Heatmap: Cluster_5 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
-6.36 -17.93 - - 1.07 0.3 - 1.82 - 1.74 1.48 - -8.36
- - - - - - - - - - - - -
0.57 -0.08 -0.38 -0.47 -0.04 -0.39 -0.07 -0.24 0.42 -0.18 0.07 -0.15 0.46
-0.41 0.12 1.0 -0.71 0.99 -0.77 -0.81 0.58 -0.91 -0.4 -2.22 0.75 -0.45
-0.3 -0.0 0.48 -0.13 0.43 -0.5 -0.05 -0.49 -0.02 0.04 0.16 -0.6 0.45
-0.49 -0.86 -0.39 -0.43 1.56 -0.29 -0.16 -0.48 -0.33 0.25 -0.06 0.17 -0.34
0.93 -0.31 0.02 -0.06 -0.19 0.19 -0.41 0.08 -0.02 -0.24 -0.47 -0.24 0.09
-0.77 0.17 -0.11 -0.23 -0.25 0.5 -1.02 0.72 -1.08 0.68 -1.15 0.8 -0.22
1.2 -5.31 -5.97 0.48 -4.26 0.12 -3.26 0.53 -1.71 0.85 -1.36 1.95 -2.22
0.73 -0.65 -1.31 0.55 -0.33 0.17 -1.1 0.05 -0.18 0.77 -0.02 -0.3 0.05
0.48 -0.55 -1.06 0.25 -0.65 0.36 -0.6 0.6 -0.7 0.73 -1.17 1.0 -1.13
0.58 -2.0 -1.59 0.64 -1.31 0.09 -0.98 0.04 -1.01 1.59 -1.22 0.91 -0.92
0.78 -1.12 -1.27 0.1 0.24 0.58 -0.36 0.45 -0.15 -0.04 -0.59 0.15 -0.2
-0.29 -0.03 0.11 -0.24 -0.59 -0.13 -0.35 -0.32 0.08 0.31 0.37 0.22 0.43
-0.25 0.02 -0.23 -0.1 -0.19 0.29 -0.05 0.08 0.18 -0.81 0.01 -0.26 0.76
0.81 -0.58 -0.54 0.36 -0.85 0.43 -1.44 0.35 -1.25 0.91 -0.32 0.27 -0.38
-0.91 -1.0 -1.04 -0.53 0.61 -0.52 0.1 0.03 -0.29 0.79 -0.03 0.9 0.12
-3.95 1.99 2.14 -3.45 -0.29 -2.81 -0.06 -2.8 -0.95 -1.44 -2.01 -0.39 -0.97
-1.94 0.22 -0.05 -0.87 -0.33 -0.43 0.56 -0.45 1.09 -1.02 0.55 -0.99 0.8
-1.88 0.22 0.35 -0.93 -0.57 -0.54 0.73 -0.76 0.87 -0.83 0.46 -1.1 0.95
- -24.58 - 3.01 - - - - - 2.31 - - -
1.03 -0.91 -0.78 0.78 0.04 0.07 -0.95 -0.31 -0.98 0.69 -0.56 0.46 -0.9
-0.21 -0.83 -0.99 0.67 0.46 0.19 -1.16 0.14 -0.11 0.26 0.2 0.0 0.19
1.85 -3.24 -4.37 0.7 -0.84 -0.58 0.34 -1.08 0.64 -0.99 0.36 -0.93 -0.36
-0.44 -3.37 -1.23 -0.35 -1.84 1.0 -2.26 1.09 -1.74 0.94 -2.3 1.91 -2.5
0.35 -0.48 -0.45 0.23 0.87 -0.57 -0.29 -0.59 0.04 0.49 0.17 -0.22 -0.52
2.48 2.89 - - - - - - - - - - -
-6.58 - - - - - - 2.52 2.51 - - -17.52 0.61
0.31 -0.81 -1.61 0.61 -0.14 0.68 -0.63 0.57 0.05 -0.45 -0.21 -0.38 0.37
-0.75 -0.53 -0.23 -0.23 1.31 -0.45 -0.45 -0.66 -0.0 0.1 0.24 -0.69 0.66
0.15 0.03 -0.09 0.08 0.18 -0.17 -0.01 -0.36 0.11 0.23 0.06 -0.68 0.21
0.71 -0.04 -0.75 -0.04 0.16 0.11 -1.31 0.65 -0.9 0.16 -0.51 0.62 -0.4
0.64 -22.29 -0.52 1.79 0.81 0.83 - - - -0.06 -0.08 0.65 -1.84
0.67 -5.17 -5.3 0.97 -0.11 0.63 -1.12 0.42 -1.36 0.61 0.04 -0.43 0.52
0.44 -1.44 -1.93 0.0 -0.81 0.48 -1.33 0.91 -0.61 0.97 -0.58 0.65 -0.13
0.49 -1.37 -2.33 0.01 -0.66 0.22 -1.18 0.8 -0.55 1.11 -0.7 0.71 -0.11
-0.23 -0.38 -0.42 0.23 -0.4 0.27 -0.58 0.35 -0.33 0.41 0.04 0.31 0.2
- - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - -
1.31 -0.81 -1.31 0.06 -0.73 -0.7 0.52 -0.57 0.2 0.19 -0.93 1.07 -1.92
0.25 -0.8 -0.65 0.73 -0.71 0.37 -1.12 0.35 -0.91 0.6 -0.98 0.96 -0.31
- - - 2.26 - - - 3.04 - - - - -
- - - - - - - - - - - - -
1.39 -2.28 -3.19 0.86 -1.61 0.32 -0.73 0.26 -0.29 0.58 -0.2 0.01 -0.55
1.26 -0.18 -0.17 -0.21 -0.11 -0.1 -1.01 -0.09 -0.2 -0.03 -0.21 -0.18 0.1
0.72 -0.68 -1.05 0.55 -0.89 0.55 -0.64 0.42 -0.33 0.45 -0.64 0.43 -0.57
0.15 -0.31 -0.41 0.49 -0.84 0.54 -0.7 0.46 -0.71 0.58 -0.8 0.63 -0.53
0.66 -1.72 -0.91 0.62 0.56 0.15 -0.43 -0.71 -0.23 0.32 0.43 -1.04 0.24
1.76 0.69 - -0.09 -0.16 - - 0.61 - - - 2.21 -
0.35 -0.16 -0.04 0.0 0.08 -0.13 -0.04 -0.14 0.04 0.14 -0.18 0.01 -0.04
-0.03 0.33 0.36 0.05 0.04 -0.33 -0.22 -0.35 -0.18 0.17 -0.06 0.02 0.0
- - - - - 3.06 - 2.23 - - - - -
0.68 0.01 -0.04 -0.55 0.3 0.0 0.07 -0.11 0.07 -0.38 -0.27 -0.37 0.13
-2.35 0.82 1.1 -2.2 1.84 -2.41 0.19 -2.83 0.04 -2.41 0.25 -2.88 0.12
0.32 0.06 -0.27 -0.27 -0.15 0.21 -0.29 0.31 -0.3 0.35 -0.71 0.54 -0.35
0.85 -0.64 -1.05 0.32 -0.76 0.57 -1.07 0.64 -0.84 0.53 -1.15 0.72 -0.72
-0.05 -0.37 -0.43 0.07 -0.06 0.25 -0.38 0.47 -0.33 0.38 -0.27 0.4 -0.12
-0.13 -0.55 -0.5 -0.18 1.48 -0.4 -0.09 -1.03 0.14 -0.58 0.68 -1.2 0.05
-0.69 -0.51 -0.53 -1.18 1.36 -1.26 0.94 -1.47 0.84 -1.18 0.44 -1.47 0.41
0.07 -1.43 -1.54 -0.71 -0.37 -0.71 0.5 -0.84 1.08 -0.52 1.1 -0.31 0.59
1.47 -1.01 -1.11 0.95 -0.98 -0.14 -0.74 -0.41 -0.67 0.55 -0.14 -0.57 -0.14
0.3 -0.75 -2.3 0.1 0.1 0.36 -1.33 0.4 0.11 0.64 -0.24 0.41 0.04
0.07 -0.35 -1.48 -0.16 -2.4 1.51 -3.0 0.05 -1.07 0.79 -1.99 1.56 -1.67
-0.47 -0.38 -0.1 -0.58 0.38 -0.56 0.21 -0.72 0.34 -0.16 0.66 -0.69 0.84
1.91 -2.64 -2.29 0.62 -0.95 0.08 -1.24 -0.13 -0.54 0.05 -0.48 0.16 -0.23
-0.33 0.42 0.47 0.04 0.39 -0.08 -0.17 -0.57 -0.27 -0.24 0.33 -1.18 0.34
-0.33 -0.06 0.17 0.27 -0.04 0.07 -0.92 -0.25 -0.44 0.28 0.41 -0.65 0.69
0.31 -0.08 -0.39 0.19 -0.28 -0.05 -0.32 -0.1 0.16 0.39 -0.17 0.03 0.06
1.03 -0.5 0.81 0.88 - -2.68 -0.65 -3.63 -0.16 -0.02 -0.82 -0.7 1.45
1.2 -1.94 -1.72 0.46 0.37 -0.21 -0.16 -0.32 -0.32 0.36 -0.31 0.4 -0.51
-0.26 0.03 0.41 0.04 -0.0 -0.18 -0.62 0.12 -0.43 0.76 -0.39 0.25 -0.36
0.12 -0.45 -0.63 0.21 -0.32 0.35 -0.67 0.42 -0.59 0.65 -0.58 0.73 -0.34
0.24 -0.95 -1.19 0.01 -0.2 0.41 -1.34 0.54 -0.92 0.8 -0.67 1.04 -0.24
-1.15 0.32 0.75 -0.48 0.16 -0.27 -0.79 -0.09 -0.5 0.19 0.2 -0.06 0.57
0.53 -0.38 -0.52 -0.1 -0.2 0.26 -0.95 0.58 -0.61 0.51 -0.7 0.65 -0.28
1.59 -0.84 - -2.11 -0.28 - -0.67 1.28 - 0.75 -2.18 1.05 0.42
-0.35 0.47 0.53 -0.27 1.55 -0.84 -1.08 -0.61 -1.74 0.97 -1.61 -0.31 -0.88
0.17 -0.19 -0.37 0.18 -0.16 0.33 -0.44 0.33 -0.15 0.23 -0.5 0.16 0.07
-1.09 0.44 0.18 -0.36 0.2 -0.17 -1.43 0.1 -0.88 1.03 -0.74 0.92 -0.53
0.12 -0.75 -0.67 0.69 -0.69 0.84 -0.87 0.73 -0.43 0.22 -0.59 0.13 -0.32
0.27 -1.46 -1.82 0.53 -1.29 0.78 -1.49 0.92 -1.11 0.85 -1.0 1.03 -0.9
0.74 -4.38 -4.14 1.04 -4.06 1.45 -5.39 1.31 -4.72 1.46 -4.81 -0.11 -3.05
1.05 -0.83 -0.8 0.61 -0.19 -0.32 -0.16 -0.73 0.17 -0.17 0.6 -0.75 -0.06
-0.18 -2.75 -1.79 1.11 0.53 0.62 -0.84 0.02 -1.02 0.97 0.1 -0.02 -1.12
0.67 -0.34 -0.52 0.14 -0.42 0.4 -0.66 0.45 -0.21 0.11 -0.62 0.42 -0.29
0.83 -1.51 -1.67 -0.01 0.55 0.21 -0.88 0.16 -0.72 0.65 -0.52 0.55 -0.08
-0.54 0.02 -0.03 -0.16 0.14 -0.6 0.03 -0.79 0.21 -0.11 0.59 -0.59 0.86
-0.13 0.26 -0.16 -0.56 -0.02 -0.73 0.84 -1.17 0.66 -1.06 0.48 -1.37 0.72
0.05 -1.08 -1.13 0.2 -0.16 0.61 -1.33 0.71 -0.97 0.74 -0.6 0.73 -0.09
0.38 -1.14 -1.59 0.03 0.71 -0.06 -0.09 0.07 0.18 -0.04 -0.16 0.27 0.14
0.82 - -1.31 -0.81 -1.38 0.05 -0.26 0.89 1.86 -1.25 - 0.07 0.06
0.42 -0.91 -0.67 0.94 -1.47 0.44 -1.16 0.16 -0.78 0.91 -0.36 0.31 -0.28
-5.73 -7.06 -7.41 - -8.46 -4.71 -4.35 2.88 -7.41 - 2.45 -5.86 -
2.01 - - 0.39 -0.02 1.7 - - - - 0.07 1.26 -
-1.52 0.39 0.48 -1.33 -2.29 -0.78 -0.35 -0.45 -0.38 -0.15 0.7 -0.03 1.57
2.09 -1.21 -1.11 - -1.12 0.7 0.76 - -2.56 1.73 - - -0.79
0.61 -0.72 -0.52 -0.29 0.76 0.13 -0.37 0.04 0.02 -0.31 -0.08 -0.32 0.25
-3.1 1.77 1.75 -3.4 1.98 -3.08 -2.36 -4.93 -1.74 -2.99 -2.24 -0.35 -1.78
1.88 -1.31 -2.01 0.5 -0.77 -0.18 -1.71 -0.16 -1.35 0.93 -1.38 0.5 -1.04
-0.01 -0.77 -1.16 -0.65 1.12 -0.19 -0.5 -0.16 -0.67 0.3 -0.58 1.02 0.16
-1.62 1.45 1.47 -0.97 -0.1 -1.08 -0.61 -1.24 -0.05 -0.27 0.08 -1.17 -0.21
0.2 0.0 0.19 -0.25 0.24 0.1 -0.5 -0.05 -0.29 0.07 -0.09 -0.32 0.42
-0.12 -2.1 -2.05 0.71 0.1 0.27 -0.65 0.4 -1.33 1.08 -0.47 0.71 -0.24
0.92 -0.98 -0.86 0.86 -0.88 -0.21 -1.62 -0.28 -0.87 1.13 -0.34 0.82 -1.37
0.69 -1.05 -1.13 0.52 -1.51 0.33 -1.51 0.35 -1.12 1.26 -1.36 1.0 -0.91
-0.32 0.11 -0.01 -0.16 -0.26 -0.37 -0.2 -0.38 -0.24 0.59 -0.22 0.86 -0.06
0.54 -0.57 -0.54 0.07 -0.18 0.36 -1.6 0.33 -0.8 0.77 -0.54 0.38 0.15
1.37 -0.5 -0.88 0.04 -0.24 0.33 -0.89 0.17 -0.71 0.44 -0.94 0.18 -0.41
-0.99 -0.24 -0.13 -0.33 0.47 0.19 -0.55 0.14 -0.03 0.15 0.23 -0.29 0.64
0.27 -0.72 -1.05 0.22 -0.08 0.36 -0.55 0.37 -0.41 0.58 -0.42 0.7 -0.46
-0.79 -0.09 -0.07 0.05 -1.0 0.94 -1.13 0.78 -0.98 0.62 -1.33 0.83 -0.55
-0.03 -1.52 -2.83 0.54 -0.82 0.47 -1.79 1.1 -3.14 1.14 -2.98 1.58 -1.97
2.05 - - 1.9 - 0.97 - - - - 1.13 -0.04 -
-0.87 0.4 0.45 -0.92 -1.28 0.26 -0.14 0.32 0.0 0.14 0.12 -0.13 0.46
-0.6 0.72 - - - -0.6 - 1.18 - 0.95 - 1.87 1.12
-0.34 0.32 0.84 0.35 -0.87 -0.34 -1.26 -0.19 -0.9 0.67 -0.24 0.42 -0.06
1.05 -3.23 -3.54 1.2 -0.76 0.08 -1.71 0.43 -1.15 1.19 0.15 -0.07 -1.5
1.2 -1.45 -2.23 0.32 -1.78 -0.54 -1.43 -0.64 -0.94 -0.2 0.83 -0.39 1.57
-0.44 -0.5 -1.29 -0.14 0.42 -0.13 -0.17 0.1 0.25 0.33 0.32 0.09 0.34
- 0.82 0.39 0.96 0.18 0.1 -0.74 0.4 - - 0.14 0.99 -0.39
-9.38 2.92 - - - - - -2.53 -0.5 - -1.27 -20.81 2.05
1.72 -0.84 -0.84 0.29 -0.81 0.34 -1.6 0.25 -1.04 0.52 -0.78 -0.85 -0.07
0.91 0.0 -1.73 0.05 -0.06 -0.0 -1.83 0.49 -1.07 0.48 -0.39 0.66 -0.1
-0.26 0.02 -0.0 -0.14 -0.91 0.41 -0.47 0.63 -0.3 0.39 -0.54 0.56 -0.27
-0.25 0.19 0.27 0.14 -1.3 0.03 -0.24 0.23 -0.15 0.73 -0.28 0.21 -0.47
-0.83 0.31 0.2 -0.52 -0.02 0.13 -0.34 0.24 -0.29 0.32 -0.45 0.65 -0.08
1.82 - - 0.0 - 0.13 - - 0.23 1.87 - 1.36 -
- - - - - - - - - - - - -
-2.06 -1.8 -3.13 -3.6 1.67 -3.66 1.01 -2.31 0.29 -0.64 -0.4 1.69 -0.07
0.39 -0.07 -0.31 -0.12 0.09 0.14 -0.06 0.13 -0.05 0.19 -0.3 -0.11 -0.08
0.49 -0.42 -0.38 -0.81 0.19 -1.15 0.41 -1.19 -0.23 0.38 -0.2 1.06 0.07
-0.5 -0.38 1.43 -0.54 -0.78 -0.73 -0.02 0.17 -0.42 0.13 -0.1 -0.35 0.36
0.18 2.07 0.67 0.68 - -0.98 - - -1.41 0.13 1.32 - -
-0.19 0.66 0.02 0.23 0.29 -0.51 -0.75 -0.25 -0.19 -0.68 0.25 -0.27 0.56
-1.06 -2.62 1.16 -0.12 -1.73 0.92 -1.65 0.99 -1.64 0.23 -3.92 1.61 -3.55
2.21 -1.88 -1.66 0.94 -0.58 -0.5 -0.57 -0.83 -0.37 -0.45 -0.16 -1.46 -1.08
-0.09 0.27 0.19 -0.13 0.59 -1.09 0.25 -1.65 0.54 -0.57 0.67 -1.08 0.19
- - 0.93 -0.44 -1.36 1.29 - 0.84 1.62 - - 1.41 -
-0.06 0.44 0.15 -0.38 -0.28 0.44 -1.24 0.41 -1.46 0.5 -0.77 0.61 -0.02
-1.55 -1.9 -1.96 -2.93 2.57 -3.06 0.31 -3.03 0.44 -1.35 0.33 -0.02 -0.73
0.56 -1.23 -0.84 0.5 1.42 -0.12 -0.48 -1.13 0.17 -0.15 0.45 -1.05 -1.1
0.74 -2.01 -2.24 1.55 -1.09 0.79 -3.22 0.59 -2.51 1.09 -0.43 -0.2 -2.12
0.19 -1.52 - 1.06 0.17 -2.26 -2.6 0.31 - 0.79 1.16 0.75 0.05
-1.63 -0.74 -0.65 -2.25 2.65 -3.07 0.62 -3.56 -0.29 -2.83 -0.19 -3.33 0.37
1.38 -0.54 -0.65 -0.35 0.67 -0.13 -0.44 -0.21 -0.1 -0.24 -0.37 -0.54 -0.08
-2.31 0.76 0.12 -1.45 1.22 -0.11 -0.39 0.02 -0.18 -0.14 -0.84 0.44 -0.14
0.31 0.72 1.03 -0.63 -0.01 -0.73 -0.04 -1.04 -0.01 -0.9 0.38 -1.98 0.37
0.12 0.05 0.16 0.08 0.13 -0.57 0.23 -0.71 0.31 -0.36 0.61 -1.24 0.24
- - - - - - - - 2.88 2.49 - - -
3.24 - - - - - - 1.83 - - - - -
- 0.68 -1.66 1.15 -0.17 0.83 -0.21 0.75 -0.55 -0.63 -0.15 0.5 -
- - - - - 2.82 - - - - 2.57 - -
0.4 0.45 0.85 -0.13 0.46 0.26 -0.85 -0.14 -0.72 0.19 -0.61 -0.5 -1.12
0.41 -1.3 -1.49 1.05 -0.61 0.48 -1.47 0.5 -0.91 0.76 -0.1 0.19 -0.51
0.58 0.29 0.58 -0.48 0.18 -0.15 -1.2 0.12 -0.27 0.09 -0.91 0.1 0.02
-0.24 -0.29 -0.23 -0.18 0.38 0.11 -0.41 0.12 0.13 -0.1 0.13 -0.28 0.53
0.02 0.22 0.02 -0.26 0.06 -0.12 -0.64 -0.28 -0.05 0.33 -0.17 0.36 0.19
0.35 -0.48 0.41 0.48 0.11 -0.3 -0.53 -0.74 0.02 0.21 0.25 -0.5 0.06
0.79 - -1.13 -1.25 0.36 0.81 - 1.18 0.54 -0.41 - 0.69 0.36
1.38 -0.57 -0.94 0.33 -0.4 -0.34 -1.38 -0.04 -0.94 0.67 -0.09 0.32 -0.43
0.15 0.09 0.42 0.23 -0.38 0.02 -0.46 -0.16 -0.16 0.04 -0.02 -0.2 0.18
-0.84 -2.3 -3.22 0.24 0.37 0.07 1.19 -1.39 0.21 - 0.88 -0.1 1.0
0.07 -0.33 0.38 -0.03 0.13 0.31 -0.96 -0.25 0.14 0.01 0.38 -0.5 0.09
0.76 -1.82 -2.4 1.77 -1.48 0.56 -0.62 -0.58 -0.61 -0.52 0.98 -1.05 -1.07
-0.84 -2.3 -3.22 0.24 0.37 0.07 1.19 -1.39 0.21 - 0.88 -0.1 1.0
-0.49 0.17 0.57 -2.77 0.38 -3.46 0.77 -1.3 -0.97 -1.91 1.08 -1.06 1.4
1.26 3.02 -12.92 - -4.89 - -0.6 - -1.51 -0.35 -0.59 - -
2.1 -2.0 -3.24 -0.7 0.46 -0.7 -0.8 -0.36 0.02 0.44 -1.37 0.29 -1.3
-0.57 -0.31 -0.04 -0.6 0.49 -0.38 -0.2 -0.43 0.3 -0.15 0.64 -0.58 0.8
0.56 -0.77 -0.36 - 0.46 - -1.82 1.1 -0.4 -1.89 -0.4 2.13 -2.52
0.18 -0.36 -0.69 0.25 -0.93 0.1 0.4 -0.07 -0.09 -0.03 0.09 0.18 0.37
-0.09 -0.18 -0.32 0.11 -0.6 0.44 -0.61 0.41 -0.24 0.59 -0.52 0.4 -0.11
- - - - 2.99 - - 2.11 - - - - -0.39
- - - - - - - - - - - - -
1.07 -4.07 -3.82 1.1 -2.52 0.6 -2.88 0.53 -2.28 1.73 -1.52 0.43 -2.84
0.28 1.07 -0.64 -0.23 -0.62 0.47 -2.27 -0.03 -2.47 1.08 -2.65 0.98 -0.88
0.4 -0.38 -0.49 -0.45 0.34 0.55 -1.3 -0.05 -0.38 -0.22 0.27 -0.07 0.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.