Heatmap: Cluster_40 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
-0.39 0.35 0.32 -0.21 -0.36 -0.21 0.43 -0.39 0.33 -0.29 0.32 -0.89 0.3
-0.24 0.02 0.25 -0.25 0.28 0.08 -0.23 -0.08 0.07 -0.54 0.35 -0.51 0.41
-0.06 0.07 0.23 0.04 0.05 0.22 -0.33 0.1 0.0 -0.36 0.05 -0.37 0.18
0.14 0.09 0.1 -0.02 -0.02 0.27 -0.4 0.07 0.07 -0.49 0.11 -0.59 0.34
0.24 -0.03 0.05 0.07 0.17 -0.03 -0.11 -0.26 0.17 -0.52 0.24 -0.91 0.44
-0.11 -0.07 0.04 0.24 -0.14 0.28 -0.32 0.14 -0.05 -0.05 0.01 -0.5 0.31
-0.4 0.38 0.35 -0.32 0.27 -0.11 -0.04 -0.25 0.34 -0.76 0.15 -0.96 0.53
-0.05 0.27 0.55 -0.17 0.18 -0.35 0.16 -0.79 0.27 -0.67 0.24 -0.98 0.44
0.09 0.32 0.12 -0.0 0.07 0.03 -0.0 -0.44 0.27 -0.52 0.17 -0.79 0.27
0.16 0.2 0.41 -0.13 0.06 -0.13 -0.19 -0.3 0.06 -0.52 0.13 -0.93 0.58
0.08 -0.02 -0.16 0.05 -0.27 0.02 0.08 -0.19 0.29 -0.28 0.29 -0.43 0.31
0.16 -0.12 0.48 0.26 0.07 -0.02 -0.13 -0.21 0.05 -0.35 -0.02 -0.8 0.22
-0.04 0.18 0.23 0.08 0.24 0.04 -0.05 -0.31 0.19 -0.48 0.15 -0.98 0.27
-0.2 0.41 0.47 -0.26 0.43 -0.3 0.0 -0.57 0.32 -0.7 0.17 -1.46 0.49
-0.29 0.27 0.36 0.12 -0.04 0.29 -0.44 -0.11 0.14 -0.17 -0.11 -0.53 0.18
-0.29 0.21 0.05 -0.08 0.05 0.05 -0.13 -0.07 0.16 -0.31 0.12 -0.43 0.44
0.17 0.01 -0.1 0.22 0.15 -0.01 0.11 -0.3 0.2 -0.41 0.18 -0.89 0.27
0.03 -0.07 0.01 0.08 0.18 0.1 -0.0 -0.14 0.07 -0.1 0.02 -0.56 0.24
-0.42 0.37 0.35 -0.1 0.26 -0.14 -0.15 -0.32 0.18 -0.13 0.13 -0.78 0.29
-0.02 -0.02 0.07 0.27 -0.17 0.09 -0.38 -0.07 -0.07 0.01 0.07 -0.22 0.3
-0.01 0.1 0.2 -0.11 0.14 -0.41 0.13 -0.5 0.38 -0.34 0.17 -0.61 0.42
0.17 0.08 0.04 0.2 -0.19 0.05 0.01 -0.16 0.05 -0.1 0.03 -0.47 0.15
-0.39 0.59 0.6 -0.29 0.54 -0.52 -0.24 -0.79 0.18 -0.58 0.25 -1.41 0.54
-0.01 0.42 0.49 -0.03 0.21 -0.38 0.02 -0.71 0.22 -0.68 0.29 -1.15 0.34
-0.45 0.05 0.21 -0.05 -0.1 0.16 -0.06 0.09 0.2 -0.37 0.14 -0.49 0.37
-0.16 0.2 0.06 0.07 -0.05 -0.15 0.22 -0.42 0.2 -0.29 0.34 -0.59 0.26
0.01 0.11 0.3 0.02 -0.01 0.1 -0.25 0.03 0.09 -0.25 -0.05 -0.47 0.21
-0.26 0.27 0.36 -0.11 -0.16 0.07 -0.07 0.06 0.07 -0.21 -0.09 -0.3 0.19
0.02 -0.03 -0.16 0.15 0.32 0.21 -0.28 -0.09 0.13 -0.36 0.16 -0.62 0.26
-0.26 0.52 0.54 -0.06 0.08 -0.07 -0.07 -0.4 0.12 -0.6 0.18 -1.09 0.32
0.32 0.05 0.18 0.19 -0.02 -0.17 -0.0 -0.5 0.27 -0.5 0.31 -1.17 0.34
0.03 0.25 0.29 0.15 -0.22 0.09 -0.53 0.03 -0.18 0.02 -0.09 -0.33 0.26
0.02 0.46 0.48 -0.12 0.2 -0.38 -0.08 -0.65 0.26 -0.61 0.21 -1.01 0.38
-0.39 0.34 0.41 -0.05 -0.26 -0.42 0.29 -0.53 0.28 -0.34 0.34 -0.7 0.37
-0.31 0.22 0.3 -0.07 0.08 0.09 -0.44 0.0 0.17 -0.29 0.08 -0.57 0.4
-0.02 0.31 0.28 -0.17 0.36 -0.37 -0.26 -0.58 0.36 -0.79 0.5 -1.43 0.56
-0.39 0.18 0.27 -0.19 0.0 -0.21 -0.01 -0.25 0.34 -0.33 0.36 -0.71 0.44
-0.05 0.15 0.1 -0.11 0.29 -0.14 -0.09 -0.33 0.42 -0.43 0.18 -0.92 0.39
-0.01 -0.06 0.12 -0.02 0.09 0.23 -0.3 0.22 -0.0 -0.12 -0.15 -0.28 0.15
0.21 0.1 0.11 0.03 0.37 -0.12 -0.04 -0.36 0.21 -0.68 0.19 -1.17 0.42
-0.15 0.49 0.51 -0.19 0.12 -0.12 -0.05 -0.33 0.2 -0.62 0.13 -1.14 0.36
0.15 0.09 0.11 0.01 0.25 -0.22 0.21 -0.55 0.35 -0.55 0.25 -1.36 0.38
0.11 -0.01 0.3 0.09 0.2 0.27 -0.27 -0.15 0.18 -0.78 0.19 -1.29 0.37
-0.44 0.18 0.12 0.09 -0.17 0.05 -0.25 -0.11 0.24 -0.23 0.32 -0.78 0.5
0.24 0.01 0.29 0.11 0.06 -0.32 0.19 -0.52 0.28 -0.49 0.21 -0.98 0.31
-0.91 0.46 0.44 -0.67 0.11 0.05 -0.3 0.16 0.13 -0.49 -0.02 -0.45 0.62
-0.43 0.4 0.39 -0.17 0.12 -0.02 0.05 -0.11 0.13 -0.35 -0.06 -0.77 0.36
0.31 -0.18 0.01 0.35 0.07 0.06 -0.27 -0.15 -0.08 -0.08 0.03 -0.66 0.31
-0.1 0.09 0.08 -0.05 0.3 -0.0 -0.16 -0.17 0.27 -0.41 0.12 -0.85 0.45
-0.18 0.38 0.32 0.05 -0.06 0.06 -0.25 -0.0 0.1 -0.28 -0.04 -0.45 0.11
-0.1 0.14 0.08 0.21 0.2 0.13 -0.35 -0.08 -0.04 -0.1 0.02 -0.5 0.21
0.01 -0.02 0.19 0.1 -0.08 0.15 -0.25 0.0 0.09 -0.24 0.1 -0.51 0.28
-0.18 0.21 0.03 -0.16 0.3 -0.15 0.06 -0.46 0.49 -0.75 0.36 -1.3 0.55
0.01 0.12 0.13 0.02 0.19 -0.01 -0.06 -0.31 0.2 -0.55 0.28 -0.9 0.39
0.24 0.03 0.24 0.08 0.12 0.01 -0.19 -0.38 0.21 -0.8 0.25 -1.0 0.49
0.26 0.04 0.09 0.15 0.03 -0.07 -0.05 -0.35 0.02 -0.42 0.27 -0.87 0.44
-0.7 0.26 0.64 -0.3 0.04 0.05 0.15 -0.2 0.16 -0.63 0.09 -0.56 0.34
-0.06 -0.06 0.14 0.02 -0.0 0.36 -0.4 0.22 -0.07 -0.36 0.0 -0.54 0.43
-0.16 0.18 0.22 -0.22 0.09 -0.02 0.04 -0.22 0.18 -0.69 0.2 -0.91 0.65
-0.04 0.22 0.24 0.15 -0.19 0.24 -0.55 0.07 -0.15 -0.04 -0.15 -0.33 0.27
-0.12 -0.11 -0.02 -0.08 0.36 0.21 -0.29 -0.06 0.11 -0.27 0.06 -0.37 0.35
0.04 0.12 0.14 0.31 0.07 0.14 -0.52 -0.14 -0.18 -0.06 0.08 -0.4 0.19
-0.4 0.52 0.55 -0.29 0.43 -0.17 -0.18 -0.46 0.15 -0.75 0.22 -1.29 0.49
-0.08 0.03 -0.18 -0.07 0.27 0.17 -0.12 0.07 0.26 -0.32 -0.06 -0.56 0.34
-0.54 0.26 0.3 0.03 0.08 0.12 -0.16 -0.23 0.09 -0.22 0.05 -0.49 0.36
0.04 0.01 0.08 -0.25 0.11 -0.31 0.06 -0.59 0.5 -0.83 0.56 -1.35 0.71
-0.01 0.02 0.16 0.21 0.09 0.28 -0.38 -0.12 0.04 -0.27 0.09 -0.76 0.31
0.24 -0.1 0.08 0.24 0.2 0.17 -0.38 -0.06 -0.07 -0.19 0.04 -0.49 0.11
-0.12 -0.08 -0.24 0.25 -0.03 -0.0 0.13 -0.1 0.32 -0.09 0.1 -0.48 0.17
-0.1 0.07 -0.07 0.19 0.04 0.2 -0.28 0.15 0.03 -0.06 -0.08 -0.3 0.12
-0.08 0.27 0.28 0.02 0.16 0.16 -0.25 -0.03 0.07 -0.32 -0.1 -0.59 0.17
-0.12 0.23 0.2 -0.04 0.16 -0.32 -0.16 -0.46 0.51 -0.73 0.44 -1.14 0.49
-0.14 -0.16 0.16 -0.05 0.21 -0.04 -0.03 -0.25 0.25 -0.39 0.28 -0.58 0.4
-0.02 0.05 0.02 -0.08 0.44 -0.3 0.23 -0.48 0.36 -0.73 0.36 -1.1 0.41
0.49 0.02 0.06 0.14 0.21 0.36 -0.07 -0.11 0.04 -1.0 0.08 -1.27 0.16
-0.12 0.04 0.13 0.04 0.04 0.21 -0.16 0.01 0.12 -0.32 -0.01 -0.54 0.34
0.1 0.13 0.39 -0.04 0.18 -0.3 0.29 -0.51 0.2 -0.55 0.19 -1.13 0.33
0.08 0.02 0.15 0.23 -0.12 0.15 -0.3 -0.17 0.03 -0.18 0.17 -0.54 0.27
-0.1 0.31 0.44 0.15 0.07 -0.36 0.02 -0.56 0.25 -0.44 0.24 -1.23 0.39
-0.02 0.44 0.45 0.01 -0.04 -0.53 0.14 -0.61 0.09 -0.39 0.39 -0.91 0.24
0.03 0.33 0.25 -0.06 0.04 -0.21 -0.01 -0.35 0.04 -0.4 0.32 -0.68 0.32
0.03 0.46 0.28 -0.05 -0.08 -0.01 -0.19 -0.09 0.14 -0.38 -0.05 -0.59 0.22
-0.26 0.21 0.29 0.04 0.07 0.05 -0.23 -0.26 0.29 -0.37 0.17 -0.87 0.4
-0.07 -0.09 -0.12 -0.05 0.17 0.07 -0.19 0.01 0.13 -0.13 0.11 -0.29 0.33
-0.17 0.18 0.19 0.01 -0.17 0.16 -0.14 -0.07 0.11 -0.48 0.23 -0.77 0.49
0.24 0.0 0.08 0.15 0.16 0.04 -0.15 -0.04 -0.02 -0.47 0.11 -0.6 0.24
-0.04 0.09 0.19 0.05 0.08 -0.12 -0.2 -0.1 0.18 -0.21 0.09 -0.52 0.31
-0.09 0.23 0.44 -0.13 0.2 -0.14 -0.18 -0.45 0.34 -0.63 0.29 -1.18 0.46
-0.14 0.19 0.4 -0.11 0.29 -0.25 -0.02 -0.54 0.39 -0.81 0.36 -1.25 0.48
-0.05 0.2 0.27 -0.14 0.41 -0.23 0.13 -0.46 0.28 -0.62 0.22 -1.24 0.39
0.11 0.03 0.29 -0.14 0.2 -0.03 -0.14 -0.07 0.13 -0.45 0.06 -0.76 0.4
0.15 0.01 -0.03 0.2 0.07 -0.03 -0.53 -0.25 0.34 -0.41 0.33 -0.92 0.47
0.02 0.2 0.29 0.13 0.11 0.01 -0.18 -0.16 0.03 -0.3 0.08 -0.87 0.29
-0.39 0.59 0.6 -0.29 0.54 -0.52 -0.24 -0.79 0.18 -0.58 0.25 -1.41 0.54
0.02 0.44 0.22 -0.03 -0.06 0.15 -0.06 -0.2 0.21 -0.39 -0.13 -0.53 0.09
-0.21 0.23 0.46 -0.13 0.38 0.1 -0.16 -0.04 0.09 -0.38 -0.14 -0.87 0.19
-0.16 0.19 0.22 -0.04 0.33 -0.01 -0.18 -0.23 0.1 -0.24 0.09 -0.43 0.16
0.03 0.13 0.41 -0.03 0.14 0.09 -0.44 -0.03 -0.14 -0.16 -0.14 -0.37 0.28
0.08 -0.08 0.36 0.0 0.28 -0.19 -0.29 -0.24 0.16 -0.13 0.13 -0.47 0.16
-0.03 0.25 0.52 0.06 0.13 -0.19 -0.07 -0.33 -0.01 -0.43 0.09 -0.71 0.29
-0.11 -0.01 0.19 0.19 0.01 0.29 -0.3 0.04 -0.19 -0.21 0.02 -0.3 0.22
-0.02 0.07 -0.1 0.06 0.19 0.04 -0.03 -0.21 0.1 -0.27 0.14 -0.59 0.38
-0.04 0.07 0.12 0.03 0.18 0.15 -0.32 -0.15 0.14 -0.37 0.15 -0.58 0.35
-0.15 0.13 0.21 0.07 -0.01 -0.11 0.15 -0.24 0.18 -0.31 0.23 -0.65 0.23
-0.41 0.35 0.42 -0.24 0.5 -0.35 0.18 -0.43 0.19 -0.5 0.1 -0.87 0.34
0.01 0.02 0.1 0.03 -0.08 0.15 -0.13 0.03 0.09 -0.26 0.05 -0.39 0.27
-0.15 0.17 0.17 -0.04 -0.01 -0.12 0.17 -0.26 0.14 -0.37 0.26 -0.61 0.35
-0.26 0.21 0.39 -0.15 -0.06 -0.34 0.18 -0.36 0.26 -0.37 0.29 -0.81 0.45
-0.31 0.34 0.4 -0.14 0.13 -0.15 0.11 -0.47 0.39 -0.63 0.27 -1.05 0.34
-0.38 0.33 0.43 -0.02 -0.24 -0.37 0.05 -0.8 0.2 -0.18 0.48 -0.82 0.5
-0.47 0.41 0.61 -0.27 0.14 0.08 -0.04 -0.16 0.09 -0.52 -0.05 -0.91 0.38
-0.3 0.26 0.29 -0.15 0.1 0.22 -0.06 0.2 -0.1 -0.18 -0.3 -0.2 0.05
-0.13 0.29 0.28 0.06 0.21 -0.19 0.13 -0.51 0.09 -0.3 0.12 -0.76 0.29
-0.37 0.25 0.4 -0.03 -0.25 -0.44 0.27 -0.57 0.23 -0.17 0.4 -0.75 0.38
-0.5 0.49 0.18 -0.1 0.06 -0.03 -0.27 -0.22 0.15 -0.22 0.23 -0.65 0.4
0.0 0.08 0.18 -0.07 0.04 -0.27 -0.06 -0.18 0.19 -0.08 0.26 -0.38 0.13
-0.26 0.16 0.24 -0.01 0.06 0.19 -0.15 0.05 0.0 -0.17 -0.08 -0.38 0.2
-0.21 0.17 0.09 0.01 0.07 0.17 -0.25 0.16 0.06 -0.23 -0.1 -0.24 0.19
-0.13 0.47 0.46 -0.07 0.04 -0.03 -0.24 -0.33 0.07 -0.36 0.09 -0.77 0.3
0.14 0.19 0.24 -0.23 0.32 -0.2 -0.1 -0.33 0.37 -0.88 0.13 -0.8 0.45
0.17 0.1 0.09 0.11 -0.09 0.19 -0.36 -0.04 -0.04 -0.14 -0.06 -0.21 0.18
-0.06 -0.0 -0.21 0.09 0.31 0.05 0.09 -0.13 0.22 -0.4 0.04 -0.68 0.36
-0.38 0.44 0.37 -0.46 0.51 -0.38 0.4 -0.28 0.22 -0.4 -0.06 -0.73 0.05
-0.17 0.41 0.31 0.16 -0.33 -0.06 0.15 -0.11 0.07 -0.14 -0.04 -0.41 -0.07
-0.11 -0.02 0.12 0.06 -0.16 0.16 -0.07 -0.11 0.18 -0.3 0.19 -0.47 0.34
-0.1 0.02 -0.02 0.06 -0.04 0.02 0.1 -0.16 0.27 -0.29 0.21 -0.76 0.38
0.11 0.38 0.34 -0.07 0.19 -0.28 -0.01 -0.43 0.19 -0.45 0.11 -0.63 0.16
-0.12 0.07 0.11 -0.01 0.12 0.07 -0.25 0.03 0.26 -0.33 0.07 -0.44 0.24
-0.17 0.25 0.23 -0.02 0.27 0.14 -0.32 0.02 0.06 -0.35 -0.03 -0.66 0.26
0.07 0.03 0.31 0.14 0.04 0.13 -0.15 -0.04 -0.1 -0.3 0.08 -0.56 0.15
-0.36 0.1 0.12 0.1 -0.08 0.19 -0.33 0.06 0.13 -0.18 0.16 -0.39 0.28
0.02 -0.1 0.01 -0.11 0.35 -0.18 0.12 -0.42 0.5 -0.63 0.37 -1.06 0.38
-0.05 0.17 0.32 0.01 0.19 -0.03 -0.28 -0.3 0.18 -0.35 0.11 -0.73 0.36
-0.17 0.32 0.37 -0.09 0.15 0.09 -0.35 -0.06 0.03 -0.31 -0.04 -0.43 0.24
0.05 -0.04 0.36 0.13 -0.05 0.15 -0.21 -0.06 -0.06 -0.16 -0.02 -0.4 0.17
-0.13 0.2 0.16 -0.11 0.09 -0.21 0.13 -0.37 0.48 -0.68 0.35 -1.23 0.46
0.0 0.08 0.18 -0.07 0.04 -0.27 -0.06 -0.18 0.19 -0.08 0.26 -0.38 0.13
-0.07 0.34 0.57 -0.11 0.2 -0.25 0.03 -0.6 0.24 -0.53 0.18 -1.14 0.31
-0.15 0.59 0.52 -0.0 -0.28 0.04 -0.09 -0.01 0.08 -0.46 -0.13 -0.65 0.04
-0.31 -0.03 0.26 0.18 0.1 -0.11 -0.03 -0.28 0.03 -0.01 0.12 -0.52 0.35
-0.0 0.1 -0.02 0.1 0.07 -0.03 -0.2 -0.2 0.19 -0.37 0.33 -0.81 0.45
0.05 -0.09 0.14 0.14 0.22 0.2 -0.26 -0.02 0.02 -0.29 -0.0 -0.48 0.19
-0.09 0.25 0.21 -0.05 0.34 -0.2 0.15 -0.56 0.25 -0.6 0.21 -1.04 0.4
-0.33 0.39 0.63 -0.29 0.21 -0.31 -0.13 -0.53 0.26 -0.61 0.26 -1.24 0.57
-0.34 0.25 0.3 -0.06 -0.02 0.02 -0.25 -0.01 0.18 -0.32 0.15 -0.68 0.42
-0.54 0.35 0.4 -0.12 0.26 -0.08 -0.13 -0.21 0.2 -0.55 0.25 -0.88 0.39
0.0 0.33 0.43 -0.03 0.12 -0.26 -0.16 -0.47 0.14 -0.41 0.18 -1.05 0.49
-0.27 0.15 0.39 -0.15 0.31 -0.23 0.17 -0.46 0.33 -0.68 0.33 -1.3 0.46
-0.5 0.34 0.65 -0.29 0.35 -0.09 -0.15 -0.23 0.1 -0.55 0.03 -0.83 0.42
0.06 0.27 0.5 0.12 0.0 -0.35 -0.01 -0.53 0.02 -0.26 0.23 -0.98 0.32
-0.06 -0.06 0.14 0.02 -0.0 0.36 -0.4 0.22 -0.07 -0.36 0.0 -0.54 0.43
-0.09 -0.2 0.21 0.14 0.06 0.24 -0.02 -0.23 0.11 -0.36 0.18 -0.88 0.42
-0.26 0.1 0.21 -0.13 0.21 0.02 0.12 -0.13 0.08 -0.41 0.16 -0.59 0.33
-0.04 -0.16 -0.04 0.05 -0.09 0.07 0.12 -0.07 0.36 -0.53 0.31 -0.79 0.39
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-0.58 0.49 0.49 -0.24 0.19 0.11 -0.14 0.0 0.03 -0.4 -0.04 -0.56 0.16
0.2 0.08 0.14 0.05 0.29 -0.13 0.05 -0.34 0.1 -0.5 0.19 -0.83 0.28
-0.38 0.37 0.37 -0.15 0.13 -0.37 0.29 -0.38 0.24 -0.36 0.13 -0.7 0.28
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-0.03 0.21 0.46 0.01 -0.17 0.14 -0.31 0.03 -0.05 -0.28 -0.11 -0.46 0.27
-0.27 0.24 0.26 -0.22 0.07 -0.27 0.15 -0.51 0.43 -0.77 0.46 -1.2 0.58
-0.49 0.1 0.23 -0.43 0.25 0.37 -0.35 0.3 -0.08 -0.32 -0.17 -0.16 0.35
0.22 0.19 0.28 0.32 0.16 -0.02 -0.49 -0.14 -0.02 -0.39 -0.07 -0.85 0.32
-0.12 0.04 0.17 0.18 -0.19 -0.06 -0.11 -0.03 -0.12 -0.12 0.11 -0.34 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.