Heatmap: Cluster_18 (HCCA)

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(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
0.7 0.89 0.84 0.74 0.99 0.86 0.74 0.91 0.92 0.74 0.84 0.65 1.0
0.74 0.91 0.86 0.71 0.74 0.8 0.72 0.76 0.86 0.72 0.96 0.67 1.0
0.83 0.94 0.84 1.0 0.67 0.83 0.89 0.77 0.92 0.85 0.91 0.69 0.9
0.25 0.97 1.0 0.41 0.62 0.67 0.45 0.64 0.66 0.39 0.66 0.28 0.93
0.82 0.67 0.65 0.89 0.61 0.85 0.76 0.79 0.84 0.77 0.93 0.67 1.0
0.09 0.96 0.92 0.31 1.0 0.5 0.76 0.62 0.78 0.6 0.89 0.76 0.95
0.69 0.81 0.96 0.64 0.51 0.72 0.45 0.6 0.65 0.52 0.89 0.4 1.0
0.67 0.76 0.72 0.74 0.62 0.91 0.69 1.0 0.9 0.7 0.76 0.81 0.93
0.41 0.98 1.0 0.49 0.85 0.59 0.83 0.57 0.87 0.67 0.77 0.62 0.98
0.41 0.83 1.0 0.47 0.54 0.45 0.51 0.39 0.46 0.49 0.5 0.39 0.53
0.38 0.89 1.0 0.51 0.66 0.64 0.48 0.59 0.57 0.54 0.56 0.45 0.66
0.61 1.0 1.0 0.76 0.61 0.75 0.67 0.7 0.66 0.85 0.71 0.6 0.72
1.0 0.68 0.88 0.7 0.72 0.7 0.45 0.64 0.46 0.4 0.57 0.28 0.8
0.74 0.95 0.93 0.75 1.0 0.84 0.74 0.77 0.93 0.76 0.84 0.65 1.0
0.84 0.76 0.73 1.0 0.77 0.74 0.59 0.91 0.89 0.8 0.75 0.58 0.92
0.74 1.0 0.98 0.85 0.78 0.87 0.7 0.86 0.77 0.85 0.77 0.72 0.96
0.99 0.9 0.93 1.0 0.88 0.73 0.66 0.73 0.7 0.66 0.74 0.45 0.93
0.33 1.0 0.92 0.41 0.65 0.55 0.72 0.5 0.87 0.44 0.76 0.32 0.91
0.72 0.71 0.97 0.71 0.7 0.67 0.56 0.59 0.73 0.53 0.84 0.38 1.0
0.7 0.86 0.86 0.69 0.83 0.96 0.68 1.0 0.81 0.78 0.66 0.89 0.86
0.79 0.74 0.7 0.89 0.69 0.92 0.75 0.99 0.91 0.93 0.85 0.93 1.0
0.38 0.92 1.0 0.72 0.65 0.81 0.64 0.78 0.79 0.8 0.8 0.76 0.98
0.2 0.94 0.85 0.42 0.64 0.57 0.72 0.55 0.83 0.45 0.86 0.41 1.0
0.28 1.0 0.72 0.28 0.61 0.36 0.68 0.37 0.69 0.47 1.0 0.49 0.97
0.61 0.95 0.87 0.88 0.46 0.73 0.75 0.68 0.88 0.81 1.0 0.63 0.87
0.5 1.0 0.94 0.62 0.6 0.58 0.62 0.52 0.6 0.58 0.56 0.48 0.61
0.59 0.76 0.78 0.61 0.86 0.64 0.87 0.6 1.0 0.59 0.89 0.53 1.0
0.42 0.98 0.92 0.63 0.85 0.67 0.95 0.62 0.95 0.69 0.91 0.6 1.0
0.77 1.0 1.0 0.9 0.82 0.78 0.75 0.73 0.83 0.88 0.79 0.72 0.77
0.42 0.59 1.0 0.67 0.63 0.57 0.5 0.48 0.61 0.58 0.88 0.28 0.99
0.68 0.9 0.69 1.0 0.54 0.71 0.89 0.59 0.86 0.83 0.96 0.5 0.76
0.49 0.78 1.0 0.7 0.67 0.69 0.59 0.6 0.77 0.66 0.81 0.51 0.9
0.28 1.0 0.97 0.42 0.78 0.52 0.73 0.48 0.73 0.47 0.72 0.37 0.8
0.57 0.93 1.0 0.63 0.86 0.95 0.73 0.78 0.8 0.7 0.77 0.45 0.99
0.98 0.87 0.79 0.96 0.67 0.98 0.62 0.95 0.94 0.79 0.91 0.86 1.0
0.85 0.9 0.81 0.9 0.68 0.97 0.65 0.91 0.86 0.89 0.85 0.85 1.0
0.85 0.97 1.0 0.81 0.75 0.83 0.56 0.75 0.69 0.63 0.76 0.61 0.95
0.51 0.88 0.86 0.78 0.67 0.75 0.96 0.74 0.91 1.0 0.67 0.62 0.8
0.17 1.0 0.87 0.25 0.8 0.37 0.49 0.36 0.52 0.38 0.44 0.33 0.65
0.72 0.77 0.79 0.75 0.71 1.0 0.69 0.97 0.87 0.77 0.74 0.86 0.93
0.46 0.92 1.0 0.4 0.83 0.44 0.52 0.42 0.59 0.44 0.58 0.3 0.89
0.5 0.94 1.0 0.67 0.83 0.6 0.84 0.59 0.85 0.7 0.76 0.58 0.83
0.44 0.93 1.0 0.54 0.69 0.64 0.47 0.58 0.64 0.46 0.59 0.39 0.77
0.84 1.0 0.91 0.95 0.77 0.83 0.91 0.73 0.91 0.88 0.88 0.78 0.91
0.43 0.85 1.0 0.52 0.62 0.48 0.6 0.51 0.57 0.55 0.46 0.49 0.58
0.62 0.89 1.0 0.72 0.76 0.6 0.87 0.59 0.93 0.63 0.78 0.56 0.83
0.75 1.0 1.0 0.99 0.7 0.96 0.7 0.83 0.74 0.97 0.75 0.73 0.9
0.68 0.92 0.8 0.84 0.74 0.8 0.85 0.75 0.92 0.78 0.86 0.63 1.0
0.75 1.0 0.9 0.9 0.68 0.6 0.91 0.56 0.82 0.87 0.83 0.57 0.73
0.62 0.85 1.0 0.68 0.51 0.54 0.42 0.4 0.51 0.69 0.71 0.37 0.71
0.98 0.95 0.96 0.88 0.9 0.76 0.8 0.74 0.88 0.78 0.82 0.62 1.0
0.75 0.98 0.96 0.68 0.85 0.76 0.65 0.66 0.86 0.6 0.85 0.51 1.0
0.65 0.98 1.0 0.74 0.91 0.77 0.78 0.77 0.91 0.76 0.8 0.73 0.87
0.3 0.96 1.0 0.4 0.82 0.45 0.77 0.45 0.75 0.58 0.68 0.43 0.69
0.7 1.0 0.98 0.67 0.6 0.59 0.65 0.53 0.71 0.6 0.69 0.5 0.69
0.78 0.77 0.79 0.81 0.76 0.8 0.76 0.81 0.88 0.82 0.85 0.73 1.0
1.0 1.0 0.97 0.81 0.8 0.77 0.87 0.75 0.9 0.79 0.74 0.75 0.87
0.75 0.8 0.68 0.89 0.75 1.0 0.65 0.93 0.86 0.69 0.82 0.71 0.93
0.88 0.87 0.89 0.94 0.93 0.83 0.69 0.81 0.95 0.81 0.9 0.64 1.0
0.58 0.73 1.0 0.55 0.83 0.72 0.59 0.71 0.8 0.56 0.73 0.43 0.94
0.83 0.69 0.69 0.92 0.79 0.82 0.74 0.74 0.82 0.75 0.94 0.67 1.0
0.85 0.94 1.0 0.89 0.7 0.95 0.74 0.88 0.83 0.86 0.82 0.71 0.99
0.87 0.83 0.74 0.88 0.92 0.99 0.62 0.93 0.88 0.79 0.81 0.8 1.0
0.85 0.87 0.99 0.97 0.96 0.99 0.77 1.0 0.9 0.98 0.86 0.86 0.93
0.76 1.0 0.94 0.7 0.53 0.57 0.58 0.52 0.57 0.78 0.59 0.56 0.6
0.93 0.91 0.85 1.0 0.82 0.93 0.69 0.92 0.96 0.92 0.98 0.78 1.0
0.43 0.93 1.0 0.6 0.85 0.62 0.66 0.55 0.73 0.58 0.71 0.41 0.82
0.83 0.95 1.0 0.89 0.85 0.82 0.9 0.79 0.95 0.87 0.85 0.64 0.99
0.67 0.97 1.0 0.87 0.77 0.84 0.69 0.76 0.78 0.79 0.78 0.66 0.8
0.79 0.9 0.99 0.99 0.76 0.85 1.0 0.76 0.87 1.0 0.94 0.76 0.92
0.75 0.71 0.63 0.87 0.81 0.81 0.9 0.73 0.94 0.74 1.0 0.67 0.85
0.48 0.6 0.61 0.62 1.0 0.66 0.57 0.68 0.59 0.75 0.68 0.51 0.85
0.62 0.92 1.0 0.77 0.9 0.9 0.66 0.92 0.79 0.84 0.77 0.69 0.98
0.55 0.88 1.0 0.69 0.63 0.78 0.58 0.83 0.67 0.78 0.65 0.68 0.85
0.55 0.91 1.0 0.79 0.92 0.84 0.55 0.77 0.85 0.71 0.65 0.46 0.86
0.63 0.84 0.75 0.67 0.81 0.64 0.94 0.59 1.0 0.65 0.92 0.48 0.96
0.65 0.87 0.97 0.69 0.66 0.79 0.64 0.71 0.76 0.68 0.86 0.62 1.0
1.0 0.76 0.84 0.95 0.92 0.81 0.81 0.76 0.84 0.85 0.89 0.67 0.8
0.3 0.85 0.77 0.5 0.62 0.6 0.53 0.68 0.68 0.77 1.0 0.76 0.97
0.66 0.83 0.79 0.83 0.8 0.76 0.88 0.7 0.85 0.77 0.93 0.63 1.0
0.79 1.0 0.79 0.88 0.38 0.63 0.27 0.66 0.48 0.71 0.59 0.49 0.62
0.5 0.88 1.0 0.75 0.57 0.53 0.76 0.49 0.82 0.62 0.97 0.51 0.94
0.7 0.84 0.9 0.72 0.83 0.76 0.83 0.68 0.92 0.67 0.87 0.53 1.0
0.87 0.84 0.91 0.86 0.79 0.72 0.8 0.74 0.95 0.72 0.88 0.6 1.0
0.86 0.82 0.8 1.0 0.7 0.83 0.77 0.64 0.8 0.86 0.83 0.58 0.95
0.59 0.75 1.0 0.75 0.56 0.7 0.5 0.6 0.67 0.85 0.6 0.57 0.78
0.7 1.0 0.99 0.88 0.82 0.79 0.88 0.67 0.94 0.84 0.88 0.65 0.98
0.72 0.92 1.0 0.79 0.97 0.76 0.91 0.72 0.89 0.79 0.96 0.62 0.97
0.92 1.0 0.97 0.95 0.68 0.77 0.68 0.67 0.65 0.9 0.68 0.62 0.63
0.54 0.81 1.0 0.58 0.82 0.72 0.61 0.65 0.77 0.46 0.75 0.4 0.91
0.87 0.89 0.88 0.99 0.69 0.88 0.62 0.88 0.71 1.0 0.71 0.81 0.73
0.33 0.99 1.0 0.37 0.69 0.38 0.48 0.35 0.68 0.35 0.58 0.26 0.73
1.0 0.69 0.76 0.89 0.72 0.72 0.59 0.58 0.6 0.68 0.7 0.48 0.82
0.42 1.0 0.87 0.54 0.74 0.55 0.76 0.52 0.84 0.51 0.7 0.48 0.78
0.72 1.0 0.68 0.83 0.82 0.86 0.95 0.8 0.95 0.73 0.81 0.58 0.98
0.26 1.0 0.88 0.43 0.7 0.4 0.63 0.45 0.57 0.57 0.56 0.45 0.7
0.86 0.85 0.9 0.83 0.7 0.96 0.66 0.98 0.91 0.88 0.77 1.0 0.95
0.72 0.88 0.92 0.98 0.8 0.87 0.97 0.86 0.89 1.0 0.9 0.83 0.94
0.44 0.96 1.0 0.67 0.73 0.82 0.69 0.83 0.83 0.69 0.73 0.65 0.97
0.37 1.0 0.79 0.41 0.58 0.42 0.44 0.35 0.68 0.46 0.61 0.27 0.75
0.91 0.74 0.69 0.95 0.69 1.0 0.71 0.96 0.84 0.92 0.91 0.86 0.96
0.69 0.87 1.0 0.75 0.68 0.7 0.54 0.69 0.67 0.76 0.66 0.82 0.73
0.76 0.66 0.76 0.73 0.78 0.67 0.57 0.68 0.72 0.81 0.76 0.54 1.0
0.73 0.78 0.91 0.88 0.74 0.76 0.85 0.81 0.88 0.87 0.96 0.76 1.0
0.65 0.87 1.0 0.75 0.75 0.67 0.64 0.62 0.71 0.77 0.75 0.64 0.77
1.0 0.77 0.81 0.9 0.93 0.82 0.68 0.71 0.78 0.66 0.95 0.51 0.95
0.74 0.82 0.97 0.81 1.0 0.69 0.84 0.62 0.96 0.63 0.98 0.47 0.99
0.74 0.82 0.97 0.81 1.0 0.69 0.84 0.62 0.96 0.63 0.98 0.47 0.99

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)