Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
WT,12hL12hD,Log,1h Dark
WT,12hL12hD,Log,1h Light
WT,12hL12hD,Log,1h Light d2
WT,12hL12hD,Log,3h Dark
WT,12hL12hD,Log,3h Light
WT,12hL12hD,Log,5h Dark
WT,12hL12hD,Log,5h Light
WT,12hL12hD,Log,7h Dark
WT,12hL12hD,Log,7h Light
WT,12hL12hD,Log,9h Dark
WT,12hL12hD,Log,9h Light
WT,12hL12hD,Log,11h Dark
WT,12hL12hD,Log,11h Light
1.0 0.18 0.15 0.73 0.25 0.58 0.31 0.57 0.37 0.72 0.32 0.83 0.34
0.2 0.28 0.31 0.12 0.25 0.07 0.25 0.02 0.48 0.12 1.0 0.01 0.52
1.0 0.03 0.03 0.4 0.06 0.2 0.06 0.26 0.25 0.36 0.39 0.79 0.24
0.0 0.0 0.74 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.53 0.47 0.11 0.9 0.16 0.82 0.13 0.65 0.14 0.52 0.25 1.0
0.61 0.21 0.28 1.0 0.34 0.62 0.24 0.4 0.43 0.35 0.79 0.14 0.56
1.0 0.39 0.31 0.59 0.31 0.67 0.36 0.69 0.48 0.63 0.4 0.86 0.54
0.58 0.73 0.71 1.0 0.52 0.87 0.76 0.72 0.82 0.86 0.63 0.77 0.74
1.0 0.15 0.14 0.66 0.35 0.7 0.22 0.73 0.22 0.93 0.31 0.83 0.28
1.0 0.04 0.02 0.72 0.02 0.55 0.02 0.41 0.02 0.48 0.05 0.3 0.16
0.71 0.74 0.75 0.7 0.61 0.65 0.72 0.51 0.99 0.49 0.92 0.28 1.0
0.72 0.14 0.11 1.0 0.8 0.64 0.36 0.3 0.42 0.46 0.79 0.25 0.37
0.81 0.95 0.99 0.7 0.72 0.56 1.0 0.45 1.0 0.55 0.89 0.36 0.88
0.85 0.89 0.8 0.87 0.56 1.0 0.61 0.9 0.77 0.82 0.72 0.89 0.83
0.66 0.47 0.44 0.54 0.58 0.45 0.65 0.35 1.0 0.3 0.84 0.22 0.78
0.13 0.27 0.38 0.15 1.0 0.11 0.5 0.11 0.29 0.12 0.23 0.08 0.23
0.99 0.3 0.23 0.57 0.31 0.48 0.58 0.44 0.6 0.5 0.35 1.0 0.37
0.74 0.61 0.56 0.77 0.74 1.0 0.9 0.81 0.74 0.57 0.6 0.6 0.73
0.08 0.03 0.08 0.21 0.26 0.23 0.06 0.04 0.07 0.22 0.15 1.0 0.23
0.76 0.84 0.66 0.82 0.55 0.96 0.8 0.93 0.81 0.86 0.62 1.0 0.64
0.17 0.05 0.03 0.16 1.0 0.12 0.44 0.12 0.37 0.21 0.42 0.15 0.32
0.67 0.1 0.07 0.37 1.0 0.19 0.85 0.32 0.73 0.7 0.48 0.83 0.29
1.0 0.29 0.29 0.86 0.4 0.8 0.5 0.67 0.63 0.66 0.64 0.59 0.64
0.28 0.3 0.36 0.22 0.47 0.15 0.59 0.1 1.0 0.08 0.61 0.06 0.69
0.52 0.86 0.89 0.5 0.56 0.72 0.65 0.51 0.87 0.57 1.0 0.35 1.0
0.82 0.52 0.49 0.86 0.56 0.75 0.52 0.72 0.59 1.0 0.61 0.88 0.68
0.7 0.26 0.19 0.53 0.61 0.58 0.92 0.36 1.0 0.14 0.69 0.46 0.41
1.0 0.38 0.38 0.66 0.66 0.43 0.57 0.37 0.63 0.53 0.73 0.46 0.62
0.86 0.71 0.62 0.67 0.58 0.63 1.0 0.48 0.67 0.6 0.7 0.57 0.83
0.52 0.5 0.48 0.66 0.3 0.76 0.36 0.83 0.32 0.82 0.28 1.0 0.34
0.56 0.03 0.02 0.23 0.15 0.09 0.39 0.07 0.86 0.1 1.0 0.06 0.32
0.72 0.14 0.07 0.79 0.53 0.58 0.47 0.47 0.75 0.49 0.94 0.37 1.0
0.99 0.65 0.55 1.0 0.56 0.76 0.74 0.63 0.73 0.84 0.77 0.65 0.77
0.98 0.61 0.49 0.89 0.54 0.7 0.7 0.98 0.62 1.0 0.58 0.91 0.53
0.3 0.32 0.23 0.52 0.38 0.93 0.33 1.0 0.37 0.59 0.34 0.87 0.47
0.46 0.27 0.21 0.59 0.18 0.79 0.19 0.86 0.26 0.77 0.26 1.0 0.34
0.49 0.92 0.91 0.6 0.84 0.55 0.75 0.41 0.85 0.35 0.91 0.21 1.0
0.22 0.18 0.17 0.52 0.17 0.54 0.33 0.76 0.42 1.0 0.52 0.61 0.49
0.63 0.03 0.02 0.5 0.11 0.52 0.03 0.66 0.03 1.0 0.02 0.96 0.04
0.37 0.41 0.42 0.64 0.28 0.47 0.4 0.47 0.38 1.0 0.33 0.81 0.39
0.37 0.44 0.52 0.55 0.67 0.64 0.7 0.58 0.56 0.74 0.5 1.0 0.47
0.6 1.0 0.89 0.73 0.51 0.92 0.63 0.86 0.78 0.82 0.73 0.76 0.86
0.96 0.83 0.83 0.95 0.79 0.61 0.92 0.53 0.9 0.7 0.98 0.58 1.0
0.53 0.85 0.57 0.38 0.9 0.36 1.0 0.35 0.67 0.36 0.5 0.84 0.49
0.37 1.0 0.84 0.35 0.54 0.41 0.51 0.42 0.49 0.47 0.35 0.75 0.44
0.53 0.58 0.61 0.71 1.0 0.74 0.62 0.78 0.75 0.6 0.85 0.85 0.81
0.49 0.16 0.1 0.33 0.22 0.26 0.54 0.2 0.62 0.25 0.83 0.22 1.0
0.3 0.57 0.41 0.54 0.36 0.63 0.19 0.71 0.4 1.0 0.5 0.57 0.53
0.32 0.81 0.45 0.47 0.68 0.37 0.94 0.22 0.97 0.25 1.0 0.26 0.71
0.11 0.24 0.19 0.04 0.88 0.03 1.0 0.03 0.73 0.03 0.63 0.04 0.69
0.09 0.34 0.34 0.2 1.0 0.19 0.33 0.14 0.43 0.07 0.45 0.04 0.41
0.62 0.65 0.48 0.57 0.78 0.61 1.0 0.62 0.85 0.69 0.6 0.7 0.8
0.59 0.51 0.55 1.0 0.4 0.99 0.48 0.87 0.59 0.91 0.75 0.66 0.83
0.37 0.78 0.52 0.94 0.12 1.0 0.12 0.9 0.35 0.85 0.55 0.27 0.98
0.74 0.76 0.8 0.61 0.96 0.77 0.84 0.67 0.77 0.48 0.71 0.53 1.0
0.49 0.3 0.26 0.13 0.3 0.12 0.7 0.07 1.0 0.04 0.74 0.02 0.67
0.89 0.43 0.41 0.93 0.51 0.8 0.45 0.83 0.47 1.0 0.56 0.86 0.64
0.24 0.37 0.48 0.26 1.0 0.29 0.57 0.28 0.7 0.29 0.79 0.22 0.95
0.75 0.17 0.17 0.24 1.0 0.22 0.55 0.22 0.59 0.27 0.69 0.24 0.79
0.48 0.28 0.16 0.24 1.0 0.14 0.54 0.14 0.29 0.22 0.25 0.17 0.48
1.0 0.42 0.39 0.99 0.33 0.72 0.52 0.63 0.58 0.85 0.45 0.97 0.5
1.0 0.03 0.02 0.34 0.08 0.1 0.25 0.09 0.38 0.1 0.18 0.18 0.08
0.0 0.0 1.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.12
0.38 0.99 1.0 0.37 0.26 0.37 0.09 0.28 0.16 0.28 0.21 0.23 0.51
0.7 0.9 0.75 0.53 0.83 0.77 0.75 0.78 1.0 0.52 0.68 0.8 0.86
0.39 0.55 0.45 0.59 1.0 0.46 0.62 0.49 0.74 0.84 0.82 0.92 0.76
0.66 1.0 0.97 0.77 0.82 0.9 0.69 0.83 0.68 0.96 0.65 0.87 0.89
0.63 0.4 0.23 0.54 0.56 0.48 0.42 0.44 1.0 0.31 0.84 0.17 0.69
0.17 1.0 1.0 0.4 0.35 0.74 0.36 0.71 0.31 0.54 0.29 0.68 0.45
0.78 0.45 0.47 1.0 0.34 0.65 0.54 0.65 0.65 0.6 0.68 0.37 0.6
0.67 0.22 0.21 0.54 0.5 0.47 0.76 0.46 1.0 0.38 0.85 0.37 0.65
0.72 0.09 0.06 0.75 0.52 0.73 0.36 0.49 0.62 0.59 0.82 0.51 1.0
0.82 0.6 0.59 0.83 0.15 0.61 0.26 0.59 0.31 1.0 0.45 0.57 0.44
0.8 0.72 0.71 0.99 0.62 1.0 0.94 0.85 0.85 0.84 0.76 0.82 0.77
0.75 0.65 0.54 0.78 0.49 0.79 0.44 0.87 0.53 0.81 0.49 1.0 0.53
0.29 0.28 0.17 0.21 0.43 0.11 0.86 0.05 0.96 0.06 1.0 0.02 0.56
0.51 0.32 0.29 0.36 0.94 0.29 0.87 0.24 0.75 0.35 0.88 0.22 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)