Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
0.38 -0.31 -0.11 0.26 -0.48 0.32 -0.78 0.4 -0.54 0.42 -0.46 0.48 -0.39
-0.23 -0.03 -0.36 0.13 -0.49 0.05 0.12 0.05 0.2 0.13 0.06 0.11 0.09
0.35 0.19 0.14 0.22 -0.13 0.11 -0.72 0.02 -0.25 0.06 -0.31 -0.01 0.03
-0.35 -0.64 -0.75 0.41 -0.63 0.82 -0.89 0.94 -0.93 0.69 -0.92 0.49 -0.52
-0.49 0.03 -0.21 0.32 -0.34 0.36 -0.51 0.29 -0.27 0.45 -0.24 0.23 -0.1
0.35 -0.7 -0.5 0.48 -0.66 0.34 -0.5 0.48 -0.56 0.51 -0.35 0.44 -0.37
0.31 -0.49 -0.78 0.56 -0.6 0.53 -0.81 0.57 -0.6 0.51 -0.54 0.42 -0.46
0.45 -1.35 -1.88 0.52 -1.9 0.89 -1.42 0.93 -1.27 0.52 -1.72 1.38 -1.38
0.55 -1.17 -1.24 0.59 -0.59 0.82 -1.0 0.76 -0.8 0.43 -0.5 0.2 -0.37
0.67 -0.32 -0.91 0.04 -0.46 0.42 -1.05 0.55 -0.51 0.56 -0.89 0.57 -0.24
0.04 0.24 0.18 -0.11 0.0 0.03 -0.25 0.11 -0.2 -0.01 -0.36 0.2 0.01
0.4 -0.17 -0.49 0.15 -0.28 0.24 -0.19 0.29 -0.23 0.27 -0.59 0.41 -0.3
-0.12 -0.44 -0.51 0.32 -0.63 0.53 -0.92 0.5 -0.44 0.51 -0.26 0.38 0.07
0.75 -0.7 -0.84 0.44 -0.82 0.63 -1.25 0.65 -0.71 0.32 -0.64 0.37 -0.18
0.91 -0.68 -0.67 0.68 -0.95 0.33 -1.03 0.35 -0.66 0.45 -0.42 0.08 -0.12
0.14 -0.22 -0.34 -0.0 0.26 0.18 -0.43 0.36 -0.4 0.26 -0.6 0.59 -0.36
-0.01 -2.68 -2.29 0.47 -1.32 0.61 -1.51 1.02 -1.51 1.24 -1.43 1.31 -1.46
0.36 -0.33 -0.67 0.32 -0.45 0.37 -0.39 0.37 -0.29 0.31 -0.42 0.45 -0.33
-0.25 0.07 0.05 0.0 -0.29 0.22 -0.31 0.27 -0.12 0.15 -0.36 0.4 -0.08
0.02 -0.32 -0.28 0.45 -0.47 0.34 -0.22 0.21 -0.05 0.15 -0.04 -0.12 0.02
0.11 -0.21 -0.43 0.26 -0.17 0.36 -0.57 0.27 -0.32 0.33 -0.28 0.27 -0.04
0.84 -0.9 -0.83 0.54 -1.03 0.53 -1.05 0.57 -0.6 0.34 -0.7 0.51 -0.36
0.03 -0.44 -0.56 -0.02 -0.68 0.51 -0.92 0.77 -0.57 0.51 -0.71 0.87 -0.41
-0.01 -0.67 -0.87 0.19 -0.4 0.63 -0.86 0.75 -0.61 0.49 -0.75 0.75 -0.28
0.35 -0.4 -0.58 0.17 -0.71 0.51 -1.0 0.69 -0.86 0.64 -0.93 0.75 -0.49
0.78 -1.06 -1.17 0.43 -0.38 0.46 -0.79 0.5 -0.64 0.46 -0.83 0.66 -0.49
0.31 0.07 0.15 0.29 -0.37 0.23 -0.87 0.28 -0.86 0.47 -0.8 0.47 -0.37
0.08 -0.2 -0.04 0.15 0.04 0.2 -0.62 0.07 -0.11 0.08 0.02 -0.08 0.23
0.06 -1.4 -1.79 0.63 -1.66 0.64 -1.83 1.12 -1.25 0.96 -1.17 1.02 -0.8
0.25 -1.12 -1.64 0.68 -1.41 0.7 -0.81 0.65 -1.18 0.9 -1.24 1.07 -1.18
0.05 -0.58 -0.75 0.33 -0.76 0.47 -1.06 0.64 -0.94 0.9 -0.98 0.95 -0.74
0.13 -0.46 -0.7 0.05 0.2 0.2 -0.3 0.35 -0.28 0.38 -0.5 0.58 -0.29
-0.83 -0.07 -0.02 0.34 -0.87 0.86 -1.64 0.96 -1.52 0.53 -1.34 0.83 -0.66
-0.07 -0.02 -0.07 0.21 -0.33 0.05 -0.02 0.09 -0.11 0.24 -0.1 -0.08 0.12
0.1 -0.16 -0.53 0.26 -0.15 -0.15 0.12 -0.21 0.37 0.04 0.03 -0.11 0.16
0.09 -0.46 -0.6 0.28 -0.79 0.3 -0.48 0.4 -0.34 0.34 -0.13 0.52 0.13
0.45 -0.66 -0.76 0.69 -0.65 0.28 -0.56 0.02 -0.32 0.35 0.03 0.13 0.09
-0.1 -0.18 -0.27 0.31 -0.31 0.05 0.19 0.02 0.06 0.23 0.03 -0.06 -0.12
0.59 -0.42 -0.59 0.52 -0.72 0.14 -0.44 0.17 -0.42 0.54 -0.29 0.32 -0.31
-0.17 0.04 0.31 0.24 -0.08 -0.09 -0.18 0.03 -0.08 0.21 -0.18 -0.1 -0.07
0.03 0.1 -0.06 0.16 -0.11 0.05 -0.14 0.04 -0.05 0.17 -0.17 -0.13 0.07
-0.19 -0.18 -0.64 0.12 -0.77 0.4 -0.24 0.49 0.08 0.25 -0.36 0.41 0.01
0.16 -0.5 -0.53 0.58 -1.13 0.54 -1.58 0.59 -0.91 0.9 -0.98 0.73 -0.57
-0.21 0.08 -0.17 -0.05 -0.02 0.3 -0.27 0.21 -0.04 0.14 -0.33 0.17 0.02
0.02 -0.1 -0.18 0.14 -0.5 0.37 -0.37 0.42 -0.18 0.13 -0.33 0.25 0.0
0.68 -0.17 -0.78 -0.06 -0.39 0.33 -1.1 0.62 -0.66 0.58 -1.03 0.67 -0.41
0.09 -0.96 -1.5 0.14 -0.85 0.45 -0.86 0.69 -0.74 0.68 -0.99 1.41 -0.95
-0.03 0.05 0.05 0.23 -0.51 0.23 -0.45 0.32 -0.34 0.26 -0.41 0.27 -0.03
0.46 -0.99 -1.14 0.18 -1.27 0.66 -1.51 0.85 -1.2 0.79 -1.64 1.26 -0.95
0.08 -0.68 -0.92 0.3 -1.38 0.76 -1.21 0.83 -1.1 0.38 -1.26 1.28 -0.61
0.32 -0.73 -0.88 0.53 -0.81 0.51 -0.77 0.5 -0.35 0.43 -0.43 0.58 -0.31
0.26 -0.18 -0.28 0.4 -0.57 0.32 -0.61 0.4 -0.45 0.45 -0.66 0.45 -0.33
0.17 -1.53 -3.13 0.85 -2.8 0.83 -1.82 0.9 -1.38 0.61 -2.07 1.62 -1.56
0.08 -0.19 -0.4 0.09 -0.29 0.48 -0.45 0.32 -0.23 0.24 -0.34 0.37 -0.09
-0.22 0.11 0.09 0.13 0.03 0.36 -0.4 0.23 -0.24 0.1 -0.35 0.0 -0.04
-0.07 -0.24 -0.18 0.22 -0.38 0.55 -0.79 0.7 -0.78 0.58 -0.92 0.55 -0.58
0.65 -0.42 -0.58 0.37 -0.27 0.52 -0.79 0.48 -0.54 0.2 -0.65 0.29 -0.34
0.35 -1.01 -1.38 0.54 -0.96 0.64 -0.76 0.63 -0.84 0.45 -0.72 0.75 -0.05
0.34 -1.0 -1.28 0.48 -1.18 0.69 -0.94 0.8 -0.58 0.52 -0.72 0.75 -0.48
0.01 -0.18 -0.41 0.13 -0.14 0.19 -0.39 0.24 -0.24 0.32 -0.1 0.25 0.05
-0.21 -0.24 -0.26 0.28 -0.4 0.27 -0.49 0.27 -0.39 0.63 -0.41 0.54 -0.25
0.2 -0.53 -0.8 0.08 -0.83 0.51 -0.67 0.64 -0.28 0.41 -0.63 0.77 -0.23
0.24 -1.09 -1.22 0.24 -0.43 0.23 -0.55 0.39 -0.36 0.71 -0.57 1.0 -0.4
0.06 -1.57 -1.62 0.36 -1.21 0.78 -1.28 1.08 -1.34 0.81 -1.42 1.19 -0.88
0.31 -0.61 -0.99 0.35 -0.43 0.32 -0.24 0.33 -0.04 0.31 -0.39 0.59 -0.41
0.48 -0.47 -0.6 0.47 -0.32 0.52 -0.74 0.39 -0.24 0.2 -0.32 0.03 -0.19
-0.09 0.02 -0.2 0.16 -0.36 0.44 -0.51 0.46 -0.21 0.08 -0.37 0.27 -0.1
-0.01 -0.31 -0.02 0.08 -0.05 0.33 -0.43 0.32 -0.26 0.3 -0.38 0.18 -0.03
0.35 -0.45 -0.39 0.41 -0.71 0.45 -1.08 0.58 -0.89 0.7 -0.83 0.67 -0.65
0.27 0.04 0.01 0.11 -0.54 -0.07 -0.52 0.09 -0.52 0.56 -0.55 0.72 -0.34
-0.03 -0.0 -0.28 0.24 -0.24 0.17 -0.13 0.15 0.04 0.11 -0.01 -0.21 0.09
0.45 -0.61 -0.91 0.33 -0.42 0.33 -0.79 0.36 -0.42 0.43 -0.4 0.39 0.2
0.59 -0.99 -0.96 0.59 -0.83 0.35 -1.03 0.4 -0.64 0.53 -0.1 0.21 0.2
0.62 -0.21 -0.09 0.44 -1.08 0.1 -0.69 -0.03 -0.41 0.54 -0.3 0.44 -0.35
0.43 -0.4 -0.7 0.59 -0.5 0.45 -0.65 0.44 -0.47 0.32 -0.36 0.12 -0.18
-0.13 0.12 -0.21 0.2 -0.73 0.31 -0.74 0.43 -0.72 0.56 -0.56 0.71 -0.3
-0.11 -0.18 0.01 0.02 -0.41 0.23 -0.34 0.29 -0.25 0.26 -0.29 0.47 -0.02
0.71 -1.04 -1.19 0.53 -0.76 0.49 -0.42 0.4 -0.34 0.28 -0.4 0.48 -0.35
0.16 -0.18 -0.05 0.17 -0.33 0.1 -0.16 0.14 -0.14 0.16 -0.24 0.08 0.15
0.6 -0.6 -0.47 0.62 -1.15 0.21 -0.63 0.16 -0.38 0.55 -0.28 0.37 -0.24
-0.14 0.05 -0.2 0.25 -0.28 0.28 -0.39 0.11 -0.12 0.35 -0.14 0.12 -0.1
0.34 -0.09 -0.41 0.46 -0.92 0.41 -1.07 0.43 -0.79 0.56 -0.58 0.53 -0.27
0.53 -0.3 -0.36 0.3 -0.29 0.34 -0.65 0.26 -0.34 0.27 -0.31 -0.02 0.04
0.13 -0.17 -0.37 0.37 -0.72 0.42 -0.61 0.42 -0.53 0.59 -0.73 0.63 -0.57
0.49 -0.54 -0.93 0.52 -0.53 0.4 -0.62 0.3 -0.33 0.28 -0.36 0.41 -0.11
0.61 -1.07 -1.8 0.54 -0.59 0.36 -0.84 0.36 -0.26 0.48 -0.24 0.74 -0.45
-0.07 -0.05 0.01 0.11 -0.34 0.2 -0.36 0.34 -0.22 0.21 -0.37 0.42 -0.17
0.2 0.07 0.09 -0.06 -0.02 0.23 -0.59 0.25 -0.33 0.1 -0.3 -0.08 0.2
-0.28 0.05 -0.05 0.08 -0.28 0.39 -0.38 0.39 -0.33 0.16 -0.36 0.4 -0.17
0.57 -0.4 -0.45 0.33 -0.52 0.28 -0.48 0.28 -0.36 0.28 -0.46 0.42 -0.21
0.3 0.08 -0.27 0.15 -0.48 0.37 -0.48 0.39 -0.1 0.04 -0.47 0.21 -0.16
0.13 -0.62 -1.04 0.31 -0.79 0.37 -0.41 0.53 0.06 0.3 0.01 0.43 -0.27
-0.04 0.05 -0.13 0.17 -0.44 0.35 -0.82 0.34 -0.1 0.08 -0.1 0.11 0.16
0.32 -1.59 -1.89 0.31 -1.0 0.38 -1.64 0.68 -1.21 1.03 -1.27 1.5 -1.09
-0.05 -0.36 -0.67 0.27 -0.59 0.41 -0.24 0.47 -0.22 0.43 -0.35 0.5 -0.35
-0.36 0.42 0.43 -0.15 -0.44 -0.15 -0.11 -0.21 -0.15 0.44 0.01 -0.19 0.1
-0.41 0.25 0.07 -0.01 -0.11 0.13 -0.6 0.06 -0.15 0.17 -0.05 0.32 0.09
0.05 0.01 0.14 0.25 -0.69 0.29 -0.54 0.38 -0.65 0.48 -0.71 0.51 -0.4
0.04 -0.33 -0.21 0.53 -0.61 0.26 -0.6 0.19 -0.57 0.62 -0.15 0.16 -0.03
-0.4 0.1 0.14 0.13 -0.48 0.38 -0.65 0.53 -0.62 0.37 -0.68 0.53 -0.22
0.13 -0.11 -0.49 0.14 -0.03 0.18 -0.04 0.17 -0.18 0.23 -0.23 0.21 -0.17
0.19 -0.54 -1.33 0.1 -1.32 0.74 -1.15 0.9 -1.14 0.5 -1.01 1.2 -0.62
0.11 0.08 -0.09 -0.01 -0.19 0.21 -0.39 0.16 0.05 0.0 -0.18 -0.01 0.16
-0.09 0.24 0.14 0.12 -0.45 0.1 -0.62 0.01 -0.41 0.51 -0.19 0.2 0.03
-0.01 -1.0 -1.49 0.52 -2.03 1.12 -2.44 1.21 -2.13 0.8 -1.49 0.83 -0.51
-0.14 0.14 0.19 -0.12 -0.18 0.13 -0.43 0.18 0.03 0.05 -0.22 0.12 0.12
0.48 -0.34 -0.63 0.3 -0.79 0.11 -0.56 0.22 -0.5 0.56 -0.57 0.84 -0.34
0.22 -0.48 -0.68 0.32 -0.51 0.49 -0.82 0.63 -0.46 0.55 -0.65 0.5 -0.38
0.36 -0.75 -0.65 0.34 -0.54 0.46 -0.68 0.6 -0.48 0.4 -0.64 0.6 -0.31
0.07 -0.04 0.22 0.22 -0.46 0.24 -0.91 0.42 -0.74 0.61 -0.53 0.3 -0.28
-0.34 -0.46 -0.32 0.0 -0.06 0.3 -0.32 0.44 -0.18 0.35 -0.44 0.56 -0.06
0.3 -0.15 -0.44 0.06 -0.23 0.22 -0.42 0.3 -0.26 0.23 -0.37 0.58 -0.31
-0.07 -0.94 -1.08 0.01 -0.26 0.91 -1.99 0.83 -0.65 0.41 -0.64 0.83 -0.11
-0.23 -0.33 -0.4 0.04 -0.67 0.47 -0.76 0.72 -0.39 0.36 -0.57 0.71 -0.07
0.54 -0.23 -0.37 0.27 -0.12 0.33 -0.45 0.31 -0.24 0.22 -0.58 0.17 -0.38
0.58 -0.41 -0.77 0.31 -1.34 0.69 -1.21 0.73 -0.89 0.35 -1.35 1.05 -0.83
0.45 -0.77 -1.19 0.43 -0.85 0.45 -0.62 0.56 -0.76 0.74 -1.05 1.0 -1.05
-0.51 0.0 -0.34 0.43 -0.82 0.28 -0.3 0.03 -0.12 0.75 -0.11 0.17 -0.18
-0.17 -0.27 -0.47 0.4 -0.58 0.34 -0.13 0.33 -0.23 0.37 -0.23 0.24 -0.06
0.15 -0.44 -1.4 0.5 -0.2 0.62 -0.86 0.6 -0.36 0.1 -0.43 0.44 -0.09
-0.15 -0.36 -0.47 0.23 -0.35 0.38 -0.61 0.49 -0.25 0.31 -0.29 0.38 0.1
-0.04 -0.25 -0.26 0.17 -0.49 0.38 -0.5 0.51 -0.41 0.31 -0.49 0.53 -0.09
0.48 -1.01 -1.31 1.05 -0.64 0.61 -0.95 0.15 -0.27 0.43 -0.36 0.06 -0.26
0.32 -0.39 -0.3 0.22 -0.25 0.04 -0.14 0.23 0.02 0.14 -0.03 -0.09 0.03
0.25 -0.46 -0.6 0.31 -1.07 0.45 -0.79 0.61 -0.48 0.5 -0.42 0.61 -0.28
0.35 -1.01 -1.38 0.54 -0.96 0.64 -0.76 0.63 -0.84 0.45 -0.72 0.75 -0.05
0.08 -0.19 -0.4 0.09 -0.29 0.48 -0.45 0.32 -0.23 0.24 -0.34 0.37 -0.09
0.05 -1.47 -2.96 0.66 -2.78 1.04 -2.19 1.04 -1.39 0.41 -2.36 1.67 -1.58
-0.08 -0.01 0.0 0.12 -0.23 0.17 -0.43 0.32 -0.23 0.24 -0.35 0.33 -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.