.16 -0.14 -0.17 -0.75 -0.01 0.02 0.41 -0.82 0.35
0.34 -0.0 -0.01 0.42 -0.46 0.02 -0.31 -0.29 -0.09 0.19 0.03 -0.29 0.16
-0.32 0.25 0.06 0.12 -0.38 -0.25 -0.01 -0.29 0.1 0.3 0.25 -0.18 0.11
1.17 -0.59 -0.74 0.3 0.88 -0.82 0.6 -1.03 0.14 -0.64 0.01 -1.62 -0.36
0.08 -0.05 0.07 0.46 -0.27 -0.54 -0.22 -0.17 0.18 0.35 0.12 -0.31 -0.04
0.44 -0.73 -0.79 0.59 -0.56 0.03 0.08 -0.08 0.08 0.31 0.15 -0.26 0.02
-0.13 -0.09 -0.08 0.08 0.0 -0.15 0.33 -0.26 0.24 0.06 0.14 -0.43 0.12
0.35 -0.07 0.0 0.2 0.18 -0.38 -0.02 -0.53 0.11 -0.26 0.46 -1.04 0.35
0.93 -0.45 -0.48 0.66 -0.17 -0.17 -0.01 -0.47 -0.05 0.17 -0.03 -0.63 -0.21
0.66 -0.59 -0.51 0.52 -0.28 -0.33 0.4 -0.5 0.17 0.15 0.3 -0.7 -0.16
0.33 -0.36 -0.42 0.64 -0.3 -0.09 -0.04 -0.4 -0.05 0.43 -0.06 -0.44 0.22
0.18 -0.1 -0.24 0.3 0.11 -0.15 -0.06 -0.41 0.17 -0.03 0.2 -0.62 0.32
-0.01 -0.03 -0.07 0.35 0.02 0.02 -0.01 -0.36 0.11 0.01 0.16 -0.67 0.21
0.36 0.07 -0.01 0.33 -0.2 -0.39 0.18 -0.7 0.25 -0.19 0.26 -0.85 0.27
-0.19 -0.02 -0.22 0.14 0.1 -0.22 0.18 -0.27 0.23 0.01 0.28 -0.61 0.3
0.55 -0.12 -0.19 0.56 -0.1 -0.05 -0.03 -0.43 0.01 -0.28 0.12 -0.72 0.17
0.62 -0.45 0.0 0.59 -0.36 -0.61 0.31 -1.02 -0.03 0.23 0.35 -0.46 -0.15
0.4 0.26 0.15 0.26 -0.36 -0.01 -0.16 -0.27 -0.12 -0.07 -0.08 -0.33 0.1
-0.12 0.09 0.08 0.14 -0.2 -0.09 0.26 -0.47 0.28 -0.01 0.24 -0.56 0.11
0.62 -0.33 -0.36 0.7 -0.62 -0.52 0.18 -0.78 0.05 0.33 0.36 -0.9 0.13
0.79 -0.53 -0.82 0.91 -0.22 0.18 0.14 -0.65 -0.41 0.28 -0.4 -0.19 -0.36
-0.71 0.57 0.5 -0.09 -0.22 -0.06 -0.06 -0.32 0.09 0.08 0.02 -0.33 0.06
0.58 -0.39 0.1 0.44 -0.23 0.13 -0.52 -0.15 -0.22 0.09 0.07 -0.51 0.13
-0.05 -0.01 0.02 0.33 -0.37 -0.03 -0.07 -0.28 -0.02 0.42 0.05 -0.26 0.08
0.09 -0.57 -0.62 0.53 -0.66 0.14 0.3 -0.18 0.25 0.13 0.2 -0.27 0.06
0.36 -0.36 -0.17 0.36 -0.19 -0.22 0.12 -0.54 0.15 -0.04 0.49 -0.77 0.24
0.39 -0.11 0.19 0.36 -0.15 -0.18 -0.39 -0.37 -0.05 0.01 0.12 -0.58 0.36
0.02 0.15 0.37 -0.03 0.27 -1.0 0.49 -1.01 0.18 0.06 0.48 -1.19 -0.02
0.38 -0.4 -0.99 0.52 -1.03 -0.25 0.03 -0.43 0.11 0.52 0.44 -0.01 0.07
0.04 -0.01 0.11 0.3 -0.32 0.05 -0.24 -0.22 0.04 0.19 0.16 -0.62 0.25
0.33 -0.61 -0.28 0.32 0.13 -0.02 -0.02 -0.28 0.25 -0.22 0.35 -0.75 0.29
0.35 -0.58 -0.31 0.44 -0.17 0.03 -0.28 -0.22 -0.1 0.25 0.21 -0.26 0.24
0.18 -0.22 -0.16 0.49 -0.27 0.03 0.09 -0.4 -0.15 0.15 0.27 -0.67 0.26
-0.35 -0.01 -0.08 -0.01 0.17 -0.45 -0.01 -0.46 0.13 0.29 0.33 -0.14 0.29
0.46 -0.28 -0.29 0.45 -0.22 -0.05 -0.11 -0.33 -0.19 0.21 0.09 -0.2 0.14
0.15 -0.13 -0.06 0.22 -0.01 -0.31 0.11 -0.44 0.07 0.12 0.2 -0.29 0.17
-0.02 0.2 0.05 0.23 -0.15 -0.25 0.27 -0.46 0.11 -0.11 0.16 -0.84 0.37
0.08 0.03 0.11 0.11 -0.34 -0.11 -0.05 -0.3 -0.06 0.06 0.14 -0.05 0.27
-0.02 -0.04 0.02 0.27 -0.31 -0.31 -0.03 -0.12 -0.06 0.4 0.28 -0.33 0.03
0.68 -0.47 -0.5 0.56 -0.37 -0.04 -0.14 -0.46 0.19 0.09 0.27 -0.48 -0.04
0.1 -0.28 -0.28 0.16 0.09 -0.5 0.22 -0.59 0.26 0.07 0.49 -0.56 0.32
0.44 -0.33 0.0 0.3 0.13 0.12 0.24 -0.22 -0.02 -0.5 0.02 -0.69 0.11
0.48 -0.33 -0.02 0.45 -0.29 0.15 -0.31 -0.31 0.16 -0.09 0.21 -0.75 0.14
0.92 -0.46 -0.26 0.39 0.65 -0.59 -0.31 -0.74 -0.3 -0.15 0.06 -0.75 0.32
0.39 -0.12 -0.12 0.41 -0.53 -0.22 0.27 -0.44 0.13 0.17 0.16 -0.53 -0.0
-0.09 0.06 0.07 0.29 -0.01 -0.45 0.15 -0.62 -0.05 0.42 0.27 -0.75 0.22
0.39 -0.22 0.12 0.56 -0.56 0.08 -0.12 -0.33 -0.18 0.32 0.02 -0.39 -0.14
0.3 -0.06 -0.03 0.27 -0.3 0.05 -0.08 -0.14 -0.2 0.29 -0.08 -0.03 -0.14
0.08 0.23 0.03 0.4 -0.28 -0.35 0.18 -0.82 0.08 0.19 0.24 -0.61 0.13
0.28 -0.07 0.16 0.26 -0.06 -0.17 -0.36 -0.48 -0.13 0.08 0.12 -0.24 0.35
0.32 -0.25 -0.01 0.51 -0.05 0.16 -0.07 -0.16 -0.18 -0.2 0.07 -0.58 0.12
0.37 -0.25 -0.17 0.21 0.06 -0.25 0.36 -0.66 0.4 -0.71 0.45 -1.57 0.47
0.44 -0.09 0.04 0.29 -0.18 -0.06 -0.43 -0.16 -0.02 0.14 -0.18 -0.13 0.1
0.23 -0.33 -0.69 0.34 -0.7 -0.4 0.12 -0.47 0.36 0.21 0.6 -0.44 0.35
0.36 -0.37 -0.36 0.61 -0.7 -0.14 0.09 -0.31 0.1 -0.03 0.53 -1.06 0.35
0.03 -0.04 0.21 0.08 0.25 -0.25 0.15 -0.45 0.07 -0.25 0.27 -1.13 0.46
0.56 -0.14 -0.01 0.31 -0.11 -0.14 -0.12 -0.41 0.01 0.13 0.16 -0.79 0.11
-0.09 -0.02 0.04 0.14 -0.14 -0.23 0.16 -0.59 0.28 0.01 0.34 -0.4 0.21
0.33 -0.15 -0.17 0.46 -0.33 -0.06 -0.1 -0.27 0.08 0.17 0.11 -0.5 0.11
-0.01 0.07 0.18 -0.01 0.12 -0.06 0.12 -0.33 0.08 -0.06 -0.08 -0.23 0.13
-0.05 -0.08 0.34 0.47 -0.4 -0.27 -0.24 -0.29 -0.24 0.53 -0.0 -0.09 -0.07
-0.87 0.4 0.42 -0.13 -0.28 -0.28 0.22 -0.33 0.16 0.16 0.22 -0.41 0.16
0.13 0.03 0.01 0.2 -0.11 0.07 0.01 -0.12 -0.21 0.12 0.0 -0.27 0.06
-0.27 0.28 0.39 -0.02 -0.19 -0.54 0.46 -1.01 0.52 0.11 0.23 -1.39 0.21
0.31 -0.36 -0.29 0.37 -0.5 0.03 0.14 -0.16 0.11 0.06 0.07 -0.13 0.09
0.45 -0.18 0.07 0.48 -0.45 -0.37 0.04 -0.53 -0.1 0.39 0.08 -0.15 -0.18
0.75 -0.57 -0.31 0.61 0.12 -0.3 0.0 -0.6 -0.02 0.08 0.35 -1.25 0.03
0.24 -0.25 0.09 0.39 0.02 -0.32 0.01 -0.34 -0.02 0.18 0.15 -0.56 0.12
0.54 -0.09 0.1 0.39 -0.31 -0.47 0.4 -0.86 -0.03 0.03 0.3 -0.82 0.03
-0.13 0.07 0.18 0.11 -0.31 -0.41 0.13 -0.57 0.17 0.16 0.35 -0.31 0.24
0.02 -0.21 -0.01 0.33 -0.23 0.0 -0.14 -0.08 0.09 0.16 0.1 -0.36 0.17
0.23 -0.07 0.18 0.35 -0.11 -0.45 0.07 -0.81 0.11 -0.09 0.57 -1.11 0.29
0.41 -0.4 -0.11 0.39 0.01 -0.29 0.07 -0.67 0.04 0.0 0.36 -0.82 0.36
0.41 -0.78 -0.97 0.42 -0.1 -0.0 0.19 -0.14 -0.06 0.34 -0.31 0.32 -0.03
-0.09 -0.07 -0.01 0.52 -0.64 -0.22 -0.03 -0.16 -0.14 0.43 0.02 -0.09 0.15
-0.22 -0.13 -0.36 0.24 -0.39 -0.39 0.07 -0.86 0.32 0.02 0.79 -0.7 0.62
0.48 -0.54 -0.41 0.53 -0.32 0.1 0.04 -0.22 -0.22 0.34 0.0 -0.16 -0.1
0.59 -0.32 -0.14 0.36 0.27 -0.17 -0.07 -0.39 -0.12 0.08 0.2 -0.89 0.04
0.75 -0.61 -0.42 0.4 -0.11 -0.14 -0.21 -0.18 0.0 -0.02 0.17 -0.47 0.25
0.39 -0.32 0.09 0.43 -0.55 -0.18 0.21 -0.49 0.12 0.16 0.22 -0.75 0.11
0.86 -0.38 -0.32 0.47 -0.24 -0.49 0.21 -0.96 0.3 -0.39 0.61 -1.43 0.15
0.32 -0.11 0.29 0.2 -0.35 -1.04 0.67 -1.51 0.47 -0.43 0.7 -1.99 0.3
0.38 0.05 -0.02 0.44 -0.23 -0.08 -0.02 -0.33 -0.08 0.1 -0.03 -0.4 -0.02
0.11 -0.03 0.14 0.01 -0.29 -0.14 -0.07 -0.51 0.05 0.26 0.23 -0.27 0.29
0.08 -0.11 0.06 0.46 -0.38 -0.35 0.17 -0.6 -0.03 0.33 0.28 -0.63 0.22
0.35 -0.21 0.44 0.36 -0.09 -0.4 -0.02 -0.6 0.0 -0.17 0.35 -0.86 0.22
-0.07 -0.15 -0.07 0.18 0.01 0.03 0.05 -0.22 0.1 0.16 0.11 -0.41 0.15
0.18 -0.64 -0.17 -0.0 0.54 -0.13 0.31 -0.45 0.26 -0.52 0.35 -1.02 0.42
0.42 -0.58 -0.44 0.4 -0.27 -0.66 0.62 -0.83 0.28 0.31 0.46 -0.81 -0.04
0.03 0.16 0.14 0.32 -0.14 -0.3 0.25 -0.27 0.03 -0.21 0.14 -1.17 0.42
0.87 -0.53 -0.31 0.53 -0.36 -0.29 0.18 -0.53 -0.02 0.23 0.02 -0.45 -0.15
0.76 -0.35 -0.46 0.41 -0.22 -0.27 0.21 -0.53 0.29 -0.19 0.3 -0.75 0.01
0.33 -0.01 0.1 0.33 -0.11 -0.27 0.03 -0.42 -0.08 0.08 0.19 -0.61 0.13
0.19 -0.23 0.14 0.2 -0.17 0.08 -0.18 -0.07 -0.16 -0.01 0.13 -0.71 0.46
0.65 -0.45 -0.72 0.49 -0.09 -0.35 0.42 -0.42 0.11 -0.06 0.26 -0.54 -0.06
-0.17 0.0 0.1 0.22 -0.38 -0.11 -0.02 -0.39 0.14 0.13 0.39 -0.43 0.24
0.06 -0.07 0.08 0.22 0.03 -0.26 0.16 -0.62 0.14 -0.16 0.55 -0.96 0.24
0.51 0.04 0.18 0.65 -0.23 -0.46 -0.05 -0.85 -0.18 0.24 0.22 -0.66 -0.18
0.49 -0.15 0.09 0.33 -0.33 -0.07 -0.13 -0.28 -0.1 0.05 0.07 -0.45 0.18
0.13 -0.19 0.09 0.41 -0.35 -0.15 0.01 -0.42 -0.02 0.38 0.14 -0.65 0.22
0.47 -0.26 0.08 0.26 0.15 -0.14 0.19 -0.52 -0.16 -0.23 0.19 -0.53 0.14
0.23 -0.01 0.23 0.22 -0.59 -0.74 0.39 -0.95 0.18 0.03 0.53 -1.07 0.41
-0.26 -0.14 0.22 0.38 -0.42 -0.11 0.16 -0.42 0.0 0.48 0.06 -0.26 -0.04
-0.13 0.09 0.03 0.2 -0.19 0.03 0.14 0.02 0.12 -0.05 -0.06 -0.49 0.17
0.18 -0.28 -0.37 0.12 0.22 -0.61 0.52 -0.74 0.35 -0.35 0.47 -0.76 0.38
-0.15 0.09 0.51 0.23 -0.52 -0.57 0.21 -0.8 0.19 0.19 0.51 -1.05 0.19
0.38 -0.32 0.07 0.47 -0.59 -0.16 0.03 -0.42 0.11 0.17 0.11 -0.36 0.11
0.15 0.18 -0.2 0.57 -0.4 -0.48 0.02 -0.73 0.18 0.19 0.19 -0.42 0.22
0.69 -0.51 -0.42 0.63 -0.33 -0.19 0.1 -0.7 -0.13 0.4 0.08 -0.3 -0.12
0.35 -0.06 0.03 0.32 -0.1 -0.83 0.23 -0.83 -0.04 0.14 0.53 -0.77 0.23
-0.05 0.07 -0.12 0.12 0.19 -0.19 0.08 -0.48 0.26 -0.13 0.24 -0.8 0.39
0.4 -0.24 -0.25 0.5 -0.32 -0.06 0.03 -0.25 -0.0 0.12 0.04 -0.17 -0.06
0.19 0.0 -0.14 0.4 -0.23 -0.01 -0.09 -0.38 -0.01 0.1 0.12 -0.31 0.16
0.24 -0.23 0.0 0.44 -0.47 -0.24 0.02 -0.44 -0.01 0.4 0.2 -0.34 0.05
0.52 -0.28 -0.17 0.58 -0.64 -0.43 0.31 -1.05 0.08 0.42 0.35 -0.66 -0.08
0.25 -0.24 -0.18 0.47 -0.17 -0.11 -0.01 -0.42 0.19 0.16 0.1 -0.51 0.13
0.23 -0.16 -0.13 0.25 -0.55 -0.51 0.38 -0.97 0.46 -0.03 0.62 -0.93 0.28
-0.0 0.08 0.11 0.28 -0.05 -0.07 0.03 -0.37 0.02 -0.22 0.24 -0.71 0.35
0.02 0.0 0.15 0.32 -0.13 0.32 -0.89 -0.16 -0.12 0.09 0.12 -0.36 0.23
0.17 -0.53 -0.37 -0.03 0.24 -0.45 0.36 -0.48 0.37 -0.29 0.43 -0.62 0.5
0.42 -0.58 -0.44 0.4 -0.27 -0.66 0.62 -0.83 0.28 0.31 0.46 -0.81 -0.04
0.01 -0.19 0.17 0.49 -0.48 -0.28 0.14 -0.41 0.04 0.43 0.11 -0.38 -0.05
0.34 -0.09 0.43 0.11 -0.02 -0.93 -0.14 -1.22 0.33 -0.15 0.67 -1.36 0.47

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.